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应用nested和touch down PCR技术分离牦牛CAPN1大亚基基因EST 被引量:6
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作者 蔡欣 吴建平 +3 位作者 徐明旭 张利平 汪虹英 刘雅楠 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2005年第2期14-18,共5页
 钙激活中性蛋白酶1(CAPN1)基因是影响肉嫩度的侯选基因。根据GeneBank中已公布的CAPN1基因cDNA序列设计同源PCR引物,通过RT,nested和touch-downPCR技术从牦牛肌肉组织总RNA中分离目的序列,与pGEM-T-easy载体连接后转化DH5α感受态菌株...  钙激活中性蛋白酶1(CAPN1)基因是影响肉嫩度的侯选基因。根据GeneBank中已公布的CAPN1基因cDNA序列设计同源PCR引物,通过RT,nested和touch-downPCR技术从牦牛肌肉组织总RNA中分离目的序列,与pGEM-T-easy载体连接后转化DH5α感受态菌株,通过PCR扩增、限制性酶切和测序分析鉴定阳性克隆。分离到的基因片段为牦牛CAPN1大亚基的部分编码序列,在GeneBank中的注册号为AY197555,与奶牛、人、食蟹猴、小鼠、绵羊以及大鼠相应序列的同源性分别为98%,89%,89%,83%,96%和81%,在不同物种之间具有较强的保守性。CAPN1基因EST的分离为进一步研究牦牛CAPN1基因奠定了基础。此研究表明,在总RNA质量不理想的情况下,同时采用这2种技术可以较大限度地获取目的序列。 展开更多
关键词 nested和touch-down PCR EST分离 CAPN1大亚基基因 牦牛
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Cloning and Sequence Analysis of Lactate Dehydrogenase C(LDH-C)Gene from Black-lipped Pika in Western Sichuan Plateau 被引量:1
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作者 贺庆华 徐亚欧 +2 位作者 郑玉才 陈锋 张文磊 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第6期63-66,共4页
[Objective] The aim was to lay a foundation for research of contraceptive rodenticide with LDH-C4 as target protein. [ Method] EST sequence of LDH-C gene from black-lipped pika was cloned by PCR with degenerate primer... [Objective] The aim was to lay a foundation for research of contraceptive rodenticide with LDH-C4 as target protein. [ Method] EST sequence of LDH-C gene from black-lipped pika was cloned by PCR with degenerate primers; then the full length open reading frame (ORF) and 3'UTR sequence were cloned by RACE technique. [ Result] The full length cDNA was 1 498 bp containing an ORF of 996 bp and a 3'UTR of 486 bp. The ORF encoded a polypeptide of 332 amino acids. The alignment of LDH-C gene ORF nucleotide sequences from different species showed that the gene was conserved even between large taxons. The phylogenic tree showed that black-lipped pika LDH-C was closer to prima- tes and artiodactyla than to rodents. [Conclusion] cDNA sequence of LDH-C gene from black-lipped pika was cloned successfully. 展开更多
关键词 LDH-C gene RACE EST Sequence analysis
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武汉市产业结构偏离-份额Esteban模型分析 被引量:1
3
作者 张飞鹏 《生产力研究》 2015年第2期76-79,104,共5页
产业结构调整是推动区域经济发展的重要动力。文章选取了2006—2013年期间湖北省和武汉市的相关数据,运用偏离-份额Est eban模型分析武汉市三次产业在产业结构调整中呈现出的特点。研究发现:武汉市第一产业缺乏比较优势和结构优势。武... 产业结构调整是推动区域经济发展的重要动力。文章选取了2006—2013年期间湖北省和武汉市的相关数据,运用偏离-份额Est eban模型分析武汉市三次产业在产业结构调整中呈现出的特点。研究发现:武汉市第一产业缺乏比较优势和结构优势。武汉市第二产业已成为武汉市的主导产业,但是专业化的程度还不够高。武汉市第三产业的结构还不够合理,但是该产业已经出现了成为武汉市未来主导产业的趋势了。 展开更多
关键词 武汉 产业结构 偏离-份额Est eban模型
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The Hungarian Community in Ferrara at the Estes Court (15-16th Centuries)
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作者 Enrica Guerra 《Journal of Literature and Art Studies》 2012年第5期567-574,共8页
This paper, that has been introduced at the annual meeting of the Renaissance Society of America (Washington, March 22, 2012), is a little part of a wider research about migration and movements of people between Wes... This paper, that has been introduced at the annual meeting of the Renaissance Society of America (Washington, March 22, 2012), is a little part of a wider research about migration and movements of people between Western and Eastern Europe (and vice versa) that, started one year ago, is still in progress. Despite a common thought that had considered, still in 15th century, Hungarians as unculturished and violent people, the town of Ferrara, ruled by the Estes, had welcomed many of them during the 15-16th centuries. They were, above all, and as the sources testify, literati and students. This paper tries to show and analyze the cultural reasons and the background that have determined Hungarians' presence in Ferrara during the Renaissance, with the consciousness that if many sources have been studied, many others must be 展开更多
关键词 the estes Pier Paolo Vergerio Janos Vit6z Hungarians Ferrara
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An Analysis of Estee Lauder and Impact of COVID-19 Pandemic
5
作者 Junchen Fan 《Proceedings of Business and Economic Studies》 2021年第1期51-53,共3页
Although the impact brought by COVID-19 pandemic is destructive to the majority of companies all over the world,Estee Lauder has proven itself to be an enduring brand that stands strong despite the pandemic headwinds.... Although the impact brought by COVID-19 pandemic is destructive to the majority of companies all over the world,Estee Lauder has proven itself to be an enduring brand that stands strong despite the pandemic headwinds.With its unique advantages over its competitors and efficient management,Estee Lauder is capable of dealing with the pandemic challenges effectively and emerging from the current crisis with an even stronger competitive position. 展开更多
关键词 COVID-19 pandemic COSMETICS ESTIMATION Financial indicators Stock price estee Lauder
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腹腔镜胆总管探查术与内镜十二指肠乳头括约肌切开术后胆总管结石复发率比较
6
作者 周东海 刘京山 《中国内镜杂志》 2026年第2期58-62,共5页
目的评估腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)与内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST)联合腹腔镜胆囊切除术(LC),治疗胆囊结石伴胆总管结石患者的远期疗效。方法回顾性分析2018年1月-2020年12月该院272例符合特定标准的胆囊结石伴胆总管结石患者(... 目的评估腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)与内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST)联合腹腔镜胆囊切除术(LC),治疗胆囊结石伴胆总管结石患者的远期疗效。方法回顾性分析2018年1月-2020年12月该院272例符合特定标准的胆囊结石伴胆总管结石患者(胆总管直径为9~15 mm,结石最大径<15 mm)的临床资料,根据手术方式不同,将患者分为LCBDE+LC组和EST+LC组。重点比较两组患者胆总管结石复发情况。结果术后随访数据显示,LCBDE+LC组术后结石复发率为12.0%,较EST+LC组的15.6%低,但两组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论针对胆总管直径为9~15 mm的胆囊结石伴胆总管结石患者,LCBDE+LC与EST+LC两种术式均为安全、有效的治疗选择。临床决策时,建议结合患者个体特征进行综合评估,选取最适宜的手术方案。 展开更多
关键词 胆总管结石 内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST) 腹腔镜胆总管探查术(LCBDE) 腹腔镜胆囊切除术(LC) 复发率
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电磁冲击处理对TC11钛合金电阻率的影响研究
7
作者 李嘉顺 翟宽 +3 位作者 周健 龚佳伟 温艳 谢乐春 《精密成形工程》 北大核心 2026年第1期1-13,共13页
目的在不同脉冲电流与恒定磁场的耦合作用下,分析电磁冲击处理(Electromagnetic Shock Treatment,EST)后TC11钛合金微区电阻率的变化规律,并通过表征其微观组织的演化过程,揭示EST作用下电阻率变化的微观机制。方法构建了一套结合四探... 目的在不同脉冲电流与恒定磁场的耦合作用下,分析电磁冲击处理(Electromagnetic Shock Treatment,EST)后TC11钛合金微区电阻率的变化规律,并通过表征其微观组织的演化过程,揭示EST作用下电阻率变化的微观机制。方法构建了一套结合四探针法与光刻工艺的微区电阻率测量系统,实现了高分辨率、可控接触条件下的局部导电性能表征。通过引入主成分分析(PCA)与多元回归建模方法,对样品厚度、电极结构和接触误差等影响因素进行量化评估与校正。在此基础上,对不同EST参数处理后的样品进行了系统测量,并结合电子背散射衍射(Electron Backscatter Diffraction,EBSD)技术,分析其晶粒尺寸、相比例及KAM值等微观结构指标。结果未处理样品(No.1)的晶粒平均面积为3.95μm^(2),对应电阻率为2.078μΩ•m;经EST处理后的样品(No.3,180 A/30 mT)晶粒平均面积降低至2.47μm^(2),电阻率升高至2.224μΩ•m。电阻率呈现“先升后降”的非线性演化趋势,误差修正后,测量精度可控制在±0.211μΩ•m以内。结论EST可显著促进晶粒细化并诱导组织重构,不同参数的EST处理对TC11钛合金导电性能产生了不同影响。适度的EST处理有助于通过微结构调控优化材料的局部电阻率表现。上述研究为钛合金在微尺度下的无损评估、电学性能调控及多场耦合机制的探索提供了理论支撑与实验基础。 展开更多
关键词 电磁冲击处理(EST) TC11钛合金 微区电阻率 晶粒细化 微结构
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白花蛇舌草苷类成分的研究 被引量:6
8
作者 张海娟 陈业高 《云南师范大学学报(自然科学版)》 2006年第3期65-69,共5页
从茜草科植物白花蛇舌草(Hedyotis diffusaWilld)中通过溶剂提取、硅胶柱层析、SephadexLH-20柱层析和制备薄层层析等方法分得6个苷类化合物。波谱分析(核磁共振氢谱、碳谱和质谱)确定它们的结构分别为E-6-O-p-methoxy cinnamoyl scando... 从茜草科植物白花蛇舌草(Hedyotis diffusaWilld)中通过溶剂提取、硅胶柱层析、SephadexLH-20柱层析和制备薄层层析等方法分得6个苷类化合物。波谱分析(核磁共振氢谱、碳谱和质谱)确定它们的结构分别为E-6-O-p-methoxy cinnamoyl scandoside methyl ester(1),Z-6-O-p-methoxycinnamoyl scandoside methyl ester(2),asperuloside(3),asperulosidic acid(4),乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷(ethylβ-D-glucopyranoside,5)和胡萝卜苷(daucosterol,6)。化合物5为首次从本植物中分到。 展开更多
关键词 白花蛇舌草 环烯醚萜苷 6-O-p-methoxy einnamoyl scandoside METHYL este asperuloside 乙基-β-D-吡喃葡萄糖苷
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LC+LCBDE与ERCP+EST+LC对胆囊结石合并胆总管结石的疗效
9
作者 艾龙龙 冉文斌 +2 位作者 秦占坤 柴源 张建民 《西藏医药》 2025年第6期57-58,共2页
目的比较内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)+经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)+腹腔镜胆囊切除术(LC)与LC+腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)对胆囊结石合并胆总管结石患者的疗效。方法选取2021年3月~2024年3月我院收治行手术的胆囊结石合并胆总... 目的比较内镜逆行性胰胆管造影术(ERCP)+经十二指肠镜Oddi括约肌切开术(EST)+腹腔镜胆囊切除术(LC)与LC+腹腔镜胆总管探查术(LCBDE)对胆囊结石合并胆总管结石患者的疗效。方法选取2021年3月~2024年3月我院收治行手术的胆囊结石合并胆总管结石患者218例,按照手术方案的不同分为对照组(n=109)接受ERCP+EST+LC治疗,研究组(n=109)则接受LC+LCBDE治疗。对比两组的治疗效果。结果与对照组相比,研究组术中出血量、手术操作时间、肛门排气时间、治疗费用及住院时间均减少(P<0.05);结石完全清除率:对照组95.41%、研究组92.66%,(P>0.05);胆总管结石残留率:对照组(8.26%),研究组(1.83%),(P<0.05);并发症发生率:对照组(19.27%),研究组(9.17%,(P<0.05)。结论两种手术方案对胆囊结石合并胆总管结石患者,均能取得比较理想的效果,具有较高的结石完全清除率;且LC+LCBDE对患者的创伤更加轻微,术后恢复时间更短,胆总管结石残留率明显更低,并发症更少。 展开更多
关键词 胆结石 ERCP EST LC LCBDE
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基于EST复合菌的化工业废水处理实验研究
10
作者 宋桂栋 《山西化工》 2025年第5期251-254,共4页
为了探索基于EST复合菌的化工业废水处理效果,通过介绍实验所需的材料与方法,深入分析了实验过程及结果。实验材料包括废水样品、活性淤泥及EST复合菌种,装置则由ABR与SBR系统构成,并进行了专门设计。实验方法涵盖了培菌、污泥驯化及正... 为了探索基于EST复合菌的化工业废水处理效果,通过介绍实验所需的材料与方法,深入分析了实验过程及结果。实验材料包括废水样品、活性淤泥及EST复合菌种,装置则由ABR与SBR系统构成,并进行了专门设计。实验方法涵盖了培菌、污泥驯化及正常运行实验三个阶段。通过对比分析启动实验与正常运行实验的数据,评估EST复合菌在处理化工业废水中的性能。研究结果表明,EST复合菌在提高废水处理效率、增强难降解有机物去除能力及稳定系统运行方面表现出色。 展开更多
关键词 EST复合菌 化工业 废水 处理 实验
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基于EST理论的高等数学课程三度混合式教学研究
11
作者 杨莉 梁佩 《教育信息化论坛》 2025年第22期10-12,共3页
以高等数学课程教学改革为切入点,针对传统教学中存在的理论脱离实践、教学方法单一、评价体系不完善等问题,引入EST理论框架,结合“课程深度、课堂饱和度、学业紧张度”三度建设理念,构建新型混合式教学模式。通过为期两年的教学实践,... 以高等数学课程教学改革为切入点,针对传统教学中存在的理论脱离实践、教学方法单一、评价体系不完善等问题,引入EST理论框架,结合“课程深度、课堂饱和度、学业紧张度”三度建设理念,构建新型混合式教学模式。通过为期两年的教学实践,验证该模式在提升学生学习积极性、改善教学效果方面的显著作用,旨在为高职院校高等数学课程改革提供可借鉴的实施路径。 展开更多
关键词 EST理论 高等数学课程 混合式教学
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结合联合处理工艺与EST复合菌的化工废水处理研究
12
作者 刘彤彤 《山西化工》 2025年第12期267-269,共3页
针对传统化工废水处理工艺对难降解污染物的去除效率低、系统稳定性不足等问题,提出一种以双层厌氧折流板反应器-序批式活性污泥法为核心的多级联合处理工艺与EST复合菌剂的协同处理策略。实际应用结果表明,该工艺对溶解性化学需氧量(C... 针对传统化工废水处理工艺对难降解污染物的去除效率低、系统稳定性不足等问题,提出一种以双层厌氧折流板反应器-序批式活性污泥法为核心的多级联合处理工艺与EST复合菌剂的协同处理策略。实际应用结果表明,该工艺对溶解性化学需氧量(COD)、五日生化需氧量(BOD_(5))、氨氮(NH_(3)-N)、总磷(TP)、苯系物及卤代烃的去除率分别达到93.6%、94.2%、87.4%、78.6%、84.9%和78.2%,较传统活性污泥法提升了14.4%~34.9%。同时,EST菌剂的投加使系统污泥质量浓度提升至4.8 g/L,微生物多样性指数达3.6,并显著增强了抗冲击负荷能力。该工艺通过多级厌氧-好氧环境与复合菌群的协同作用,实现了对复杂化工废水的高效、稳定处理,为工业废水治理提供了新的解决方案。 展开更多
关键词 化工废水 双层厌氧折流板反应器 序批式活性污泥法 EST复合菌剂
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单纯内镜乳头小球囊扩张术在胆总管较大结石中的应用效果及安全性
13
作者 沈俊松 王翔 +3 位作者 张莉莉 成凤干 刘新春 陈红芹 《中国内镜杂志》 2025年第12期56-63,共8页
目的分析内镜乳头小球囊扩张术(EPSBD)治疗胆总管较大结石(直径10~15 mm)的临床效果及安全性。方法选择2020年1月-2023年12月该院收治的胆总管较大结石(直径10~15 mm)患者142例,采用随机数表法分为观察组与对照组,各71例。观察组行EPSBD... 目的分析内镜乳头小球囊扩张术(EPSBD)治疗胆总管较大结石(直径10~15 mm)的临床效果及安全性。方法选择2020年1月-2023年12月该院收治的胆总管较大结石(直径10~15 mm)患者142例,采用随机数表法分为观察组与对照组,各71例。观察组行EPSBD(扩张球囊直径10 mm)治疗,对照组行内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST)联合球囊扩张术(EPBD)治疗。比较两组患者围手术期相关指标(取石成功率、取石时间、术后首次排便时间和住院时间),术前和术后48 h肝功能指标[总胆红素(TBiL)、谷丙转氨酶(GPT)和谷草转氨酶(GOT)],术后早期与远期并发症的发生情况,以及术后12个月内实施腹腔镜胆囊切除术(LC)情况。结果两组患者取石成功率、取石时间、术后首次排便时间和住院时间比较,差异均无统计学意义(P>0.05);术后48 h,两组患者血清TBiL、GPT和GOT水平明显低于术前,差异均有统计学意义(P<0.05),但两组间比较,差异均无统计学意义(P>0.05);观察组术后早期并发症发生率为11.27%,与对照组的8.45%比较,差异无统计学意义(P>0.05);观察组术后远期并发症发生率为2.82%,明显低于对照组的16.90%,差异有统计学意义(P<0.05);术后12个月内,观察组有5例实施了LC,对照组有4例实施了LC,两组间比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论应用EPSBD治疗胆总管较大结石(10~15 mm),与EST+EPBD治疗方案相比,能获得相近的取石成功率,但前者有利于降低远期并发症的发生率。值得临床推广应用。 展开更多
关键词 内镜乳头小球囊扩张术(EPSBD) 胆总管较大结石(直径10~15 mm) 内镜十二指肠乳头括约肌切开术(EST) 术后并发症 奥迪括约肌 内镜治疗
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水稻抗白叶枯病基因Xa23的EST标记及其在分子育种上的利用 被引量:52
14
作者 王春连 戚华雄 +4 位作者 潘海军 李进波 樊颖伦 章琦 赵开军 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1996-2001,共6页
用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本JG30杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP的数据,筛选并合成12个EST标记的引物,进行亲本间多... 用水稻抗白叶枯病基因Xa23的近等基因系CBB23与其感病轮回亲本JG30杂交,构建了包含2562个单株的F2作图群体。抗性鉴定表明,F2植株抗感分离比严格符合3∶1。根据日本水稻基因组计划RGP的数据,筛选并合成12个EST标记的引物,进行亲本间多态性检测,找到2个在CBB23与JG30间有多态性的EST标记,C189和CP02662。用该标记对F2群体中的571个感病单株进行分子检测和连锁分析,结果表明这两个EST标记位于Xa23基因的两侧,C189靠着丝粒一侧,与Xa23的遗传距离为0.8cM;CP02662靠端粒一侧,与Xa23的遗传距离为1.3cM。将C189成功用于水稻分子育种实践,标记辅助选择的正确率接近100%,已培育出3个将Xa23基因与高产、优质、抗褐飞虱等性状聚合的水稻恢复系。 展开更多
关键词 水稻 XA23 水稻白叶枯病 EST标记 分子育种 标记辅助选择 近等基因系 日本水稻 抗白叶枯病 EST
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油茶种子EST文库构建及主要表达基因的分析 被引量:60
15
作者 谭晓风 胡芳名 +3 位作者 谢禄山 石明旺 张党权 乌云塔娜 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第1期43-48,共6页
为研究油茶种子在油脂转化高峰期的基因表达并分离克隆与油脂合成等有关的重要基因,以油茶优良无性系湘林1号和湘林4号近成熟种子为材料构建cDNA文库;随机挑取2327个克隆进行3′端测序构建EST文库。将数据完整并无X、N的1979条cDNA序列... 为研究油茶种子在油脂转化高峰期的基因表达并分离克隆与油脂合成等有关的重要基因,以油茶优良无性系湘林1号和湘林4号近成熟种子为材料构建cDNA文库;随机挑取2327个克隆进行3′端测序构建EST文库。将数据完整并无X、N的1979条cDNA序列与NCBI核酸数据库的非冗余序列进行同源性比较,确认763条cDNA序列与核酸数据库中其他物种的DNA序列具有很高或较高的同源性,可确认266种基因;有1216个克隆序列为未知功能的基因序列。各类基因表现出不同的表达丰度,其中贮藏蛋白基因、与基因表达调控相关的基因、抗逆相关基因、种子成熟和胚胎发育相关的基因等为高丰度表达,与脂肪酸代谢相关的基因等为中丰度表达,另外还有大量的其他基因和未知功能基因在种子中表达。各类基因表达的数量和趋势与种子接近发育成熟阶段相吻合。 展开更多
关键词 油茶 CDNA EST 文库 表达基因
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白菜EST-SSR信息分析与标记的建立 被引量:73
16
作者 忻雅 崔海瑞 +4 位作者 卢美贞 姚艳玲 金基强 林容杓 崔水莲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期549-554,共6页
数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SS... 数量迅速增加的EST为开发新的SSR标记提供了宝贵的资源。本研究对4584条白菜EST进行了搜索,共检索出474个SSR,检出率为10·3%,包括40种重复基元。其中二核苷酸和三核苷酸重复单元的EST-SSR占主导地位,二者出现的频率基本相近,占总SSR的近83%;其它重复类型所占比例均不足5%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型,分别占二、三核苷酸重复类型的71·5%和37·5%。设计了15对EST-SSR引物,在合适的PCR反应体系下,以构建EST的白菜自交系A的DNA为模板,对设计的EST-SSR引物进行筛选,发现15对EST-SSR引物都能扩增出产物。进一步用这些可扩增的引物对28个白菜品种进行PCR扩增,发现7对引物显示多态性,占引物总数的46·7%。此结果表明,根据EST建立EST-SSR标记是一条简便而又有效的途径。 展开更多
关键词 白菜 EST SSR信息 标记
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茶树EST-SSR的信息分析与标记建立 被引量:89
17
作者 金基强 崔海瑞 +4 位作者 陈文岳 卢美贞 姚艳玲 忻雅 龚晓春 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期17-23,共7页
在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,... 在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%。本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的。 展开更多
关键词 茶树 EST SSR信息 标记建立
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荔枝EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发 被引量:56
18
作者 孙清明 马文朝 +6 位作者 马帅鹏 赵俊生 白丽军 陈洁珍 蔡长河 向旭 欧良喜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第19期4037-4049,共13页
【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDN... 【目的】明确荔枝EST序列中SSR的总体特点,开发荔枝EST-SSR引物,为利用EST-SSR分子标记进行荔枝种质资源遗传多样性、连锁图谱构建及亲缘关系研究奠定基础。【方法】应用SSRIT软件,按照设定标准从自行构建的一个荔枝果皮发育关键期的cDNA文库中的1 331条Unigene(惟一序列)中搜索SSR位点。利用软件Primer primer5.0设计EST-SSR引物。选用16份表型差异较大的荔枝种质资源检测引物的有效性及多态性,利用聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)进行片段分离。【结果】荔枝的1 331条EST序列中共搜索出220个SSR位点,分布于189条EST中,出现频率是16.53%。这些EST-SSR的平均长度为18.43 bp,平均分布频率1/4.42 kb。在1—6 bp的重复基元中,二核苷酸和三核苷酸重复类型占主导地位,共占总SSR的69.09%,二者出现的频率分别为37.27%和31.82%。共观察到72种重复基元,出现频率最高的是GA/TC(16.82%);其次是AG/CT、A/T、AT/TA及GAA/TTC,频率分别为14.55%、11.82%、5.00%和3.64%。不同核苷酸数目的重复基元的重复次数差异很大。设计、合成150对EST-SSR引物,122对(81.33%)引物在荔枝中获得有效扩增,100对引物具有多态性。【结论】荔枝EST资源中含有高频率的SSR位点,且EST-SSR标记开发效率较高。本研究为利用EST-SSR标记开展荔枝遗传研究提供了100对EST-SSR引物,并为进一步开发荔枝EST-SSR标记提供了含SSR位点的候选序列。 展开更多
关键词 荔枝 EST SSR
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小麦EST-SSR标记的开发和遗传作图 被引量:41
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作者 潘海涛 汪俊君 +2 位作者 王盈盈 齐照良 李斯深 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期452-461,共10页
【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18—2007.2.4)进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软... 【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列(2006.4.18—2007.2.4)进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。【结果】在265362条普通小麦EST序列中,共发现6314个SSR,占整个EST数据库的2.38%。其中二核苷酸、三核苷酸重复序列最多,分别为2237(35.43%)和2084(33.01%)个。二核苷酸重复中,以GA/CT和AG/TC出现频率最高、分别占SSR总数的17.85%和10.37%,其次是CA/GT(4.07%)和AC/TG(2.53%);三核苷酸重复中,CAA/GTT(3.93%)、CGG/GCC(3.83%)、CGC/GCG(3.36%)、GGC/CCG(3.14%)、CTT/GAA(2.53%)、TGC/ACG(2.27%)以较高的频率出现。根据筛选得到的微卫星序列共设计了596个EST-SSR引物对,选择其中95分以上的194个合成。PCR检测表明,165个引物对(85%)可以扩增出稳定清晰的带型;在RIL群体中检测到21个EST-SSR引物26个位点有多态性,将其中的23个位点整合到已有的小麦遗传图谱上。【结论】开发了165个小麦EST-SSR新标记,EST序列是小麦SSR标记的重要来源。 展开更多
关键词 小麦 EST—SSR 分子标记 RIL 遗传图谱
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梨EST-SSR标记的开发及其在梨品种遗传多样性分析中的应用评价 被引量:45
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作者 王西成 姜淑苓 +4 位作者 上官凌飞 曹玉芬 乔玉山 章镇 房经贵 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第24期5079-5087,共9页
【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条... 【目的】分析梨EST中SSR位点分布规律,开发梨EST-SSR引物,探讨EST-SSR用于梨品种遗传差异研究的可行性。【方法】从NCBI公共数据库中下载梨表达序列标签(expressed sequence tag,EST)1293条,利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条件的序列选出,利用Primer3.0Plus软件设计48对引物,通过非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)研究这些SSR引物的PCR扩增特点,并对部分扩增产物克隆与测序,以验证其真实性。【结果】1293条梨的EST序列中含有SSR位点的序列为82条,SSR位点92个。二核苷酸、三核苷酸和六核苷酸重复是最主要的SSR类型,分别占48.91%、17.39%和17.39%。48对引物中有31对引物能扩增出理想的PCR产物,其中27对引物扩增条带具有多态性。同时发现11对引物中,有83.87%的片段具有相应的SSR位点。聚类结果表明,梨被明显地区分成东方梨和西方梨两大群,分类效果明显。【结论】梨EST-SSR标记开发效率较高,是梨SSR标记开发的重要措施,对于梨品种的鉴定与遗传多样性分析具有重要应用价值。 展开更多
关键词 EST SSR 遗传多样性
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