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mtDNA的非同义突变与人类有氧耐力的获得及保护
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作者 漆正堂 高婧怡 刘微娜 《广州体育学院学报》 北大核心 2025年第4期82-90,共9页
线粒体DNA(mtDNA)对能量需求相关的选择压力表现出极高的敏感性,并且具有较高的突变率。其中,非同义突变对能量代谢的影响尤为显著,因此在一定程度上可以反映人类有氧耐力的获得进程。在哺乳动物和鸟类的研究中发现,运动能力的退化与能... 线粒体DNA(mtDNA)对能量需求相关的选择压力表现出极高的敏感性,并且具有较高的突变率。其中,非同义突变对能量代谢的影响尤为显著,因此在一定程度上可以反映人类有氧耐力的获得进程。在哺乳动物和鸟类的研究中发现,运动能力的退化与能量代谢约束放松后mtDNA非同义突变的积累有关。与其他灵长类动物相比,mtDNA非同义突变以及核DNA的协同进化使得人类选择性地获得了有氧耐力。由于现代社会能量的易获性以及耐力运动的非必要性,人类mtDNA的非同义突变积累逐渐增多,占据基因池甚至引发更多慢性代谢性疾病。从哺乳动物和鸟类的mtDNA非同义突变与运动能力退化的关系判断,人类主动设置能量代谢的约束条件,即主动进行有氧运动可保持mtDNA的纯洁性、防止mtDNA非同义突变,从个体和进化两个时间尺度上维系人类健康。 展开更多
关键词 mtdna 非同义突变 人类有氧耐力 有氧运动 慢性疾病
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黑龙江省南部小飞鼠种群mtDNA控制区的遗传结构
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作者 田新民 王佳琪 +2 位作者 白小珍 刘涵奇 石兰英 《动物学杂志》 北大核心 2025年第2期213-223,共11页
小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物,受森林采伐与栖息地丧失等因素影响,其种群数量与分布在不断减少。为增强保护与管理的针对性,亟需对其种群的遗传变化,特别是遗传多样性与基因流等种群遗传信息开展进一步评价。本研... 小飞鼠(Pteromys volans)为树栖夜行滑行类啮齿动物,受森林采伐与栖息地丧失等因素影响,其种群数量与分布在不断减少。为增强保护与管理的针对性,亟需对其种群的遗传变化,特别是遗传多样性与基因流等种群遗传信息开展进一步评价。本研究在黑龙江省南部的方正、宾县、苇河和穆棱4个重点研究区域,分别采集到20、26、15和27只小飞鼠个体的毛发样本,采用mt DNA控制区全序列(1070 bp)评估其种群遗传多样性与遗传结构。研究发现,在88个小飞鼠控制区全序列中,共检测到155个变异位点和67个单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.992(0.945~0.986),核苷酸多样性(Pi)为1.772%(1.221%~1.974%),仅单倍型H_20为宾县与苇河种群共享,只有1只个体的单倍型有52个,其稀有单倍型高达77.16%(52/67);种群之间遗传分化系数(FST)为0.0513~0.1357(P<0.05),基因流(Nm)为3.19~9.24;种群之间遗传分化程度与地理距离的Mantel检验呈现不显著的正相关(r=0.413,P>0.05)。结果表明,小飞鼠种群遗传多样性丰富,其中,苇河和穆棱种群最高、宾县种群次之、方正种群最低,高比例稀有单倍型提示,未来种群存在遗传多样性下降的风险;4个地理种群之间均存在显著的中等水平遗传分化,距离隔离模型不能有效地解释小飞鼠种群目前遗传格局的形成;系统进化树与单倍型网络图没有呈现出明显的系统地理格局,其种群间基因流的限制可能是近期出现的。研究结果提示,需开展栖息地修复和生态廊道构建,从而实现该物种的种群增长与扩散。 展开更多
关键词 小飞鼠 mtdna控制区 种群遗传结构 遗传多样性
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基于mtDNA D-Loop片段的饶羊个体母系血统分子鉴定
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作者 高程远 刘从 +2 位作者 彭宝松 田树军 陈晓勇 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第11期144-150,共7页
本研究旨在从基因水平鉴别未知个体羊与饶湖后代个体(饶羊与湖羊杂交)、饶寒后代个体(饶羊与小尾寒羊杂交)、以及湖寒四元后代个体(湖羊和小尾寒羊为母本四元杂交)母系血统,建立一种准确简便高效的血统身份分子诊断方法,为绵羊亲缘关系... 本研究旨在从基因水平鉴别未知个体羊与饶湖后代个体(饶羊与湖羊杂交)、饶寒后代个体(饶羊与小尾寒羊杂交)、以及湖寒四元后代个体(湖羊和小尾寒羊为母本四元杂交)母系血统,建立一种准确简便高效的血统身份分子诊断方法,为绵羊亲缘关系、品种资源调查、品种保护提供技术支撑。以饶羊(湖羊、小尾寒羊为母本培育的新种群)、小尾寒羊、湖羊为研究对象,采用测序方法获得线粒体基因组D-Loop片段序列,通过两两比较方法分析上述每个品种内个体间D-Loop区序列变异范围,根据饶羊、小尾寒羊、湖羊3个种群个体间D-Loop区相似度范围,探索设计开发未知个体母系血统鉴别方法。结果表明,饶羊个体间D-Loop片段相似度为92.02%~96.88%,湖羊个体间D-Loop片段相似度为97.36%~99.66%,小尾寒羊个体间D-Loop片段相似度为97.01%~99.92%,饶羊与湖羊个体线粒体D-Loop序列相似度为93.01%~96.97%,饶羊与小尾寒羊个体线粒体D-Loop序列相似度为93.03%~96.85%。综上,当未知个体与饶羊群体D-Loop序列相似度大于92.02%,且未知个体与湖羊D-Loop序列相似度为93.01%~96.97%,与小尾寒羊D-Loop序列相似度为93.03%~96.85%时,即该未知个体既含有湖羊血统又含有小尾寒羊血统,该未知个体与饶羊有相同的母系血统。本研究建立了一种基于mtDNA D-Loop片段的饶羊个体母系血统的两步法分子诊断方法,该方法可以同时鉴别未知个体是否含有饶羊、湖羊、小尾寒羊母系血统。 展开更多
关键词 饶羊 母系血统 湖羊 小尾寒羊 mtdna D-LOOP
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原发性心肌病猝死心肌mtDNA^(4977)缺失变化
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作者 陈新山 楼迪栋 张益鹄 《中国法医学杂志》 CSCD 2005年第5期268-270,共3页
目的探讨原发性心肌病(PCM)猝死者心肌线粒体DNA(m tDNA4977)缺失情况及其与猝死的关系。方法对18例PCM猝死和28例对照组病例心肌组织蜡块,用常规方法提取心肌m tDNA,以PCR、琼脂糖紫外凝胶成像技术确定扩增产物激光密度,初步定量检测m ... 目的探讨原发性心肌病(PCM)猝死者心肌线粒体DNA(m tDNA4977)缺失情况及其与猝死的关系。方法对18例PCM猝死和28例对照组病例心肌组织蜡块,用常规方法提取心肌m tDNA,以PCR、琼脂糖紫外凝胶成像技术确定扩增产物激光密度,初步定量检测m tDNA4977缺失率。结果PCM猝死18例中,检见13例m tDNA4977缺失,占72.44%。对照组28例中,检见3例m tDNA4977缺失,占10.71%;两组病例m tDNA4977缺失率均值分别为0.5795和0.0744,差异有非常显著性意义。结论多数PCM,特别是扩张型心肌病猝死者心肌可检见m tDNA4977缺失;提示其心肌m tDNA4977缺失变化与PCM猝死的发生可能有一定关系。 展开更多
关键词 法医病理学 猝死 原发性心肌病 mtdna缺失 mtdna^4977 原发性心肌病 猝死 扩张型心肌病 心肌线粒体 mtdna PCM 组织蜡块 常规方法 扩增产物
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西藏自治区10个黄牛群体的mtDNA遗传多样性与母系起源研究
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作者 姚婷婷 李昊 +9 位作者 阎卉萱 曹一凡 次仁罗布 索朗曲吉 尼玛仓决 赵丽 旦增洛桑 斯朗旺姆 巴桑珠扎 陈宁博 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期2194-2202,共9页
旨在探究西藏自治区10个黄牛群体的线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。本研究通过线粒体基因组序列比对对西藏自治区10个黄牛群体的167个个体的线粒体基因组序列进行分析,重点探究其线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。通过系统发... 旨在探究西藏自治区10个黄牛群体的线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。本研究通过线粒体基因组序列比对对西藏自治区10个黄牛群体的167个个体的线粒体基因组序列进行分析,重点探究其线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。通过系统发育学和遗传多样性分析,检测到167个黄牛拥有120种单倍型,其中包括普通牛的T2、T3和T4单倍型,原牛的Q单倍型;瘤牛的I1和I2单倍型;以及牦牛的单倍型。T3单倍型还包括T3119和T3055两个东亚普通牛特异的亚单倍型。线粒体基因组遗传多样性分析结果显示,巴桑牛的单倍型多样度最高,为0.990±0.028,白朗牛的最低,为0.867±0.107;核苷酸多样度最高的为吉隆牛0.030±0.0005,最低的为日喀则牛0.001±0.0002。系统发育树和单倍型网络图表明,10个黄牛群体主要为普通牛母系起源,有少量牦牛及瘤牛母系起源。总体而言,10个黄牛群体均具有较高的遗传多样性,具有普通牛、瘤牛和牦牛的母系起源,表明这10个黄牛群体母系遗传多样性丰富,并且和牦牛之间存在基因交流。这些结果对于深入理解西藏自治区黄牛的遗传演化机制以及合理保护和利用这一珍贵遗传资源具有重要意义。 展开更多
关键词 西藏自治区 mtdna基因组 遗传多样性
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石潭鸡与中国地方鸡种mtDNA密码子偏好性分析
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作者 张梦萍 林明昕 +3 位作者 吴忠亮 罗景飞 陈珊对儿 吴琼 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第12期5772-5784,共13页
【目的】分析石潭鸡与中国其他地方鸡种线粒体DNA(mtDNA)基因序列的密码子使用模式及特性,探究石潭鸡与中国主要地方鸡种的进化关系。【方法】获取10只健康成年石潭鸡的mtDNA基因序列,采用CodonW 1.4.2软件分析其与中国17个地方鸡种mtDN... 【目的】分析石潭鸡与中国其他地方鸡种线粒体DNA(mtDNA)基因序列的密码子使用模式及特性,探究石潭鸡与中国主要地方鸡种的进化关系。【方法】获取10只健康成年石潭鸡的mtDNA基因序列,采用CodonW 1.4.2软件分析其与中国17个地方鸡种mtDNA基因密码子使用偏好性,计算密码子偏好参数,并进行偏好性密码子的聚类分析、氨基酸分析、因子相关性及基因序列的聚类分析。【结果】石潭鸡与中国主要地方鸡种的mtDNA序列均倾向于使用以C碱基结尾的密码子,而以G碱基结尾的密码子使用频率较低。石潭鸡以CGA、CUA、ACC、UUC等27个密码子的相对密码子使用度(RSCU)均>1,为偏好性密码子。石潭鸡与桃源鸡、五华三黄鸡、广西三黄鸡、如皋黄鸡、海南文昌鸡、河田鸡和皖南三黄鸡的密码子偏好性相近,进一步选取上述7个鸡种展开分析,明确石潭鸡与该群体在遗传层面的关联特征,氨基酸组成分析显示,石潭鸡线粒体中亮氨酸含量最高,其次为异亮氨酸和苏氨酸,8个鸡种以AC和GU结尾的密码子呈现明显分化,且AC结尾密码子的含量较高。基于mtDNA基因序列的聚类分析发现,石潭鸡与如皋黄鸡的亲缘关系最近。【结论】石潭鸡与中国主要地方鸡种mtDNA序列均表现出以C碱基结尾密码子的显著偏好,且AC结尾的密码子含量相对较高;石潭鸡线粒体中亮氨酸含量最高,与如皋黄鸡的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 石潭鸡 mtdna 密码子偏好性 进化分析
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苏尼特家养双峰驼mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的遗传多样性 被引量:3
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作者 张成东 任战军 杨雪娇 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2015年第3期32-42,共11页
【目的】研究苏尼特家养双峰驼的遗传多样性,以全面揭示中国双峰驼的起源进化,为科学保护和利用我国的双峰驼遗传资源奠定基础。【方法】采集15峰苏尼特家养双峰驼(10峰雄驼和5峰雌驼)的血样,提取其DNA,采用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA... 【目的】研究苏尼特家养双峰驼的遗传多样性,以全面揭示中国双峰驼的起源进化,为科学保护和利用我国的双峰驼遗传资源奠定基础。【方法】采集15峰苏尼特家养双峰驼(10峰雄驼和5峰雌驼)的血样,提取其DNA,采用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cyt b)基因的全序列及D-loop的671bp序列,进行遗传多样性分析,并结合GenBank中已有的双峰驼的mtDNACyt b基因序列和D-loop序列进行系统发育分析。【结果】苏尼特家养双峰驼mtDNACyt b基因中存在10个变异位点,共形成了7种单倍型,单倍型多样度为0.857±0.065,核苷酸多样度为0.001 94±0.002 70,平均核苷酸差异数为2.210;在D-loop的671bp序列中,存在6个变异位点,共定义了6种单倍型,单倍型多样度为0.714±0.116,核苷酸多样度为0.002 53±0.002 75,平均核苷酸差异数为1.695。基于Cyt b基因和D-loop序列进行的系统发育分析均显示,苏尼特家养双峰驼与野生双峰驼归于2个不同的母系世系,野生双峰驼不是苏尼特家养双峰驼的直接祖先。【结论】苏尼特家养双峰驼mtDNA Cyt b基因和D-loop序列遗传多态性均比较丰富;苏尼特家养双峰驼与野生双峰驼归于2个不同的母系世系,野生双峰驼不是苏尼特家养双峰驼的直接祖先;家养双峰驼内部存在着一定的遗传分化。 展开更多
关键词 苏尼特家养双峰驼 mtdnaCyt B基因 mtdna D-loop序列
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利用mtDNA COⅠ基因序列鉴定我国烟粉虱的生物型 被引量:213
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作者 罗晨 姚远 +3 位作者 王戎疆 阎凤鸣 胡敦孝 张芝利 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期759-763,共5页
利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。... 利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。在 5个种群的基因片段上 ,截取与Texas B型相应的 72 0bp的序列分析 ,结果表明所测序列中只有 2个碱基与Texas B型不同 ,序列相似性为 99 7% ;在西安一品红种群和新疆吐鲁番棉花种群的原序列中截取与Arizona B型序列相应的4 2 3bp片段 ,分析表明这两个种群与AZB3型属于同一个单倍型。因此 ,我国烟粉虱 5个实验种群的生物型与Texas B型和Arizona B型种群为同一生物型“B”。 展开更多
关键词 mtdna COⅠ基因序列 鉴定 烟粉虱 生物型
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云南黄牛和大额牛的mtDNA多态性研究 被引量:55
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作者 兰宏 熊习昆 +2 位作者 林世英 刘爱华 施立明 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1993年第5期419-425,共7页
本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南... 本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南黄牛的相类似。云南黄牛可能具有两种起源,即普通黄牛起源和瘤牛起源。今天的云南黄牛群体是这两种类型的混合。大额牛的限制性类型与瘤牛相同,表明大额牛的起源与瘤牛有密切关系。 展开更多
关键词 云南黄牛 mtdna 遗传 多态现象
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中国5种珍稀绢蝶非损伤性取样的mtDNA序列及系统进化 被引量:45
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作者 陈永久 张亚平 +4 位作者 沈发荣 张云武 杨大荣 聂龙 杨跃雄 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 1999年第3期203-207,共5页
应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,... 应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,该5种绢蝶间DNA序列变异丰富。PAUP3.1.1(简约法)数据分析软件构建该5个种绢蝶的分子系统树显示,爱珂绢蝶(Parnassiusacco)和巴裔绢蝶(Parnassiusbaileyi)的亲缘关系比较接近,阿波罗绢蝶(Parnassiusapollo)、珍珠绢蝶(Parnassiusorlears)和西猴绢蝶(Parnassiussimo)3种绢蝶均为相对独立的一支,其中西猴绢蝶分化较早,与形态学研究结果相吻合。 展开更多
关键词 绢蝶 非损伤性取样 mtdna 系统进化
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中国大陆梅花鹿mtDNA控制区序列变异及种群遗传结构分析 被引量:31
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作者 刘海 杨光 +2 位作者 魏辅文 李明 胡锦矗 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期53-60,共8页
测定了 37只中国大陆梅花鹿 (Cervusnippon)不同种群mtDNA控制区 5′端 35 1bp的序列 ,共发现 2 3个变异位点 ,定义了 5种单元型。分子变异分析表明 ,中国大陆梅花鹿出现了显著的种群分化 (Φst=0 45 ,Fst=0 6 0 ,P <0 0 0 1) ,... 测定了 37只中国大陆梅花鹿 (Cervusnippon)不同种群mtDNA控制区 5′端 35 1bp的序列 ,共发现 2 3个变异位点 ,定义了 5种单元型。分子变异分析表明 ,中国大陆梅花鹿出现了显著的种群分化 (Φst=0 45 ,Fst=0 6 0 ,P <0 0 0 1) ,支持把分布于东北、华南和四川的梅花鹿种群归入各自独立的管理单元。中国大陆、日本南部和日本北部之间无共享单元型 ,且有 2 5个鉴别位点。最小跨度网络图 (Minimumspanningnetwork ,MSN)和基于最大似然法和邻接法的系统发生分析均把单元型聚类为对应于中国大陆、日本南部和日本北部的三个单系 ,其中中国大陆和日本南部梅花鹿有相对较近的亲缘关系 ,支持日本梅花鹿的祖先通过至少两个大陆桥从亚洲迁移到日本的观点 [动物学报 49(1) :5 3~ 6 0 ,2 0 0 3]。 展开更多
关键词 中国大陆梅花鹿 mtdna 控制区序列 变异 种群 遗传结构
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鲤属鱼类mtDNA控制区(D-环区)序列的变异性分析 被引量:27
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作者 郑冰蓉 张亚平 +2 位作者 肖蘅 蓝家湖 昝瑞光 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期289-294,共6页
采用PCR-测序技术对我国鲤属7个种、亚种和2个品种共62个个体(其中鲤的样品包括采自长江、黄河、松花江三个水系的共4个种群),进行了mtDNA控制区(D-环区)始自3’端共459bp碱基的序列测定,发现其D-环区3’端至中央保守区之间不似其他鱼... 采用PCR-测序技术对我国鲤属7个种、亚种和2个品种共62个个体(其中鲤的样品包括采自长江、黄河、松花江三个水系的共4个种群),进行了mtDNA控制区(D-环区)始自3’端共459bp碱基的序列测定,发现其D-环区3’端至中央保守区之间不似其他鱼类和哺乳类是一个单一的高变区,而是在其内部还插有一段长约110bp的保守区,这很可能是鲤属鱼类mtDNA D-环区自身的一个特点。 展开更多
关键词 鲤属 鱼类 mtdna控制区 D-环区 变异性 线粒体 序列分析
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四川马铃薯晚疫病菌交配型、生理小种、甲霜灵敏感性及mtDNA单倍型组成分析 被引量:28
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作者 李洪浩 彭化贤 +2 位作者 席亚东 王晓黎 刘波微 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期728-736,共9页
【目的】对马铃薯晚疫病菌群体特征进行系统分析,为马铃薯晚疫病的防控提供科学依据。【方法】对2008—2011年采集自四川的马铃薯晚疫病菌的交配型、甲霜灵敏感性、生理小种及mtDNA单倍型进行分析。【结果】四川马铃薯晚疫病菌以A2交配... 【目的】对马铃薯晚疫病菌群体特征进行系统分析,为马铃薯晚疫病的防控提供科学依据。【方法】对2008—2011年采集自四川的马铃薯晚疫病菌的交配型、甲霜灵敏感性、生理小种及mtDNA单倍型进行分析。【结果】四川马铃薯晚疫病菌以A2交配型为主,占测定菌株的62.5%,A1交配型和自育型菌株的发生频率分别为18.8%和18.4%,A1交配型菌株集中在九龙县和普格县。192个菌株中共测定出55个生理小种,其中生理小种1.2.3.4.5.6.7.8.9.10.11发生频率最高,99.48%的供试菌株含有多个毒力基因。甲霜灵敏感性测定发现四川马铃薯晚疫病菌群体包含抗性、中抗和敏感菌株,分别占测定菌株的63.0%、22.0%和15.0%,敏感菌株分布于普格县、道孚县和九龙县。检测到四川马铃薯晚疫病菌有Ⅰa和Ⅱa两种单倍型,分别占测定菌株的97.4%和2.6%,为第二次全球迁移后出现的"新"群体,Ⅰa单倍型马铃薯晚疫病菌广泛分布于四川各马铃薯产区,其中存在A1交配型、A2交配型、自育型和未知交配型菌株。【结论】四川马铃薯晚疫病菌群体组成日趋复杂,亟待发掘新抗源和培育水平抗病品种,以及合理布局已有抗病品种和利用马铃薯晚疫病预警系统,科学防控马铃薯晚疫病。 展开更多
关键词 马铃薯晚疫病 交配型 生理小种 甲霜灵敏感性 mtdna单倍型 致病疫霉
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中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究 被引量:24
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作者 齐国强 昝林森 +3 位作者 张桂香 王志刚 王均辉 韩旭 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期7-11,共5页
对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 ... 对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 0±0.005 6,平均核苷酸差异(Average number of nucleotide differences,k)为18.445 0,表明我国水牛的遗传多态性丰富。构建的NJ进化树显示这10个品种的水牛主要有两个母系起源。 展开更多
关键词 中国地方水牛 mtdna D-LOOP 遗传多样性 起源
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中国东南沿海青蟹属不同种类的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育 被引量:26
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作者 林琪 李少菁 +1 位作者 黎中宝 王桂忠 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期268-273,共6页
对采自中国东南沿海青蟹属的4种青蟹锯缘青蟹Scylla serrata(Forskal,1775),紫螯青蟹S.tranquebarica(Fab-ricius,1798),榄绿青蟹S.olivacea(Herbst,1796),拟穴青蟹S.paramamosain(Estampador,1949)的线粒体COI基因片段进行了测定,分析... 对采自中国东南沿海青蟹属的4种青蟹锯缘青蟹Scylla serrata(Forskal,1775),紫螯青蟹S.tranquebarica(Fab-ricius,1798),榄绿青蟹S.olivacea(Herbst,1796),拟穴青蟹S.paramamosain(Estampador,1949)的线粒体COI基因片段进行了测定,分析研究了其种间遗传差异及系统发育关系.研究结果显示:4种青蟹在COI基因片段上存在差异,种间序列差异远大于种内差异.青蟹属在我国的优势种与GenBank上的S.paramamosain的遗传距离为0.001 3,与S.ser-rata的遗传距离为0.121 3.序列特征、遗传距离和系统进化等分析结果表明中国青蟹属的优势种为拟穴青蟹S.para-mamosain. 展开更多
关键词 青蟹属 mtdna COI 基因序列 系统发育
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家牦牛线粒体DNA(mtDNA)遗传多样性及其分类 被引量:36
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作者 郭松长 祁得林 +2 位作者 陈桂华 徐世晓 赵新全 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期4286-4294,共9页
通过分析包括我国10个家牦牛品种(类群)在内共296个样本的mtDNA控制(D-loop)区部分序列的遗传变异,对我国家牦牛的遗传多样性、遗传分化、聚类关系和分类进行了研究。所测序列经比对后,共检测到61个变异位点,定义了77种单倍型。分析显... 通过分析包括我国10个家牦牛品种(类群)在内共296个样本的mtDNA控制(D-loop)区部分序列的遗传变异,对我国家牦牛的遗传多样性、遗传分化、聚类关系和分类进行了研究。所测序列经比对后,共检测到61个变异位点,定义了77种单倍型。分析显示青海环湖牦牛的单倍型多样性最高,达0.9848±0.0403,而巴州牦牛单倍型多样性最低,为0.8000±0.0825;核苷酸多样性方面,斯布牦牛存在最为丰富的核苷酸序列变异,核苷酸多样性值为0.022582±0.011767,而巴州牦牛仅为0.006856±0.002476,表明我国家牦牛品种(类群)遗传多样性水平存在较大差异。总体上,我国家牦牛单倍型多样性、核苷酸多样性分别为0.9251±0.0095和0.015265±0.007757,呈现出丰富的遗传多样性。聚类分析显示我国家牦牛存在两个聚类簇——斯布牦牛独立为一类;其余9个品种(类群)聚为一类,表明家牦牛品种(类群)间遗传距离与地理分布无明显相关。分子变异分析(AMOVA)显示九龙、嘉黎、斯布牦牛构成的组与其余7个家牦牛品种(类群)构成的组之间存在极显著的遗传分化(ΦCT=0.05285,P<0.01),且其品种间/组内遗传分化不显著(ΦSC=0.00648,P>0.05),支持依据遗传分化程度将我国家牦牛划分为两大类型。AMOVA支持的分组在品种(类群)组成上与蔡立的研究结果相符,首次为我国家牦牛划分为横断高山型和青藏高原型两种类型提供了源自分子遗传学的证据。 展开更多
关键词 家牦牛 mtdna控制区 遗传多样性 聚类关系 遗传分化 分类
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云南致病疫霉交配型、甲霜灵敏感性、mtDNA单倍型及其群体演替研究 被引量:23
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作者 赵志坚 曹继芬 +3 位作者 李灿辉 孙道旺 杨明英 王军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期727-734,共8页
【目的】对致病疫霉群体特征的认识,是控制晚疫病危害的必要前提。【方法】对云南32个马铃薯和番茄产区的致病疫霉群体的交配型、甲霜灵敏感性、mtDNA单倍型进行了研究。【结果】云南马铃薯致病疫霉群体主要由A1交配型组成,番茄致病疫... 【目的】对致病疫霉群体特征的认识,是控制晚疫病危害的必要前提。【方法】对云南32个马铃薯和番茄产区的致病疫霉群体的交配型、甲霜灵敏感性、mtDNA单倍型进行了研究。【结果】云南马铃薯致病疫霉群体主要由A1交配型组成,番茄致病疫霉全部为A1交配型。A2交配型和自育型菌株总体发生频率较低,分别为3.4%和4.4%。自从2002年以后,致病疫霉的群体结构发生了明显的变化,没有检测到A2交配型或自育型菌株。致病疫霉对甲霜灵敏感性的离体测定显示马铃薯和番茄上均存在抗性、中抗和敏感菌株。甲霜灵抗性、中抗、敏感菌株分别占测定菌株的13.2%、9.4%和77.4%。分离自番茄的甲霜灵抗性菌株比例高于分离自马铃薯的菌株。Ⅰa、Ⅱa和Ⅰb三种mtDNA单倍型被检测到,马铃薯致病疫霉有Ⅰa和Ⅱa两种单倍型,全部为第二次全球迁移后出现的“新”群体。Ⅰa单倍型在群体中的比例为96%,分布于所有马铃薯产区;番茄致病疫霉则为Ⅰa和Ⅰb两种单倍型,“新”、“旧”群体共存。【结论】马铃薯和番茄致病疫霉群体的遗传结构有明显差异;致病疫霉“新”、“旧”群体在云南已发生演替,马铃薯致病疫霉“新”群体已成功替代了“旧”群体;迁移和有限的有性生殖可能在云南致病疫霉群体的演替中担当了重要的作用。 展开更多
关键词 交配型 自育性 甲霜灵敏感性 mtdna单倍型 晚疫病
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成都地区四种食尸性蝇类mtDNA中COⅠ基因序列检测 被引量:14
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作者 蔡继峰 刘敏 +7 位作者 应斌武 董建国 邓振华 陶涛 潘洪富 张红霞 闫红涛 廖志钢 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期101-106,共6页
通过检测食尸性苍蝇线粒体DNA(mtDNA)上细胞色素氧化酶亚基Ⅰ (COⅠ )中 2 78bp基因序列 ,鉴定食尸性苍蝇的种类 ,解决依据形态学方法不能鉴定苍蝇卵的种类、很难鉴定幼虫种类的难题 ,作为法医鉴别食尸性苍蝇及其幼虫、卵种类依据。随... 通过检测食尸性苍蝇线粒体DNA(mtDNA)上细胞色素氧化酶亚基Ⅰ (COⅠ )中 2 78bp基因序列 ,鉴定食尸性苍蝇的种类 ,解决依据形态学方法不能鉴定苍蝇卵的种类、很难鉴定幼虫种类的难题 ,作为法医鉴别食尸性苍蝇及其幼虫、卵种类依据。随机采集放置在成都地区室外草地兔尸体上的 4种 15个食尸性苍蝇。利用改进的小型昆虫DNA匀浆方法提取上述苍蝇mtDNA ;通过Perkin Elmer 96 0 0扩增仪进行PCR扩增 ;聚丙烯酰胺非变性凝胶连续缓冲体系垂直电泳和银染显色技术进行扩增结果检测 ;PCR胶回收试剂盒纯化 ;ABI 377测序仪测序 ;MEGA2 1软件包进行序列分析和构建系统发育树。在双翅目食尸性苍蝇的种内进化分歧均数小于 1% ,种间进化分歧均数大于 7%。mtDNA上COⅠ序列分析能有效地对主要的食尸性苍蝇进行种类鉴定。该检测方法快速、简便和精确 ,能作为法医鉴别食尸性苍蝇种类的可靠依据。 展开更多
关键词 成都市 食尸性蝇类 mtdna CoⅠ基因 序列分析 细胞色素氧化酶亚基I 法医鉴定学
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贵州四个山羊品种mtDNA多态性及起源分化 被引量:60
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作者 贾永红 史宪伟 +6 位作者 简承松 朱文适 张亚平 何正权 廖正录 余应淮 李通权 《Zoological Research》 CAS CSCD 1999年第2期88-92,共5页
采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(caprasp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHⅠ、HindⅢ和SalⅠ3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。... 采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(caprasp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHⅠ、HindⅢ和SalⅠ3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。单倍型Ⅰ和Ⅱ在贵州山羊4个品种中分布频率较高,分别为7742%和2150%,单倍型Ⅲ分布频率较低(108%);品种间亲缘关系聚类分析表明白山羊和黑山羊亲缘关系最近,其次为黔北麻羊,而与小香羊的亲缘关系最远。推测贵州山羊mtDNA单倍型Ⅰ和Ⅱ可能来源于两个母系祖先,其分化时间约在19万年前。 展开更多
关键词 山羊 mtdna RFLP 起源分化
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中国黄牛mtDNA D-loop遗传多样性及起源 被引量:12
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作者 房兴堂 周艳 +2 位作者 陈宏 蔡欣 方南洙 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第5期928-933,共6页
Complete mitochondrial D-loop sequences of 140 samples obtained from 15 Chinese local cattle breeds were analyzed.The result showed 67 different haplotypes with 113 polymorphic sites.The haplotype diversity and nucleo... Complete mitochondrial D-loop sequences of 140 samples obtained from 15 Chinese local cattle breeds were analyzed.The result showed 67 different haplotypes with 113 polymorphic sites.The haplotype diversity and nucleotide diversity were 0.608-1.000 and 0.002-0.028,respectively,indicating abundant genetic diversity in Chinese cattle.The constructed Neighbor-Joining(NJ) tree revealed that there were two maternal origins of Bos taurus and Bos indicus in Chinese cattle.Among them,the Bos taurus lineage had rich mtDNA genetic diversity,while Bos indicus lineage had poor mtDNA genetic diversity,respectively.It can be concluded that the cattle in Northern China originated from the Bos taurus lineage,while the cattle in Central China and Southern China originated from Bos taurus and Bos indicus lineages.In our study,two mtDNA haplotypes belonging to African cattle were detected,thus providing molecular evidence for an African lineage in Chinese cattle. 展开更多
关键词 中国黄牛 mtdna D-LOOP 单倍型 起源
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