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Error-prone PCR获得EPSP酶突变基因提高水稻的草甘膦抗性 被引量:10
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作者 苏军 陈建民 +2 位作者 田大刚 朱祯 王锋 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第5期830-836,共7页
将通过Error-prone PCR方法获得的表达水稻EPSP酶突变基因epsp102和未经修饰的水稻epsp基因分别导入籼稻恢复系明恢86,获得转化克隆84个和109个。对T1、T2代转基因水稻三叶期和分蘖期喷施草甘膦,各选出4个对草甘膦高抗性的T3代材料,进... 将通过Error-prone PCR方法获得的表达水稻EPSP酶突变基因epsp102和未经修饰的水稻epsp基因分别导入籼稻恢复系明恢86,获得转化克隆84个和109个。对T1、T2代转基因水稻三叶期和分蘖期喷施草甘膦,各选出4个对草甘膦高抗性的T3代材料,进行分子鉴定。对其中的3个株系进行农艺性状考察,并各选1个株系作为父本与其他优良恢复系进行杂交,进一步考察epsp和epsp102基因在不同遗传背景下的抗性和农艺性状表现。Southern结果显示:epsp的整合拷贝数为2~3拷贝,epsp102拷贝数为1~2拷贝。萌发种子、三叶期及分蘖期对草甘膦抗性检测显示:转基因萌发种子对草甘膦的抗性提高15倍;三叶期对草甘膦的抗性提高3~4倍。分蘖期剂量效应检测结果显示:非转基因对照在施0.1倍以上的致死剂量农达时,植株显著失水,而转基因株系水分生理正常。两地两季的农艺性状考察显示:与对照相比转基因株系的穗数明显增多,转基因株系ep-3和ep102-20结实率和单株重与对照没有显著差异;以ep-3和ep102-20作父本,与4个恢复系杂交的F2代对草甘膦的抗性没有降低,两个组合的结实率显著增加,SK/ep-3组合结实率显著下降,其余组合的结实率与对照持平。 展开更多
关键词 水稻 error-prone pcr EPSP酶突变基因 草甘膦
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Error-prone PCR致哈茨木霉几丁质酶突变的条件优化 被引量:2
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作者 王傲雪 李微 +1 位作者 陈秀玲 李景富 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期134-138,共5页
运用Error-prone PCR对哈茨木霉几丁质酶基因(Chit42)进行人工突变。在常规PCR基础上,通过提高体系中Mg2+浓度,适当加入一定浓度Mn2+,调节四种dNTP(dATP、dGTP、dCTP、dGTP)浓度,得到产生明显突变效果的试验条件。在Error-prone PCR中,... 运用Error-prone PCR对哈茨木霉几丁质酶基因(Chit42)进行人工突变。在常规PCR基础上,通过提高体系中Mg2+浓度,适当加入一定浓度Mn2+,调节四种dNTP(dATP、dGTP、dCTP、dGTP)浓度,得到产生明显突变效果的试验条件。在Error-prone PCR中,使用5.0 mmol·L-1Mg2+,0.5 mmol·L-1Mn2+,0.04 mmol·L-1dATP和dGTP,1.5 mmol·L-1dTTP和dCTP进行扩增后,随机挑选10个克隆测序,累积13 370个碱基,检测到57个突变,平均突变率为0.4%。为产生优良突变株、酶分子定向进化奠定基础。 展开更多
关键词 Error—prone pcr 哈茨木霉几丁质酶 Chit42 突变
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猪肠道病毒和猪捷申病毒双重荧光RT-PCR检测方法的建立
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作者 莫玲 于新友 +5 位作者 吕素芳 毕艳丽 张颖 李天芝 Ashenafi Kiros Wubshet 王文秀 《动物医学进展》 北大核心 2026年第2期49-53,共5页
为建立同时检测猪肠道病毒(PEV)和猪捷申病毒(PTV)的荧光RT-PCR方法,根据NCBI中PEV VP1(NCBI AF363453)和PTV VP1(NCBI GQ293092)基因序列,分别设计特异性引物和探针,通过优化反应体系和扩增程序,建立了一种无需提取核酸即可同时检测PEV... 为建立同时检测猪肠道病毒(PEV)和猪捷申病毒(PTV)的荧光RT-PCR方法,根据NCBI中PEV VP1(NCBI AF363453)和PTV VP1(NCBI GQ293092)基因序列,分别设计特异性引物和探针,通过优化反应体系和扩增程序,建立了一种无需提取核酸即可同时检测PEV和PTV的双重荧光RT-PCR检测方法,对该方法的特异性、敏感性及重复性进行评估,并对临床样品进行检测。结果表明,20μL体系中各引物和探针最适加入量为:PEV-F 0.8μL、PEV-R 1.3μL、PEV-P 0.6μL、PTV-F 1.2μL、PTV-R 1.4μL和PTV-P 0.7μL,优化后的扩增程序为:90℃3 min;60℃反转录5 min;95℃5 s,52℃退火延伸20 s(此处收集荧光),共计40个循环。该对猪常见病原均无扩增,对PEV和PTV检测敏感性分别为5.13 TCID 50/100μL和3.47 TCID 50/100μL,对135份临床样品检测结果与传统核酸提取法结果一致。成功建立了PEV和PTV的免提取核酸双重荧光RT-PCR方法,特异性好,敏感性高,可用于临床两种疑似病例的快速检测。 展开更多
关键词 猪肠道病毒 猪捷申病毒 免提取核酸 荧光pcr
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dPCR方法动态监测T790M突变在EGFR阳性非小细胞肺癌耐药治疗中的指导作用
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作者 姚铠涛 曾小芸 +3 位作者 连逸恺 林建雄 王双玲 魏丹娜 《分子诊断与治疗杂志》 2026年第1期131-134,共4页
目的本研究旨在探讨使用数字PCR(dPCR)方法动态监测血浆EGFR T790M突变的可行性,并评估基于血浆T790M突变检测的早期干预是否可作为EGFR突变非小细胞肺癌患者EGFR-TKI转换治疗的最佳时机。方法初筛2021年7月至2023年12月在汕头大学医学... 目的本研究旨在探讨使用数字PCR(dPCR)方法动态监测血浆EGFR T790M突变的可行性,并评估基于血浆T790M突变检测的早期干预是否可作为EGFR突变非小细胞肺癌患者EGFR-TKI转换治疗的最佳时机。方法初筛2021年7月至2023年12月在汕头大学医学院第二附属医院75例接受埃克替尼治疗的EGFR阳性Ⅳ期NSCLC患者,T790M突变率为53.3%,最终纳入40例患者。试验组(n=18)在血浆检测到T790M突变后更换第三代EGFR-TKI治疗,对照组(n=22)在影像学进展及T790M突变后更换EGFR-TKI治疗。比较两组的临床疗效、无进展生存期(PFS)及不良反应。结果试验组的客观缓解率(ORR)为72.2%,对照组为68.2%,两组差异无统计学意义(P>0.05)。试验组的疾病控制率(DCR)为94.4%,对照组为81.9%,差异无统计学意义(P>0.05)。试验组的中位PFS显著长于对照组,差异有统计学意义(14.8个月vs 10.3个月,P=0.024)。两组的不良反应均为1~2级,皮疹、腹泻及肝功能异常的发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论使用dPCR动态监测血浆EGFR T790M突变,可较影像学更早识别一代EGFR-TKI耐药,从而及时转换三代EGFR-TKI治疗,延缓疾病进展,是一种经济且临床可行的策略。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EGFR T790M 数字pcr 三代酪氨酸激酶抑制剂
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猴痘病毒荧光定量PCR检测方法的建立
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作者 孙健 赵柏林 《山东畜牧兽医》 2026年第1期8-12,共5页
猴痘病毒(Monkeypox virus,MPXV)作为一种重要的人畜共患病毒,其在全球范围内传播和蔓延引起了广泛关注,尤其是在近年来的疫情中,及时有效的检测方法显得尤为重要。为建立一种快速诊断MPXV的检测方法,根据2022年公布的MPXV的靶基因片段F... 猴痘病毒(Monkeypox virus,MPXV)作为一种重要的人畜共患病毒,其在全球范围内传播和蔓延引起了广泛关注,尤其是在近年来的疫情中,及时有效的检测方法显得尤为重要。为建立一种快速诊断MPXV的检测方法,根据2022年公布的MPXV的靶基因片段F3L(462 bp,GenBank登录号AF380138.1)保守区域,设计了1对特异性的引物和1条探针,建立了猴痘病毒荧光定量PCR检测方法。结果显示,本方法仅能有效检测MPXV,与牛结节皮肤病病毒、非洲猪瘟病毒VP72片段质粒、圆环病毒Ⅱ型标准品均无交叉反应;对重组质粒标准品的最低检测限为5.1 copies/μL;批内与批间的重复试验变异系数均小于6%。结果表明,本试验方法具有较强的敏感性、特异性和稳定性,可以用于猴痘病毒的快速鉴别诊断。 展开更多
关键词 猴痘病毒 荧光定量 pcr 检测方法
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机场道面承载能力ACR-PCR评价方法及其改进方向
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作者 袁捷 李杰 +2 位作者 马鲁宽 凌建明 姜昌山 《同济大学学报(自然科学版)》 北大核心 2026年第2期255-263,共9页
道面承载能力评价是保障飞机安全运行的重要工作之一。在回顾飞机分类号-道面分类号(aircraft classification number-pavement classification number,ACN-PCN)评价方法基本原理并总结其局限性的基础上,阐述了飞机分类等级-道面分类等... 道面承载能力评价是保障飞机安全运行的重要工作之一。在回顾飞机分类号-道面分类号(aircraft classification number-pavement classification number,ACN-PCN)评价方法基本原理并总结其局限性的基础上,阐述了飞机分类等级-道面分类等级(aircraft classification rating-pavement classification rating,ACR-PCR)评价方法的优化内容;明确了ACR和PCR的计算方法,并通过算例对比分析了2种方法,同时提出了改进方向。结果表明,ACR-PCR评价方法优化了标准道面结构、当量单轮胎压等参数,更新了道面结构破坏模式的控制准则及力学响应计算方法,实现了与现行设计方法的统一;ACR值不能简单地用10倍的ACN值表示,并且ACR-PCR评价方法对刚性道面承载能力提出了更高要求;建议在优化标准结构的基础上,提出针对无机结合料稳定类基层道面的ACR计算方法以及刚性道面上加铺层复合道面承载能力ACR-PCR评价方法。 展开更多
关键词 机场工程 机场道面 承载能力 ACR-pcr评价方法
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基于直接PCR的转基因种子纯度快速检测方法
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作者 翟杉杉 李俊 +4 位作者 肖芳 李允静 武玉花 高鸿飞 吴刚 《中国油料作物学报》 北大核心 2026年第1期168-181,共14页
种子纯度检测对于保证种子质量,提高作物产量具有重要意义。建立快速、准确、低成本的转基因种子纯度检测技术将为推进生物育种产业化发展提供有力支撑。本研究基于直接PCR技术提出了一种转基因种子纯度快速检测方案,包括:(1)利用自主... 种子纯度检测对于保证种子质量,提高作物产量具有重要意义。建立快速、准确、低成本的转基因种子纯度检测技术将为推进生物育种产业化发展提供有力支撑。本研究基于直接PCR技术提出了一种转基因种子纯度快速检测方案,包括:(1)利用自主研发的快速提取试剂,在常温下实现单粒种子研磨、提取同步进行,2分钟内一步式实现核酸提取,提取液无需纯化、直接作为模板进行实时荧光PCR扩增;(2)配制PCR反应体系;(3)样品分板;(4)高通量检测;(5)种子纯度计算。利用本方法对3种转基因大豆中黄6106、DBN9004、SHZD3201种子样品进行纯度检测,15份样品从制样到结果鉴定一个工作日内全部完成。该方法简化了现有纯度检测技术的操作步骤,显著缩短了分析时间,为转基因种子纯度检测提供了一种可靠的单粒快速检测新方法。 展开更多
关键词 转基因种子 纯度检测 DNA快速提取 直接pcr
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槲树不同器官及盐胁迫下qRT-PCR的内参基因筛选及验证
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作者 蒋萌 白晓宁 +4 位作者 王文波 赵亚洲 胡增辉 苏淑钗 冷平生 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2026年第1期211-220,234,共11页
[目的]筛选在不同器官及盐胁迫下表达稳定的槲树内参基因,验证所选内参基因在qRT-PCR中的适用性和稳定性,为精准评价槲树目标基因表达量提供理论依据。[方法]从槲树盐胁迫转录组中筛选出10个高表达传统管家基因作为候选内参基因(TUBA、T... [目的]筛选在不同器官及盐胁迫下表达稳定的槲树内参基因,验证所选内参基因在qRT-PCR中的适用性和稳定性,为精准评价槲树目标基因表达量提供理论依据。[方法]从槲树盐胁迫转录组中筛选出10个高表达传统管家基因作为候选内参基因(TUBA、TUBA、GAPDH、Actin、EIF2B5、UBE2W、ADCK、EEF1B、UBE2J1和EIF5A),采用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件和ΔCt程序对候选基因在槲树中的表达稳定性进行分析。以槲树6个器官(根、茎、叶、叶芽、花序、种子)及盐胁迫下4个不同处理时期(CK、3 h、24 h、96 h)的叶片为样品,通过qRT-PCR技术,结合候选内参基因,验证过氧化氢酶基因QdCAT2在槲树不同器官及盐胁迫下的表达模式以及候选内参基因的表达稳定性。[结果]10个候选内参基因中,EIF5A和UBE2W的表达稳定性最高,综合排名位居前列,EIF2B5为最不稳定内参基因。QdCAT2基因在槲树叶片中表达量最高,且随着盐胁迫时间的延长,表达量呈先升高后降低的趋势,在处理3 h后达到高峰,使用EIF5A、UBE2W及EIF5A+UBE2W组合作为内参基因得到的相对表达结果基本一致,表明EIF5A和UBE2W为槲树各器官及盐胁迫最适合的内参基因。[结论]成功筛选出了2个稳定内参基因,并验证了EIF5A、UBE2W及EIF5A+UBE2W组合均适合作为槲树不同器官及盐胁迫下qRT-PCR的内参基因,为槲树不同器官及盐胁迫下基因表达分析提供了参考,并为后续槲树分子生物学研究奠定理论基础。 展开更多
关键词 槲树 实时荧光定量pcr 内参基因筛选 盐胁迫 表达分析
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基于边缘无浆体msp4基因的PCR检测方法的建立及应用
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作者 廖培淇 朱子奇 +4 位作者 苏中华 甘富斌 李俊强 陈远才 张龙现 《中国兽医科学》 北大核心 2026年第1期77-82,共6页
为建立特异、敏感、快速的边缘无浆体PCR检测方法,以其msp4基因的保守区为靶标设计一对特异性引物。优化PCR反应条件后,进行了敏感性、特异性、重复性试验及临床样品检测。结果显示,所建立的方法能够特异性检测边缘无浆体核酸,而与其他... 为建立特异、敏感、快速的边缘无浆体PCR检测方法,以其msp4基因的保守区为靶标设计一对特异性引物。优化PCR反应条件后,进行了敏感性、特异性、重复性试验及临床样品检测。结果显示,所建立的方法能够特异性检测边缘无浆体核酸,而与其他动物常见血液原虫无交叉反应;该方法的检测下限为380 fg/μL,拷贝数为126拷贝/反应;批内、批间试验结果表明,该方法具有良好的重复性和稳定性;对120份牦牛血液临床样本检测结果表明,该方法检测边缘无浆体阳性率为54.1%(65/120),高于文献报道方法检测结果37.5%(45/120),表明该方法具有良好的敏感性和准确性。成功建立了一种敏感、特异、快速的边缘无浆体PCR检测方法,为我国牛无浆体病的流行病学调查和诊断防控提供了技术支撑。 展开更多
关键词 边缘无浆体 msp4基因 pcr 牛无浆体病
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暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交F_(1)代的荧光PCR鉴定技术的建立
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作者 赵昕 车帅 +4 位作者 王焕 孙侦龙 尤颖哲 柳淑芳 庄志猛 《渔业科学进展》 北大核心 2026年第1期37-47,共11页
暗纹东方鲀(Takifugu obscurus♀)×红鳍东方鲀(T.rubripes♂)的杂交F_(1)代具备双亲诸多优良性状,市场前景较好。但杂交F_(1)代的形态特征与其亲本难以区分,为河鲀种质资源保护和开发利用带来了困扰,迫切需要开发有效的分子鉴定方... 暗纹东方鲀(Takifugu obscurus♀)×红鳍东方鲀(T.rubripes♂)的杂交F_(1)代具备双亲诸多优良性状,市场前景较好。但杂交F_(1)代的形态特征与其亲本难以区分,为河鲀种质资源保护和开发利用带来了困扰,迫切需要开发有效的分子鉴定方法对杂交F_(1)代及其亲本进行精准判别。为实现杂交F_(1)代及其亲本的快速准确鉴定,本研究根据核基因SH3PX3多态性SNP位点,设计荧光PCR扩增引物及探针,优化了荧光PCR参数,建立了暗纹东方鲀、红鳍东方鲀及其杂交F_(1)代的荧光PCR鉴定方法,并对该方法进行了验证。结果显示:杂交F_(1)代的COI序列与母本暗纹东方鲀的序列相似度为100%,在NJ进化树中聚为一支,无法实现杂交F_(1)代和母本的区分;SH3PX3基因荧光PCR体系最佳退火温度为48℃;荧光PCR扩增后,暗纹东方鲀仅FAM通道有Ct值,ΔCt值大于20,红鳍东方鲀FAM信号通道比HEX通道的Ct值高2~5,杂交F_(1)代的FAM通道与HEX通道的Ct值接近,二者之差小于2;基于上述方法对17份暗纹东方鲀、21份红鳍东方鲀和53份杂交F_(1)代样品进行验证,鉴定准确率为100%。本研究建立的荧光PCR鉴定方法不仅具有结果准确、易判读等优点,还避免了测序等繁琐流程,可实现高通量检测,显著提高了检测效率,为河鲀种质资源鉴定与保护、杂交育种和遗传多样性研究提供了技术支持。 展开更多
关键词 暗纹东方鲀 红鳍东方鲀 杂交F_(1)代 SH3PX3基因 荧光pcr 物种鉴定
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猪圆环病毒2型微滴数字PCR检测方法的建立及临床应用
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作者 刘武函 唐小明 +8 位作者 彭志 张坤 谢怡灵 范仲鑫 王卫国 尚玲 张梦凡 杨青 胡巧云 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2026年第1期120-125,共6页
为建立一种特异性强、敏感性高、重复性好的猪圆环病毒2型(PCV-2)微滴数字PCR检测方法,试验基于PCV-2 ORF1保守区域设计引物和探针,通过优化引物浓度、探针浓度和退火温度及特异性、敏感性和重复性试验建立微滴数字PCR方法,并采用该方法... 为建立一种特异性强、敏感性高、重复性好的猪圆环病毒2型(PCV-2)微滴数字PCR检测方法,试验基于PCV-2 ORF1保守区域设计引物和探针,通过优化引物浓度、探针浓度和退火温度及特异性、敏感性和重复性试验建立微滴数字PCR方法,并采用该方法对90份临床样本进行检测。结果表明:建立的PCV-2微滴数字PCR检测方法的最佳引物和探针浓度分别为18μmol/L和9μmol/L,退火温度为61℃;能特异性检出PCV-2,与多种常见猪病原[猪圆环病毒3型(PCV-3)、伪狂犬病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、非洲猪瘟病毒(ASFV)、猪瘟病毒(CSFV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)]无交叉反应;最低检测限为3.48 copies/μL;重复性试验中扩增后的拷贝数组内与组间变异系数范围分别在0.91%~6.13%和1.44%~8.53%之间,均小于10%。90份临床样本中,建立的微滴数字PCR方法检出PCV-2阳性样本43份,检出率为47.78%,经统计微滴数字PCR方法检出的阳性样本包含了实时荧光定量PCR方法检出的所有阳性样本,与实时荧光定量PCR方法的符合率为88.89%。说明本研究建立的PCV-2微滴数字PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好,适用于临床样本(特别是低病毒载量样本)的检测。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 微滴数字pcr 病毒检测 检测方法 特异性试验 敏感性试验 重复性试验
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奶牛乳腺炎致病菌三重qPCR检测方法的建立
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作者 康新华 赵雯 牛琼 《中国牛业科学》 2026年第1期29-37,共9页
为建立奶牛乳腺炎主要致病菌的快速检测方法,选择大肠埃希氏菌(Escherichia coli)phoA基因、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)mdh基因、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)femA基因以及内标基因ACtB的保守区序列设计合成特异性... 为建立奶牛乳腺炎主要致病菌的快速检测方法,选择大肠埃希氏菌(Escherichia coli)phoA基因、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)mdh基因、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)femA基因以及内标基因ACtB的保守区序列设计合成特异性引物探针,建立了奶牛乳腺炎大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌的三重荧光PCR检测方法。该方法可特异性检出3种常见的奶牛乳腺炎致病菌,与无乳链球菌、停乳链球菌、牛支原体、沙门氏菌等常见病原无交叉反应,特异性强;对phoA、mdh和femA的最低检出限分别为16.9、16.7和20.4拷贝/μL,且组内和组间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。用该方法对90份奶牛乳腺炎生乳样本进行检测,检测结果与单一荧光PCR方法一致。表明所建立的奶牛乳腺炎大肠埃希氏菌、肺炎克雷伯菌和金黄色葡萄球菌三重荧光定量PCR检测方法具有特异性强、灵敏度高、操作简单的特点,适用于奶牛乳腺炎的临床诊断检测。 展开更多
关键词 奶牛乳腺炎 大肠埃希氏菌 肺炎克雷伯菌 金黄色葡萄球菌 三重荧光qpcr
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弓形虫和钩端螺旋体双重荧光定量PCR方法的建立
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作者 栾扬 张亚 +5 位作者 李志敏 王蕾 毕振威 钱晶 熊富强 谭业平 《中国动物检疫》 2026年第1期118-123,130,共7页
为建立快速准确的弓形虫和钩端螺旋体检测方法,以弓形虫529 bp重复序列和钩端螺旋体LigB基因保守区域为靶标分别设计特异性引物和TaqMan MGB探针,进行双重荧光定量PCR反应体系和条件优化以及敏感性、特异性、重复性试验和临床样品检测... 为建立快速准确的弓形虫和钩端螺旋体检测方法,以弓形虫529 bp重复序列和钩端螺旋体LigB基因保守区域为靶标分别设计特异性引物和TaqMan MGB探针,进行双重荧光定量PCR反应体系和条件优化以及敏感性、特异性、重复性试验和临床样品检测。结果显示,该方法对弓形虫核酸检测限为1 copy/μL,钩端螺旋体核酸检测限为10 copies/μL;可特异性检测弓形虫和钩端螺旋体,与犬细小病毒、犬腺病毒II型、猫疱疹病毒、隐孢子虫、猫细小病毒等病原核酸无交叉反应;组内变异系数小于3.16%,组间的变异系数小于2.23%;临床样品检测验证该方法阳性检出率高于普通PCR方法,两种方法具有良好一致性。结果表明,所建立的双重荧光定量PCR方法具有敏感、特异、稳定等特性,可用于弓形虫和钩端螺旋体临床检测。 展开更多
关键词 弓形虫 钩端螺旋体 荧光定量pcr
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猫疱疹病毒Ⅰ型SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测方法的建立及应用
14
作者 刘雅雯 赵广荣 +9 位作者 许丽文 孙亚杰 李双双 刘佳佳 李智杰 张成琪 符建海 张子闯 胡博 白雪 《畜牧与兽医》 北大核心 2026年第1期79-84,共6页
猫疱疹病毒I型(FHV-1)是威胁猫科动物健康的重要传染性疾病,本研究旨在研发一种灵敏、高效的FHV-1检测技术。依据GenBank上FHV-1 US6保守区域的基因序列,设计合成1对针对FHV-1 gD基因的引物,建立了一种SYBR Green I荧光定量PCR的检测方... 猫疱疹病毒I型(FHV-1)是威胁猫科动物健康的重要传染性疾病,本研究旨在研发一种灵敏、高效的FHV-1检测技术。依据GenBank上FHV-1 US6保守区域的基因序列,设计合成1对针对FHV-1 gD基因的引物,建立了一种SYBR Green I荧光定量PCR的检测方法,构建标准曲线后分别验证该方法的特异性、敏感性、重复性,并将其进一步应用于人工感染猫产生的临床样本检测。结果:该特异性引物与猫杯状病毒(FCV)、猫细小病毒(FPV)和猫冠状病毒(FCoV)均未出现交叉反应,检测下限为14.78 copies/μL,组内和组间重复试验的变异系数均低于2%;该方法对临床样本的检出率比常规PCR高出25.46%;通过该方法检测人工感染FHV-1强毒后猫的每日排毒量,结果呈现上升趋势,与临床发病程度相符,猫的脏器病毒载量存在个体差异,但集中在心脏、肺脏、肠道和膀胱中检出。综上,该研究建立的SYBR Green I荧光定量PCR方法对FHV-1具有较好的特异性、灵敏度和重复性,为FHV-1感染的快速诊断以及疾病的防控提供方法支持。 展开更多
关键词 猫疱疹病毒Ⅰ型 荧光定量pcr SYBR GreenⅠ US6基因 猫病毒性鼻气管炎
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非洲猪瘟病毒B646L/I177L基因双重荧光PCR鉴别检测方法的建立和初步应用
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作者 赵凯 胡永新 +6 位作者 郑东霞 邹艳丽 刘珊 蔡其刚 李金明 吴晓东 王志亮 《中国动物检疫》 2026年第1期101-109,共9页
为监测越南上市使用的非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)I177L基因缺失疫苗株传入我国的情况,聚焦国内流行的ASFV毒株类型,基于I177L基因设计特异性引物和探针,同时结合国家标准推荐的B646L基因荧光PCR检测方法,优化并建立... 为监测越南上市使用的非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)I177L基因缺失疫苗株传入我国的情况,聚焦国内流行的ASFV毒株类型,基于I177L基因设计特异性引物和探针,同时结合国家标准推荐的B646L基因荧光PCR检测方法,优化并建立了一种能够区分我国流行的野毒株与I177L基因人工缺失毒株的双重荧光PCR检测方法。进一步,对该方法的敏感性、特异性和重复性进行验证。结果显示:此方法对两种基因的最低检测限均为5 copies/μL,具有较高敏感性;与其他猪病病原无交叉反应,显示出强特异性;组内与组间重复性试验的变异系数均小于5%,重复性良好;可有效检出我国不同类型的ASFV流行株,具有良好的通用性;对100份临床样品核酸进行检测,本方法检测结果与国标方法一致。结果表明,本研究建立的ASFV(B646L/I177L)双重荧光PCR检测方法可用于I177L基因缺失株的精准检测,为临床上ASFV野毒株与I177L基因缺失株的鉴别检测提供了技术支撑。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 双重荧光pcr B646L基因 I177L基因
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DHAV-1、DAstV-1、DHAV-3和APMV-1四重PCR检测方法的建立及应用
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作者 李海名 吴晓燕 +3 位作者 康华裕 王旭 王一涵 张彦龙 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2026年第2期94-99,共6页
为了建立一种能同时检测鸭甲肝病毒1型(DHAV-1)、鸭星状病毒1型(DAstV-1)、鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)和禽副黏病毒1型(APMV-1)的方法,试验根据GenBank中公布的DHAV-13A基因、DAstV-11a基因、DHAV-33a3b基因和APMV-1 F基因序列分别设计4对... 为了建立一种能同时检测鸭甲肝病毒1型(DHAV-1)、鸭星状病毒1型(DAstV-1)、鸭甲肝病毒3型(DHAV-3)和禽副黏病毒1型(APMV-1)的方法,试验根据GenBank中公布的DHAV-13A基因、DAstV-11a基因、DHAV-33a3b基因和APMV-1 F基因序列分别设计4对特异性引物,通过优化反应条件及特异性、敏感性和重复性试验建立了四重PCR检测方法,并采用该方法对96份疑似病毒感染的鸭病料样本进行检测。结果表明:DHAV-1、DHAV-3、DAstV-1和APMV-1四重RT-PCR检测方法的最优退火温度和引物浓度分别为56℃、0.8μmol/L。该方法能同时扩增出大小为195 bp(DHAV-13A基因)、289 bp(DAstV-11a基因)、462 bp(DHAV-33a3b基因)、726 bp(APMV-1基因)的特异性片段,而与鸭瘟病毒(DPV)、鸭坦布苏病毒(DTMUV)、鸭圆环病毒(DuCV)和鸭甲肝病毒2型(DHAV-2)无交叉反应;对DHAV-1、DAstV-1、DHAV-3和APMV-1的最低检测限分别为1.111×10~4 copies/μL、3.078×10~2 copies/μL、4.938×10~3 copies/μL、3.456×10~2 copies/μL;批间重复试验和批内重复试验的3个平行样本的结果均一致。采用该方法对96份临床样本的检测结果与参考方法的符合率为100%。说明本研究建立的针对DHAV-1、DHAV-3、DAstV-1和APMV-1四重PCR检测方法特异性强、敏感性较高、重复性好,在临床样本检测中展现出良好的应用效果。 展开更多
关键词 鸭甲肝病毒 鸭星状病毒 禽副黏病毒1型 混合感染 多重pcr检测方法 检测方法建立
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布鲁菌双重TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 彭海涛 高阳 +6 位作者 刘雨欣 顾德媛 张东 张如 许会会 陈思 杨艳玲 《畜牧兽医学报》 北大核心 2026年第1期369-377,共9页
旨在建立一种经济高效的布鲁菌双重TaqMan荧光定量PCR鉴别检测方法,用于布鲁菌感染的动物及动物产品的快速检测并区分牛种布鲁菌和其他种布鲁菌感染的动物,为临床常的疫苗和研发的新型疫苗提供科学有效的鉴别诊断方法。本研究根据GenBan... 旨在建立一种经济高效的布鲁菌双重TaqMan荧光定量PCR鉴别检测方法,用于布鲁菌感染的动物及动物产品的快速检测并区分牛种布鲁菌和其他种布鲁菌感染的动物,为临床常的疫苗和研发的新型疫苗提供科学有效的鉴别诊断方法。本研究根据GenBank公布的galU和Omp31的序列设计检测引物和探针,构建重组质粒,对方法特异性、灵敏性及重复性评价,检测实验室制备和临床动物布病血清及组织样品。结果表明,成功建立了布鲁菌双重TaqMan荧光定量PCR检测方法,该方法最低检测限为1.93×10^(0) copies·μL^(-1),与其他革兰阴性菌无交叉反应,批内及批间变异系数均小于2%。利用本研究建立的方法检测实验室制备样品和临床采集样品共156份,与BCSP31-PCR相比,两者阳性符合率为69.75%;与PCR和虎红凝集试验相比,灵敏性更高,双重TaqMan荧光定量PCR的敏感性为100%,PCR的敏感性为69.75%,虎红凝集试验的敏感性为58.65%。本研究建立的布鲁菌双重TaqMan荧光定量PCR检测方法,为布鲁菌临床鉴别检测、流行病学调查及净化提供技术支持。 展开更多
关键词 布鲁菌 双重Taq Man荧光定量pcr 检测方法 鉴别诊断
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H1亚型禽流感病毒TaqMan探针qRT-PCR检测方法的建立
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作者 王莹 田峰 +6 位作者 王阳 蔡成杰 李雯馨 蒋文明 刘华雷 李阳 蔡玉梅 《中国动物检疫》 2026年第2期107-112,共6页
为构建一种迅速、高效、特异且灵敏的H1亚型禽流感病毒检测方法,从NCBI数据库中下载近年来公开的H1亚型禽流感病毒的HA基因序列,选取其中的保守区域设计1对荧光引物和TaqMan探针,通过优化反应条件和体系,以重组质粒为模板制作标准曲线,... 为构建一种迅速、高效、特异且灵敏的H1亚型禽流感病毒检测方法,从NCBI数据库中下载近年来公开的H1亚型禽流感病毒的HA基因序列,选取其中的保守区域设计1对荧光引物和TaqMan探针,通过优化反应条件和体系,以重组质粒为模板制作标准曲线,建立H1亚型禽流感病毒的TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法,并对其特异性、敏感性、重复性进行评价。结果显示:该方法标准曲线线性方程为y=-3.225x+38.241,相关系数R2=0.9996,显现出良好的线性关系;与其他亚型禽流感病毒和常见禽类病原体均无交叉反应;最低检测限为1.0×10^(2) copies/μL,灵敏度是常规RT-PCR的10倍;组间以及组内变异系数均小于2%。对100份临床样品检测结果显示,该检测方法敏感性高于常规RT-PCR方法,与病毒分离鉴定结果一致,符合率为100%。结果表明,建立的方法操作简便,灵敏度高、特异性强、重复性好,可应用于H1亚型禽流感病毒临床检测和监测,为禽流感防控提供了技术支撑。 展开更多
关键词 H1亚型禽流感病毒 实时荧光定量pcr TAQMAN探针
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血清学检测指标及实时荧光定量PCR检测在侵袭性念珠菌病患者中的诊断价值
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作者 MD ALI HOSSAIN 彭亮 +2 位作者 袁余 周晓涵 马莹 《四川大学学报(医学版)》 北大核心 2026年第1期170-176,共7页
目的 评估血清学检测指标1, 3-β-D-葡聚糖试验(G试验)、念珠菌甘露聚糖(Mn)抗原、念珠菌甘露聚糖IgG抗体(Mn-IgG)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测在侵袭性念珠菌病(IC)患者中的临床诊断价值。方法 收集四川大学华西医院2022年12月-2024年1... 目的 评估血清学检测指标1, 3-β-D-葡聚糖试验(G试验)、念珠菌甘露聚糖(Mn)抗原、念珠菌甘露聚糖IgG抗体(Mn-IgG)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测在侵袭性念珠菌病(IC)患者中的临床诊断价值。方法 收集四川大学华西医院2022年12月-2024年12月期间通过血培养及无菌体液培养确诊为IC患者的血清样本79例作为IC组,排除IC感染患者的血清样本83例作为非IC组,进行G试验(磁微粒化学发光法)、Mn抗原(ELISA法)、Mn-IgG抗体(化学发光法)和qPCR检测。比较分析G试验、Mn抗原、Mn-IgG抗体和qPCR检测及联合检测对IC诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值,绘制受试者工作特征(ROC)曲线并计算ROC曲线下面积(AUC)。结果 3种血清学检测指标单独检测对IC诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为:G试验62.03%、94.87%、92.45%、71.15%;Mn抗原65.63%、86.59%、79.25%、76.34%;Mn-IgG抗体31.65%、87.95%、71.43%、57.48%。G试验、Mn抗原、Mn-IgG三项联合检测敏感性提高至73.44%。基于ROC曲线分析,各血清学检测指标诊断IC的AUC分别为:G试验0.862(95%CI:0.803-0.922)、Mn试验0.853(95%CI:0.790-0.915)、Mn-IgG 0.603(95%CI:0.514-0.692)。G试验+Mn试验两项联合检测、G试验+Mn-IgG两项联合检测、G试验+Mn试验+Mn-IgG三项联合检测的AUC分别为0.875(95%CI:0.809-0.925)、0.869(95%CI:0.805-0.917)和0.875(95%CI:0.809-0.924),优于单独检测。qPCR对IC诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为100.00%、98.80%、98.75%、100.00%。以培养菌株基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)鉴定结果为金标准,qPCR检测对白念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌的诊断一致性分别为100.00%、100.00%、94.44%和90.00%。结论 G试验、Mn抗原和Mn-IgG抗体联合检测可提高诊断敏感性,有助于IC的早期诊断。qPCR对IC具有优异的诊断性能,可将IC常见念珠菌鉴定至种水平,并可覆盖其他念珠菌种,与临床培养方法结果一致性好。 展开更多
关键词 1 3-β-D葡聚糖 念珠菌甘露聚糖抗原 念珠菌甘露聚糖IgG抗体 实时荧光定量pcr 侵袭性念珠菌病
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多重PCR在血流感染细菌及其耐药基因检测中的临床应用价值
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作者 曾桂胜 陈丹虹 +3 位作者 吴见欢 陈志芬 邹惠英 廖建军 《齐齐哈尔医学院学报》 2026年第3期264-269,共6页
目的评价多重PCR法在检测血流感染细菌及其耐药基因中的临床应用价值。方法使用血流感染细菌及其耐药基因15项联合检测试剂盒,采用多重PCR法于体外同时检测50例报阳血液培养中的12种临床常见血流感染病原菌及KPC、mecA、NDM 3种耐药基因... 目的评价多重PCR法在检测血流感染细菌及其耐药基因中的临床应用价值。方法使用血流感染细菌及其耐药基因15项联合检测试剂盒,采用多重PCR法于体外同时检测50例报阳血液培养中的12种临床常见血流感染病原菌及KPC、mecA、NDM 3种耐药基因,与传统血培养方法比较其检出时效性,准确性。结果共检测出表皮葡萄球菌、铜绿假单胞菌、人葡萄球菌、金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、大肠埃希菌、嗜麦芽单胞菌、肺炎链球菌、鲍曼不动杆菌的,未检出溶血葡萄球菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯菌和KPC、mecA、NDM等耐药基因。相较传统血培养方法,多重PCR法对血培养阳性患者的TAT时间可缩短1~2 d,及早提示感染病原菌。结论与传统血培养细菌鉴定相比,联合检测试剂盒体现出多重PCR的敏感性、特异性、阳性预测值较高,可提高血流感染细菌检测速度,对多重感染的鉴定及指导临床早期合理用药具有意义。 展开更多
关键词 血流感染 细菌培养 多重pcr 耐药基因
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