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融合CNN和Bi-LSTM的miRNA-lncRNA互作关系预测模型 被引量:10
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作者 石文浩 孟军 +1 位作者 张朋 刘婵娟 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2019年第8期1652-1660,共9页
非编码RNA(ncRNA)在很多动植物生命活动方面起着重要的调节作用,而微小RNA(miRNA)与长非编码RNA(lncRNA)的相互作用更为重要,其互作关系的研究不仅有助于深入分析基因间生物学功能,也可为疾病的诊治和植物的遗传育种方面提供新思路.目前... 非编码RNA(ncRNA)在很多动植物生命活动方面起着重要的调节作用,而微小RNA(miRNA)与长非编码RNA(lncRNA)的相互作用更为重要,其互作关系的研究不仅有助于深入分析基因间生物学功能,也可为疾病的诊治和植物的遗传育种方面提供新思路.目前,miRNA-lncRNA互作关系的预测大多使用生物实验和传统机器学习方法.由于生物鉴定代价高耗时长和机器学习涉及过多人工干预且特征提取过程复杂,在此提出一种融合卷积神经网络(convolutional neural network, CNN)和双向长短期记忆网络(bidirectional long short-term memory network, Bi-LSTM)的深度学习模型,兼备两者优势,既考虑序列间信息相关性和结合上下文信息,又能充分提取序列数据的特征.采用交叉检验评估模型性能,在玉米数据集上与传统机器学习方法和单一模型比对,取得较优的分类效果.另外,采用马铃薯和小麦数据集进行模型测试,准确率分别达到95%和93%以上,验证了模型具有良好的泛化能力. 展开更多
关键词 卷积神经网络 双向长短期记忆网络 mirna-lncrna 预测 深度学习
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miRNA-lncRNA影响人NK细胞与树突状细胞免疫功能和乳腺癌细胞侵袭力的分子机制 被引量:2
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作者 李雅怡 张雨洁 卓文杏 《河北医药》 CAS 2020年第12期1771-1774,1779,共5页
目的研究miRNA-lncRNA相互作用影响人NK细胞与树突状细胞免疫功能和乳腺癌细胞侵袭力的分子机制。方法实验分为4组:乳腺癌组织,正常组织,乳腺癌细胞系,正常细胞系;通过RT-qPCR检测LncRNA(MEG3)分别在4个试验组的表达;通过CCK-8检测NK细... 目的研究miRNA-lncRNA相互作用影响人NK细胞与树突状细胞免疫功能和乳腺癌细胞侵袭力的分子机制。方法实验分为4组:乳腺癌组织,正常组织,乳腺癌细胞系,正常细胞系;通过RT-qPCR检测LncRNA(MEG3)分别在4个试验组的表达;通过CCK-8检测NK细胞与树突状细胞活力;通过Transwell测定法测量乳腺癌细胞迁移和侵袭能力;通过荧光素酶活性检测miRNA(miR-21)和MEG3之间的关系;通过蛋白质免疫检测miR-21模拟物转染或MEG3转染后,NK细胞免疫功能标记蛋白(CD56)、DC免疫功能标记蛋白(CD80)和细胞侵袭标记蛋白(MMP-2和MMP-9)的表达量。结果MEG3在乳腺癌组织和细胞中下调表达(P<0.05);MEG3的过表达抑制NK细胞与树突状细胞活力以及乳腺癌细胞迁移和侵袭能力(P<0.05);过表达的miR-21导致MEG3-WT荧光素酶活性降低,但对MEG3-mut报告基因的荧光素酶活性无明显影响;过表达的MEG3减弱了miR-21模拟物对CD56、CD80、MMP-2和MMP-9蛋白的表达(P<0.05)。结论miRNA-lncRNA相互作用在人NK细胞与树突状细胞免疫功能和乳腺癌细胞侵袭进展中的调节作用,并为乳腺癌细胞治疗提供了新的潜在治疗策略。 展开更多
关键词 MIRNA lncRNA 自然杀伤细胞 树突状细胞 乳腺癌细胞
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miRNA-lncRNA相互作用影响人NK细胞与树突状细胞免疫功能和胃癌细胞侵袭力的分子机制 被引量:3
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作者 王保全 王战红 王旭 《中国医药导刊》 2020年第4期265-269,共5页
目的:研究miRNA-lncRNA相互作用影响人自然杀伤细胞(NK)和树突状细胞(DC)免疫功能和胃癌(GC)细胞侵袭力的分子机制。方法:实验分为4组:GC组织、正常组织、GC细胞系、正常细胞系,通过定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)检测lncRNA(MEG3)在4... 目的:研究miRNA-lncRNA相互作用影响人自然杀伤细胞(NK)和树突状细胞(DC)免疫功能和胃癌(GC)细胞侵袭力的分子机制。方法:实验分为4组:GC组织、正常组织、GC细胞系、正常细胞系,通过定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)检测lncRNA(MEG3)在4个实验组的表达;通过CCK-8检测NK细胞与DC细胞的活力;通过Transwell测定法测量GC细胞迁移和侵袭能力;通过荧光素酶活性检测miRNA(miR-21)和MEG3之间的关系;通过蛋白质免疫检测miR-21模拟物转染或MEG3转染后,NK细胞免疫功能标记蛋白(CD56)、DC细胞免疫功能标记蛋白(CD80)和细胞侵袭标记蛋白(MMP-2和MMP-9)的表达量。结果:MEG3在GC组织和细胞中下调表达(P<0.05);MEG3的过表达抑制了GC的NK细胞与DC细胞的活力以及GC细胞迁移和侵袭能力(P<0.05);过表达的miR-21导致MEG3-WT荧光素酶活性降低,但对MEG3-mut报告基因的荧光素酶活性没有明显影响;过表达的MEG3减弱了miR-21模拟物对CD56、CD80、MMP-2和MMP-9蛋白的表达(P<0.05)。结论:miRNA-lncRNA相互作用在人NK细胞与DC细胞免疫功能和GC细胞侵袭进展中具调节作用,其诱发MEG3的过表达,从而抑制了GC的NK细胞与DC细胞的活力。 展开更多
关键词 MIRNA lncRNA NK细胞 树突状细胞 胃癌细胞
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CircRNA、lncRNA-miRNA网络调控骨质疏松症的研究进展
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作者 周畅 李明笑 +8 位作者 张嘉恒 冯泰云 陶晶 陈思敏 郭阳红旭 许文波 雷晓明 刘骐志 张国民 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2026年第3期460-468,共9页
骨质疏松症(osteoporosis,OP)是一种全身性代谢疾病,以骨密度降低和骨组织微观结构破坏为主要特征,这种病理变化显著提升了骨折风险,严重损害患者生活质量。近年来,非编码RNA,尤其是微小RNA(microRNA,miRNA)、长非编码RNA(long non-codi... 骨质疏松症(osteoporosis,OP)是一种全身性代谢疾病,以骨密度降低和骨组织微观结构破坏为主要特征,这种病理变化显著提升了骨折风险,严重损害患者生活质量。近年来,非编码RNA,尤其是微小RNA(microRNA,miRNA)、长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)在OP发病中扮演关键角色,可调控成骨细胞、破骨细胞及骨髓间充质干细胞功能,有助于揭示OP的发病根源,更可作为诊断和预后评估的潜在生物标志物,在OP发病机制中的作用日益受到重视。此外,中药可调节这些非编码RNA网络,在OP治疗中展现出显著效果,为治疗提供了新的思路和研究靶点,为开发新型治疗策略提供了坚实基础。 展开更多
关键词 非编码RNA circRNA MIRNA lncRNA 骨质疏松症
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LncRNA-miRNA调控网络影响骨髓间充质干细胞成骨分化的研究进展
5
作者 姜登宸 王兴盛 +5 位作者 王小强 党泽亮 彭培 秦启顺 何友斌 徐世红 《中国骨质疏松杂志》 北大核心 2026年第1期150-156,共7页
骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)作为一种多功能细胞在医学领域的研究中深受重视,而随着小分子领域研究的不断深入,近年来发现多种非编码RNA(ncRNA)可以调节BMSCs的成骨分化,其中LncRNA和miRNA能够参与BMSC... 骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)作为一种多功能细胞在医学领域的研究中深受重视,而随着小分子领域研究的不断深入,近年来发现多种非编码RNA(ncRNA)可以调节BMSCs的成骨分化,其中LncRNA和miRNA能够参与BMSCs分化中的多种过程,并且LncRNA还能与miRNA产生竞争性调节网络,对成骨相关的Runx蛋白、骨形态发生蛋白、Smad蛋白及相关信号通路产生调节来影响BMSCs的成骨分化。本文就LncRNA和miRNA形成的竞争性调节网络在BMSCs成骨分化中的研究进展进行综述,以期为骨髓间充质干细胞相关研究提供更多的理论基础。 展开更多
关键词 骨髓间充质干细 成骨分化 LncRNA MIRNA
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非编码RNA调控家畜肌肉生长发育的分子机制
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作者 魏亚丽 房华 +5 位作者 王永飞 董宇 李舜 林正辉 托合提麦麦提·努日 张云峰 《中国畜牧杂志》 北大核心 2026年第2期103-111,120,共10页
家畜肌肉生长速度、产量及肉品质直接关系到畜牧业的经济效益,因此,骨骼肌发育研究对畜牧业生产具有重要意义。近年来,随着测序技术和组学技术的不断进步,研究人员在肌肉细胞中鉴定出了大量非编码RNA(ncRNA)。ncRNA具有生物学功能但不... 家畜肌肉生长速度、产量及肉品质直接关系到畜牧业的经济效益,因此,骨骼肌发育研究对畜牧业生产具有重要意义。近年来,随着测序技术和组学技术的不断进步,研究人员在肌肉细胞中鉴定出了大量非编码RNA(ncRNA)。ncRNA具有生物学功能但不参与蛋白质翻译,主要包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA),这些ncRNA通过多种调控机制在转录后水平调控肌肉生长发育关键基因,进而影响肌细胞的数量和体积,最终决定肌肉质量。本文综述了参与肌肉生长发育调控的候选ncRNA(miRNA、lncRNA和circRNA)及其相关基因、调控机制和相关信号通路(如Wnt、PI3K/Akt通路),旨在为进一步阐明ncRNA在家畜肌肉生长发育中的分子调控机制提供理论参考。 展开更多
关键词 肌肉生长发育 MIRNAS lncRNAs circRNAs
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基于lncRNA H19/micRNA-21/FOXO3a信号通路探讨敦煌大补肺汤对特发性肺纤维化模型大鼠的干预机制
7
作者 袁寒玉 韩翼飞 +2 位作者 张家琼 韦燕飞 明海霞 《中国病理生理杂志》 北大核心 2026年第3期543-552,共10页
目的:基于lncRNA H19/micRNA-21/FOXO3a和小窝蛋白1(caveolin-1,Cav-1)探讨敦煌大补肺汤(Dabufei decoction,DBFD)对特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)模型大鼠的干预机制。方法:将SPF级SD大鼠60只随机分为6组,每组10... 目的:基于lncRNA H19/micRNA-21/FOXO3a和小窝蛋白1(caveolin-1,Cav-1)探讨敦煌大补肺汤(Dabufei decoction,DBFD)对特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)模型大鼠的干预机制。方法:将SPF级SD大鼠60只随机分为6组,每组10只:空白组、IPF模型组、DBFD低、中、高剂量组(0.88、1.76、3.52 g/100g)和吡非尼酮组(162 mg/kg)。麻醉后借助喉镜经气管单次滴注,除空白组(滴注等体积生理盐水)外,其余组滴注博来霉素(5 mg/kg)进行IPF大鼠造模;于第15天灌胃给药,1次/天,连续给药28 d后取材。Masson染色评价肺组织纤维化程度;透射电镜观察大鼠AECII超微结构;Western blot检测肺组织α平滑肌肌动蛋白(α-smooth muscle actin,α-SMA)、Cav-1和磷酸化的叉头框转录因子O3a(phosphorylated forkhead box protein O3a,p-FOXO3a)蛋白表达;RTqPCR检测肺组织α-SMA、Cav-1、FOXO3a、lncRNA H19和miRNA-21基因表达。结果:Masson染色显示,与空白组比较,IPF模型组肺组织结构较空白组破坏严重,大量蓝染胶原纤维沉积,Ashcroft评分和纤维组织表达百分比均显著升高(P<0.01);与模型组相比,各给药组肺组织结构破坏程度减轻,肺间质蓝染胶原纤维沉积较少,Ashcroft评分和纤维组织表达百分比均降低(P<0.05);与吡非尼酮组相比,各给药组评分升高(P<0.05),而DBFD高剂量组的上述病变无明显改变。透射电镜结果显示:与空白组比较,模型组可见肺组织AECII内板层小体数量明显减少且结构异常;与模型组比较,各给药组AECII内板层小体(lamellar body,LB)数量逐渐增加且结构趋于正常;与吡非尼酮组相比,DBFD中、高剂量组LB的数量与结构异常、线粒体肿胀情况相似,肺泡巨噬细胞形态改善程度相当,细胞器损伤修复程度相似。Western blot显示:与空白组比较,模型组大鼠肺组织α-SMA、p-FOXO3a蛋白表达明显升高,Cav-1蛋白表达显著降低(P<0.01);与模型组比较,DBFD中、高剂量组及吡非尼酮组大鼠肺组织α-SMA、p-FOXO3a蛋白表达降低,Cav-1蛋白表达升高(P<0.05)。RT-qPCR显示:与空白组比较,模型组大鼠肺组织miRNA-21、lncRNA H19、α-SMA mRNA表达量较空白组显著升高,Cav-1、FOXO3a mRNA表达量显著降低(P<0.01);与模型组比较,DBFD中、高剂量组及吡非尼酮组大鼠肺组织miRNA-21、lncRNA H19、α-SMA mRNA表达降低(P<0.05),DBFD高剂量组及吡非尼酮组Cav-1和FOXO3a mRNA表达升高(P<0.01)。结论:敦煌大补肺汤可能通过调控lncRNA H19/micRNA-21/FOXO3a相关分子的表达、改变Cav-1及AECII胞内板层小体数量减轻IPF模型大鼠肺纤维化。 展开更多
关键词 敦煌大补肺汤 特发性肺纤维化 lncRNAH19/micRNA-21/FOXO3a信号通路 小窝蛋白1 板层小体
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非编码RNA调控PI3K/AKT/mTOR信号通路参与三阴性乳腺癌发生和发展的研究进展
8
作者 黄祝 李文静 +5 位作者 宋子卷 黄思仪 杨紫晴 储亚桠 丁伏生 李从虎 《生理学报》 北大核心 2026年第2期315-330,共16页
三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)以高侵袭转移、预后不良、死亡率高为特征,是恶性最强的乳腺癌,目前仍缺乏有效的治疗靶点。磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)... 三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)以高侵袭转移、预后不良、死亡率高为特征,是恶性最强的乳腺癌,目前仍缺乏有效的治疗靶点。磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,AKT)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)通路在TNBC中普遍异常激活,导致TNBC患者化疗药物耐药性增加、临床预后不良。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)等,参与多种生物学过程,可作为致癌基因或抑癌基因调控PI3K/AKT/mTOR信号通路,促进或抑制TNBC的发生和发展。本文综述了TNBC中一些重要的miRNA,lncRNA,circRNA及其调控PI3K/AKT/mTOR信号通路的靶点和分子机制,希望为TNBC的研究开辟新的途径,最终促进TNBC精确有效治疗的发展。 展开更多
关键词 三阴性乳腺癌 PI3K/AKT/mTOR信号通路 MIRNA lncRNA circRNA
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LncRNA NONRATT021203.2通过调控miRNA-138-5p表达促进骨癌痛进展
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作者 俞晨阳 朱涵希 +5 位作者 朱正华 宋梦雪 顾卓 李星润 陈家宏 魏金荣 《江苏大学学报(医学版)》 2026年第1期51-57,64,共8页
目的:探索长链非编码RNA(lncRNA)NONRATT021203.2在骨癌痛进展中的作用及其可能的分子机制。方法:采用胫骨内注射乳腺癌Walker 256细胞构建SD大鼠骨癌痛模型;取16只180~200 g成年SD雌鼠,随机分为对照组和骨癌痛组,每组8只,分别胫骨注射1... 目的:探索长链非编码RNA(lncRNA)NONRATT021203.2在骨癌痛进展中的作用及其可能的分子机制。方法:采用胫骨内注射乳腺癌Walker 256细胞构建SD大鼠骨癌痛模型;取16只180~200 g成年SD雌鼠,随机分为对照组和骨癌痛组,每组8只,分别胫骨注射10μL生理盐水和10μL乳腺癌Walker 256细胞悬液(1×10^(8)个细胞/mL),通过行为学检测大鼠造模侧下肢爪退缩阈值(paw withdrawal threshold,PWT)和爪退缩潜伏期(paw withdrawal latency,PWL),采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测背根神经节(dorsal root ganglion,DRG)中lncRNA NONRATT021203.2和miRNA-138-5p相对表达,荧光原位杂交分析miRNA-138-5p在DRG组织中定位。取造模后7 d骨癌痛大鼠10只,分为骨癌痛+siRNA组(n=5)和骨癌痛+siNC组(n=5),分别鞘内注射lncRNA NONRATT021203.2-siRNA及siNC,qRT-PCR检测两组lncRNA NONRATT021203.2和miRNA-138-5p相对表达量。取造模后7 d骨癌痛大鼠16只,分为骨癌痛+mimics组(n=8)和骨癌痛+NC组(n=8),分别鞘内注射miRNA-138-5p mimics和阴性对照寡核苷酸(NC),行为学检测两组PWT和PWL。利用miRand、miRwalk3.0软件分析lncRNA NONRATT021203.2和miRNA-138-5p结合位点。结果:与对照组相比,骨癌痛组造模侧下肢PWT和PWL明显降低(P<0.05),lncRNA NONRATT021203.2相对表达量明显升高(P<0.01),miRNA-138-5p相对表达量明显降低(P<0.001);荧光原位杂交结果显示,miRNA-138-5p定位于神经元胞质中。与骨癌痛+siNC组相比,骨癌痛+lncRNA NONRATT021203.2-siRNA组lncRNA NONRATT021203.2相对表达量明显降低(P<0.05),而miRNA-138-5p相对表达量明显升高(P<0.05)。与骨癌痛+NC组相比,骨癌痛+miRNA-138-5p mimics组PWT明显升高(P<0.01)。生物信息学分析结果显示,lncRNA NONRATT021203.2与miRNA-138-5p存在结合位点。结论:LncRNA NONRATT021203.2可通过竞争性结合miRNA-138-5p,降低胞内游离miRNA-138-5p水平,从而促进骨癌痛的发生与发展。 展开更多
关键词 骨癌痛 背根神经节 lncRNA NONRATT021203.2 miRNA-138-5p
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从LncRNA-UCA1探讨针刺调节miRNA-331-3p/BRD4轴改善脾虚大鼠肠道炎症作用机制 被引量:3
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作者 刘继东 张家豪 +2 位作者 王建波 曲怡 薛亚楠 《中华中医药学刊》 北大核心 2025年第6期183-188,I0027-I0030,共10页
目的从长链非编码RNA尿路上皮癌相关基因1(LncRNA-UCA1)探讨针刺调节miRNA-331-3p/溴结构域蛋白4(BRD4)轴改善脾虚大鼠肠道炎症作用机制,探讨“健益脾气”针刺疗法改善脾虚便溏症状现代作用机制。方法将60只SD雄性大鼠以随机数字表法分... 目的从长链非编码RNA尿路上皮癌相关基因1(LncRNA-UCA1)探讨针刺调节miRNA-331-3p/溴结构域蛋白4(BRD4)轴改善脾虚大鼠肠道炎症作用机制,探讨“健益脾气”针刺疗法改善脾虚便溏症状现代作用机制。方法将60只SD雄性大鼠以随机数字表法分为正常组、模型组、非经非穴组、针刺组,每组15只。除正常组外,其余3组采用劳倦过度和不规律饮食复合方法建立脾虚证大鼠模型。造模成功后,针刺组电针“足三里”穴及“脾俞”穴干预治疗,非经非穴组给予电针尾尖作为对照干预,每日1次/20 min,共治疗14 d。治疗结束后,取大鼠血清及结肠组织。qPCR法检测大鼠结肠组织LncRNA-UCA1、miRNA-331-3p/BRD4轴相关基因的表达;ELISA法检测大鼠血清中白介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-6(IL-6)的含量;HE染色法观察大鼠结肠组织病理形态变化;免疫组化法观察结肠中BRD4、白细胞介素-8(IL-8)的表达情况;免疫荧光法观察IL-1β、IL-6、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及核因子-κBp65(NFκBp65)的表达水平;TUNEL染色法观察各组结肠组织凋亡情况。结果与正常组比较,模型组、非经非穴组大鼠结肠组织miRNA-331-3p的表达水平明显下降(P<0.05),LncRNA-UCA1、BRD4、NF-κB p65、IL-1β、IL-6、IL-8、TNF-α的mRNA表达水平有所升高(P<0.05);与模型组比较,针刺组大鼠结肠组织miRNA-331-3p的表达水平明显升高(P<0.05),LncRNA-UCA1、BRD4、NF-κB p65、IL-1β、IL-6、IL-8、TNF-α的mRNA表达水平有所降低(P<0.05)。与正常组比较,模型组大鼠血清中促炎因子IL-1β、IL-6表达水平明显升高(P<0.05),与模型组比较,针刺组大鼠结肠组织中促炎因子IL-1β、IL-6的表达水平有所降低(P<0.05)。免疫组化法结果显示与正常组比较,模型组大鼠结肠组织BRD4、IL-8表达有所升高(P<0.05);与模型组比较,针刺组的BRD4表达有所降低(P<0.05)。免疫荧光结果显示与正常组比较,模型组、非经非穴组结肠组织IL-1β、IL-6、TNF-α、NF-κB p65免疫荧光平均吸光度值升高(P<0.05);与模型组比较,针刺组大鼠结肠组织中IL-1β、IL-6、TNF-α、NF-κB p65免疫荧光平均吸光度值降低(P<0.05)。另外HE染色结果显示,针刺治疗可有效减轻结肠黏膜组织中炎症细胞浸润和杯状细胞的损失;TUNEL染色结果显示,针刺治疗可以改善脾虚大鼠结肠炎症,抑制结肠黏膜细胞凋亡。结论电针“足三里”“脾俞”穴可以干预LncRNA-UCA1调节miRNA-331-3p/BRD4轴,抑制肠道炎症和促炎症介质的表达,进而抑制结肠黏膜细胞凋亡,提高机体免疫力,从而改善脾虚便溏症状。 展开更多
关键词 足三里 脾俞 脾虚 肠道炎症 LncRNA-UCA1 miRNA-331/BRD4
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原发性肺癌患者血清非编码长链RNA及微RNA表达水平与预后的关系
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作者 谢紫阳 姜小建 +1 位作者 孙佳 折彦儒 《国际医药卫生导报》 2025年第6期983-989,共7页
目的探讨原发性肺癌患者血清非编码长链RNA(long non-coding RNA,lncRNA)-GAS5、lncRNA UCA1、微RNA(microRNA,miR)-29a-3p的表达水平与预后关系。方法选取西安市中心医院2020年1月至2023年12月收治的原发性肺癌患者402例(肺癌组),男19... 目的探讨原发性肺癌患者血清非编码长链RNA(long non-coding RNA,lncRNA)-GAS5、lncRNA UCA1、微RNA(microRNA,miR)-29a-3p的表达水平与预后关系。方法选取西安市中心医院2020年1月至2023年12月收治的原发性肺癌患者402例(肺癌组),男196例、女206例,年龄(58.87±6.31)岁,所有患者均接受肺叶切除治疗。另选取院内同期体检的402例健康人作为对照(健康对照组),男179例、女223例,年龄(59.31±5.96)岁。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)法检测受试者血清中的lncRNA-GAS5、lncRNA UCA1、miR-29a-3p的表达水平。原发性肺癌患者随访12个月,根据生存预后分为生存组和死亡组,采用t、χ^(2)检验进行统计比较,logistic回归分析原发性肺癌患者预后的影响因素,评估lncRNA-GAS5、lncRNA UCA1、miR-29a-3p与原发性肺癌患者预后的关系。结果402例患者中死亡162例,病死率为40.30%。肺癌组患者的lncRNA-GAS5、miR-29a-3p表达水平低于健康对照组(均P<0.05),lncRNA UCA1表达水平高于健康对照组(P<0.05)。死亡组吸烟占比、低分化占比、TNMⅢ期占比、肿瘤大小、lncRNA UCA1水平高于生存组(均P<0.05);lncRNA-GAS5、miR-29a-3p水平低于生存组(均P<0.05)。吸烟(OR=3.117,95%CI:1.066~9.121)、分化程度(OR=3.337,95%CI 1.140~9.762)、TNM分期(OR=4.899,95%CI 1.674~14.332)、肿瘤大小(OR=4.023,95%CI 1.375~11.769)、lncRNA UCA1(OR=3.600,95%CI 1.231~10.533)、lncRNA-GAS5(OR=0.242,95%CI 0.083~0.708)、miRNA-29a-3p(OR=0.201,95%CI 0.069~0.589)是原发性肺癌患者死亡的影响因素(均P<0.05)。lncRNA-GAS5、lncRNA UCA1、miR-29a-3p单一及联合预测原发性肺癌死亡的灵敏度分别为0.713、0.804、0.706、0.883,特异度分别为0.772、0.781、0.687、0.901,曲线下面积分别为0.728、0.783、0.739、0.886。不同lncRNA-GAS5、lncRNA UCA1、miR-29a-3p表达组间的生存曲线比较,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论lncRNA UCA1高表达与lncRNA-GAS5、miR-29a-3p低表达与原发性肺癌患者的预后结局有关。 展开更多
关键词 预后 原发性肺癌 非编码长链-GAS5 非编码长链UCA1 微RNA-29a-3p
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JNK信号通路在骨肉瘤中的研究进展 被引量:1
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作者 秦庆庆 王一坤 +1 位作者 阳庆林 王勇平 《中国药理学通报》 北大核心 2025年第6期1001-1005,共5页
骨肉瘤(osteosarcoma,OS)是最常见的原发性骨恶性肿瘤,具有很高的局部浸润和转移倾向。c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinases,JNK)是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)家族中极为重要的一员,而且JNK信... 骨肉瘤(osteosarcoma,OS)是最常见的原发性骨恶性肿瘤,具有很高的局部浸润和转移倾向。c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinases,JNK)是丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)家族中极为重要的一员,而且JNK信号通路已被证明参与调控了OS的发生发展。该文就JNK信号通路调控OS的增殖、迁移、侵袭、血管生成、自噬、凋亡和焦亡等生物学行为,以及氧化应激和非编码RNA通过JNK信号通路对OS调控的研究进展进行综述,进一步探究JNK信号通路的内在调控机制,为寻找OS的治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 JNK 骨肉瘤 信号通路 MIRNA lncRNA 机制
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非编码RNA在非小细胞肺癌放射抗性中的作用 被引量:1
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作者 陈梦丹 王华英 俞万钧 《新医学》 2025年第5期519-527,共9页
肺癌不仅是全球常见的恶性肿瘤之一,而且是全球病死率最高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的亚型。放射治疗是晚期NSCLC患者的主要治疗方式之一,而长期治疗过程中产生的放射抗性是导致放射治疗失败和预后差的关键。随着全... 肺癌不仅是全球常见的恶性肿瘤之一,而且是全球病死率最高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌(NSCLC)是最常见的亚型。放射治疗是晚期NSCLC患者的主要治疗方式之一,而长期治疗过程中产生的放射抗性是导致放射治疗失败和预后差的关键。随着全基因组和RNA测序技术的广泛应用以及在此基础上对非编码RNA(ncRNA)生物学功能的深入探究,越来越多的证据表明ncRNA是肿瘤发生发展中的关键调节因子,其中不同的ncRNA在肿瘤放射抗性上起着促进或抑制作用,有望成为肿瘤诊断的标志物和肿瘤治疗的新靶点。文章对近年研究较多的ncRNA如微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)在NSCLC放射抗性中的作用研究进展进行综述。 展开更多
关键词 肺癌 放射抗性 非编码RNA 微小RNA 长链非编码RNA 环状RNA
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龙柴降血方对原发性血小板增多症转录组关键节点的调控 被引量:2
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作者 赵霈 杨二鹏 +6 位作者 孙妍 李雨蒙 郑茂凤 陈卓 王明镜 吕妍 胡晓梅 《世界中西医结合杂志》 2025年第1期126-135,共10页
目的基于转录组学,构建原发性血小板增多症(Essential thrombocythemia,ET)相关lncRNA-miR⁃NA-mRNA调控网络,并寻找龙柴降血方发挥治疗作用的靶点。方法纳入28例ET患者和14例健康人。其中10例患者治疗前的标本和5例健康人的标本用于lnc... 目的基于转录组学,构建原发性血小板增多症(Essential thrombocythemia,ET)相关lncRNA-miR⁃NA-mRNA调控网络,并寻找龙柴降血方发挥治疗作用的靶点。方法纳入28例ET患者和14例健康人。其中10例患者治疗前的标本和5例健康人的标本用于lncRNA、miRNA、mRNA高通量测序;剩余9例健康人和18例ET患者治疗前的标本用做荧光定量PCR(Quantitative realtime PCR,qPCR)检测验证高通量测序的结果;最后将上述患者按1∶1纳入观察组(龙柴降血方+基础治疗)和对照组(基础治疗),用qPCR检测他们在治疗4个月后标本中的关键差异基因表达水平。结果5个lncRNA、12个miRNA和19个mRNA被纳入lncRNA-miRNA-mRNA网络,共包含7对miRNA-lncRNA、35对miRNA-mRNA关系。差异mRNA的GO和KEGG富集分析表明,血小板活化信号通路和PI3K-AKT信号通路在ET中显著富集。两条通路涉及的关键靶点有:F2R、ITGA2B、ITGB1、ITGB3、PTGS1、GP1BB、THBS1和YWHAH,这些与血栓和增殖相关。利用qPCR验证上述网络节点,与健康组相比,18例ET患者GP1BB、ITGB1、THBS1、F2R、ITGA2B、ITGB3和YWHAH的表达水平显著上调,差异有统计学意义(P<0.05),与高通量测序结果一致,PTGS1无显著差异(P>0.05)。使用qPCR检测上述患者治疗后样本中除PTGS1外的关键节点。与对照组比较,观察组治疗后THBS1、F2R和ITGB3的表达水平显著降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论龙柴降血方可能通过下调THBS1、F2R和ITGB3的表达水平,调控ET相关lncRNA-miRNA-mRNA网络中的血小板活化信号通路和PI3K-AKT信号通路。 展开更多
关键词 龙柴降血方 原发性血小板增多症 lncRNA MIRNA MRNA 调控网络 转录组学
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非编码RNA在前列腺上皮-间质转化调控中的作用机制及中药干预研究进展
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作者 刘新越 范姗姗 +5 位作者 李晨铭 马路遥 刘云龙 吕春晓 李自强 黄宇虹 《药物评价研究》 北大核心 2025年第7期2039-2047,共9页
前列腺是男性特有的性腺器官,上皮-间质转化(EMT)在前列腺细胞生物学行为中扮演着重要角色,影响多种前列腺疾病发生发展。EMT是一个复杂的细胞过程,表现为上皮细胞失去其极性、细胞间连接和基底膜附着改变,并获得间质细胞的特性。非编码... 前列腺是男性特有的性腺器官,上皮-间质转化(EMT)在前列腺细胞生物学行为中扮演着重要角色,影响多种前列腺疾病发生发展。EMT是一个复杂的细胞过程,表现为上皮细胞失去其极性、细胞间连接和基底膜附着改变,并获得间质细胞的特性。非编码RNA(ncRNA)参与调控前列腺上皮细胞EMT过程,在前列腺疾病中发挥关键作用。近年来,中药在EMT介导的前列腺疾病中作用的研究日益增多,并逐渐成为研究焦点。基于此,围绕ncRNA在前列腺EMT中的调控机制及中药干预作用展开综述,追踪前列腺疾病EMT进程中ncRNA的调控作用及潜在机制的研究前沿,归纳近年常见中药及其成分的干预作用,探讨其作为前列腺疾病诊断和治疗靶点的潜力,为前列腺疾病的治疗提供新思路。 展开更多
关键词 前列腺 非编码RNA 微小RNA 长链非编码RNA 环状RNA 上皮-间质转化 中药
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基于全转录组测序的亚洲柑橘木虱激素生物合成相关基因互作网络构建
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作者 朱莉 吕佳 +2 位作者 黄振东 蒲占湑 刘顺民 《生物安全学报(中英文)》 北大核心 2025年第3期264-274,共11页
【目的】深入了解亚洲柑橘木虱的转录后调控机制,为丰富亚洲柑橘木虱发育调控网络提供重要分子信息。【方法】基于亚洲柑橘木虱全发育历期混样的全转录组测序,围绕昆虫激素生物合成信号通路进行新转录本挖掘、转录本变异统计、基因结构... 【目的】深入了解亚洲柑橘木虱的转录后调控机制,为丰富亚洲柑橘木虱发育调控网络提供重要分子信息。【方法】基于亚洲柑橘木虱全发育历期混样的全转录组测序,围绕昆虫激素生物合成信号通路进行新转录本挖掘、转录本变异统计、基因结构分析、互作miRNA预测及miRNA-LncRNA和miRNA-CircRNA互作网络构建,使用皮尔逊双变量相关性分析候选miRNA表达与激素相关基因表达间的相关性。【结果】本研究鉴定到25个可注释到昆虫激素生物合成信号通路的新转录本,并发现JH-o-MT、JHEH2、MFE、FOHSDR、ALDH、JHE等基因可能存在新的非编码区域。通过miRNA预测挖掘到miR-252a-5p、miR-315-5p、miR-71-5p、miR-993-3p、miR-1000-5p、miR-929-5p共6类miRNA可与FOHSDR和JHEH2分别存在互作。进一步构建FOHSDR/JHEH2-miRNA-LncRNA和FOHSDR/JHEH2-miRNA-CircRNA互作网络发现,MSTRG.30118.1、MSTRG.16869.1、MSTRG.39461.1、MSTRG.29283.2等8条LncRNA可与5类miRNA存在互作,dcicirc_003865、dcicirc_001724、dcicirc_004421、dcicirc_006125、dcicirc_006016等45条CircRNA与6类miRNA均存在互作。此外,miR-252a-1-5p、miR-315-1-5p、miR-71-2-5p和miR-929-1-5p在取食嫩梢后呈现出低表达水平。实时荧光定量和表达量相关性分析结果指出,miR-929-1-5p与JH合成关键限速酶HMGCR呈高度负相关,miR-252a-1-5p和miR-929-1-5p的表达均与JH合成基因FPPS、FA-o-MT,20E合成基因Sad呈中度负相关。【结论】本研究首次构建了亚洲柑橘木虱FOHSDR/JHEH2-miRNA-LncRNA和FOHSDR/JHEH2-miRNA-CircRNA互作网络,不仅获得了一些具有高连通性的miRNA、LncRNA和CircRNA,还发现miR-252a-1-5p和miR-929-1-5p可能与柑橘木虱取食嫩梢后启动JH和20E生物合成存在重要联系。相关研究结果暗示了这些miRNA、LncRNA和CircRNA在亚洲柑橘木虱激素生物合成的转录后调控中可能存在重要功能,为解析亚洲柑橘木虱发育转录后调控机制提供了重要线索。 展开更多
关键词 亚洲柑橘木虱 发育 生殖 小RNA 长链非编码RNA 环状RNA
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非编码RNA调控牦牛脂肪沉积的研究进展
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作者 陈建宇 孙永刚 +4 位作者 韩银仓 丁维芹 刘亚倩 靳生伟 苟发杰 《饲料工业》 北大核心 2025年第24期98-103,共6页
牦牛是青藏高原及周边地区的特有家畜,是高海拔地区重要的生产资料。脂肪组织是机体重要的能量代谢器官,在机体能量稳态的调节过程中发挥着重要的作用,与肉品质等生产性状密切相关。脂肪沉积受多种因素调控,非编码RNA(non-coding RNA,nc... 牦牛是青藏高原及周边地区的特有家畜,是高海拔地区重要的生产资料。脂肪组织是机体重要的能量代谢器官,在机体能量稳态的调节过程中发挥着重要的作用,与肉品质等生产性状密切相关。脂肪沉积受多种因素调控,非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是影响脂肪沉积的重要调节因子,包括微小RNA(microRNA,miRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和环状RNA(circular RNA,circRNA)。文章简要介绍了脂肪沉积过程、ncRNA的种类和特点,综述了近年来与牦牛脂肪沉积相关的ncRNA及其作用机制,以期为牦牛肉品质改良提供参考。 展开更多
关键词 牦牛 MIRNA lncRNA circRNA 脂肪沉积 调控机制
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非编码RNA在脑出血的作用及机制研究进展 被引量:1
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作者 刘鹏 熊涛 +6 位作者 陈秋欣 姚卫灵 胡文悦 肖周华 王欣 朱杉杉 张菶 《中国医药导刊》 2025年第3期220-226,共7页
脑出血(ICH)是指脑实质内血管破裂导致血液外渗并形成血肿的一种急性脑血管疾病,作为中风的一个亚型,具有高致残率和高死亡率的特点,给个人、家庭和社会带来沉重负担。ICH病因多样,主要包括高血压、脑血管畸形等。ICH后的病理损伤包括... 脑出血(ICH)是指脑实质内血管破裂导致血液外渗并形成血肿的一种急性脑血管疾病,作为中风的一个亚型,具有高致残率和高死亡率的特点,给个人、家庭和社会带来沉重负担。ICH病因多样,主要包括高血压、脑血管畸形等。ICH后的病理损伤包括原发性和继发性脑损伤,ICH后血肿的占位效应会压迫脑组织引起原发性脑损伤,而血肿成分及其降解产物可以导致继发性脑损伤,如影响线粒体功能障碍、小胶质细胞激活、神经递质和炎症介质的释放而对脑组织造成损伤。目前治疗脑出血的方法主要是手术和内科治疗,但是均具有一定的局限性。非编码RNAs(Non-coding RNAs,ncRNAs)主要分为3类:microRNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA)。大量研究结果显示ncRNAs在脑出血病理机制中扮演重要角色,与疾病预后密切相关。非编码RNA在脑出血中的研究逐渐深入,本研究通过对非编码RNA调节ICH后的增殖与氧化应激、神经与血管再生、自噬、脑水肿和血脑屏障、细胞死亡和炎症等机制进行综述,以期为ICH的研究和临床治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 脑出血 非编码RNA MIRNA lncRNA circRNA
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基于全转录组测序的2个不同品种绵羊卵巢ceRNA网络构建及关键miRNA的筛选 被引量:1
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作者 谷博 王安琪 +4 位作者 于鑫淼 郭俊彤 杨一 邓祎婕 姜怀志 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第6期2765-2777,共13页
旨在解析非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)对绵羊卵巢发育过程的分子调控机制,筛选提高绵羊繁殖力的关键基因。本研究以多胎型(小尾寒羊)和单胎型(乌珠穆沁羊)绵羊为材料,选取健康成年母羊各3只,构建卵巢组织ncRNA及mRNA表达谱,筛选差... 旨在解析非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)对绵羊卵巢发育过程的分子调控机制,筛选提高绵羊繁殖力的关键基因。本研究以多胎型(小尾寒羊)和单胎型(乌珠穆沁羊)绵羊为材料,选取健康成年母羊各3只,构建卵巢组织ncRNA及mRNA表达谱,筛选差异表达(differentially expressed,DE)lncRNAs、circRNAs、miRNAs及mRNAs,并对其进行靶基因预测以及功能和信号通路的富集分析,筛选出繁殖相关通路进一步构建ceRNA(lncRNA-miRNA-mRNA和circRNA-miRNA-mRNA)调控网络,最后总结调控网络中的关键miRNA。结果显示,乌珠穆沁羊和小尾寒羊卵巢组织共筛选出差异表达lncRNAs共1579个,circRNA共561个,miRNAs共175个及mRNAs共3095个。GO和KEGG富集分析结果显示,差异表达的靶基因显著富集于胚胎的形态发生、减数分裂的激活等生物过程及粘蛋白型O-聚糖生物合成、鞘糖脂生物合成、精氨酸鸟氨酸代谢等信号通路。筛选繁殖相关通路上富集到的差异表达基因,构建1个ceRNA网络(包含87个lncRNA,27个circiRNA,3个miRNA和3个mRNA),获得3个关键miRNAs(miR-140、miR-338及miR-423-5p)及对应的靶向调控ceRNA网络。采用qRT-PCR方法对随机选取的9个差异表达lncRNAs、circRNAs、miRNAs、mRNAs进行验证,结果证实了RNA-seq测序的准确性。本研究对DE ncRNAs与对应靶基因的协调调控机制进行分析,为阐明调控绵羊卵巢发育的关键基因及分子机制提供有效理论依据,进而充分了解绵羊的繁殖生物学特性,对于提高繁殖效率具有重要指导意义。 展开更多
关键词 乌珠穆沁羊 小尾寒羊 卵巢 lncRNA circRNA MIRNA ceRNA网络
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山羊骨骼肌发育相关非编码RNA研究进展
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作者 李静轩 林岩娇 +2 位作者 黄琼君 韩新燕 张月朗 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第2期582-592,共11页
山羊肉具有肉质细嫩、脂肪和胆固醇含量低等特点,深受消费者喜爱。骨骼肌是动物机体的重要组成部分,很大程度上影响山羊的产肉量和肉品质。许多基因、信号通路和分子参与调控骨骼肌的生长发育,如生肌调节因子家族(MRFs)、配对盒基因家族... 山羊肉具有肉质细嫩、脂肪和胆固醇含量低等特点,深受消费者喜爱。骨骼肌是动物机体的重要组成部分,很大程度上影响山羊的产肉量和肉品质。许多基因、信号通路和分子参与调控骨骼肌的生长发育,如生肌调节因子家族(MRFs)、配对盒基因家族(PAX)、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等。非编码RNA(ncRNA)包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等,通过对这些基因和信号通路进行调控,进而在骨骼肌的生长发育过程中发挥重要作用。如miR-495-3p、miR-101a、miR-27b、lncR-125b等能够促进骨骼肌卫星细胞的分化;miR-99b-3p能够促进骨骼肌卫星细胞增殖。部分lncRNA通过充当miRNA海绵,调节靶基因的表达,进而调控骨骼肌的生长发育。对参与调控山羊骨骼肌发育的ncRNA进行研究,有利于了解山羊骨骼肌的生长发育过程,对于肉品质的改善也有重要作用。作者简要介绍了山羊骨骼肌发育相关miRNA、lncRNA、circRNA的功能及相关的调控机制,为进一步研究ncRNA调控山羊骨骼肌发育提供参考。 展开更多
关键词 山羊 骨骼肌发育 MIRNA lncRNA circRNA
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