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宣和猪ADRP和FASN基因多态性及其与肉质性状的关联分析
1
作者
赖金花
王孝义
+7 位作者
吴娅
朱东霞
朱怡轩
张克忠
黄兆军
管和平
李明丽
鲁绍雄
《中国畜牧兽医》
北大核心
2026年第2期879-891,共13页
【目的】筛选宣和猪脂肪分化相关蛋白(adipose differentiation-related protein,ADRP)和脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并揭示SNP位点与宣和猪肉质性状的关联...
【目的】筛选宣和猪脂肪分化相关蛋白(adipose differentiation-related protein,ADRP)和脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并揭示SNP位点与宣和猪肉质性状的关联性。【方法】以120头宣和猪为试验对象,系统测定了其肉色、大理石纹、pH_(1)、滴水损失和肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量等肉质性状指标,对ADRP和FASN基因进行PCR扩增及Sanger测序,筛选SNP位点,并基于最小二乘模型对各SNP位点不同基因型与宣和猪肉质性状进行关联分析。【结果】在ADRP基因第8外显子存在3个SNPs位点,其中rs325276230位点为同义突变,rs321564137和rs81217193位点为错义突变,其优势基因型分别为AA、AA和GG,优势等位基因分别为A、A和G,3个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。在FASN基因中共检出6个SNPs位点,包含4个同义突变位点(rs337531100、rs324640280、rs81478148、rs319161464)和2个错义突变位点(rs337267671、rs342967881),其优势基因型分别为TC、CC、TT、GG、GG和CT,优势等位基因分别为C、C、T、G、G和T,其中rs81478148位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。关联分析结果显示,ADRP与FASN基因SNP位点与宣和猪肉质性状存在显著关联,其中,ADRP基因rs325276230位点AA基因型个体的IMF含量、大理石纹、pH_(1)极显著或显著高于GG基因型(P<0.01;P<0.05);rs321564137位点AA基因型个体的IMF含量显著高于AG基因型,肉色显著低于AG基因型(P<0.05);rs81217193位点GG基因型个体的IMF含量显著高于GA与AA基因型(P<0.05)。FASN基因rs337531100位点CC基因型个体的IMF含量显著高于TT与TC基因型(P<0.05);rs324640280位点TT基因型个体的肉色显著高于CT基因型(P<0.05);rs81478148位点CT基因型个体的肉色、pH_(1)及滴水损失极显著或显著高于TT基因型(P<0.01;P<0.05);rs319161464位点AA基因型个体的pH_(1)显著低于GG和GA基因型(P<0.05);rs337267671位点GG基因型个体的大理石纹显著高于GA与AA基因型(P<0.05);rs342967881位点TT基因型个体的IMF含量与大理石纹均显著高于CC基因型(P<0.05)。【结论】ADRP和FASN基因SNP位点与宣和猪肉质性状存在显著关联,其中ADRP基因的rs325276230、rs321564137、rs81217193位点及FASN基因的rs337531100和rs342967881位点可作为改善宣和猪IMF含量的潜在分子标记。
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关键词
宣和猪
ADRP基因
FASN基因
单核苷酸多态性
肉质性状
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职称材料
题名
宣和猪ADRP和FASN基因多态性及其与肉质性状的关联分析
1
作者
赖金花
王孝义
吴娅
朱东霞
朱怡轩
张克忠
黄兆军
管和平
李明丽
鲁绍雄
机构
云南农业大学动物科学技术学院
宣威市畜禽改良工作站
宣威市农业农村局
出处
《中国畜牧兽医》
北大核心
2026年第2期879-891,共13页
基金
云南省生猪产业技术体系(2023KJX0016)
云南省创新引导与科技型企业培育计划项目(202104BI090022)
+1 种基金
国家重点研发计划(2022YFD1601902)
云南省产业技术领军人才专项(YNWR-CYJS-2018-056)。
文摘
【目的】筛选宣和猪脂肪分化相关蛋白(adipose differentiation-related protein,ADRP)和脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FASN)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,并揭示SNP位点与宣和猪肉质性状的关联性。【方法】以120头宣和猪为试验对象,系统测定了其肉色、大理石纹、pH_(1)、滴水损失和肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量等肉质性状指标,对ADRP和FASN基因进行PCR扩增及Sanger测序,筛选SNP位点,并基于最小二乘模型对各SNP位点不同基因型与宣和猪肉质性状进行关联分析。【结果】在ADRP基因第8外显子存在3个SNPs位点,其中rs325276230位点为同义突变,rs321564137和rs81217193位点为错义突变,其优势基因型分别为AA、AA和GG,优势等位基因分别为A、A和G,3个SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。在FASN基因中共检出6个SNPs位点,包含4个同义突变位点(rs337531100、rs324640280、rs81478148、rs319161464)和2个错义突变位点(rs337267671、rs342967881),其优势基因型分别为TC、CC、TT、GG、GG和CT,优势等位基因分别为C、C、T、G、G和T,其中rs81478148位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。关联分析结果显示,ADRP与FASN基因SNP位点与宣和猪肉质性状存在显著关联,其中,ADRP基因rs325276230位点AA基因型个体的IMF含量、大理石纹、pH_(1)极显著或显著高于GG基因型(P<0.01;P<0.05);rs321564137位点AA基因型个体的IMF含量显著高于AG基因型,肉色显著低于AG基因型(P<0.05);rs81217193位点GG基因型个体的IMF含量显著高于GA与AA基因型(P<0.05)。FASN基因rs337531100位点CC基因型个体的IMF含量显著高于TT与TC基因型(P<0.05);rs324640280位点TT基因型个体的肉色显著高于CT基因型(P<0.05);rs81478148位点CT基因型个体的肉色、pH_(1)及滴水损失极显著或显著高于TT基因型(P<0.01;P<0.05);rs319161464位点AA基因型个体的pH_(1)显著低于GG和GA基因型(P<0.05);rs337267671位点GG基因型个体的大理石纹显著高于GA与AA基因型(P<0.05);rs342967881位点TT基因型个体的IMF含量与大理石纹均显著高于CC基因型(P<0.05)。【结论】ADRP和FASN基因SNP位点与宣和猪肉质性状存在显著关联,其中ADRP基因的rs325276230、rs321564137、rs81217193位点及FASN基因的rs337531100和rs342967881位点可作为改善宣和猪IMF含量的潜在分子标记。
关键词
宣和猪
ADRP基因
FASN基因
单核苷酸多态性
肉质性状
Keywords
Xuanhe pigs
ADRPgene
FASNgene
single nucleotide polymorphism
meatqualitytrait
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
宣和猪ADRP和FASN基因多态性及其与肉质性状的关联分析
赖金花
王孝义
吴娅
朱东霞
朱怡轩
张克忠
黄兆军
管和平
李明丽
鲁绍雄
《中国畜牧兽医》
北大核心
2026
0
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