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基于共表达网络研究巨噬细胞在动脉硬化中的作用
1
作者
赵宏群
张一骅
+4 位作者
李琬
何月涵
吕俊杰
黄昊
陈丽娜
《国际免疫学杂志》
CAS
2015年第5期409-412,共4页
目的探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化形成和发展中的作用机理。方法从GEO数据库中下载一组人类冠状动脉粥样硬化(AS)的单核细胞转录组基因表达谱数据。通过Bicor相关方法分别构建基于正常和疾病样本差异基因共表达网络,用ClusterOne挖掘...
目的探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化形成和发展中的作用机理。方法从GEO数据库中下载一组人类冠状动脉粥样硬化(AS)的单核细胞转录组基因表达谱数据。通过Bicor相关方法分别构建基于正常和疾病样本差异基因共表达网络,用ClusterOne挖掘疾病候选功能模块后进行富集分析,对模块之间重叠度及功能富集情况进行分析。结果在疾病和正常网络中分别得到3个功能相关模块,共富集到11个功能类,从正常到疾病状态中模块间基因存在差异,富集到的功能类也存在差异。结论不同模块中基因的突变、凋亡、磷酸化和去磷酸化等在巨噬细胞致AS过程中起着重要作用。
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关键词
动脉粥样硬化
巨噬细胞
共表达网络
Biweight
midcorrelation
原文传递
题名
基于共表达网络研究巨噬细胞在动脉硬化中的作用
1
作者
赵宏群
张一骅
李琬
何月涵
吕俊杰
黄昊
陈丽娜
机构
哈尔滨医科大学生物信息学院
出处
《国际免疫学杂志》
CAS
2015年第5期409-412,共4页
基金
国家自然科学基金(61272388)
黑龙江省自然科学基金(F201237)
国家及黑龙江省大学生创新创业训练基金(201410226010).
文摘
目的探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化形成和发展中的作用机理。方法从GEO数据库中下载一组人类冠状动脉粥样硬化(AS)的单核细胞转录组基因表达谱数据。通过Bicor相关方法分别构建基于正常和疾病样本差异基因共表达网络,用ClusterOne挖掘疾病候选功能模块后进行富集分析,对模块之间重叠度及功能富集情况进行分析。结果在疾病和正常网络中分别得到3个功能相关模块,共富集到11个功能类,从正常到疾病状态中模块间基因存在差异,富集到的功能类也存在差异。结论不同模块中基因的突变、凋亡、磷酸化和去磷酸化等在巨噬细胞致AS过程中起着重要作用。
关键词
动脉粥样硬化
巨噬细胞
共表达网络
Biweight
midcorrelation
Keywords
Atherosclerosis
Macrophage
Co-expression networks
Biweight
midcorrelation
分类号
R543.5 [医药卫生—心血管疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于共表达网络研究巨噬细胞在动脉硬化中的作用
赵宏群
张一骅
李琬
何月涵
吕俊杰
黄昊
陈丽娜
《国际免疫学杂志》
CAS
2015
0
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参考文献
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