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花生AhmTERF1与其同源基因启动子顺式作用元件分析
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作者 李丽梅 李玲 李晓云 《分子植物育种》 北大核心 2025年第14期4592-4598,共7页
四倍体栽培种花生是由二倍体野花生进化而来的。多倍化过程中,多倍体的基因库扩大,同时基因可能产生多种功能。因此,对不同倍性花生的基因进行分析,有利于研究多倍化过程中基因表达调控网络的变化,为花生育种提供理论指导。花生线粒体... 四倍体栽培种花生是由二倍体野花生进化而来的。多倍化过程中,多倍体的基因库扩大,同时基因可能产生多种功能。因此,对不同倍性花生的基因进行分析,有利于研究多倍化过程中基因表达调控网络的变化,为花生育种提供理论指导。花生线粒体转录终止因子AhmTERF1与其二倍体同源基因Aradu.QVX65的CDS序列高度相似,但启动子序列差异大。启动子的差异可能影响基因在不同倍性花生中的表达水平。为了进一步探究二者的启动子差异,本研究采用PLACE数据库进行顺式作用元件预测,与Aradu.QVX65启动子相比,AhmTERF1启动子调控区含有更丰富的顺式作用元件,包括多种组织特异性相关元件和胁迫响应元件。并且AhmTERF1启动子包含一段CT-rich序列。通过构建完整和缺失CT-rich序列的GUS报告载体,发现CT-rich序列可增强AhmTERF1的表达。推测AhmTERF1和Aradu.QVX65启动子序列差异,可能导致了在不同倍性花生中,基因的功能有不同。本研究加深了对花生多倍化过程中序列变化的认识,从分子水平探讨基因表达调控的机制,为基于启动子调控的作物遗传改良提供新思路。 展开更多
关键词 花生 mterf1 启动子 顺式作用元件 CT-rich
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The maize mTERF18 regulates transcriptional termination of the mitochondrial nad6 gene and is essential for kernel development
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作者 Zhengwei Guan Yong Wang Jun Yang 《Journal of Genetics and Genomics》 2025年第3期422-431,共10页
Mitochondria are semi-autonomous organelles present in eukaryotic cells,containing their own genome and transcriptional machinery.However,their functions are intricately linked to proteins encoded by the nuclear genom... Mitochondria are semi-autonomous organelles present in eukaryotic cells,containing their own genome and transcriptional machinery.However,their functions are intricately linked to proteins encoded by the nuclear genome.Mitochondrial transcription termination factors(mTERFs)are nucleic acid-binding proteins involved in RNA splicing and transcription termination within plant mitochondria and chloroplasts.Despite their recognized importance,the specific roles of mTERF proteins in maize remain largely unexplored.Here,we clone and functionally characterize the maize mTERF18 gene.Our findings reveal that mTERF18 mutations lead to severely undifferentiated embryos,resulting in abortive phenotypes.Early kernel exhibits abnormal basal endosperm transfer layer and a significant reduction in both starch and protein accumulation in mterf18.We identify the mTERF18 gene through mapping-based cloning and validate this gene through allelic tests.mTERF18 is widely expressed across various maize tissues and encodes a highly conserved mitochondrial protein.Transcriptome data reveal that mTERF18 mutations disrupt transcriptional termination of the nad6 gene,leading to undetectable levels of Nad6 protein and reduced complex I assembly and activity.Furthermore,transmission electron microscopy observation of mterf18 endosperm uncover severe mitochondrial defects.Collectively,these findings highlight the critical role of mTERF18 in mitochondrial gene transcription termination and its pivotal impact on maize kernel development. 展开更多
关键词 mterf18 MITOCHONDRIA Zea mays Transcriptional termination Kernel development Nad6
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蒺藜状苜蓿中MtERF-6基因的克隆及序列分析 被引量:5
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作者 连瑞丽 李宇伟 赵德刚 《草业科学》 CAS CSCD 2006年第9期82-87,共6页
乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对蒺藜状苜蓿Medicago truncatula测序的数据库进行分析,设计合成引物,通过RT-PCR扩增得到了乙烯反应元件结合蛋白基因(MtERF-6),并测... 乙烯反应元件结合蛋白属于植物特有的一个转录因子家族,这个家族保守的DNA结合域称为ERF结构域。根据对蒺藜状苜蓿Medicago truncatula测序的数据库进行分析,设计合成引物,通过RT-PCR扩增得到了乙烯反应元件结合蛋白基因(MtERF-6),并测定了其核苷酸全序列。该基因完整的读码框包括654 bp,编码218个氨基酸。用此片段的氨基酸序列通过GenBankBLAST分析表明,该基因属于EREBP(Ethylene responsive element binding proteins)家族,其核苷酸与已报道的ERF4[Gossypium hirsu-tum]、ATERF-9[Arabidopsis thaliana]、NtERF3[Nicotiana tabacum]、NsERF3[Nicotiana sylvestris]、CaEREBP-C1[Capsicum annuum]的相似性分别为45%、47%、41%、40%和42%,是新的基因。MtERF-6的核酸序列在GenBank发表,登录号为DQ344024。 展开更多
关键词 蒺藜状苜蓿 乙烯反应元件结合蛋白 mterf-6基因
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线粒体转录终止因子(mTERF)蛋白家族的研究进展 被引量:17
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作者 黄淑颜 丘式浚 +3 位作者 陈家逸 陈健璞 李晓云 李玲 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第5期455-459,共5页
线粒体基因的表达调控与线粒体的功能密切相关。线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factors,mTERFs)具有与线粒体核酸结合的结构域,参与线粒体基因的复制、转录及翻译。由于线粒体基因与人类线粒体疾病密切相... 线粒体基因的表达调控与线粒体的功能密切相关。线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factors,mTERFs)具有与线粒体核酸结合的结构域,参与线粒体基因的复制、转录及翻译。由于线粒体基因与人类线粒体疾病密切相关,因此受到广泛关注。动物中mTERFs分为四类亚家族,均定位于线粒体,每类mTERF蛋白所含mTERF结构域的数量与位置不同,功能各异。相比动物,植物中的mTERF类蛋白的研究相对滞后,为多基因家族。已报导的mTERF蛋白参与植物的发育及胁迫响应,具有重要的生物功能,但仍有很多mTERF家族成员的功能及调控机制仍不清楚。目前有关植物mTERFs的研究,对探讨作物中mTERFs成员功能、提高作物抗性及产量均具有重要意义。 展开更多
关键词 线粒体转录终止因子(mterf) 后生动物 植物
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利用CRISPR/Cas9技术创建OsmTERF家族基因突变体 被引量:1
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作者 韩垚 王忠伟 +3 位作者 杨小艳 唐荣莉 谢树章 吴红 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第18期6062-6067,共6页
植物线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factor,mTERF)在核质基因协调表达的过程中起着关键的作用,影响植物的生长发育和抗逆性。水稻是一种重要的粮食作物和基因组研究的模式植物,应用CRISPR/Cas9技术修饰... 植物线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factor,mTERF)在核质基因协调表达的过程中起着关键的作用,影响植物的生长发育和抗逆性。水稻是一种重要的粮食作物和基因组研究的模式植物,应用CRISPR/Cas9技术修饰水稻的基因,有助于产生具有优良农艺表型的理想突变体植株。针对水稻OsmTERF家族基因,我们在OsmTERF基因外显子区域设计靶位点,成功构建了3个OsmTERF基因(Os06g0225100,Os07g0583200和Os08g0515800)的CRISPR/Cas9基因编辑载体;利用农杆菌介导法转化水稻‘中花11’(ZH11),获得49株T_0代转基因植株;测序T_0代转基因植株,有16株Os06g0225100基因突变单株,8株Os07g0583200基因突变单株,25株Os08g0515800基因突变单株。本研究为水稻育种计划提供了宝贵的资源,为进一步研究水稻中OsmTERF家族基因功能提供了材料和信息。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa) 线粒体转录终止因子(mterf) CRISPR/Cas9
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甘蓝型油菜BnaA06.mTERF1基因的功能及进化分析 被引量:1
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作者 李双 叶姜 +4 位作者 詹杰鹏 朱瑶瑶 危文亮 师家勤 王新发 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期230-239,共10页
在高等植物中,线粒体转录终止因子(mTERF)影响线粒体或叶绿体的基因表达及植物对逆境的反应等生物学过程。为了研究甘蓝型油菜中线粒体转录终止因子1(mTERF1)的功能,本研究以甘蓝型油菜品种中双11号为材料,在A06连锁群上克隆了mTERF1,... 在高等植物中,线粒体转录终止因子(mTERF)影响线粒体或叶绿体的基因表达及植物对逆境的反应等生物学过程。为了研究甘蓝型油菜中线粒体转录终止因子1(mTERF1)的功能,本研究以甘蓝型油菜品种中双11号为材料,在A06连锁群上克隆了mTERF1,该基因编码285个氨基酸,含有5个mTERF功能结构域。利用生物信息学分析筛选到37个甘蓝型油菜mTERF家族蛋白,并进行了系统进化树、基因结构及染色体定位分析。此外,构建甘蓝型油菜BnaA06.mTERF1基因的功能互补表达载体,转化拟南芥mTERF1(soldat10)突变体后,拟南芥的表型恢复到野生型(Ler),说明该基因在油菜和拟南芥中具有保守的功能。本研究填补了油菜中线粒体转录终止因子研究的空白,为进一步探究油菜中线粒体转录终止因子的分子功能奠定了基础。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 mterf1 基因克隆 进化关系
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谷子mTERF基因家族全基因组鉴定与分析 被引量:3
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作者 任雪梅 刘浩瑞 +2 位作者 南力彰 陈晋杰 韩渊怀 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第2期1-11,共11页
[目的]线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factor,mTERF)是由核基因编码调控细胞器基因表达的一类蛋白。本研究从谷子基因组中鉴定了mTERF基因家族成员,为探究该基因家族在谷子生长发育中的生物学功能提供理... [目的]线粒体转录终止因子(mitochondrial transcription termination factor,mTERF)是由核基因编码调控细胞器基因表达的一类蛋白。本研究从谷子基因组中鉴定了mTERF基因家族成员,为探究该基因家族在谷子生长发育中的生物学功能提供理论基础。[方法]通过生物信息学方法分析该家族基因的染色体分布、系统发育进化树、保守结构域及基序、顺式作用元件、基因表达及亚细胞定位。[结果]共鉴定到37个谷子mTERF基因家族成员,在染色体上呈不均匀分布,1号染色体上基因数目最多;37个谷子mTERF蛋白都含有保守的mTERF结构域,绝大多数mTERF蛋白中motif按一定的顺序排列,motif1在每个mTERF蛋白上较其它motif保守;该家族含有光、干旱诱导、醇溶蛋白代谢、细胞周期、昼夜节律、黄酮合成响应的顺式元件以及生长素、赤霉素等多种植物激素响应的顺式元件;谷子、玉米及拟南芥的97个mTERF家族的基因可分为6大类;谷子mTERF基因表达具有组织特异性,其中Si9g06960在叶片的表达量最高;该家族蛋白主要在叶绿体及线粒体中有定位信号。[结论]谷子mTERF基因家族可能影响叶绿体及线粒体的形态发育,对谷子的生长及逆境响应等生物学过程发挥着重要的作用,该研究有助于了解谷子mTERF对谷子生长发育及抗逆等生物学过程的意义,为后续基因的研究提供指导。 展开更多
关键词 谷子 mterf 全基因组 表达分析
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基于ONCOMINE和TCGA数据库分析人MTERF3在子宫颈癌中的表达及预后意义 被引量:10
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作者 梅雯 自加吉 +4 位作者 孙美涛 杨勇琴 张晓娟 余敏 熊伟 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2018年第1期43-47,共5页
为了探讨人线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)在子宫颈癌中的表达及预后意义,检索ONCOMINE数据库中关于人MTERF3的信息,并对目前数据库中资料进行2次分析,对人MTERF3在子宫颈癌中转录水平... 为了探讨人线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)在子宫颈癌中的表达及预后意义,检索ONCOMINE数据库中关于人MTERF3的信息,并对目前数据库中资料进行2次分析,对人MTERF3在子宫颈癌中转录水平的表达进行荟萃分析ONCOMINE数据库中共收集了344个不同类型的研究结果。关于MTERF3表达有统计学差异的研究结果总计20项,其中MTERF3表达显著性增高的研究有19项,表达降低的显著性研究有1项(P<0.05)。数据库中共有10个不同的研究涉及MTERF3在子宫颈癌组织中和正常组织中的表达,包括310例临床样本,与对照组相比,MTERF3在子宫颈癌中高表达,且差异具有统计学意义(P=0.036)。通过c Bioportal工具分析TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中的研究发现,MTERF3高表达的子宫颈癌患者与MTERF3低表达的子宫颈癌患者的总生存率(OS)和无病生存率(DFS)均无显著相关性(P>0.05)。通过数据挖掘,揭示人MTERF3在子宫颈癌组织中高表达,但其表达水平与子宫颈癌的预后无明显关联。 展开更多
关键词 mterf3 子宫颈癌 ONCOMINE 数据库
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人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在Caski宫颈癌细胞的表达和定位 被引量:8
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作者 孙美涛 张成桂 +4 位作者 梅雯 杨勇琴 杨泽芳 张晓娟 熊伟 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期783-788,共6页
目的构建人线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因真核表达载体,并在人Caski宫颈癌细胞中过表达,观察其编码蛋白质在Caski细胞中的定位。方法从Caski细胞中提取总RNA,采用反转录PCR扩增人MTERF2基因可读框序列,将其重组于p3×FLAG-CMV-1... 目的构建人线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因真核表达载体,并在人Caski宫颈癌细胞中过表达,观察其编码蛋白质在Caski细胞中的定位。方法从Caski细胞中提取总RNA,采用反转录PCR扩增人MTERF2基因可读框序列,将其重组于p3×FLAG-CMV-14载体中,利用PCR和DNA测序鉴定重组子正确性;并用脂质体法转染至Caski细胞,转染24、32、48 h,采用Western blot法检测MTERF2蛋白水平,通过免疫荧光细胞化学染色观察其亚细胞定位情况。结果经过PCR和DNA测序鉴定,人MTERF2基因可读框正确地插入到真核表达质粒中,大小为1158 bp,表达的蛋白相对分子质量(Mr)为44 000,与预计大小相符。转染p3×FLAG-MTERF2质粒的Caski细胞培养24 h,可检测到目的蛋白表达,该蛋白主要定位于线粒体中。结论在Caski细胞成功表达了MTERF2蛋白并证实其定位于线粒体。 展开更多
关键词 线粒体转录终止因子2(mterf2) Caski宫颈癌细胞 真核表达 蛋白定位
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基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌的表达及预后意义 被引量:3
10
作者 自加吉 李彬 +4 位作者 王唯斯 孙美涛 梅雯 严长宝 熊伟 《生物技术》 CAS 2018年第5期484-491,共8页
[目的]线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)是线粒体基因复制和转录的负调控因子,但目前尚未见其在肝细胞癌中的系统研究。该研究基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌(hepatocellular carc... [目的]线粒体转录终止因子3(mitochondrial transcription termination factor 3,MTERF3)是线粒体基因复制和转录的负调控因子,但目前尚未见其在肝细胞癌中的系统研究。该研究基于数据挖掘分析MTERF3基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及正常肝组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF3基因对肝细胞癌患者预后的影响。[方法]利用Oncomine数据库分析MTERF3基因mRNA在正常肝组织和肝细胞癌组织中的表达变化。通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)人体正常组织和其相应的肿瘤组织中MTERF3基因的表达差异。通过c Bioportal分析MTERF3基因在肝细胞癌组织中的突变情况。经MethHC数据库分析肝细胞癌和正常肝组织中MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平的差异。利用Onco Lnc数据库对MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者生存率作Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验。在String-DB数据库中探索在线粒体DNA表达调控过程中与MTERF3基因关系密切的相关基因。[结果]与正常肝组织相比,肝细胞癌组织中MTERF3基因在mRNA水平呈显著高表达(P≤0. 05),MTERF3基因DNA启动子区甲基化水平显著降低(P≤0. 05)。肝细胞癌组织中MTERF3基因存在错义突变,导致其编码蛋白质的243位甲硫氨酸突变为缬氨酸(M243V)。MTERF3基因的表达水平与肝细胞癌患者的总生存时间存在相关性(Logrank P≤0. 05),MTERF3基因高表达的肝细胞癌患者总生存时间显著缩短。MFN1、MFN2、VDAC1、ATG12、UBA52、UBB、UBC、PINK1、SQSTM1、RPS27A等基因与MTERF3基因有明显的相互作用。[结论]大样本数据挖掘能迅速地获取肝细胞癌组织中MTERF3基因表达的相关信息,为深入研究MTERF3基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 肝细胞癌 mterf3 数据挖掘 预后
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利用Oncomine和TCGA数据集分析MTERF3在大肠腺癌的表达及预后作用 被引量:7
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作者 梅雯 孙美涛 +4 位作者 王唯斯 张态 柴蓓蓓 张若鹏 熊伟 《齐齐哈尔医学院学报》 2018年第8期869-873,共5页
目的基于数据挖掘探讨人线粒体转录终止因子3在正常肠组织和大肠腺癌中的表达水平,并探讨MTERF3 mRNA表达量与大肠腺癌患者临床病理参数的相关性及其预后作用。方法从Oncomine基因芯片数据库和美国癌症基因组图谱中下载关于大肠腺癌患者... 目的基于数据挖掘探讨人线粒体转录终止因子3在正常肠组织和大肠腺癌中的表达水平,并探讨MTERF3 mRNA表达量与大肠腺癌患者临床病理参数的相关性及其预后作用。方法从Oncomine基因芯片数据库和美国癌症基因组图谱中下载关于大肠腺癌患者MTERF3 mRNA二代测序数据及临床病理资料,使用R 3.3.0软件分析MTERF3表达量与临床病理参数的相关性及其预后价值。结果Oncomine数据库中共收集了344个不同类型的肿瘤研究结果,关于MTERF3表达有统计学差异的研究结果共20项,其中MTERF3高表达的研究有19项,低表达的研究有1项(P<0.05)。数据库中共有7个不同的研究涉及MTERF3在大肠腺癌组织中和正常大肠组织中的表达,与正常肠组织相比,MTERF3在大肠腺癌中呈高表达,且差异具有统计学意义(P=1.56×10^(-23))。分析发现,349例大肠腺癌患者MTERF3表达水平与年龄、性别、肿瘤部位、浸润深度、淋巴转移、远处转移无关(P>0.05),与病理类型相关(P<0.05);Kaplan-Meier分析发现,大肠腺癌患者MTERF3的表达水平与总生存率(OS)和无病生存率(DFS)均无显著相关性(P>0.05)。结论人MTERF3在大肠腺癌组织中高表达,但MTERF3 mRNA表达量与大肠腺癌患者的预后无显著的相关性。 展开更多
关键词 mterf3 大肠腺癌 Oncomine TCGA
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MTERF2在人子宫颈癌细胞株中的表达及对细胞增殖、迁移和侵袭的影响 被引量:4
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作者 李素芬 王唯斯 +4 位作者 孙美涛 梅雯 自加吉 张若鹏 熊伟 《生物技术通讯》 CAS 2019年第4期464-472,共9页
目的:线粒体转录终止因子2(MTERF2)是线粒体类核的重要组成成分,且参与线粒体基因的表达调控。本研究旨在阐明MTERF2基因在体外培养的人类正常子宫颈上皮细胞株和子宫颈癌细胞株中的表达情况,并进一步探讨MTERF2对子宫颈癌HeLa细胞增殖... 目的:线粒体转录终止因子2(MTERF2)是线粒体类核的重要组成成分,且参与线粒体基因的表达调控。本研究旨在阐明MTERF2基因在体外培养的人类正常子宫颈上皮细胞株和子宫颈癌细胞株中的表达情况,并进一步探讨MTERF2对子宫颈癌HeLa细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法:采用qRT-PCR和Western印迹检测正常子宫颈上皮细胞株(End1/E6E7)和子宫颈癌细胞株(HeLa、SiHa、C-33A、C4-1、CaSki)中MTERF2 mRNA及其蛋白质的表达情况;分别构建MTERF2稳定过表达或下调表达的子宫颈癌HeLa细胞株,通过XTT实验、细胞划痕实验、Transwell迁移实验、Transwell侵袭实验、克隆形成实验和流式细胞术等方法观察MTERF2基因过表达或表达下调对子宫颈癌细胞恶性生物学行为的影响。结果:MTERF2蛋白及mRNA在子宫颈癌细胞株中的表达水平均低于正常宫颈上皮细胞株。与对照组相比,稳定过表达MTERF2的子宫颈癌HeLa细胞增殖能力下降,同时子宫颈癌HeLa细胞的克隆形成能力、迁移能力和侵袭能力均显著下降;细胞周期出现G1/S期阻滞,周期蛋白D1和pRb蛋白的表达水平明显下降。下调MTERF2表达的子宫颈癌HeLa细胞的增殖能力、克隆形成能力、迁移能力和侵袭能力均有所增强,且未出现细胞周期阻滞。此外,稳定过表达或下调MTERF2表达对子宫颈癌HeLa细胞凋亡均没有显著影响。结论:MTERF2基因在子宫颈癌细胞株中的表达水平低于正常子宫颈上皮细胞株,且负调控子宫颈癌细胞增殖、迁移和侵袭,提示其可能在子宫颈癌发生发展中发挥类似抑癌基因的作用。 展开更多
关键词 子宫颈癌细胞株 线粒体转录终止因子2(mterf2) 增殖 迁移 侵袭
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基于Oncomine和TCGA数据挖掘分析MTERF2在胰腺癌中的表达及临床意义 被引量:5
13
作者 王唯斯 梅雯 +4 位作者 孙美涛 李彬 张态 张若鹏 熊伟 《生物技术通讯》 CAS 2019年第2期163-169,共7页
目的:探究人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine数据库中的MTERF2信息,对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析;从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载胰腺癌数据集MTERF2 RNA Seq V2... 目的:探究人线粒体转录终止因子2(MTERF2)在胰腺癌中的表达及临床意义。方法:检索Oncomine数据库中的MTERF2信息,对其在胰腺癌组织和正常胰腺组织中的表达进行荟萃分析;从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载胰腺癌数据集MTERF2 RNA Seq V2数据及临床病理资料;利用R 2.15.3软件分析MTERF2表达量与临床病理参数的相关性及预后;利用Kaplan-Meier生存函数分析MTERF2表达量和胰腺癌患者预后的关联。结果:Oncomine数据库中共收集了586个不同类型的研究结果,其中关于MTERF2表达有统计学差异的研究有58个,MTERF2表达增高的研究有26个,表达减低的研究有32个。共有9项研究涉及MTERF2在胰腺癌组织和正常组织中的表达,包括226例临床样本,与对照组相比,MTERF2在胰腺癌中低表达(P=7.34×10-6)。TCGA胰腺癌数据集中共收集179例具有临床病理参数的病例及其对应的MTERF2 mRNA表达量。剔除病理参数不详或不完整的病例,利用R 2.15.3软件分析发现,MTERF2 mRNA表达量与胰腺癌患者T分期、M分期、癌症类型及原发部位存在显著相关(均P<0.05),而与患者的年龄、性别、N分期、AJCC病理分期、等级、组织学类型及饮酒史无显著相关(均P>0.05)。Kaplan-Meier生存分析发现,胰腺癌患者MTERF2的表达水平与总生存率(OS)无显著相关性(P>0.05),而与无病生存率(DFS)显著相关(P<0.001)。结论:Oncomine和TCGA数据挖掘显示,人MTERF2在胰腺癌组织中低表达,且MTERF2表达量与胰腺癌患者总生存率无显著相关性,与无病生存率有显著相关性。 展开更多
关键词 线粒体转录终止因子2(mterf2) 胰腺癌 Oncomine数据库 癌症基因组图谱(TCGA) 数据挖掘
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利用TCGA数据集分析人MTERF3基因在子宫颈癌的表达及意义 被引量:2
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作者 梅雯 王唯斯 +4 位作者 孙美涛 张态 柴蓓蓓 张若鹏 熊伟 《大理大学学报》 CAS 2019年第2期38-43,共6页
目的:基于TCGA数据集探讨人MTERF3基因mRNA在子宫颈癌的表达及其临床价值。方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载关于子宫颈癌患者MTERF3 mRNA二代测序数据及临床病理资料。基因表达谱动态分析(GEPIA)正常宫颈组织和宫颈癌组织中MTERF... 目的:基于TCGA数据集探讨人MTERF3基因mRNA在子宫颈癌的表达及其临床价值。方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载关于子宫颈癌患者MTERF3 mRNA二代测序数据及临床病理资料。基因表达谱动态分析(GEPIA)正常宫颈组织和宫颈癌组织中MTERF3 mRNA表达差异。使用R 3.3.0软件分析MTERF3 mRNA表达量与临床病理参数的相关性;使用生存分析和Log-rank P检验。结果:与正常宫颈组织相比,子宫颈癌组织中MTERF3 mRNA呈现高表达。子宫颈癌患者MTERF3 mRNA表达量与年龄、T分期、N分期、M分期差异均无统计学意义(P>0.05);而与AJCC临床分期、病理分级差异有统计学意义(P<0.05);Kaplan-Meier生存分析显示,MTERF3 mRNA0.05);单因素分析显示,T分期、N分期、M分期、临床分期均能影响患者的预后(P<0.05),年龄、病理分级、病理类型、MTERF3mRNA表达与子宫颈癌患者预后无相关性(P>0.05);COX多因素回归分析显示,N分期是影响子宫颈癌患者预后的独立因素(P<0.05)。结论:人MTERF3 mRNA表达量与子宫颈癌患者AJCC临床分期和病理分级有显著相关性,提示MTERF3基因可能参与子宫颈癌发展的病理进程;MTERF3 mRNA表达量与子宫颈癌患者的预后无显著相关性。 展开更多
关键词 TCGA数据集 mterf3 子宫颈癌
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人MTERF4基因启动子的生物信息学研究
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作者 熊伟 杨勇琴 +3 位作者 余敏 孙美涛 左绍远 张海洋 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第6期510-515,共6页
人线粒体转录终止因子4(mitochondrial transcription termination factor 4,MTERF4)基因属于线粒体转录终止因子基因超家族,其编码的蛋白质是调控线粒体核糖体生物合成和线粒体蛋白质翻译的重要因子。目前,MTERF4基因自身的表达调控... 人线粒体转录终止因子4(mitochondrial transcription termination factor 4,MTERF4)基因属于线粒体转录终止因子基因超家族,其编码的蛋白质是调控线粒体核糖体生物合成和线粒体蛋白质翻译的重要因子。目前,MTERF4基因自身的表达调控机制仍不清楚。为了探讨人MTERF4基因启动子区的序列特征和基因转录调控机制,采用进化足迹法,利用生物信息学在线软件对人MTERF4基因上游5'端的启动子分布、转录因子及其结合位点、CpG岛进行分析。结果表明,人MTERF4基因上游5'端3 000 bp的核苷酸序列至少存在3个启动子,其中1 799-2 368 bp之间可能包含核心启动子。启动子区序列中存在1个长为558 bp的CpG岛。人和小鼠MTERF4同源基因的启动子区有1个保守区域,存在18个共有的转录因子结合位点。通过生物信息学软件分析人MTERF4基因启动子,提高了针对该基因启动子的研究效率,为后续实验深入研究启动子的功能奠定了重要的理论基础。 展开更多
关键词 线粒体转录终止因子4基因(mterf4) 启动子 CPG岛 转录因子 生物信息学
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基于数据挖掘分析MTERF2基因在子宫内膜癌的表达及意义 被引量:2
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作者 李彬 自加吉 +4 位作者 孙美涛 王唯斯 张若鹏 严长宝 熊伟 《生物技术通讯》 CAS 2018年第5期629-635,共7页
目的:基于数据挖掘分析线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因在子宫内膜癌及正常子宫内膜组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF2对子宫内膜癌患者预后的影响。方法:利用Oncomine数据库分析MTERF2基因DNA拷贝数在子宫内膜癌组织中的变化;利用c... 目的:基于数据挖掘分析线粒体转录终止因子2(MTERF2)基因在子宫内膜癌及正常子宫内膜组织中的表达情况,并进一步探讨MTERF2对子宫内膜癌患者预后的影响。方法:利用Oncomine数据库分析MTERF2基因DNA拷贝数在子宫内膜癌组织中的变化;利用cBioportal分析MTERF2基因在子宫内膜癌组织中的突变情况;通过基因表达谱动态分析(GEPIA)探讨人体正常组织及其相应的肿瘤组织中MTERF2基因的表达差异;经MethHC分析子宫内膜癌和正常子宫内膜组织中MTERF2基因DNA启动子区甲基化水平的差异;利用OncoLnc对MTERF2基因的表达水平与子宫内膜癌患者生存率做Kaplan-Meier生存分析和Log-Rank检验;在String-DB数据库中探索MTERF2基因在线粒体DNA表达调控过程中关系密切的相关基因。结果:与正常子宫内膜组织相比,子宫内膜癌组织中MTERF2基因DNA拷贝数无明显变化(P>0.05),在mRNA水平呈显著低表达(P<0.05),DNA启动子区甲基化水平显著降低(P<0.005);MTERF2基因的表达水平与子宫内膜癌患者的总体生存时间无显著相关性(Log-Rank P>0.05);TFB1M、TFB2M、POLMT、MTERFD1、MTERFD2、PTCD1、SSBP1、COA3、HDGFRP3等基因与MTERF2基因关系密切,可能存在相互作用。结论:大样本数据挖掘能迅速获取子宫内膜癌组织中MTERF2基因表达的相关信息,为深入探究MTERF2基因在子宫内膜癌发生发展中的作用机制及其预后价值奠定基础。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 线粒体转录终止因子2(mterf2) 数据挖掘
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mTERF基因及其作用研究进展 被引量:1
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作者 刘小林 涂玉莲 陈纪鹏 《湖南农业科学》 2016年第5期125-128,共4页
线粒体转录终止因子mTERF是一类由核基因编码且高度保守的线粒体DNA结合单体蛋白质,对线粒体、叶绿体功能的调控、生物进化、基因诊断与治疗具有重要作用。从mTERF基因与线粒体和叶绿体的关系、mTERF基因的种类和结构和mTERF基因的作用... 线粒体转录终止因子mTERF是一类由核基因编码且高度保守的线粒体DNA结合单体蛋白质,对线粒体、叶绿体功能的调控、生物进化、基因诊断与治疗具有重要作用。从mTERF基因与线粒体和叶绿体的关系、mTERF基因的种类和结构和mTERF基因的作用3个方面综述了动植物中mTERF基因的研究进展。 展开更多
关键词 基因 线粒体转录终止因子 线粒体 叶绿体 功能 综述
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MTERF3过表达对脑胶质瘤U251细胞线粒体基因表达及细胞增殖和迁移的影响 被引量:6
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作者 孙美涛 梅雯 +4 位作者 王唯斯 李素芬 自加吉 张晓娟 熊伟 《实用医药杂志》 2019年第5期454-459,共6页
目的探讨MTERF3基因过表达对脑胶质瘤U251细胞线粒体基因表达及细胞增殖和迁移的影响。方法以U251细胞作为实验对象,构建MTERF3过表达的U251细胞稳定转染株。实验分为3组:空白对照组(无转染的野生型U251细胞)、阴性对照组(转染EGFP-Fla... 目的探讨MTERF3基因过表达对脑胶质瘤U251细胞线粒体基因表达及细胞增殖和迁移的影响。方法以U251细胞作为实验对象,构建MTERF3过表达的U251细胞稳定转染株。实验分为3组:空白对照组(无转染的野生型U251细胞)、阴性对照组(转染EGFP-Flag质粒的U251细胞)、实验组(转染MTERF3-Flag质粒的U251细胞)。采用半定量PCR和Western blot分别检测MTERF3过表达对U251细胞线粒体DNA拷贝量及线粒体编码蛋白的表达水平的影响;采用流式细胞术和XTT法分别检测MTERF3过表达对U251细胞周期及细胞增殖的影响;采用细胞划痕和Transwell小室迁移实验检测U251细胞迁移能力的变化。结果半定量PCR结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达显著抑制U251细胞线粒体DNA的拷贝量(P<0.05);Western blot结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达显著降低线粒体DNA编码ND1、ND6和CYB蛋白表达水平(P<0.05);XTT结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达明显促进U251细胞的增殖(P<0.05);流式细胞术结果显示,与对照组比较,MTERF3过表达能促进U251细胞G1/S转换,未出现细胞周期阻滞和细胞凋亡。Transwell小室迁移实验结果显示,实验组在每个视野下迁移的细胞数[(435.00±42.26)个]显著多于空白对照组[(259.00±30.22)个]和阴性对照组[(252.00±27.58)个],组间差异极显著(P<0.01)。结论 MTERF3过表达对人脑胶质瘤U251细胞的线粒体DNA拷贝量和线粒体蛋白质表达有负调控作用,且上调U251细胞MTERF3的表达使细胞增殖和迁移能力显著提高,并且未出现细胞周期阻滞和细胞凋亡。 展开更多
关键词 脑胶质瘤 U251细胞 mterf3 细胞增殖 细胞迁移
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Genome-Wide Identification and Characterisation of Abiotic Stress Responsive mTERF Gene Family in Amaranthus hypochondriacus
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作者 Mortaza Hajyzadeh 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2023年第5期1649-1664,共16页
Abiotic stresses at different growth stages in the life of plants negatively affect yield productivity.Therefore,plants,including Amaranthus hypochondriacus,develop adaptive strategies to face the stresses and expand ... Abiotic stresses at different growth stages in the life of plants negatively affect yield productivity.Therefore,plants,including Amaranthus hypochondriacus,develop adaptive strategies to face the stresses and expand functional diversification.In plants,the mitochondrial transcription termination factors(mTERF)are essential functions in regulation,and organelles(mitochondria and chloroplasts)control gene expression(OGE)under several stress conditions.Based on the in-silico-wide genome and transcriptome analysis,twenty-four mTERF genes were detected in the main targeted mitochondria organelles clustered into three different main groups.The chromosomal location and gene duplication analysis indicated one segmental and one tandem duplication in the genome.The promoter region cis-elements assessment showed that there wasa high correlation between the growth and development process,stress,and hormone responses of these genes.Expression profiling of mTERF genes under salt stress revealed a total number of 24 gene families with seven upregulated and 6 down-regulated genes in drought and salt stress.However,Ah-mTERF-8 and 14 indicated up-regulation under drought stress.Ah-mTERF-4,6,14,15,17,and 20 were up-regulated under salt stress.Molecular characterization and identification through the in-silico study of the specific genes and their differential expression profiling demonstrated the role of mTERF proteins throughout their reaction to growth and development,during stress in A.hypochondriacus.These results demonstrated that mTERF genes were significantly related to the abiotic stress responses. 展开更多
关键词 Genus Amaranthus mterf protein MITOCHONDRIA RNA-seq TRANSCRIPTION salt and drought stress
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人MTERF3基因启动子的克隆及其荧光素酶报告基因载体的构建
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作者 张晓娟 孙美涛 +3 位作者 梅雯 自加吉 杨勇琴 熊伟 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2017年第1期40-44,共5页
人MTERF3基因编码线粒体基因转录和能量代谢的负调控因子。采用PCR技术对人MTERF3基因5'侧翼上游1251 bp启动子序列进行扩增,并将其克隆至荧光素酶表达载体p GL6-TA,构建人MTERF3基因启动子荧光素酶报告基因质粒。经酶切、测序鉴定... 人MTERF3基因编码线粒体基因转录和能量代谢的负调控因子。采用PCR技术对人MTERF3基因5'侧翼上游1251 bp启动子序列进行扩增,并将其克隆至荧光素酶表达载体p GL6-TA,构建人MTERF3基因启动子荧光素酶报告基因质粒。经酶切、测序鉴定后,将其用脂质体转染体外培养的HEK293细胞株,利用双荧光素酶测定系统检测其表达活性。研究结果表明,克隆获得的1251 bp DNA序列与Gen Bank报道的一致,且插入方向正确。含人MTERF3基因启动子的报告基因荧光素酶的表达活性显著提高(P<0.05),约为对照组(空载体p GL6-TA)的9.8倍。本研究通过对人MTERF3基因启动子的克隆及其荧光素酶表达载体构建与表达活性的测定,为进一步阐明人MTERF3基因表达的调控机制奠定实验基础。 展开更多
关键词 mterf3 启动子 报告基因 荧光素酶 载体
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