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致鹅卵黄性腹膜炎E.coli fimFGH基因序列分析
1
作者
钱琨
张永志
+1 位作者
金文杰
秦爱建
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期854-857,共4页
为研究致鹅卵黄性腹膜炎大肠杆菌(E.coli)fimFGH基因的变异情况,本实验根据GenBank中登录的序列设计引物,PCR扩增了3株致鹅卵黄性腹膜炎性E.coli E0238、E0239、E0240Ⅰ型菌毛的fimFGH基因并测序。序列比对分析结果表明,3株细菌的fimF、...
为研究致鹅卵黄性腹膜炎大肠杆菌(E.coli)fimFGH基因的变异情况,本实验根据GenBank中登录的序列设计引物,PCR扩增了3株致鹅卵黄性腹膜炎性E.coli E0238、E0239、E0240Ⅰ型菌毛的fimFGH基因并测序。序列比对分析结果表明,3株细菌的fimF、fimG和fimH基因及其所编码的蛋白序列同源性达96%以上,其中fimH编码蛋白的序列同源性达98%以上。序列变异分析结果显示,FimH蛋白的变异主要集中分布在FimH粘附素N末端的4个氨基酸位点N91(S)/S91N99、A48V以及N156K,仅有E0239菌株发生了A48V变异;FimF、FimG蛋白各有一个多变区域,分别位于FimF蛋白的111位~124位氨基酸和FimG蛋白的4位~16位氨基酸之间,其中E0238、E0239菌株FimF蛋白发生了A111S的变异,E0238和E0240菌株FimG蛋白发生了C4R/V9L的变异,但变异的具体意义还需要进一步研究。
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关键词
鹅卵黄性腹膜炎
E.COLI
fimF
fimg
fimH
序列分析
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职称材料
题名
致鹅卵黄性腹膜炎E.coli fimFGH基因序列分析
1
作者
钱琨
张永志
金文杰
秦爱建
机构
扬州大学禽类预防医学省部共建教育部重点实验室/江苏省动物预防医学重点实验室
出处
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第11期854-857,共4页
基金
江苏省高校自然科学重大基础研究项目(07KJA23021)
文摘
为研究致鹅卵黄性腹膜炎大肠杆菌(E.coli)fimFGH基因的变异情况,本实验根据GenBank中登录的序列设计引物,PCR扩增了3株致鹅卵黄性腹膜炎性E.coli E0238、E0239、E0240Ⅰ型菌毛的fimFGH基因并测序。序列比对分析结果表明,3株细菌的fimF、fimG和fimH基因及其所编码的蛋白序列同源性达96%以上,其中fimH编码蛋白的序列同源性达98%以上。序列变异分析结果显示,FimH蛋白的变异主要集中分布在FimH粘附素N末端的4个氨基酸位点N91(S)/S91N99、A48V以及N156K,仅有E0239菌株发生了A48V变异;FimF、FimG蛋白各有一个多变区域,分别位于FimF蛋白的111位~124位氨基酸和FimG蛋白的4位~16位氨基酸之间,其中E0238、E0239菌株FimF蛋白发生了A111S的变异,E0238和E0240菌株FimG蛋白发生了C4R/V9L的变异,但变异的具体意义还需要进一步研究。
关键词
鹅卵黄性腹膜炎
E.COLI
fimF
fimg
fimH
序列分析
Keywords
yolk-sac peritonitis of geese
E.coli
fimF
fimg
fimH
sequence analysis
分类号
S862.61 [农业科学—野生动物驯养]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
致鹅卵黄性腹膜炎E.coli fimFGH基因序列分析
钱琨
张永志
金文杰
秦爱建
《中国预防兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
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