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hsa-miR-1908靶基因预测及生物信息学分析 被引量：1
1
作者 杨蕾 季晨博 +5 位作者 史春梅 陈玲 庞玲霞 夏黎 郭锡熔 倪毓辉 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期820-824,共5页
目的对hsa-miR-1908进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程及信号通路,为深入研究其在人脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法应用miRBase获取hsa-miR-1908的序列,并分析其特征;应用miRanda预测hsa... 目的对hsa-miR-1908进行系统的生物信息学分析,预测其可能参与的生物学过程及信号通路,为深入研究其在人脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法应用miRBase获取hsa-miR-1908的序列,并分析其特征;应用miRanda预测hsa-miR-1908的靶基因,并取预测结果及基因芯片结果的交集,进一步进行基因功能注释(Gene ontology)和生物通路富集分析(Pathway enrichment)。结果 hsa-miR-1908在各物种之间有一定保守性,其靶基因功能富集于Wnt受体信号的调控、细胞周期、细胞凋亡等生物学过程;其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路及胰腺癌等疾病通路中。结论 hsa-miR-1908预测的靶基因集合富集于多个信号通路及生物学过程,与肥胖密切相关,为后续has-miR-1908在人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础。 展开更多
关键词 mir-1908 MIRNA 生物信息学 人脂肪细胞 肥胖
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人miR-1908慢病毒载体构建及在人脂肪前体细胞中的表达验证 被引量：1
2
作者 杨蕾 季晨博 +5 位作者 史春梅 陈玲 庞玲霞 夏黎 郭锡熔 倪毓辉 《中国儿童保健杂志》 CAS 北大核心 2014年第10期1018-1021,共4页
目的构建人miR-1908慢病毒表达载体,包被病毒并检测其在人脂肪前体细胞中过表达效果。方法以人脂肪细胞基因组DNA为模板,PCR高保真扩增包含miR-1908区域上下游各100bp左右的基因组DNA,亚克隆入慢病毒表达载体,与包装质粒共转染HEK-293T... 目的构建人miR-1908慢病毒表达载体,包被病毒并检测其在人脂肪前体细胞中过表达效果。方法以人脂肪细胞基因组DNA为模板,PCR高保真扩增包含miR-1908区域上下游各100bp左右的基因组DNA,亚克隆入慢病毒表达载体,与包装质粒共转染HEK-293T细胞,包装病毒,收取病毒上清,纯化后感染人脂肪前体细胞,36h开始观察荧光标记,72h收取细胞,抽提RNA,Realtime PCR检测慢病毒感染下miR-1908的相应表达量。结果成功构建人miR-1908慢病毒表达载体,包装获得的病毒感染人脂肪前体细胞的效率可达到70%以上,miR-1908过表达水平可接近2倍。结论本研究成功构建了人miR-1908慢病毒过表达载体,包被的慢病毒可以在人脂肪前体细胞中实现过表达效果,为后续功能研究奠定了基础。 展开更多
关键词 mir-1908 慢病毒 人脂肪前体细胞
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hsa-miR-1908上游启动子区的生物信息学分析 被引量：2
3
作者 匡仟卉柠 李景云 +3 位作者 季晨博 郭锡镕 倪毓辉 徐美玉 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期379-383,共5页
目的利用各种生物信息学工具预测hsa-miR-1908上游启动子功能，以进一步研究其在人脂肪细胞中的转录调控机制。方法应用Ensemble数据库获取hsa-miR-1908上游启动子序列，利用多种在线相关软件预测出甲基化部位和转录因子结合部位。结果... 目的利用各种生物信息学工具预测hsa-miR-1908上游启动子功能，以进一步研究其在人脂肪细胞中的转录调控机制。方法应用Ensemble数据库获取hsa-miR-1908上游启动子序列，利用多种在线相关软件预测出甲基化部位和转录因子结合部位。结果获取hsa-miR-1908上游启动子序列全长1458bp。miR-1908启动子序列中CpG岛位于（438～756）bp、（836937）bp、（979～1374）bp处，CpG岛的存在会抑制miR-1908启动子的转录。miR-1908有15个转录因子的结合位点。结论miRNA启动子相关生物信息学的研究，提高对启动子的研究效率，为进一步研究miR-1908的转录调控机制提供了重要的信息。 展开更多
关键词 mir-1908启动子区 生物信息学分析 转录因子结合部位
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miR-1908抑制高糖诱导的人视网膜血管内皮细胞系HRECs凋亡 被引量：3
4
作者 周丽萍 毛晓春 李琴 《基础医学与临床》 CSCD 2020年第8期1090-1095,共6页
目的探讨miR-1908对高糖诱导的人视网膜血管内皮细胞(HRECs)凋亡的影响及分子机制。方法培养HRECs细胞,分为对照组和高糖组,RT-qPCR检测细胞中miR-1908表达水平。转染miR-1908模拟物(mimics)、整合素连接激酶(ILK)的小干扰RNA至HRECs细... 目的探讨miR-1908对高糖诱导的人视网膜血管内皮细胞(HRECs)凋亡的影响及分子机制。方法培养HRECs细胞,分为对照组和高糖组,RT-qPCR检测细胞中miR-1908表达水平。转染miR-1908模拟物(mimics)、整合素连接激酶(ILK)的小干扰RNA至HRECs细胞,qRT-PCR和Western blot分别检测miR-1908和ILK蛋白表达验证转染效率。使用高糖干预过表达miR-1908或ILK表达抑制的HRECs细胞,流式细胞仪检测凋亡率,Western blot检测B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)和B淋巴细胞瘤-2相关蛋白(Bax)表达水平。双荧光素酶报告基因实验验证miR-1908和ILK之间关系。结果与对照组比,高糖组HRECs细胞中miR-1908的表达水平显著降低(P<0.05)。过表达miR-1908或ILK表达可降低高糖诱导的HRECs细胞凋亡率(P<0.05),上调Bcl-2蛋白表达(P<0.05),下调Bax蛋白表达(P<0.05)。miR-1908负调控ILK表达,ILK过表达逆转了miR-1908对HRECs细胞凋亡率、Bcl-2和Bax蛋白表达的影响。结论miR-1908可能通过负调控ILK表达上调Bcl-2蛋白表达,下调Bax蛋白表达抑制HRECs细胞的凋亡。 展开更多
关键词 人视网膜血管内皮细胞 高糖 mir-1908 整合素连接激酶 细胞凋亡
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转染的miR-1908通过靶向转化生长因子β1抑制肾脏纤维化 被引量：2
5
作者 谢飞 李小顺 +3 位作者 韦婵 苟亮 党彦龙 陕泽嫘 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1682-1685,1689,共5页
目的探讨miR-1908在肾纤维化中的调控作用。方法运用实时定量PCR检测纤维化进程中人肾组织中miR-1908和转化生长因子β1(TGF-β1)mRNA的水平;运用生物学信息分析和萤光素酶报告基因技术探索miR-1908对TGF-β1的靶向调控关系;体外转染miR... 目的探讨miR-1908在肾纤维化中的调控作用。方法运用实时定量PCR检测纤维化进程中人肾组织中miR-1908和转化生长因子β1(TGF-β1)mRNA的水平;运用生物学信息分析和萤光素酶报告基因技术探索miR-1908对TGF-β1的靶向调控关系;体外转染miR-1908腺病毒表达载体后,运用Western blot法检测人原代肾间质细胞中TGF-β1、smad2/3和基质金属蛋白酶2(MMP-2)的蛋白水平;对早期肾纤维化模型小鼠腹腔注射miR-1908腺病毒表达载体6周后,Masson染色观察肾纤维化情况。结果 miR-1908在人肾纤维化过程中水平逐渐降低,与TGF-β1 mRNA水平变化趋势相反;过表达miR-1908后,原代肾间质成纤维细胞中TGF-β1、smad2/3和MMP-2的蛋白水平均显著下调;注射miR-1908腺病毒表达载体6周后,与未注射组相比,小鼠肾纤维化症状明显缓解。结论 miR-1908通过靶向TGF-β1,对抑制肾脏纤维化有一定作用。 展开更多
关键词 肾纤维化 mir-1908 转化生长因子Β1 腺病毒表达载体
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miR-1908过表达的人脂源性多能干细胞基因表达谱分析 被引量：1
6
作者 黄芳延 杨蕾 +6 位作者 尤梁慧 季晨博 史春梅 陈玲 庞玲霞 倪毓辉 郭锡熔 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2016年第7期496-498,共3页
目的研究miR-1908对脂源性多能干细胞基因表达谱的影响，并探讨其在肥胖发生过程中的可能作用。方法构建miR-1908过表达的脂源性多能干细胞，利用基因表达谱芯片技术筛选得到与阴性对照组差异表达的基因。挑选3个差异表达基因，利用Real... 目的研究miR-1908对脂源性多能干细胞基因表达谱的影响，并探讨其在肥胖发生过程中的可能作用。方法构建miR-1908过表达的脂源性多能干细胞，利用基因表达谱芯片技术筛选得到与阴性对照组差异表达的基因。挑选3个差异表达基因，利用Real—timePCR技术验证miRNA芯片检测结果。结果基因表达谱芯片结果显示，差异表达的123个基因中，2倍以上上调的基因有69个，下调的有54个，差异均有统计学意义（P均〈0．05）。将这些基因按照功能分类，分为15组：高分子配合物亚基基因（18／123，14．63％），RNA结合相关基因（16／123，13．01％），凋亡相关基因（14／123，11．38％），细胞程序性死亡相关基因（14／123，11．38％），磷酸酶活性相关基因（9／123，7．32％），蛋白结构域结合相关基因（10／123，8．13％），蛋白磷酸酶活性相关基因（8／123，6．50％），分子成分分解相关基因（5／123，4．07％），肾脏发育相关基因（6／123，4．88％），RNA聚合酶Ⅱ转录启动子基因（9／123，7．32％），泌尿生殖系统发育相关基因（6／123，4．88％），依赖DNA的转录基因（9／123，7．32％），RNA合成相关基因（9／123，7．32％），I型干扰素合成过程相关基因（2／123，1．63％）及I型干扰素合成产物相关基因（2／123，1．63％）。结论miR-1908可能在肥胖发生的过程中发挥调控作用。在下调表达的基因中验证了miR-1908可能直接作用的靶基因，为研究miR-1908在肥胖发生中的作用奠定了基础，同时也为miRNA的生物学功能及其作用机制的研究提供了参考。 展开更多
关键词 mir-1908 脂源性多能干细胞 基因芯片 肥胖
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miR-1908对人内脏前体脂肪细胞增殖、细胞凋亡和细胞周期的影响
7
作者 郭冰冰 付锦艳 +1 位作者 裴晶晶 蒋新液 《中华肥胖与代谢病电子杂志》 2019年第2期79-84,共6页
目的研究miR-1908对人内脏前体脂肪细胞(HPA-v)增殖、细胞凋亡和细胞周期的影响。方法体外培养HPA-v脂肪细胞,并根据实验分为抑制剂组(转染经化学修饰的miR-1908-5p抑制剂)、空载体组(转染空载体)、对照组(未进行任何处理),CCK8(Cell Co... 目的研究miR-1908对人内脏前体脂肪细胞(HPA-v)增殖、细胞凋亡和细胞周期的影响。方法体外培养HPA-v脂肪细胞,并根据实验分为抑制剂组(转染经化学修饰的miR-1908-5p抑制剂)、空载体组(转染空载体)、对照组(未进行任何处理),CCK8(Cell Counting Kit-8)法用于检测细胞的增殖情况,流式细胞仪检测细胞周期、Tunnel法检测细胞凋亡情况。结果 CCK8结果显示miR-1908抑制剂组的吸光度(OD)值(0.61±0.07)明显低于对照组(1.01±0.05)(P<0.05),抑制miR-1908具有抑制HPA-v脂肪细胞增殖的作用;Tunel结果表示miR1908抑制剂组凋亡率(0.27±0.03)%明显大于对照组(0.13±0.05)%(P<0.05);流式细胞测定的结果为G0/G1期细胞增加(与对照组相比,P<0.05),表明抑制miR-1908表达可能通过诱导HPA-v脂肪细胞G0/G1期阻滞抑制HPA-v脂肪细胞增殖。结论下调miR-1908表达能明显抑制人内脏前体脂肪细胞增殖,诱导细胞凋亡及改变细胞周期分布。 展开更多
关键词 mir-1908 脂肪细胞 增殖 凋亡 细胞周期
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