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高血压患者ACE基因Insertion/Deletion多态性中的罕见突变1例 被引量:1
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作者 李娅亨 王倩 +1 位作者 杨杉 李亚峰 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2024年第2期6069-6072,共4页
高血压是最强的心血管危险因素之一,目前我国高血压的患病人数已达约2.45亿[1]。《中国心血管健康与疾病报告2021》数据显示,我国≥18岁成人高血压知晓率41.0%,治疗率34.9%,控制率仅11.0%。在高血压的用药治疗方面,由于用药种类繁多,且... 高血压是最强的心血管危险因素之一,目前我国高血压的患病人数已达约2.45亿[1]。《中国心血管健康与疾病报告2021》数据显示,我国≥18岁成人高血压知晓率41.0%,治疗率34.9%,控制率仅11.0%。在高血压的用药治疗方面,由于用药种类繁多,且存在药物反应的个体差异,通常会导致抗高血压药物的疗效不佳或不良反应[2]。2015年,国家卫生和计划生育委员会发布的《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》[3]。 展开更多
关键词 高血压 血管紧张素转换酶(ACE)基因 pcr溶解曲线法 insertion/Deletion多态性 一代测序
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Identification of T-DNA Inserted Mutant Gene Transcription by Using Real-time PCR in Arabidopsis
2
作者 YUAN Man BAI Xi CAI Hua LI Yong JI Wei ZHU Yanming 《Journal of Northeast Agricultural University(English Edition)》 CAS 2011年第2期41-47,共7页
AtERF4 (ethylene response factor) is a negative regulator in jasmonic acid mediated signal transduction pathway and ethylene mediated signal transduction pathway of Arabidopsis. It could respond to abscisic acid (... AtERF4 (ethylene response factor) is a negative regulator in jasmonic acid mediated signal transduction pathway and ethylene mediated signal transduction pathway of Arabidopsis. It could respond to abscisic acid (ABA) and ethylene stimulus ATSYR1 gene encodes a syntaxin localizing at the plasma membrane in Arabidopsis, which can be induced by abiotic stress. To identify mutation lines for gene functional analysis, real-time PCR was employed to detect the expression level of AtERF4 and ATSYR1 in homozygous T-DNA insertion mutant line, respectively. Real-time PCR is a powerful tool which can be used to detect steady-state mRNA levels specifically, sensitively and reproducibly. Comparing to other forms of quantitative RT-PCR, the amount of amplified products can be detected by real-time PCR instantly and thus is a preferable alternative. In this study, RNA with T-DNA inserting into exon could be detected in AtERF4 knock-out mutation line. The results indicated that AtERF4 had been trucked in transcription level. On the other hand, T-DNA inserting into the promoter of gene ATSYR1 had no effect on reducing the expression level ofATSYR1 gene. Further molecular and phenotype studies now are ongoing to clarify the potential consequences of AtERF4 and ATSYR1 deficiency in Arabidopsis 展开更多
关键词 Arabidopsis thaliana ERF4 SYR1 T-DNA insertion real-time pcr
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两种PCR快速检测转基因糜子中外源基因的插入拷贝数
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作者 董晓静 夏启玉 +3 位作者 降彦苗 刘国庆 程汝宏 赵辉 《热带农业科学》 2025年第2期55-63,共9页
近年来,糜子(Panicum miliaceum L.)的转基因育种研究越来越多,本研究旨在建立简单快速检测转基因糜子中外源基因插入拷贝数的方法。从糜子基因组中筛选了一个单拷贝基因SD1,并以其为内参基因,以潮霉素抗性基因(Hyg)为外源基因,建立了数... 近年来,糜子(Panicum miliaceum L.)的转基因育种研究越来越多,本研究旨在建立简单快速检测转基因糜子中外源基因插入拷贝数的方法。从糜子基因组中筛选了一个单拷贝基因SD1,并以其为内参基因,以潮霉素抗性基因(Hyg)为外源基因,建立了数字PCR检测转基因糜子中外源基因插入拷贝数的方法。并以数字PCR鉴定的一个双拷贝样品为参照样本,建立了荧光定量PCR检测转基因糜子中外源基因插入拷贝数的方法。生物信息学分析表明,SD1为单拷贝基因,可作为转基因糜子中外源基因插入拷贝数检测的内参基因。数字PCR法检测的转基因糜子样品中,9份样品均为单拷贝或双拷贝插入;荧光定量PCR法检测的转基因糜子样品中,10份样品为单拷贝或双拷贝插入,其余13份样品均为多拷贝插入;对其中的4份低拷贝样品也进行了数字PCR检测,结果与荧光定量PCR法的检测结果完全一致,表明荧光定量PCR法检测转基因糜子中外源基因低拷贝时的准确度较高。本研究建立的数字PCR法简单快速,准确度高,适合在样品数量较少时使用,而荧光定量PCR法检测低拷贝插入时准确度较高,且成本低廉,适合从大量转基因株系中初筛出的低拷贝插入株系。这2种方法均可简单快速地检测糜子转基因育种中外源基因插入拷贝数。 展开更多
关键词 转基因糜子 外源基因 插入拷贝数 数字pcr 荧光定量pcr
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TAIL-PCR法快速分离红曲霉色素突变株T-DNA插入位点侧翼序列 被引量:8
4
作者 邵彦春 丁月娣 +1 位作者 陈福生 谢笔钧 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期323-326,共4页
采用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)法分离红曲霉色素突变株T-DNA插入位点的侧翼序列,扩增到了长度介于500bp~1300bp之间的7个DNA片段,对这些DNA片段测序,并采用生物信息学方法对测序结果进行了分析,表... 采用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR,TAIL-PCR)法分离红曲霉色素突变株T-DNA插入位点的侧翼序列,扩增到了长度介于500bp~1300bp之间的7个DNA片段,对这些DNA片段测序,并采用生物信息学方法对测序结果进行了分析,表明其中有1个片段与烟曲霉Af293发育调控子flbA的相似性较高。TAIL-PCR法成功应用于分离红曲霉突变株T-DNA插入位点的侧翼序列,为大规模获取插入位点侧翼序列建立了可行的方法,也为进一步研究红曲霉功能基因奠定了基础。 展开更多
关键词 红曲霉 T-DNA插入 突变子 TAIL-pcr
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结合通用引物快速简便鉴定阳性克隆的PCR方法 被引量:4
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作者 崔静 黄爱龙 张文露 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第3期99-102,共4页
通用引物与载体多克隆位点两端序列互补,将目的片段构建入载体pGEM-T Easy中,利用载体通用引物M13F和M13R结合片段特异引物进行菌液PCR反应。用PCR产物电泳结果来筛选阳性克隆并鉴定目的片段插入方向,同时能有效对短插入片段重组子进行... 通用引物与载体多克隆位点两端序列互补,将目的片段构建入载体pGEM-T Easy中,利用载体通用引物M13F和M13R结合片段特异引物进行菌液PCR反应。用PCR产物电泳结果来筛选阳性克隆并鉴定目的片段插入方向,同时能有效对短插入片段重组子进行筛选与鉴定。最终以DNA测序结果来验证,与测序结果一致,显示通用引物PCR方法对阳性克隆的筛选和鉴定优于传统酶切和普通PCR鉴定方法,能够弥补传统方法的不足,且简便快速,可作为筛选和鉴定阳性克隆的有效手段。 展开更多
关键词 通用引物pcr 鉴定 插入方向 短插入片段
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新疆细毛羊2倍基因组BAC文库PCR筛选系统的构建与使用 被引量:2
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作者 李谨 杨公社 +3 位作者 陈创夫 刘海波 马润林 王金富 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2006年第6期489-494,共6页
本研究所构建的BAC文库覆盖了8倍新疆细毛羊的基因组,平均插入片段的大小为133kb.同时文库92.5%的克隆插入片段大于100kb,而且有部分克隆甚至大于300kb,假定绵羊的基因组含有3×10^6kb,根据文库的平均插入片段大小为133kb,... 本研究所构建的BAC文库覆盖了8倍新疆细毛羊的基因组,平均插入片段的大小为133kb.同时文库92.5%的克隆插入片段大于100kb,而且有部分克隆甚至大于300kb,假定绵羊的基因组含有3×10^6kb,根据文库的平均插入片段大小为133kb,从文库筛选到目的片段的概率为98.208%。为了验证文库有较好的覆盖率.构建了2倍基因组文库PCR筛选系统,并对位于新疆细毛羊20号染色体MHC基因邻近区段的DMB_EX2、MCMA36、CP73和BM12584个分子标记进行了筛选.得到的平均阳性克隆数为1.5个,从筛选结果来看,这与文库插入片段估计的8倍基因组覆盖率相当接近并且没有偏向,这使得本文库成为研究绵羊的功能基因、位置克隆和完善基因组物理图谱的极为有用的资源。 展开更多
关键词 新疆细毛羊 基因组 BAC文库 插入片段 pcr筛选系统
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PCR方法筛选布氏田鼠小片断插入微卫星文库 被引量:3
7
作者 王登 施大钊 《草地学报》 CAS CSCD 2007年第3期278-282,共5页
为了研究布氏田鼠(Lasiopodomys brandtii)不同地理种群的遗传差异,克隆其微卫星位点。将布氏田鼠基因组DNA用限制性内切酶消化后的小片段与Pbluescript SK(+)连接,用含有CT重复序列的寡聚核苷酸和质粒上的T3序列作为引物进行PCR扩增,... 为了研究布氏田鼠(Lasiopodomys brandtii)不同地理种群的遗传差异,克隆其微卫星位点。将布氏田鼠基因组DNA用限制性内切酶消化后的小片段与Pbluescript SK(+)连接,用含有CT重复序列的寡聚核苷酸和质粒上的T3序列作为引物进行PCR扩增,筛选阳性克隆,对质粒上插入位置和片段大小合适的外源DNA序列进行测序。共获得116个阳性克隆,测序结果显示37个包含布氏田鼠微卫星DNA序列,28个具完整的侧翼序列。 展开更多
关键词 布氏田鼠 小片断插入文库 pcr筛选
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3种检测布鲁氏菌荧光定量PCR方法的比较 被引量:10
8
作者 董浩 原霖 +5 位作者 赵明海 许中衎 刘巍 徐阳 陈亚娜 梁春南 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2021年第6期947-952,共6页
为了筛选适用于家畜布鲁氏菌病检测的荧光定量PCR方法,合成目前报道最多的布鲁氏菌IS711插入序列、per基因和bcsp31基因的引物和探针,并分别对这3种荧光定量PCR方法的敏感性、特异性、重复性以及63份临床样品检测效果进行比较。结果显... 为了筛选适用于家畜布鲁氏菌病检测的荧光定量PCR方法,合成目前报道最多的布鲁氏菌IS711插入序列、per基因和bcsp31基因的引物和探针,并分别对这3种荧光定量PCR方法的敏感性、特异性、重复性以及63份临床样品检测效果进行比较。结果显示:3种荧光定量PCR方法均具有较好的敏感性且均不与其他常见细菌发生交叉反应;3种方法的批内变异系数和批间变异系数均小于5%。在检测临床样品时,3种方法的敏感性均高于套式PCR方法,其中IS711荧光定量PCR方法与套式PCR方法符合率为95.24%,其他2种方法与套式PCR方法的符合率为98.41%。比较而言,IS711荧光定量PCR敏感性最高,更适合于布鲁氏菌核酸含量低的样品的检测。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 荧光定量pcr 方法比对 IS711插入序列
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一种测定水稻白叶枯菌基因组中插入序列IS1112拷贝数的定量PCR方法
9
作者 佘宇佳 谢家建 +1 位作者 王锡锋 高必达 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期99-103,共5页
建立了以标准质粒为基础的测定水稻白叶枯基因组中插入序列IS1112拷贝数的TaqMan实时荧光定量PCR方法。通过重叠PCR方法扩增了由16S rDNA基因与插入序列IS1112的部分片段组成的重组片段,连接到载体pMD18-T上,构建了标准质粒。利用该标... 建立了以标准质粒为基础的测定水稻白叶枯基因组中插入序列IS1112拷贝数的TaqMan实时荧光定量PCR方法。通过重叠PCR方法扩增了由16S rDNA基因与插入序列IS1112的部分片段组成的重组片段,连接到载体pMD18-T上,构建了标准质粒。利用该标准质粒建立的定量方法测定了我国12种白叶枯菌株基因组中IS1112的拷贝数。 展开更多
关键词 插入序列IS1112 拷贝数 定量pcr 标准质粒 水稻白叶枯病菌
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菌落PCR方法筛选低能离子束辐射引起的IS插入突变
10
作者 潘少杰 汤明礼 《安徽大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2010年第4期98-103,共6页
建立一种基于单拷贝基因的菌落PCR方法,筛选低能离子束辐射下IS因子插入引起的大肠杆菌lacI基因突变.PCR的优化结果显示,DMSO是一种合适的添加剂,而细胞的裂解方法和过程在菌落PCR中有比较关键的作用.经过测定,该方法的菌落PCR最低菌浓... 建立一种基于单拷贝基因的菌落PCR方法,筛选低能离子束辐射下IS因子插入引起的大肠杆菌lacI基因突变.PCR的优化结果显示,DMSO是一种合适的添加剂,而细胞的裂解方法和过程在菌落PCR中有比较关键的作用.经过测定,该方法的菌落PCR最低菌浓度约为1×105个菌.0.8%琼脂糖凝胶电泳结果显示,96个突变子的菌落PCR的成功率为95%以上.测序结果表明:两个由IS因子插入引起的突变被成功筛选. 展开更多
关键词 菌落pcr 插入序列 lacI基因 突变 低能离子
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临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系 被引量:8
11
作者 郭向娇 王颖芳 +4 位作者 段广才 王琳琳 王鹏飞 杨海燕 郗园林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期543-549,共7页
【目的】了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系。【方法】以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因... 【目的】了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系。【方法】以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因ipaH、ial、ipaBCD、virA进行检测。对CRISPR1的PCR结果进行测序,并用CRISPRfinder在线软件对CRISPR1基因座进行分析。通过卡方检验初步分析CRISPR/Cas系统与毒力基因的关系。【结果】测序结果显示,CRISPR1基因座中间隔序列数目较少且在不同菌株间一致性较高;57株志贺菌中,84.2%(48/57)的志贺菌中可检测到CRISPR/Cas系统,其中68.8%(33/48)的志贺菌中cas6e-cas5基因或(和)cse2基因中发现插入序列;毒力基因ipaH、ial、virA、ipaBCD的检出率依次为100%、100%、98.2%和87.7%;毒力基因ipaBCD的阳性率与活性CRISPR/Cas系统的分布无关(P>0.05)。【结论】CRISPR/Cas系统广泛存在于临床分离志贺菌中;部分cas基因中有插入序列;并未发现志贺菌中活性CRISPR/Cas系统与毒力基因的分布有关。 展开更多
关键词 志贺菌 CRISPR/Cas系统 聚合酶链式反应 插入序列 毒力基因
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耐碳青霉烯鲍曼不动杆菌的耐药机制及分子流行病学 被引量:17
12
作者 肖秀美 高爽 +2 位作者 段京京 姚贝 张捷 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期704-710,共7页
目的碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)逐年升高的分离率和全球播散已成为极为严重的问题,本研究目的是阐明我院CRAB的耐药机制和分子流行病学特征。方法使用gyrB多重PCR方法将我院2014年7月—2015年6月分离的327株非重复醋酸钙-鲍曼不动... 目的碳青霉烯耐药鲍曼不动杆菌(CRAB)逐年升高的分离率和全球播散已成为极为严重的问题,本研究目的是阐明我院CRAB的耐药机制和分子流行病学特征。方法使用gyrB多重PCR方法将我院2014年7月—2015年6月分离的327株非重复醋酸钙-鲍曼不动杆菌复合体(ABC)鉴定到种,VITEK-2仪器法和E-test法测定抗菌药物的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration MIC),PCR方法检测常见的碳青霉烯酶耐药基因、ISAba1并测序,Turton 2组多重PCR方法进行分子分型。结果327株ABC中有315株鲍曼不动杆菌(ABA)、9株皮特不动杆菌和3株医院不动杆菌,ABA、皮特和医院不动杆菌对亚胺培南的耐药率分别为91.7%、0和66.7%,耐药株主要分离自急诊科和呼吸ICU。ABA bla_(OXA-23-like)和ISAba1检出率均为91.1%,测序均为bla_(OXA-23),bla_(OXA-51-like)和ISAba1检出率分别为100%和0.3%,测序主要为bla_(OXA-66)和bla_(OXA-69),未检测到其他OXAs型、NDM、IMP、GIM、KPC、SIM、VIM和GES酶基因。Turton分子分型76.8%属于国际克隆Ⅱ型(IC Ⅱ)。结论携带bla_(OXA-23)和ISAba1的IC Ⅱ克隆是我院主要的流行克隆株,克隆播散是CRAB感染增加和暴发的重要原因。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯耐药 OXAs碳青霉烯酶 插入序列 多重pcr序列分型
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耐亚胺培南鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶基因型及插入序列ISAba1研究 被引量:8
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作者 胡巧娟 胡志东 +3 位作者 李静 田彬 徐海茹 李金 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期145-147,共3页
目的检测耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的碳青霉烯酶基因型及其基因周围环境。方法对101株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌进行药物敏感试验,头孢他啶与2-巯基丙酸协同试验筛选金属酶,多重PCR同时检测6种碳青霉烯酶耐药基因,对部分阳性产物进行测序比... 目的检测耐亚胺培南鲍曼不动杆菌的碳青霉烯酶基因型及其基因周围环境。方法对101株耐亚胺培南鲍曼不动杆菌进行药物敏感试验,头孢他啶与2-巯基丙酸协同试验筛选金属酶,多重PCR同时检测6种碳青霉烯酶耐药基因,对部分阳性产物进行测序比对,同时分析碳青霉烯酶基因上游插入序列。结果协同试验未检出产金属酶菌株。所有菌株都携带OXA-51-like基因,87株(86.1%)OXA-23-like基因阳性,2株OXA-24-like基因阳性,OXA-58-like基因与金属酶基因全为阴性。85株OXA-23-like基因上游检测到插入序列ISAba1,OXA-51-like基因上游未检测到ISAba1。结论 OXA-23和OXA-51组β-内酰胺酶基因是本组鲍曼不动杆菌最主要的碳青霉烯酶基因型,OXA-23组碳青霉烯酶基因与插入序列ISAba1关系密切。 展开更多
关键词 鲍曼不动杆菌 碳青霉烯酶 插入序列 金属酶 多重pcr
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水稻Ac×Ds后代基因组DNA中Ds侧翼序列的扩增及其Ds插入分析 被引量:6
14
作者 孙丙耀 谈建中 +3 位作者 陆小平 曲春香 万志刚 顾福根 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1555-1561,共7页
采用TAIL-PCR技术从经鉴定含Ac/Ds双元件的材料中扩增Ds侧翼序列并测序,对水稻Ac×Ds后代基因组DNA进行Ac和Ds插入的PCR分析。利用NCBI的BLAST软件,以Ds侧翼序列为待查询序列进行GenBank在线搜索比对,获得Ds插入相关基因的染色体定... 采用TAIL-PCR技术从经鉴定含Ac/Ds双元件的材料中扩增Ds侧翼序列并测序,对水稻Ac×Ds后代基因组DNA进行Ac和Ds插入的PCR分析。利用NCBI的BLAST软件,以Ds侧翼序列为待查询序列进行GenBank在线搜索比对,获得Ds插入相关基因的染色体定位和功能注释等信息。对扩增的93个有效Ds侧翼序列进行分析,结果显示,有21个水稻杂交后代中Ds插入于基因编码区,其余72个插入在基因间序列,其中12个插入在特定基因的上游3kb以内的间隔区。本研究强调了提高Ds侧翼序列扩增和Ac/Ds植株筛选效率的技术关键。 展开更多
关键词 水稻 Ds侧翼序列 Ds插入 温度非对称交互pcr
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两种Actinobacteria鉴定方法的比较 被引量:4
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作者 余利岩 李秋萍 姚天爵 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期10-14,共5页
Actinobacteria classis nov.一般包括具有超过 5 0 % G+ C的 DNA碱基组成的微生物。其中的一些菌种在生物技术和医药方面具有重要的意义。为了分离能产生有用物质的新型微生物 ,我们扩大了分离对象 ,从以前的 Streptomyces和 Streptomy... Actinobacteria classis nov.一般包括具有超过 5 0 % G+ C的 DNA碱基组成的微生物。其中的一些菌种在生物技术和医药方面具有重要的意义。为了分离能产生有用物质的新型微生物 ,我们扩大了分离对象 ,从以前的 Streptomyces和 Streptomyces以外的放线菌扩大到所有的 Actinobacteria。本论文实验中的Actinobacteria将特指那些具有普通细菌形态的高 G+ C含量革兰氏阳性细菌。为了能够将 Actinobacteria和其它革兰氏阳性低 G+ C含量的细菌加以区分 ,我们建立了两种鉴定方法。一种是荧光原位杂交 (FISH)方法 ,它具有准确和直观的优点。另外一种是 PCR方法 ,因在 Actinobacteria2 3S r RNA基因的 domain (螺旋区 5 4a)有 1个大约 10 0个碱基的稳定插入片段 ,通过体外 PCR扩增 2 3S r DNA片段 ,并用琼脂糖电泳分析 ,可以简便地鉴定 Actinobacteria。 展开更多
关键词 ACTINOBACTERIA pcr 荧光原位杂交 插入片段 微生物来源抗生素
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中国汉族人及维吾尔族人Rh血型基因结构多态性研究与分析 被引量:6
16
作者 王从容 曹琼 兰炯采 《广东医学》 CAS CSCD 2002年第11期1136-1138,共3页
目的 研究中国汉族及维吾尔族家系的RHD基因结构。方法 采用聚合酶链反应 -序列特异性引物扩增 (PCR -SSP)方法 ,对汉族和维族Rh阴性家系的D基因结构多态性进行研究。结果 中国人RHD基因结构具有多态性 ,特别是带有C的个体 ;82例RHD... 目的 研究中国汉族及维吾尔族家系的RHD基因结构。方法 采用聚合酶链反应 -序列特异性引物扩增 (PCR -SSP)方法 ,对汉族和维族Rh阴性家系的D基因结构多态性进行研究。结果 中国人RHD基因结构具有多态性 ,特别是带有C的个体 ;82例RHD血清学阴性个体中 ,完整携带十个外显子的有 14个样本 ,部分携带的有 6个样本 ,8个样本为完全缺失。结论 中国汉族人群与高加索人种有着显著的不同 。 展开更多
关键词 汉族人 维吾尔族人 RH血型 基因结构 多态性 聚合酶链反应-序列特异性引物扩增
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青香茅和五节芒内生固氮菌的分离与生理生化鉴定 被引量:23
17
作者 谭志远 傅琴梅 +3 位作者 彭桂香 原红娟 程艳波 江院 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期643-649,共7页
为研究青香茅(Cymbopogon caesius)和五节芒(Miscanthus floridulus)内生固氮菌的多样性,基于两种无氮培养基结合乙炔还原法从这两种牧草中分别分离到30株和36株菌.采用SDS-PAGE(Dodecyl sulfate sodium saltpolyacrylamide gel electro... 为研究青香茅(Cymbopogon caesius)和五节芒(Miscanthus floridulus)内生固氮菌的多样性,基于两种无氮培养基结合乙炔还原法从这两种牧草中分别分离到30株和36株菌.采用SDS-PAGE(Dodecyl sulfate sodium saltpolyacrylamide gel electrophoresis)全细胞蛋白电泳和IS-PCR(Insertion sequence-based PCR)指纹图谱将这66株内生固氮菌聚类为10个类群(I-X,每群3株以上,共61个聚群菌株)和3个未归类小组(共5个未聚群菌株).从10个聚类群和3个未归类小组中各选1株菌作为代表进行16S rDNA序列分析,发现它们与洋葱伯克霍尔德菌(Burkholderia cepacia)、阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)、固氮植物菌(Phytobacter diazotrophicus)、阿氏肠杆菌(Enterobacter asburiae)、织片草螺菌(Herbaspirillum seropedicae)、阪崎克洛诺菌(Cronobacter sakazakii)、水稻肠杆菌(Enterobacter oryzae)、肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)、溶解肠杆菌(Enterobacter dissolvens)、无乳固氮螺螺(Azospirillum amazonense)、都柏林克罗诺杆菌(Cronobacter dublinensis)等的相似性分别达97%以上,表明所分离内生固氮菌多样性高.进一步对它们进行生理生化测定,结果表明有些菌株具泌氨能力、产吲哚、解磷、解钾效果,在农业生产上具有一定的应用潜力. 展开更多
关键词 乙炔还原法 全细胞蛋白电泳 IS-pcr 内生固氮菌 固氮酶活性 微生物多样性 青香茅 五节芒
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胶孢炭疽菌T-DNA插入突变体库的构建及其分子分析 被引量:8
18
作者 黄贵修 薛迎春 卢昕 《热带作物学报》 CSCD 2008年第1期27-32,共6页
利用根癌农杆菌介导的T-DNA插入遗传转化体系转化杧果炭疽菌SC2菌株,共获得抗潮霉素B突变体4680个,平均每转化1.0×106个炭疽菌分生孢子可得到300~980个突变体,且潮霉素抗性在多次传代实验中得到稳定遗传。随机挑取38个突变体进行... 利用根癌农杆菌介导的T-DNA插入遗传转化体系转化杧果炭疽菌SC2菌株,共获得抗潮霉素B突变体4680个,平均每转化1.0×106个炭疽菌分生孢子可得到300~980个突变体,且潮霉素抗性在多次传代实验中得到稳定遗传。随机挑取38个突变体进行PCR检测,均可扩增出1条约1.2kb的目标谱带,说明突变体为T-DNA插入引起;进一步的Southern blot杂交分析结果表明,在随机挑选的20个突变体中,有1个(5%)为三拷贝T-DNA插入,4个(20%)为双拷贝插入,剩余的15个(75%)为单拷贝插入。 展开更多
关键词 胶孢炭疽菌 T-DNA 插入突变 pcr SOUTHERN杂交
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藤县药用野生稻内生固氮菌分离鉴定及系统发育分析 被引量:13
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作者 胡文哲 谭泽文 +2 位作者 王勇 徐羡微 谭志远 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期111-119,共9页
从广西梧州市藤县药用野生稻中筛选内生固氮菌,为微生物肥料生产收集菌种资源。采用3种无氮培养基经平板划线法筛选内生固氮菌;通过乙炔还原法测定其固氮酶活性;利用IS-PCR(Insertion sequence-based PCR)指纹图谱和全细胞蛋白电泳图谱... 从广西梧州市藤县药用野生稻中筛选内生固氮菌,为微生物肥料生产收集菌种资源。采用3种无氮培养基经平板划线法筛选内生固氮菌;通过乙炔还原法测定其固氮酶活性;利用IS-PCR(Insertion sequence-based PCR)指纹图谱和全细胞蛋白电泳图谱对获得的内生固氮菌进行聚类分析;根据16S r RNA基因序列分析确定其进化关系;使用分光光度计比色法检测其产生长素能力、产铁载体能力、溶磷能力和ACC脱氨酶活性。结果显示,从野生稻中筛选获得34株内生固氮菌分为5个类群,类群I和II各有8株,类群III、IV、V分别有2株、5株和11株,其固氮酶活性介于5.0和1 036.7 nmol/(m L·h)之间。类群I代表菌株HU33与无乳固氮螺菌(Azospirillum amazonense ATCC 35119T)相似性为97.13%;类群II代表菌株HU31与变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola DSM 15968T)相似性为99.71%;类群III代表菌株HU17与蒙氏假单胞菌(Pseudomonas monteilii ATCC 700476T)相似性为99.86%;类群IV代表菌株HU13与黄黄色杆菌(Xanthobacter flavus ATCC 35867T)相似性为100%;类群V代表菌株CM05与越南伯克霍尔德菌(Burkholderia vietnamiensis LMG 10929T)相似性为99.86%。药用野生稻内生固氮菌资源具有遗传多样性;有些菌株有较强的产生长素、产铁载体、ACC脱氨酶活性和溶磷能力,在农业生产上具有一定的应用潜力;类群I可能是一个新类群。 展开更多
关键词 药用野生稻 内生固氮菌 系统发育分析 全细胞蛋白电泳 IS-pcr
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两种菌落聚合酶链反应在抗体库筛选中的应用比较 被引量:3
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作者 薛国柱 窦科峰 +1 位作者 吕勇刚 药立波 《医学研究生学报》 CAS 2004年第12期1057-1058,1061,共3页
目的 :探讨两种菌落PCR方法在抗体库筛选中的应用价值。 方法 :分别以 5个阳性克隆细菌菌落直接悬浮于去离子水中及悬浮于含 0 .1%的TritonX 10 0后经水浴煮沸作为模板 ,进行PCR反应。同时提取质粒DNA ,进行双酶切鉴定。 结果 :5个克... 目的 :探讨两种菌落PCR方法在抗体库筛选中的应用价值。 方法 :分别以 5个阳性克隆细菌菌落直接悬浮于去离子水中及悬浮于含 0 .1%的TritonX 10 0后经水浴煮沸作为模板 ,进行PCR反应。同时提取质粒DNA ,进行双酶切鉴定。 结果 :5个克隆的菌落PCR及酶切鉴定均检测到目的基因。 结论 :菌落PCR可用于筛选阳性重组克隆。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 菌落 抗体库 目的基因
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