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miR159-GAMYB途径调控植物生长发育的研究进展 被引量:7
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作者 黎猛 陈跃 胡凤荣 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期234-247,共14页
miR159(microRNA159)是植物中一类古老而又保守的microRNA,其靶基因主要是一类编码R2R3 MYB转录因子的GAMYB-like基因。miR159-GAMYB途径高度保守,miR159通过转录后调控GAMYB在植物营养生长、开花诱导、雄性生殖、花器官发育、植物育性... miR159(microRNA159)是植物中一类古老而又保守的microRNA,其靶基因主要是一类编码R2R3 MYB转录因子的GAMYB-like基因。miR159-GAMYB途径高度保守,miR159通过转录后调控GAMYB在植物营养生长、开花诱导、雄性生殖、花器官发育、植物育性、果实发育、种子萌发和胁迫响应中发挥着重要作用。主要探讨了近些年来miR159-GAMYB途径对植物生长发育的影响,为今后相关研究提供参考。 展开更多
关键词 mir159 GAMYB 营养生长 花药 胁迫响应 赤霉素
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stu-miR159a negatively regulates anthocyanin-specific MYB transcription factor to mediate drought stress tolerance in potato
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作者 Yurong Deng Jiangwei Yang +5 位作者 Jingjing Wei Shengyan Liu Liang Yang Xiaofeng Wang Ning Zhang Huaijun Si 《Horticultural Plant Journal》 2025年第5期1917-1929,共13页
MicroRNAs(miRNAs) are a class of small endogenous non-coding RNAs that direct post-transcriptional gene silencing.In plants,numerous miRNAs have been demonstrated to be regulated under drought-induced stress.However,t... MicroRNAs(miRNAs) are a class of small endogenous non-coding RNAs that direct post-transcriptional gene silencing.In plants,numerous miRNAs have been demonstrated to be regulated under drought-induced stress.However,the role of miRNAs in drought regulation remains unclear in potato.In this work,the function of stu-miR159a was investigated in responding to drought stress in potato.Upon examination,StGAMyb-like1 was identified as the target gene for stu-miR159a.Overexpression of stu-miR159a(stu-miR159a OE plants) increased sensitivity to drought,interference with stu-miR159a activity by target mimics(stu-miR159a ST plants) resulted in drought resistance.During drought treatment,the target gene StGAMyb-like1 showed increased activation in stu-miR159a ST plants compared to non-transgenic plants.In contrast,drought stress induced weaker activation of the target gene in stu-miR159a OE plants.In stu-miR159a ST plants,the expression of critical genes in the anthocyanin biosynthesis pathway(StF3'5'H,StF3'H and StCHS2)was increased by decreasing stu-miR159a activity and simultaneously increasing that of StGAMyb-like1.Meanwhile,with drought treatment,stu-miR159a ST plants exhibited higher anthocyanin accumulation than non-transgenic ones,indicating enhanced antioxidant capacity and improved drought tolerance.The above data support that stu-miR159a is a negative regulator of drought stress and provide new insights into the stu-miR159a-mediated regulation of the anthocyanin biosynthesis pathway in controlling drought tolerance in potato. 展开更多
关键词 POTATO mir159-gamyb pathway Drought ANTHOCYANIN Antioxidant activity
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葡萄miR159及其靶基因VvGAMYB在花发育过程中的作用分析 被引量:21
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作者 王梦琦 解振强 +4 位作者 孙欣 李晓鹏 朱旭东 王晨 房经贵 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1061-1072,共12页
以‘魏可’葡萄(Vitis vinifera L.‘Wink’)为试材,克隆得到一个葡萄赤霉素信号途径中的MYB转录因子基因Vv GAMYB。该基因开放阅读框(ORF)长1 680 bp,编码559个氨基酸,该蛋白序列含有GAMYB基因家族保守的R2R3 DNA结合域以及Box1、Box2... 以‘魏可’葡萄(Vitis vinifera L.‘Wink’)为试材,克隆得到一个葡萄赤霉素信号途径中的MYB转录因子基因Vv GAMYB。该基因开放阅读框(ORF)长1 680 bp,编码559个氨基酸,该蛋白序列含有GAMYB基因家族保守的R2R3 DNA结合域以及Box1、Box2、Box3保守域。洋葱表皮细胞的瞬时表达结果显示,VvGAMYB定位于细胞核中。VvGAMYB和其下游基因Vv LFY在葡萄花发育过程中的表达都呈现先上升后下降的趋势,而赤霉素处理促进了VvGAMYB和VvLFY的表达,从而使开花提前。VvGAMYB是miR159的靶基因,其作用受到miR159的调控。miR159和VvGAMYB的表达负相关,赤霉素处理下调miR159表达从而也降低了对VvGAMYB的裂解作用。由上述结果可以看出,VvGAMYB通过赤霉素开花途径参与葡萄的开花过程。在这一过程中,赤霉素抑制miR159裂解VvGAMYB的作用,从而上调VvLFY的基因表达,参与了调控葡萄开花过程。 展开更多
关键词 葡萄 GAMYB mir159 赤霉素 花发育 基因表达
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龙眼miR159家族成员进化特性及时空表达 被引量:6
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作者 陈旭 曾友竞 +8 位作者 王嘉毅 陈晓慧 徐小萍 李汉生 张梓浩 陈裕坤 赖钟雄 王天池 林玉玲 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期602-608,共7页
为了解植物miR159家族成员的进化特性及其在不同组织部位的表达规律,以龙眼miR159家族为例对miRNA家族进行探讨.通过龙眼miR159家族前体与成熟体序列比对、前体二级结构预测、系统发育进化树的构建、靶基因预测及实时荧光定量等手段,对... 为了解植物miR159家族成员的进化特性及其在不同组织部位的表达规律,以龙眼miR159家族为例对miRNA家族进行探讨.通过龙眼miR159家族前体与成熟体序列比对、前体二级结构预测、系统发育进化树的构建、靶基因预测及实时荧光定量等手段,对龙眼miR159基因家族进行研究.结果显示:龙眼miR159家族存在7个前体成员和6个成熟体成员,序列比对发现5个成熟体可以高度定位于7个前体序列中一个共有的、约20个碱基的保守区域,推测miR159成熟体主要来源于该区域;进一步分析发现6个成熟体序列中仅2个可定位于pre-MIR159中.mfold预测结果显示miR159家族7个前体的最小折叠自由能在-56.54--92.53 kal/mol之间,均能自发形成典型、稳定的茎环二级结构.系统发育进化树显示龙眼miR159家族前体与成熟体成员均具有保守性与多样性.靶基因预测发现龙眼miR159家族所有成员共预测出14个不同靶标,其中3个成员也可以作用于同一靶标.实时荧光定量PCR显示,龙眼pre-MIR159家族成员间在不同组织部位表达量差异显著,但表达趋势却几乎一致,其中花器官中表达量最高,提示了dlo-miR159在生殖器官形成过程中具有重要的作用,尤其是在雄花中作用显著.本研究表明龙眼miR159家族在进化过程中形成了保守性与多样性并存的进化特性,并且可能在花器官形成过程中发挥了重要的作用. 展开更多
关键词 龙眼 mir159家族 进化特性 实时荧光定量
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葡萄miR159s靶基因的鉴定及其应答GA在果实不同组织的调控作用 被引量:4
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作者 张文颖 韩旭 +6 位作者 朱旭东 解振强 纠松涛 黄雨晴 贾海锋 房经贵 王晨 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第16期2858-2870,共13页
【目的】鉴定葡萄miR159家族成员及其靶基因,明确葡萄miR159家族成员及其靶基因应答外源赤霉素(GA)在无核葡萄果实不同组织发育过程中的作用。【方法】以‘白罗莎里奥’葡萄(Rosario Bianco)为试材,利用miR-RACE和PCR技术克隆鉴定VvmiR1... 【目的】鉴定葡萄miR159家族成员及其靶基因,明确葡萄miR159家族成员及其靶基因应答外源赤霉素(GA)在无核葡萄果实不同组织发育过程中的作用。【方法】以‘白罗莎里奥’葡萄(Rosario Bianco)为试材,利用miR-RACE和PCR技术克隆鉴定VvmiR159a/b/c的成熟体及前体序列;通过PsRNATarget软件预测VvmiR159s的靶基因,利用生物信息学软件对其进行系统进化及保守结构域分析;通过启动子作用元件分析预测VvmiR159s及其靶基因的潜在功能;采用RLM-RACE和PPM-RACE验证VvmiR159s对靶基因的裂解作用;利用qRT-PCR鉴定其应答外源GA在葡萄果实不同组织发育过程中的时空表达模式。【结果】从‘白罗莎里奥’葡萄果实中克隆获得VvmiR159a/b/c的成熟体序列、前体序列并折叠发夹结构。鉴定到VvmiR159s的四条靶基因(VvGAMYB、VvMYB48、VvAIX15、VvGRAS-l),其中VvmiR159s与VvGAMYB匹配程度最高,与VvAIX15匹配程度最低。靶基因系统进化及保守结构域分析显示,4条靶基因与其他物种同源基因具有较高同源性。VvmiR159s前体基因及其靶基因启动子的激素响应元件均以赤霉素和水杨酸响应元件为主,表明其可能主要通过应答这两种激素参与调控葡萄的生长发育过程。VvmiR159s在不同组织中的表达具有时空特异性,其中VvmiR159c在果皮和果肉中的表达趋势不同,在果皮中VvmiR159a/b/c与VvAIX15的表达水平呈负相关;而在果肉中,VvmiR159a/b与VvGAMYB和VvAIX15的表达模式相反。此外,在葡萄果皮、果肉中GA处理可显著下调VvmiR159a/c的表达,但却在幼果果肉中上调VvmiR159b的表达。表明葡萄miR159家族成员在果实不同组织中通过不同模式应答GA信号参与果实发育的调控。【结论】葡萄miR159家族含有VvmiR159a/b/c 3个成员;3个成员均可切割VvGAMYB、VvMYB48、VvAIX15及VvGRAS-l 4个靶基因;VvmiR159a/b/c及其4个靶基因可能以不同的GA应答模式参与调控葡萄果皮与果肉的发育。 展开更多
关键词 葡萄 mir159 靶基因 GA 进化特性 基因表达
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植物miR159家族成员分子特性及其进化规律研究 被引量:3
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作者 陈旭 王嘉毅 +3 位作者 张梓浩 王天池 赖钟雄 林玉玲 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1286-1295,共10页
为了解植物miR159家族成员的分子特性及其进化规律,该研究对miRBase数据库中登录的miR159家族成员进行分类统计、进化树构建、科间比较、二级结构预测及靶基因分析。结果表明:miR159家族在植物界分布非常广泛,蕨类植物可能是miR159家族... 为了解植物miR159家族成员的分子特性及其进化规律,该研究对miRBase数据库中登录的miR159家族成员进行分类统计、进化树构建、科间比较、二级结构预测及靶基因分析。结果表明:miR159家族在植物界分布非常广泛,蕨类植物可能是miR159家族的进化祖先;系统发育进化树分析显示,植物miR159家族成员间存在多个进化分支,且进化关系与植物属性有关,即植物亲缘关系越近的成员更易成枝,且具有相同进化方向的成员序列高度同源;Mfold预测显示,pre-miR159均会自发形成典型、稳定的茎环二级结构,并包含19~21个碱基为单位的功能片段,每个单位均有可能形成miR159成熟体;靶基因分析发现,miR159家族成员主要作用于MYB转录因子、转座因子和假定蛋白等,但在不同物种间及相同物种的不同成员间作用的靶标种类与靶基因ID数量均存在差异,尤其是miR159-3p与miR159-5p间的差异最为显著。 展开更多
关键词 mir159家族 分子特性 进化规律 靶基因
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葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析 被引量:4
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作者 葛金涛 王丽丽 +1 位作者 赵统利 刘兴满 《江西农业学报》 CAS 2018年第2期21-25,共5页
为了研究葡萄miR159基因家族在葡萄生长发育过程中发挥的作用,利用生物信息学工具和方法,对葡萄miR159家族成员进行了基因定位、前体序列二级结构预测、成熟序列保守性分析、靶基因及其功能预测以及系谱进化分析。结果显示:在葡萄miR15... 为了研究葡萄miR159基因家族在葡萄生长发育过程中发挥的作用,利用生物信息学工具和方法,对葡萄miR159家族成员进行了基因定位、前体序列二级结构预测、成熟序列保守性分析、靶基因及其功能预测以及系谱进化分析。结果显示:在葡萄miR159家族成员中vvi-miR159a和vvi-miR159b两个成员均分布在染色体15上,vvi-miR159c分布在染色体17上;葡萄miR159家族成员基本上符合进化规律;葡萄miR159家族成员的前体均可形成稳定的茎环结构,且其成熟序列都产生于其前体茎环结构的5'端臂上,其碱基序列保守性较高;葡萄miR159家族对应的靶基因主要有两个(GSVIVT01012447001与GSVIVT01037362001),经BLAST分析,主要为GAMYB转录因子家族。 展开更多
关键词 葡萄 mir159 基因家族 分子进化 靶基因预测
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马铃薯miR159的克隆及人工表达载体构建 被引量:1
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作者 刘雪 杨江伟 +4 位作者 唐勋 张宁 文义凯 周香艳 司怀军 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期2659-2664,共6页
MicroRNAs(miRNAs)是一类非编码小分子RNA,是体内重要的内源性基因调节因子,主要是在转录后水平调控靶基因的表达。本研究是通过人工microRNA技术(artificial microRNA,简称amiRNA),与PCR技术克隆得到了701 bp的miR159片段,然后将获得的... MicroRNAs(miRNAs)是一类非编码小分子RNA,是体内重要的内源性基因调节因子,主要是在转录后水平调控靶基因的表达。本研究是通过人工microRNA技术(artificial microRNA,简称amiRNA),与PCR技术克隆得到了701 bp的miR159片段,然后将获得的miR159片段通过双酶切后链接到植物表达载体p CPB121,构建了马铃薯amiR159表达载体。经PCR和酶切分析鉴定,确认载体构建成功。为后期通过马铃薯的遗传转化研究miR159/MYB的调控模式提供了帮助。 展开更多
关键词 马铃薯 mir159 MYB转录因子 人工microRNA技术
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砂梨miR159家族进化特性及在冬季休眠的表达模式分析 被引量:1
9
作者 刘瑾航 沈炳荣 +7 位作者 李宜轩 梁沁 冯宇 林晓洁 沈茂芬 吴少华 李亮 李永裕 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期2007-2018,共12页
【目的】探究砂梨miR159家族成员进化特性及其在梨花芽休眠进程中的作用。【方法】通过检索已构建的砂梨(黄花)miRNA文库,筛选鉴定出2个miR159成熟体和2个前体序列,分别为ppy-miR159a和ppy-miR159b、ppyMIR159a和ppy-MIR159b。从黄花梨... 【目的】探究砂梨miR159家族成员进化特性及其在梨花芽休眠进程中的作用。【方法】通过检索已构建的砂梨(黄花)miRNA文库,筛选鉴定出2个miR159成熟体和2个前体序列,分别为ppy-miR159a和ppy-miR159b、ppyMIR159a和ppy-MIR159b。从黄花梨中克隆得到ppy-miR159a和ppy-miR159b。通过生物信息学分析梨miR159家族。采用实时荧光定量测定梨两个miR159家族成员及其靶基因pyrus_GLEAN_10035941(GAMYB转录因子)在梨花芽休眠进程中以及单氰胺(HC)处理梨休眠花芽的变化。【结果】植物miR159家族成熟体进化树的结果显示在进化树的大分支中,miR159家族的碱基高度重合,并且大多数miR159家族都具有相同的序列,说明了黄花梨与其他物种在进化过程中高度保守。而在进化树中出现各种小分支,说明miR159家族在进化过程由于功能分化,其成熟序列也出现相应的碱基改变。两个miR159家族成员的前体均能形成环状结构,且成熟体都在3’臂。ppy-miR159a和ppy-miR159b的最小折叠自由能(ΔG)分别为-368.81 kJ·mol^(-1)和-352.96 kJ·mol^(-1)。进化树分析发现梨miR159的亲缘关系与苹果更为接近。梨miR159调控的潜在靶基因主要是MYB家族基因,它与GA的调控有关,另外两个miR159的其他潜在靶基因并不完全相同,还包括蛋白激酶、细胞色素等功能不同的蛋白基因。在梨花芽休眠进程中,梨miR159相对表达量在整个休眠期间呈现先下降后上升再下降的双峰动态变化,靶基因pyrus_GLEAN_10035941的表达趋势与miR159相反,呈现先上升后下降再上升的变化,且miR159和靶基因的表达量均在休眠解除时期出现显著变化;而单氰胺(HC)处理梨休眠花芽的定量结果显示,随着HC破眠处理时间的增加,miR159的表达量降低,靶基因pyrus_GLEAN_10035941的表达量升高,靶基因pyrus_GLEAN_10035941变化趋势与miR159相反。【结论】两个miR159家族成员的潜在靶基因主要是MYB家族基因。梨花芽可能通过下调miR159表达,促进GAMYB表达,提高GA含量,促进花芽冬季休眠的解除。另外靶基因pyrus_GLEAN_10035941和DELLA基因的表达模式类似。 展开更多
关键词 砂梨 休眠 mir159 表达模式 进化特性
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‘库尔勒香梨’miR159家族成员进化特性及表达分析 被引量:5
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作者 马丽 周丽 +3 位作者 徐航 全绍文 杨洁萍 牛建新 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期1-10,共10页
【目的】了解‘库尔勒香梨’miR159家族成员的进化特征及其在萼片脱落与宿存中的作用。【方法】以‘库尔勒香梨’Small RNA高通量测序中获得的miR159家族前体序列和成熟体序列为基础进行系统发育树构建、前体和成熟体的序列比对、前体... 【目的】了解‘库尔勒香梨’miR159家族成员的进化特征及其在萼片脱落与宿存中的作用。【方法】以‘库尔勒香梨’Small RNA高通量测序中获得的miR159家族前体序列和成熟体序列为基础进行系统发育树构建、前体和成熟体的序列比对、前体二级结构预测、WebLogo保守性分析、靶基因预测和表达量分析。【结果】‘库尔勒香梨’miR159家族存在2个前体成员(psi-MIR159a、psi-MIR159c)和2个成熟体成员(psi-miR159a、psi-miR159c)。2个前体成员的序列均能形成典型稳定的茎环结构,且序列完全一致,它们的最小折叠自由能(dG)都为-93.95 kal·mol^(-1)。系统发育进化树显示,‘库尔勒香梨’和苹果MIR159家族亲缘关系很近。WebLogo分析表明,miR159家族成熟体的保守性很高,其保守序列为5'-UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAUU-3',但‘库尔勒香梨’的碱基保守性较低。靶基因预测显示,‘库尔勒香梨’miR159基因家族靶基因为转录因子bHLH91、BES1/BZR1同源蛋白4、热激70 ku蛋白质、Trihelix转录因子GT-1、G型凝集素S-受体类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RLK1等。实时荧光定量PCR(qPCR)显示,‘库尔勒香梨’miR159家族的2个成员在初花期、盛花期和末花期3个时期萼片脱落组和宿存组的表达量有显著差异。【结论】‘库尔勒香梨’miR159家族在进化过程中既有保守性又有多样性,可能在萼片脱落过程中起作用。 展开更多
关键词 '库尔勒香梨’ mir159家族 进化特性 表达模式
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MiR159调节植物生长发育和逆境胁迫的研究进展 被引量:2
11
作者 李波娣 何平安 +2 位作者 许志豪 邹汉成 王金祥 《嘉应学院学报》 2018年第8期63-70,共8页
MicroRNA(miRNA)在调节植物生长发育及应答生物和非生物胁迫方面起重要作用.MiR159是一类非常保守的miRNA,近年的研究揭示其在植物生长发育和逆境响应方面具备重要的调节作用.本文综述了miR159的研究进展,提出了miR159调节植物生长发育... MicroRNA(miRNA)在调节植物生长发育及应答生物和非生物胁迫方面起重要作用.MiR159是一类非常保守的miRNA,近年的研究揭示其在植物生长发育和逆境响应方面具备重要的调节作用.本文综述了miR159的研究进展,提出了miR159调节植物生长发育和逆境胁迫的后续研究应重点关注的几个问题. 展开更多
关键词 mir159 生长发育 逆境响应
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植物miR159靶向MYB基因家族的调控作用及其跨界调控哺乳动物生理功能的研究进展 被引量:2
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作者 段红娟 孟桂智 +4 位作者 刘宝宝 贾晶莹 马燕芬 马云 蔡小艳 《畜牧与饲料科学》 2022年第5期48-54,60,共8页
植物miR159靶向MYB基因家族在植物的生长发育、新陈代谢、逆境响应及病原防御等多种生理过程中发挥关键作用。植物miR159可以跨界调控哺乳动物的生理功能,如抑制肿瘤生长、改善能量代谢、抗氧化应激、调节机体免疫功能等。阐述了miR159... 植物miR159靶向MYB基因家族在植物的生长发育、新陈代谢、逆境响应及病原防御等多种生理过程中发挥关键作用。植物miR159可以跨界调控哺乳动物的生理功能,如抑制肿瘤生长、改善能量代谢、抗氧化应激、调节机体免疫功能等。阐述了miR159通过调控MYB基因家族参与多种植物营养生长、逆境胁迫、开花和果实发育过程,以及外源性植物miR159跨界调控哺乳动物生理功能和对乳腺癌的调控作用,以期为后续深入研究植物miR159的调控网络以及跨物种调控机制提供参考。 展开更多
关键词 mir159 MYB家族 跨界调控 生理功能
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Extraction and verification of miRNA from ginseng decoction 被引量:2
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作者 Ying-fang Wang Wen-juan Wang +5 位作者 Yan-lin Chen Zhi-hua He Jing-jing Cao Ze-min Yang Meng-juan Gong Yong-qin Yin 《Chinese Herbal Medicines》 CAS 2018年第3期318-322,共5页
Objective: To verify the existence of microRNAs(miRNAs) extracted from fresh ginseng decoction.Methods: Fresh ginseng was prepared into decoction according to the conventional method. The miRNA were extracted from the... Objective: To verify the existence of microRNAs(miRNAs) extracted from fresh ginseng decoction.Methods: Fresh ginseng was prepared into decoction according to the conventional method. The miRNA were extracted from the condensed ginseng decoction by plant microRNA extraction kit. Then miRNA were treated by DNase I and subjected to agarose gel electrophoresis and Agilent 2100 bioanalysis. Mi R-159 and mi R-6135, which were highly expressed in ginseng, were selected and verified by real-time quantitative PCR to detect the expression in the decoction.Results: Ginseng miRNA were successfully extracted from fresh decoction. Mi R-159 and mi R-6135 were expressed in fresh decoction with lower levels than those of fresh ginseng.Conclusion: miRNAs stably existed after processing, and retained some stability after high-temperature treatment. The findings provide a valuables basis for the further studies on ginseng miRNAs. 展开更多
关键词 fresh ginseng mirNA mir-159 mir-6135 real-time quantitative PCR water decoction
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