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木耳emg1基因克隆与生物信息学分析 被引量：2
1
作者 方明 姚方杰 +1 位作者 王晓娥 陈影 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期416-419,共4页
以毛木耳和皱木耳的cDNA序列为模板设计简并引物并进行扩增,获得1条长度为1 075 bp的序列Aa-2;与JGI数据库中皱木耳基因组Blastn比对E值为0;与编码emg1的氨基酸序列Blastx同源性比对的E值高达1.82e-112。与木耳全基因组序列中注释为emg... 以毛木耳和皱木耳的cDNA序列为模板设计简并引物并进行扩增,获得1条长度为1 075 bp的序列Aa-2;与JGI数据库中皱木耳基因组Blastn比对E值为0;与编码emg1的氨基酸序列Blastx同源性比对的E值高达1.82e-112。与木耳全基因组序列中注释为emg1的核酸序列有775 bp的序列完全一致。经GenBank数据库Blastn同源比对,与玉米丝黑穗菌emg1蛋白cDNA的部分序列相似性达91%。经GenBank中Conserved domains搜索,Aa-2序列与emg1蛋白超家族序列同源比对的E值达2.66e-43,初步判定Aa-2的部分序列为emg1蛋白的编码序列。 展开更多
关键词 木耳 emg1 基因克隆
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