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A web site for online training,technical support and scientific information for nucleic acidt esting:www.ebloodbank.com
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《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第S1期402-,共1页
关键词 WWW A web site for online training technical support and scientific information for nucleic acidt esting
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腹腔镜胆总管探查术与内镜十二指肠乳头括约肌切开术后胆总管结石复发率比较
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作者 周东海 刘京山 《中国内镜杂志》 2026年第2期58-62,共5页
目的评估腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)与内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST)联合腹腔镜胆囊切除术(LC),治疗胆囊结石伴胆总管结石患者的远期疗效。方法回顾性分析2018年1月-2020年12月该院272例符合特定标准的胆囊结石伴胆总管结石患者(... 目的评估腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)与内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST)联合腹腔镜胆囊切除术(LC),治疗胆囊结石伴胆总管结石患者的远期疗效。方法回顾性分析2018年1月-2020年12月该院272例符合特定标准的胆囊结石伴胆总管结石患者(胆总管直径为9~15 mm,结石最大径<15 mm)的临床资料,根据手术方式不同,将患者分为LCBDE+LC组和EST+LC组。重点比较两组患者胆总管结石复发情况。结果术后随访数据显示,LCBDE+LC组术后结石复发率为12.0%,较EST+LC组的15.6%低,但两组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论针对胆总管直径为9~15 mm的胆囊结石伴胆总管结石患者,LCBDE+LC与EST+LC两种术式均为安全、有效的治疗选择。临床决策时,建议结合患者个体特征进行综合评估,选取最适宜的手术方案。 展开更多
关键词 胆总管结石 内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST) 腹腔镜胆总管探查术(LCBDE) 腹腔镜胆囊切除术(LC) 复发率
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LC+LCBDE与ERCP+EST+LC对胆囊结石合并胆总管结石的疗效
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作者 艾龙龙 冉文斌 +2 位作者 秦占坤 柴源 张建民 《西藏医药》 2025年第6期57-58,共2页
目的比较内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)+经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)+腹腔镜胆囊切除术(LC)与LC+腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)对胆囊结石合并胆总管结石患者的疗效。方法选取2021年3月~2024年3月我院收治行手术的胆囊结石合并胆总... 目的比较内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)+经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)+腹腔镜胆囊切除术(LC)与LC+腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)对胆囊结石合并胆总管结石患者的疗效。方法选取2021年3月~2024年3月我院收治行手术的胆囊结石合并胆总管结石患者218例,按照手术方案的不同分为对照组(n=109)接受ERCP+EST+LC治疗,研究组(n=109)则接受LC+LCBDE治疗。对比两组的治疗效果。结果与对照组相比,研究组术中出血量、手术操作时间、肛门排气时间、治疗费用及住院时间均减少(P<0.05);结石完全清除率:对照组95.41%、研究组92.66%,(P>0.05);胆总管结石残留率:对照组(8.26%),研究组(1.83%),(P<0.05);并发症发生率:对照组(19.27%),研究组(9.17%,(P<0.05)。结论两种手术方案对胆囊结石合并胆总管结石患者,均能取得比较理想的效果,具有较高的结石完全清除率;且LC+LCBDE对患者的创伤更加轻微,术后恢复时间更短,胆总管结石残留率明显更低,并发症更少。 展开更多
关键词 胆结石 ERCP EST LC LCBDE
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基于EST复合菌的化工业废水处理实验研究
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作者 宋桂栋 《山西化工》 2025年第5期251-254,共4页
为了探索基于EST复合菌的化工业废水处理效果,通过介绍实验所需的材料与方法,深入分析了实验过程及结果。实验材料包括废水样品、活性淤泥及EST复合菌种,装置则由ABR与SBR系统构成,并进行了专门设计。实验方法涵盖了培菌、污泥驯化及正... 为了探索基于EST复合菌的化工业废水处理效果,通过介绍实验所需的材料与方法,深入分析了实验过程及结果。实验材料包括废水样品、活性淤泥及EST复合菌种,装置则由ABR与SBR系统构成,并进行了专门设计。实验方法涵盖了培菌、污泥驯化及正常运行实验三个阶段。通过对比分析启动实验与正常运行实验的数据,评估EST复合菌在处理化工业废水中的性能。研究结果表明,EST复合菌在提高废水处理效率、增强难降解有机物去除能力及稳定系统运行方面表现出色。 展开更多
关键词 EST复合菌 化工业 废水 处理 实验
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基于EST理论的高等数学课程三度混合式教学研究
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作者 杨莉 梁佩 《教育信息化论坛》 2025年第22期10-12,共3页
以高等数学课程教学改革为切入点,针对传统教学中存在的理论脱离实践、教学方法单一、评价体系不完善等问题,引入EST理论框架,结合“课程深度、课堂饱和度、学业紧张度”三度建设理念,构建新型混合式教学模式。通过为期两年的教学实践,... 以高等数学课程教学改革为切入点,针对传统教学中存在的理论脱离实践、教学方法单一、评价体系不完善等问题,引入EST理论框架,结合“课程深度、课堂饱和度、学业紧张度”三度建设理念,构建新型混合式教学模式。通过为期两年的教学实践,验证该模式在提升学生学习积极性、改善教学效果方面的显著作用,旨在为高职院校高等数学课程改革提供可借鉴的实施路径。 展开更多
关键词 EST理论 高等数学课程 混合式教学
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结合联合处理工艺与EST复合菌的化工废水处理研究
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作者 刘彤彤 《山西化工》 2025年第12期267-269,共3页
针对传统化工废水处理工艺对难降解污染物的去除效率低、系统稳定性不足等问题,提出一种以双层厌氧折流板反应器-序批式活性污泥法为核心的多级联合处理工艺与EST复合菌剂的协同处理策略。实际应用结果表明,该工艺对溶解性化学需氧量(C... 针对传统化工废水处理工艺对难降解污染物的去除效率低、系统稳定性不足等问题,提出一种以双层厌氧折流板反应器-序批式活性污泥法为核心的多级联合处理工艺与EST复合菌剂的协同处理策略。实际应用结果表明,该工艺对溶解性化学需氧量(COD)、五日生化需氧量(BOD_(5))、氨氮(NH_(3)-N)、总磷(TP)、苯系物及卤代烃的去除率分别达到93.6%、94.2%、87.4%、78.6%、84.9%和78.2%,较传统活性污泥法提升了14.4%~34.9%。同时,EST菌剂的投加使系统污泥质量浓度提升至4.8 g/L,微生物多样性指数达3.6,并显著增强了抗冲击负荷能力。该工艺通过多级厌氧-好氧环境与复合菌群的协同作用,实现了对复杂化工废水的高效、稳定处理,为工业废水治理提供了新的解决方案。 展开更多
关键词 化工废水 双层厌氧折流板反应器 序批式活性污泥法 EST复合菌剂
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单纯内镜乳头小球囊扩张术在胆总管较大结石中的应用效果及安全性
7
作者 沈俊松 王翔 +3 位作者 张莉莉 成凤干 刘新春 陈红芹 《中国内镜杂志》 2025年第12期56-63,共8页
目的分析内镜乳头小球囊扩张术(EPSBD)治疗胆总管较大结石(直径10~15 mm)的临床效果及安全性。方法选择2020年1月-2023年12月该院收治的胆总管较大结石(直径10~15 mm)患者142例,采用随机数表法分为观察组与对照组,各71例。观察组行EPSBD... 目的分析内镜乳头小球囊扩张术(EPSBD)治疗胆总管较大结石(直径10~15 mm)的临床效果及安全性。方法选择2020年1月-2023年12月该院收治的胆总管较大结石(直径10~15 mm)患者142例,采用随机数表法分为观察组与对照组,各71例。观察组行EPSBD(扩张球囊直径10 mm)治疗,对照组行内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST)联合球囊扩张术(EPBD)治疗。比较两组患者围手术期相关指标(取石成功率、取石时间、术后首次排便时间和住院时间),术前和术后48 h肝功能指标[总胆红素(TBiL)、谷丙转氨酶(GPT)和谷草转氨酶(GOT)],术后早期与远期并发症的发生情况,以及术后12个月内实施腹腔镜胆囊切除术(LC)情况。结果两组患者取石成功率、取石时间、术后首次排便时间和住院时间比较,差异均无统计学意义(P>0.05);术后48 h,两组患者血清TBiL、GPT和GOT水平明显低于术前,差异均有统计学意义(P<0.05),但两组间比较,差异均无统计学意义(P>0.05);观察组术后早期并发症发生率为11.27%,与对照组的8.45%比较,差异无统计学意义(P>0.05);观察组术后远期并发症发生率为2.82%,明显低于对照组的16.90%,差异有统计学意义(P<0.05);术后12个月内,观察组有5例实施了LC,对照组有4例实施了LC,两组间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论应用EPSBD治疗胆总管较大结石(10~15 mm),与EST+EPBD治疗方案相比,能获得相近的取石成功率,但前者有利于降低远期并发症的发生率。值得临床推广应用。 展开更多
关键词 内镜乳头小球囊扩张术(EPSBD) 胆总管较大结石(直径10~15 mm) 内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST) 术后并发症 奥迪括约肌 内镜治疗
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水稻抗白叶枯病基因Xa23的EST标记及其在分子育种上的利用 被引量:52
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作者 王春连 戚华雄 +4 位作者 潘海军 李进波 樊颖伦 章琦 赵开军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1996-2001,共6页
用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本JG30杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP的数据,筛选并合成12个EST标记的引物,进行亲本间多... 用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本JG30杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP的数据,筛选并合成12个EST标记的引物,进行亲本间多态性检测,找到2个在CBB23与JG30间有多态性的EST标记,C189和CP02662。用该标记对F2群体中的571个感病单株进行分子检测和连锁分析,结果表明这两个EST标记位于Xa23基因的两侧,C189靠着丝粒一侧,与Xa23的遗传距离为0.8cM;CP02662靠端粒一侧,与Xa23的遗传距离为1.3cM。将C189成功用于水稻分子育种实践,标记辅助选择的正确率接近100%,已培育出3个将Xa23基因与高产、优质、抗褐飞虱等性状聚合的水稻恢复系。 展开更多
关键词 水稻 XA23 水稻白叶枯病 EST标记 分子育种 标记辅助选择 近等基因系 日本水稻 抗白叶枯病 EST
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油茶种子EST文库构建及主要表达基因的分析 被引量:60
9
作者 谭晓风 胡芳名 +3 位作者 谢禄山 石明旺 张党权 乌云塔娜 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第1期43-48,共6页
为研究油茶种子在油脂转化高峰期的基因表达并分离克隆与油脂合成等有关的重要基因,以油茶优良无性系湘林1号和湘林4号近成熟种子为材料构建cDNA文库;随机挑取2327个克隆进行3′端测序构建EST文库。将数据完整并无X、N的1979条cDNA序列... 为研究油茶种子在油脂转化高峰期的基因表达并分离克隆与油脂合成等有关的重要基因,以油茶优良无性系湘林1号和湘林4号近成熟种子为材料构建cDNA文库;随机挑取2327个克隆进行3′端测序构建EST文库。将数据完整并无X、N的1979条cDNA序列与NCBI核酸数据库的非冗余序列进行同源性比较,确认763条cDNA序列与核酸数据库中其他物种的DNA序列具有很高或较高的同源性,可确认266种基因;有1216个克隆序列为未知功能的基因序列。各类基因表现出不同的表达丰度,其中贮藏蛋白基因、与基因表达调控相关的基因、抗逆相关基因、种子成熟和胚胎发育相关的基因等为高丰度表达,与脂肪酸代谢相关的基因等为中丰度表达,另外还有大量的其他基因和未知功能基因在种子中表达。各类基因表达的数量和趋势与种子接近发育成熟阶段相吻合。 展开更多
关键词 油茶 CDNA EST 文库 表达基因
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白菜EST-SSR信息分析与标记的建立 被引量:73
10
作者 忻雅 崔海瑞 +4 位作者 卢美贞 姚艳玲 金基强 林容杓 崔水莲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期549-554,共6页
数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SS... 数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71·5%和37·5%。设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46·7%。此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。 展开更多
关键词 白菜 EST SSR信息 标记
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茶树EST-SSR的信息分析与标记建立 被引量:89
11
作者 金基强 崔海瑞 +4 位作者 陈文岳 卢美贞 姚艳玲 忻雅 龚晓春 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期17-23,共7页
在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,... 在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%。本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的。 展开更多
关键词 茶树 EST SSR信息 标记建立
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荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发 被引量:56
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作者 孙清明 马文朝 +6 位作者 马帅鹏 赵俊生 白丽军 陈洁珍 蔡长河 向旭 欧良喜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第19期4037-4049,共13页
【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDN... 【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDNA文库中的1 331条Unigene(惟一序列)中搜索SSR位点。利用软件Primer primer5.0设计EST-SSR引物。选用16份表型差异较大的荔枝种质资源检测引物的有效性及多态性,利用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)进行片段分离。【结果】荔枝的1 331条EST序列中共搜索出220个SSR位点,分布于189条EST中,出现频率是16.53%。这些EST-SSR的平均长度为18.43 bp,平均分布频率1/4.42 kb。在1—6 bp的重复基元中,二核苷酸和三核苷酸重复类型占主导地位,共占总SSR的69.09%,二者出现的频率分别为37.27%和31.82%。共观察到72种重复基元,出现频率最高的是GA/TC(16.82%);其次是AG/CT、A/T、AT/TA及GAA/TTC,频率分别为14.55%、11.82%、5.00%和3.64%。不同核苷酸数目的重复基元的重复次数差异很大。设计、合成150对EST-SSR引物,122对(81.33%)引物在荔枝中获得有效扩增,100对引物具有多态性。【结论】荔枝EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高。本研究为利用EST-SSR标记开展荔枝遗传研究提供了100对EST-SSR引物,并为进一步开发荔枝EST-SSR标记提供了含SSR位点的候选序列。 展开更多
关键词 荔枝 EST SSR
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小麦EST-SSR标记的开发和遗传作图 被引量:41
13
作者 潘海涛 汪俊君 +2 位作者 王盈盈 齐照良 李斯深 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期452-461,共10页
【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18—2007.2.4)进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软... 【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18—2007.2.4)进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。【结果】在265362条普通小麦EST序列中,共发现6314个SSR,占整个EST数据库的2.38%。其中二核苷酸、三核苷酸重复序列最多,分别为2237(35.43%)和2084(33.01%)个。二核苷酸重复中,以GA/CT和AG/TC出现频率最高、分别占SSR总数的17.85%和10.37%,其次是CA/GT(4.07%)和AC/TG(2.53%);三核苷酸重复中,CAA/GTT(3.93%)、CGG/GCC(3.83%)、CGC/GCG(3.36%)、GGC/CCG(3.14%)、CTT/GAA(2.53%)、TGC/ACG(2.27%)以较高的频率出现。根据筛选得到的微卫星序列共设计了596个EST-SSR引物对,选择其中95分以上的194个合成。PCR检测表明,165个引物对(85%)可以扩增出稳定清晰的带型;在RIL群体中检测到21个EST-SSR引物26个位点有多态性,将其中的23个位点整合到已有的小麦遗传图谱上。【结论】开发了165个小麦EST-SSR新标记,EST序列是小麦SSR标记的重要来源。 展开更多
关键词 小麦 EST—SSR 分子标记 RIL 遗传图谱
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橡胶树EST-SSR标记的开发与应用 被引量:56
14
作者 安泽伟 赵彦宏 +2 位作者 程汉 李维国 黄华孙 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期311-319,共9页
通过对橡胶树10778条EST序列进行拼接,共得到Unigene3090条,从中发掘出分布于353条Unigene的430个EST-SSR位点,SSR发生频率为11.42%,平均分布距离为3.93kb。在橡胶树EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占63.49%、32... 通过对橡胶树10778条EST序列进行拼接,共得到Unigene3090条,从中发掘出分布于353条Unigene的430个EST-SSR位点,SSR发生频率为11.42%,平均分布距离为3.93kb。在橡胶树EST-SSR中,二核苷酸和三核苷酸重复是主要的重复类型,分别占63.49%、32.09%。TC/AG、CT/GA和CTT/GAA、AAG/TTC、AGA/TCT是二、三核苷酸的优势重复类型。利用PRIMER5.0设计引物148对,随机挑选21对引物进行合成,并用其中15对扩增较好的引物,通过变性聚丙烯酰胺凝胶结合银染的方法对44个橡胶树无性系进行了遗传多样性检测,构建了聚类分析树状图。研究结果表明,从橡胶树EST中开发SSR标记是有效、可行的,文章所开发的EST-SSR引物可用于橡胶树遗传分析研究。 展开更多
关键词 橡胶树 SSR EST
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油茶FAD2基因全长cDNA的克隆和序列分析 被引量:40
15
作者 谭晓风 陈鸿鹏 +6 位作者 张党权 曾艳玲 李魏 蒋瑶 谢禄山 胡孝义 胡芳名 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第3期70-75,共6页
FAD2基因控制油酸转化为亚油酸,是油茶油脂合成代谢的关键酶基因。在构建的油茶EST文库基础上,采用5′RACE和交错延伸PCR技术获得了油茶FAD2基因的全长cDNA克隆。该基因序列长1682bp,开放阅读框为1149bp,编码382个氨基酸,并且具有FAD2... FAD2基因控制油酸转化为亚油酸,是油茶油脂合成代谢的关键酶基因。在构建的油茶EST文库基础上,采用5′RACE和交错延伸PCR技术获得了油茶FAD2基因的全长cDNA克隆。该基因序列长1682bp,开放阅读框为1149bp,编码382个氨基酸,并且具有FAD2特有的保守序列和相关特征。经过比对分析,发现油茶的FAD2基因与其他植物的FAD2基因具有较高的相似性。 展开更多
关键词 油茶 EST文库 FAD2基因 RACE 交错延伸PCR 基因克隆
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从小麦EST序列中开发新的SSR引物 被引量:67
16
作者 陈军方 任正隆 +1 位作者 高丽锋 贾继增 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期154-158,共5页
小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs... 小麦EST数量的迅速增加为开发新的SSR标记提供了宝贵的数据资源 ,本实验从国际小麦族EST协作网 (ITEC)上公布的 10 380条EST序列中检索到 4 4 4条含有SSR的序列 ,检出率为 4 1%。其中含二核苷酸重复单元和三核苷酸重复单元的SSR ESTs分别为 34条 (7 7% )和 347条 (78 0 % )。利用这些SSR ESTs序列共设计 135对cSSR引物 ,其中 82对在小麦上有扩增产物 ,占所设计引物总数的 6 0 8%。利用小麦缺体 四体 ,32对cSSR引物被定位到小麦除 2D、4B和 4D外的 18条染色体上。 展开更多
关键词 EST SSR-ESTs cSSR引物 小麦
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梨EST-SSR标记的开发及其在梨品种遗传多样性分析中的应用评价 被引量:45
17
作者 王西成 姜淑苓 +4 位作者 上官凌飞 曹玉芬 乔玉山 章镇 房经贵 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第24期5079-5087,共9页
【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条... 【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条件的序列选出,利用Primer3.0Plus软件设计48对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物克隆与测序,以验证其真实性。【结果】1293条梨的EST序列中含有SSR位点的序列为82条,SSR位点92个。二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,分别占48.91%、17.39%和17.39%。48对引物中有31对引物能扩增出理想的PCR产物,其中27对引物扩增条带具有多态性。同时发现11对引物中,有83.87%的片段具有相应的SSR位点。聚类结果表明,梨被明显地区分成东方梨和西方梨两大群,分类效果明显。【结论】梨EST-SSR标记开发效率较高,是梨SSR标记开发的重要措施,对于梨品种的鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。 展开更多
关键词 EST SSR 遗传多样性
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草莓EST-SSR标记开发及在品种遗传多样性分析中的应用 被引量:39
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作者 董清华 王西成 +3 位作者 赵密珍 宋长年 葛安静 王静 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第17期3603-3612,共10页
【目的】探讨草莓EST序列中SSR位点的分布规律,开发草莓EST-SSR引物,并分析其在草莓品种遗传多样性研究中的应用。【方法】从NCBI公共数据库下载草莓表达序列标签(expressed sequence tag,EST)55 750条,利用MISA软件查找SSR位点,并利用P... 【目的】探讨草莓EST序列中SSR位点的分布规律,开发草莓EST-SSR引物,并分析其在草莓品种遗传多样性研究中的应用。【方法】从NCBI公共数据库下载草莓表达序列标签(expressed sequence tag,EST)55 750条,利用MISA软件查找SSR位点,并利用Primer3.0 Plus软件设计60对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物进行克隆和测序,以验证其真实性。【结果】55 750条草莓EST序列含有SSR位点的序列1 334条,SSR位点1 490个。其中,二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,分别占36.17%、26.51%和19.87%。60对引物中有42对引物能在20个草莓品种中扩增出理想的PCR产物,其中36对引物扩增条带具有多态性。利用11对验证的EST-SSR引物分析了20个草莓品种的亲缘关系。【结论】草莓EST-SSR标记的开发对于草莓品种鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。 展开更多
关键词 草莓 EST SSR 遗传多样性
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基于EST信息的百合SSR标记的建立 被引量:42
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作者 杨素丽 明军 +2 位作者 刘春 穆鼎 李名扬 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1069-1074,共6页
依据已知的百合EST(expres sedsequence tags)序列信息,开发新的SSR(simple sequence re-peats)标记,在NCBI的EST数据库1688条EST中检索到98条含有101个SSR的序列,SSR的检出率为5.98%,其中三核苷酸重复类型占主导地位,出现频率为2.84%。... 依据已知的百合EST(expres sedsequence tags)序列信息,开发新的SSR(simple sequence re-peats)标记,在NCBI的EST数据库1688条EST中检索到98条含有101个SSR的序列,SSR的检出率为5.98%,其中三核苷酸重复类型占主导地位,出现频率为2.84%。EST-SSR的重复基元共搜索到47种,其中三核苷酸重复基元类型最为丰富,大约占重复基元类型总数的一半。利用部分EST-SSRs序列共设计23对SSR引物,以铁炮百合‘Snow Queen’DNA为模板,对引物进行筛选,其中18对引物有扩增产物,占所设计引物总数的78.26%;进一步用这些引物在5个杂种系列13个百合品种进行多态性测试,显示多态性的引物占可扩增引物的66.7%。本研究结果证明了基于百合EST信息建立SSR标记是一种有效而又可行的方法。 展开更多
关键词 百合 EST SSR 引物设计
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用EST-SSR分子标记技术构建大白菜核心种质及其指纹图谱库 被引量:48
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作者 李丽 何伟明 +4 位作者 马连平 刘庞源 徐海明 徐家柄 郑晓鹰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期76-88,共13页
利用EST-SSR分子标记对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行分析研究。构建大白菜种质资源的核心种质并且形成核心种质的EST-SSR指纹图谱库。结果表明利用4组鉴定白菜品种的EST-SSR的特异性标记组合,获得... 利用EST-SSR分子标记对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行分析研究。构建大白菜种质资源的核心种质并且形成核心种质的EST-SSR指纹图谱库。结果表明利用4组鉴定白菜品种的EST-SSR的特异性标记组合,获得近158个EST-SSR多态的标记,对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行核心种质的构建提供了分析数据。形成的核心种质包括168份样品,占库存资源的8.8%,它的多态位点百分率保持了原群体的100%。所构建的核心种质涵盖了原资源的绝大部分区域来源的品种,包含了早、中、晚熟品种中所有典型的大白菜类型和其相关的特征特性。并进一步进行了核心种质资源遗传多样性分析。核心种质的EST-SSR指纹图谱库中,每一份样品的指纹都是唯一的,为登记、评价、整理、分发、繁殖等种质资源库的管理和育种者对其材料的利用提供了重要的有价值的信息。EST-SSR标记组合是构建中国大白菜核心种质及其指纹图谱的经济、高效的方法。 展开更多
关键词 大白菜 EST—SSR 核心种质 指纹图谱
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