目的 比较几种药典收载石斛与常见市场混淆品种的 mat K基因序列 ,为石斛类药材的鉴定提供分子依据。方法 PCR扩增、测序、PAUP软件分析。结果 非石斛属的几种混淆品与正品石斛间的 mat K基因序列差异远大于正品石斛间的差异 ,PAUP4....目的 比较几种药典收载石斛与常见市场混淆品种的 mat K基因序列 ,为石斛类药材的鉴定提供分子依据。方法 PCR扩增、测序、PAUP软件分析。结果 非石斛属的几种混淆品与正品石斛间的 mat K基因序列差异远大于正品石斛间的差异 ,PAUP4.0构建的树型图亦显示几种石斛属植物聚在一起 ,而非石斛属植物聚在外方。结论 通过 mat K基因序列可以分析石斛及其混淆品间的遗传关系 ,将正品与混淆品区别开来。展开更多
以新疆地区不同居群的52份新疆野苹果[Malussieversii（Ledeb．）Roem．]、9份中国苹果品种（Malus×domesticasubsp．chinensisLi．）、1份森林苹果（MsylvestrisMiller）种质为试材，进行核糖体DNA内转录间隔区（ribosomal DNA in...以新疆地区不同居群的52份新疆野苹果[Malussieversii（Ledeb．）Roem．]、9份中国苹果品种（Malus×domesticasubsp．chinensisLi．）、1份森林苹果（MsylvestrisMiller）种质为试材，进行核糖体DNA内转录间隔区（ribosomal DNA intemal transcribed spacers，ITS）和叶绿体成熟酶K（matK）基因的测序分析。从GenBank中获取了11个苹果栽培品种、14个塞威士苹果、26个苹果属其它种及1个外类群欧洲梨（Pyruscommunis）的ITS及matK序列。利用MEGA（ver．4．0）计算不同序列间的碱基组成频率、简约信息位点数、转换／颠换比率、序列间成对距离，以最大简约法与邻接法进行系统发育分析。结果表明，采集的“新疆野苹果”与“中国苹果”的ITS序列长度在589-594bp，含有148个简约信息位点，转换／颠换比率（R）为1．029：MatK序列长度为1451～1461bp，没有复制子Ⅱ序列，含有16个简约信息位点，转换／颠换为1．442。ITS分析将中国苹果、新疆野苹果（来自中国新疆）和塞威士苹果（来自GenBank）聚类于一个大的发育枝内，新疆野苹果5个居群的系统演化按新源、巩留、霍城和塔城的先后次序发生。MarK序列的系统发育分析将中国苹果和新疆野苹果聚类在一个大的发育枝内，但自展支持率低。由此说明，中国苹果由新疆野苹果驯化而来。matK不适于栽培苹果种内的系统发育分析。展开更多
matK基因是陆地植物核心条码候选片段之一,文章通过克隆获得22个核桃品种matK基因近3'端长度为726 bp EST序列,运用序列分析技术探索matK在核桃种间关系研究中的价值。结果表明,在所测的matK基因的核苷酸序列中发生变异的核桃品种...matK基因是陆地植物核心条码候选片段之一,文章通过克隆获得22个核桃品种matK基因近3'端长度为726 bp EST序列,运用序列分析技术探索matK在核桃种间关系研究中的价值。结果表明,在所测的matK基因的核苷酸序列中发生变异的核桃品种均属早实核桃类群,而晚实核桃类群无变异发生;推导氨基酸序列分析显示薄壳香由于发生突变,提前终止翻译而只编码173个氨基酸,而其他品种均编码234个氨基酸;采用近邻接树法和最大简约法构建的系统进化树显示,22个品种核桃分为5个组,其中扎343与其他21个品种有明显差异,8个新选育的品种中金薄丰1号较为突出;而辽核1号与西扶1号亲缘关系最近。对matK基因深入研究将为核桃种质资源保护、杂交育种及开发运用提供分子生物学依据。展开更多
文摘目的 比较几种药典收载石斛与常见市场混淆品种的 mat K基因序列 ,为石斛类药材的鉴定提供分子依据。方法 PCR扩增、测序、PAUP软件分析。结果 非石斛属的几种混淆品与正品石斛间的 mat K基因序列差异远大于正品石斛间的差异 ,PAUP4.0构建的树型图亦显示几种石斛属植物聚在一起 ,而非石斛属植物聚在外方。结论 通过 mat K基因序列可以分析石斛及其混淆品间的遗传关系 ,将正品与混淆品区别开来。
文摘以新疆地区不同居群的52份新疆野苹果[Malussieversii（Ledeb．）Roem．]、9份中国苹果品种（Malus×domesticasubsp．chinensisLi．）、1份森林苹果（MsylvestrisMiller）种质为试材，进行核糖体DNA内转录间隔区（ribosomal DNA intemal transcribed spacers，ITS）和叶绿体成熟酶K（matK）基因的测序分析。从GenBank中获取了11个苹果栽培品种、14个塞威士苹果、26个苹果属其它种及1个外类群欧洲梨（Pyruscommunis）的ITS及matK序列。利用MEGA（ver．4．0）计算不同序列间的碱基组成频率、简约信息位点数、转换／颠换比率、序列间成对距离，以最大简约法与邻接法进行系统发育分析。结果表明，采集的“新疆野苹果”与“中国苹果”的ITS序列长度在589-594bp，含有148个简约信息位点，转换／颠换比率（R）为1．029：MatK序列长度为1451～1461bp，没有复制子Ⅱ序列，含有16个简约信息位点，转换／颠换为1．442。ITS分析将中国苹果、新疆野苹果（来自中国新疆）和塞威士苹果（来自GenBank）聚类于一个大的发育枝内，新疆野苹果5个居群的系统演化按新源、巩留、霍城和塔城的先后次序发生。MarK序列的系统发育分析将中国苹果和新疆野苹果聚类在一个大的发育枝内，但自展支持率低。由此说明，中国苹果由新疆野苹果驯化而来。matK不适于栽培苹果种内的系统发育分析。
文摘matK基因是陆地植物核心条码候选片段之一,文章通过克隆获得22个核桃品种matK基因近3'端长度为726 bp EST序列,运用序列分析技术探索matK在核桃种间关系研究中的价值。结果表明,在所测的matK基因的核苷酸序列中发生变异的核桃品种均属早实核桃类群,而晚实核桃类群无变异发生;推导氨基酸序列分析显示薄壳香由于发生突变,提前终止翻译而只编码173个氨基酸,而其他品种均编码234个氨基酸;采用近邻接树法和最大简约法构建的系统进化树显示,22个品种核桃分为5个组,其中扎343与其他21个品种有明显差异,8个新选育的品种中金薄丰1号较为突出;而辽核1号与西扶1号亲缘关系最近。对matK基因深入研究将为核桃种质资源保护、杂交育种及开发运用提供分子生物学依据。
