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Novel immonium type peptide coupling reagent: 5-(1H-benzotriazol-1-yloxy)-3,4-dihydro-l-methyl 2H-pyrrolium hexachloroantimonate (BDMP ) 被引量:1
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作者 李鹏 徐杰诚 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2000年第1期85-93,共9页
A novel immonium type coupling reagent, 5-(1H-benzotria-zol-1-yloxy )-3,4-dihydro-1-methyl 2H-pyrrolium hexachlo-roantimonate (BDMP) has been designed, synthesized and u-tilized to synthesize oligopeptides and biologi... A novel immonium type coupling reagent, 5-(1H-benzotria-zol-1-yloxy )-3,4-dihydro-1-methyl 2H-pyrrolium hexachlo-roantimonate (BDMP) has been designed, synthesized and u-tilized to synthesize oligopeptides and biologically active pep-tide both in solution and solid phase with satisfactory yield, low racemization and fast reaction rate. The estimation of racemization and the influence of several reaction parameters were studied by HPLC method using the model reaction: Z-Gly-Phe-OH + Val-OMe·HCl→Z-Gly-D/L-Phe-Val-OMe. It was shown that the reactivity of BDMP was much higher and the racemization was much lower than those of HOBt-based 'onium' reagents, even though its analogues BOMI. To further verified the effectiveness of BDMP, Leu-enkephalin was synthesized both in solution and solid phase using BDMP as coupling reagent. The proposed mechanism was also speculated. 展开更多
关键词 BDMP peptide coupling reagent immonium salt RACEMIZATION REACTIVITY
全文增补中
串联飞行时间质谱中亚胺离子的断裂特征及其在肽段鉴定中的作用 被引量:2
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作者 王勇 李水明 何曼文 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2014年第7期1010-1016,共7页
基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)产生的亚胺离子可以提供丰富的肽段组成信息,该方法通常用于基于数据库搜索的蛋白质鉴定,或者结合化学衍生法用于从头测序,因而在一定程度上限制了对亚胺离子的认识及应用。本研... 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)产生的亚胺离子可以提供丰富的肽段组成信息,该方法通常用于基于数据库搜索的蛋白质鉴定,或者结合化学衍生法用于从头测序,因而在一定程度上限制了对亚胺离子的认识及应用。本研究利用239个串联质谱探索MALDI-TOF/TOF中亚胺离子的断裂特征以及它们在肽段鉴定中的应用,发现在高能碰撞诱导解离条件下组氨酸等14种氨基酸可产生较强的亚胺离子信号(>50%阳性率),氨基酸的化学结构、位置效应和氨基酸残基个数是影响碎片离子强度的主要因素。此外,探讨了亚胺离子应用过程中的假阳性问题,提出亚胺离子相对强度的比较可以降低假阳性和提高肽段鉴定确定度,有助于完善目前的数据库搜索算法和辅助从头测序分析。 展开更多
关键词 亚胺离子 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 蛋白质鉴定 肽段鉴定
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谷氨酸甲基化修饰的基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱分析 被引量:1
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作者 王勇 李水明 +2 位作者 何曼文 冯里茹 韩庆国 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2013年第10期1505-1510,共6页
利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了枯草芽孢杆菌中的蛋白酶抑制剂和杆菌肽F两种蛋白及其翻译后修饰,发现在这两种蛋白质中共有5个肽段发生谷氨酸甲基化,其中肽段FELVVYDSEHK存在FE(Methylation... 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了枯草芽孢杆菌中的蛋白酶抑制剂和杆菌肽F两种蛋白及其翻译后修饰,发现在这两种蛋白质中共有5个肽段发生谷氨酸甲基化,其中肽段FELVVYDSEHK存在FE(Methylation)LVVYDSEHK和FELVVYDSE(Methylation)HK两种形式。结果表明,MALDI-TOF/TOF高能CID所提供的丰富断裂信息和全质量范围扫描对提高分析结果的确定性具有重要作用。此外,这5个甲基化肽段都可以检测到相对含量更高的非甲基化肽段,这为降低分析结果的假阳性提供了辅助判据。在低质量区检测到甲基化赖氨酸的亚胺相关离子m/z 98和143,说明发生了赖氨酸的甲基化;检测到m/z 116则提示发生了谷氨酸甲基化。 展开更多
关键词 谷氨酸甲基化 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 枯草芽孢杆菌 亚胺离子
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亚胺及其相关离子在区分赖氨酸和谷氨酰胺残基中的应用 被引量:1
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作者 李水明 何曼文 王勇 《质谱学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第3期256-261,共6页
完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸... 完全从头测序要求区分肽段中的同量异序氨基酸谷氨酰胺和赖氨酸,而这通常需要借助高分辨质谱。谷氨酰胺和赖氨酸都可以产生m/z 101亚胺离子和m/z 84亚胺相关离子,尽管已知赖氨酸亚胺离子m/z101有时强度较弱,以及m/z84离子可预示赖氨酸的存在,但该特征能否用于区分赖氨酸和谷氨酰胺仍存在争议。本工作以合成肽段和蛋白质胰酶水解肽段为研究体系,利用基质辅助激光解吸电离的高能碰撞诱导解离模式产生的亚胺及其相关离子的相对强度区分这两种氨基酸。结果表明:谷氨酰胺更易产生m/z101离子,而赖氨酸更易产生m/z84和m/z129离子。对于不同时含有赖氨酸和谷氨酰胺的肽段,使用m/z84离子与亚胺离子m/z101的相对强度比值,而非它们的绝对强度,以及m/z101离子的测量值,可以直接判断序列中存在的是赖氨酸还是谷氨酰胺。对于含有谷氨酰胺,并以赖氨酸结尾或含有漏切赖氨酸的肽段,该强度比可为序列中谷氨酰胺的个数和位置提供参考。因此,低质量区提供的亚胺及其相关离子信息有助于区分赖氨酸和谷氨酰胺。 展开更多
关键词 亚胺离子 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 赖氨酸 谷氨酰胺 同量异序氨基酸
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人工解析提高串联质谱鉴定肽段的数据利用度
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作者 王勇 李水明 +1 位作者 何曼文 冯里茹 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS 北大核心 2013年第5期538-544,共7页
为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离–串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表... 为降低蛋白质鉴定的假阴性,利用标准蛋白和实际样品,探讨影响基质辅助激光解吸电离–串联飞行时间质谱数据利用度的原因.发现误差设置偏小、翻译后修饰、异常酶解和氨基酸突变等是导致蛋白质数据库检索不匹配目标肽段的主要原因.实验表明,典型情况下一级和二级质谱误差可设定在0.3Da.对未与数据库匹配的串联质谱进行亚胺离子辅助的人工解析发现,色氨酸双氧化、丝氨酸乙酰胺化和半胱氨酸丙酰胺化等不常见修饰,酪氨酸与苯丙氨酸、天冬氨酸与谷氨酸两两之间的突变和非特异性酶解等现象,该研究可提高质谱鉴定的数据利用度. 展开更多
关键词 蛋白质组学 数据库搜索 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱 人工解析 亚胺离子
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