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DB-1310,a HER3-targeting antibody-drug conjugate,has synergistic anti-tumor activity with trastuzumab in HER2-and HER3-expressing breast cancer
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作者 Xi Li Liwen Liang +2 位作者 Zhongyuan Zhu Haiqing Hua Yang Qiu 《Cancer Biology & Medicine》 2025年第3期231-236,共6页
DB-1310 and trastuzumab synergistically inhibit breast cancer(BC)cell proliferation in vitro.HER3 overexpression has been described in patients with HER2-positive BC1.We determined the levels of HER2 and HER3 expressi... DB-1310 and trastuzumab synergistically inhibit breast cancer(BC)cell proliferation in vitro.HER3 overexpression has been described in patients with HER2-positive BC1.We determined the levels of HER2 and HER3 expression in BC using RNA-seq data from 1,082 BC patient samples in the TCGA dataset and 67 BC cell lines in the CCLE database(Supplementary material 1). 展开更多
关键词 synergistic anti tumor activity her targeting antibody drug conjugate tcga dataset TRASTUZUMAB DB her her expressing breast cancer her her expression
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GZMK-expressing CD8+T cells promote recurrent airway inflammatory diseases
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作者 Feng Lan 《四川生理科学杂志》 2025年第1期70-70,共1页
Inflammatory diseases are often chronic and recurrent,and current treatments do not typically remove underlying disease drivers1.T cells participate in a wide range of inflammatory diseases such as psoriasis2,Crohn... Inflammatory diseases are often chronic and recurrent,and current treatments do not typically remove underlying disease drivers1.T cells participate in a wide range of inflammatory diseases such as psoriasis2,Crohn's disease3,oesophagitis4 and multiple sclerosis5,6,and clonally expanded antigen-specific T cells may contribute to disease chronicity and recurrence,in part by forming persistent pathogenic memory.Chronic rhinosinusitis and asthma are inflammatory airway diseases that often present as comorbidities7.Chronic rhinosinusitis affects more than 10%of the general population8.Among these patients,20-25%would develop nasal polyps,which often require repeated surgical resections owing to a high incidence of recurrence9.Whereas abundant T cells infiltrate the nasal polyps tissue10,11,T cell subsets that drive the disease pathology and promote recurrence are not fully understood.By comparing T cell repertoires in nasal polyp tissues obtained from consecutive surgeries,here we report that persistent CD8^(+)T cell clones carrying effector memory-like features colonize the mucosal tissue during disease recurrence,and these cells characteristically express the tryptase Granzyme K(GZMK).We find that GZMK cleaves many complement components,including C2,C3,C4 and C5,that collectively contribute to the activation of the complement cascade.GZMK-expressing CD8^(+)T cells participate in organized tertiary lymphoid structures,and tissue GZMK levels predict the disease severity and comorbidities better than well-established biomarkers such as eosinophilia and tissue interleukin-5.Using a mouse asthma model,we further show that GZMK-expressing CD8^(+)T cells exacerbate the disease in a manner dependent on the proteolytic activity of GZMK and complements.Genetic ablation or pharmacological inhibition of GZMK after the disease onset markedly alleviates tissue pathology and restores lung function.Our work identifies a pathogenic CD8^(+)memory T cell subset that promotes tissue inflammation and recurrent airway diseases by the effector molecule GZMK and suggests GZMK as a potential therapeutic target. 展开更多
关键词 DISEASES AIRWAY expressing
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FOXO1-expressing neutrophils:a double-edged sword in traumatic brain injury
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作者 Dong-Dong Yang Meng Zhao +1 位作者 Jia-Xiu Du Yu Shi 《Military Medical Research》 2025年第7期1154-1156,共3页
Traumatic brain injury(TBI)remains a prominent global cause of mortality and disability,accounting for an estimated 69 million new cases annually[1].Both civilian and military populations face substantial health chall... Traumatic brain injury(TBI)remains a prominent global cause of mortality and disability,accounting for an estimated 69 million new cases annually[1].Both civilian and military populations face substantial health challenges due to TBI,particularly in military settings,where combat-related injuries introduce unique considerations for prevalence and management[2].Despite notable advancements in acute care,our comprehension of the complex pathophysiological mechanisms underlying the long-term eff ects of TBI remains inadequate[3].Although the initial mechanical impact triggers the cascade of injury,it is often the subsequent neuroinfl ammatory processes that propel progressive neuronal damage and lead to long-term neurological impairments[4,5]. 展开更多
关键词 Traumatic brain injury(TBI) FOXO1-high expressing neutrophils NEUROINFLAMMATION Acute brain damage
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中青年正常高值血压患者血管彩超参数与其心功能相关性分析
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作者 郑英娟 李朝喜 +3 位作者 刘星宇 胡敏霞 刘俊峰 温德惠 《影像科学与光化学》 2026年第1期59-65,共7页
目的:分析中青年正常高值血压人群血管彩超参数表达特征及与心功能相关性。方法:随机选择70例正常高值血压患者(Ⅰ期33例,Ⅱ期37例)、68例高血压患者及70例健康体检者作为对照组,收集并比较各组颈动脉IMT、弹性参数及心脏功能指标,使用P... 目的:分析中青年正常高值血压人群血管彩超参数表达特征及与心功能相关性。方法:随机选择70例正常高值血压患者(Ⅰ期33例,Ⅱ期37例)、68例高血压患者及70例健康体检者作为对照组,收集并比较各组颈动脉IMT、弹性参数及心脏功能指标,使用Pearson相关性分析血管彩超参数与心功能的相关性。结果:高血压组和高值血压组的血压、IMT、血管弹性指数等参数均高于对照组,且高血压组>高值血压Ⅱ期组>高值血压I期组(P<0.05)。Pearson相关性分析显示,血管参数与心功能指标存在显著相关性(P<0.01)。结论:本研究表明,中青年正常高值血压人群的血管参数与心功能存在相关性,提示此类人群可能存在心血管风险,为心血管病防治工作提供了新的思路和目标人群。 展开更多
关键词 中青年 高值血压 血管彩超 参数表达 血管损伤 心功能
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加权基因共表达网络分析结合机器学习筛选及验证骨关节炎生物标记物
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作者 张倩 黄东锋 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第5期1096-1105,共10页
背景:脂质代谢异常影响软骨细胞代谢,在骨关节炎的发生和进展中有着重要的作用,但目前其机制尚不明确。目的:采用加权基因共表达网络分析结合机器学习算法鉴定骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因,并进行初步验证。方法:采用加权基因共表... 背景:脂质代谢异常影响软骨细胞代谢,在骨关节炎的发生和进展中有着重要的作用,但目前其机制尚不明确。目的:采用加权基因共表达网络分析结合机器学习算法鉴定骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因,并进行初步验证。方法:采用加权基因共表达网络分析和微阵列数据的线性模型获得差异共表达基因,结合机器学习方法,最终筛选得到脂质代谢相关的特征基因。通过蛋白质互作网络分析,探究差异共表达基因的蛋白质互作网络关系;采用基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析探索差异共表达基因所在信号通路;运用免疫相关性分析鉴定特征基因与免疫细胞浸润模式;体外分子实验验证特征基因的mRNA和蛋白表达水平。结果与结论:①经数据标准化处理和主成分分析、加权基因共表达网络分析和微阵列数据的线性模型获得高/低表达的差异共表达基因123和110个;②运用逻辑回归、随机森林和支持向量机3种机器学习算法筛选得到特征基因37个,最终得到2个脂质代谢相关的特征基因SMPD3和CYP4F3;③蛋白质互作网络分析显示SMPD3和CYP4F3蛋白相互作用均较低;④基因本体论结果显示差异共表达基因主要富集在中性粒细胞脱颗粒、中性粒细胞免疫反应和应答、中性粒细胞激活和白细胞脱颗粒等;而京都基因与基因组百科全书富集分析提示差异共表达基因主要涉及细胞外基质受体的作用和黏附等关键通路;⑤基于基因表达数据的细胞类型亚型鉴定分析显示8种免疫细胞在骨关节炎中具有显著差异;相关性分析显示SMPD3与静息态树突状细胞显著正相关(r=0.44,P=3.6×10^(-3)),与中性粒细胞显著负相关(r=-0.48,P=1.7×10^(-3));而CYP4F3与单核细胞和中性粒细胞显著正相关(r=0.76,P=7.6×10^(-9);r=0.73,P=6.0×10^(-8)),与T细胞滤泡辅助细胞和静息态树突状细胞显著负相关(r=-0.38,P=0.01;r=-0.38,P=0.01);⑥体外分子实验证明,在骨关节炎组SMPD3 mRNA和蛋白水平显著增高,而CYP4F3降低;⑦结果显示,骨关节炎软骨细胞脂质代谢特征基因SMPD3和CYP4F3可作为骨关节炎靶向治疗及软骨修复或退变的潜在生物标记物,为深入探究国人群体中脂质代谢异常与骨关节炎的关系及临床靶向治疗提供新策略。 展开更多
关键词 骨关节炎 脂质代谢 加权基因共表达网络分析 机器学习 靶向治疗 软骨修复或退变
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Establishment of BHK-21 Stable Cell Lines Expressing T7 RNAP and GFP
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作者 宋玲玲 李欣 +4 位作者 王洪梅 高运东 王立群 仲跻峰 何洪彬 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第9期79-81,147,共4页
[Objective] The aim was to establish the BHK-21 stable cell lines expressing T7 RNAP and GFP.[Method]T7 RNAP gene was amplified from E.coli BL21(DE3)and inserted into FG12 vector.The lenti-virus recombinant plasmid ... [Objective] The aim was to establish the BHK-21 stable cell lines expressing T7 RNAP and GFP.[Method]T7 RNAP gene was amplified from E.coli BL21(DE3)and inserted into FG12 vector.The lenti-virus recombinant plasmid FG12-T7 RNAP plasmid was obtained via identification with double enzymes digestion and gene sequencing.The transient expressed T7 RNAP protein was determined by WB in 293T cells transfected with FG12-T7 RNAP plasmid.The recombinant FG12-RNAP lenti-virus was packaged up by transfecting the 293 cells with the recombinant vector FG12-RNAP and the helper plasmids via lipofectamine-2000,which was then used to infect BHK-21 cells.The positive cell clones were obtained after continuous screening by GFP.The expression of T7 RNAP gene was confirmed by Western blot.[Result]The cell line stably expressing the T7 RNAP gene was established by Western blot.[Conclusion]T7 RNAP gene could be stably expressed in eukaryotic cells and it provided a good platform to rescue RNA virus in vivo. 展开更多
关键词 GFP T7 RNAP Eukaryotic expression
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Excavating and Expressing the Individuality Culture in the Environmental Landscape Design of Residential Plot——Taking the Environmental Landscape Section of ‘Miaojiang·Yujinyuan’ Residential Plot in Taijiang County of Guizhou Province as an Example
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作者 王志泰 包玉 张静 《Journal of Landscape Research》 2009年第6期1-4,共4页
Local culture resources were excavated and expressed in environmental landscape section of ‘Miaojiang ·Yujinyuan’ residential plot in Taijiang County of Guizhou Province, with lusheng, Bronze drum and national ... Local culture resources were excavated and expressed in environmental landscape section of ‘Miaojiang ·Yujinyuan’ residential plot in Taijiang County of Guizhou Province, with lusheng, Bronze drum and national architecture as design elements. Making environmental landscape of residential plot, where the minority nationality lived in, possess culture agreement and emotion arrangement. 展开更多
关键词 RESIDENTIAL PLOT Environmental LANDSCAPE INDIVIDUALITY CULTURE Expression
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维持性血液透析患者血清成纤维细胞生长因子、可溶性生长刺激表达基因2蛋白、高敏肌钙蛋白Ⅰ水平与心室结构的相关性
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作者 刘飞 刘志勇 +2 位作者 任建光 宋晓辉 朱江涛 《陕西医学杂志》 2026年第1期83-86,共4页
目的:探讨维持性血液透析(MHD)患者血清成纤维细胞生长因子(FGF-23)、可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)、高敏肌钙蛋白Ⅰ(hs-cTnI)水平与心室结构的相关性。方法:选取81例MHD患者,另选同期90例健康者为对照组。比较两组受试者血清FGF... 目的:探讨维持性血液透析(MHD)患者血清成纤维细胞生长因子(FGF-23)、可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)、高敏肌钙蛋白Ⅰ(hs-cTnI)水平与心室结构的相关性。方法:选取81例MHD患者,另选同期90例健康者为对照组。比较两组受试者血清FGF-23、sST2、hs-cTnI水平,记录MHD组左心室肥厚(LVH)发生情况,多因素Logistic回归分析MHD患者左心室肥厚的影响因素。结果:血清FGF-23、sST2、hs-cTnI水平比较,MHD组均高于对照组。与非LVH组比较,LVH组血清FGF-23、sST2、hs-cTnI水平及LVMI升高(均P<0.05)。影响MHD患者LVH的因素有:透析龄长、高血清FGF-23、sST2、hs-cTnI水平及LVMI升高(均P<0.05)。血清FGF-23、sST2、hs-cTnI水平均与MHD患者LVH呈正相关(均P<0.05)。结论:维持性血液透析患者血清FGF-23、sST2、hs-cTnI水平均呈上升趋势,与左心室肥厚有关,且以上指标均为左心室肥厚的影响因素。 展开更多
关键词 维持性血液透析 成纤维细胞生长因子23 可溶性生长刺激表达基因2蛋白 高敏肌钙蛋白I 左心室肥厚
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Promoting Cultural Exchange Through Thangka
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作者 LI YUAN 《China Today》 2026年第1期72-75,共4页
A Tibetan art form bridges the past and present and connects cultures around the world.THANGKA,a unique form of Tibetan sacred painting,is gaining prominence globally due to its vibrant colors,exquisite craftsmanship,... A Tibetan art form bridges the past and present and connects cultures around the world.THANGKA,a unique form of Tibetan sacred painting,is gaining prominence globally due to its vibrant colors,exquisite craftsmanship,and profound religious and cultural significance.With the acceleration of globalization,this symbol of Tibetan culture that combines artistic expression with spirituality has become a bridge for cultural exchange between the East and the West.Recently,China Today spoke to Yixi Puncog,art collector and council member of the China Association for Preservation and Development of Tibetan Culture,to learn more about Thangka art,its role in international exchange,and how it is enhancing China’s cultural soft power. 展开更多
关键词 GLOBALIZATION cultural exchange Tibetan art yixi puncogart international exchange thangka artistic expression cultural soft power
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Specific dendritic spine modifications and dendritic transport:From in vitro to in vivo
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作者 Albert H.K.Fok Charlotte H.M.Lam Cora S.W.Lai 《Neural Regeneration Research》 2026年第2期665-666,共2页
Dendritic spines are small protrusions along dendrites that contain most of the excitatory synapses in principal neurons,playing a crucial role in neuronal function by creating a compartmentalized environment for sign... Dendritic spines are small protrusions along dendrites that contain most of the excitatory synapses in principal neurons,playing a crucial role in neuronal function by creating a compartmentalized environment for signal transduction.The plasticity of spine morphologies provides a tunable handle to regulate calcium signal dynamics,allowing rapid regulation of protein expression necessary to establish and maintain synapses(Cornejo et al.,2022).If excitatory inputs were to be located primarily on dendritic shafts,dendrites would frequently short-circuit,preventing voltage signals from propagating(Cornejo et al.,2022).It is thus not surprising that the structural plasticity of dendritic spines is closely linked to synaptic plasticity and memory formation(Berry and Nedivi,2017).While comprehensive in vitro studies have been conducted,in vivo studies that directly tackle the mechanism of dendritic transport and translation in regulating spine plasticity spatiotemporally are limited. 展开更多
关键词 excitatory synapses principal neuronsplaying compartmentalized environment establish maintain synapses cornejo dendritic spines regulate calcium signal dynamicsallowing regulation protein expression dendritic shaft
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Morphological characteristics and corresponding functional properties of homeostatic human microglia
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作者 Pariya Khodabakhsh Olga Garaschuk 《Neural Regeneration Research》 2026年第3期1112-1113,共2页
Microglia,the resident immune cells of the central nervous system,exhibit a wide array of functional states,even in their so-called“homeostatic”condition,when they are not actively responding to overt pathological s... Microglia,the resident immune cells of the central nervous system,exhibit a wide array of functional states,even in their so-called“homeostatic”condition,when they are not actively responding to overt pathological stimuli.These functional states can be visualized using a combination of multi-omics techniques(e.g.,gene and protein expression,posttranslational modifications,mRNA profiling,and metabolomics),and,in the case of homeostatic microglia,are largely defined by the global(e.g.,genetic variations,organism’s age,sex,circadian rhythms,and gut microbiota)as well as local(specific area of the brain,immediate microglial surrounding,neuron-glia interactions and synaptic density/activity)signals(Paolicelli et al.,2022).While phenomics(i.e.,ultrastructural microglial morphology and motility)is also one of the key microglial state-defining parameters,it is known that cells with similar morphology can belong to different functional states. 展开更多
关键词 functional properties multi omics techniques protein expressionposttranslational modificationsmrna profilingand homeostatic human microglia morphological characteristics resident immune cells homeostatic microgliaare protein expression
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嗜热拟青霉耐热阿拉伯木聚糖酶的异源表达及其对麦芽糖化的影响
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作者 杨行 张文姣 +4 位作者 闫协民 赵伟 江正强 闫巧娟 杨绍青 《食品工业科技》 北大核心 2026年第1期189-196,共8页
目的:发掘耐热木聚糖酶并探究其在麦芽糖化中的应用潜力。方法:克隆嗜热拟青霉(Paecilomyces thermophila)J18木聚糖酶(PtXynA)基因,将其在黑曲霉中进行异源表达,在5 L发酵罐中采用液体深层发酵制备重组酶(PtXynA),进一步探究酶的酶学性... 目的:发掘耐热木聚糖酶并探究其在麦芽糖化中的应用潜力。方法:克隆嗜热拟青霉(Paecilomyces thermophila)J18木聚糖酶(PtXynA)基因,将其在黑曲霉中进行异源表达,在5 L发酵罐中采用液体深层发酵制备重组酶(PtXynA),进一步探究酶的酶学性质,最后评价重组酶在麦芽糖化中的应用效果。结果:重组菌经液体深层发酵96 h后,木聚糖酶的酶活力达到904.0 U/mL,蛋白含量为1.4 mg/mL。重组酶在pH7.0和70℃下表现出最高酶活力,在pH5.5~9.0和75℃以下保持稳定。PtXynA显示出严格的底物特异性,对小麦阿拉伯木聚糖(1993.2 U/mg)的比酶活力最高,其次为燕麦木聚糖(1782.5 U/mg)、榉木木聚糖(1552.0 U/mg)和桦木木聚糖(1238.7 U/mg)。在麦芽糖化过程中添加木聚糖酶(200 U/g麦芽),麦芽汁的过滤时间和黏度分别降低了43.9%和10.8%。结论:PyXynA具有优良的酶学特性,在啤酒糖化过程中显示出较大应用潜力。 展开更多
关键词 嗜热拟青霉 异源表达 嗜热木聚糖酶 阿拉伯木聚糖酶 麦芽糖化
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The Differences of Expressing Love between Western and Chinese Culture
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作者 张立峰 《海外英语》 2012年第8X期208-210,共3页
Cultures are different between western countries and China,and people's ways of expressing their love are also different.Thes edifferences badly influence well communication between lovers and family members.By co... Cultures are different between western countries and China,and people's ways of expressing their love are also different.Thes edifferences badly influence well communication between lovers and family members.By comparing the different ways of expressing love between western people and Chinese,this paper tries to make readers deeply recognize and make use of the differences of expressing love. 展开更多
关键词 CULTURE DIFFERENCES expressing LOVE Chinese wester
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猫冠状病毒N蛋白单克隆抗体的制备及鉴定
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作者 刘佳佳 符建海 +4 位作者 孙亚杰 许丽文 李双双 白雪 胡博 《畜牧与兽医》 北大核心 2026年第1期107-114,共8页
为制备猫冠状病毒(FCoV)核衣壳蛋白(N)的单克隆抗体,本研究利用生物信息学预测工具对FCoV N蛋白序列进行分析,并通过原核表达制备N蛋白,将蛋白纯化处理后对BALB/c小鼠实施免疫,采用细胞融合手段获得杂交瘤细胞,并经过多轮亚克隆筛选流... 为制备猫冠状病毒(FCoV)核衣壳蛋白(N)的单克隆抗体,本研究利用生物信息学预测工具对FCoV N蛋白序列进行分析,并通过原核表达制备N蛋白,将蛋白纯化处理后对BALB/c小鼠实施免疫,采用细胞融合手段获得杂交瘤细胞,并经过多轮亚克隆筛选流程成功制备单克隆抗体。通过效价测定、亚型鉴定及特异性分析等方式对该抗体进行系统性检测评估。生物信息学分析显示,N蛋白由377个氨基酸组成,理化特性分析表明其为亲水性不稳定蛋白,二级结构组成中α-螺旋占10.61%、β-转角占14.85%、无规则卷曲达74.54%;结构特征分析表明该蛋白既无典型信号肽序列,也不含跨膜结构域,但存在多个具有潜在免疫原性的B淋巴细胞表位区域。基于此,制备并获得了分子量约为67 kDa的FCoV N蛋白,并成功筛选出1株单克隆抗体的杂交瘤细胞株(3A5),测定抗体效价为1∶256000,抗体亚型为IgG1型,Western blot及间接免疫荧光试验结果显示其能够与FCoV N蛋白和FCoV发生免疫反应。本研究结果为FCoV免疫学诊断、抗体药物研制提供了有力支撑。 展开更多
关键词 猫冠状病毒 N蛋白 生物信息学 原核表达 单克隆抗体
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小麦TaAPC11基因家族鉴定及TaAPC11-5B参与干旱胁迫的生物学功能研究
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作者 胡城祯 高维东 +4 位作者 孔斌雪 王建飞 车卓 杨德龙 陈涛 《作物学报》 北大核心 2026年第1期148-164,共17页
后期促进复合物(anaphase-promoting complex/cyclosome,APC/C)是一种由多亚基组成的cullin-RING型E3泛素连接酶,其中复合物亚基APC11含有RING结构域,可能通过泛素化特定的靶蛋白调控细胞周期,进而参与植物的非生物胁迫。本研究采用生... 后期促进复合物(anaphase-promoting complex/cyclosome,APC/C)是一种由多亚基组成的cullin-RING型E3泛素连接酶,其中复合物亚基APC11含有RING结构域,可能通过泛素化特定的靶蛋白调控细胞周期,进而参与植物的非生物胁迫。本研究采用生物信息学方法对小麦TaAPC11家族成员进行全基因组鉴定,并重点研究了TaAPC11-5B基因参与干旱胁迫调控的生物学功能。结果表明,小麦基因组中共鉴定到23个TaAPC11家族成员,可分为3个亚族,同一亚族成员具有相似的基因结构和Motif。共线性分析表明,片段复制促进TaAPC11基因家族的扩张,且在进化过程中受到纯化选择。顺式作用元件分析表明,TaAPC11基因家族成员的启动子区存在大量非生物胁迫响应元件。实时荧光定量(qRT-PCR)分析表明,TaAPC11-5B/6A2/4D1/3B2基因的转录表达均受到PEG-6000和ABA的显著诱导,其中TaAPC11-5B在PEG-6000处理后上调倍数最高。亚细胞定位表明,TaAPC11-5B定位于细胞核与细胞质中。对野生型(WT)和TaAPC11转基因水稻株系(TaAPC11-5B-OE)进行干旱胁迫处理,分析其抗旱表型发现,TaAPC11-5B-OE的存活率显著高于WT,株高显著增加,叶片卷曲程度减轻;生理指标测定发现,TaAPC11-5B-OE的相对电导率和丙二醛含量显著低于WT,脯氨酸含量显著高于WT。进一步通过DAB(3,3'-二氨基联苯胺)、NBT(氮蓝四唑)染色及抗氧化酶活性分析发现,PEG-6000处理后TaAPC11-5B-OE叶片的过氧化氢(H_(2)O_(2))和超氧阴离子(O_(2)^(-))含量低于WT,过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)和超氧化物歧化酶(SOD)的活性均显著高于WT。本研究为深入解析小麦TaAPC11-5B基因响应干旱胁迫的生物学功能提供了理论依据和材料基础。 展开更多
关键词 小麦 干旱胁迫 基因家族 TaAPC11-5B 表达模式 耐旱功能研究
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pcolcea和pcolceb基因在斑马鱼骨骼发育中的功能分化
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作者 王文秀 陈宇龙 +2 位作者 肖正雨 高泽霞 聂春红 《水产学报》 北大核心 2026年第1期22-33,共12页
【目的】探究硬骨鱼类前胶原蛋白酶增强因子(PCOLCE)的2种亚型(pcolcea和pcolceb)在斑马鱼骨骼发育中的作用。【方法】采用生物信息学分析、原位杂交、荧光定量PCR、CRISPR/Cas9基因编辑及显微型计算机断层扫描等分析技术和实验手段以... 【目的】探究硬骨鱼类前胶原蛋白酶增强因子(PCOLCE)的2种亚型(pcolcea和pcolceb)在斑马鱼骨骼发育中的作用。【方法】采用生物信息学分析、原位杂交、荧光定量PCR、CRISPR/Cas9基因编辑及显微型计算机断层扫描等分析技术和实验手段以明确斑马鱼pcolcea和pcolceb基因的序列特征、蛋白结构、组织表达以及功能缺失对骨骼发育的影响。【结果】pcolcea和pcolceb基因主要在脊椎、头部和胸鳍表达。与野生型斑马鱼相比,pcolcea^(-/-)斑马鱼和pcolcea^(-/-);pcolceb^(-/-)双突变斑马鱼脊椎骨的密度显著降低,而pcolceb^(-/-)斑马鱼与野生型相比无显著性差异。在pcolcea^(-/-)突变体的尾部椎骨中,bmp1b、col1a1a、col1a2、runx2b、alpl、sp7基因的表达显著下调,在pcolcea^(-/-);pcolceb^(-/-)双突变体的尾部椎骨中,bmp1b、col1a1a、col1a1b、col1a2、runx2b、entpd5a、bglap、sp7基因的表达均显著低于野生型斑马鱼。【结论】pcolcea基因功能的丧失会影响斑马鱼骨骼组织的正常矿化,且pcolcea和pcolceb基因的同时缺失会显著加重该表型。本研究揭示了pcolcea和pcolceb在斑马鱼骨骼发育中的作用,为进一步研究鱼类骨骼发育的分子调控机制提供了科学依据。 展开更多
关键词 斑马鱼 pcolcea pcolceb 骨骼发育 CRISPR/Cas9 基因表达
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糖尿病与肥厚型心肌病的因果关系:GWAS数据库信息分析
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作者 赵迎新 郎彤 +1 位作者 孟令丙 高玉霞 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第11期2933-2948,共16页
背景:糖尿病与肥厚型心肌病相互影响,糖尿病患者心血管并发症风险显著升高,但两者之间的因果关系及分子机制尚不明确。目的:利用孟德尔随机化方法,结合GWAS和GEO数据库数据,评估糖尿病对肥厚型心肌病的因果效应,通过生物信息学分析筛选... 背景:糖尿病与肥厚型心肌病相互影响,糖尿病患者心血管并发症风险显著升高,但两者之间的因果关系及分子机制尚不明确。目的:利用孟德尔随机化方法,结合GWAS和GEO数据库数据,评估糖尿病对肥厚型心肌病的因果效应,通过生物信息学分析筛选关键调控因子。方法:从最新的全基因组关联研究(GWAS,由美国国家人类基因组研究所和欧洲生物信息研究所合作建立)数据库中获取162个与糖尿病相关的单核苷酸多态性,这些数据来自24659例糖尿病患者和459939名对照参与者,获取肥厚型心肌病数据,包括507例肥厚型心肌病病例和489220名对照参与者,进行两样本孟德尔随机化分析,使用逆方差加权法评估糖尿病与肥厚型心肌病之间的因果关系。下载基因表达数据库(GEO)中的糖尿病数据集GSE184050和肥厚型心肌病数据集GSE160997,利用WGCNA探讨与糖尿病和肥厚型心肌病相关的重要模块及核心基因。通过GSEA探讨核心基因相关的富集术语和通路。将核心基因输入比较毒理学基因组数据库(CTD)网站以确定与核心基因相关的疾病。采用多种算法探讨HSF1在糖尿病和肥厚型心肌病中的作用。结果与结论:①以糖尿病为暴露因子,提取了160个单核苷酸多态性的分析结果,采用逆方差加权、MR-Egger和加权中位数回归方法评估遗传预测的糖尿病与肥厚型心肌病之间的因果关系,MR-Egger检验显示糖尿病与肥厚型心肌病之间存在显著因果关联,确定HSF1为糖尿病与肥厚型心肌病因果关系的核心生物标志物(P=0.01802898),加权中位数和逆方差加权法也提供了一致趋势。通过GEO数据库的数据验证确认了HSF1是同时影响糖尿病和肥厚型心肌病的潜在核心生物标志物。HSF1在糖尿病中高表达、在肥厚型心肌病中低表达。通过逐一移除单核苷酸多态性并重复孟德尔随机化分析的敏感性分析显示,没有单一单核苷酸多态性显著影响因果关系估计。将HSF1输入CTD网站以识别与核心基因相关的疾病,结果显示HSF1与糖尿病、2型糖尿病、肥厚型心肌病、心脏病、高血压、代谢紊乱和炎症等相关联。②研究主要基于国际大型数据库(如欧洲人群的GWAS和GEO表达谱数据),采用遗传工具变量进行因果推断,具有较强的科学性。中国生物医学研究应加强本土多组学数据的积累和整合,借助类似方法探索适用于中国人群的精准预防和治疗靶点。 展开更多
关键词 糖尿病 肥厚型心肌病 孟德尔随机化 HSF1 遗传学 差异表达基因
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东方蜜蜂微孢子虫烯醇化酶的分子特征、系统进化及基因表达模式
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作者 王梦怡 雷建朋 +7 位作者 冉又予 臧贺 陈金华 徐文华 付中民 陈大福 邱剑丰 郭睿 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第1期98-106,共9页
【目的】丰富东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)烯醇化酶(Enolase)的理化性质和蛋白分子特征,为NcEnolase基因的功能研究提供依据。【方法】通过PCR扩增NcEnolase的CDS通过Mega 11.0软件构建Enolase的进化树。利用相关软件预测和分析NcE... 【目的】丰富东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)烯醇化酶(Enolase)的理化性质和蛋白分子特征,为NcEnolase基因的功能研究提供依据。【方法】通过PCR扩增NcEnolase的CDS通过Mega 11.0软件构建Enolase的进化树。利用相关软件预测和分析NcEnolase蛋白的分子特征和理化性质。采用MEME软件鉴定和比较东方蜜蜂微孢子虫和其他9种真菌的Enolase的保守基序和结构域。利用RT-qPCR检测东方蜜蜂微孢子虫侵染中NcEnolase的相对表达量。【结果】成功扩增出NcEnolase的CDS;NcEnolase包含1242个核苷酸,可编码413个氨基酸;颗粒病微粒子虫和家蚕微孢子虫的Enolase同源性最高;NcEnolase蛋白的分子质量约为46.25 ku,脂溶系数为92.95,理论等电点为5.74,平均亲水系数-0.28,不含跨膜结构域和信号肽;NcEnolase含有32个丝氨酸磷酸化位点、8个酪氨酸磷酸化位点及4个苏氨酸磷酸化位点;NcEnolase的二级结构包含187个α-螺旋、59条延长链和167个无规则卷曲;NcEnolase的三级结构与模板A0A0F9WPC2.1.A之间的序列同源性为100%;东方蜜蜂微孢子虫、纳卡变形微孢子虫、熊蜂微粒子虫和兔脑炎微孢子虫的Enolase均包含12个相同的保守基序;NcEnolase含有1个enolase-like superfamily结构域,其他9种真菌均含有1个相同的enolase结构域;东方蜜蜂微孢子虫接种蜜蜂工蜂后相较于接种后1 d,中华蜜蜂工蜂中肠中NcEnolase的表达量在接种后2 d和接种后4 d均显著下调(P<0.05),意大利蜜蜂工蜂中肠中NcEnolase的表达量在接种后4 d上调(P>0.05)。【结论】NcEnolase是一种潜在的亲水性蛋白、非跨膜蛋白和胞内蛋白;NcEnolase在东方蜜蜂微孢子虫侵染中华蜜蜂和意大利蜜蜂工蜂的过程中动态表达且表现出不同的表达规律;NcEnolase可能参与东方蜜蜂微孢子虫的侵染过程。 展开更多
关键词 东方蜜蜂微孢子虫 烯醇化酶 意大利蜜蜂 中华蜜蜂 分子特征 表达模式
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重组微小囊担子菌氨肽酶DmpA高效催化生产L-肌肽
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作者 孙晓瑄 张瑞婕 +3 位作者 孙雯 陈凌宇 朱显峰 张保国 《食品工业科技》 北大核心 2026年第1期226-235,共10页
本实验研究了一种来自微小囊担子菌MCA4210(Cystobasidium minutum MCA 4210)的氨肽酶基因dmpA催化合成L-肌肽的能力,构建基因工程菌株,以L-组氨酸和β-丙氨酸甲酯盐酸盐为底物催化合成L-肌肽,旨在提高L-肌肽的合成效率。将Cystobasidiu... 本实验研究了一种来自微小囊担子菌MCA4210(Cystobasidium minutum MCA 4210)的氨肽酶基因dmpA催化合成L-肌肽的能力,构建基因工程菌株,以L-组氨酸和β-丙氨酸甲酯盐酸盐为底物催化合成L-肌肽,旨在提高L-肌肽的合成效率。将Cystobasidium minutum MCA 4210来源的DmpA经密码子优化后在大肠杆菌BL21(DE3)(Escherichia coli BL21(DE3))中异源表达,并通过与麦芽糖结合蛋白(Maltose Binding Protein,MBP)进行融合表达提高目的蛋白可溶性表达和粗酶活性,构建重组菌株BL21(DE3)-MBP-DmpA,对重组菌株进行诱导表达条件和转化条件的探究。结果表明,实验成功将目的基因片段与MBP相连得到重组菌株BL21(DE3)-MBP-DmpA,经诱导条件优化粗酶活达到了145 U;经转化条件优化L-肌肽产量高达55.72 g/L,产率达54.54%。本研究将具有L-肌肽合成功能的Cystobasidium minutum MCA 4210来源的DmpA在大肠杆菌中异源表达,通过添加助溶标签和条件优化实现了L-肌肽的高效生产,所得L-肌肽的产量为目前报道最高,为基因工程菌工业化生产L-肌肽提供了实验基础,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 氨肽酶 DMPA L-肌肽 麦芽糖结合蛋白 异源表达 酶催化转化
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恶性疟原虫PfSET5的生物信息学分析及蛋白纯化
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作者 朱文菊 李亚楠 +6 位作者 张俊梅 刘娇 谢金晶 张欣 董宏杰 尹昆 王琦 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第1期66-72,共7页
目的PfSET5属于SET家族,是一种包含SET结构域的组蛋白甲基转移酶。恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)PfSET5可以通过介导组蛋白H3的第64位赖氨酸(H3K64)的甲基化修饰,影响染色质结构并参与基因表达调控。本研究通过对PfSET5进行生物信... 目的PfSET5属于SET家族,是一种包含SET结构域的组蛋白甲基转移酶。恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)PfSET5可以通过介导组蛋白H3的第64位赖氨酸(H3K64)的甲基化修饰,影响染色质结构并参与基因表达调控。本研究通过对PfSET5进行生物信息学分析以及重组蛋白的表达纯化,阐明PfSET5蛋白的理化特性和结构特征,为后续的功能研究和靶向药物的开发奠定基础。方法从NCBI数据库获取PfSET5的氨基酸序列,采用Expasy,TMHMM,SignalP,NetPhos3.1等软件分析PfSET5的理化性质、跨膜区、信号肽、疏水性以及磷酸化位点预测。通过分子克隆构建pET28a-MBP-PfSET5重组蛋白,在大肠埃希菌BL21(DE3)中诱导表达,高压破碎后依次采用镍离子亲和层析、阴离子亲和层析以及分子筛排阻层析进行蛋白纯化。结果PfSET5蛋白共由178个氨基酸组成,带正电荷,无跨膜区,无信号肽,弱亲水性;系统发育树和多序列对比分析显示PfSET5在进化过程中比较保守;成功构建pET28a-MBP-PfSET5重组蛋白并获得大量高纯度蛋白。结论本研究成功实现了PfSET5蛋白的高效表达及纯化,为PfSET5蛋白甲基化分子机制的进一步研究和靶向药物开发奠定基础。 展开更多
关键词 PfSET5 异源表达 重组蛋白 蛋白纯化
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