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csn-miR171b-3p_2 targets CsSCL6-4 to participate in the defense against drought stress in tea plant
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作者 Caiyun Tian Chengzhe Zhou +9 位作者 Shengjing Wen Niannian Yang Jiayao Tan Cheng Zhang Lele Jiang Anru Zheng Xiaowen Hu Zhongxiong Lai Chen Zhu Yuqiong Guo 《Horticultural Plant Journal》 2026年第1期172-188,共17页
Drought stress is a serious natural challenge for tea plants that significantly affects tea yield and quality.miR171s play critical roles in plant stress responses,however,their role in drought stress tolerance in tea... Drought stress is a serious natural challenge for tea plants that significantly affects tea yield and quality.miR171s play critical roles in plant stress responses,however,their role in drought stress tolerance in tea plants(Camellia sinensis)is poorly understood.This study experimentally verified the expression patterns of csn-miR171b-3p_2 and its target,scarecrow-like(SCL).We found that csn-miR171b-3p_2 could target and regulate CsSCL6-4 to play an important role in the defense against drought stress in tea plants.CsSCL6-4 is located in the nucleus and is selfactivated in vivo.In addition,we obtained 819 putative binding regions of CsSCL6-4 using DNA affinity purification sequencing analysis,which were assigned to 786 different genes,four of which were drought-resistant genes(CsPrx,CsSDR,CsFAD7,and CsCER1).Yeast one-hybrid and dual-luciferase reporter assays revealed that CsSCL6-4 directly promoted the expression of these four drought resistance genes by binding motifs 1/2/3 in their promoter regions.Both overexpression and suppression of CsSCL6-4 proved that CsSCL6-4 participated in the defense against drought stress in tea plants by regulating the expression of CsPrx,CsSDR,CsFAD7,and CsCER1.In addition,suppression of csn-miR171b-3p_2 expression significantly increased the expression of CsSCL6-4 and activated CsSCL6-4-bound gene transcription under drought stress.Therefore,the csn-miR171b-3p_2-CsSCL6-4 module participates in tea plant resistance to drought stress by promoting the expression of drought resistance genes.Our results revealed the function of csn-miR171b-3p_2 in tea plants and provided new insights into the mechanism of tea plant resistance to drought stress. 展开更多
关键词 Camellia sinensis miR171 Scarecrow-like Drought stress
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miR394a-FBX6模块调控棉花黄萎病抗性
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作者 廖婵娟 李丹 +6 位作者 赵文军 吴琪 尹秀娟 钟贵买 王智 胡广 翟俊峰 《棉花学报》 北大核心 2025年第3期165-174,I0001,I0002,共12页
【目的】探究ghr-miR394-GhFBX6模块在棉花黄萎病抗性中的功能,为棉花抗病育种提供候选基因。【方法】利用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析ghr-miR394a和GhFBX6的表达模式... 【目的】探究ghr-miR394-GhFBX6模块在棉花黄萎病抗性中的功能,为棉花抗病育种提供候选基因。【方法】利用实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)分析ghr-miR394a和GhFBX6的表达模式。在棉花中瞬时超表达ghr-miR394a,利用病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)技术在棉花中分别瞬时沉默ghr-miR394a和GhFBX6,研究二者在抗黄萎病中的功能。利用5'端RNA连接酶介导的cDNA末端快速扩增(5'-RNA ligase-mediated rapid amplification of cDNA ends,5'RLM-RACE)技术并结合荧光素酶(luciferase,LUC)报告系统,分析ghr-miR394a对GhFBX6的调控作用。【结果】qRT-PCR表明,ghr-miR394a在棉花叶片中的表达量较高,其次为茎和根。与清水处理相比,大丽轮枝菌侵染可显著降低根中ghr-miR394a的表达量,显著提高GhFBX6的表达量。与对照植株相比,在棉花中瞬时沉默ghr-miR394a导致病情指数、病株率显著降低,茎段恢复培养后菌丝积累量较少,棉花对黄萎病的抗性增强;而瞬时过表达ghr-miR394a或瞬时沉默GhFBX6则会降低棉花对大丽轮枝菌的抗性,具体表型为二者的病情指数和病株率均显著升高,过表达ghr-miR394a的茎段恢复培养后菌丝积累量较多,GhFBX6沉默棉株茎秆的维管束褐变程度加重。5'RLM-RACE和LUC报告系统结果表明,ghr-miR394a在转录后水平抑制GhFBX6表达。【结论】ghr-miR394a可靶向抑制GhFBX6的表达,且ghr-miR394a和GhFBX6在棉花黄萎病抗性响应中分别发挥负调控和正调控功能。 展开更多
关键词 miR394 GhFBX6 棉花 黄萎病 抗病性 病毒诱导的基因沉默
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超声造影参数及miR⁃214、miR⁃1296在甲状腺乳头癌中表达及意义 被引量:1
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作者 刘庆华 陈晓晓 任正君 《分子诊断与治疗杂志》 2025年第1期41-45,共5页
目的探究超声造影参数结合血清miR⁃214、miR⁃1296对甲状腺乳头癌(PTC)的诊断价值及其与肿瘤增殖、侵袭关系。方法选取2020年12月至2023年5月濮阳市人民医院收治的60例PTC患者、甲状腺腺瘤患者60例分别作为观察组、对照组。对比两组超声... 目的探究超声造影参数结合血清miR⁃214、miR⁃1296对甲状腺乳头癌(PTC)的诊断价值及其与肿瘤增殖、侵袭关系。方法选取2020年12月至2023年5月濮阳市人民医院收治的60例PTC患者、甲状腺腺瘤患者60例分别作为观察组、对照组。对比两组超声造影参数[峰值强度(PI)、平均通过时间(MTT)、达峰时间(TTP)、曲线下面积(AUC)]、血清miR⁃214、miR⁃1296表达,分析超声造影参数(PI、MTT、TTP、AUC)、血清miR⁃214、miR⁃1296表达与增殖、侵袭基因(PDCD4、ADAM9、PP4R1、BCORL1、TPX2、CXCR4)表达的关系,绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价超声造影参数、血清miR⁃214、miR⁃1296表达对PTC的诊断价值。结果观察组PI、AUC及血清miR⁃1296表达低于对照组,TTP、MTT及血清miR⁃214表达高于对照组(P<0.05);Logistic回归分析显示,PI、AUC、miR⁃1296升高是PTC的保护因素,TTP、MTT、miR⁃214升高是PTC的危险因素(P<0.05);相关性分析显示,PTC患者PI、AUC及血清miR⁃1296表达与PDCD4、PP4R1表达呈正相关关系,与TPX2、ADAM9、BCORL1、CXCR4表达呈负相关关系,TTP、MTT及血清miR⁃214表达与PDCD4、PP4R1表达呈负相关关系,与TPX2、ADAM9、BCORL1、CXCR4表达呈正相关关系(P<0.05);PTC患者PI、AUC与血清miR⁃214表达呈负相关关系,与血清miR⁃1296表达呈正相关关系;TTP、MTT与血清miR⁃214表达呈正相关关系,与血清miR⁃1296表达呈负相关关系(P<0.05);ROC曲线结果显示,超声造影参数、血清miR⁃214、miR⁃1296表达联合诊断ROC曲线的AUC最大,且>0.9,具有良好诊断效能。结论超声造影参数、血清miR⁃214、miR⁃1296表达与PTC增殖及侵袭程度密切相关,联合检测可提高PTC的诊断效能。 展开更多
关键词 甲状腺乳头癌 超声造影参数 miR⁃214 miR⁃1296
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植物miR397及其靶基因调控的研究进展
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作者 吴鹏 王丽 +2 位作者 郭茜茜 范明玉 丁楚琦 《分子植物育种》 北大核心 2025年第20期6738-6744,共7页
miR397是高度保守的miRNA之一,大多有1~3个成员组成,作为一种重要的调控因子,在植物基因组中普遍存在,并且广泛参与了植物的细胞和生理过程。在PmiREN数据库和miRBase数据库已收录了不同植物的miR397家族,目前已有研究表明miR397会与特... miR397是高度保守的miRNA之一,大多有1~3个成员组成,作为一种重要的调控因子,在植物基因组中普遍存在,并且广泛参与了植物的细胞和生理过程。在PmiREN数据库和miRBase数据库已收录了不同植物的miR397家族,目前已有研究表明miR397会与特定的靶基因结合参与植物六大器官的生长过程,且参与植物的胁迫响应,进而影响不同物种的产量。本研究综述了植物miR397同源性、二级结构预测、靶基因预测以及靶基因的调控功能,以期了解其进化机制并清晰地阐明miR397在各属植物生长过程中扮演的重要角色,并指出近年来miR397在植物研究中的各种问题并对其未来发展情况提出展望,为进一步研究miR397的生物学功能提供参考。 展开更多
关键词 miR397 生物信息学 靶基因 非生物胁迫 生物胁迫
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LncRNA miR17HG对膀胱癌细胞恶性生物学特性的影响
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作者 杨宇 陈云志 +1 位作者 廖爱玲 张岩 《温州医科大学学报》 2025年第6期458-464,共7页
目的:探究lncRNA miR17HG在膀胱癌组织中的表达水平及其对膀胱癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。方法:采用RT-qPCR检测膀胱癌组织中lncRNA miR17HG的表达;将阴性对照NC shRNA和lncRNA miR17HG shRNA转染至T24和EJ膀胱癌细胞中,RT-q... 目的:探究lncRNA miR17HG在膀胱癌组织中的表达水平及其对膀胱癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。方法:采用RT-qPCR检测膀胱癌组织中lncRNA miR17HG的表达;将阴性对照NC shRNA和lncRNA miR17HG shRNA转染至T24和EJ膀胱癌细胞中,RT-qPCR检测转染后细胞中lncRNA miR17HG表达情况,CCK-8实验检测细胞增殖能力,细胞划痕实验检测细胞迁移能力,Transwell实验检测细胞侵袭能力,流式细胞仪检测细胞凋亡情况。将转染的膀胱癌细胞经皮下注射至裸鼠体内构建膀胱癌肿瘤移植模型,观察追踪肿瘤的生长情况,并用RT-qPCR检测裸鼠模型肿瘤组织中lncRNA miR17HG表达情况。结果:膀胱癌组织中lncRNA miR17HG的水平显著高于正常癌旁组织(P<0.05);用干扰RNA技术敲低lncRNA miR17HG后,与sh-NC组(裸鼠侧腹部皮下注射肿瘤细胞成瘤)比,lncRNA miR17HG敲低组的T24和EJ细胞中lncRNA miR17HG表达显著降低(P<0.05),且细胞增殖、迁移和侵袭能力被显著抑制,而癌细胞的凋亡率明显升高(P<0.05)。在裸鼠膀胱癌肿瘤移植模型中,lncRNA miR17HG敲低小鼠的肿瘤组织其体积和质量均显著小于sh-NC组,且lncRNA miR17HG表达量显著降低(P<0.05)。结论:敲低lncRNA miR17HG表达可有效抑制膀胱癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力。 展开更多
关键词 lncRNA miR17HG 膀胱癌 细胞侵袭 细胞迁移 细胞增殖
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LncRNA MIR17HG靶向miR-153-3p对骨髓瘤细胞增殖、侵袭的影响
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作者 安宏玉 张欣 《中国细胞生物学学报》 2025年第12期3182-3191,共10页
该文旨在探讨LncRNA MIR17HG靶向mi R-153-3p对骨髓瘤(MM)细胞增殖、侵袭的影响。qRT-PCR检测MM组织、正常骨髓组织、人正常骨髓浆细胞(nPCs)和MM细胞(U266、RPMI-8226、NCI-H929、LP-1)中MIR17HG和miR-153-3p的表达水平;将NCI-H929细... 该文旨在探讨LncRNA MIR17HG靶向mi R-153-3p对骨髓瘤(MM)细胞增殖、侵袭的影响。qRT-PCR检测MM组织、正常骨髓组织、人正常骨髓浆细胞(nPCs)和MM细胞(U266、RPMI-8226、NCI-H929、LP-1)中MIR17HG和miR-153-3p的表达水平;将NCI-H929细胞分为control组、si-NC组、si-MIR17HG组、si-MIR17HG+inhibitor NC组、si-MIR17HG+miR-153-3p inhibitor组、si-MIR17HG+miR-NC组,si-MIR17HG+miR-153-3p mimics组;qRT-PCR检测细胞中MIR17HG、miR-153-3p表达水平;CCK-8检测细胞增殖;划痕实验检测细胞迁移;Transwell实验检测细胞侵袭;流式细胞术检测细胞凋亡;Western blot检测细胞中E-cadherin、cleaved caspase-3、N-cadherin、vimentin、PCNA、MMP-2蛋白表达水平;双荧光素酶活性实验验证miR-153-3p与MIR17HG的靶向关系。MM组织和MM细胞系中MIR17HG表达水平升高,miR-153-3p表达水平降低;敲低MIR17HG表达后NCI-H929细胞中MIR17HG表达水平下降,D450(24 h、48 h)值降低,划痕愈合率降低,N-cadherin、vimentin、PCNA和MMP-2蛋白表达水平降低,细胞侵袭数量减少,miR-153-3p表达水平,凋亡率,E-cadherin和cleaved caspase-3蛋白表达水平升高(P<0.05);沉默miR-153-3p表达可降低敲低MIR17HG表达对NCI-H929细胞恶性生物学行为的抑制作用(P<0.05);上调miR-153-3p表达可提高敲低MIR17HG表达对NCI-H929细胞恶性生物学行为的抑制作用(P<0.05)。MIR17HG可调控miR-153-3p表达影响MM细胞恶性生物学行为。 展开更多
关键词 MIR17HG miR-153-3p 骨髓瘤 增殖 侵袭
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LncRNA miR155HG/miR-155-5p在肾透明细胞癌发生发展中的调控机制
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作者 陶美满 成康 +1 位作者 钱洲楠 马克钧 《实用癌症杂志》 2025年第2期181-186,共6页
目的 分析LncRNA miR155HG/miR-155-5p在肾透明细胞癌发生发展中的调控机制。方法 将RCC细胞系786-O进行细胞培养,接种于DMEM培养基,随后建立舒尼替尼耐药RCC细胞。基于培养方式的不同,将其分为正常组、自噬抑制剂组、空载体组、miR-155... 目的 分析LncRNA miR155HG/miR-155-5p在肾透明细胞癌发生发展中的调控机制。方法 将RCC细胞系786-O进行细胞培养,接种于DMEM培养基,随后建立舒尼替尼耐药RCC细胞。基于培养方式的不同,将其分为正常组、自噬抑制剂组、空载体组、miR-155-5p干扰组、miR155HG干扰组、miR155HG干扰+miR-155-5p过表达组、miR-155-5p干扰+PDK1干扰组。对各组细胞的LncRNA miR155HG/miR-155-5p/PDK1表达水平进行检测,使用RT-qPCR检测总RNA,并且计算其中LncRNA miR155HG/miR-155-5p/PDK1的相对表达量。通过Western Blot检测PDK1蛋白相对表达水平。通过MTT法、流式细胞术、划痕实验、Transwell试验、Western Blot、CCK8法检测各组的细胞增殖率、细胞凋亡率、细胞迁移能力、细胞侵袭能力、细胞自噬情况以及耐药性。最后通过荧光素酶报告基因对miR-155-5p与PDK1的结合能力进行检测,观察PDK1是否可以作为miR-155-5p的作用靶点。结果 研究结果表明,在肾透明细胞系786-O当中,miR155HG、miR-155-5p/-3p表达量最高;在干扰miR155-HG、miR-155-5p/-3p的表达中,细胞系786-O的细胞增殖能力、侵袭能力以及迁移能力均明显受到抑制;对于786-O细胞系而言,将miR155HG下调能够明显对细胞增殖、侵袭、迁移能力造成抑制,miR-155-5p、miR-155-3p的过表达会逆转这一情况;经过生物信息学软件、TargetScan数据库的分析,一共有13个共靶向基因,并且在生物学过程和途径都有所参与。结论 对miR155HG表达进行干扰,能够明显对ccRCC细胞系的增殖、迁移、侵袭形成抑制;miR155HG可以当做miR-155-5p/-3p前体,并且促进ccRCC的发展;将LncRNA miR155HG/miR-155-5p/-3p轴阻断之后,能够有效抑制ccRCC的增殖能力、侵袭能力和迁移能力。 展开更多
关键词 miR-155-5p LncRNA miR155HG 肾透明细胞 增殖 侵袭 迁移
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FAM19A4/miR124-2基因甲基化与p16/Ki-67联合检测对宫颈癌前病变的诊断效能
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作者 黄鹏翀 李鹏程 沈乾坤 《实用癌症杂志》 2025年第8期1353-1356,共4页
目的探究FAM19A4/miR124-2基因甲基化联合p16/Ki-67检测能否提高宫颈癌筛查的检测效能。方法收集宫颈非典型鳞状细胞患者96例为研究对象,病理学检查判断宫颈病变分型,液基薄层细胞学(TCT)观察患者的FAM19A4/miR124-2基因甲基化,免疫组化... 目的探究FAM19A4/miR124-2基因甲基化联合p16/Ki-67检测能否提高宫颈癌筛查的检测效能。方法收集宫颈非典型鳞状细胞患者96例为研究对象,病理学检查判断宫颈病变分型,液基薄层细胞学(TCT)观察患者的FAM19A4/miR124-2基因甲基化,免疫组化(IHC)检测p16和Ki-67的阳性率。结果宫颈脱落细胞中FAM19A4/miR124-2甲基化阳性率为68.75%,且随着宫颈病变严重程度增加;根据p16/Ki-67的IHC进行IS评分分组,对宫颈上皮瘤变的严重程度有一定的区分度。FAM19A4/miR124-2甲基化联合p16/Ki-67检测敏感性和特异性分别为90%和85%,AUC为0.92。结论FAM19A4/miR124-2甲基化和p16/Ki-67免疫组化检测对宫颈≥HSIL病变均具有较高临床价值,联合p16/Ki-67检测能更灵敏准确地检测出宫颈≥HSIL的病变。 展开更多
关键词 宫颈癌前病变 FAM19A4/miR124-2 甲基化 p16/Ki-67
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miR169a调节马铃薯气孔特性适应动态环境
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作者 张宏冠 雷紫芊 +6 位作者 王明 张幸媛 毛俊 林原 胡新喜 熊兴耀 秦玉芝 《园艺学报》 北大核心 2025年第11期2889-2898,共10页
为了验证马铃薯MicroRNA169a(miR169a)作用于气孔的特定功能,分别构建了马铃薯miR169a过表达(OE169a)与沉默株系(STTM169),以野生型为对照,测定相关指标。结果显示OE169a提高马铃薯处于动态环境下的气孔开度,降低其净光合速率(P_(n))、... 为了验证马铃薯MicroRNA169a(miR169a)作用于气孔的特定功能,分别构建了马铃薯miR169a过表达(OE169a)与沉默株系(STTM169),以野生型为对照,测定相关指标。结果显示OE169a提高马铃薯处于动态环境下的气孔开度,降低其净光合速率(P_(n))、胞间二氧化碳浓度(C_(i))、内部水分利用率(iWUE)及抗氧化能力;STTM169降低马铃薯处于动态环境下的气孔开度,提高其P_(n)、C_(i)、iWUE及抗氧化能力。综上所述,沉默miR169可降低马铃薯处于动态环境下的气孔开度,并在逆境下维持较高的光能及水份利用率,从而提升马铃薯对动态环境的适应性。 展开更多
关键词 miR169 气孔 动态环境 光合特性 马铃薯
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外源miR3979处理水稻对拟禾本科根结线虫趋性、侵染和发育的影响
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作者 杨行洲 崔苗苗 +4 位作者 魏利辉 顾爱国 李东霞 乐秀虎 冯辉 《中国水稻科学》 北大核心 2025年第5期703-710,共8页
【目的】miR3979-3p参与水稻响应多种生物和非生物胁迫,在拟禾本科根结线虫(Meloidogyne graminicola)侵染的根组织中下调表达,因此探究miR3979-3p对根结线虫与水稻互作中的作用具有重要意义。【方法】利用人工合成的双链miR3979(ds-miR... 【目的】miR3979-3p参与水稻响应多种生物和非生物胁迫,在拟禾本科根结线虫(Meloidogyne graminicola)侵染的根组织中下调表达,因此探究miR3979-3p对根结线虫与水稻互作中的作用具有重要意义。【方法】利用人工合成的双链miR3979(ds-miR3979)浸泡水稻根组织,采用q PCR测量水稻内源miR3979-3p的表达水平,通过平板接种和组织染色观察二龄幼虫的趋性和侵染能力,结合盆钵接种评价ds-miR3979处理对水稻根结产生和线虫发育的影响。【结果】100~800 nmol/L ds-miR3979处理12~24 h对二龄幼虫的运动活性无显著影响;与ddH2O处理的对照相比,400 nmol/L ds-miR3979浸泡根系12~24 h显著提高了立针期和三叶期水稻根系和叶片miR3979-3p的表达水平;连续显微观察2~8 h,发现二龄幼虫向水稻根尖移动趋性降低,集聚在根尖周围的线虫数量显著减少;同时,平板接种1~3 d侵入根内的线虫数量减少,盆钵接种7~21 d根系上的根结数目、根内雌虫数量和占比显著下降,且雌虫的发育进程延缓。【结论】人工合成的ds-miR3979可被水稻吸收并上调内源miR3979-3p表达,进而影响根结线虫的侵染和雌虫发育。 展开更多
关键词 小RNA miR3979-3p 水稻 拟禾本科根结线虫 侵染 发育
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口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
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作者 刘絮影 李锦存 +3 位作者 翟堃 胡晨 董文 马坚 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第2期109-117,共9页
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer ge... 目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 长链非编码RNA 预后 LINC01980 MIR99AHG
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基于miR-155/FGF7通路介导的巨噬细胞极化探讨顾步汤改善糖尿病足溃疡的分子机制
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作者 王继雪 杨稀瑞 +4 位作者 周涛 燕树勋 王思琦 夏联恒 袁星星 《海南医科大学学报》 北大核心 2025年第21期1621-1629,共9页
目的:探讨顾步汤通过miR-155/FGF7信号通路调控巨噬细胞极化,揭示其在改善糖尿病足溃疡(DFU)的作用机制。方法:实验分为5组:空白组、模型组、顾步汤组、miR-155 inhibitor组及顾步汤+miR-155 inhibitor组。通过腹腔注射55 mg/kg链脲佐菌... 目的:探讨顾步汤通过miR-155/FGF7信号通路调控巨噬细胞极化,揭示其在改善糖尿病足溃疡(DFU)的作用机制。方法:实验分为5组:空白组、模型组、顾步汤组、miR-155 inhibitor组及顾步汤+miR-155 inhibitor组。通过腹腔注射55 mg/kg链脲佐菌素,构建SD大鼠糖尿病模型,并构建DFU模型。顾步汤组给予顾步汤浓缩液(90 mL/kg)进行灌胃,空白组和模型组则以蒸馏水(90 mL/kg)灌胃,miR-155inhibitor组通过腹腔注射miR-155 inhibitor(20μmoL/L),顾步汤+miR-155 inhibitor组则同时进行腹腔注射和灌胃。通过H&E染色观察各组大鼠溃疡组织的病理形态,酶联免疫吸附法检测各组血清中炎症因子(IL-6、IL-1β、IL-10、IL-4)水平,流式细胞术分析溃疡组织中巨噬细胞CD206表达及巨噬细胞极化标记分子表达,qPCR和Western blot检测miR-155、iNOS、COX-2、Arg-1、YM-1及FGF7表达。结果:与空白组相比,模型组IL-6、IL-1β水平、CD68、iNOS、COX-2、miR-155表达量及CD68/CD206的比值均显著升高;而IL-4、IL-10水平、CD206、Arg-1、YM-1及FGF7表达显著降低(P<0.01)。与模型组相比,顾步汤组IL-6、IL-1β水平、CD68、iNOS、COX-2、miR-155表达量及CD68/CD206比值均显著下降,而IL-4、IL-10的水平、CD206、Arg-1、YM-1及FGF7表达显著升高(P<0.05)。结论:顾步汤通过靶向miR-155上调FGF7表达,促进巨噬细胞M2极化,抑制炎症,最终改善DFU症状。 展开更多
关键词 顾步汤 糖尿病足溃疡 巨噬细胞极化 miR155/FGF7通路
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PTFE非晶相结构三级透射中红外光谱组学研究 被引量:1
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作者 杜林楠 吉一帆 +3 位作者 李宇涵 李泷帆 尹昭 于宏伟 《微纳电子技术》 2025年第3期60-67,共8页
聚四氟乙烯(PTFE)是一种重要的高分子聚合材料。开展了PTFE非晶相结构及其热稳定性研究。分别研究了PTFE非晶相结构的三级中红外(MIR)光谱组学,包括透射MIR光谱、变温透射MIR光谱及二维透射MIR光谱。结果发现,在303 K温度下,PTFE分子非... 聚四氟乙烯(PTFE)是一种重要的高分子聚合材料。开展了PTFE非晶相结构及其热稳定性研究。分别研究了PTFE非晶相结构的三级中红外(MIR)光谱组学,包括透射MIR光谱、变温透射MIR光谱及二维透射MIR光谱。结果发现,在303 K温度下,PTFE分子非晶相结构伸缩振动模式对应的红外吸收峰为933.82、849.60、781.45、741.39、721.35和709.50 cm^(-1)。热扰动因素下,PTFE分子非晶相结构红外吸收频率及吸光度没有明显的改变。PTFE分子非晶相结构二维MIR光谱中吸收峰变化顺序为:941 cm^(-1)早于936 cm^(-1);840 cm^(-1)早于850 cm^(-1);722 cm^(-1)早于744 cm^(-1)早于778 cm^(-1)早于709 cm^(-1)。热扰动因素下,PTFE分子部分非晶相结构被破坏,而其相应的热稳定性也进一步降低。 展开更多
关键词 中红外(MIR)光谱 聚四氟乙烯(PTFE) 非晶相 结构 热稳定性
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基于机器学习和中红外光谱的牦牛奶掺假预测模型研究 被引量:2
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作者 褚楚 罗雪路 +5 位作者 王海童 温佩佩 杜超 丁考仁青 拉毛草 张淑君 《华中农业大学学报》 北大核心 2025年第2期116-124,共9页
为监督和规范牦牛奶生产和销售,对牦牛奶中奶牛奶的掺假比例进行定量预测,研发新的快速检测技术,通过中红外光谱技术结合机器学习算法建立检测牦牛奶中掺加奶牛奶的预测模型,以76份纯牦牛奶、76份掺加10%奶牛奶的牦牛奶、76份掺加25%奶... 为监督和规范牦牛奶生产和销售,对牦牛奶中奶牛奶的掺假比例进行定量预测,研发新的快速检测技术,通过中红外光谱技术结合机器学习算法建立检测牦牛奶中掺加奶牛奶的预测模型,以76份纯牦牛奶、76份掺加10%奶牛奶的牦牛奶、76份掺加25%奶牛奶的牦牛奶、76份掺加50%奶牛奶的牦牛奶为研究对象,利用5种光谱预处理算法、6种定性和12种定量机器学习算法,分别建立鉴别纯牦牛奶和掺加奶牛奶的牦牛奶的二分类定性模型和预测掺加奶牛奶比例的定量回归模型。结果显示,基于支持向量机建模算法、无预处理光谱建立的鉴定纯牦牛奶和掺加奶牛奶的牦牛奶的预测模型效果最好,该模型验证集AUC为0.95,准确性0.84,灵敏度0.93,特异性0.87,可用于纯奶和掺假奶的鉴定。利用贝叶斯正则化神经网络建模算法和一阶导数光谱预处理算法建立了预测牦牛奶中奶牛奶掺加比例的最佳定量模型,该模型R_(P)^(2)=0.88,RMSEV=6.57%,RPD=2.89%。结果表明,中红外光谱技术结合机器学习算法可有效地鉴定出掺加奶牛奶的牦牛奶,并可检测出掺假的比例。 展开更多
关键词 中红外光谱(MIRS) 机器学习 牦牛奶 牛奶掺假 预测模型
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LncRNA MIR223HG调控共济失调毛细血管扩张突变的表达影响肺腺癌细胞的增殖、迁移和凋亡
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作者 齐凯 郑丽 +3 位作者 彭金华 宋超 陈向来 徐建军 《中国呼吸与危重监护杂志》 2025年第1期42-50,共9页
目的探讨长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)MIR223HG影响肺腺癌细胞增殖、迁移和凋亡的分子机制。方法用DNA损伤剂Zeocin处理人胚肺细胞MRC-5和肺腺癌细胞A549和H1299,并通过实时定量聚合酶链式反应分析检测MIR223HG的表达。同时... 目的探讨长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)MIR223HG影响肺腺癌细胞增殖、迁移和凋亡的分子机制。方法用DNA损伤剂Zeocin处理人胚肺细胞MRC-5和肺腺癌细胞A549和H1299,并通过实时定量聚合酶链式反应分析检测MIR223HG的表达。同时,通过实时定量聚合酶链式反应检测使用Zeocin的肺癌细胞A549和H1299中的共济失调毛细血管扩张突变(ataxia-telangiectasia mutated,ATM)蛋白和ATM通路下游因子细胞周期检查点激酶2(checkpoint kinase2,Chk2)、p53肿瘤抑制蛋白(p53 tumor suppressor protein,p53)的表达。进行细胞转染、Transwell迁移试验、菌落形成试验和细胞凋亡试验,验证共济失调毛细血管扩张突变基因(ataxia telangiectasia mutated gene,ATM)在肺腺癌MIR223HG表达中的作用。结果与人胚肺细胞MRC-5相比,肺腺癌细胞A549和H1299在使用Zeocin后MIR223HG的表达明显减少。在使用Zeocin的肺癌细胞中,ATM蛋白及其下游因子Chk2、p53参与了这一过程,而ATM则调控MIR223HG的表达。此外,ATM也参与了MIR223HG调控肺腺癌细胞增殖、迁移和凋亡的过程。结论MIR223HG的表达与肺癌的DNA损伤反应有关,MIR223HG通过ATM/Chk2/p53途径调控肺癌细胞的增殖、迁移和凋亡。MIR223HG或可成为治疗肺癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 长非编码RNA MIR223HG 共济失调毛细血管扩张突变 肺腺癌
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毛果杨miR171家族成员的起源及靶基因调控分析
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作者 崔玉 徐宏蔚 +2 位作者 刘新茹 孙誉菡 徐吉臣 《分子植物育种》 北大核心 2025年第20期6689-6695,共7页
miR171家族广泛存在于植物基因组中,探讨miR171成员在基因组中的起源、序列特征及与靶基因的作用特点,有助于拓展miR171对植物基因调控作用的认知。本研究基于测序的毛果杨基因组序列,对miRNA171家族成员进行染色体定位,分析miRNA171的... miR171家族广泛存在于植物基因组中,探讨miR171成员在基因组中的起源、序列特征及与靶基因的作用特点,有助于拓展miR171对植物基因调控作用的认知。本研究基于测序的毛果杨基因组序列,对miRNA171家族成员进行染色体定位,分析miRNA171的起源;利用DNAMAN软件对杨树miR171成员碱基组成进行比对,利用psRNATarget软件预测miR171的靶基因,揭示不同成员的特征及功能差异。结果显示,杨树miR171家族包含4个5p和13个3p成员,源于13个前体miRNA序列。其中miR171a前体来自CDS区,其他前体均来源于基因间隔区。序列比对发现,17个成熟miRNA中包含9个单一的序列,差异碱基数在1~8 bp之间。靶基因预测显示,miR171主要调控转录因子GRAS的表达,也参与了包括MYB、bHLH转录因子、蛋白激酶、水解酶等基因的表达调控。对核心位点的分析显示,7个杨树miR171成员通过切割模式调控靶基因mRNA的转录水平,4个杨树miR171成员对靶基因的作用通过翻译抑制的方式进行。miR171家族成员序列变异丰富,参与了多种靶基因的表达调控,在植物生长及逆境抗性等过程中具有重要的作用。 展开更多
关键词 杨树 miR171家族 起源 靶基因
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马铃薯miR169基因序列分析与启动子瞬时诱导表达
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作者 毛俊 张幸媛 +2 位作者 雷紫芊 肖乐书 秦玉芝 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第21期80-88,共9页
为研究马铃薯miR169基因家族的特征,探讨其功能及调控机制,从miRBase数据库得到8个马铃薯miR169家族成员的序列与染色体定位信息。运用ClustalX 2.1和Weblogo3比对分析马铃薯stu-miR169的序列及其碱基保守性;采用MEGA 11和邻接法构建拟... 为研究马铃薯miR169基因家族的特征,探讨其功能及调控机制,从miRBase数据库得到8个马铃薯miR169家族成员的序列与染色体定位信息。运用ClustalX 2.1和Weblogo3比对分析马铃薯stu-miR169的序列及其碱基保守性;采用MEGA 11和邻接法构建拟南芥、辣椒、番茄、马铃薯miR169前体序列间的进化关系树。用PLANTCARE分析stu-miR169基因启动子1 500 bp长度序列所包含的顺式作用元件。通过克隆stu-miR169家族启动子并且添加GUS标记遗传转化拟南芥,进行GUS染色分析stu-miR169启动子在不同组织中的活性和进行脱落酸(ABA)、聚乙二醇(PEG)、4℃低温处理后的调控特征。结果显示,stu-miR169基因家族成员之间的5′端序列高度相似,并共用1套stu-miR169-5p成熟体序列;stu-miR169a、stu-miR169b与Can-miR169i,stu-miR169d与Can-miR169j、Can-miR169k,stu-miR169f与sly-miR169e近源。StmiR169的启动子含有包括ABRE、TATC-box、P-box、TGA-element和LTR等在内的激素和光温响应调控元件以及TC-rich repeats、ARE、DRE core、MYB、MYC、W-box等胁迫调控元件。GUS组织表达特征分析发现,stu-miR169a、stu-miR169c、stu-miR169f可全株表达,stu-miR169d、stu-miR169e仅在叶缘弱表达,stu-miR169b、stu-miR169g、stu-miR169h在下胚轴无表达;另外,stu-miR169家族成员均受到外源ABA、PEG和4℃低温的诱导,但表达丰度存在明显差异,其中stu-miR169a的启动子受到干旱、ABA和4℃低温的强烈诱导。综上,miR169在马铃薯、番茄和辣椒中存在一定的功能保守性;马铃薯miR169家族参与生长发育调控,根据组织表达特征可分成3个亚组,亚组内成员间存在功能冗余;其对外源ABA、PEG、4℃低温处理的响应模式存在类似的差异化表达特征,表明其不同的家族成员在特定的环境或发育阶段中具有不同作用。 展开更多
关键词 马铃薯 miR169 序列分析 启动子 瞬时表达
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毛竹miR156靶向SPL19A调节植物年龄发育
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作者 张晓彦 陈自银 +4 位作者 谢开旺 雷春华 骆文浩 王琴 张莉 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第4期485-494,共10页
【目的】研究毛竹miR156(PhemiR156)及其靶基因SPL(PheSPL)在调控植物年龄发育中的作用,为毛竹开花机制研究及遗传改良提供依据。【方法】通过同源序列比对筛选PhemiR156和PheSPL基因并分析其序列、结构及理化性质;利用毛竹转录组数据... 【目的】研究毛竹miR156(PhemiR156)及其靶基因SPL(PheSPL)在调控植物年龄发育中的作用,为毛竹开花机制研究及遗传改良提供依据。【方法】通过同源序列比对筛选PhemiR156和PheSPL基因并分析其序列、结构及理化性质;利用毛竹转录组数据研究基因表达模式;构建拟南芥PheMIR156和PheSPL异源转基因株系,并分析其年龄发育表型。【结果】在毛竹中鉴定到14个PhemiR156前体基因和36个PheSPL同源基因,其中,17个PheSPL基因有miR156结合位点,32个基因编码含SBP结构域的蛋白。PhemiR156表达量随着毛竹年龄增长而降低,而PheSPL在生殖发育阶段的表达量较高;过表达PheMIR156H显著抑制了拟南芥的年龄发育,而过表达PheSPL19A则导致拟南芥提前进入成年期。【结论】毛竹中的PheMIR156H和靶基因PheSPL19A分别抑制和促进植物年龄发育。 展开更多
关键词 毛竹 miR156-SPL分子模块 年龄发育 拟南芥 异源表达
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茅苍术nov-miR396-GRF模块的鉴定与表达分析
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作者 李谦 汤嘉豪 +4 位作者 郭家逸 刘越圳 沈银峰 余坤 邓娟 《植物生理学报》 北大核心 2025年第11期1577-1585,共9页
miRNA是药用植物中重要的内源小分子,通过调控其靶基因的表达来发挥作用。为挖掘茅苍术(Atractylodes lancea)small RNA数据库中新颖的miRNA,解析其功能,本文克隆茅苍术MIR396家族中新颖的miRNA(nov-miR396)的前体序列,分析其特征,发现n... miRNA是药用植物中重要的内源小分子,通过调控其靶基因的表达来发挥作用。为挖掘茅苍术(Atractylodes lancea)small RNA数据库中新颖的miRNA,解析其功能,本文克隆茅苍术MIR396家族中新颖的miRNA(nov-miR396)的前体序列,分析其特征,发现nov-miR396成熟体位于长度为94 nt的前体序列的5′端;利用生物信息学方法对nov-miR396的靶基因进行预测和分析,确定茅苍术AlGRF1转录因子为其靶基因;进一步构建双元表达载体pCNG-nov-miR396和pCNGFP-AlGRF1,注射烟草(Nicotiana benthamiana)叶片进行农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)介导的烟草瞬时表达实验,发现nov-miR396可以下调靶基因AlGRF1的表达;利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测nov-miR396和AlGRF1在茅苍术不同组织中的表达水平,发现nov-miR396在根茎中表达量最低,但在花和须根中有较高的表达量,而靶基因AlGRF1在根茎中表达量最高,在须根中表达量最低,二者呈现负调控模式。因此,本研究成功克隆茅苍术novmiR396,揭示nov-miR396可以负调控靶基因AlGRF1的表达。研究结果可为miR396-GRF模块调控茅苍术生长发育研究提供基础。 展开更多
关键词 茅苍术 miR396 调控 生长调节因子(GRF)
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miR172b/c-BnMSH7.A1模块响应甘蓝型油菜中Cu^(2+)胁迫机制
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作者 刘芳 杜芊芊 +3 位作者 何昊 肖钢 晏仲元 郝小花 《生物技术通报》 北大核心 2025年第2期139-149,共11页
【目的】探究基于miRNA调控甘蓝型油菜BnMSH7.A1响应Cu^(2+)胁迫的作用机理,为解析重金属胁迫响应机制中miRNA的调控功能提供新的研究思路。【方法】通过克隆甘蓝型油菜BnMSH7基因,利用生物信息学方法进行序列特征及潜在功能分析,预测... 【目的】探究基于miRNA调控甘蓝型油菜BnMSH7.A1响应Cu^(2+)胁迫的作用机理,为解析重金属胁迫响应机制中miRNA的调控功能提供新的研究思路。【方法】通过克隆甘蓝型油菜BnMSH7基因,利用生物信息学方法进行序列特征及潜在功能分析,预测筛选出调控甘蓝型油菜BnMSH7基因的候选miRNA,并使用烟草双荧光素酶报告系统对其进行体外验证,过表达pre-miR172b和pre-miR172c侵染油菜子叶,进行体内验证。经不同浓度Cu^(2+)处理油菜幼苗,RT-qPCR检测miR172b、miR172c和BnMSH7.A1表达情况,进行相关分析,推断Cu^(2+)胁迫下,miR172b和miR172c对BnMSH7.A1的调控情况。【结果】野生型萤火虫荧光值与海肾荧光值比值比空白对照显著下降,说明BnMSH7.A1受miR172b和miR172c调控。同时体内验证发现miR172b和miR172c与BnMSH7.A1的表达规律相反,表现为抑制调控,进一步说明miR172b和miR172c可以调控BnMSH7.A1。经生物信息学预测发现,miR172b、miR172c和BnMSH7.A1启动子上均存在铜响应元件;且Cu^(2+)处理后,根中pre-miR172b和pre-miR172c分别可以促进miR172b和miR172c表达,进一步促进BnMSH7.A1表达。叶中miR172b和miR172c负向调控BnMSH7.A1的表达,pre-miR172b、premiR172c与miR172b、miR172c呈负相关关系,但相关性不显著。【结论】在不同组织中miR172b/c-BnMSH7.A1模块的调控方式存在差异,在根中pre-miR172b、pre-miR172c与miR172b、miR172c均为正相关关系,miR172b/c可正向调控BnMSH7.A1表达。在叶中pre-miR172b、pre-miR172c与miR172b/c相关性不显著,但miR172b/c可负向调控BnMSH7.A1的表达。 展开更多
关键词 Cu^(2+)胁迫 BnMSH7.A1 miR172b/c 双荧光素酶报告实验分析 相关性分析
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