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Molecular phylogeographic analyses and species delimitations reveal that Leopoldamys edwardsi(Rodentia:Muridae)is a species complex 被引量:6
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作者 Haotian LI Lingming KONG +5 位作者 Kaiyun WANG Shuping ZHANG Masaharu MOTOKAWA Yi WU Wenquan WANG Yuchun LI 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2019年第5期494-505,共12页
Leopoldamys edwardsi is a species with wide distribution ranges in southern China but is not discussed in studies on geographic variation and species differentiation.We used 2 mitochondrial(Cytb,CO1)and 3 nuclear(GHR,... Leopoldamys edwardsi is a species with wide distribution ranges in southern China but is not discussed in studies on geographic variation and species differentiation.We used 2 mitochondrial(Cytb,CO1)and 3 nuclear(GHR,IRBP and RAG1)genes to clarify species phylogeography and geographical differentiation.Maximum likelihood(ML)and Bayesian phylogenetic inference(BI)trees consistently indicated that L.edwardsi is a species complex containing 3 main lineages with high Kimura-2-parameter(K2P)divergences(i.e.lineages LN,LS and LHN)found in the northern and southern China and Hainan Island,respectively.The 3 species delimitation methods,automated barcoding gap discovery,Bayesian poisson tree process analysis and Bayesian phylogenetics and phylogeography,consistently supported the existence of cryptic species.Divergence times among the main lineages were inferred to be during the Pleistocene,with LHN/LS split at 1.33 Ma and LN/(LHN+LS)at 2.61 Ma;the diversifications of L.edwardsi complex might be caused by the rapid uplifts of Tibetan Plateau,paleoclimate change and complex topography.The divergence between LHN and LS was probably related to the separation of Hainan Island from the mainland via the formation of the Qiongzhou Strait.Lineages LN and(LS+LHN)likely diverged due to the Wuyi-Nanling mountain range forming a dispersal barrier.Our results suggested that L.edwardsi complex contains at least 3 distinct species:LHN represents L.hainanensis,endemic to Hainan Island and previously considered as a subspecies L.e.hainanensis;LS represents a cryptic species distributed throughout the southern Chinese continent;and LN represents the nominotypical species L.edwardsi. 展开更多
关键词 ancient hybridization cryptic species Leopoldamys edwardsi complex Leopoldamys hainanensis species delimitation
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江苏兽类新纪录——小泡巨鼠兼记江苏产海南社鼠形态与分布
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作者 杜怿霖 叶琳 +2 位作者 王美丁 高国富 包浩然 《环境监控与预警》 2024年第5期183-191,共9页
于2019年3月16日,在江苏省宜兴市太华镇(119.56392273°E,31.18658179°N)进行小型兽类野外调查时,采集到小泡巨鼠属(Leopoldamys)标本1号;结合形态特征比较和基于细胞色素b(Cyt b)、细胞色素氧化酶I(COI)和16S核糖体核糖核酸(1... 于2019年3月16日,在江苏省宜兴市太华镇(119.56392273°E,31.18658179°N)进行小型兽类野外调查时,采集到小泡巨鼠属(Leopoldamys)标本1号;结合形态特征比较和基于细胞色素b(Cyt b)、细胞色素氧化酶I(COI)和16S核糖体核糖核酸(16S rRNA)基因片段的系统发生分析,确定为小泡巨鼠[(L.edwardsi)(Thomas,1882)],系江苏省兽类属级新纪录。2022年10月—2023年4月,在江苏省南京市江宁区汤山(118.99581021°E,31.99214746°N)和高淳区马鞍山(118.9560781°E,31.2719167°N)采集到白腹鼠属(Niviventer)标本共计12号;结合形态学比较和分子系统发生分析,确定为海南社鼠[(N.lotipes)(Allen,1926)]。根据分子系统学的近期研究报道,对海南社鼠和北社鼠[(N.confucianus)(Milne-Edwards,1871)]在长江下游地区的分布格局进行了厘定和讨论。研究结果丰富了江苏兽类多样性,为相关啮齿动物的系统发生、生物地理和遗传多样性研究提供了基础资料。 展开更多
关键词 小泡巨鼠 江苏省 新纪录 海南社鼠 分布格局
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小泡巨鼠和社鼠对珍稀濒危植物红豆树种子的捕食和扩散作用 被引量:7
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作者 刘鑫 王政昆 肖治术 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期93-96,共4页
红豆树(Ormosia hosiei)为我国特有的国家Ⅱ级保护珍稀濒危植物,有关动物对种子的捕食和扩散作用是否影响其种群更新目前尚无研究。2009年秋季,我们在四川省都江堰地区利用大型实验围栏研究了小泡巨鼠(Leopoldamys edwardsi)和社鼠(Nivi... 红豆树(Ormosia hosiei)为我国特有的国家Ⅱ级保护珍稀濒危植物,有关动物对种子的捕食和扩散作用是否影响其种群更新目前尚无研究。2009年秋季,我们在四川省都江堰地区利用大型实验围栏研究了小泡巨鼠(Leopoldamys edwardsi)和社鼠(Niviventor confucianus)对红豆树种子的捕食和贮藏格局,以便了解鼠类在红豆树种子扩散中的潜在作用。结果表明小泡巨鼠和社鼠均取食红豆树种子,但二者贮藏种子的方式不同:社鼠主要集中贮藏种子,对红豆树种子的扩散作用不大,而小泡巨鼠则主要分散贮藏种子,故对红豆树种子有一定的扩散作用。研究结果说明尽管鼠类可通过捕食而降低种子存活,但分散贮藏的鼠种能促进红豆树种子的扩散,从而有利于其种群维持。 展开更多
关键词 Ormosia hosiei Leopoldamys edwardsi Niviventor confucianus 分散贮藏 种子扩散 种子捕食 自然更新
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河南省哺乳动物分布新纪录——小泡巨鼠 被引量:1
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作者 路纪琪 刘彬 《四川动物》 CSCD 北大核心 2008年第3期435-435,共1页
关键词 小泡巨鼠Leopoldamys edwardsi 新纪录 河南
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从粤东丰溪自然保护区白腹巨鼠和褐家鼠体内分离出莱姆病螺旋体 被引量:8
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作者 万康林 郭衍 +4 位作者 许世锷 张哲夫 潘林祥 谢林崇 罗敬平 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 1999年第3期174-175,共2页
目的:探讨鼠类携带莱姆病螺旋体情况。方法:用BSK培养基分离病原、单克隆抗体鉴定。结果:从白腹巨鼠和褐家鼠体内分离出2株疏螺旋体,经用莱姆病螺旋体种属特异的单克隆抗体进行间接免疫荧光抗体试验,证实均为莱姆病螺旋体,命... 目的:探讨鼠类携带莱姆病螺旋体情况。方法:用BSK培养基分离病原、单克隆抗体鉴定。结果:从白腹巨鼠和褐家鼠体内分离出2株疏螺旋体,经用莱姆病螺旋体种属特异的单克隆抗体进行间接免疫荧光抗体试验,证实均为莱姆病螺旋体,命名为MD21和MD55。结论:首次从病原学证实鼠类为粤东地区莱姆病螺旋体的主要宿主动物。 展开更多
关键词 莱姆病 莱姆病螺旋体 白腹巨鼠 褐家鼠
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金华北山三种啮齿动物身体热值、脂肪和水分含量的研究 被引量:6
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作者 杜卫国 鲍毅新 +2 位作者 施利强 金伟星 俞华英 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第1期155-159,共5页
研究了浙江金华3种啮齿动物的身体热值、脂肪含量和水分含量。成年社鼠、褐家鼠和白腹巨鼠生物量热值季节变动范围分别为6.209~7.657KJ/g,6.153~7.096KJ/g,6.199~12.033KJ/g;水分含量为66.64%~69.75%,67.48%~70.19%,56.64%~72.37%... 研究了浙江金华3种啮齿动物的身体热值、脂肪含量和水分含量。成年社鼠、褐家鼠和白腹巨鼠生物量热值季节变动范围分别为6.209~7.657KJ/g,6.153~7.096KJ/g,6.199~12.033KJ/g;水分含量为66.64%~69.75%,67.48%~70.19%,56.64%~72.37%;灰分含量不存在季节差异,年平均值分别为12.50%,12.23%,10.49%。社鼠脂肪含量春、夏季高于秋冬季,与繁殖密切相关;褐家鼠脂肪含量没有季节差异;白腹巨鼠脂肪含量则是冬季明显高于春、夏季。脂肪含量的种间差异与动物环境条件和对寒冷的适应对策不同有关,同时也反映了种的动物地理史。春季成年社鼠的水分含量高于亚成年个体,褐家鼠春、秋季幼年个体的脂肪含量生物量热值低于成年和亚成年个体。动物水分含量与脂肪含量呈显著负相关。 展开更多
关键词 身体热值 脂肪含量 水分含量 啮齿动物 鼠科
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基于16S rRNA基因的鼠Mycoplasma haemomuris的分子鉴定和种系发育分析
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作者 白挨泉 李高强 +5 位作者 郭建超 李欣 蒲文珺 李国清 陈志伟 张浩吉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1471-1476,共6页
为了从分子水平揭示野生鼠类血原体的种类特征和系统发生关系,无菌采集32份野生白腹巨鼠血样,抽提全血基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16SrRNA基因的扩增,对扩增产物进行克隆和测序。结果从其中21只血样中成功地扩增出目的片段大小... 为了从分子水平揭示野生鼠类血原体的种类特征和系统发生关系,无菌采集32份野生白腹巨鼠血样,抽提全血基因组DNA,采用真细菌的通用引物进行16SrRNA基因的扩增,对扩增产物进行克隆和测序。结果从其中21只血样中成功地扩增出目的片段大小的核苷酸序列。对阳性产物进行克隆、测序,获得了两条代表性序列(GenBank登录号HQ183731和HQ183732)。序列分析显示,获得的两条序列与GenBank中收录的鼠Mycoplasma haemomuris 16SrRNA基因(AB758435)相似性最高,分别为95%和97%。两个样本间16SrRNA基因序列相似性达98.3%。种系发育分析表明,获得白腹巨鼠血原体的两条序列形成了独立的进化分支,并与来自野鼠的Haemobartonella muris(HMU82963)和来自家鼠M.haemomuris(AB758435)所形成的进化分枝为姊妹枝。上述研究证明,白腹巨鼠具有较普遍的M.haemomuris感染,并与已报道的啮齿动物M.haemomuris有一定的遗传差异,是一种新基因型的血原体。对进一步研究人和动物的亲血性支原体的流行病学、种群生物学等研究具有一定价值。 展开更多
关键词 MYCOPLASMA haemomuris 16SRRNA基因 分子鉴定 种系发育分析
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履行怪蚤的雌蚤(蚤目:细蚤科)
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作者 刘井元 马立名 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第z1期121-122,共2页
描述履行怪蚤ParadoxopsylluscalceiformaZhangetLiu ,1985的雌蚤 ,该种雌蚤与昏暗怪蚤P .phaeopis (JordanetRoths child ,1911)极相近似 。
关键词 蚤目 细蚤科 怪蚤属 白腹巨鼠 雌性
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基于COI基因的赣北地区小泡巨鼠的鉴定
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作者 陈飞 胡海军 +3 位作者 刘占斌 陶卉英 钱科 郑卫青 《中华卫生杀虫药械》 CAS 2023年第6期495-498,共4页
目的以线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COI)基因为目的基因,利用DNA条形码技术对未知鼠样本进行鉴定.方法采用夹夜法对九江市武宁县宋溪镇某村的鼠密度进行调查,经形态学初步鉴定后,以捕获的1只无法明确鉴定的大型鼠样本为对象,提取基因组DN... 目的以线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COI)基因为目的基因,利用DNA条形码技术对未知鼠样本进行鉴定.方法采用夹夜法对九江市武宁县宋溪镇某村的鼠密度进行调查,经形态学初步鉴定后,以捕获的1只无法明确鉴定的大型鼠样本为对象,提取基因组DNA并采用COI基因通用引物BatL5310和R6036R进行PCR扩增及测序,将测序结果在NCBI网站进行BLAST比对,采用MEGA7软件选择最大似然法构建系统发育树.结果共捕获小型兽类7只,密度为3.38%,经形态学鉴定有褐家鼠2只,黑线姬鼠2只,臭鼩鼱2只,形态学初步鉴定为青毛巨鼠或小泡巨鼠的未知鼠1只,提取的未知鼠样本DNA通过PCR成功扩增出COI基因目的条带,与NCBI基因库中小泡巨鼠(KP995219)序列同源性高达100%,系统发育树显示该鼠样本与小泡巨鼠(KP995219、KP995203)处于同一分支,遗传距离分别为0、0.0016,而青毛巨鼠(NC_036730)单独处于另一分支,遗传距离较远.结论赣北地区首次报道小泡巨鼠,采用COI基因的DNA条形码技术可快速、准确的进行鼠种鉴定,有助于弥补非常见鼠形态学鉴定困难的不足. 展开更多
关键词 小泡巨鼠 DNA条形码 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因 系统发育
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The effects of seed detectability and seed traits on hoarding preference of two rodent species 被引量:1
10
作者 Minghui WANG Xianfeng YI 《Integrative Zoology》 SCIE CSCD 2022年第5期944-952,共9页
Seed traits play an important role in affecting seed preference and hoarding behaviors of small rodents.Despite greatly affected by seed traits,seed detectability of competitors represents pilfering risks and may also... Seed traits play an important role in affecting seed preference and hoarding behaviors of small rodents.Despite greatly affected by seed traits,seed detectability of competitors represents pilfering risks and may also modify seed hoarding preference of animals.However,whether seed traits and seed detectability show consistent effects on seed hoarding preference of animals remain largely unknown.Here,we explored how seed traits and seed detectability correlate with seed hoarding preference of Leopoldamys edwardsi and Apodemus chevrieri in a subtropical forest.Despite the effects of seed coat thickness and caloric value on hoarding preference of L.edwardsi,we detected no significant effects of other seed traits on hording preference of the 2 rodent species.There was no correlation between larder-hoarding preference and inter-or intra-specific seed detectability of L.edwardsi;however,seed detectability of L.edwardsi was negatively correlated with its own scatter-hoarding preference.Although scatter-hoarding preference of A.chevrieri was not correlated with inter-and intra-specific seed detectability,larder-hoarding preference of A.chevrieri was positively correlated with intra-specific seed detectability.Our study may provide evidence that intra-specific seed detectability rather than seed traits and inter-specific pilfering risks play an important role in modifying seed hoarding preference of rodents. 展开更多
关键词 Apodemus chevrieri Leopoldamys edwardsi seed detectability seed hoarding preference seed traits
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基于illumina测序技术分析小泡巨鼠肠道微生物多样性 被引量:1
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作者 轩断断 黎元莉 +8 位作者 张冠男 丁林威 曹佩佩 贾瑞杰 郑玉爱 周晓君 潘良源 胡守奎 牛莉娜 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期512-518,共7页
为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠(14只雄和11只雌性)粪便样本DNA,基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法... 为探讨海南岛的小泡巨鼠肠道微生物群落组成及其菌群多样性。2019年12月于海南医学院-香港大学热带传染病联合实验室提取25只海南岛的成年小泡巨鼠(14只雄和11只雌性)粪便样本DNA,基于IonS5TMXL测序平台,利用单端测序(Single-End)的方法,构建小片段文库进行单端测序。通过对测序片段剪切过滤,操作分类单元(Operational Taxonomic Units,OTUs)聚类,利用mothur方法与SSUrRNA数据库对OTUs进行物种注释及丰度分析,并进一步开展α多样性分析(Alpha Diversity)和β多样性分析(Beta Diversity)。结果显示,从25只小泡巨鼠肠道粪便样本中共得到高质量序列1481842条,归属为14个门、85个科、186个属。从门分类水平上,小泡巨鼠的主要核心生物群有厚壁菌门(Firmicutes,46.04%),拟杆菌门(Bacteroidetes,25.34%);随后依次为变形菌门(Proteobacteria,17.09%),柔壁菌门(Tenericutes,7.38%),放线菌门(Actinobacteria,1.67%);这5个门占所有菌门的97.52%。属水平上螺杆菌属(Helicobacter)所占比例最大,为12.44%;其次为乳杆菌属(Lactobacillus,11.39%),梭菌属(Clostridium,6.19%),支原体属(Mycoplasma,4.23%),黄杆菌属(Flavonifractor,3.52%)。综上,高通量测序分析表明海南岛小泡巨鼠肠道菌群结构复杂,菌种多样,具有进一步研究的意义。 展开更多
关键词 肠道微生物 高通量测序 操作分类单元 小泡巨鼠
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