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4-苄基哌啶类拮抗剂选择性识别hCCR3的分子模拟 被引量：2
1
作者 李锦莲 王建萍 +2 位作者 胡冬华 邵琛 苏忠民 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2010年第8期1636-1642,共7页
以牛视网膜紫质X射线衍射晶体结构为模板,参考定位突变实验数据,采用配体支持同源模建(Ligand-supported homology modeling)方法构建了拮抗剂键合(Antagonist-bound)的人类趋化因子受体hCCR3和hCCR1的三维结构模型.将一系列1,4-二取代... 以牛视网膜紫质X射线衍射晶体结构为模板,参考定位突变实验数据,采用配体支持同源模建(Ligand-supported homology modeling)方法构建了拮抗剂键合(Antagonist-bound)的人类趋化因子受体hCCR3和hCCR1的三维结构模型.将一系列1,4-二取代哌啶类拮抗剂分别对接进优化后的hCCR3和hCCR1模型中,以配体在hCCR3中的结合自由能理论值对-lgIC50值进行线性回归,确定性系数r2为0.94.分析对接结果发现,配体主要通过疏水芳香作用与hCCR3结合,而4-苄基哌啶类拮抗剂对hCCR3产生选择性的主要原因在于配体的哌啶环与hCCR3中Tyr255(TM7)的苯酚侧链产生面对面的范德华作用,而且hCCR3中处于结合口袋的EL2区的疏水性也为拮抗剂对hCCR3的选择性做出了贡献. 展开更多
关键词 hccr3 hCCR1 4-苄基哌啶类拮抗剂 疏水性 分子模拟
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