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乳腺癌组织miR-1247-5p表达及其靶基因生物信息学预测研究
1
作者
陈芳
王仡阳
马方婧
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024年第6期453-457,共5页
目的:探讨微小核糖核酸-1247-5p(miR-1247-5p)在乳腺癌组织中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析。方法:收集2019年6月至2020年12月本院手术治疗的104例乳腺癌患者癌组织及其癌旁组织。RT-PCR检测标本中miR-1247-5p的相对表达...
目的:探讨微小核糖核酸-1247-5p(miR-1247-5p)在乳腺癌组织中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析。方法:收集2019年6月至2020年12月本院手术治疗的104例乳腺癌患者癌组织及其癌旁组织。RT-PCR检测标本中miR-1247-5p的相对表达量;比较不同临床病理特征患者癌组织miR-1247-5p表达;预测miR-1247-5p的靶基因;采用DAVID数据库对miR-1247-5p靶基因进行功能和通路富集分析;String数据库对miR-1247-5p靶基因进行互作分析。结果:miR-1247-5p在乳腺癌组织中的表达水平较癌旁组织下调(P<0.05)。miR-1247-5p潜在靶基因38个,其靶基因功能主要富集于RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控、基因表达/转录调控、质膜部分、突触小体、蛋白质结合、poly(A)RNA结合等;参与的通路主要富集于癌症通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等。磷酸酯酶与张力蛋白同源物(PTEN)、上皮生长因子受体(EGFR)、假尿苷酸合酶1(PUS1)的编码蛋白质在miR-1247-5p基因靶基因蛋白质互作网络(PPI)中关键节点位置。结论:miR-1247-5p在乳腺癌组织中的表达下调,其靶基因富集于多个生物学过程及与肿瘤相关的信号转导通路上,miR-1247-5p可能通过调控其靶基因的表达参与乳腺癌的发生发展过程。
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关键词
乳腺肿瘤
微小核糖核酸-1247-5p
靶基因
生物信息学
暂未订购
脂多糖诱发的小鼠急性肺损伤肺组织中microRNA表达谱的变化
被引量:
12
2
作者
王斌
卿娣
+4 位作者
程东良
陶少华
沈蔚
陈衍晨
杜江
《中华实用儿科临床杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期931-935,共5页
目的研究脂多糖(LPS)诱导的小鼠急性肺损伤(ALI)/急性呼吸窘迫综合征(ARDS)肺组织中microRNA表达谱的改变,探讨microRNA在ALI/ARDS发生机制中的作用。方法C57BL小鼠24只,随机分为实验组和对照组,每组12只。实验组小鼠通过气...
目的研究脂多糖(LPS)诱导的小鼠急性肺损伤(ALI)/急性呼吸窘迫综合征(ARDS)肺组织中microRNA表达谱的改变,探讨microRNA在ALI/ARDS发生机制中的作用。方法C57BL小鼠24只,随机分为实验组和对照组,每组12只。实验组小鼠通过气管切开经呼吸道向肺内注入LPS(6mg/kg),构建小鼠ALI/ARDS模型。对照组用同样的方法注入相应剂量的9g/L盐水。所有小鼠均于手术后24h处死,取左肺组织用于测量干湿质量比,右中肺叶行HE染色观察病理变化。应用microRNA芯片技术检测对照组及实验组小鼠肺组织microRNA表达谱的差异,用生物信息学方法进行靶基因预测及信号通路分析。结果与对照组比较,实验组小鼠出现明显的呼吸系统症状,肺组织干湿质量比明显升高(P〈0.01),病理结果符合ALI/ARDS特征。芯片结果显示ALI/ARDS小鼠肺组织中明显差异表达的microRNA有48个,其中上调的有27个,下调的有21个,这些microRNA的靶基因可能参与调节炎症相关的信号通路。结论在ALI/ARDS小鼠模型中,部分microRNA的表达发生明显的变化,microRNA在ALI/ARDS病理生理过程中起重要作用。
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关键词
MICRORNA
急性肺损伤
急性呼吸窘迫综合征
原文传递
题名
乳腺癌组织miR-1247-5p表达及其靶基因生物信息学预测研究
1
作者
陈芳
王仡阳
马方婧
机构
新疆医科大学第一附属医院乳腺外科
出处
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024年第6期453-457,共5页
基金
省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室开放课题项目(SKL-HIDCA-2021-41)。
文摘
目的:探讨微小核糖核酸-1247-5p(miR-1247-5p)在乳腺癌组织中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析。方法:收集2019年6月至2020年12月本院手术治疗的104例乳腺癌患者癌组织及其癌旁组织。RT-PCR检测标本中miR-1247-5p的相对表达量;比较不同临床病理特征患者癌组织miR-1247-5p表达;预测miR-1247-5p的靶基因;采用DAVID数据库对miR-1247-5p靶基因进行功能和通路富集分析;String数据库对miR-1247-5p靶基因进行互作分析。结果:miR-1247-5p在乳腺癌组织中的表达水平较癌旁组织下调(P<0.05)。miR-1247-5p潜在靶基因38个,其靶基因功能主要富集于RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录调控、基因表达/转录调控、质膜部分、突触小体、蛋白质结合、poly(A)RNA结合等;参与的通路主要富集于癌症通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等。磷酸酯酶与张力蛋白同源物(PTEN)、上皮生长因子受体(EGFR)、假尿苷酸合酶1(PUS1)的编码蛋白质在miR-1247-5p基因靶基因蛋白质互作网络(PPI)中关键节点位置。结论:miR-1247-5p在乳腺癌组织中的表达下调,其靶基因富集于多个生物学过程及与肿瘤相关的信号转导通路上,miR-1247-5p可能通过调控其靶基因的表达参与乳腺癌的发生发展过程。
关键词
乳腺肿瘤
微小核糖核酸-1247-5p
靶基因
生物信息学
Keywords
Breast neoplasms
microkna
-1247-5-p
Target gene
Bioinformatics454
分类号
R737.9 [医药卫生—肿瘤]
暂未订购
题名
脂多糖诱发的小鼠急性肺损伤肺组织中microRNA表达谱的变化
被引量:
12
2
作者
王斌
卿娣
程东良
陶少华
沈蔚
陈衍晨
杜江
机构
南方医科大学珠江医院儿科
出处
《中华实用儿科临床杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第12期931-935,共5页
文摘
目的研究脂多糖(LPS)诱导的小鼠急性肺损伤(ALI)/急性呼吸窘迫综合征(ARDS)肺组织中microRNA表达谱的改变,探讨microRNA在ALI/ARDS发生机制中的作用。方法C57BL小鼠24只,随机分为实验组和对照组,每组12只。实验组小鼠通过气管切开经呼吸道向肺内注入LPS(6mg/kg),构建小鼠ALI/ARDS模型。对照组用同样的方法注入相应剂量的9g/L盐水。所有小鼠均于手术后24h处死,取左肺组织用于测量干湿质量比,右中肺叶行HE染色观察病理变化。应用microRNA芯片技术检测对照组及实验组小鼠肺组织microRNA表达谱的差异,用生物信息学方法进行靶基因预测及信号通路分析。结果与对照组比较,实验组小鼠出现明显的呼吸系统症状,肺组织干湿质量比明显升高(P〈0.01),病理结果符合ALI/ARDS特征。芯片结果显示ALI/ARDS小鼠肺组织中明显差异表达的microRNA有48个,其中上调的有27个,下调的有21个,这些microRNA的靶基因可能参与调节炎症相关的信号通路。结论在ALI/ARDS小鼠模型中,部分microRNA的表达发生明显的变化,microRNA在ALI/ARDS病理生理过程中起重要作用。
关键词
MICRORNA
急性肺损伤
急性呼吸窘迫综合征
Keywords
microkna
Acute lung injury
Acute respiratory distress syndrome
分类号
R563.8 [医药卫生—呼吸系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乳腺癌组织miR-1247-5p表达及其靶基因生物信息学预测研究
陈芳
王仡阳
马方婧
《中国现代普通外科进展》
CAS
2024
0
暂未订购
2
脂多糖诱发的小鼠急性肺损伤肺组织中microRNA表达谱的变化
王斌
卿娣
程东良
陶少华
沈蔚
陈衍晨
杜江
《中华实用儿科临床杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2013
12
原文传递
已选择
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