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miR169a调节马铃薯气孔特性适应动态环境
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作者 张宏冠 雷紫芊 +6 位作者 王明 张幸媛 毛俊 林原 胡新喜 熊兴耀 秦玉芝 《园艺学报》 北大核心 2025年第11期2889-2898,共10页
为了验证马铃薯MicroRNA169a(miR169a)作用于气孔的特定功能,分别构建了马铃薯miR169a过表达(OE169a)与沉默株系(STTM169),以野生型为对照,测定相关指标。结果显示OE169a提高马铃薯处于动态环境下的气孔开度,降低其净光合速率(P_(n))、... 为了验证马铃薯MicroRNA169a(miR169a)作用于气孔的特定功能,分别构建了马铃薯miR169a过表达(OE169a)与沉默株系(STTM169),以野生型为对照,测定相关指标。结果显示OE169a提高马铃薯处于动态环境下的气孔开度,降低其净光合速率(P_(n))、胞间二氧化碳浓度(C_(i))、内部水分利用率(iWUE)及抗氧化能力;STTM169降低马铃薯处于动态环境下的气孔开度,提高其P_(n)、C_(i)、iWUE及抗氧化能力。综上所述,沉默miR169可降低马铃薯处于动态环境下的气孔开度,并在逆境下维持较高的光能及水份利用率,从而提升马铃薯对动态环境的适应性。 展开更多
关键词 mir169 气孔 动态环境 光合特性 马铃薯
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马铃薯miR169基因序列分析与启动子瞬时诱导表达
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作者 毛俊 张幸媛 +2 位作者 雷紫芊 肖乐书 秦玉芝 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第21期80-88,共9页
为研究马铃薯miR169基因家族的特征,探讨其功能及调控机制,从miRBase数据库得到8个马铃薯miR169家族成员的序列与染色体定位信息。运用ClustalX 2.1和Weblogo3比对分析马铃薯stu-miR169的序列及其碱基保守性;采用MEGA 11和邻接法构建拟... 为研究马铃薯miR169基因家族的特征,探讨其功能及调控机制,从miRBase数据库得到8个马铃薯miR169家族成员的序列与染色体定位信息。运用ClustalX 2.1和Weblogo3比对分析马铃薯stu-miR169的序列及其碱基保守性;采用MEGA 11和邻接法构建拟南芥、辣椒、番茄、马铃薯miR169前体序列间的进化关系树。用PLANTCARE分析stu-miR169基因启动子1 500 bp长度序列所包含的顺式作用元件。通过克隆stu-miR169家族启动子并且添加GUS标记遗传转化拟南芥,进行GUS染色分析stu-miR169启动子在不同组织中的活性和进行脱落酸(ABA)、聚乙二醇(PEG)、4℃低温处理后的调控特征。结果显示,stu-miR169基因家族成员之间的5′端序列高度相似,并共用1套stu-miR169-5p成熟体序列;stu-miR169a、stu-miR169b与Can-miR169i,stu-miR169d与Can-miR169j、Can-miR169k,stu-miR169f与sly-miR169e近源。StmiR169的启动子含有包括ABRE、TATC-box、P-box、TGA-element和LTR等在内的激素和光温响应调控元件以及TC-rich repeats、ARE、DRE core、MYB、MYC、W-box等胁迫调控元件。GUS组织表达特征分析发现,stu-miR169a、stu-miR169c、stu-miR169f可全株表达,stu-miR169d、stu-miR169e仅在叶缘弱表达,stu-miR169b、stu-miR169g、stu-miR169h在下胚轴无表达;另外,stu-miR169家族成员均受到外源ABA、PEG和4℃低温的诱导,但表达丰度存在明显差异,其中stu-miR169a的启动子受到干旱、ABA和4℃低温的强烈诱导。综上,miR169在马铃薯、番茄和辣椒中存在一定的功能保守性;马铃薯miR169家族参与生长发育调控,根据组织表达特征可分成3个亚组,亚组内成员间存在功能冗余;其对外源ABA、PEG、4℃低温处理的响应模式存在类似的差异化表达特征,表明其不同的家族成员在特定的环境或发育阶段中具有不同作用。 展开更多
关键词 马铃薯 mir169 序列分析 启动子 瞬时表达
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植物miR169/NF-YA调控模块研究进展 被引量:15
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作者 徐妙云 朱佳旭 +1 位作者 张敏 王磊 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期700-706,共7页
MicroRNAs(miRNAs)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。miR169家族是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在转录后水平调控植物中一类保守的转录因子NF-YA(Nuclear transcription factor Y subunit A)。... MicroRNAs(miRNAs)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。miR169家族是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在转录后水平调控植物中一类保守的转录因子NF-YA(Nuclear transcription factor Y subunit A)。已有研究表明,miR169/NF-YA调控模块对植物的发育和逆境响应起着重要作用。本文对植物miR169基因家族的起源、进化、分子多样性及miR169/NF-YA模块在植物中调控功能的研究进展进行了阐述,特别介绍了miR169/NF-YA参与调控"逆境诱导早花"的分子机制,并展望了未来的研究方向。 展开更多
关键词 mir169家族 靶基因 NF-YA 调控模块 发育 逆境响应
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葡萄miR169及其靶基因的生物信息学分析 被引量:8
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作者 方辉 曲俊杰 +2 位作者 孙嘉曼 尹玲 潘凤英 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1329-1334,共6页
【目的】明确葡萄miR169(vvi-miR169)基因家族在葡萄生长发育及逆境胁迫响应中的重要作用,为其在葡萄分子育种和抗逆新品种选育中的应用提供参考依据。【方法】利用miRNA、Phytozome、NCBI等数据库及Clustal X2.1、MEGA 6.0、RNAfold We... 【目的】明确葡萄miR169(vvi-miR169)基因家族在葡萄生长发育及逆境胁迫响应中的重要作用,为其在葡萄分子育种和抗逆新品种选育中的应用提供参考依据。【方法】利用miRNA、Phytozome、NCBI等数据库及Clustal X2.1、MEGA 6.0、RNAfold Web Server、ps RNATarget等在线软件对vvi-miR169基因家族的序列分布、定位特征、二级结构、发育进化树和靶基因调控功能进行生物信息学分析。【结果】在miRBase中搜索到25条vvi-miR169基因同源序列,分别分布在6条染色体上,其中以位于Chr11上的序列最多,共有17条,位于Chr01、Chr04和Chr14上各有2条,而在Chr08和Chr17上各有1条。vvi-miR169基因家族成熟序列的碱基保守性很高,其前体序列均可形成稳定的二级茎环结构,且位于同一条染色体上的miR169基因序列显示出相对更近的亲缘关系。vvi-miR169基因家族共预测到21个靶基因,绝大部分miRNA都有多个靶基因,且不同miRNA具有相同的靶基因,其中有22个miRNA靶基因均含有GSVIVT01015120001(NF-YA转录因子)。【结论】vvi-miR169基因家族序列保守性较高,家族特征明显,且具有相似的调控功能;NF-YA转录因子是vvi-miR169基因家族最主要的靶基因,也是葡萄生长发育过程中抗逆境胁迫的主要调控元件。 展开更多
关键词 葡萄 mir169基因 靶基因 NF-YA转录因子 生物信息学
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油菜Bna-miR169d基因的分离与过表达初步分析 被引量:8
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作者 董云 王毅 +5 位作者 靳丰蔚 孙万仓 刘自刚 方彦 徐妙云 王磊 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期1809-1815,共7页
miRNA是一类长度约为21~24nt的内源性非编码RNA,在基因表达调控网络中起着重要作用。miR169家族是植物中最大的miRNA家族,其成员在植物的生长发育过程中发挥重要的调控作用。但至今仍缺乏系统研究,为了探究油菜miR169的功能,本研... miRNA是一类长度约为21~24nt的内源性非编码RNA,在基因表达调控网络中起着重要作用。miR169家族是植物中最大的miRNA家族,其成员在植物的生长发育过程中发挥重要的调控作用。但至今仍缺乏系统研究,为了探究油菜miR169的功能,本研究从油菜栽培种‘Westar’中克隆了miR169d前体基因,并构建了miR169d的过表达载体,通过农杆菌介导法将其转化到甘蓝型油菜‘Westar’品种中,经PCR法鉴定获得4株阳性株,其中2株T0代表现早花,较对照生育期缩短10~12d。初步推测,油菜miR169d可能通过调控靶基因的表达参与了油菜的早花发育。 展开更多
关键词 油菜 开花 早熟 mir169 遗传转化
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杨树MIR169基因家族分子进化分析 被引量:7
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作者 刘志祥 曾超珍 谭晓风 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1307-1316,共10页
MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员,是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR... MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员,是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR169基因家族的分子系统发育、基因倍增模式、表达分化和靶基因进行了分析。结果表明,染色体大片段重复和串联重复在毛果杨MIR169基因家族扩张中均具有重要作用;MIR169基因家族在表达方式上已经出现了较大的分化;MIR169基因家族可能在杨树中已经形成了复杂的调控网络,对杨树的生长发育和适应性等具有重要的调控作用。文章为杨树及杨柳科相关植物中miRNA基因家族的分子进化研究提供了参考。 展开更多
关键词 毛果杨 mir169基因家族 分子进化
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Ath-miR169d介导的拟南芥叶片发育的分子调控机制 被引量:2
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作者 张敏 朱明 +5 位作者 李文宗 马洁 刘悦萍 江海洋 王磊 徐妙云 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第16期3063-3070,共8页
【目的】探究ath-miR169d在拟南芥叶片发育过程中的作用,明确其调控的分子机制,为增强叶菜类植物的光合效率以及增加生物量和提高作物产量提供理论依据。【方法】选取ath-miR169d过表达和降低表达的拟南芥转基因株系以及野生型拟南芥,... 【目的】探究ath-miR169d在拟南芥叶片发育过程中的作用,明确其调控的分子机制,为增强叶菜类植物的光合效率以及增加生物量和提高作物产量提供理论依据。【方法】选取ath-miR169d过表达和降低表达的拟南芥转基因株系以及野生型拟南芥,在22℃、相对湿度60%、16 h/8 h光周期条件下培养,观察不同生长阶段叶片发育表型的差异;同时构建pmiR169d::GUS表达载体,转化农杆菌EHA105,并利用蘸花法转化野生型拟南芥(Columbia,Col-0),获得转基因拟南芥,利用GUS染色对ath-miR169d在拟南芥不同组织器官中的表达模式进行研究;选取8周龄的过表达材料和野生型对照株系,对其叶片表皮细胞形态进行扫描电镜分析;对4周龄过表达材料和野生型对照株系的幼苗顶端分生组织和叶片中总IAA进行定量分析,并进行基因芯片表达谱分析,筛选差异表达基因;通过实时荧光定量PCR对生长素信号途径部分差异表达关键基因的表达情况进行分析。【结果】Ath-miR169d过表达拟南芥株系莲座叶数目较野生型少,叶片小,而ath-miR169d降低表达的拟南芥株系的莲座叶较野生型多,叶片大,且在抽薹和种子成熟之后还持续长出新叶,而野生型莲座叶则在种子成熟之后逐渐衰老干枯;扫描电镜观察到ath-miR169d过表达拟南芥株系叶片中表皮细胞小于野生型;表达模式分析表明,ath-miR169d主要在顶端分生组织(shoot apical meristem,SAM)和叶片维管系统中表达,且新叶中表达强。SAM是产生生长素的部位,IAA测定结果表明ath-miR169d过表达拟南芥株系中IAA含量显著降低,为野生型植株的38.6%,同时基因芯片表达谱分析也验证了ath-miR169d参与调控植物体内激素信号转导途径。进一步研究发现,ath-miR169d过表达株系中生长素合成关键基因YUC2和转运体蛋白基因PIN1均显著下调表达,而具有转录抑制功能的生长素响应因子1和2基因(ARF1和ARF2)表达上调;STTM miR169d低表达株系中这4个基因的表达则为相反趋势,该结果与观察到的表型相一致。【结论】Ath-miR169d通过介导生长素信号途径参与了拟南芥叶片发育的调控,ath-miR169d表达量发生变化会影响叶片的数量和大小,最终影响整个植株的生物量。 展开更多
关键词 拟南芥 mir169 叶片 发育 生长素信号途径
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实时荧光定量PCR检测miR169g在脱水与高盐胁迫下胡杨叶中的表达 被引量:6
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作者 覃玉蓉 夏新莉 尹伟伦 《现代仪器》 CAS 2011年第3期28-30,共3页
microRNAs是一类具有重要功能的约由22个核苷酸组成的小分子非编码RNAs,一些miRNAs在植物非生物胁迫中发挥着重要的作用。本文采用stem-loopSYBR Green实时RT-PCR方法检测miR169g在脱水与高盐处理下胡杨叶中的表达情况,结果表明,miR169... microRNAs是一类具有重要功能的约由22个核苷酸组成的小分子非编码RNAs,一些miRNAs在植物非生物胁迫中发挥着重要的作用。本文采用stem-loopSYBR Green实时RT-PCR方法检测miR169g在脱水与高盐处理下胡杨叶中的表达情况,结果表明,miR169g脱水与高盐胁迫下胡杨叶中均表达上调。此方法灵敏简便,结果稳定可靠,适用于检测短序列miRNAs成熟体的表达。 展开更多
关键词 实时 RT-PCR mir169g 胡杨 脱水 高盐
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鹰嘴豆miR169家族的生物信息学分析及靶基因预测 被引量:2
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作者 于月华 王朝露 倪志勇 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第12期3887-3895,共9页
在多种植物中miR169家族成员应答多种非生物胁迫,如高盐,低温和干旱。为了揭示Car-miR169的生物学功能,对Car-miR169家族13个成员的序列进行生物信息学分析及靶基因预测。染色体定位结果表明,11个Car-miR169成员分布在鹰嘴豆Ca1、Ca2、... 在多种植物中miR169家族成员应答多种非生物胁迫,如高盐,低温和干旱。为了揭示Car-miR169的生物学功能,对Car-miR169家族13个成员的序列进行生物信息学分析及靶基因预测。染色体定位结果表明,11个Car-miR169成员分布在鹰嘴豆Ca1、Ca2、Ca4、Ca6和Ca75条染色体上,Car-miR169g和Car-miR169l分别定位在scaffold2734和scaffold362上。Car-miR169a和Car-miR169i在鹰嘴豆Ca1染色体上成簇存在。Car-miR169f和Car-miR169m在鹰嘴豆Ca7染色体上成簇存在。序列比对表明13个Car-miR169成员的成熟miRNA序列一致性为84.28%。13个Car-MIR169成员的前体序列的二级结构分析结果表明,成熟的miRNA序列均位于5'端,均形成稳定的茎环结构。进化树分析表明,Car-MIR169a、Car-MIR169c、CarMIR169d、Car-MIR169e、Car-MIR169g与苜蓿的Mtr-MIR169家族亲缘关系较近。Car-MIR169b、Car-MIR169f、Car-MIR169h和大豆Gma-MIR169家族聚在一个分支,Car-MIR169i、Car-MIR169j、Car-MIR169k、CarMIR169l和水稻Os-MIR169a聚在一个分支,而Car-MIR169m单独为一个分支。靶基因预测表明大部分CarmiR169家族成员的靶基因为核转录因子A亚基。鹰嘴豆8个组织的转录组数据分析表明Car-miR169i、Car-miR169j、Car-miR169k、Car-miR169l在叶、茎、花蕾、花和豆荚中不表达,Car-miR169e在茎中不表达,其他成员在8个组织中均表达。这些研究结果为研究鹰嘴豆Car-miR169家族成员及其靶基因的功能提供了基础。 展开更多
关键词 鹰嘴豆 mir169 靶基因
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水稻miR169o及其靶基因OsNF-YAs对缺水胁迫的早期表达模式 被引量:5
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作者 陈禹彤 陈华民 +3 位作者 余超 Amy Thein 田芳 何晨阳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期76-81,共6页
Micro RNAs(mi RNAs)是一类小的非编码RNA,在植物逆境胁迫应答中发挥重要的调控作用。mi R169可受干旱胁迫诱导表达,而过表达mi R169则可以增强植物对干旱的耐受性。然而,mi R169及其靶基因NF-YAs在水稻干旱胁迫条件下的表达动态至今尚... Micro RNAs(mi RNAs)是一类小的非编码RNA,在植物逆境胁迫应答中发挥重要的调控作用。mi R169可受干旱胁迫诱导表达,而过表达mi R169则可以增强植物对干旱的耐受性。然而,mi R169及其靶基因NF-YAs在水稻干旱胁迫条件下的表达动态至今尚不清楚。对水稻进行不同时间缺水处理,用q RT-PCR法定量测定了水稻根、茎、叶组织中mi R169o及其靶基因表达的动态变化。结果表明,随着缺水处理时间的增加,水稻不同组织中mi R169o表达量总体上有升高趋势;而靶基因(NF-YA1、NFYA2和NF-YA3)表达模式基本与mi R169o的表达模式相反,但并不全部对应。推测在水稻干旱胁迫早期反应中,mi R169o可能主要调控了部分特定靶基因的表达。此外,mi R169o在水稻根、茎、叶组织中的表达和丰度存在着明显的差异,具有组织特异性。 展开更多
关键词 mir169o OsNF-YAs 水稻 干旱胁迫 表达模式
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辣椒miR169及其靶基因的生物信息学分析 被引量:4
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作者 刘雪梅 王悦 +3 位作者 李玮琦 魏继承 任如意 郝爱平 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1510-1515,共6页
为了解miR169基因家族在辣椒生长发育过程的重要调控作用,通过生物信息学的方法对can-miR169基因家族的成员进行了染色体定位、序列保守性分析、系统发育进化树分析、前体序列二级结构预测和靶基因预测。结果表明:can-miR169家族成员定... 为了解miR169基因家族在辣椒生长发育过程的重要调控作用,通过生物信息学的方法对can-miR169基因家族的成员进行了染色体定位、序列保守性分析、系统发育进化树分析、前体序列二级结构预测和靶基因预测。结果表明:can-miR169家族成员定位在4条染色体上;成熟序列高度保守,前体序列在产生成熟序列的位置高度保守;预测结果显示can-miR169家族成员均有靶基因,这些靶基因主要以靶基因核因子A(NF-YA)复合物为主,且大体相同。这些靶基因可以参与到种子萌发、植株发育和对外界环境胁迫的应答等多种生命活动中。 展开更多
关键词 mir169 辣椒 生物信息学 NF-YA
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谷子miR169家族及其靶基因的鉴定与功能分析 被引量:2
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作者 卢平 康庆芳 +7 位作者 赵孟瑶 张凤洁 武强强 马芳芳 王宇珅 韩渊怀 王兴春 李雪垠 《作物杂志》 北大核心 2022年第2期54-63,共10页
micro RNA广泛参与植物中多个生长发育过程,mi R169家族是最保守的mi RNA家族之一。对谷子mi R169(sit-miR169)家族进行生物信息学分析,包括染色体分布、系统进化、碱基保守性、二级结构和sit-mi R169及其靶基因的表达。鉴定了15个sit-m... micro RNA广泛参与植物中多个生长发育过程,mi R169家族是最保守的mi RNA家族之一。对谷子mi R169(sit-miR169)家族进行生物信息学分析,包括染色体分布、系统进化、碱基保守性、二级结构和sit-mi R169及其靶基因的表达。鉴定了15个sit-miR169,分布于7条染色体上。系统进化分析显示,sit-miR169家族前体sit-MIR169大致可以分为2簇,部分sit-MIR169成员与水稻osa-MIR169家族成员亲缘关系较近。sit-miR169的前体均可形成稳定的二级茎环结构,成熟体均产生于前体的5′端臂上,且成熟序列的碱基保守性很强。sit-miR169在花、叶和根中均有表达,具有明显组织表达特异性。sit-miR169的靶基因主要是NF-YA转录因子基因,此外还有L型凝集素类受体蛋白激酶、ω-6脂肪酸去饱和酶、转运蛋白Sec1a、SDG40蛋白、环指跨膜蛋白和核糖体大亚基假尿苷合酶SVR1基因等。mi R169通过调控靶基因,尤其是NF-YA的表达量来影响植物的生长发育和对环境的应答。谷子NF-YA基因主要在根和穗中表达,表现出明显的组织表达特异性。此外,sit-mi R169靶基因的表达受环境诱导,如干旱条件能进一步诱导Seita.9G521100基因在根中的表达。 展开更多
关键词 谷子 MIRNA mir169 靶基因 生物信息学
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山核桃miR169克隆及功能分析 被引量:3
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作者 舒李露 孙志超 +2 位作者 张玮 付顺华 王正加 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1453-1462,共10页
为探究山核桃miR169(cca-miR169)序列特征及功能,本研究利用生物信息学及分子生物学方法对山核桃中miR169进行分析。通过构建miR169系统进化树发现,双子叶植物和单子叶植物明显的分布在2个支上,且cca-miR169聚类在双子叶分支上;序列分... 为探究山核桃miR169(cca-miR169)序列特征及功能,本研究利用生物信息学及分子生物学方法对山核桃中miR169进行分析。通过构建miR169系统进化树发现,双子叶植物和单子叶植物明显的分布在2个支上,且cca-miR169聚类在双子叶分支上;序列分析表明,miR169在双子叶植物上的保守性大于单子叶植物。通过在线预测网站在拟南芥数据库和山核桃转录组数据库中对ccamiR169进行靶基因预测,在2物种中分别获得4个和3个靶基因,且AT2 G41820与Unigene17062为同源基因;表达分析表明,AT2G41820与Unigene17062在花发育时期表达量均呈下降趋势。在拟南芥中过表达cca-miR169发现,转基因植株开花较野生型提前4 d。对转基因植株及野生型植株中开花相关基因进行qRT-PCR分析,结果表明,开花促进因子LFY基因在转基因植株中表达量明显上调。cca-miR169具有较强的序列保守性,在拟南芥中过表达cca-miR169能够促进拟南芥提前开花,表明cca-miR169在山核桃中通过作用下游基因可以调节植物花发育。本研究结果为进一阐明山核桃成花调控机制提供了试验依据。 展开更多
关键词 山核桃 cca-mir169 LFY基因 QRT-PCR
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辣椒miR169家族在非生物胁迫下的表达及启动子顺式作用元件分析 被引量:5
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作者 黄渺 宋泽洋 +2 位作者 蔡骏一 南红 肇瑾 《西部林业科学》 CAS 北大核心 2023年第1期165-174,共10页
miRNA169(miR169)是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在非生物胁迫下的功能被广泛报道。为深入研究辣椒miR169基因家族(Can-miR169)在非生物胁迫下的表达及上游转录调控机制,以‘遵辣一号’(Zunla-1)为研究对象,利用生物信... miRNA169(miR169)是植物中保守且规模较大的一类miRNA基因家族,其在非生物胁迫下的功能被广泛报道。为深入研究辣椒miR169基因家族(Can-miR169)在非生物胁迫下的表达及上游转录调控机制,以‘遵辣一号’(Zunla-1)为研究对象,利用生物信息学手段分析辣椒与其他植物miR169成熟体和前体保守性和进化关系。采用real-time PCR技术对干旱、低温、高盐、高温胁迫下辣椒miR169基因家族前体进行应答检测。克隆辣椒Can-miR169基因家族12个成员启动子,进行顺式作用元件预测及元件功能验证。结果显示:(1)miR169成熟体在植物中保守性强。(2)4种非生物胁迫下,辣椒miR169家族成员前体表达量相对于对照组差异显著。(3)成功克隆了Can-miR169基因家族12个启动子,顺式作用元件预测其家族启动子中含有大量与非生物胁迫相关的元件,如MYB、MYC、MBS、ABRE、LTR、DRE等。(4)经验证明,这些元件为干旱、低温、高盐等胁迫应答元件。本研究结果为进一步挖掘非生物胁迫下调控Can-miR169的转录因子,明确其上游调控机制提供新信息,为辣椒分子育种及品种改良提供新视野。 展开更多
关键词 辣椒 mir169家族 启动子 非生物胁迫 顺式作用元件
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油菜miR169基因家族的生物信息学分析及靶基因预测 被引量:5
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作者 阮先乐 王俊生 +2 位作者 刘红占 陈良兵 赵锦慧 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第8期1273-1280,共8页
为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析。结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成... 为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析。结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成2个组;其前体序列在形成成熟miRNA的位置高度保守;油菜miR169基因家族上游启动子主要元件有13个,数量最多的是胚乳表达元件、厌氧胁迫元件、热响应元件和MBS;油菜miR169基因家族的靶基因一共有16个,大部分属于NF-YA基因家族。该结果为进一步研究油菜miR169基因家族的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 油菜 mir169基因家族 靶基因 生物信息学
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miR169/NFYA模块响应植物非生物胁迫的研究进展
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作者 季洁韵 李强 曾幼玲 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期27-34,共8页
microRNA(miRNA)是一类非编码小RNA,通过剪切m RNA或抑制翻译调控与其互补的靶基因。近年来,已发现miRNA及其靶基因组成的调控模块广泛且深度地参与植物的生理生化过程。植物miR169及主要靶基因Nuclear Factor Y-As(NFYAs)家族会通过脱... microRNA(miRNA)是一类非编码小RNA,通过剪切m RNA或抑制翻译调控与其互补的靶基因。近年来,已发现miRNA及其靶基因组成的调控模块广泛且深度地参与植物的生理生化过程。植物miR169及主要靶基因Nuclear Factor Y-As(NFYAs)家族会通过脱落酸介导的激素信号通路参与植物抵御非生物胁迫过程。本文阐述了miR169/NFYA模块在植物非生物胁迫及生长发育中的作用机制,为抗性分子育种提供参考。 展开更多
关键词 mir169 NFYA 非生物胁迫 植物
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The roles of rice microRNAs in rice-Magnaporthe oryzae interaction
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作者 Yan Li John Martin Jerome Jeyakumar +4 位作者 Qin Feng Zhi-Xue Zhao Jing Fan Muhammad Ibrahim Khaskheli Wen-Ming Wang 《Phytopathology Research》 2019年第1期7-18,共12页
MicroRNAs(miRNAs)are a class of small(20–24 nucleotides(nt)long)non-coding RNAs.One mature miRNA can be transcribed from one or more gene loci known as miRNA genes(MIRs).The transcript of a MIR forms a stem-loop stru... MicroRNAs(miRNAs)are a class of small(20–24 nucleotides(nt)long)non-coding RNAs.One mature miRNA can be transcribed from one or more gene loci known as miRNA genes(MIRs).The transcript of a MIR forms a stem-loop structure that is processed into a 20–24-nt miRNA-5p/−3p duplex by RNase III family endoribonucleases such as Dicer-like1(DCL1).In turn,the overhang ends of the duplex are methylated by HUA ENHANCER 1(HEN1),generating stabilized mature miRNAs.The mature miRNAs are loaded onto ARGONAUTE(AGO)proteins,forming a miRNAinduced gene silencing complex(miRISC).Then,the miRISC binds to target sites with sequences complementary to the miRNAs,leading to either cleavage or translational inhibition of the target mRNAs,or methylation of the target sequences,resulting in post-transcriptional and transcriptional gene silencing,respectively.In the past decade,more than 700 miRNAs have been identified in rice,a subset of which have been found to be responsive to the rice blast fungus,Magnaporthe oryzae,or its elicitors.Moreover,members of 10 miRNA families have been found to positively or negatively regulate rice defense against M.oryzae,namely miR160,miR164,miR166,miR167,miR169,miR319,miR396,miR398,miR444 and miR7695.This review summarizes the identification and functional characterization of the miRNAs,which respond to M.oryzae or its elicitors and describes the current understanding of the complicated but wellorganized network in the context of rice-M.oryzae interaction. 展开更多
关键词 Dicer-like 1 MicroRNA miR164 miR167 mir169 miR319 miR396 miR398 miR7695
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