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芸薹属蔬菜分子标记数据库VEGMarkerDB的开发与应用
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作者 杨宝菊 贺小宁 +6 位作者 陈海旭 蔡旭 侯佳伟 李玉芳 王辉 王晓武 武剑 《园艺学报》 北大核心 2025年第5期1285-1300,共16页
分子标记作为DNA水平遗传多态性的直接表征,在蔬菜遗传研究中具有重要应用价值。针对现有分子标记分析工具存在操作复杂、引物设计效率低下的问题,本研究基于SNP和InDel分子标记开发了整合数据存储与高通量引物设计的芸薹属蔬菜分子标... 分子标记作为DNA水平遗传多态性的直接表征,在蔬菜遗传研究中具有重要应用价值。针对现有分子标记分析工具存在操作复杂、引物设计效率低下的问题,本研究基于SNP和InDel分子标记开发了整合数据存储与高通量引物设计的芸薹属蔬菜分子标记数据库VEGMarkerDB。系统采用B/S架构,基于Django框架构建后端服务,结合MySQL数据库管理系统,整合了白菜(Brassicarapa)、甘蓝(B.oleracea)、甘蓝型油菜(B. napus)和芥菜(B. juncea)四大类作物的重测序数据及VCF变异文件。数据库提供变异位点检索服务,可以根据染色体位置查询,实现分子标记信息的快速定位。创新性地开发了在线批量引物设计模块,采用并行计算技术处理用户提交的批量设计任务,通过可视化界面实时反馈候选引物参数(包括退火温度、GC含量、产物长度等),并生成标准化实验报告。利用实验室现有材料对本数据库设计的KASP引物进行验证,设计成功率高达95%以上。VEGMarkerDB实现了芸薹属蔬菜多物种分子标记资源的整合管理;实现了基于Web的批量化引物设计解决方案;建立了实验验证与算法优化的闭环反馈机制。VEGMarkerDB(vegmarker.top)为芸薹属蔬菜分子育种研究提供了高效的技术平台,其基于通用关系型数据库架构的模块化设计可扩展应用于其他作物体系。 展开更多
关键词 芸薹属 分子标记 数据库 在线批量引物设计 KASP
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从传统杂交到智能设计:中国甘蔗育种的路径演进与技术革新
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作者 刘晓 蓝艳华 +1 位作者 蔡裕洋 安玉兴 《中国糖料》 2026年第1期16-23,共8页
本文系统地梳理了中国甘蔗育种从传统杂交到智能设计的技术演进路径,揭示了其在高产、高糖、抗逆及机械化适配等产业需求推动下的革新逻辑。传统杂交育种通过“五圃制选育程序”与骨干亲本策略培育了‘粤糖’‘桂糖’等标志性品种,但其... 本文系统地梳理了中国甘蔗育种从传统杂交到智能设计的技术演进路径,揭示了其在高产、高糖、抗逆及机械化适配等产业需求推动下的革新逻辑。传统杂交育种通过“五圃制选育程序”与骨干亲本策略培育了‘粤糖’‘桂糖’等标志性品种,但其周期长、遗传改良效率低等局限性日益凸显。分子标记辅助育种、航天诱变及转基因技术显著缩短了品种选育周期,并通过创制新种质突破遗传多样性的瓶颈。智能设计阶段,多组学整合解析了糖分-抗逆代谢网络,CRISPR基因编辑定向改良目标性状,人工智能模型则实现了表型精准预测。然而,复杂性状遗传解析不足、种质资源狭窄及技术转化滞后仍是主要挑战。本研究提出“双轨并行”策略,即优化传统育种流程并深度融合智能技术,同时建议通过跨学科协同、种质库升级及政策支持推动产业可持续发展。未来,甘蔗育种将依托多组学、基因编辑与人工智能,迈向“可预测、可设计、可定制”的新阶段。 展开更多
关键词 甘蔗育种 传统杂交 智能设计 分子标记辅助育种 基因编辑 人工智能 种质资源 技术革新
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Marker-assisted Selection of ZmC_4Ppc in Rice Breeding and Yield Trait Performances of Advanced Lines 被引量:1
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作者 XIANG Xun chao LI Ji hang +1 位作者 HE Li bin Li Ping 《Rice science》 SCIE 2007年第3期181-188,共8页
The full-length of intact Zea mays gene for phosphoenolpyruvate carboxylase gene (ZmC4Ppc) is 6 781 bp. The products of PCR for this gene were not clear with poor repeatability, resulting in that it was difficult fo... The full-length of intact Zea mays gene for phosphoenolpyruvate carboxylase gene (ZmC4Ppc) is 6 781 bp. The products of PCR for this gene were not clear with poor repeatability, resulting in that it was difficult for marker-assisted selection (MAS) both in rice and maize. For selecting the markers for MAS, sequences presented only in maize rather than in rice were identified by BLAST, and used for primer design using Primer Premier 5.0. A pair of specific primer termed MRpc (Forward: 5' AAGCAGGGAAGCGAGACG 3', Reverse: 5' GATTGCCGCCAGCAGTAG 3') was used for selection of transformed rice, and ZmC4Ppc could be highly and constitutively expressed at each tested developmental stages in the transformed rice selected by using MRpc. Thus, MRpc was used for MAS of progenies carrying ZmC4Ppc gene in rice and some restorer lines with ZmC4Ppc (e.g. FPM881) derived from ZmC4Ppc-transformed Kitaake backcrossed with a restorer line Shuhui 881 were obtained. The analyses on genetic background, PEPCase activity, net photosynthetic rate, general combining ability (GCA) and specific combining ability (SCA) of FPM881 showed that similarity of genetic background reached above 95%, the PEPCase and net photosynthetic rate were higher than those of the control, and some of the progenies carrying ZmC4Ppc gene had better GCA and SCA for grain yield per plant, number of panicles per plant, and 1000-grain weight than those of the control. This suggested that the introduction of maize ZmC4Ppc gene via MAS and its stable expression could increase grain yield of rice and would likely provide a pathway for rice varietal improvement. 展开更多
关键词 rice Zea mays gene for phosphoenolpyruvate carboxylase primer design marker-assisted selection varietal improvement phosphoenotpyruvate carboxylase activity net photosynthetic rate general combining ability specialcombniing ability
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Breeding by Design^(TM)
4
作者 A.P. Sφrensen M. van Haaren A. van Tunen 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第2期234-234,共1页
The development of high throughput molecular marker technologies and automated scoring of multiple markers simultaneously has opened the possibilities for the development of highly saturated molecular
关键词 表型 基因型 分子标记 育种技术
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基于3~6岁儿童绘画马克笔的研发和探究 被引量:1
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作者 谢力威 《中国制笔》 2025年第1期40-47,共8页
在当前教育与创意市场蓬勃发展的背景下,儿童绘画教育日益受到家长和教育机构的关注。然而,市场上的儿童绘画马克笔常忽视几个关键因素:墨水色彩的科学搭配、产品的人体工学设计以及墨水的安全性。这导致它们无法满足儿童绘画的多元化需... 在当前教育与创意市场蓬勃发展的背景下,儿童绘画教育日益受到家长和教育机构的关注。然而,市场上的儿童绘画马克笔常忽视几个关键因素:墨水色彩的科学搭配、产品的人体工学设计以及墨水的安全性。这导致它们无法满足儿童绘画的多元化需求,还可能潜在威胁儿童健康。为此,本文采用跨学科研究方法,结合心理学原理、人体工程学和材料安全标准,对儿童绘画用马克笔进行了全面研发与探索。研究重点包括:优化墨水色彩搭配,以刺激儿童视觉发展;改进产品设计,提高儿童握持舒适性和操作便利性;确保墨水成分安全,防止有害物质对儿童造成伤害。 展开更多
关键词 马克笔 色彩 产品设计 墨水安全性
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基于Kano模型和QFD方法的马克笔设计
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作者 吴彦祺 洪歆慧 《丝网印刷》 2025年第7期85-87,共3页
马克笔在人机工程学、墨水可视性、环保材料及使用便利性方面存在不足。采用Kano模型和质量功能展开法,将用户需求转化为具体功能要素。揭示了用户对马克笔的多元化需求,为马克笔设计提供了科学依据和实用指导。
关键词 马克笔设计 KANO模型 QFD质量功能展开方法
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正交设计优化假俭草SRAP-PCR反应体系及引物筛选 被引量:42
7
作者 郑轶琦 王志勇 +2 位作者 郭海林 薛丹丹 刘建秀 《草业学报》 CSCD 2008年第4期110-117,共8页
以假俭草叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2+、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶4种因素3个水平,对假俭草SRAP反应体系进行研究,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了假俭草的SRAP最佳反应体系。结果表明,假俭草SRAP-PCR最佳... 以假俭草叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2+、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶4种因素3个水平,对假俭草SRAP反应体系进行研究,并比较了不同浓度模板DNA对扩增效果的影响,建立了假俭草的SRAP最佳反应体系。结果表明,假俭草SRAP-PCR最佳反应体系为:2μL 10×PCR buffer、60 ng模板DNA、Mg2+1.50 mmol/L、dNTP 260μmol/L、引物0.25μmol/L、Taq DNA聚合酶0.5 U,总体积为20μL。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以Mg2+浓度影响最大,Taq DNA聚合酶的影响最小。运用该体系对4份假俭草种源进行验证,证明该体系稳定可靠,并从45个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的26个引物组合。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行假俭草分子遗传学研究提供了科学依据。 展开更多
关键词 假俭草 SRAP标记 正交试验设计 体系优化 引物筛选
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火龙果IRAP分子标记反应体系的建立与优化 被引量:13
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作者 陶金 乔光 +2 位作者 文晓鹏 刘涛 彭志军 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期33-38,共6页
基于火龙果Ty1-copia类反转录转座子的长末端重复序列信息设计引物,采用5因素4水平L16(45)的完全随机正交试验,对Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶用量、引物浓度和DNA含量进行优化,建立火龙果IRAP分子标记反应体系。结果表明,25μL... 基于火龙果Ty1-copia类反转录转座子的长末端重复序列信息设计引物,采用5因素4水平L16(45)的完全随机正交试验,对Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq DNA聚合酶用量、引物浓度和DNA含量进行优化,建立火龙果IRAP分子标记反应体系。结果表明,25μL反应体系含基因组DNA 20ng、2.5mmol/L MgCl2、0.10mmol/L dNTPs、10×PCR Buffer 2.5μL、Taq DNA聚合酶0.75U、0.25μmol/L LTR引物,0.080g/mL的非变性PAGE胶适于IRAP多态性检测。 展开更多
关键词 火龙果 反转录转座子间扩增多态性标记 正交设计
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狗牙根SRAP-PCR反应体系优化及引物筛选 被引量:31
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作者 王志勇 袁学军 +1 位作者 刘建秀 郭海林 《草业学报》 CSCD 2008年第3期79-85,共7页
利用正交设计,从Mg2+、dNTP、引物浓度和DNA聚合酶4种因素3个水平以及不同的模板DNA浓度来优化狗牙根SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了全面筛选。狗牙根SRAP-PCR优化反应体系结果为:2μL 10×buffer4、0 ng模板DNA、Mg2+1.25 mmol/L... 利用正交设计,从Mg2+、dNTP、引物浓度和DNA聚合酶4种因素3个水平以及不同的模板DNA浓度来优化狗牙根SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了全面筛选。狗牙根SRAP-PCR优化反应体系结果为:2μL 10×buffer4、0 ng模板DNA、Mg2+1.25 mmol/Ld、NTP 260μmol/L、引物0.2μmol/L、Taq DNA聚合酶1.0 U,总体积20μL。运用该结果从90对引物中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物34对。优化体系的建立及其引物的筛选为今后利用SRAP标记技术进行狗牙根遗传分析、图谱构建、基因定位与种质资源鉴定奠定了技术基础。 展开更多
关键词 狗牙根 SRAP标记 正交试验 体系优化 引物
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基于三维标识物的虚实配准方法研究 被引量:5
10
作者 卢韶芳 韩雪 关馨 《吉林大学学报(信息科学版)》 CAS 2017年第3期288-295,共8页
为提高医疗辅助手术中增强现实系统的虚实配准效率,设计了一种基于海明编码的正六面体三维标识物,对标识物进行检测和识别。针对三维标识物的特点,采用POSIT(Pose from Orthography and Scaling with Iterations)算法求得摄像机的位姿,... 为提高医疗辅助手术中增强现实系统的虚实配准效率,设计了一种基于海明编码的正六面体三维标识物,对标识物进行检测和识别。针对三维标识物的特点,采用POSIT(Pose from Orthography and Scaling with Iterations)算法求得摄像机的位姿,并对标识物的尺度进行实验研究,从而得到优化尺度;利用获得的转移矩阵将CT(Computed Tomography)重建并渲染后的虚拟颅骨模型实时显示在真实场景中,最后调整标识物将虚拟模型与真实颅骨模型虚实配准显示。经多组实验验证,设计的三维标识物可在多数情况下识别一个以上标志面,优化后的标识物识别效果良好,可成功地应用在虚实配准实验中,从而证明了这种标识的有效性。 展开更多
关键词 增强现实 虚实配准 标识物设计
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水稻产量分子设计育种研究进展 被引量:6
11
作者 张分云 李宏 +5 位作者 周向阳 王重荣 周德贵 赖穗春 陈立云 周少川 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期663-672,共10页
高产是水稻育种的重要目标。随着水稻基因组测序的广泛使用,功能基因组学和生物信息学的飞速发展,越来越多的水稻产量相关基因或QTL被精确定位甚至克隆,以SNP为代表的新一代分子标记技术为水稻高产分子设计育种奠定了重要基础。本文以... 高产是水稻育种的重要目标。随着水稻基因组测序的广泛使用,功能基因组学和生物信息学的飞速发展,越来越多的水稻产量相关基因或QTL被精确定位甚至克隆,以SNP为代表的新一代分子标记技术为水稻高产分子设计育种奠定了重要基础。本文以水稻产量性状分子生物学为基础,总结水稻产量分子设计育种所成就及阻碍其发展的制约因子,提出实现水稻产量分子设计育种必须建立高通量、高效、便捷的检测平台,从而达到提高水稻产量潜力的最终目的。 展开更多
关键词 水稻产量 SNP标记 分子设计育种
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风暴潮警戒潮位标志物设计研究 被引量:3
12
作者 贾旭飞 张冉 +2 位作者 王立贵 常宇 孟超 《海岸工程》 2016年第2期66-78,共13页
风暴潮警戒潮位是有关海洋预报部门发布预警信息及指导政府部门进行防灾减灾决策的重要参考,通过设置风暴潮警戒潮位标志物是进行预警的有效途径。风暴潮警戒潮位标志物是将沿海警戒潮位值按蓝色、黄色、橙色和红色警戒潮位进行直观化,... 风暴潮警戒潮位是有关海洋预报部门发布预警信息及指导政府部门进行防灾减灾决策的重要参考,通过设置风暴潮警戒潮位标志物是进行预警的有效途径。风暴潮警戒潮位标志物是将沿海警戒潮位值按蓝色、黄色、橙色和红色警戒潮位进行直观化,更便于沿海地区直接了解风暴潮警戒潮位情况。通过对风暴潮警戒潮位标志物进行科学合理的设计,可以节省建设成本,提高警戒潮位的辨识度,为沿海的风暴潮防灾减灾工作提供了更好的技术支持,减少海洋灾害对沿海地区带来的损失。 展开更多
关键词 风暴潮 警戒潮位 标志物 设计
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日本沼虾SRAP反应体系正交设计及优化 被引量:10
13
作者 姚建华 傅洪拓 +4 位作者 龚永生 吴滟 何新龙 李慧萍 乔慧 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第B10期122-125,共4页
对影响SRAP反应的4个因素(Taq酶、dNTP、Mg2+、引物)4个水平进行正交组合,以建立日本沼虾的SRAP分子标记技术。试验分两步进行:第一步筛选出可有效扩增的引物组合;第二步对筛选出的体系进行优化。结果表明,日本沼虾SRAP反应体系适宜引... 对影响SRAP反应的4个因素(Taq酶、dNTP、Mg2+、引物)4个水平进行正交组合,以建立日本沼虾的SRAP分子标记技术。试验分两步进行:第一步筛选出可有效扩增的引物组合;第二步对筛选出的体系进行优化。结果表明,日本沼虾SRAP反应体系适宜引物组合为Me4Em2,最适条件为在25μL的反应体系中,Mg2+、dNTP、Taq酶、引物浓度分别为2.5 mmol/L、0.25 mmol/L、0.64 U/20μL、0.6μmol/L。本研究结果为SRAP分子标记技术在日本沼虾中的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 日本沼虾 分子标记 SRAP 正交设计
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蒺藜苜蓿EST-SSRs分布特征及标记的开发 被引量:10
14
作者 屠德鹏 魏臻武 +3 位作者 武自念 雷艳芳 张栋 邱伟伟 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期746-752,共7页
利用蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)EST数据库开发新的EST-SSRs标记,分析EST-SSRs的分布特征。利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测,共检测出6 688个SSR序列,分布于6 512个EST中,占整个EST数据库的2.... 利用蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)EST数据库开发新的EST-SSRs标记,分析EST-SSRs的分布特征。利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测,共检测出6 688个SSR序列,分布于6 512个EST中,占整个EST数据库的2.28%。其中二核苷酸重复基元出现的频率最高,占总EST-SSRs的34.4%(2 301条),其次是三核苷酸重复基元,占29.6%(1 982条),4~6核苷酸重复基元所占比例均较小。利用Pri mer Premier 5.0随机设计100对EST-SSRs引物,PCR扩增结果表明,85对引物在蒺藜苜蓿RIL群体亲本A17和A20上有清晰的扩增条带,占合成引物总数的85%,在RIL-8群体中检测到29个EST-SSRs引物有多态性,占可扩增引物的34.1%。本研究开发了85个蒺藜苜蓿EST-SSRs新标记。 展开更多
关键词 蒺藜苜蓿 EST-SSRS 引物设计 标记开发
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梨SCoT-PCR反应体系的优化及‘库尔勒香梨’营养系变异鉴定 被引量:10
15
作者 和世玉 牛建新 马建江 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1337-1346,共10页
【目的】建立稳定性好、可重复性强、多态性扩增效果好的‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系,证明SCoT分子标记可以用于梨属植物优良营养系的鉴定。【方法】以新疆库尔勒农二师29团、33团和34团的‘库尔勒香梨’优良营养系为试材,通过L25(... 【目的】建立稳定性好、可重复性强、多态性扩增效果好的‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系,证明SCoT分子标记可以用于梨属植物优良营养系的鉴定。【方法】以新疆库尔勒农二师29团、33团和34团的‘库尔勒香梨’优良营养系为试材,通过L25(56)正交试验设计对‘库尔勒香梨’SCoT-PCR反应体系进行筛选,并对扩增反应程序进行优化,运用正交设计直观分析法和正交设计助手Ⅱ软件对正交设计扩增结果进行分析,从筛选出的20个引物中随机选择2条引物对24份材料扩增,用DNAMAN、Editseq、ORF Finder和NCBI-BLAST-tblastx对测序结果分析。【结果】优化后的香梨SCoT-PCR 20μL反应分析体系含(2.5 mmol·L^(-1)10×buffer with Mg^(2+))2.5μL、Taq酶1.5 U、引物10μmol·L^(-1)、模板DNA25 ng、dNTPs 1.6 mmol·L^(-1)。反应程序为94℃预变性4 min;94℃变性1 min,52℃退火45 s,72℃延伸1 min,30次循环;72℃延伸8 min。对测序结果分析表明:扩增产物的大小为200~2 000 bp,23份材料与对照材料存在单碱基的缺失,利用单碱基变异可以区分出24份材料,说明18份优良营养系材料发生了遗传变异。【结论】SCoT分子标记可用于梨树营养系变异的鉴定。 展开更多
关键词 '库尔勒香梨’ SCoT分子标记 正交设计 体系优化 优良营养系
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菊花SSR-PCR反应体系的建立和优化 被引量:11
16
作者 李亚慧 黄丛林 董然 《北方园艺》 CAS 北大核心 2012年第13期127-131,共5页
为快速确定菊花SSR反应体系,利用正交实验设计L16(45)对菊花基因组SSR-PCR反应体系的5个因素(模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和Taq酶)在4个水平上进行正交设计,筛选出适合菊花的最佳SSR-PCR反应体系,进一步利用单因素完全随机试验筛选各反... 为快速确定菊花SSR反应体系,利用正交实验设计L16(45)对菊花基因组SSR-PCR反应体系的5个因素(模板DNA、Mg2+、dNTP、引物和Taq酶)在4个水平上进行正交设计,筛选出适合菊花的最佳SSR-PCR反应体系,进一步利用单因素完全随机试验筛选各反应因素的最佳水平。结果表明:建立菊花基因组DNA SSR-PCR反应体系为25μL:60ng模板DNA、2.0mmol/L Mg2+、0.1mmol/L dNTP、0.3μmol/L引物、1UTaq酶。并对菊花引物进行梯度退火试验,其最佳退火温度在53.1℃;扩增程序是:95℃预变性5min;32个循环的94℃变性50s、53.1℃退火50s、72℃延伸50s;72℃延伸8min,4℃保存。该体系的建立为今后菊花SSR分析奠定了基础。 展开更多
关键词 菊花 SSR标记 正交设计 反应体系优化
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航天搭载紫花苜蓿SSR-PCR反应体系的优化以及引物的筛选 被引量:9
17
作者 范润钧 陈本建 +2 位作者 邓波 柴小琴 张蕴薇 《草原与草坪》 CAS 2010年第2期22-26,32,共6页
航天育种的变异频率高、变异幅度大、有益变异多、稳定性强,优势明显。依据正交试验设计原理,设计了用正交试验和细调正交试验来确定航天搭载紫花苜蓿SSR-PCR反应体系中各成分的浓度,从dNTP、Taq酶、Pri mers、Mg2+4种因素对航天搭载紫... 航天育种的变异频率高、变异幅度大、有益变异多、稳定性强,优势明显。依据正交试验设计原理,设计了用正交试验和细调正交试验来确定航天搭载紫花苜蓿SSR-PCR反应体系中各成分的浓度,从dNTP、Taq酶、Pri mers、Mg2+4种因素对航天搭载紫花苜蓿SSR-PCR反应体系进行了优化,得到适合航天搭载紫花苜蓿SSR-PCR最佳反应体系,即25μL的反应体系中含有dNTP 0.2 mmol/L、TaqDNA聚合酶2U、引物0.7μmol/L、Mg2+2.5 mmol/L、以及10×buffer和60 ng模板DNA。在试验确定最佳反应体系基础上,对17对SSR引物进行筛选,选出6对扩增条带信号强、背景清晰的引物。 展开更多
关键词 航天搭载紫花苜蓿 SSR标记 正交试验 体系优化 引物
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正交设计优化秋海棠属植物SRAP-PCR反应体系及引物筛选 被引量:3
18
作者 宣继萍 郭忠仁 +1 位作者 徐菲 郑玉红 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第6期1423-1425,共3页
相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymophism,SRAP)是2001年由Li和Quiros开发的一种基于PCR的新型分子标记技术[1]。与RAPD、AFLP、SSR等标记方法相比,SRAP具有简单、高效、高共显性、重复性好、易测序等优点,已经用... 相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymophism,SRAP)是2001年由Li和Quiros开发的一种基于PCR的新型分子标记技术[1]。与RAPD、AFLP、SSR等标记方法相比,SRAP具有简单、高效、高共显性、重复性好、易测序等优点,已经用于许多植物的种子纯度检测、杂种鉴定、遗传多样性分析、指纹图谱及遗传连锁图的构建等[2-8]。 展开更多
关键词 秋海棠属 SRAP标记 正交试验设计 体系优化 引物筛选
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观赏海棠SRAP-PCR反应体系优化及引物筛选 被引量:10
19
作者 楚爱香 汤庚国 《湖北农业科学》 北大核心 2008年第12期1394-1397,共4页
以观赏海棠叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2+、dNTP、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素4个水平,对观赏海棠的SRAP反应体系进行了研究,建立了观赏海棠的SRAP最佳反应体系。结果表明,观赏海棠SRAP-PCR最佳反应体系为:Mg2+2.50 m... 以观赏海棠叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg2+、dNTP、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素4个水平,对观赏海棠的SRAP反应体系进行了研究,建立了观赏海棠的SRAP最佳反应体系。结果表明,观赏海棠SRAP-PCR最佳反应体系为:Mg2+2.50 mmol·L-1、dNTP 0.2 mmol·L-1、引物0.4μmol·L-1、Taq DNA聚合酶2U、10 ng模板DNA,总体积为25μL。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以dNTP浓度的影响最大,模板浓度的影响最小。运用该体系对观赏海棠4个种进行验证,证明该体系稳定可靠,并从70个SRAP引物组合中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的26个引物组合。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为今后利用SRAP标记技术进行观赏海棠的分子遗传学研究提供了科学的依据。 展开更多
关键词 观赏海棠 序列相关扩增多态性分子标记 正交试验设计 体系优化 引物筛选
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利用正交设计优化异色瓢虫SRAP-PCR反应体系 被引量:10
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作者 关桦楠 迟德富 +1 位作者 宇佳 董婧 《昆虫知识》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期156-161,共6页
利用正交设计L16(4^5)对异色瓢虫Harmonia axyridis(Pallas)SRAP-PCR反应体系的5个因素(Taq 酶、Mg^2+、模板DNA、dNTPs、引物)在4个水平上进行优化试验,试验结果用DIS和MINITAB软件进行分析,建立了异色瓢虫SRAP-PCR反应的最... 利用正交设计L16(4^5)对异色瓢虫Harmonia axyridis(Pallas)SRAP-PCR反应体系的5个因素(Taq 酶、Mg^2+、模板DNA、dNTPs、引物)在4个水平上进行优化试验,试验结果用DIS和MINITAB软件进行分析,建立了异色瓢虫SRAP-PCR反应的最佳体系,即在20止体系中模板50—100ng、引物0.25μmol/L、dNTPs 0.1mmol/L、Taq DNA聚合酶1.5U、Mg^2+0.375~0.625mmol/L。并对反应体系进行梯度退火试验,得到最佳退火温度为50.3℃。这一优化系统的建立,为今后利用SRAP技术进行瓢虫遗传图谱的构建、多态性分析和基因定位奠定了技术基础。 展开更多
关键词 异色瓢虫 SRAP 正交设计 分子标记 天敌昆虫
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