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mtDNA的非同义突变与人类有氧耐力的获得及保护
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作者 漆正堂 高婧怡 刘微娜 《广州体育学院学报》 北大核心 2025年第4期82-90,共9页
线粒体DNA(mtDNA)对能量需求相关的选择压力表现出极高的敏感性,并且具有较高的突变率。其中,非同义突变对能量代谢的影响尤为显著,因此在一定程度上可以反映人类有氧耐力的获得进程。在哺乳动物和鸟类的研究中发现,运动能力的退化与能... 线粒体DNA(mtDNA)对能量需求相关的选择压力表现出极高的敏感性,并且具有较高的突变率。其中,非同义突变对能量代谢的影响尤为显著,因此在一定程度上可以反映人类有氧耐力的获得进程。在哺乳动物和鸟类的研究中发现,运动能力的退化与能量代谢约束放松后mtDNA非同义突变的积累有关。与其他灵长类动物相比,mtDNA非同义突变以及核DNA的协同进化使得人类选择性地获得了有氧耐力。由于现代社会能量的易获性以及耐力运动的非必要性,人类mtDNA的非同义突变积累逐渐增多,占据基因池甚至引发更多慢性代谢性疾病。从哺乳动物和鸟类的mtDNA非同义突变与运动能力退化的关系判断,人类主动设置能量代谢的约束条件,即主动进行有氧运动可保持mtDNA的纯洁性、防止mtDNA非同义突变,从个体和进化两个时间尺度上维系人类健康。 展开更多
关键词 mtdna 非同义突变 人类有氧耐力 有氧运动 慢性疾病
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黑龙江省南部小飞鼠种群mtDNA控制区的遗传结构
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作者 田新民 王佳琪 +2 位作者 白小珍 刘涵奇 石兰英 《动物学杂志》 北大核心 2025年第2期213-223,共11页
小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物,受森林采伐与栖息地丧失等因素影响,其种群数量与分布在不断减少。为增强保护与管理的针对性,亟需对其种群的遗传变化,特别是遗传多样性与基因流等种群遗传信息开展进一步评价。本研... 小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物,受森林采伐与栖息地丧失等因素影响,其种群数量与分布在不断减少。为增强保护与管理的针对性,亟需对其种群的遗传变化,特别是遗传多样性与基因流等种群遗传信息开展进一步评价。本研究在黑龙江省南部的方正、宾县、苇河和穆棱4个重点研究区域,分别采集到20、26、15和27只小飞鼠个体的毛发样本,采用mt DNA控制区全序列(1070 bp)评估其种群遗传多样性与遗传结构。研究发现,在88个小飞鼠控制区全序列中,共检测到155个变异位点和67个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.992(0.945~0.986),核苷酸多样性(Pi)为1.772%(1.221%~1.974%),仅单倍型H_20为宾县与苇河种群共享,只有1只个体的单倍型有52个,其稀有单倍型高达77.16%(52/67);种群之间遗传分化系数(FST)为0.0513~0.1357(P<0.05),基因流(Nm)为3.19~9.24;种群之间遗传分化程度与地理距离的Mantel检验呈现不显著的正相关(r=0.413,P>0.05)。结果表明,小飞鼠种群遗传多样性丰富,其中,苇河和穆棱种群最高、宾县种群次之、方正种群最低,高比例稀有单倍型提示,未来种群存在遗传多样性下降的风险;4个地理种群之间均存在显著的中等水平遗传分化,距离隔离模型不能有效地解释小飞鼠种群目前遗传格局的形成;系统进化树与单倍型网络图没有呈现出明显的系统地理格局,其种群间基因流的限制可能是近期出现的。研究结果提示,需开展栖息地修复和生态廊道构建,从而实现该物种的种群增长与扩散。 展开更多
关键词 小飞鼠 mtdna控制区 种群遗传结构 遗传多样性
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西藏自治区10个黄牛群体的mtDNA遗传多样性与母系起源研究
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作者 姚婷婷 李昊 +9 位作者 阎卉萱 曹一凡 次仁罗布 索朗曲吉 尼玛仓决 赵丽 旦增洛桑 斯朗旺姆 巴桑珠扎 陈宁博 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期2194-2202,共9页
旨在探究西藏自治区10个黄牛群体的线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。本研究通过线粒体基因组序列比对对西藏自治区10个黄牛群体的167个个体的线粒体基因组序列进行分析,重点探究其线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。通过系统发... 旨在探究西藏自治区10个黄牛群体的线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。本研究通过线粒体基因组序列比对对西藏自治区10个黄牛群体的167个个体的线粒体基因组序列进行分析,重点探究其线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。通过系统发育学和遗传多样性分析,检测到167个黄牛拥有120种单倍型,其中包括普通牛的T2、T3和T4单倍型,原牛的Q单倍型;瘤牛的I1和I2单倍型;以及牦牛的单倍型。T3单倍型还包括T3119和T3055两个东亚普通牛特异的亚单倍型。线粒体基因组遗传多样性分析结果显示,巴桑牛的单倍型多样度最高,为0.990±0.028,白朗牛的最低,为0.867±0.107;核苷酸多样度最高的为吉隆牛0.030±0.0005,最低的为日喀则牛0.001±0.0002。系统发育树和单倍型网络图表明,10个黄牛群体主要为普通牛母系起源,有少量牦牛及瘤牛母系起源。总体而言,10个黄牛群体均具有较高的遗传多样性,具有普通牛、瘤牛和牦牛的母系起源,表明这10个黄牛群体母系遗传多样性丰富,并且和牦牛之间存在基因交流。这些结果对于深入理解西藏自治区黄牛的遗传演化机制以及合理保护和利用这一珍贵遗传资源具有重要意义。 展开更多
关键词 西藏自治区 mtdna基因组 遗传多样性
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基于mtDNA D-loop序列分析青海省果洛州牦牛遗传资源的母系遗传多样性及群体遗传结构 被引量:4
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作者 曹萍 梅萨 +12 位作者 陈生梅 李鸿康 郭卫兴 李瑞哲 达桑 才加 莫延新 官却扎西 忠尕 李文浩 刘书杰 崔宏伟 马志杰 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期134-146,共13页
为从分子水平上对青海省果洛藏族自治州牦牛遗传资源进行系统评估,分析其母系遗传多样性、群体遗传结构和群体遗传分化,本研究对甘德、班玛、久治和玛多牦牛群体共152头个体进行线粒体DNA(mtDNA)D-loop区测序,并从GenBank下载已公布的3... 为从分子水平上对青海省果洛藏族自治州牦牛遗传资源进行系统评估,分析其母系遗传多样性、群体遗传结构和群体遗传分化,本研究对甘德、班玛、久治和玛多牦牛群体共152头个体进行线粒体DNA(mtDNA)D-loop区测序,并从GenBank下载已公布的37条达日牦牛和32条玛沁牦牛的相应序列,对这6个牦牛群体mtDNA D-loop序列进行综合分析。结果表明:(1)221条牦牛mtDNA D-loop序列(636~638 bp)比对分析共检测出57个变异位点,包括8个单一多态位点和49个简约信息位点。根据D-loop序列间核苷酸变异共确定了45种单倍型,其中班玛、达日、甘德、久治、玛多、玛沁牦牛群体分别拥有1、6、5、4、7、6种特有单倍型。(2)6个牦牛群体总的单倍型多样度和核苷酸多样度为0.901和0.014,表明其母系遗传多样性丰富。其中,甘德牦牛的单倍型多样度最高(Hd=0.951),久治牦牛的单倍型多样度最低(Hd=0.818)。(3)遗传分化和基因流分析表明,除久治牦牛与班玛、甘德、玛沁牦牛群体间分化程度均呈中等遗传分化水平(0.05≤FST<0.15),基因交流相对贫乏外,其他牦牛群体间FST值较小(0<FST<0.05),分化程度弱,基因交流相对频繁。(4)聚类分析表明久治、甘德、班玛3个牦牛群体间亲缘关系较近,而玛多、玛沁、达日3个牦牛群体间亲缘关系较近。(5)系统发育分析显示6个牦牛群体中除久治牦牛由3个母系遗传支系(即Mt-Ⅰ、Mt-Ⅱ和Mt-Ⅲ)组成外,其他群体均由Mt-Ⅰ和Mt-Ⅱ2个母系支系组成,推测果洛藏族自治州中久治牦牛群体有3个母系起源,其他牦牛群体均有2个母系起源。综上,青海省果洛藏族自治州6个牦牛群体均拥有特殊的母系遗传信息且母系遗传多样性较为丰富;各牦牛群体间遗传分化程度整体较弱;久治、甘德和班玛3个牦牛群体间亲缘关系较近,而玛多、玛沁和达日3个牦牛群体间亲缘关系较近;除久治牦牛群体有3个母系起源外,其他牦牛群体均有2个母系起源。本研究为青海省果洛藏族自治州牦牛遗传资源的合理保护和开发利用提供了理论基础。 展开更多
关键词 牦牛 mtdna D-loop区 遗传多样性 遗传分化 群体结构 系统发育
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庆阳驴mtDNA D-loop区遗传多样性及起源分析 被引量:1
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作者 施海娜 王永杰 +5 位作者 梁万鹏 耿智广 李世恩 徐振飞 刘刚 刘哲 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期601-613,共13页
[目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,... [目的]研究庆阳驴养殖群体的遗传多样性与母系起源,了解其遗传信息,为保护庆阳驴种质资源、选育和遗传改良工作提供理论依据。[方法]随机选取133头庆阳驴,对其线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区序列进行PCR扩增、测序及比对,并探讨庆阳驴的遗传多样性与母系起源。[结果]在获得的520 bp D-loop碱基序列中,AT含量(57.3%)高于GC含量(42.8%),表现出碱基的偏倚性;检测到38个变异位点,包含8个碱基对的转换;其核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸差异(K)分别为0.01591、0.895和8.274,与欧洲家驴和中国家驴研究的平均值相比较低,说明该驴品种核苷酸变异较为贫乏。庆阳驴mtDNA D-loop区存在35个单倍型,单倍型之间的遗传距离为0.002~0.042。系统进化结果显示,庆阳驴存在2个线粒体支系,表明其具有2个母系起源,且遗传距离表明,庆阳驴与克罗地亚家驴之间的遗传距离较近。[结论]本研究从分子水平初步揭示庆阳驴核苷酸变异比较贫乏,杂交程度高,mtDNA遗传多态性正逐步丧失,应加强庆阳驴品种的遗传资源保护工作。 展开更多
关键词 庆阳驴 mtdna D-LOOP区 遗传多样性 起源
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甘孜藏牛mtDNA 基因组遗传多样性分析 被引量:2
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作者 张佳琳 姚婷婷 +2 位作者 马伟东 李付强 雷初朝 《中国牛业科学》 2024年第1期5-8,共4页
[目的]探究甘孜藏牛的mtDNA基因组遗传多样性与母系起源。[方法]采用mtDNA全基因组序列比对及生物信息学方法。[结果]结果显示:在28头甘孜藏牛mtDNA基因组中,共检测到1232个变异位点,确定了22种单倍型,其单倍型多样度(Hd)为0.98820±... [目的]探究甘孜藏牛的mtDNA基因组遗传多样性与母系起源。[方法]采用mtDNA全基因组序列比对及生物信息学方法。[结果]结果显示:在28头甘孜藏牛mtDNA基因组中,共检测到1232个变异位点,确定了22种单倍型,其单倍型多样度(Hd)为0.98820±0.00010,核苷酸多样度(Pi)为0.02420±0.00003,表明甘孜藏牛具有丰富的母系遗传多样性。系统发育树和网络分布图表明,28头甘孜藏牛mtDNA基因组包括4种母系支系,分别为普通牛的T2、T3与T4支系,还有牦牛支系,其中T2支系占7.14%,T3支系占64.29%,T4支系占3.57%,牦牛支系占25%。[结论]甘孜藏牛具有较丰富的母系遗传多样性,为普通牛母系起源,但与牦牛有杂交。 展开更多
关键词 甘孜藏牛 mtdna基因组 遗传多样性 母系起源
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基于mtDNA Cytb基因对甘肃4个马群体遗传多样性和系统发育的研究
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作者 高颖 成述儒 +6 位作者 史金平 罗志皓 张全伟 王建福 刘哲 张勇 刘婷 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第12期41-49,123,124,共11页
为了研究甘肃境内部分马群体的遗传多样性、遗传结构和母系起源,试验采用DNA测序技术对甘肃4个马群体(岔口驿马49匹、河曲马20匹、山丹马30匹和肃南马34匹)共133个个体血样的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)中的细胞色素b(cytochrom... 为了研究甘肃境内部分马群体的遗传多样性、遗传结构和母系起源,试验采用DNA测序技术对甘肃4个马群体(岔口驿马49匹、河曲马20匹、山丹马30匹和肃南马34匹)共133个个体血样的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)中的细胞色素b(cytochrome b,Cytb)基因进行PCR扩增,并对4个马群体的Cytb基因序列特征、遗传多样性、遗传距离、遗传分化与变异进行了分析,结合其他马群体的Cytb基因序列构建了系统发育树单位型网络关系图。结果表明:4个马群体Cytb基因序列全长1140 bp,A+T含量(54.6%)大于G+C含量(45.4%),共检测到46个多态位点,33种单倍型;总单倍型多样度为0.9332±0.0100,总核苷酸多样度为0.00385±0.00017,总平均核苷酸差异为4.3714,平均Tajima's D值和Fu's Fs值分别为-1.0352和-13.057;4个马群体间的遗传距离、遗传变异系数和基因流的范围分别为0.0035~0.0042,0.01923~0.09132,4.975~25.504;4个马群体内的遗传变异(94.54%)远大于其群体间的遗传变异(5.46%);4个马群体的33种单倍型分散于6个支系(A~F)中。说明甘肃4个马群体间亲缘关系较近,都具有较高的遗传多样性且均为多母系起源。 展开更多
关键词 线粒体DNA(mtdna) 细胞色素b(Cytb)基因 遗传多样性 系统发育
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氧化应激通过TDP-43激活mtDNA-cGAS/STING通路诱发神经元损伤和小鼠痛觉敏化 被引量:2
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作者 李丽 黄鹏辉 崔剑 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第18期2036-2045,共10页
目的探索TAR DNA结合蛋白43(transactive response DNA binding protein 43,TDP-43)在氧化应激诱导的小鼠神经元(neuro-2a,N2a)细胞损伤及小鼠痛觉敏化中的作用及机制。方法①为评估最佳诱导浓度,不同浓度的H_(2)O_(2)处理N2a细胞分为4... 目的探索TAR DNA结合蛋白43(transactive response DNA binding protein 43,TDP-43)在氧化应激诱导的小鼠神经元(neuro-2a,N2a)细胞损伤及小鼠痛觉敏化中的作用及机制。方法①为评估最佳诱导浓度,不同浓度的H_(2)O_(2)处理N2a细胞分为4组:对照组、200μmol/L H_(2)O_(2)组、400μmol/L H_(2)O_(2)组和800μmol/L H_(2)O_(2)组。②为评估最佳诱导时间,400μmol/L H_(2)O_(2)处理N2a细胞分为4组:对照组、6 h H_(2)O_(2)组、12 h H_(2)O_(2)组和24 h H_(2)O_(2)组。③为验证线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)释放途径,使用环孢素(cyclosporin,CsA)抑制线粒体通透性转换孔(mitochondrial permeability transition pore,mPTP)分为3组:对照组、24 h H_(2)O_(2)组和24 h H_(2)O_(2)+CsA组。④为验证TDP-43介导的细胞损伤机制,siRNA抑制TDP-43后分为3组:对照组、24 h H_(2)O_(2)组、24 h H_(2)O_(2)+siTDP-43组。⑤采用CCK-8检测细胞活性,EdU检测细胞增殖,Western blot检测TDP-43、神经元标志物(neuronal nuclei,NeuN)、环状GMP-AMP合酶(cylic GMP-AMP synthase,cGAS)和干扰素基因刺激因子(stimulator of interferon,STING)表达,qPCR检测mtDNA,免疫染色观察细胞内TDP-43表达变化,Calcein AM染色评估mPTP开放。⑥为验证TDP-43在神经病理性疼痛(neuropathic pain,NP)中的作用,将24只6~8周健康SPF级雄性C57BL/6J小鼠(体质量25~30 g)使用随机数字表法分为3组:对照组、慢性压迫性损伤(chronic constriction injury,CCI)组、CCI+siTDP-43组,术前1 d和术后7、14、21 d进行鞘内注射siTDP-43;术前1 d和术后1、3、5、7、14、21 d通过von Frey纤维丝和热辐射法测定小鼠机械痛阈值和热痛阈值,免疫荧光检测术后21 d腰段(L5-L6)脊髓背角中TDP-43与NeuN的变化。结果氧化应激刺激诱导N2a中TDP-43蛋白表达增加,刺激mtDNA通过mPTP释放,上调cGAS、STING的表达,影响N2a的细胞活性(P<0.05);CsA抑制mPTP通道的开放并减少mtDNA释放(P<0.05);下调TDP-43的表达后可显著降低mtDNA的释放,抑制cGAS和STING的表达,并恢复N2a细胞的增殖能力(P<0.05)。CCI术后5 d,小鼠机械痛阈值和热痛阈值出现明显下降并持续至21 d(P<0.05);CCI小鼠术后21 d脊髓背角神经元中TDP-43表达增加(P<0.05);鞘内注射siRNA抑制TDP-43后,可提高CCI小鼠的机械痛阈值和热痛阈值(P<0.05)。结论氧化应激诱导神经元细胞TDP-43蛋白增加,刺激mtDNA通过mPTP释放到细胞质,激活cGAS/STING通路,导致神经元损伤并加重CCI小鼠痛觉敏化。 展开更多
关键词 神经病理性疼痛 TDP-43 cGAS/STING通路 mtdna 氧化应激
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秦川牛mtDNA全基因组遗传多样性与母系起源研究
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作者 白萌萌 马卫东 +2 位作者 成海建 黄永震 雷初朝 《中国牛业科学》 2024年第2期11-14,共4页
[目的]从32头秦川牛全基因组中提取其mtDNA全基因组序列进行分析,以揭示秦川牛mtDNA基因组的遗传多样性与母系起源。[方法]采用mtDNA全基因组序列比对及生物信息学方法。[结果]在32头秦川牛mtDNA全基因组序列中,共检测到30种不同的单倍... [目的]从32头秦川牛全基因组中提取其mtDNA全基因组序列进行分析,以揭示秦川牛mtDNA基因组的遗传多样性与母系起源。[方法]采用mtDNA全基因组序列比对及生物信息学方法。[结果]在32头秦川牛mtDNA全基因组序列中,共检测到30种不同的单倍型,其平均单倍型多样度(Hd±SD)为0.996±0.009,其平均核苷酸多样度(π±SD)为0.0067±0.0010,表明秦川牛具有丰富的母系遗传多样性。构建的mtDNA全基因组系统发育树与单倍型网络图表明,32头秦川牛的mtDNA全基因组序列包括T2、T3、T4、I1共4个不同的支系,其中T2支系占21.88%,T3支系占40.625%,T4支系占9.375%,I1支系占28.125%。说明秦川牛具有普通牛和瘤牛两个支系,其中普通牛支系占71.88%,瘤牛支系占28.12%。[结论]秦川牛具有丰富的母系遗传多样性,有普通牛和瘤牛两个母系起源,但以普通牛起源为主。 展开更多
关键词 秦川牛 mtdna全基因组 遗传多样性 母系起源
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Parent-offspring relationship recognition based on SSR and mtDNA confirmed resource supplement effect of Fenneropenaeus chinensis release 被引量:1
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作者 Song Sun Ding Lyu +2 位作者 Xianshi Jin Xiujuan Shan Weiji Wang 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2024年第2期156-160,共5页
The resource of Fenneropenaeus chinensis has declined sharply due to excessive fishing intensity,ecological changes and diseases.In order to supplement the fishing yield and restore resources of F.chinensis,the releva... The resource of Fenneropenaeus chinensis has declined sharply due to excessive fishing intensity,ecological changes and diseases.In order to supplement the fishing yield and restore resources of F.chinensis,the relevant authorities have carried out the activities of stock enhancement and releasing.It can increase biomass and recover resources.However,compared with increasing biomass,there were still few reports on its effect on the recovery of resources.Resource recovery is a process related to whether the released individuals can form a reproductive population.Up to now,there has been a lack of evidence whether the released F.chinensis can complete the entire life history,and form reproduction population.In this study,gravid female shrimp after spawning migration were captured from coastal waters of Haiyang,Qingdao,and Yellow Sea.After identifying parentage relationships using simple sequence repeat(SSR)and mtDNA haplotype,it was finally confirmed that there were eight released individuals in the recapture samples.It was confirmed for the first time that at least part of the released F.chinensis can complete overwintering and reproductive migration,and maintain the migration habits as their wild counterparts.Therefore,we infered that the released shrimp can reproduce under natural conditions,these F.chinensis can form reproductive populations theoretically if without human intervention.These results indicated that enhancenment and release activities have a positive effect on resource recovery. 展开更多
关键词 Fenneropenaeus chinensis RELEASE simple sequence repeat(SSR) mtdna resource supplement
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基于mtDNA Cytb基因序列的新疆两个地方黄牛品种遗传多样性和系统发育研究 被引量:1
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作者 王盼盼 巴合提·博代 +2 位作者 博拉提汗·马哈托夫 曾伟欣 吾热力哈孜·哈孜汗 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第12期35-40,122,共7页
为了探讨新疆地方黄牛品种的遗传多样性和母系起源,试验以新疆2个地方黄牛品种(哈萨克牛72头和阿勒泰白头牛34头)为研究对象,利用PCR技术扩增其线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cytb)基因序列并进行多态位点、单倍型、核苷酸多样度(Pi)、单... 为了探讨新疆地方黄牛品种的遗传多样性和母系起源,试验以新疆2个地方黄牛品种(哈萨克牛72头和阿勒泰白头牛34头)为研究对象,利用PCR技术扩增其线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cytb)基因序列并进行多态位点、单倍型、核苷酸多样度(Pi)、单倍型多样度(Hd)及平均核苷酸差异(K)和中性检验分析,并与我国部分黄牛品种的mtDNA Cytb基因序列进行综合分析以探讨二者的母系起源。结果表明:哈萨克牛和阿勒泰白头牛Cytb基因序列全长为463 bp, A、T、C三种碱基含量均为32.3%、27.0%、 26.2%,G碱基含量分别为14.5%和14.6%;A+T含量均为59.3%,G+C含量分别为40.7%和40.8%,A+T含量高于G+C含量;共检测到19个多态位点,包含12个转换、4个颠换和3个颠换/转换,其中单一多态位点10个,简约信息位点9个,导致6个氨基酸发生错义突变;19个多态位点共定义了24种单倍型(即Hap-1~24),总单倍型多样度为0.701±0.046,总核苷酸多样度为0.003 45±0.000 46,平均核苷酸差异为1.598;72头哈萨克牛Cytb基因序列的单倍型多样度为0.674±0.059,核苷酸多样度为0.003 28±0.000 53,且中性检验结果不显著(0.050.10);哈萨克牛和阿勒泰白头牛的优势单倍型均为Hap-1、Hap-6、Hap-3,起源于德国普通牛和瘤牛两大混合母系,以德国普通牛血统为主。说明哈萨克牛和阿勒泰白头牛的遗传多样性较匮乏,且有两个共同的母系祖先。 展开更多
关键词 新疆黄牛 哈萨克牛 阿勒泰白头牛 线粒体DNA(mtdna) 细胞色素b(Cytb)基因 遗传多样性 系统发育
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原发性心肌病猝死心肌mtDNA^(4977)缺失变化
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作者 陈新山 楼迪栋 张益鹄 《中国法医学杂志》 CSCD 2005年第5期268-270,共3页
目的探讨原发性心肌病(PCM)猝死者心肌线粒体DNA(m tDNA4977)缺失情况及其与猝死的关系。方法对18例PCM猝死和28例对照组病例心肌组织蜡块,用常规方法提取心肌m tDNA,以PCR、琼脂糖紫外凝胶成像技术确定扩增产物激光密度,初步定量检测m ... 目的探讨原发性心肌病(PCM)猝死者心肌线粒体DNA(m tDNA4977)缺失情况及其与猝死的关系。方法对18例PCM猝死和28例对照组病例心肌组织蜡块,用常规方法提取心肌m tDNA,以PCR、琼脂糖紫外凝胶成像技术确定扩增产物激光密度,初步定量检测m tDNA4977缺失率。结果PCM猝死18例中,检见13例m tDNA4977缺失,占72.44%。对照组28例中,检见3例m tDNA4977缺失,占10.71%;两组病例m tDNA4977缺失率均值分别为0.5795和0.0744,差异有非常显著性意义。结论多数PCM,特别是扩张型心肌病猝死者心肌可检见m tDNA4977缺失;提示其心肌m tDNA4977缺失变化与PCM猝死的发生可能有一定关系。 展开更多
关键词 法医病理学 猝死 原发性心肌病 mtdna缺失 mtdna^4977 原发性心肌病 猝死 扩张型心肌病 心肌线粒体 mtdna PCM 组织蜡块 常规方法 扩增产物
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受损神经来源的mtDNA通过GRP75增加线粒体内Ca2+水平诱导U87细胞凋亡和小鼠痛觉敏化
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作者 黄鹏辉 李丽 崔剑 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第18期2081-2091,共11页
目的探讨受损神经来源的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)对人脑星形胶质母细胞瘤细胞(human glioblastoma cell line U-87MG,U87)内GRP75蛋白表达、线粒体Ca^(2+)水平、细胞凋亡的影响,及其诱导小鼠痛觉敏化的机制。方法采用坐骨神... 目的探讨受损神经来源的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)对人脑星形胶质母细胞瘤细胞(human glioblastoma cell line U-87MG,U87)内GRP75蛋白表达、线粒体Ca^(2+)水平、细胞凋亡的影响,及其诱导小鼠痛觉敏化的机制。方法采用坐骨神经慢性缩窄(chronic constriction injury,CCI)建立小鼠神经病理性疼痛(neuropathic pain,NeP)模型,采用随机数字表法将20只C57BL/6雄性小鼠(6~8周龄,体质量20~30 g)分为4组:假手术组、CCI-7天组、CCI-14天组、CCI-21天组,行为学检测痛觉敏化情况,实时荧光定量PCR法(quantitative Real-time PCR,qPCR)检测小鼠脊髓中mtDNA含量变化。从H_(2)O_(2)处理的人神经母细胞瘤细胞(human neuroblastoma cell line SH-SY5Y,SH-SY5Y)提取mtDNA。采用浓度为0~1 ng/μL的mtDNA处理U87细胞。CCK-8检测细胞活力变化,根据结果选择适宜的实验浓度。将U87细胞分为5组:对照组、mtDNA组、mtDNA+GRP75抑制剂(MKT-0771μg/mL)组、mtDNA+钙螯合剂(BAPTA-AM 10μmol/L)组和mtDNA+MKT-077+BAPTA-AM组,mtDNA处理前2 h分别予以MKT-077、BAPTA-AM预处理。Western blot检测GRP75蛋白(glucose-regulated protein 75,GRP75)的表达,内质网-线粒体共定位染色观察内质网-线粒体连接;钙离子荧光探针检测线粒体Ca^(2+)水平;活性氧(reactive oxygen species,ROS)及线粒体膜电位检测评估线粒体氧化应激功能;PI荧光标记检测U87细胞凋亡率。结果与假手术组相比,CCI-21天组小鼠脊髓中用于检测mtDNA含量的细胞色素c氧化酶I(cytochrome c oxidase I,CO1)和NADH脱氢酶亚基1(nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase 1,ND1)均升高,CO1:1.01±0.20 vs 2.22±0.26(P<0.05),ND1:1.00±0.12 vs 1.79±0.07(P<0.05)。CCK-8结果显示:mtDNA(1 ng/μL)可抑制U87细胞活力(P<0.01);0.2 ng/μL mtDNA可上调GRP75蛋白的表达(P<0.05),促进内质网-线粒体偶联,增加线粒体Ca^(2+)水平(109.4±62.6 vs 540.3±150.3,P<0.05),并诱使线粒体释放ROS增多(P<0.05)。MKT-077或/和BAPTA-AM处理后,线粒体Ca^(2+)量减少,线粒体膜电位改善,PI检测显示U87细胞凋亡率降低[mtDNA组vs mtDNA+MKT-077组:(18.39±2.09)vs(13.22±1.42),P<0.05;mtDNA组vs mtDNA+BAPTA-AM组:(18.39±2.09)vs(12.09±1.53),P<0.05;mtDNA组vs mtDNA+MKT-077+BAPTA-AM组:(18.39±2.09)vs(11.65±2.09),P<0.05]。结论受损神经来源的mtDNA可上调GRP75蛋白的表达、干扰线粒体Ca^(2+)水平、加剧线粒体氧化应激,以诱导U87细胞凋亡,这可能是一种参与NeP形成的新机制。 展开更多
关键词 神经病理性疼痛 mtdna GRP75 凋亡
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苏尼特家养双峰驼mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的遗传多样性 被引量:3
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作者 张成东 任战军 杨雪娇 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2015年第3期32-42,共11页
【目的】研究苏尼特家养双峰驼的遗传多样性,以全面揭示中国双峰驼的起源进化,为科学保护和利用我国的双峰驼遗传资源奠定基础。【方法】采集15峰苏尼特家养双峰驼(10峰雄驼和5峰雌驼)的血样,提取其DNA,采用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA... 【目的】研究苏尼特家养双峰驼的遗传多样性,以全面揭示中国双峰驼的起源进化,为科学保护和利用我国的双峰驼遗传资源奠定基础。【方法】采集15峰苏尼特家养双峰驼(10峰雄驼和5峰雌驼)的血样,提取其DNA,采用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cyt b)基因的全序列及D-loop的671bp序列,进行遗传多样性分析,并结合GenBank中已有的双峰驼的mtDNACyt b基因序列和D-loop序列进行系统发育分析。【结果】苏尼特家养双峰驼mtDNACyt b基因中存在10个变异位点,共形成了7种单倍型,单倍型多样度为0.857±0.065,核苷酸多样度为0.001 94±0.002 70,平均核苷酸差异数为2.210;在D-loop的671bp序列中,存在6个变异位点,共定义了6种单倍型,单倍型多样度为0.714±0.116,核苷酸多样度为0.002 53±0.002 75,平均核苷酸差异数为1.695。基于Cyt b基因和D-loop序列进行的系统发育分析均显示,苏尼特家养双峰驼与野生双峰驼归于2个不同的母系世系,野生双峰驼不是苏尼特家养双峰驼的直接祖先。【结论】苏尼特家养双峰驼mtDNA Cyt b基因和D-loop序列遗传多态性均比较丰富;苏尼特家养双峰驼与野生双峰驼归于2个不同的母系世系,野生双峰驼不是苏尼特家养双峰驼的直接祖先;家养双峰驼内部存在着一定的遗传分化。 展开更多
关键词 苏尼特家养双峰驼 mtdnaCyt B基因 mtdna D-loop序列
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DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒在案件中的应用研究
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作者 杨乐 陈滢 +4 位作者 吴俞衡 石妍 齐朝阳 孔祥仕 马温华 《刑事技术》 2024年第3期255-261,共7页
本文探讨DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒在案件中应用的可行性。应用DNATyper mtDNASNP60^(TM)试剂盒对100个汉族无关个体和20组全同胞进行mtDNA SNP检验;取25 pg/μL马、牛、羊、猪、鸡、鸭、猫、狗、兔、鼠和大肠杆菌的DNA样品进行... 本文探讨DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒在案件中应用的可行性。应用DNATyper mtDNASNP60^(TM)试剂盒对100个汉族无关个体和20组全同胞进行mtDNA SNP检验;取25 pg/μL马、牛、羊、猪、鸡、鸭、猫、狗、兔、鼠和大肠杆菌的DNA样品进行种属特异性测试;取5、10、20、40μmol/L血红素进行抗抑制性测试;取两个批次的DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒经反复冻融10次后进行稳定性测试;分别应用VeriFiler^(TM)Plus PCR扩增试剂盒和DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒对100份陈旧、腐败、降解检材进行检验。结果表明,100个汉族无关个体均获得清晰的mtDNA SNP分型结果,其检验结果与通过mtDNA测序获得的结果完全一致;100个汉族无关个体含有100种不同的单倍型;20组全同胞中每组个体之间mtDNA SNP分型结果相同;DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒对马、牛、羊、猪、鸡、鸭、猫、狗、兔、鼠和大肠杆菌的DNA样品进行检测,均未出现特异性分型;当血红素浓度≤40μmol/L时,所有mtDNA SNP位点均获得正确分型;两个批次的DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒经反复冻融10次后,所有mtDNA SNP位点均可正确分型;对于100份陈旧、腐败、降解检材,STR检出率为55%,mtDNA SNP的检出率为86%,mtDNA SNP的检出率显著高于STR。当模板DNA浓度大于5 pg/μL时,DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒能得到完整的分型谱图。综上,DNATyper mtDNA-SNP60^(TM)试剂盒可应用于陈旧、腐败、降解检材的检验,具有很好的实战应用价值。 展开更多
关键词 法医遗传学 DNATyper mtdna-SNP60^(TM)试剂盒 线粒体DNA 单核苷酸多态性 VeriFiler^(TM)Plus PCR扩增试剂盒 短串联重复序列
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基于mtDNA COⅠ基因序列的山香圆平背粉虱遗传多样性分析 被引量:1
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作者 孟泽洪 王威锐 +3 位作者 罗林丽 李帅 蒲运丹 周玉锋 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期74-79,共6页
为探究茶树害虫山香圆平背粉虱(Crenidorsum turpiniae)的遗传多样性,掌握山香圆平背粉虱的遗传分化现状及精准防控提供理论依据,通过基因组DNA提取、PCR扩增与测序,测定贵州省11个不同地理区域的山香圆平背粉虱种群mtDNA COⅠ基因序列... 为探究茶树害虫山香圆平背粉虱(Crenidorsum turpiniae)的遗传多样性,掌握山香圆平背粉虱的遗传分化现状及精准防控提供理论依据,通过基因组DNA提取、PCR扩增与测序,测定贵州省11个不同地理区域的山香圆平背粉虱种群mtDNA COⅠ基因序列片段,开展基因序列特征、单倍型及遗传多样性、遗传分化与基因交流、分子变异和单倍型系统发育分析。结果表明,山香圆平背粉虱mtDNA COⅠ基因序列片段扩增长度均为658 bp,序列具有明显的A+T偏倚性,共定义10个单倍型。贵州茶园山香圆平背粉虱总群体遗传多样性较高,表现出高单倍型多样性(Hd=0.800)和高核苷酸多样性(Pi=0.067 0)。11个地理种群的山香圆平背粉虱总群体遗传分化程度高(Fst=0.920 3),基因交流水平低(Nm=0.04)。AMOVA分析显示,山香圆平背粉虱的遗传变异主要来自组间(FCT=0.912 9);中性检验与错配分布分析综合表明,山香圆平背粉虱近期未发生过明显扩张现象;单倍型系统发育分析及中介网络图聚类结果均表明,山香圆平背粉虱聚为3分支,分化枝可能已达物种水平。 展开更多
关键词 茶树新害虫 山香圆平背粉虱 线粒体COⅠ基因 遗传多样性 遗传分化
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利用mtDNA COⅠ基因序列鉴定我国烟粉虱的生物型 被引量:212
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作者 罗晨 姚远 +3 位作者 王戎疆 阎凤鸣 胡敦孝 张芝利 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期759-763,共5页
利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。... 利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。在 5个种群的基因片段上 ,截取与Texas B型相应的 72 0bp的序列分析 ,结果表明所测序列中只有 2个碱基与Texas B型不同 ,序列相似性为 99 7% ;在西安一品红种群和新疆吐鲁番棉花种群的原序列中截取与Arizona B型序列相应的4 2 3bp片段 ,分析表明这两个种群与AZB3型属于同一个单倍型。因此 ,我国烟粉虱 5个实验种群的生物型与Texas B型和Arizona B型种群为同一生物型“B”。 展开更多
关键词 mtdna COⅠ基因序列 鉴定 烟粉虱 生物型
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云南黄牛和大额牛的mtDNA多态性研究 被引量:55
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作者 兰宏 熊习昆 +2 位作者 林世英 刘爱华 施立明 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1993年第5期419-425,共7页
本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南... 本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南黄牛的相类似。云南黄牛可能具有两种起源,即普通黄牛起源和瘤牛起源。今天的云南黄牛群体是这两种类型的混合。大额牛的限制性类型与瘤牛相同,表明大额牛的起源与瘤牛有密切关系。 展开更多
关键词 云南黄牛 mtdna 遗传 多态现象
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中国5种珍稀绢蝶非损伤性取样的mtDNA序列及系统进化 被引量:45
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作者 陈永久 张亚平 +4 位作者 沈发荣 张云武 杨大荣 聂龙 杨跃雄 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1999年第3期203-207,共5页
应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,... 应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,该5种绢蝶间DNA序列变异丰富。PAUP3.1.1(简约法)数据分析软件构建该5个种绢蝶的分子系统树显示,爱珂绢蝶(Parnassiusacco)和巴裔绢蝶(Parnassiusbaileyi)的亲缘关系比较接近,阿波罗绢蝶(Parnassiusapollo)、珍珠绢蝶(Parnassiusorlears)和西猴绢蝶(Parnassiussimo)3种绢蝶均为相对独立的一支,其中西猴绢蝶分化较早,与形态学研究结果相吻合。 展开更多
关键词 绢蝶 非损伤性取样 mtdna 系统进化
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中国大陆梅花鹿mtDNA控制区序列变异及种群遗传结构分析 被引量:31
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作者 刘海 杨光 +2 位作者 魏辅文 李明 胡锦矗 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期53-60,共8页
测定了 37只中国大陆梅花鹿 (Cervusnippon)不同种群mtDNA控制区 5′端 35 1bp的序列 ,共发现 2 3个变异位点 ,定义了 5种单元型。分子变异分析表明 ,中国大陆梅花鹿出现了显著的种群分化 (Φst=0 45 ,Fst=0 6 0 ,P <0 0 0 1) ,... 测定了 37只中国大陆梅花鹿 (Cervusnippon)不同种群mtDNA控制区 5′端 35 1bp的序列 ,共发现 2 3个变异位点 ,定义了 5种单元型。分子变异分析表明 ,中国大陆梅花鹿出现了显著的种群分化 (Φst=0 45 ,Fst=0 6 0 ,P <0 0 0 1) ,支持把分布于东北、华南和四川的梅花鹿种群归入各自独立的管理单元。中国大陆、日本南部和日本北部之间无共享单元型 ,且有 2 5个鉴别位点。最小跨度网络图 (Minimumspanningnetwork ,MSN)和基于最大似然法和邻接法的系统发生分析均把单元型聚类为对应于中国大陆、日本南部和日本北部的三个单系 ,其中中国大陆和日本南部梅花鹿有相对较近的亲缘关系 ,支持日本梅花鹿的祖先通过至少两个大陆桥从亚洲迁移到日本的观点 [动物学报 49(1) :5 3~ 6 0 ,2 0 0 3]。 展开更多
关键词 中国大陆梅花鹿 mtdna 控制区序列 变异 种群 遗传结构
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