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拟南芥At-pri-miR828基因的克隆及其对番茄的遗传转化 被引量：6
1
作者 贾小云 于治芹 +5 位作者 梁建萍 唐贵良 金雷皓 张莉 贺立恒 李润植 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期2419-2428,共10页
MicroRNA828(miRNA828)是一种新近发现的生物学功能还未全面研究的miRNA。为从不同角度阐明miRNA828的生物学功能,从拟南芥中克隆到At-pri-miR828基因并构建了该基因过量表达的植物表达载体pC2300-pOT2-At-pri-miR828,通过农杆菌介导的... MicroRNA828(miRNA828)是一种新近发现的生物学功能还未全面研究的miRNA。为从不同角度阐明miRNA828的生物学功能,从拟南芥中克隆到At-pri-miR828基因并构建了该基因过量表达的植物表达载体pC2300-pOT2-At-pri-miR828,通过农杆菌介导的叶盘法将pC2300-pOT2-At-pri-miR828导入异源植物番茄品种‘Ailsa Craig’中。PCR鉴定结果显示,外源基因At-pri-miR828已成功整合到转基因番茄基因组中,共获得9个转基因株系,67株转基因植株。定量PCR检测结果显示,与野生型番茄植株相比,转基因植株中miR828的表达量显著增加,而生物信息学所预测的miR828靶基因Sly-myb-like1的表达水平则相应降低。花青素含量测定结果显示,miR828过量表达的转基因番茄植株花青素含量明显低于野生型植株,表明miR828参与了番茄花青素的生物合成调控。 展开更多
关键词 番茄 mir828 Sly-myb-likel花青素 实时定量PCR
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植物发育相关miR828基因家族靶基因预测及生物信息学分析 被引量：1
2
作者 韩雪杨 刘宁 +3 位作者 温鑫 魏继承 任如意 郝爱平 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期515-522,共8页
MicroRNAs(miRNAs)是一类小的调节性RNA。miRNAs在生物体内许多自然和病理过程中发挥重要作用。为了研究植物miR828家族特征及生物学功能,利用生物信息学方法对miR828成员二级结构、靶基因预测、序列比对、进化树进行分析。通过PmiREN... MicroRNAs(miRNAs)是一类小的调节性RNA。miRNAs在生物体内许多自然和病理过程中发挥重要作用。为了研究植物miR828家族特征及生物学功能,利用生物信息学方法对miR828成员二级结构、靶基因预测、序列比对、进化树进行分析。通过PmiREN数据库获取miR828家族成员的前体和成熟序列,通过前体序列在线预测二级结构,通过成熟序列进行序列对比、预测靶基因并构建进化树。从数据库中共获得45个成熟miR828成员,仅分布在被子植物中。前体和成熟miRNAs在植物进化过程中高度保守。二级结构预测发现,植物miR828家族成员都能形成稳定的茎环结构。靶基因预测分析发现,miR828家族靶基因包括结构域蛋白、转录因子、载体蛋白、泛素连接酶等,多为MYB转录因子及MYB结构域蛋白。进化树分析表明,miR828家族成员间的亲缘关系较近。这些结果为进一步研究植物miR828家族特征及功能提供了基础。 展开更多
关键词 mir828 靶基因 生物信息学
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紫娟茶树miR828a靶基因WER的克隆及生物信息学分析
3
作者 刘悦 曲浩 +4 位作者 尚卫琼 孙云南 田易萍 仝佳音 陈林波 《山西农业科学》 2020年第11期1707-1710,1723,共5页
为进一步了解mi R828a靶基因WER的功能及生物学特性,通过RACE方法对紫娟茶树WER基因进行克隆,并使用生物信息学Protparam、Signal P、SWISS-Mo DEL等工具对其序列进行分析。结果表明,WER基因全长885 bp,含有一条276 bp的完整开放阅读框... 为进一步了解mi R828a靶基因WER的功能及生物学特性,通过RACE方法对紫娟茶树WER基因进行克隆,并使用生物信息学Protparam、Signal P、SWISS-Mo DEL等工具对其序列进行分析。结果表明,WER基因全长885 bp,含有一条276 bp的完整开放阅读框,编码92个氨基酸,与番樱桃So MYB114具有较高的亲缘性;WER属于不稳定亲水蛋白,具有跨膜结构域,亚细胞定位于质膜和线粒体上,推测WER蛋白在质膜和线粒体上发挥信号转导的作用。 展开更多
关键词 茶树 mir828a WER RACE方法 克隆 生物信息学分析
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拟南芥MicroRNA828负调控蔗糖诱导的花青素合成 被引量：9
4
作者 谢烨 孙毅 +1 位作者 李淡宁 黄继荣 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期188-194,共7页
花青素生物合成途径及转录调控因子虽然已基本被阐明,但其调控机理仍在日益更新。本研究利用蔗糖诱导花青素合成的表型,建立了一种筛选拟南芥花青素代谢突变体的方法。我们从T-DNA插入突变体库中筛选出一株花青素合成过量突变体,基因克... 花青素生物合成途径及转录调控因子虽然已基本被阐明,但其调控机理仍在日益更新。本研究利用蔗糖诱导花青素合成的表型,建立了一种筛选拟南芥花青素代谢突变体的方法。我们从T-DNA插入突变体库中筛选出一株花青素合成过量突变体,基因克隆结果表明是由MicroRNA828(miR828)的功能缺失所致。进一步研究发现miR828过表达植株中蔗糖诱导的花青素积累较野生型减少,这与敲除miR828的靶基因TAS4导致花青素积累比野生型高的结果一致,表明miR828负调控花青素合成。miR828在各组织中表达量很低,但其表达受到蔗糖诱导。在讨论中,我们提出了miR828调控蔗糖诱导花青素合成的模型。 展开更多
关键词 花青素 mir828 TAS4 蔗糖 负调控
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