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Retraction: Inhibition of Liver Carcinoma Cell Invasion and Metastasis by Knockdown of Cullin7 In Vitro and In Vivo
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作者 Oncology Research Editorial Office 《Oncology Research》 2025年第8期2179-2179,共1页
Published:18 July 2025 The published article titled“Inhibition of Liver Carcinoma Cell Invasion and Metastasis by Knockdown of Cullin7 In Vitro and In Vivo”has been retracted from Oncology Research,Vol.23,No.4,2015,... Published:18 July 2025 The published article titled“Inhibition of Liver Carcinoma Cell Invasion and Metastasis by Knockdown of Cullin7 In Vitro and In Vivo”has been retracted from Oncology Research,Vol.23,No.4,2015,pp.171–181.DOI:10.3727/096504016X14519995067562 URL:https://www.techscience.com/or/v23n4/57554 Following the publication,concerns have been raised about a number of figures in this article.An unexpected area of similarity was identified in terms of the cellular data,where the results from differently performed experiments were intended to have been shown,although the areas immediately surrounding this area featured comparatively different distributions of cells.In addition,the western blots in this article were presented with atypical,unusually shaped and possibly anomalous protein bands in many cases. 展开更多
关键词 cellular datawhere liver carcinoma cell cell invasion CULLIN liver carcinoma knockdown cullin metastasis RETRACTION
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Knockdown resistance associated organochlorine resistance in mosquito-borne diseases(Anopheles culicifacies):A systematic review
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作者 Ebrahim Abbasi Salman Daliri +3 位作者 Shokrollah Mohseni Aman Allah Zamani Noorbakhsh Alivand Mohammad Djaefar Moemenbellah-Fard 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 2025年第1期3-9,共7页
Objective:To investigate the prevalence,mechanisms,and trends of knockdown resistance(kdr)in Anopheles(An.)culicifacies and its impact on the efficacy of organochlorine and other insecticides.Methods:A systematic revi... Objective:To investigate the prevalence,mechanisms,and trends of knockdown resistance(kdr)in Anopheles(An.)culicifacies and its impact on the efficacy of organochlorine and other insecticides.Methods:A systematic review was conducted based on PRISMA guidelines,extracting data from biooan.org,Embase,ProQuest,PubMed,Scopus,and Web of Science without a time limit until the end of 2022.Articles meeting the inclusion criteria were assessed using the STROBE checklist.Data on kdr mutations,insecticide resistance,and effectiveness were analyzed across eight selected studies from various regions.Results:The review revealed widespread kdr-mediated resistance in An.culicifacies,primarily against dichloro-diphenyl-trichloroethane(DDT),persisting even decades after discontinued use.Key kdr mutations,including L1014F and L1014S,were identified.Resistance to deltamethrin was less stable,with increased sensitivity observed after short-term discontinuation.The findings underscore the vector's sustained resistance to organochlorine insecticides and relative sensitivity to pyrethroids.Conclusions:Stable kdr resistance in An.culicifacies to organochlorine insecticides highlights the need for periodic susceptibility assessments and strategic rotation or combination of insecticides to combat malaria effectively and prevent the development of resistance. 展开更多
关键词 knockdown resistance(kdr) ORGANOCHLORINE Mosquito-borne diseases Anopheles culicifacies Systematic review
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Establishing Programmable CRISPR/Cas13b-Mediated Knockdown System in Rice
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作者 WANG Shuman ZHANG Linqi +4 位作者 GAO Ruiren WEI Guangbo DONG Weiguo XU Jiming WANG Zhiye 《Rice science》 2025年第2期217-227,I0043-I0046,共15页
CRISPR-Cas endonucleases mediate prokaryotic adaptive immunity by targeting foreign nucleic acids.CRISPR/Cas13b is a class 2 type VI-B ribonuclease that targets and cleaves single-stranded RNA.It exhibits higher RNA i... CRISPR-Cas endonucleases mediate prokaryotic adaptive immunity by targeting foreign nucleic acids.CRISPR/Cas13b is a class 2 type VI-B ribonuclease that targets and cleaves single-stranded RNA.It exhibits higher RNA interference activity than Cas13a and Cas13c and causes fewer collateral effects than RxCas13d in mammalian cells.However,a programmable CRISPR/Cas13b-mediated RNA interference system for endogenous transcripts in rice has not yet been established.Here,we developed a CRISPR/Cas13b-mediated system to target endogenous transcripts in rice.Our CRISPR/Cas13b system could inhibit multiple endogenous mRNAs simultaneously.In addition,this system efficiently repressed endogenous long noncoding RNAs with more than 50% inhibition in stable transgenic plants.Furthermore,we found only weak collateral effects of the CRISPR/Cas13b-mediated system at the transcriptome-wide level,and no difference in the agronomic traits of stable transgenic rice in the field.We present a programmable CRISPR/Cas13b-mediated knockdown system for rice,offering a potential biotechnological tool for functional genomics and crop improvement. 展开更多
关键词 CRISPR/Cas13b RNA knockdown system RICE collateral effect inorganic phosphate starvation
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Sm-like 5 knockdown inhibits proliferation and promotes apoptosis of colon cancer cells by upregulating p53,CDKN1A and TNFRSF10B
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作者 Cai-Jing Mo Xiao-Yuan Deng +3 位作者 Ru-Lan Ma Kun Zhu Lei Shi Kang Li 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2024年第6期2716-2726,共11页
BACKGROUND The role of Sm-like 5(LSM5)in colon cancer has not been determined.In this study,we investigated the role of LSM5 in progression of colon cancer and the potential underlying mechanism involved.AIM To determ... BACKGROUND The role of Sm-like 5(LSM5)in colon cancer has not been determined.In this study,we investigated the role of LSM5 in progression of colon cancer and the potential underlying mechanism involved.AIM To determine the role of LSM5 in the progression of colon cancer and the potential underlying mechanism involved.METHODS The Gene Expression Profiling Interactive Analysis database and the Human Protein Atlas website were used for LSM5 expression analysis and prognosis analysis.Real-time quantitative polymerase chain reaction and Western blotting were utilized to detect the expression of mRNAs and proteins.A lentivirus targeting LSM5 was constructed and transfected into colon cancer cells to silence LSM5 expression.Proliferation and apoptosis assays were also conducted to evaluate the growth of the colon cancer cells.Human GeneChip assay and bioinformatics analysis were performed to identify the potential underlying mechanism of LSM5 in colon cancer.RESULTS LSM5 was highly expressed in tumor tissue and colon cancer cells.A high expression level of LSM5 was related to poor prognosis in patients with colon cancer.Knockdown of LSM5 suppressed proliferation and promoted apoptosis in colon cancer cells.Silencing of LSM5 also facilitates the expression of p53,cyclin-dependent kinase inhibitor 1A(CDKN1A)and tumor necrosis factor receptor superfamily 10B(TNFRSF10B).The inhibitory effect of LSM5 knockdown on the growth of colon cancer cells was associated with the upregulation of p53,CDKN1A and TNFRSF10B.CONCLUSION LSM5 knockdown inhibited the proliferation and facilitated the apoptosis of colon cancer cells by upregulating p53,CDKN1A and TNFRSF10B. 展开更多
关键词 Sm-like 5 Colon cancer PROLIFERATION Apoptosis knockdown
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辽宁省白纹伊蚊对3种拟除虫菊酯类杀虫剂的抗药性及其击倒抗性基因型分布研究 被引量:1
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作者 王纯玉 赵春春 +2 位作者 邢俊 李华锋 丁俊 《中国媒介生物学及控制杂志》 2025年第1期22-27,共6页
目的了解辽宁省白纹伊蚊对3种拟除虫菊酯类杀虫剂的抗药性水平及其击倒抗性基因型分布特点,为该地区防控白纹伊蚊及规范使用杀虫剂提供科学依据。方法2023年7-8月,在辽宁省大连和营口市白纹伊蚊孳生地采集蚊虫,经形态学方法鉴定为白纹... 目的了解辽宁省白纹伊蚊对3种拟除虫菊酯类杀虫剂的抗药性水平及其击倒抗性基因型分布特点,为该地区防控白纹伊蚊及规范使用杀虫剂提供科学依据。方法2023年7-8月,在辽宁省大连和营口市白纹伊蚊孳生地采集蚊虫,经形态学方法鉴定为白纹伊蚊后,采用成蚊接触筒法测定其对氯菊酯、溴氰菊酯和高效氯氰菊酯的抗药性。提取单只蚊虫的基因组DNA,PCR扩增电压门控钠离子通道(VGSC)基因部分片段,测序后对白纹伊蚊击倒抗性基因突变情况进行描述性统计分析。结果大连地区白纹伊蚊成蚊对氯菊酯、溴氰菊酯、高效氯氰菊酯为可能抗性种群。营口地区白纹伊蚊成蚊对氯菊酯、溴氰菊酯、高效氯氰菊酯均已产生抗性。共检测2个野外种群110只白纹伊蚊,获得220条基因序列,长度约为400 bp,白纹伊蚊在1016、1532和1534位点均检测到突变。1016位点有2种等位基因,分别为野生型GTA/V(82.73%)和突变型GGA/G(17.27%);有3种基因型,分别为野生型纯合子V/V(68.18%)、野生/突变型杂合子V/G(29.09%)和突变型纯合子G/G(2.73%)。1532位点有2种等位基因,分别为野生型ATC/I(86.82%)和突变型ACC/T(13.18%);有3种基因型,分别为野生型纯合子I/I(76.36%)、野生/突变型杂合子I/T(20.91%)和突变型纯合子T/T(2.73%)。1534位点有4种等位基因,分别为野生型TTC/F(50.46%)、突变型TCC/S(23.64%)、突变型TGC/C(15.45%)和突变型CTC/L(10.45%);有8种基因型,分别为野生型纯合子F/F(24.55%)、野生/突变型杂合子F/S(24.55%)、F/C(11.82%)和F/L(15.45%),突变型纯合子S/S(9.09%)、C/C(7.27%)和L/L(2.73%),突变型杂合子S/C(4.54%)。结论辽宁省大连地区白纹伊蚊成蚊对3种拟除虫菊酯类杀虫剂为可能抗性种群,营口地区白纹伊蚊成蚊为抗性种群,大连和营口市白纹伊蚊均发生击倒抗性基因突变,其中1534位点突变率高且突变情况复杂多样,应持续关注白纹伊蚊抗药性水平,减少拟除虫菊酯类杀虫剂的使用,以延缓杀虫剂抗药性产生和发展。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 抗药性 击倒抗性 突变 辽宁省
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高温需求因子A2在神经毒素诱导的线粒体未折叠蛋白反应中的作用
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作者 陈枝挺 付青贤 +1 位作者 陈丽娜 叶钦勇 《中国神经精神疾病杂志》 北大核心 2025年第7期413-419,共7页
目的探讨高温需求因子A2(high-temperature requirement factor A2,HTRA2)在神经毒素1-甲基-4-苯基吡啶(1-methyl-4-phenylpyridinium,MPP^(+))诱导的线粒体未折叠蛋白反应(mitochondrial unfolded protein response,mtUPR)模型中的作... 目的探讨高温需求因子A2(high-temperature requirement factor A2,HTRA2)在神经毒素1-甲基-4-苯基吡啶(1-methyl-4-phenylpyridinium,MPP^(+))诱导的线粒体未折叠蛋白反应(mitochondrial unfolded protein response,mtUPR)模型中的作用及其他蛋白酶的代偿作用。方法采用MPP^(+)干预SH-SY5Y细胞,构建mtUPR细胞模型,采用Cell Counting Kit-8(CCK-8)法检测细胞存活率,透射电镜观察线粒体的形态变化,荧光显微镜观察细胞内活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平,免疫印迹(Western blot,WB)检测转录因子C/EBP同源蛋白(C/EBP homologous protein,CHOP)、热休克蛋白E1(homo sapiens heat shock protein family E member 1)、蛋白酶YME1样三磷酸腺苷酶(YME1 like 1 ATPase,YME1L1)、酪蛋白水解线粒体基质肽酶蛋白水解亚基(caseinolytic mitochondrial matrix peptidase proteolytic subunit,CLPP)和线粒体离子肽酶1(lon peptidase 1,mitochondrial,LONP1)的表达。慢病毒敲减(knock down,KD)SH-SY5Y细胞的HTRA2基因,实时荧光定量PCR法和WB法分别检测HTRA2的mRNA和蛋白的表达。用400μmol/L MPP^(+)诱导HTRA2-KD的SH-SY5Y细胞的mtUPR反应,CCK-8法检测细胞存活率改变,WB检测HTRA2、YME1L1、CLPP和LONP的表达改变。结果400μmol/L MPP^(+)干预SH-SY5Y细胞24 h构建了mtUPR细胞模型,SH-SY5Y细胞生存率与对照组相比无明显改变,透射电子显微镜下mtUPR组的线粒体嵴及大小未发生明显变化,mtUPR组的ROS平均荧光强度是PBS组的(1.25±0.08)倍,差别有统计学意义(P=0.001),mtUPR组的CHOP、HSPE1、HTRA2、CLPP和LONP的表达水平较对照组明显升高,分别为对照组的(2.68±0.94)倍、(2.83±0.89)倍、(1.67±0.20)倍、(1.65±0.28)倍和(1.66±0.13)倍,差别有统计学意义(均P<0.05),mtUPR组的YME1L1表达水平为对照组的(1.28±0.27)倍,差异无统计学意义(P>0.05)。慢病毒敲减SH-SY5Y细胞的HTRA2基因后,CLPP、YME1L1和LONP1的表达水平升高,分别为空病毒组的(1.46±0.79)倍、(1.41±0.12)倍和(1.32±0.25)倍(均P<0.05)。敲减SH-SY5Y细胞的HTRA2基因再予400μmol/L MPP^(+)干预SH-SY5Y细胞24 h,HTRA2组的SH-SY5Y细胞生存率下降为空病毒组88.4%±6.1%(P<0.001)。HTRA2组的YME1L1和LONP1的表达水平与空病毒组比较无明显改变(均P>0.05),CLPP表达空病毒组的(1.88±0.62)倍,差别有统计学意义(P=0.033)。结论HTRA2是MPP^(+)诱导mtUPR反应的重要的线粒体蛋白酶,其他线粒体蛋白酶有部分代偿HTRA2的作用。 展开更多
关键词 高温需求因子A2 线粒体未折叠蛋白反应 帕金森病 1-甲基-4-苯基吡啶离子 基因敲减技术
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我国3个登革热高风险地区白纹伊蚊电压门控钠离子通道基因突变调查 被引量:1
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作者 曹英志 葛文君 +9 位作者 张亚军 赵春春 伦辛畅 栗冬梅 刘小波 梁莹 宋秀平 鲁亮 刘起勇 孟凤霞 《中国媒介生物学及控制杂志》 2025年第3期402-407,共6页
目的通过检测我国登革热高风险地区白纹伊蚊野外种群电压门控钠离子通道(VGSC)基因的基因型及分布特点,了解白纹伊蚊击倒抗性(kdr)情况,为科学防控登革热提供依据。方法2022年4-10月,在福建省福州市、云南省景洪市、广东省广州市3地采... 目的通过检测我国登革热高风险地区白纹伊蚊野外种群电压门控钠离子通道(VGSC)基因的基因型及分布特点,了解白纹伊蚊击倒抗性(kdr)情况,为科学防控登革热提供依据。方法2022年4-10月,在福建省福州市、云南省景洪市、广东省广州市3地采集伊蚊幼蚊,于实验室集中饲养,羽化后经形态学鉴定为白纹伊蚊,单只提取白纹伊蚊基因组DNA,PCR扩增VGSC基因部分片段并测序,对白纹伊蚊kdr突变情况进行描述性统计分析。结果共测定540只白纹伊蚊的VGSC基因片段,在V1016位点存在2种等位基因,分别为野生型GTA/V(724,67.04%)和突变型GGA/G(356,32.96%),V1016G突变在3个登革热高风险区均有检出,突变型等位基因频率为18.41%~68.91%;共检测到3种基因型,以野生型纯合子V/V为主(288,53.33%),野生型/突变型杂合子V/G次之(148,27.41%),突变型纯合子G/G最少(104,19.26%)基因突变频率为31.19%~84.62%。F1534位点存在4种等位基因,分别为野生型TTC/F(401,37.13%)、突变型TCC/S(399,36.94%)、突变型TGC/C(273,25.28%)、突变型TTG/L(7,0.65%),突变型等位基因频率为29.81%~77.48%;检测出7种基因型,分别为野生型纯合子F/F(109,20.19%),野生型/突变型杂合子F/S(117,21.67%)、F/C(59,10.92%)和F/L(7,1.30%)、突变型杂合子S/C(126,23.33%)、突变型纯合子S/S(78,14.44%)和C/C(44,8.15%),基因突变频率为49.36%~94.56%。共检测到19种基因型组合,其中V/V+S/C基因型组合所占比例最高(119,22.04%)。结论3个登革热高风险区kdr突变频率较高,以V1016G、F1534S突变类型为主,应科学合理使用杀虫剂,从而延缓抗药性发展。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 登革热 击倒抗性 杀虫剂抗药性 拟除虫菊酯类杀虫剂
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贵州省兴义市致倦库蚊对拟除虫菊酯类杀虫剂的抗性机制研究
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作者 孔雪雪 王丹 +4 位作者 周敬祝 管毓威 罗小龙 胡勇 梁文琴 《中国热带医学》 北大核心 2025年第3期323-327,共5页
目的 了解贵州省兴义市致倦库蚊成蚊对3种常用拟除虫菊酯类杀虫剂的抗性水平,并检测代谢解毒酶活性变化及击倒抗性(kdr)基因突变情况,为当地致倦库蚊防制提供科学依据。方法 2024年在兴义市不同方位采集致倦库蚊幼虫,带回实验室饲养至成... 目的 了解贵州省兴义市致倦库蚊成蚊对3种常用拟除虫菊酯类杀虫剂的抗性水平,并检测代谢解毒酶活性变化及击倒抗性(kdr)基因突变情况,为当地致倦库蚊防制提供科学依据。方法 2024年在兴义市不同方位采集致倦库蚊幼虫,带回实验室饲养至成蚊,采用成蚊接触筒法测定其对拟除虫菊酯类杀虫剂抗药性。对抗药性测试后存活的试虫(抗性种群)为样本,采用酶标仪检测其多功能氧化酶(MFO)、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)和非特异性酯酶(NSE)活性以及提取单只致倦库蚊成蚊基因组DNA,采用普通PCR扩增电压门控钠离子通道(VGSC)基因片段并测序,分析kdr基因突变情况。结果 兴义市致倦库蚊成蚊接触0.25%氯菊酯、0.025%溴氰菊酯和0.025%高效氯氰菊酯药膜24 h的死亡率分别为1.00%、0%和0.88%,均表现为抗性。抗氯菊酯种群MFO活力为正态分布,抗溴氰菊酯和高效氯氰菊酯种群MFO活力为偏态分布,3个种群的RR分别为1.17、1.03和1.07倍,野外种群MFO酶活力与敏感品系差异无统计学意义(P均>0.05);抗氯菊酯和高效氯氰菊酯野外种群的GST活力比敏感品系高,为敏感品系的1.06和1.45倍(P<0.05)。抗拟除虫菊酯类杀虫剂致倦库蚊成蚊的VGSC基因片段测序显示在1014位点存在突变,有2种等位基因,即野生型TTA(L)(1.26%)和突变型TTT(F)(98.74%);有2种基因型,即野生/突变型杂合子L/F(2.52%)和突变型纯合子F/F(97.48%)。3种抗拟除虫菊酯类杀虫剂致倦库蚊种群之间的抗性基因突变频率并无统计学意义(P>0.05)。结论 兴义市致倦库蚊成蚊对3种常用拟除虫菊酯类杀虫剂均已产生抗性,代谢解毒酶活性发生变化,且kdr基因发生突变。建议加强蚊媒抗药性监测,开展以清除孳生地为核心的环境治理工作,减少拟除虫菊酯类杀虫剂使用,考虑轮换使用其他类型的杀虫剂,以延缓其抗药性的发展。 展开更多
关键词 致倦库蚊 抗药性 代谢酶 击倒抗性基因 兴义市
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三疣梭子蟹PtRab2A的特征及其在血淋巴组织中响应副溶血弧菌感染的DNA甲基化研究
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作者 周现法 孙东方 +3 位作者 吕建建 刘萍 王学忠 高保全 《渔业科学进展》 北大核心 2025年第5期223-233,共11页
为探究DNA甲基化在三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)感染中的表观遗传调控机制,对三疣梭子蟹PtRab2A进行了基因结构、相似性、系统进化、组织表达以及血淋巴组织在副溶血弧菌感染过程中不同时... 为探究DNA甲基化在三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)感染中的表观遗传调控机制,对三疣梭子蟹PtRab2A进行了基因结构、相似性、系统进化、组织表达以及血淋巴组织在副溶血弧菌感染过程中不同时间点的基因表达水平和DNA甲基化模式进行了研究。结果显示,该基因全长为1824 bp,其中包括15 bp的5′UTR、822 bp的ORF区域和987 bp的3′UTR,在PtRab2A的C端发现了2个保守的半胱氨酸残基,预测分子式为C1322H2084N382O399S12,分子量为30.10 kDa,理论等电点(pI)为7.05,共编码274个氨基酸。PtRab2A的保守结构域与拟穴青蟹的保守结构域相似性最高(100%);实时荧光定量PCR分析显示,PtRab2A在三疣梭子蟹各个组织中均有表达,副溶血弧菌感染下该基因的表达水平在12 h和72 h时显著升高(P<0.05);亚硫酸氢盐(BS)-PCR分析显示,副溶血弧菌感染72 h后该基因的DNA甲基化水平显著降低,与基因表达呈显著负相关性(P<0.05)。采用RNAi敲降PtRab2A后,其表达量显著下调,24 h时,敲降效率达到80%。采用RNAi敲降PtRab2A后,注射副溶血弧菌后发现,实验组的死亡率在2 h时显著高于对照组,且死亡高峰期提前。因此,副溶血弧菌感染下,三疣梭子蟹可能通过DNA甲基化水平下调促进免疫基因的表达,从而提高其免疫力。研究结果丰富了三疣梭子蟹抵御病原入侵的分子调控机制。 展开更多
关键词 三疣梭子蟹 DNA甲基化 RNAi敲降 基因表达 血淋巴
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弓形虫TGME49_240850基因编码的含WD40结构域蛋白的生物学功能
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作者 洪照微 王萌 +4 位作者 孙黎秀 寇永杰 马志雅 江新成 付宝权 《中国兽医科学》 北大核心 2025年第5期577-585,共9页
为探究弓形虫中TGME49_240850基因编码的含WD40结构域蛋白的生物学功能,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建弓形虫TGME49_240850条件性敲除虫株(TGME49_240850-m AID-6HA),并分析该基因在弓形虫Pru-TIR1虫株的亚细胞定位和基本生物学功能... 为探究弓形虫中TGME49_240850基因编码的含WD40结构域蛋白的生物学功能,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建弓形虫TGME49_240850条件性敲除虫株(TGME49_240850-m AID-6HA),并分析该基因在弓形虫Pru-TIR1虫株的亚细胞定位和基本生物学功能。间接免疫荧光试验显示,TGME49_240850蛋白定位于细胞核,并且加入吲哚乙酸后能将该蛋白降解;Western-blot结果表明,TGME49_240850-m AID-6HA融合蛋白大小约为90 k Da;与对照组相比,TGME49_240850-m AID-6HA虫株形成噬斑的能力(P<0.001)和增殖能力(P<0.01)均显著降低,而对入侵、逸出和缓殖子转化能力却无明显影响(P>0.05)。以上结果表明,TGME49_240850蛋白的降解减弱了弓形虫的体外增殖能力。结论:成功构建了TGME49_240850条件性敲除虫株,为进一步研究弓形虫中含WD40结构域相关蛋白的功能奠定基础。 展开更多
关键词 弓形虫 WD40结构域 条件性敲除 生长素诱导降解系统
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NEDD8表达下调对胃癌细胞增殖、侵袭以及胃癌在体内生长的抑制作用
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作者 信文 王晓娜 +1 位作者 陈靖 孔凡铭 《天津师范大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期16-21,共6页
为了评估NEDD8在胃癌组织中的表达水平,探究NEDD8表达与胃癌患者预后的可能相关性,采用免疫组化(IHC)方法检测NEDD8在胃癌组织和正常组织中的表达,进一步通过CCK-8、克隆形成实验、划痕愈合实验和Transwell实验检测NEDD8对胃癌细胞增殖... 为了评估NEDD8在胃癌组织中的表达水平,探究NEDD8表达与胃癌患者预后的可能相关性,采用免疫组化(IHC)方法检测NEDD8在胃癌组织和正常组织中的表达,进一步通过CCK-8、克隆形成实验、划痕愈合实验和Transwell实验检测NEDD8对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响,并利用动物模型评估NEDD8对肿瘤生长和转移的影响.结果显示:(1)NEDD8在胃癌组织中的表达显著升高,高表达的NEDD8与胃癌患者的预后不良密切相关;(2)NEDD8的敲降显著抑制了胃癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并抑制了小鼠肿瘤的生长和转移.由此认为,NEDD8参与了胃癌的进展,可以作为胃癌的一个潜在治疗靶点. 展开更多
关键词 胃癌 NEDD8 敲降 细胞增殖 侵袭 迁移
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基于机器学习算法的结肠癌代谢核心基因鉴定及其功能机制研究
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作者 吴炼 马仪超 +4 位作者 张竞秋 韦晨 季浩 赵佳豪 汤东 《实用临床医药杂志》 2025年第17期20-27,共8页
目的基于机器学习算法筛选结肠癌代谢核心基因,并分析其功能机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)获取数据,TCGA队列包含375例肿瘤样本、32例癌旁组织样本,GSE39582队列包含419例肿瘤样本。采用单因素Cox... 目的基于机器学习算法筛选结肠癌代谢核心基因,并分析其功能机制。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合数据库(GEO)获取数据,TCGA队列包含375例肿瘤样本、32例癌旁组织样本,GSE39582队列包含419例肿瘤样本。采用单因素Cox回归分析结合随机森林、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归算法,筛选代谢核心基因。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,以曲线下面积(AUC)评估核心基因的预测效能。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和免疫组织化学(IHC)方法检测核心基因表达。敲低核心基因,探讨其在结肠癌中的作用。结果基于机器学习算法筛选出3个核心基因,即CPT2、SCP2、NR3C2。根据ROC曲线的AUC比较结果,NR3C2的预测效能最佳。qRT-PCR检测结果显示,NR3C2 mRNA在结肠癌细胞系中低表达;IHC检测结果显示,NR3C2在结肠癌组织中低表达。敲低NR3C2可显著促进结肠癌细胞增殖与迁移。结论交叉运用3种机器学习算法筛选出NR3C2为结肠癌核心代谢抑制基因,这或可为代谢靶向治疗提供新策略。 展开更多
关键词 结肠癌 代谢组学 机器学习算法 NR3C2基因 基因敲低技术 增殖 迁移 代谢靶向治疗
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核酸质谱检测白纹伊蚊击倒抗性基因突变方法的建立
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作者 张龙飞 张晓越 高翔 《中华卫生杀虫药械》 2025年第3期266-269,共4页
目的建立一种基于核酸质谱技术检测白纹伊蚊对拟除虫菊酯类杀虫剂抗性相关的击倒抗性(kdr)基因突变的方法。方法设计特异性引物和探针,实现了在同一聚合酶链式反应(PCR)反应体系中进行多重扩增,并选取2023年8月于北京市通州区采集的白... 目的建立一种基于核酸质谱技术检测白纹伊蚊对拟除虫菊酯类杀虫剂抗性相关的击倒抗性(kdr)基因突变的方法。方法设计特异性引物和探针,实现了在同一聚合酶链式反应(PCR)反应体系中进行多重扩增,并选取2023年8月于北京市通州区采集的白纹伊蚊成蚊。取单只样本研磨后提取核酸,采用核酸质谱方法测定钠离子通道(VGSC)基因第1016、1532、1534氨基酸位点的碱基突变情况,使用金标准一代测序对核酸质谱检测白纹伊蚊kdr突变方法的准确性进行验证。结果经核酸质谱检测,44只白纹伊蚊突变位点与一代测序结果一致。结论质谱检测白纹伊蚊kdr突变在与一代测序结果的比较中展现出高符合率,有望成为检测白纹伊蚊VGSC基因突变的新方法。 展开更多
关键词 核酸质谱 白纹伊蚊 击倒抗性 突变
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过表达溶质载体家族1成员5和敲低慢病毒载体构建及稳定转染RAW264.7细胞株
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作者 郭大鑫 范苏苏 +2 位作者 朱振东 侯建红 张旋 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第7期1414-1421,共8页
背景:溶质载体家族1成员5(solute carrier family 1 member 5,SLC1A5)在多种疾病中发挥了潜在作用,但确切作用机制尚不清楚。构建稳定的SLC1A5过表达和敲低细胞模型可为深入研究SLC1A5在疾病中的确切作用机制以及发现潜在治疗靶点提供... 背景:溶质载体家族1成员5(solute carrier family 1 member 5,SLC1A5)在多种疾病中发挥了潜在作用,但确切作用机制尚不清楚。构建稳定的SLC1A5过表达和敲低细胞模型可为深入研究SLC1A5在疾病中的确切作用机制以及发现潜在治疗靶点提供有力的实验工具。目的:构建小鼠SLC1A5过表达和敲低的慢病毒载体,以建立稳定转染的RAW264.7细胞株,为深入探讨SLC1A5在炎症中的作用提供实验基础。方法:根据SLC1A5基因序列设计合成引物并使用聚合酶链反应扩增该基因片段。将目的基因定向接入经Age I/Nhe I酶切的载体质粒GV492中构建重组慢病毒质粒,对阳性克隆进一步筛选后测序比对结果;pHelper1.0质粒载体、pHelper2.0质粒载体、目的质粒载体与293T细胞共同培养并转染,获得慢病毒原液进行包装和滴度测定;在此基础上,通过体外培养RAW264.7细胞,确定嘌呤霉素工作质量浓度;不同滴度的慢病毒分别与RAW264.7细胞共同培养,根据荧光强度确定转染效率;用嘌呤霉素挑选出稳定转染细胞,实时荧光定量聚合酶链反应和蛋白免疫印迹方法检测稳定转染细胞株的SLC1A5基因和蛋白表达水平。结果与结论:(1)测序序列与目的序列一致提示重组慢病毒载体构建成功;(2)过表达SLC1A5慢病毒的滴度为1×10~9 TU/mL,敲低SLC1A5慢病毒的滴度为3×10~9 TU/mL;(3)确定RAW264.7细胞嘌呤霉素工作质量浓度为3μg/mL;(4)过表达/敲低SLC1A5慢病毒转染RAW264.7细胞的最佳条件皆为HiTransG P转染增强液且感染复数值等于50;(5)过表达SLC1A5稳转细胞株中SLC1A5基因和蛋白的表达量明显上调,而敲低SLC1A5稳转细胞株中SLC1A5基因和蛋白的表达量显著下调。结果表明,成功构建了小鼠SLC1A5过表达和敲低的慢病毒载体并获得稳定转染的RAW264.7细胞株。 展开更多
关键词 慢病毒载体 溶质载体家族1成员5 SLC1A5 过表达 敲低 RAW264.7细胞 稳转细胞株
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非编码RNA的引导RNA的设计及其应用
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作者 秦玉婷 潘森涛 陈渝萍 《生物技术通报》 北大核心 2025年第3期71-82,共12页
非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA)是指通常不编码蛋白质的功能性RNA分子,多通过调控编码基因的表达和功能发挥重要的生理作用。微小RNA (microRNA, miRNA)、环状RNA (circular RNA, circRNA)及长编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA... 非编码RNA (non-coding RNA, ncRNA)是指通常不编码蛋白质的功能性RNA分子,多通过调控编码基因的表达和功能发挥重要的生理作用。微小RNA (microRNA, miRNA)、环状RNA (circular RNA, circRNA)及长编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是目前已知的三大类具有重要生理和病理意义的调控型ncRNA,其基因的缺失重排和表达失调与多种疾病的发生发展密切相关。成簇规律间隔短回文重复序列及相关蛋白质系统(clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated proteins, CRISPR/Cas)是一类广泛存在于细菌和古菌中的免疫防御系统,由CRISPR相关蛋白(CRISPRassociated proteins, Cas)和引导RNA (guide RNAs, gRNA)共同组成。该系统利用gRNA引导Cas核酸酶剪切和清除外源基因,因此Cas酶对靶DNA/RNA的精准识别和有效切割是由gRNA决定的。CRISPR/Cas技术具有优异的基因组定点编辑和转录本特异性剪切能力,能精准高效地编辑、干预和检测ncRNA的异常,帮助人们成功诊治疾病。本文在总结Cas9和Cas13 gRNA的组成和设计原则的基础上,针对miRNA、circRNA及lncRNA基因和其RNA自身或RNA形成过程中产生的特殊分子特征,重点介绍针对三类ncRNA的gRNA的设计策略和敲除靶点的选择,以及Cas9和Cas13核酸酶如何在gRNA高特异性和高效率的引导下,对异常miRNA、circRNA和lncRNA进行精准检测和干预。进一步讨论3类ncRNA的gRNA设计异同点和CRISRP/Cas应用在ncRNA上所面临的挑战,并对未来精准靶向ncRNA的gRNA设计进行展望,旨在为CRISPR/Cas技术在治疗ncRNA相关疾病上的应用提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas guide RNA 非编码RNA MIRNAS circRNAs lncRNAs 敲除靶点
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上海市2024年白纹伊蚊击倒抗性基因突变检测
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作者 周秋明 盛望望 +8 位作者 李佳璇 李翔宇 周琳瑛 许月萍 焦焱桐 袁浩 董昊炜 单文琪 彭恒 《中国热带医学》 北大核心 2025年第11期1446-1450,1498,共6页
目的检测上海市白纹伊蚊野外种群电压门控钠离子通道(VGSC)基因的基因型分布特点,了解白纹伊蚊击倒抗性(kdr)基因突变及趋势情况,为上海市蚊媒防制措施提供科学依据。方法于2024年9月—10月从上海市12个行政区13个地点采集白纹伊蚊幼虫/... 目的检测上海市白纹伊蚊野外种群电压门控钠离子通道(VGSC)基因的基因型分布特点,了解白纹伊蚊击倒抗性(kdr)基因突变及趋势情况,为上海市蚊媒防制措施提供科学依据。方法于2024年9月—10月从上海市12个行政区13个地点采集白纹伊蚊幼虫/蛹,经实验室饲养羽化后,筛选健康雌蚊用于基因检测。采用离心柱法抽提基因组DNA,针对VGSC基因的DomainⅡ、Ⅲ、Ⅳ位点设计引物进行PCR扩增。扩增产物经琼脂糖凝胶电泳验证后送测,使用SeqMan软件比对序列峰图,确定突变位点及基因型。用Excel计算突变频率,并通过卡方检验比较区域间的差异。结果共检测455只白纹伊蚊,总体突变率为79.8%(363/455),13个群体均存在不同程度突变。V1016位点突变等位基因为GGA/G(5.0%,45/910),I1532位点突变等位基因为ACC/T(4.3%,39/910),F1534位点的2种突变等位基因分别为TCC/S(48.5%,441/910)和TGC/C(14.0%,127/910)。未发现3个位点同时突变的个体情况,两个位点同时突变的个体有52个(11.4%),V1016和F1534同时突变个体2个(0.4%),I1532和F1534位点同时突变个体50个(11.0%)。结论上海市白纹伊蚊群体KDR突变呈快速进化特征,其中1532位点(I/T)和1534位点(F/S)的组合突变型在多数监测区域稳定分布,需警惕协同抗性发展,且建立动态监测体系结合药剂轮换使用,构建多维度抗性治理策略,以延缓抗性基因扩散与累积。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 击倒抗性基因 基因突变 抗药性 蚊媒防制
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基于慢病毒感染技术敲低CTNNB 1基因的H1299细胞系构建
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作者 沈齐 金玉玲 +4 位作者 曹金金 张玲芳 汪洋 胡翰 刘滨磊 《湖北工业大学学报》 2025年第2期55-61,共7页
为构建β-连环蛋白编码基因CTNNB 1稳定敲低的肺癌H1299细胞模型,以深入探讨其在肺癌转移复发及耐药性中的作用机制。通过筛选功能性siRNA序列,构建pLKO.1-CTNNB 1-shRNA-EGFP-puro重组表达载体,基因测序证实shRNA序列正确插入载体,经2... 为构建β-连环蛋白编码基因CTNNB 1稳定敲低的肺癌H1299细胞模型,以深入探讨其在肺癌转移复发及耐药性中的作用机制。通过筛选功能性siRNA序列,构建pLKO.1-CTNNB 1-shRNA-EGFP-puro重组表达载体,基因测序证实shRNA序列正确插入载体,经293T细胞包装获得慢病毒颗粒。采用慢病毒感染H1299细胞后,通过嘌呤霉素筛选获得阳性细胞群体,结合有限稀释法成功分离单克隆细胞系。流式细胞术检测显示单克隆细胞EGFP阳性率达99%。RT-qPCR及Western blot分析表明,CTNNB 1在mRNA和蛋白表达水平分别下降至对照组的54%和60%。实验成功建立CTNNB 1基因稳定敲降的H1299细胞模型,该模型为后续研究β-catenin信号通路在肺癌恶性进展中的调控机制提供了可靠的细胞平台。 展开更多
关键词 H1299细胞 慢病毒 CTNNB 1基因 敲低细胞系
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3-巯基丙酮酸硫基转移酶敲低稳转神经胶质瘤细胞系的构建及表达
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作者 王琪 李日清 陈晓霞 《赣南医科大学学报》 2025年第10期934-939,共6页
目的:构建3-巯基丙酮酸硫基转移酶(3-mercaptopyruvate sulfurtransferase, MPST)敲低的神经胶质瘤稳转细胞系GSC1023和GBM0709,并分析MPST在神经胶质瘤细胞内的定位。方法:设计并合成2对MPST-shRNA干扰序列,连接到pLKO. 1-Puro慢病毒... 目的:构建3-巯基丙酮酸硫基转移酶(3-mercaptopyruvate sulfurtransferase, MPST)敲低的神经胶质瘤稳转细胞系GSC1023和GBM0709,并分析MPST在神经胶质瘤细胞内的定位。方法:设计并合成2对MPST-shRNA干扰序列,连接到pLKO. 1-Puro慢病毒载体上,构建敲低MPST基因的慢病毒载体pLKO. 1-MPST-shRNA并感染人源神经胶质瘤干细胞GSC1023和神经胶质瘤细胞GBM0709。用嘌呤霉素筛选稳定敲低MPST基因的神经胶质瘤细胞系GSC1023和GBM0709。采用RT-qPCR、蛋白质免疫印迹(Western blot)和免疫荧光检测细胞中MPST的表达。结果:成功构建敲低MPST基因的GSC1023和GBM0709稳转细胞系;RT-qPCR结果显示敲低MPST基因GSC1023和GBM0709稳转细胞系中MPST基因mRNA表达量显著降低(P<0.05);Western blot结果显示敲低MPST基因GSC1023和GBM0709稳转细胞系中MPST蛋白表达量显著降低(P<0.05);免疫荧光结果显示在神经胶质瘤细胞中MPST主要定位于线粒体。结论:成功构建了稳定敲低MPST基因的GSC1023和GBM0709神经胶质瘤细胞系,为进一步探讨MPST介导的内源性H_2S在神经胶质瘤发生发展的影响奠定了基础。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 3-巯基丙酮酸硫基转移酶 基因敲低技术
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TET1 knockdown inhibits the odontogenic differentiation potential of human dental pulp cells 被引量:10
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作者 Li-Jia Rao Bai-Cheng Yi +1 位作者 Qi-Meng Li Qiong Xu 《International Journal of Oral Science》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期110-116,共7页
Human dental pulp cells (hDPCs) possess the capacity to differentiate into odontoblast-like cells and generate reparative dentin in response to exogenous stimuli or injury. Ten-eleven translocation 1 (TET1) is a n... Human dental pulp cells (hDPCs) possess the capacity to differentiate into odontoblast-like cells and generate reparative dentin in response to exogenous stimuli or injury. Ten-eleven translocation 1 (TET1) is a novel DNA methyldioxygenase that plays an important role in the promotion of DNA demethylation and transcriptional regulation in several cell lines. However, the role of TET1 in the biological functions of hDPCs is unknown. To investigate the effect of TET1 on the proliferation and odontogenic differentiation potential of hDPCs, a recombinant shRNA lentiviral vector was used to knock down TET1 expression in hDPCs. Following TET1 knockdown, TET1 was significantly downregulated at both the mRNA and protein levels. Proliferation of the hDPCs was suppressed in the TET1 knockdown groups. Alkaline phosphatase activity, the formation of mineralized nodules, and the expression levels of DSPP and DMP1 were all reduced in the TETl-knockdown hDPCs undergoing odontogenic differentiation. Based on these results, we concluded that TET1 knockdown can prevent the proliferation and odontogenic differentiation of hDPCs, which suggests that TET1 may play an important role in dental pulp repair and regeneration. 展开更多
关键词 DNA demethylation human dental pulp cell knockdown odontogenic differentiation ten-eleven translocation 1
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Let-7a gene knockdown protects against cerebral ischemia/reperfusion injury 被引量:10
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作者 Zhong-kun Wang Fang-fang Liu +2 位作者 Yu Wang Xin-mei Jiang Xue-fan Yu 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期262-269,共8页
The micro RNA(mi RNA) let-7 was one of the first mi RNAs to be discovered, and is highly conserved and widely expressed among species. let-7 expression increases in brain tissue after cerebral ischemia/reperfusion i... The micro RNA(mi RNA) let-7 was one of the first mi RNAs to be discovered, and is highly conserved and widely expressed among species. let-7 expression increases in brain tissue after cerebral ischemia/reperfusion injury; however, no studies have reported let-7 effects on nerve injury after cerebral ischemia/reperfusion injury. To investigate the effects of let-7 gene knockdown on cerebral ischemia/reperfusion injury, we established a rat model of cerebral ischemia/reperfusion injury. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction demonstrated that 12 hours after cerebral ischemia/reperfusion injury, let-7 expression was up-regulated, peaked at 24 hours, and was still higher than that in control rats after 72 hours. Let-7 gene knockdown in rats suppressed microglial activation and inflammatory factor release, reduced neuronal apoptosis and infarct volume in brain tissue after cerebral ischemia/reperfusion injury. Western blot assays and luciferase assays revealed that mitogen-activated protein kinase phosphatase-1(MKP1) is a direct target of let-7. Let-7 enhanced phosphorylated p38 mitogen-activated protein kinase(MAPK) and c-Jun N-terminal kinase(JNK) expression by down-regulating MKP1. These findings suggest that knockdown of let-7 inhibited the activation of p38 MAPK and JNK signaling pathways by up-regulating MKP1 expression, reduced apoptosis and the inflammatory reaction, and exerted a neuroprotective effect following cerebral ischemia/reperfusion injury. 展开更多
关键词 nerve regeneration cerebral ischemia/reperfusion injury LET-7 mitogen-activated protein kinase phosphatase-1 apoptosis MICROGLIA inflammation mitogen-activated protein kinase NEURONS c-Jun N-terminal kinase gene knockdown brain injury neural regeneration
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