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Cobalt-modified nitrogen-doped carbon nanotubes as bifunctional catalysts for one-pot synthesis of 2,5-diformylfuran from glucose
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作者 Trinh Hao Nguyen Dao Anh Le Nguyen +4 位作者 Duy Quoc Mai Mai Ngoc Thi Le Diep Dinh Le Ha Bich Phan Phuong Hoang Tran 《Journal of Energy Chemistry》 2025年第4期440-447,共8页
In the past century,industrial and economic growth relied heavily on fossil fuels such as coal,oil,and natural gas.As the society energy demands continue to grow,these fossil fuel reserves are depleted,leading to sign... In the past century,industrial and economic growth relied heavily on fossil fuels such as coal,oil,and natural gas.As the society energy demands continue to grow,these fossil fuel reserves are depleted,leading to significant environmental issues[1].Currently,sustainable biomass resources have attracted much attention as potential substitutes to fossil fuels for producing biofuels and commodity chemicals[2]. 展开更多
关键词 commodity chemicals fossil fuels diformylfuran fossil fuel one pot synthesis natural gasas bifunctional catalysts cobalt modified nitrogen doped carbon nanotubes
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桑树GASA基因家族全基因组鉴定及表达模式分析 被引量:1
2
作者 皇晶晶 王树昌 +4 位作者 林培群 娄德钊 耿涛 武华周 余文刚 《热带作物学报》 北大核心 2025年第6期1341-1353,共13页
GASA(gibberellic acid-stimulated Arabidopsis)是植物体内广泛存在的小分子多肽,在植物生长发育等过程中起重要作用,尤其在桑树芽休眠调控方面具有潜在价值,但目前对桑树中MaGASA基因在芽休眠过程中的功能了解有限。本研究旨在鉴定桑... GASA(gibberellic acid-stimulated Arabidopsis)是植物体内广泛存在的小分子多肽,在植物生长发育等过程中起重要作用,尤其在桑树芽休眠调控方面具有潜在价值,但目前对桑树中MaGASA基因在芽休眠过程中的功能了解有限。本研究旨在鉴定桑树GASA基因家族成员,解析其在芽休眠中的作用。采用生物信息学方法鉴定GASA成员,并分析其理化性质等特征,同时利用实时荧光定量PCR和转录组数据分析其表达模式。结果表明:在桑树中存在12个MaGASA家族成员(MaGASA1~MaGASA12),分布在8条染色体上;成员间酸碱存在差异、亲水性平均系数有正有负,但均含GASA保守结构域;进化树显示其与桃具有较近的亲缘关系;共线性分析显示,在MaGASA基因家族中存在3条共线性关系;MaGASAs启动子区域含响应光照、低温及多种激素的顺式作用元件;MaGASA家族成员具有组织和品种特异性,其中MaGASA12在桑芽中的表达量显著高于其他部位;转录组分析表明,在解除休眠过程中,MaGASA12表达量显著降低,推测该基因是桑树芽解除休眠的负调控基因;而MaGASA10表达量急剧上调,推测该基因可能是桑芽解除休眠的关键基因。通过实时荧光定量PCR技术对MaGASA10和MaGASA12在不同休眠阶段的样本表达量进行检测,结果进一步验证了转录组分析的结论,表明MaGASA10和MaGASA12可能与桑属冬芽休眠过程相关。研究结果为桑树MaGASA生物功能的深入研究及遗传育种提供理论参考。 展开更多
关键词 桑树 GASA基因家族 休眠解除 生物信息学 转录组
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辣椒GASA基因家族的鉴定及分析
3
作者 王田田 常雪瑞 +4 位作者 黄婉洋 黄嘉欣 苗如意 梁燕平 王静 《生物技术通报》 北大核心 2025年第4期166-175,共10页
【目的】研究辣椒(Capsicum annuum L.)GASA的基因结构和表达分析,为阐明CaGASA基因的生物学功能及进一步培育抗逆性强的辣椒品种提供参考。【方法】运用生物信息学方法对辣椒8个GASA进行鉴定,并分析它们的理化性质、系统发育关系、基... 【目的】研究辣椒(Capsicum annuum L.)GASA的基因结构和表达分析,为阐明CaGASA基因的生物学功能及进一步培育抗逆性强的辣椒品种提供参考。【方法】运用生物信息学方法对辣椒8个GASA进行鉴定,并分析它们的理化性质、系统发育关系、基因结构、保守基序、染色体位置、蛋白互作网络、基因同源性和启动子区域等,实时荧光定量PCR(realtime fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)验证辣椒GASA基因家族成员在不同组织、非生物胁迫和激素处理下的表达模式。【结果】8个CaGASA在辣椒5条染色体上不均匀分布,所有CaGASA蛋白都有一个共同的结构域GASA;亚细胞定位预测结果表明,CaGASA蛋白存在于细胞外区域;辣椒、拟南芥(Arabidopsis thaliana)、番茄(Solanum lycopersicum L.)、水稻(Oryza sativa L.)基因组的直系同源GASA基因共线性分析结果表明,辣椒与其他3个物种之间有14个共线性事件,CaGASA5与3个物种的GASA基因均具有共线性;顺式元件分析表明,GASA基因可能受到多种植物激素和胁迫的诱导;转录组数据分析显示,CaGASA在辣椒花和果实中的表达水平高于叶;RT-qPCR分析表明,CaGASA基因响应低温、高温胁迫和脱落酸(abscisic acid,ABA)、赤霉素(gibberellin,GA)、吲哚乙酸(indole acetic acid,IAA)和茉莉酸(jasmonic acid,MeJA)激素处理。【结论】辣椒GASA基因家族可能参与辣椒花发育,响应激素和耐高、低温胁迫的应答。 展开更多
关键词 辣椒 GASA基因家族 基因家族鉴定 生物信息学分析 表达分析
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基于GASA算法的水库除险加固工程决策分析 被引量:1
4
作者 王珍珍 《水电与新能源》 2025年第4期76-79,共4页
针对水库除险加固设计方案,以投资、工期、安全性和施工难易程度为准则,建立了水库除险加固工程多目标模糊均衡优化模型,采用融合遗传算法和模拟退火算法的多目标优化方法获得最优非劣解集。江西某水库实例研究表明:获得的非劣方案集能... 针对水库除险加固设计方案,以投资、工期、安全性和施工难易程度为准则,建立了水库除险加固工程多目标模糊均衡优化模型,采用融合遗传算法和模拟退火算法的多目标优化方法获得最优非劣解集。江西某水库实例研究表明:获得的非劣方案集能够全面反映投资、工期、安全性和施工难易程度之间关系,可作为方案决策基础。 展开更多
关键词 水库 除险加固 GASA算法 决策
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茶树GASA基因家族的生物信息学分析
5
作者 王艳 叶凡 +4 位作者 王坤 聂嘉玲 吴媛媛 刘国峰 刘慧娟 《信阳师范大学学报(自然科学版)》 2025年第1期24-33,共10页
GASA(Gibberellic acid-stimulated in arabidopsis)是植物特有的转录因子家族,与植物的生长、发育、抗逆密切相关。采用生物信息学方法,基于茶树的全基因组序列,共鉴定到了29个GASA基因,根据染色体排列,编号为CsGASA 1—CsGASA 29。系... GASA(Gibberellic acid-stimulated in arabidopsis)是植物特有的转录因子家族,与植物的生长、发育、抗逆密切相关。采用生物信息学方法,基于茶树的全基因组序列,共鉴定到了29个GASA基因,根据染色体排列,编号为CsGASA 1—CsGASA 29。系统发育分析、保守基序分析、共线性分析、启动子元件分析及表达分析显示:CsGASA分为3个亚家族,编码64~218个氨基酸;共鉴定到6个保守基序;有4个CsGASA来源于片段重复事件,5个CsGASA来源于串联重复事件;有53%的启动子元件与环境响应有关;有部分CsGASA基因受到干旱、低温和盐胁迫调控;CsGASA 3基因只在根处具有较高的表达量。 展开更多
关键词 茶树 GASA基因 进化分析 生物信息学分析
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一种GASA混合优化策略 被引量:37
6
作者 王凌 郑大钟 《控制理论与应用》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第4期552-554,共3页
结合遗传算法的并行搜索结构和模拟退火的概率突跳性 ,提出了一种高效的GASA混合优化策略 .基于典型TSP问题的仿真研究表明 ,混合策略的优化性能较单一算法和启发式算法有很大改善 .
关键词 遗传算法 GASA 混合优化策略 模拟退水算法
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山岭隧道围岩参数智能反演及稳定性分析 被引量:25
7
作者 王述红 董福瑞 +2 位作者 朱宝强 刘欢 张泽 《应用基础与工程科学学报》 EI CSCD 北大核心 2021年第5期1171-1185,共15页
隧道围岩参数的确定直接关系到围岩稳定性评价的准确性,为确保围岩力学参数取值的合理性,提出一种新的围岩参数智能反演模型.利用模拟退火算法(SA)的退火策略对遗传算法(GA)进行优化,组成GASA智能模型,以此对极限学习机(ELM)的初始权值... 隧道围岩参数的确定直接关系到围岩稳定性评价的准确性,为确保围岩力学参数取值的合理性,提出一种新的围岩参数智能反演模型.利用模拟退火算法(SA)的退火策略对遗传算法(GA)进行优化,组成GASA智能模型,以此对极限学习机(ELM)的初始权值和阈值进行优化;将GASA-ELM模型应用于重庆市兴隆隧道(ZK38+020)~(ZK38+010)断面围岩力学参数反演中,基于现场实测变形反演得出围岩力学参数,并输入到ANSYS中计算得到位移正算值,与已有模型进行对比;最后利用计算结果对ZK38+010断面围岩稳定性进行分析,预测了该断面的变形量和变形速率.结果表明:模型反演所得参数在ANSYS中正算结果与现场实测值相对误差均在5.4%以内,均优于已有研究中的GA-BP及BP模型,表明了反演结果合理可靠;而ZK38+010断面将在开挖后46d左右进入稳定阶段.研究成果可为山岭隧道围岩力学参数反演提供参考,具有理论意义和工程实用价值. 展开更多
关键词 隧道工程 围岩参数反演 遗传退火算法(GASA) 极限学习机(ELM) 围岩稳定性
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基于GASA算法的网络控制系统的控制器设计 被引量:10
8
作者 李毅 胡保生 彭勤科 《系统仿真学报》 CAS CSCD 2004年第7期1571-1575,1588,共6页
提出了一种基于遗传算法和模拟退火算法的混合策略,用于单包传输下的线性网络控制系统中远程PID控制器的设计。这种新的混合策略被称为GASA算法。由于网络导致的延迟存在,GASA算法被用于确定最佳的PID增益。在求解过程中,GASA算法在各... 提出了一种基于遗传算法和模拟退火算法的混合策略,用于单包传输下的线性网络控制系统中远程PID控制器的设计。这种新的混合策略被称为GASA算法。由于网络导致的延迟存在,GASA算法被用于确定最佳的PID增益。在求解过程中,GASA算法在各温度下依次进行GA和SA搜索,其中SA的初始解来自GA的进化结果,SA经过Metropolis抽样过程得到的解又成为了GA进一步进化的初始种群,而温度的更新由退温操作来控制。对设定的性能指标如超调量和调整时间的违背量将作为GASA适应度函数中的惩罚项。本文对基于Profibus-DP网络的网络控制系统进行测试,并与修正Ziegler-Nichols法的优化结果进行比较,结果表明在对网络导致的延迟没有任何先验知识的情况下,用于网络控制系统中远程控制器设计的GASA算法能够获得满意的控制效果。 展开更多
关键词 GASA 网络控制系统(NCS) 网络导致的延迟 单包传输 PROFIBUS-DP
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基于粗糙集的PPP项目风险分担方案选择研究 被引量:13
9
作者 尹航 李远富 赵冬梅 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2015年第9期9-15,共7页
为保证PPP项目的成功实施,公共部门和私营部门必须合理地分担风险。构建了一套适用于PPP项目的风险分担方案选择指标评审体系,设计了一种基于GASA和粗糙集理论的风险分担方案选择方法。引入GASA法解决数据离散化后对决策规则支持度低,... 为保证PPP项目的成功实施,公共部门和私营部门必须合理地分担风险。构建了一套适用于PPP项目的风险分担方案选择指标评审体系,设计了一种基于GASA和粗糙集理论的风险分担方案选择方法。引入GASA法解决数据离散化后对决策规则支持度低,影响决策准确性的问题。利用基于粗糙集和条件信息熵理论的方法计算权重,提高了适用性和可靠性,改良了GRA法的准确性。将求得权重和约简后数据代入GRA公式,选取适度值最高者为最优方案。 展开更多
关键词 公私合作制(PPP)项目 风险分担 粗糙集 遗传模拟退火算法(GASA) 灰色关联分析法(GRA)
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一类GASA混合策略及其收敛性研究 被引量:19
10
作者 王凌 郑大钟 《控制与决策》 EI CSCD 北大核心 1998年第6期669-672,共4页
结合模拟退火算法(SA)和遗传算法(GA),提出一类GASA混合优化策略,借助于非平稳马氏链理论证明混合算法的全局渐近收敛性,同时定性地分析了算法的优化效率。
关键词 模拟退火 GASA混合策略 收敛性 NP完全问题
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GASA基因超家族新成员——烟草抗菌肽基因的克隆及序列分析 被引量:3
11
作者 林世锋 任学良 +2 位作者 王东茂 张拓 王仁刚 《中国烟草学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2012年第3期97-102,共6页
抗菌肽可以增强植物对病原微生物的抵抗能力,本研究利用生物信息学方法,获得了烟草品种K326的3种抗菌肽cDNA序列(NtSN1a、NtSN1b和NtSN2a),并对其进行了序列分析。结果表明,3种抗菌肽cDNA序列均具有完整的开放读码框,NtSN1a和NtSN1b均编... 抗菌肽可以增强植物对病原微生物的抵抗能力,本研究利用生物信息学方法,获得了烟草品种K326的3种抗菌肽cDNA序列(NtSN1a、NtSN1b和NtSN2a),并对其进行了序列分析。结果表明,3种抗菌肽cDNA序列均具有完整的开放读码框,NtSN1a和NtSN1b均编码88个氨基酸,NtSN2a编码104个氨基酸。对推导的氨基酸序列分析发现,它们都具有典型的GASA基因超家族保守结构域,属于GASA基因超家族成员。系统进化分析表明,NtSN1a和NtSN1b与马铃薯抗菌肽snaking-1聚为一类,NtSN2a与马铃薯抗菌肽snaking-2聚为一类。这些结果为进一步研究抗菌肽基因的抑菌效应,比较其在烟草抗病防御反应中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 烟草 GASA基因超家族 抗菌肽 克隆 序列分析
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玫瑰GASA4-like基因的克隆及其序列分析 被引量:3
12
作者 张强 孟月娥 +3 位作者 李艳敏 王慧娟 王利民 王志勇 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第9期161-166,共6页
从大马士革玫瑰(Rosa damascena)中利用同源克隆结合RACE的方法首次获得了一个GASA4-like基因的cDNA和DNA序列全长(GenBank登陆号FJ595792,FJ595793),并利用TAIL—PCR的方法克隆了其部分启动予序列。结果表明,玫瑰GASA4-like基... 从大马士革玫瑰(Rosa damascena)中利用同源克隆结合RACE的方法首次获得了一个GASA4-like基因的cDNA和DNA序列全长(GenBank登陆号FJ595792,FJ595793),并利用TAIL—PCR的方法克隆了其部分启动予序列。结果表明,玫瑰GASA4-like基因包含4个外显子,3个内含子,开放阅读框为327bp,编码108个氨基酸序列。对推导的氨基酸序列分析发现,N末端1~26个氨基酸是一信号肽序列,c末端含有12个保守的半胱氨酸残基,具有GASA基因家族共同的一些结构特征。系统进化分析表明,玫瑰GASA4-like与分生组织中表达的GAsA蛋白聚为一类。启动子顺式作用调控元件分析表明,GASA4-like基因上游318bp的部分启动子含有诱导表达调控元件和一些转录因子的结合位点;最后,对GASA4-like基因可能的生物学功能进行了预测。 展开更多
关键词 玫瑰 GASA4-like 克隆 序列分析
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基于GASA混合优化策略的双层规划模型求解算法研究 被引量:14
13
作者 刘伟铭 姜山 《土木工程学报》 EI CSCD 北大核心 2003年第7期27-32,共6页
本文提出用遗传—模拟退火算法(GASA)混合优化策略来求解双层规划模型。混合优化策略结合了遗传算法的并行结构和模拟退火算法的概率突跳性,提高了找到全局最优解的可靠性和计算效率。数值模拟实验表明算法性能良好,GASA混合优化策略求... 本文提出用遗传—模拟退火算法(GASA)混合优化策略来求解双层规划模型。混合优化策略结合了遗传算法的并行结构和模拟退火算法的概率突跳性,提高了找到全局最优解的可靠性和计算效率。数值模拟实验表明算法性能良好,GASA混合优化策略求得全局最优解时的进化代数比单一的遗传算法减少约35%,比模拟退火算法的迭代次数减少约50%。 展开更多
关键词 双层规划 遗传算法 模拟退火算法 GASA混合优化策略 备用能力
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基于智能优化算法的设备布局设计 被引量:11
14
作者 柏甫荣 秦永法 《组合机床与自动化加工技术》 北大核心 2004年第6期50-52,55,共4页
制造系统的设备布局与生产率和生产成本密切相关 ,布局设计是制造系统设计者面临的关键问题之一。文章针对布局问题的平方分派模型 ,构建了一种布局设计的混合智能优化算法———遗传退火算法 ,并分析了算法实现的方法。实例表明遗传退... 制造系统的设备布局与生产率和生产成本密切相关 ,布局设计是制造系统设计者面临的关键问题之一。文章针对布局问题的平方分派模型 ,构建了一种布局设计的混合智能优化算法———遗传退火算法 ,并分析了算法实现的方法。实例表明遗传退火算法的高效性。 展开更多
关键词 制造系统 设备布局 遗传退火 优化 平方分派模型 GASA算法
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富含半胱氨酸的GASA小分子蛋白研究进展 被引量:11
15
作者 钟春梅 王小菁 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期1-8,共8页
GASA蛋白是植物特有的一类富含半胱氨酸的小分子蛋白,大多定位于细胞壁,在植物生长发育和激素信号转导过程中发挥重要作用。该蛋白具有富含12个半胱氨酸残基的GASA结构域,该结构域被认为是GASA蛋白维持空间结构和发挥功能的关键区域。... GASA蛋白是植物特有的一类富含半胱氨酸的小分子蛋白,大多定位于细胞壁,在植物生长发育和激素信号转导过程中发挥重要作用。该蛋白具有富含12个半胱氨酸残基的GASA结构域,该结构域被认为是GASA蛋白维持空间结构和发挥功能的关键区域。该文重点综述了植物GASA蛋白的分子结构、亚细胞定位和生物学功能,并对相关领域的研究进行了展望。 展开更多
关键词 GASA蛋白 富含半胱氨酸蛋白 小分子蛋白 赤霉素
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GASA-SVM改进算法及其在柴油机供油系统故障诊断中的应用 被引量:3
16
作者 何俊强 李建勇 +2 位作者 姜涛涛 代勤芳 唐超 《西南科技大学学报》 CAS 2011年第2期44-48,共5页
针对目前支持向量机(SVM)参数选择的盲目性,结合遗传算法GA的并行搜索和模拟退火算法SA的概率突跳特性,提出一种改进的基于遗传退火算法(GASA)混合策略优化支持向量机惩罚函数和核函数参数的GASA-SVM算法。利用柴油机供油系统油压波形... 针对目前支持向量机(SVM)参数选择的盲目性,结合遗传算法GA的并行搜索和模拟退火算法SA的概率突跳特性,提出一种改进的基于遗传退火算法(GASA)混合策略优化支持向量机惩罚函数和核函数参数的GASA-SVM算法。利用柴油机供油系统油压波形的实测数据,归一化处理后作为诊断模型的特征值,建立了基于GASA-SVM的柴油机供油系统故障诊断模型。通过与BP神经网络、RBF神经网络、SVM和GA-SVM故障诊断模型比较表明:应用GASA-SVM建立的故障诊断模型在故障识别准确性上优于其它网络模型,能够有效进行柴油机供油系统的故障诊断。 展开更多
关键词 遗传退火算法(GASA) 支持向量机(SVM) 供油系统 故障诊断
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谷子GASA基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应 被引量:4
17
作者 王东胜 张小朵 +2 位作者 尚炫辰 王振华 刘维仲 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期859-869,共11页
谷子(Setaria italica)抗逆性强,是我国种植的主要小杂粮之一,但其抗逆机理尚不清楚。GASA(gibberellic acid–timulated Arabidopsis)是植物体内广泛存在的一类小分子多肽,参与植物生长发育及逆境胁迫响应等多个生理过程。探明谷子体内... 谷子(Setaria italica)抗逆性强,是我国种植的主要小杂粮之一,但其抗逆机理尚不清楚。GASA(gibberellic acid–timulated Arabidopsis)是植物体内广泛存在的一类小分子多肽,参与植物生长发育及逆境胁迫响应等多个生理过程。探明谷子体内GASA的结构和功能可以为其抗逆机理的解析及品种选育提供理论依据。本研究采用生物信息学方法鉴定谷子中的GASA基因家族,对其序列、结构、进化地位及表达模式进行分析,同时利用实时定量PCR技术检测该家族基因在非生物胁迫下的表达特性。结果发现,谷子中存在12个GASA基因(SiGASA1~12),不均匀分布于6条基因支架(scaffold)上;SiGASAs启动子区含响应光照、逆境胁迫及多种激素的顺式作用元件;所编码蛋白为碱性、疏水性外泌蛋白,且均含GASA保守结构域;SiGASA基因家族成员组织表达模式存在差异,所有成员在芽和茎中的表达量均较低;SiGASA1~9参与谷子对干旱和盐胁迫的响应。研究结果为谷子中GASA生物功能的深入研究及遗传育种提供理论参考。 展开更多
关键词 谷子 GASA基因家族 胁迫响应 生物信息学
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乘用车发动机装配线多目标工艺优化 被引量:2
18
作者 宓为建 陈竹青 舒帆 《上海海事大学学报》 北大核心 2013年第2期84-88,共5页
针对传统装配线工艺优化中优化单一目标而忽略其他重要因素的缺陷,构建以产能最大化、负载均衡化、成本最低化为目标的乘用车发动机装配线多目标优化数学模型.根据乘用车发动机装配工序繁杂、工位数量多、工装工具昂贵、市场需求大的特... 针对传统装配线工艺优化中优化单一目标而忽略其他重要因素的缺陷,构建以产能最大化、负载均衡化、成本最低化为目标的乘用车发动机装配线多目标优化数学模型.根据乘用车发动机装配工序繁杂、工位数量多、工装工具昂贵、市场需求大的特点,运用遗传算法和模拟退火算法相结合的GASA算法进行求解.实例验证表明,该模型及算法能有效解决大规模乘用车发动机装配线的工艺优化问题. 展开更多
关键词 乘用车 发动机装配线 多目标 工艺优化 GASA算法
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基于GASA优化支持向量机的基准地价测算 被引量:3
19
作者 赖红松 吴次芳 《中国土地科学》 CSSCI 北大核心 2008年第8期54-59,共6页
研究目的:以江西省赣县县城商业用地为例,探讨支持向量机在基准地价测算中的应用。研究方法:支持向量机法和对比分析法。研究结果:支持向量机的测算精度明显高于传统的回归模型和BP网络模型方法。研究结论:该方法是可行有效的,能够用于... 研究目的:以江西省赣县县城商业用地为例,探讨支持向量机在基准地价测算中的应用。研究方法:支持向量机法和对比分析法。研究结果:支持向量机的测算精度明显高于传统的回归模型和BP网络模型方法。研究结论:该方法是可行有效的,能够用于基准地价测算。 展开更多
关键词 基准地价 支持向量机 GASA优化 赣县
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百合LdGASA1基因克隆与生物信息学及表达分析 被引量:1
20
作者 李雪艳 胡新颖 +5 位作者 白一光 王伟东 周俐宏 赵统利 杨迎东 刘威生 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2023年第14期4579-4586,共8页
本研究从百合小鳞茎发育不同阶段蛋白质组数据中,筛选出调控鳞茎发育的上调表达基因LdGASA1,对其进行克隆、生物信息学分析及表达分析。序列分析显示LdGASA1基因全长725 bp,编码区CDS序列为336 bp,编码111个氨基酸。结构域分析显示,LdGA... 本研究从百合小鳞茎发育不同阶段蛋白质组数据中,筛选出调控鳞茎发育的上调表达基因LdGASA1,对其进行克隆、生物信息学分析及表达分析。序列分析显示LdGASA1基因全长725 bp,编码区CDS序列为336 bp,编码111个氨基酸。结构域分析显示,LdGASA1第52至第111个氨基酸含有一个典型的GASA保守结构域。其理化性质分析显示,编码蛋白质理论等电点(pI)为9.1,不稳定系数为35.14,属于稳定的疏水性蛋白,亚细胞定位预测该蛋白最可能定位在细胞质中,其二级结构主要为无规则卷曲(65.86%)和α-螺旋(22.52%),另外含有少量延伸链(12.60)和β-折叠(9.01%)。通过RT-qPCR分析发现LdGASA1基因在小鳞茎出现前表达量相对较低,主要在小鳞茎形态建成和发育阶段表达,且在小鳞茎形态基本建成(35 d)时表达量达到最高。本研究结果为探索GASA基因调控百合生长发育的机制打下基础。 展开更多
关键词 百合 鳞茎发育 GASA基因 生物信息学分析 表达分析
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