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Metarelation2vec:A Metapath-Free Scalable Representation Learning Model for Heterogeneous Networks 被引量:1
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作者 Lei Chen Yuan Li +1 位作者 Yong Lei Xingye Deng 《Tsinghua Science and Technology》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第2期553-575,共23页
Metapaths with specific complex semantics are critical to learning diverse semantic and structural information of heterogeneous networks(HNs)for most of the existing representation learning models.However,any metapath... Metapaths with specific complex semantics are critical to learning diverse semantic and structural information of heterogeneous networks(HNs)for most of the existing representation learning models.However,any metapaths consisting of multiple,simple metarelations must be driven by domain experts.These sensitive,expensive,and limited metapaths severely reduce the flexibility and scalability of the existing models.A metapath-free,scalable representation learning model,called Metarelation2vec,is proposed for HNs with biased joint learning of all metarelations in a bid to address this problem.Specifically,a metarelation-aware,biased walk strategy is first designed to obtain better training samples by using autogenerating cooperation probabilities for all metarelations rather than using expert-given metapaths.Thereafter,grouped nodes by the type,a common and shallow skip-gram model is used to separately learn structural proximity for each node type.Next,grouped links by the type,a novel and shallow model is used to separately learn the semantic proximity for each link type.Finally,supervised by the cooperation probabilities of all meta-words,the biased training samples are thrown into the shallow models to jointly learn the structural and semantic information in the HNs,ensuring the accuracy and scalability of the models.Extensive experimental results on three tasks and four open datasets demonstrate the advantages of our proposed model. 展开更多
关键词 metarelation random walk heterogeneous network metapath representation learning
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Incorporating metapath interaction on heterogeneous information network for social recommendation
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作者 Yanbin JIANG Huifang MA +2 位作者 Xiaohui ZHANG Zhixin LI Liang CHANG 《Frontiers of Computer Science》 SCIE EI CSCD 2024年第1期33-48,共16页
Heterogeneous information network(HIN)has recently been widely adopted to describe complex graph structure in recommendation systems,proving its effectiveness in modeling complex graph data.Although existing HIN-based... Heterogeneous information network(HIN)has recently been widely adopted to describe complex graph structure in recommendation systems,proving its effectiveness in modeling complex graph data.Although existing HIN-based recommendation studies have achieved great success by performing message propagation between connected nodes on the defined metapaths,they have the following major limitations.Existing works mainly convert heterogeneous graphs into homogeneous graphs via defining metapaths,which are not expressive enough to capture more complicated dependency relationships involved on the metapath.Besides,the heterogeneous information is more likely to be provided by item attributes while social relations between users are not adequately considered.To tackle these limitations,we propose a novel social recommendation model MPISR,which models MetaPath Interaction for Social Recommendation on heterogeneous information network.Specifically,our model first learns the initial node representation through a pretraining module,and then identifies potential social friends and item relations based on their similarity to construct a unified HIN.We then develop the two-way encoder module with similarity encoder and instance encoder to capture the similarity collaborative signals and relational dependency on different metapaths.Extensive experiments on five real datasets demonstrate the effectiveness of our method. 展开更多
关键词 heterogeneous information network social reco-mmender system metapath interaction attention mechanism
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隐式关系增强的图神经网络推荐算法 被引量:1
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作者 熊中敏 张军 《计算机应用研究》 北大核心 2025年第5期1338-1344,共7页
在推荐任务中用户社交网络信息和用户-项目交互信息可以用来提高推荐性能。但现有的社交推荐算法往往仅使用初始的社交图与交互图,未充分挖掘用户间以及项目间潜在的链接关系,同时没有考虑社交关系中的不可靠性。为此,提出融合隐式关系... 在推荐任务中用户社交网络信息和用户-项目交互信息可以用来提高推荐性能。但现有的社交推荐算法往往仅使用初始的社交图与交互图,未充分挖掘用户间以及项目间潜在的链接关系,同时没有考虑社交关系中的不可靠性。为此,提出融合隐式关系的图神经网络推荐算法(IREGraphRec)。首先,在多视角下挖掘实体间潜在信息来获取可靠的用户社交信息及用户项目交互信息,并将其重构为基于用户偏好的异构信息网络,运用图谱嵌入和定义多种元路径方式获得特征向量表示,同时使用注意力机制为其在信息聚合中分配不同的权重。最后,在图神经网络中进行多轮学习来获得最终的预测结果。在Epinions等三个公开的数据集上与S4Rec等传统网络模型进行对比,在MAE上降低了1.65%,在RMSE上降低了2.34%。实验结果和分析证明提出模型更具优势。 展开更多
关键词 图神经网络 社交推荐 知识图谱 元路径 注意力机制
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分槽聚合元路径信息的异质网络图对比学习方法
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作者 闫光辉 权思洁 罗浩 《计算机应用研究》 北大核心 2025年第11期3378-3386,共9页
异质信息网络中由于节点类型各异,邻居信息在聚合前需投影到相同特征空间,这易导致语义混淆;同时,节点特征学习过程常面临局部拓扑结构特征与全局语义信息难以有效融合的问题。为此,提出一种分槽聚合元路径信息的异质网络图对比学习(sta... 异质信息网络中由于节点类型各异,邻居信息在聚合前需投影到相同特征空间,这易导致语义混淆;同时,节点特征学习过程常面临局部拓扑结构特征与全局语义信息难以有效融合的问题。为此,提出一种分槽聚合元路径信息的异质网络图对比学习(stack-based metapath aggregation graph contrastive learning,S-MACon)方法。该方法基于元路径从多视角捕捉节点间的语义与结构关系,在元路径内部引入stack结构实现分槽聚合,为每类节点提供独立的消息传递过程,从而保留其类型特征空间中的信息表达;同时,在不同元路径视图上引入图对比学习,增强模型对全局图结构的理解能力;最后,通过注意力机制完成元路径与槽之间的信息聚合,得到最终节点表示。实验结果表明,S-MACon方法在链路预测和节点分类任务中分别达到95.61%和94.59%的准确率,显著优于现有主流方法,验证了其有效性与推广价值。 展开更多
关键词 异质网络 元路径 图对比学习 图神经网络
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一种引入元路径相似性度量的材料实体检索方法
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作者 黄华泽 胡紫璇 +3 位作者 游进国 黄星瑞 陶静梅 易健宏 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2024年第9期2781-2786,共6页
近年来,随着材料数据的积累以及“材料基因组计划”的普及,面对大量需要处理和管理的材料数据,快速准确地检索并获取相应信息已成为一个重要问题。传统的检索方法由于仅能查询某一材料的相关信息,并且存在检索结果不全面、无法处理复杂... 近年来,随着材料数据的积累以及“材料基因组计划”的普及,面对大量需要处理和管理的材料数据,快速准确地检索并获取相应信息已成为一个重要问题。传统的检索方法由于仅能查询某一材料的相关信息,并且存在检索结果不全面、无法处理复杂语义关系等问题,难以获取相似程度较高的材料。为了快速、准确地找到与某种材料相似的材料,提出可度量不同节点的加权材料相似度计算模型WM-PathSim。首先,使用metapath2vec学习材料节点的嵌入表示;其次,引入TFIDF-CBOW模型学习材料路径实例的存在概率,进而计算不同元路径的权重;最后,加权求和符合条件的元路径得到最后的相似性度量,来预测不同材料之间的相似程度。在真实数据集上的结果表明,在不同的路径关系中,所提模型相比于基线方法在性能上有较大提升,其AUC和precision指标分别提升了0.37~5.02百分点和1~7.33百分点,说明所提模型得到材料间的相似程度更加准确和有效,从而能够获得相似材料。 展开更多
关键词 材料相似度 metapath2vec TFIDF-CBOW 元路径权重
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基于PathSim的MOOCs知识概念推荐模型 被引量:2
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作者 祝义 居程程 郝国生 《计算机科学与探索》 CSCD 北大核心 2024年第8期2049-2064,共16页
大规模开放在线课程提供大规模开放式在线学习平台,为推进现代教育发挥关键作用。然而,减少用户学习盲区和改善用户体验方面的研究仍具有挑战性:交互数据稀疏;难以扩展到大型推荐任务上;用户需求不单由用户喜好决定,还受到不同教师、课... 大规模开放在线课程提供大规模开放式在线学习平台,为推进现代教育发挥关键作用。然而,减少用户学习盲区和改善用户体验方面的研究仍具有挑战性:交互数据稀疏;难以扩展到大型推荐任务上;用户需求不单由用户喜好决定,还受到不同教师、课程影响;以统一的方式对课程学习事件中不同类型实体及关系进行建模并不妥靠。基于此,引入相关性度量,依据全图结构信息计算各边权重,提出采用相关性度量算法PathSim进行邻域采样的知识概念推荐模型PathSimSage。各实体间相关性得分可在本地离线计算,将神经网络与传播过程分离,保证神经网络的堆叠层数和传播过程的独立性,大幅减少模型所需训练时间。在公开的MoocCube数据集上进行了综合实验,PathSimSage降低了不相关的信息甚至噪声的影响,解决随机游走采样所引发的高度节点偏差问题,并在一定程度上缓解了过平滑效应。 展开更多
关键词 大规模开放在线课程 图神经网络 个性化课程推荐 图卷积 基于元路径的子图 相似性度量
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基于元路径属性融合的异质网络表示学习 被引量:1
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作者 王静红 吴芝冰 +2 位作者 黄鹏 杨家腾 李笔 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1-13,共13页
针对信息网络的表示学习进行研究,提出了一种基于元路径信息融合的异质图神经网络(metapath attribute fusion graph neural network,MAFGNN),通过在异质网络中引入元路径之前将目标节点的邻居信息包括元路径信息融入到节点中,实现目标... 针对信息网络的表示学习进行研究,提出了一种基于元路径信息融合的异质图神经网络(metapath attribute fusion graph neural network,MAFGNN),通过在异质网络中引入元路径之前将目标节点的邻居信息包括元路径信息融入到节点中,实现目标节点和邻居信息的融合。该方法首先将不同类型的节点属性特征进行维度转换便于后续的融合操作,通过计算目标节点和邻居节点权重值完成目标节点信息的融合操作。然后根据特定元路径对目标节点进行融合,最后在不同元路径间实现不同语义信息的融合操作。在多个异质信息数据集上进行实验表明,MAFGNN模型在处理异质网络节点嵌入方面相比于最先进的基准实验有最好的性能和更加准确的预测结果。 展开更多
关键词 元路径 异质信息网络 异质图嵌入 信息融合 注意力机制
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基于交互属性增强的电影评分预测
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作者 许星波 张明西 +1 位作者 赵瑞 朱衍熹 《软件导刊》 2024年第1期182-189,共8页
电影评分预测旨在预测用户对未评价的电影可能赋予的评分,是推荐系统、电影分类等现实应用的重要依据。现有预测方法主要关注用户与电影的交互信息和文本信息表示,对属性特征的直接表示考虑较少。为此,提出一种基于交互属性增强的电影... 电影评分预测旨在预测用户对未评价的电影可能赋予的评分,是推荐系统、电影分类等现实应用的重要依据。现有预测方法主要关注用户与电影的交互信息和文本信息表示,对属性特征的直接表示考虑较少。为此,提出一种基于交互属性增强的电影评分预测模型。首先,考虑使用属性节点在网络中的嵌入向量表示不同的属性特征信息,根据数据间的交互和从属关系构建电影信息网络,利用Metapath2vec算法获得属性节点的嵌入向量,将各属性特征转换为具有不同元路径结构信息及语义信息的向量表示。然后,将用户和电影的属性特征向量输入双塔模型,与各自ID特征向量交互融合,以探索不同属性偏好对用户及电影的影响。最后,得到用户和电影特征向量,通过点积实现用户对电影的评分预测。在公开数据集上的结果表明,所提模型相较于传统模型预测准确性更高,证明了模型的有效性。 展开更多
关键词 电影评分预测 metapath2vec 双塔模型 交互属性
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基于异构网络的企业科研合作者推荐研究 被引量:1
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作者 杨娜 刘钱 余小菊 《科技管理研究》 CSSCI 2024年第14期234-242,共9页
旨在研究产学研领域中面向企业的科研合作者推荐问题,以改进现有方法中仅使用专利、合作关系等单一信息的现状,以及避免在可移植性方面的局限性。提出基于异构网络向企业推荐潜在科研合作人员的方法:首先引入异构网络,融合企业、科研人... 旨在研究产学研领域中面向企业的科研合作者推荐问题,以改进现有方法中仅使用专利、合作关系等单一信息的现状,以及避免在可移植性方面的局限性。提出基于异构网络向企业推荐潜在科研合作人员的方法:首先引入异构网络,融合企业、科研人员、专利和论文等多元节点信息,以及企业技术需求和社交关联等多元关联信息;其次分析不同语义关系下连通企业与科研合作者的元路径,并以各元路径下的路径实例为语料,运用SkipGram模型进行网络嵌入训练,用向量余弦相似度表示节点之间的关联程度;最后融合不同路径下的推荐结果,得到最终的科研合作者推荐列表。基于Scholarmate的实例验证表明,元路径1和路径3的推荐效果最好,而综合各条元路径时模型在准确率和特异度指标上表现更好;此外,在符合企业实际情况的不同推荐列表长度下,模型各指标变化不大且处于理想水平,且综合多条元路径时模型的鲁棒性更强。此方法可为企业解决科技人才获取难的问题提供解决方案,并为企业的技术需求分析和产学研领域的社交关系分析提供思路参考。 展开更多
关键词 科研合作者推荐 潜在科研合作人员 异构网络 元路径 网络嵌入 Skig-Gram模型
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基于路径排序的元路径模式搜索算法
10
作者 李振军 赵华 +5 位作者 刘祖军 陶周天 杨斌 黄嘉琦 谭卓 邢颖 《微处理机》 2024年第5期29-32,共4页
针对现有的基于元路径模式建模的异质图神经网络模型灵活性和完全性较差的问题,为进一步提高异质图神经网络模型的效率,基于对现有模型原理的详细分析,提出一种双向路径排序(FR-PR)算法。该算法发挥了图神经网络作为一种基于深度学习的... 针对现有的基于元路径模式建模的异质图神经网络模型灵活性和完全性较差的问题,为进一步提高异质图神经网络模型的效率,基于对现有模型原理的详细分析,提出一种双向路径排序(FR-PR)算法。该算法发挥了图神经网络作为一种基于深度学习的图表示技术在提取图数据特征方面的优越性能,可以自动识别异质图中的元路径模式,并对其进行排序。通过实验,在常用开源异质图数据集上与目前已有的可提取异质图元路径模式的模型进行对比分析,验证了算法的有效性。 展开更多
关键词 异质图 元路径 路径排序
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行为增强的多层次协同Top-N推荐
11
作者 刘宇鹏 吕衍河 《哈尔滨工程大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1119-1126,共8页
传统推荐系统只利用单一用户行为,然而用户行为间是具有关联性,忽视用户行为会丢失辅助行为对目标行为的影响。本文提出了一种行为增强的多层次协同Top-N推荐,在推荐二分图和元路径图上利用注意力机制传播信息,学习多层次高阶和异质协... 传统推荐系统只利用单一用户行为,然而用户行为间是具有关联性,忽视用户行为会丢失辅助行为对目标行为的影响。本文提出了一种行为增强的多层次协同Top-N推荐,在推荐二分图和元路径图上利用注意力机制传播信息,学习多层次高阶和异质协同信号(包括用户-项目间的和项目间的)以提高推荐性能,这样可以更好地利用推荐图结构,并充分考虑到推荐图结构上各种行为间的相互影响。在经典数据集上做了全方位实验验证模型有效性,在电商推荐数据上取得了很好效果。 展开更多
关键词 辅助行为 多行为 图神经网络 元路径图 用户-项目 传播层 目标行为 高阶异质信号
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一种基于异质信息网络的多维度语义融合推荐算法研究
12
作者 甘宏 王华武 《江西科学》 2024年第1期169-176,共8页
为解决目前互联网信息过载问题,推荐系统已经广泛应用于电子商务、新闻资讯和影视音乐网站等。推荐算法目标就是挖掘用户的潜在兴趣,为他们提供个性化的信息推送,最终解决信息过载的问题,从而为用户解决该分类问题,选择合适推荐算法就... 为解决目前互联网信息过载问题,推荐系统已经广泛应用于电子商务、新闻资讯和影视音乐网站等。推荐算法目标就是挖掘用户的潜在兴趣,为他们提供个性化的信息推送,最终解决信息过载的问题,从而为用户解决该分类问题,选择合适推荐算法就显得尤为重要,同时也是解决数据挖掘领域的重要方法。但当前推荐模型缺乏对多源头异质数据的有效利用,同时在聚合语义信息的过程中存在信息损失问题。为解决上述问题,提出了一种基于异质信息网络的多维度语义融合推荐算法模型。首先,通过元路径和异质图描述推荐任务内复杂的语义结构,然后,对于元路径所引导的邻域进行划分,并通过基于多层邻域交互捕获多尺度语义信息,最后,通过在低阶、高阶维度下引导多尺度语义信息融合。实验结果表明,该方法具有较高的准确度。 展开更多
关键词 人工智能技术 异质信息网络 元路径 语义融合
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面向管控一体化网络的网管系统模型与关键技术研究 被引量:15
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作者 彭黎 谈群 邱涤珊 《计算机工程与应用》 CSCD 2012年第24期1-6,71,共7页
针对在传统企业信息化建设中存在管理网络与控制网络相互独立的问题,提出了一种适用于管控一体化网络的网管系统模型。该模型根据管控一体化网络结构复杂、实时性高、稳定性强等特点,通过利用计算机网络技术、实时数据库技术和自动控制... 针对在传统企业信息化建设中存在管理网络与控制网络相互独立的问题,提出了一种适用于管控一体化网络的网管系统模型。该模型根据管控一体化网络结构复杂、实时性高、稳定性强等特点,通过利用计算机网络技术、实时数据库技术和自动控制技术等将管理网络与控制网络紧密的集成在一起,解决了网络节点数据流状况难于分析、网络扩展性强引起的网络结构形式复杂多变等网络管理的问题。以实际企业管控一体化网络为例进行验证,实验结果表明该模型能够提高网络管理效率、改善网络运行状态。 展开更多
关键词 网络管理 企业信息化 管控一体化 实时监控
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基于元路径的动态异质网络表示学习 被引量:3
14
作者 刘群 谭洪胜 +1 位作者 张优敏 王国胤 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第8期1830-1839,共10页
对网络表示学习的研究已经取得了很多成果,但是大部分网络表示学习模型忽略了网络动态性和异质性,无法区分网络中耦合的时间和空间(结构)特征,也不能捕获网络的丰富语义信息.本文提出了基于元路径的动态异质网络表示学习方法.首先将节... 对网络表示学习的研究已经取得了很多成果,但是大部分网络表示学习模型忽略了网络动态性和异质性,无法区分网络中耦合的时间和空间(结构)特征,也不能捕获网络的丰富语义信息.本文提出了基于元路径的动态异质网络表示学习方法.首先将节点的邻域结构按照时间划分出不同的子空间结构,并为每个节点采样出所有时间加权元路径的序列.其次通过门控循环单元将节点的全部时间加权元路径序列上的邻域信息进行集成,最后利用带注意力机制的双向门控循环单元对融合后的节点序列进行时空上下文信息学习,获得每个节点的最终表示向量.通过在真实数据集上的实验表明,在节点分类、聚类和可视化的下游任务测试中,本文提出的算法较基线方法在性能上均有较大提升.节点分类任务中的Micro-F1平均提高了1.09%~3.72%,节点聚类任务中的ARI值提高了3.23%~14.49%. 展开更多
关键词 网络表示学习 动态异质网络 元路径 注意力机制 门控循环单元
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最大Meta路及其在供应链建模与分析中的应用 被引量:5
15
作者 刘晋 《系统工程》 CSCD 北大核心 2003年第4期43-48,共6页
对供应链建模与分析研究现状进行简述 ,并介绍笔者先前提出的基于 Meta图的供应链建模方法 ;在此基础上提出最大 Meta路的概念 ,并给出其数学定义 ;提出基于 Meta图邻接矩阵传递闭包的最大 Meta路的算法 ,并对其算法复杂度进行分析 ,结... 对供应链建模与分析研究现状进行简述 ,并介绍笔者先前提出的基于 Meta图的供应链建模方法 ;在此基础上提出最大 Meta路的概念 ,并给出其数学定义 ;提出基于 Meta图邻接矩阵传递闭包的最大 Meta路的算法 ,并对其算法复杂度进行分析 ,结果表明该算法的复杂度为多项式的 ;通过实例对最大Meta路在供应链建模及其结构分析中的应用进行讨论 。 展开更多
关键词 最大Meta路 META图 供应链 建模 分析
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多重注意力指导下的异构图嵌入方法 被引量:3
16
作者 孟祥福 温晶 +1 位作者 李子函 纪鸿樟 《智能系统学报》 CSCD 北大核心 2023年第4期688-698,共11页
现有的异构图嵌入学习方法存在两个方面的问题,一是没有考虑不同节点属性间的深层联系,二是通过注意力机制聚合邻居节点来生成目标节点的向量表示,忽略了目标节点的特征在向量表示中起的作用。为解决上述问题,本文提出了一种多重注意力... 现有的异构图嵌入学习方法存在两个方面的问题,一是没有考虑不同节点属性间的深层联系,二是通过注意力机制聚合邻居节点来生成目标节点的向量表示,忽略了目标节点的特征在向量表示中起的作用。为解决上述问题,本文提出了一种多重注意力指导下的异构图神经网络,从点-线-网3个角度学习异构节点嵌入向量。使用双向长短期记忆模型(bidirectional long short-term memory networks,Bi-LSTM)挖掘不同节点的属性间的深层关联关系并将其映射到同一向量空间,利用级联网络对单条元路径实例上的邻居节点和目标节点的特征信息进行融合,从而增强嵌入向量对目标节点信息的表达能力,提出一种多重注意力机制来聚合多条元路径实例上的节点信息,生成最终的节点嵌入向量表示。在3个大型异构图上的实验结果表明,本文提出的模型在异构图嵌入的效果方面优于现有基线模型,并且对于增强节点属性信息上的表达展现出了良好的性能。 展开更多
关键词 异构信息网络 图表示学习 异构图嵌入 元路径 元路径实例 图注意力 异构图 图神经网络
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一种基于注意力机制的节点相似性度量方法 被引量:2
17
作者 赵宇红 张凯 《内蒙古科技大学学报》 CAS 2021年第2期174-179,共6页
在异构信息网络挖掘中,度量节点之间的相似性是一项非常有挑战性的工作.为了更准确地度量节点之间的相似性,通过结合注意力机制,从节点与元路径两方面单独进行计算,提出一种全新的节点相似性度量方法.通过在真实网络数据集上与传统算法... 在异构信息网络挖掘中,度量节点之间的相似性是一项非常有挑战性的工作.为了更准确地度量节点之间的相似性,通过结合注意力机制,从节点与元路径两方面单独进行计算,提出一种全新的节点相似性度量方法.通过在真实网络数据集上与传统算法进行实验对比,证明所提出相似性度量算法的准确性. 展开更多
关键词 异构信息网络 注意力机制 元路径 信息散度 相似性度量
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基于图核的异质信息网络链路预测方法 被引量:4
18
作者 赵妍 赵书良 马秋微 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2021年第10期3125-3130,共6页
链路预测是图挖掘主要研究的问题,其研究重点是提取图的特征信息,现有研究方法大多只关注网络拓扑结构而忽略了节点属性信息。针对该问题,提出了基于图核的链路预测方法NGLP。该方法能挖掘有效、可用的元路径;基于元路径对预测对象生成... 链路预测是图挖掘主要研究的问题,其研究重点是提取图的特征信息,现有研究方法大多只关注网络拓扑结构而忽略了节点属性信息。针对该问题,提出了基于图核的链路预测方法NGLP。该方法能挖掘有效、可用的元路径;基于元路径对预测对象生成带节点属性的子图,使用子图表示被预测的链路;然后利用图核方法计算子图之间的相似性;最后训练SVM得出链路预测结果。实验结果表明,提出方法与其他方法相比具有更高的精度和更强的稳定性。 展开更多
关键词 异质信息网络 链路预测 图核 元路径
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基于异质信息网络元路径的药物-靶标相互作用预测模型 被引量:3
19
作者 廖懿鸣 欧阳纯萍 +1 位作者 刘永彬 胡富裕 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第1期37-44,共8页
提出一种融合元路径信息的图神经网络模型,用于预测药物-靶标相互作用(GMDTI)。首先根据8个数据集中的药物、靶标、疾病和副作用数据以及它们之间的8种作用关系,构建药物-靶标异质信息网络(HIN);然后定义两条元路径来捕获药物-靶标HIN... 提出一种融合元路径信息的图神经网络模型,用于预测药物-靶标相互作用(GMDTI)。首先根据8个数据集中的药物、靶标、疾病和副作用数据以及它们之间的8种作用关系,构建药物-靶标异质信息网络(HIN);然后定义两条元路径来捕获药物-靶标HIN中的不同子结构信息和不同节点间隐藏的语义信息,并应用图神经网络的方法聚合节点的一阶邻居信息和元路径中节点间的语义信息;最后利用端到端的学习方法完成DTIs预测。该方法同时考虑药物-靶标HIN的结构特性和元路径语义信息,有助于学习到更多潜在的药物-靶标作用关系。实验结果表明,GMDTI的预测准确率高于所有基线模型,AUC达到98.6%,AUPR达到94.5%。同时通过调整数据的稀疏度和降噪实验,证明GMDTI具备优于所有基线模型的鲁棒性。 展开更多
关键词 药物-靶标相互作用预测 图神经网络 异质信息网络 元路径 特征表示
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基于元路径的图Transformer神经网络 被引量:1
20
作者 梁书晴 蒋运承 《计算机系统应用》 2022年第11期1-9,共9页
图神经网络作为一种新的深度学习模型,被广泛运用在图数据中,并极大地推动了推荐系统、社交网络、知识图谱等应用的发展.现有的异构图神经网络通常事先定义了多条元路径来学习异构图中的复合关系.然而,这些模型通常在特征聚合步骤中只... 图神经网络作为一种新的深度学习模型,被广泛运用在图数据中,并极大地推动了推荐系统、社交网络、知识图谱等应用的发展.现有的异构图神经网络通常事先定义了多条元路径来学习异构图中的复合关系.然而,这些模型通常在特征聚合步骤中只考虑单条元路径,导致模型只关注了元路径的局部结构,忽略了元路径之间的全局相关性;还有一些模型则是忽略掉了元路径的中间节点和边信息,导致模型无法学习到元路径内部的语义信息.针对以上问题,本文提出一种基于元路径的图Transformer神经网络(MaGTNN).该模型首先将异构图采样为基于元路径的多关系子图,利用提出的位置编码和边编码的方法来获取元路径中的语义信息.随后使用改进的图Transformer层计算出目标节点与其元邻居的相似度,并利用该相似度来聚合其所有的元邻居信息.在3个公开数据集的节点分类和节点聚类任务中,MaGTNN均高于最新的基准模型. 展开更多
关键词 异构图 异构图嵌入 元路径 图神经网络 TRANSFORMER
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