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二重荧光RT-LAMP对牛病毒性腹泻病毒和牛轮状病毒的鉴别诊断 被引量:7
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作者 范晴 谢芝勋 +6 位作者 谢志勤 谢丽基 黄娇玲 张艳芳 曾婷婷 王盛 罗思思 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期457-462,共6页
牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和牛轮状病毒(BRV)是2种引起牛病毒性腹泻症的主要病原体,且经常混合感染,难以区分。本研究旨在建立一种可视化二重荧光RT-LAMP方法用于BVDV和BRV的鉴别诊断。根据GenBank中BVDV的5′端非编码区和BRV的VP6基因保... 牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和牛轮状病毒(BRV)是2种引起牛病毒性腹泻症的主要病原体,且经常混合感染,难以区分。本研究旨在建立一种可视化二重荧光RT-LAMP方法用于BVDV和BRV的鉴别诊断。根据GenBank中BVDV的5′端非编码区和BRV的VP6基因保守序列,设计了2套特异性引物,在每条内引物的5′端标记不同荧光基团,经过反应条件优化,特异性、灵敏度和干扰性试验评估后,建立了一种可凭肉眼读取结果的二重RT-LAMP检测方法。结果表明,该方法对BVDV和BRV有高度特异,与其他牛病原体无交叉反应,敏感性高,每个反应最低能检测100个BVDV RNA和100个BRV RNA;干扰性小,能同时检测2个不同浓度的模板组合。对144份样品的检测结果显示,BVDV感染率为18.1%,BRV感染率为7.6%,2种病毒混合感染率为1.4%;与荧光RT-PCR方法相比敏感性和特异性均为100.0%。结果显示,该二重RT-LAMP方法可鉴别诊断BVDV和BRV,具有特异、敏感、快速、稳定等优点,适用于流行病学调查和临床检测。 展开更多
关键词 牛病毒性腹泻病毒 牛轮状病毒 二重RT-lamp 检测
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病原性鳗弧菌(Vibrio anguillarum)双重PCR与LAMP检测方法的建立 被引量:6
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作者 孙晶晶 高晓建 +6 位作者 张晓君 马丽娜 阎斌伦 白雪松 赵佳铭 毕可然 秦蕾 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2015年第6期49-55,共7页
本研究检测了分离自发病大菱鲆、半滑舌鳎及鲤鱼的22株病原鳗弧菌(Vibrio anguillarum)毒力相关基因的携带情况,并建立了病原鳗弧菌的分子生物学检测方法。以PCR方法检测8个毒力相关基因的分布,结果显示,22株病原鳗弧菌均可扩增出6个... 本研究检测了分离自发病大菱鲆、半滑舌鳎及鲤鱼的22株病原鳗弧菌(Vibrio anguillarum)毒力相关基因的携带情况,并建立了病原鳗弧菌的分子生物学检测方法。以PCR方法检测8个毒力相关基因的分布,结果显示,22株病原鳗弧菌均可扩增出6个基因(empA、vah1、vah4、flaA、rtxA和tonB)目的条带,未扩增出virA和angM基因;针对vah4和rtxA设计引物进行双重PCR扩增,同一PCR反应体系可扩增出两条目的条带,灵敏度为2.4×103 CFU/ml,对照菌无任何扩增条带;以vah4设计引物进行LAMP扩增,病原鳗弧菌可扩增出阶梯状条带,呈现阳性反应,6株对照菌无阶梯状扩增条带且呈现阴性反应,LAMP扩增灵敏度为2.4×10~1 CFU/ml。LAMP检测灵敏度是双重PCR的100倍,LAMP技术与PCR比较,操作简便、快速、灵敏度高且不需昂贵仪器,LAMP检测鳗弧菌的方法更适合于养殖生产实际应用。 展开更多
关键词 鳗弧菌 毒力相关基因 双重PCR 环介导恒温扩增技术(lamp)
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二重荧光RT-LAMP方法鉴别检测口蹄疫病毒和水泡性口炎病毒 被引量:15
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作者 范晴 谢芝勋 +8 位作者 谢志勤 谢丽基 黄娇玲 张艳芳 曾婷婷 王盛 罗思思 邓显文 刘加波 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期996-1004,共9页
口蹄疫和水泡性口炎是牛常见高度急性病毒传染病,在全球范围内广泛存在。本研究旨在建立一种可同时鉴别口蹄疫病毒和水泡性口炎病毒的二重荧光RT-LAMP检测方法。根据口蹄疫病毒(FMDV)3D基因和水泡性口炎病毒(VSV)N基因的保守序列,设计了... 口蹄疫和水泡性口炎是牛常见高度急性病毒传染病,在全球范围内广泛存在。本研究旨在建立一种可同时鉴别口蹄疫病毒和水泡性口炎病毒的二重荧光RT-LAMP检测方法。根据口蹄疫病毒(FMDV)3D基因和水泡性口炎病毒(VSV)N基因的保守序列,设计了2套特异性引物,在每条内引物的5′端标记荧光基团,通过扩增产物颜色判断检测结果。优化反应条件,建立了可同时检测口蹄疫病毒和水泡性口炎病毒的二重荧光RT-LAMP方法。结果显示,该方法灵敏性高,每个反应最低能够检测到100个拷贝混合模板;特异性好,能在同一个反应管里检测到两种病毒,对其他牛病原体无扩增;干扰性小,扩增效率不受模板浓度影响。本研究建立的口蹄疫病毒和水泡性口炎病毒二重荧光RT-LAMP方法具有简便、快速、特异、敏感等优点,可用于FMDV和VSV的临床检测和流行病学调查。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 水泡性口炎病毒 二重荧光RT-lamp 检测
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口蹄疫病毒和水泡性口炎病毒二重RT-LAMP鉴别检测方法的建立 被引量:9
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作者 范晴 谢芝勋 +4 位作者 谢志勤 庞耀珊 邓显文 谢丽基 黄莉 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1829-1834,共6页
LAMP技术是一种快速新型的核酸检测技术,该技术利用4条引物在恒温下扩增目的 DNA,特异性好敏感性高。本试验旨在建立一种能同时鉴别诊断FMDV和VSV的二重RT-LAMP检测方法。根据口蹄疫病毒(FMDV)3D基因和水泡性口炎病毒(VSV)N基因的保守序... LAMP技术是一种快速新型的核酸检测技术,该技术利用4条引物在恒温下扩增目的 DNA,特异性好敏感性高。本试验旨在建立一种能同时鉴别诊断FMDV和VSV的二重RT-LAMP检测方法。根据口蹄疫病毒(FMDV)3D基因和水泡性口炎病毒(VSV)N基因的保守序列,设计了2套特异性引物,在每套引物的内引物中插入酶切位置EcoRⅠ,对反应条件进行了优化,建立了恒温快速的检测方法。结果显示:该方法特异性好,能检测到口蹄疫病毒的A,O,Asia1亚型和水泡性口炎的NJ和IND亚型,并与其他对照牛病原体不发生交叉反应;敏感性高,最低能够检测个100个FMDV病毒RNA和100个VSV病毒RNA;干扰性小,能同时检测两个模板的不同浓度组合。本试验建立的口蹄疫和水泡性口炎二重RT-LAMP方法具有简便、快速、特异、敏感等优点,可用于FMDV和VSV的临床检测和流行病学调查。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 水泡性口炎病毒 二重RT-lamp 酶切
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禽白血病病毒和鸡传染性贫血病毒二重荧光LAMP检测方法的建立及应用 被引量:7
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作者 张民秀 谢芝勋 +7 位作者 谢志勤 谢丽基 张艳芳 邓显文 曾婷婷 范晴 罗思思 黄娇玲 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2007-2014,共8页
【目的】建立同时鉴别ALV和CIAV的二重荧光环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速诊断及有效防控ALV和CIAV的单一或混合感染提供技术支持。【方法】参考ALV(A亚群、B亚群、C亚群、D亚群和J亚群)的pol基因和CIAV的VP2基因保守序列,... 【目的】建立同时鉴别ALV和CIAV的二重荧光环介导等温扩增(LAMP)检测方法,为临床上快速诊断及有效防控ALV和CIAV的单一或混合感染提供技术支持。【方法】参考ALV(A亚群、B亚群、C亚群、D亚群和J亚群)的pol基因和CIAV的VP2基因保守序列,设计2套用于LAMP的特异性引物,并在ALV和CIAV的F1c和B1c覆盖区域分别设计双标记探针[ALV-Probe(5'端标记FAM荧光基团,3'端标记BHQ3淬灭基团)和CIAV-Probe(5'端标记CY5荧光基团,3'端标记BHQ3淬灭基团)]。在Loopamp LA-320C实时浊度仪中反应结束后,将反应管置于多色荧光系统内进行观察分析;并通过特异性试验、灵敏度试验及临床样品检测验证二重荧光LAMP检测方法的适用性和可靠性。【结果】优化后的二重荧光LAMP反应体系20.0μL:DNA/cDNA模板2.0μL,2×ReactionMix 10.0μL,Bst DNA聚合酶0.8μL,内引物ALV-FIP、ALV-BIP、CIAV-FIP和CIAV-BIP(工作浓度40.0μmol/L)各0.8μL,外引物ALV-F3、ALV-B3、CIAV-F3和CIAV-B3(工作浓度5.0μmol/L)各0.4μL,ALV-Probe(工作浓度0.5μmol/L)0.4μL,CIAV-Probe(工作浓度0.5μmol/L)0.8μL,以ddH_(2)O补足至20.0μL。扩增程序:62℃反应60 min,80℃灭活5 min。建立的二重荧光LAMP检测方法能特异性同时检测ALV和CIAV,对其他禽类病原体无特异性扩增;检测CIAV和ALV单一模板的下限均为102拷贝/μL,检测混合模板时ALV的检测下限为102拷贝/μL、CIAV的检测下限为103拷贝/μL。应用建立的二重荧光LAMP检测方法对13份咽喉和泄殖腔棉拭子样品进行检测,其检测结果与常规PCR检测结果的吻合率达100%。【结论】建立的二重荧光LAMP检测方法能实现在同一反应管内鉴别诊断ALV和CIAV,具有特异性好、敏感性高及污染风险小等优点,且检测结果可通过多色荧光系统进行肉眼观察,适用于ALV和CIAV的临床快速筛查。 展开更多
关键词 禽白血病病毒(ALV) 鸡传染性贫血病毒(CIAV) 二重荧光lamp 探针 特异性 敏感性
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可视化牛支原体和传染性鼻气管炎二重荧光LAMP诊断方法的建立 被引量:8
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作者 范晴 谢芝勋 +8 位作者 谢志勤 谢丽基 黄娇玲 张艳芳 曾婷婷 王盛 罗思思 邓显文 刘加波 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期448-456,共9页
牛支原体(mycoplasma bovis, MB)和牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)是引起牛呼吸综合症的主要病原体。本研究根据MB和IBRV的保守基因序列,设计并合成两套特异性LAMP引物,在每条内引物的5’端标记... 牛支原体(mycoplasma bovis, MB)和牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)是引起牛呼吸综合症的主要病原体。本研究根据MB和IBRV的保守基因序列,设计并合成两套特异性LAMP引物,在每条内引物的5’端标记荧光基团,通过扩增产物的颜色判断检测结果,建立了用于检测MB和IBRV的二重荧光LAMP检测方法。该方法与其他牛病原体无交叉反应,检测敏感度达100拷贝/μL。应用该方法检测125份样品,MB的感染率为44.8%,IBRV的感染率为13.6%,2种病原混合感染率为1.6%;与OIE推荐的荧光定量PCR检测方法相比,此二重LAMP方法敏感性为94.4%~96.6%,特异性为100%。结果表明该方法灵敏度高,特异性好,重复性好,能同时检测大量样本,可用于MB和IBRV的临床检测和流行病学调查。 展开更多
关键词 牛支原体(MB) 牛传染性鼻气管病毒(IBRV) 二重荧光lamp
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大肠埃希菌ETT2毒力岛ECs3703基因和HPI毒力岛irp2基因双重LAMP检测方法的建立 被引量:4
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作者 蔡树东 成大荣 +2 位作者 朱善元 吴双 左伟勇 《动物医学进展》 北大核心 2017年第1期1-5,共5页
根据GenBank中大肠埃希菌ETT2毒力岛保守基因ECs3703和HPI毒力岛的保守基因irp2分别设计一套LAMP引物,在同一体系中进行LAMP扩增,通过对体系Mg2+、dNTP、内引物及反应温度和反应时间等进行优化,建立了在60℃恒温下对大肠埃希菌ETT2和HP... 根据GenBank中大肠埃希菌ETT2毒力岛保守基因ECs3703和HPI毒力岛的保守基因irp2分别设计一套LAMP引物,在同一体系中进行LAMP扩增,通过对体系Mg2+、dNTP、内引物及反应温度和反应时间等进行优化,建立了在60℃恒温下对大肠埃希菌ETT2和HPI毒力岛进行同步检测的LAMP方法,并进行了特异性和灵敏性试验。结果显示,所建立的双重LAMP检测方法同时检测ETT2和HPI毒力岛大肠埃希菌检测限均可达到100fg,比常规PCR灵敏度高100倍。利用该方法对8株非大肠埃希菌进行LAMP扩增,结果均为阴性。用该方法对采集的20份临床样品进行检测,与双重PCR检测结果一致。结果显示,该双重LAMP方法可用于大肠埃希菌ETT2和HPI毒力岛的同步快速检测,可作为临床疫病诊断的有效手段。 展开更多
关键词 大肠埃希菌 ETT2毒力岛 HPI毒力岛 双重lamp
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创伤弧菌和副溶血弧菌双重LAMP检测方法的建立及初步应用 被引量:4
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作者 周顺 高志鑫 张敏 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1875-1881,共7页
为建立创伤弧菌和副溶血弧菌的双重环介导等温扩增(loop—mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,本试验以创伤弧菌metalloprotease基因和副溶血弧菌ompA基因为靶点设计LAMP扩增引物,并在内引物间添加不同的酶切位点,... 为建立创伤弧菌和副溶血弧菌的双重环介导等温扩增(loop—mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,本试验以创伤弧菌metalloprotease基因和副溶血弧菌ompA基因为靶点设计LAMP扩增引物,并在内引物间添加不同的酶切位点,通过对反应时间和温度的优化及酶切反应,成功建立了双重LAMP检测方法,并对其检测特异性、灵敏度和实际应用性进行了研究。结果显示,62℃反应45min时可同时检测到2种弧菌的存在,通过限制性内切酶酶切,可准确区分2种弧菌。该方法比普通PCR检测方法灵敏度高10^2~10^3倍。选择17株细菌菌株作为检测模板,发现除创伤弧菌和副溶血弧菌反应结果呈阳性外,其他均为阴性。以大菱鲆作为实验动物,检测双重LAMP技术的实际应用可能,该方法可准确检测并鉴定出组织和血液中感染的细菌种类,其灵敏度可达374~410CFU/g(mL)。SYBR Green Ⅰ是一种结合于DNA双链小沟中的荧光染料,反应产物加入该染料后,极易用肉眼判别。本试验成功建立了创伤弧菌和副溶血弧菌的双重LAMP检测方法,该方法可用于水产养殖中病原菌的早期诊断。 展开更多
关键词 创伤弧菌 metalloprotease基因 副溶血弧菌 ompA基因 双重lamp
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一种可视化双重荧光RT-LAMP方法鉴别不同毒力新城疫病毒 被引量:2
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作者 曾婷婷 谢丽基 +7 位作者 谢芝勋 罗思思 李孟 黄娇玲 张民秀 张艳芳 范晴 邓显文 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1902-1908,共7页
环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测技术具有快速、敏感、仪器简单的优势。为了达到多重鉴别检测的目的,将分子信标引入LAMP反应体系,建立一套鉴别不同毒力新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的可... 环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测技术具有快速、敏感、仪器简单的优势。为了达到多重鉴别检测的目的,将分子信标引入LAMP反应体系,建立一套鉴别不同毒力新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)的可视化双重荧光RT-LAMP方法。分别设计2套扩增不同毒力ClassⅡNDV F基因的LAMP引物,针对区分NDV毒力的分子标志F蛋白裂解位点的基序差异设计2条分子信标。中、强毒NDV分子信标5′端标记FAM荧光基团,3′端标记Dabcyl淬灭基团;弱毒NDV 5′端标记CY5荧光基团,3′端标记BHQ3淬灭基团。用经过条件优化的RT-LAMP体系对不同毒力NDV及其他病原进行鉴别检测,结果显示,LAMP引物能特异地扩增ClassⅡNDV,在荧光成像仪下,中、强毒NDV显示绿色荧光,弱毒显示红色荧光,混合感染显示黄色荧光,而其他家禽常见病原无荧光显示;以体外转录的NDV ssRNA片段为模板,建立的RT-LAMP反应体系最低检测限度为100 copies/μL;随机检测疑似NDV病料20份,鉴定结果与经分离、测序鉴定的结果一致。本研究建立的分子信标与LAMP结合的检测方法,可为NDV多重检测提供新的思路。 展开更多
关键词 双重荧光RT-lamp 分子信标 新城疫病毒 F基因
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猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒双重RT-LAMP检测方法的建立与应用 被引量:4
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作者 袁向芬 吴绍强 +2 位作者 吕继洲 张永宁 林祥梅 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期721-728,共8页
根据GenBank中猪瘟病毒(CSFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的保守序列各设计一套LAMP引物,在同一体系中进行RT-LAMP扩增,通过对体系内引物浓度及反应温度等进行优化,建立了可在63℃恒温下对CSFV和PRRSV进行同步检测的LAMP方法,并进... 根据GenBank中猪瘟病毒(CSFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的保守序列各设计一套LAMP引物,在同一体系中进行RT-LAMP扩增,通过对体系内引物浓度及反应温度等进行优化,建立了可在63℃恒温下对CSFV和PRRSV进行同步检测的LAMP方法,并进行了敏感性和特异性试验。结果显示,该方法的灵敏度与荧光定量RT-PCR相当,与常规RT-PCR相比高10倍;用该方法对猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、猪轮状病毒、伪狂犬病病毒、猪圆环病毒2型进行RT-LAMP扩增,均未发生交叉反应。用该法对采自天津市4个猪场的52份临床样品进行检测,与荧光定量RT-PCR检测结果的符合率为100%。结果表明,该方法具有良好的敏感性和特异性,可实现两病原的同步快速检测,是临床疫病初筛技术的强有力候选。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 猪繁殖与呼吸综合征病毒 双重RT-lamp 检测
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二重荧光RT-LAMP鉴别检测禽呼肠孤病毒和鸡滑液囊支原体 被引量:4
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作者 曾婷婷 谢芝勋 +9 位作者 谢丽基 王盛 谢志勤 黄娇玲 万丽军 任红玉 张艳芳 张民秀 范晴 邓显文 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2023年第9期66-75,共10页
本研究旨在建立一套通过添加荧光探针FD,反应后可使用成像仪直接观测结果的鉴别检测禽呼肠孤病毒(ARV)和鸡滑液囊支原体(MS)的二重荧光RT-LAMP检测方法。根据ARV和MS的保守基因片段,设计了2套LAMP引物,并各添加1条FD荧光探针,2条FD探针... 本研究旨在建立一套通过添加荧光探针FD,反应后可使用成像仪直接观测结果的鉴别检测禽呼肠孤病毒(ARV)和鸡滑液囊支原体(MS)的二重荧光RT-LAMP检测方法。根据ARV和MS的保守基因片段,设计了2套LAMP引物,并各添加1条FD荧光探针,2条FD探针分别标记CY5和6-FAM荧光基团。结果:ARV阳性对照在成像仪下发出红色荧光,MS阳性对照发出绿色荧光,双重模板经过图像融合后为黄色荧光;特异性结果显示,该二重荧光RT-LAMP检测方法仅能扩增ARV和MS两种病原,对其他常见病原如鸡毒支原体(MG)、禽流感病毒(AIV)、新城疫病毒(NDV)等无扩增反应;敏感性结果显示,该二重荧光RT-LAMP检测方法对ARV和MS的最低检测量分别为1.7×10^(2)copies和1.9×10^(2)copies;使用该方法检测40份临床样品,检出率与本实验室前期建立的二重荧光RT-PCR检测结果相同。综上,该二重荧光RT-LAMP检测方法可特异、敏感地鉴别检测ARV和MS,通过添加FD荧光探针和成像仪观测结果,为不同条件的实验室提供了新的检测手段。 展开更多
关键词 FD荧光探针 二重荧光RT-lamp 禽呼肠孤病毒 鸡滑液囊支原体
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检测猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪圆环病毒的二重荧光LAMP方法的建立 被引量:3
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作者 谢志勤 张民秀 +11 位作者 谢芝勋 范晴 罗思思 谢丽基 黄娇玲 王盛 曾婷婷 张艳芳 李孟 李丹 邓显文 刘加波 《中国兽药杂志》 2020年第9期1-9,共9页
建立一种二重荧光LAMP的检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和猪圆环病毒(PCV)的快速诊断技术。根据已发表的PRRSV NSP2基因和PCV2 ORF2基因序列保守区域,分别设计并合成了两组针对PRRSV和PCV2序列的特异性引物和两条探针,两条探针分别... 建立一种二重荧光LAMP的检测猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)和猪圆环病毒(PCV)的快速诊断技术。根据已发表的PRRSV NSP2基因和PCV2 ORF2基因序列保守区域,分别设计并合成了两组针对PRRSV和PCV2序列的特异性引物和两条探针,两条探针分别标记不同的荧光基团,PRRSV-Probe 5’端标记FAM荧光基团,3’端标记BHQ1淬灭基团,PCV-Probe 5’端标记CY5.5荧光基团,3’端标记BHQ2淬灭基团。对组成反应体系中的引物、探针以及反应试剂进行优化,建立了二重荧光LAMP检测PRRSV和PCV2方法。对建立的方法进行特异性和敏感性测试,并用模拟混合样品和临床样品进行检测验证。结果显示,本研究建立的方法可以鉴别区分PRRSV和PCV2,特异性试验表明该方法只检测出PRRSV或PCV2,且与参试的对照病毒无交叉反应,特异性好。敏感性测试表明该方法最低检测PRRSV或PCV为100拷贝,敏感性好。对临床样品的检测,结果与荧光定量PCR方法检测结果一致。本研究建立的PRRSV和PCV2二重荧光LAMP检测方法,具有良好的特异性和敏感性,可用于临床样品中检测PRRSV和PCV2。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 猪圆环病毒 二重lamp 检测
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猪瘟病毒和猪圆环病毒2型二重荧光LAMP检测方法的建立 被引量:10
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作者 谢志勤 张民秀 +11 位作者 谢芝勋 范晴 罗思思 谢丽基 黄娇玲 王盛 曾婷婷 张艳芳 李孟 李丹 邓显文 刘加波 《动物医学进展》 北大核心 2021年第3期1-6,共6页
建立二重荧光LAMP方法,检测猪瘟病毒(CSFV)和猪圆环病毒2型(PCV2)。根据CSFV E2基因和PCV2 ORF2基因序列保守区域,分别设计并合成了2组针对CSFV和PCV2序列的特异性引物和2条标记不同的荧光基团探针,在CSFV探针序列5′端标记FAM荧光基团,... 建立二重荧光LAMP方法,检测猪瘟病毒(CSFV)和猪圆环病毒2型(PCV2)。根据CSFV E2基因和PCV2 ORF2基因序列保守区域,分别设计并合成了2组针对CSFV和PCV2序列的特异性引物和2条标记不同的荧光基团探针,在CSFV探针序列5′端标记FAM荧光基团,3′端标记BHQ1淬灭基团,PCV2探针序列5′端标记CY5.5荧光基团,3′端标记BHQ2淬灭基团。以设计合成的引物、探针以及LAMP反应试剂建立二重荧光LAMP检测方法区分CSFV和PCV2,对该方法中的反应体系进行优化,并进行特异性、敏感性和干扰性测试以及临床样品验证测试。结果表明,建立的方法可鉴别CSFV和PCV2,特异性试验显示,该方法只检测出CSFV或PCV2,且与参试的对照病毒无交叉反应,特异性好。该方法最低检测CSFV或PCV2为100拷贝/μL,敏感性好。临床样品的检测结果与荧光定量PCR检测结果一致。建立的CSFV和PCV2二重荧光LAMP检测方法具有良好的特异性和敏感性,可适用于CSFV和PCV2的鉴别检测。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 猪圆环病毒2型 二重荧光lamp 检测
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猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒二重荧光LAMP检测方法的建立 被引量:3
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作者 谢志勤 张民秀 +11 位作者 谢芝勋 范晴 罗思思 谢丽基 黄娇玲 王盛 曾婷婷 张艳芳 李孟 李丹 邓显文 刘加波 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1220-1228,共9页
本研究为建立一种检测猪瘟病毒(CSFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的二重荧光(LAMP)技术,根据已发表的CSFV E2基因和PRRSV NSP2基因序列保守区域,分别设计并合成了2组针对CSFV和PRRSV序列的特异性引物和2条探针,在CSFV探针5′端标记... 本研究为建立一种检测猪瘟病毒(CSFV)和猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的二重荧光(LAMP)技术,根据已发表的CSFV E2基因和PRRSV NSP2基因序列保守区域,分别设计并合成了2组针对CSFV和PRRSV序列的特异性引物和2条探针,在CSFV探针5′端标记FAM荧光基团,3′端标记BHQ1淬灭基团,PRRSV探针5′端标记CY5.5荧光基团,3′端标记BHQ2淬灭基团。用设计的引物、探针及反应试剂组成反应体系,建立CSFV和PRRSV二重荧光LAMP检测方法。对建立的方法进行特异性、敏感性、干扰性试验,并用临床样品进行验证。结果显示,本研究成功建立了鉴别CSFV和PRRSV的二重荧光LAMP方法,该方法只检测出CSFV(绿色)或PRRSV(红色)或CSFV和PRRSV混感(黄色),而对照毒株则无荧光颜色出现,具有较好的特异性。敏感性检测CSFV或PRRSV的含量浓度,其最低检测浓度均为100 copies/mL,敏感性较好。干扰性结果显示,高低不同的模板浓度不影响本方法的检测扩增,干扰性小。对112份采集的临床样品进行检测,结果,检出CSFV阳性样品41份,PRRSV阳性样品12份,CSFV和PRRSV同时为阳性的样品3份,该结果与荧光定量RT-PCR方法的检测结果一致。上述结果表明,本研究建立的CSFV和PRRSV二重荧光LAMP检测方法具有良好的特异性和敏感性,并具有检测临床样品中CSFV和PRRSV的潜力。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 猪繁殖与呼吸综合征病毒 二重荧光 lamp检测方法
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艰难梭菌毒素A和B双重环介导等温扩增检测方法的建立及验证 被引量:1
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作者 席小燕 林玉兰 +2 位作者 卢金莹 陈惠权 彭凌 《中国生物制品学杂志》 2025年第1期67-72,79,共7页
目的建立快速检测艰难梭菌毒素A(Clostridium difficile toxin A,TcdA)和B(TcdB)的双重环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,为艰难梭菌(Clostridium difficile,CD)感染的快速检测和毒素分型提供技术... 目的建立快速检测艰难梭菌毒素A(Clostridium difficile toxin A,TcdA)和B(TcdB)的双重环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,为艰难梭菌(Clostridium difficile,CD)感染的快速检测和毒素分型提供技术支持。方法根据TcdA和TcdB基因的保守序列各设计1套LAMP引物,在同一体系内进行双重LAMP扩增,通过对反应体系和反应条件的优化,建立快速检测TcdA和TcdB的LAMP方法,对该方法进行特异性和灵敏度验证,并对LAMP扩增产物进行熔解曲线分析。用建立的方法对18份腹泻患者粪便样本进行检测。结果TcdA和TcdB均能进行较好扩增的双重LAMP反应条件为:Mg2+浓度6.8 mmol/L,dNTPs浓度1.2 mmol/L,扩增温度64℃。扩增结果可采用SYBR GreenⅠ染色完成初步检测,目标基因(菌)显示翠绿色荧光,6种其他常见肠道病原体(大肠埃希菌、屎肠球菌、粪肠球菌、产气荚膜梭菌、脆弱类杆菌、肉毒梭菌)无荧光;双重LAMP体系检测TcdA和TcdB的灵敏度分别为10~0和10~1个质粒/反应,通过分析熔解曲线的特征峰可判断CD菌株所含的确切目标毒素。18份腹泻患者粪便样本中有8份样本初步检测为阳性,经溶解曲线分析,均含TcdA和TcdB两种毒素。结论初步建立了TcdA和TcdB双重LAMP检测方法,该方法具有较好的灵敏度和特异性,可用于CD感染的快速检测,并可实现TcdA与TcdB的同时快速检测。 展开更多
关键词 艰难梭菌毒素A 艰难梭菌毒素B 双重环介导等温扩增技术 毒素分型
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基于不同PCR方法的Ⅱ型鲤疱疹病毒检测技术研究 被引量:7
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作者 谢亚君 税典章 +3 位作者 吴萍 叶元土 王敏 蒋蓉 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期1018-1025,共8页
异育银鲫"鳃出血病"是一种因感染了鲤疱疹病毒Ⅱ型(Cy HV-2)而引起的疾病,近年来给江苏异育银鲫养殖业造成了巨大的经济损失。为了能够建立及时、有效检出Ⅱ型鲤疱疹病毒的技术,本研究在克隆了Cy HV-2解旋酶基因和三联体蛋白... 异育银鲫"鳃出血病"是一种因感染了鲤疱疹病毒Ⅱ型(Cy HV-2)而引起的疾病,近年来给江苏异育银鲫养殖业造成了巨大的经济损失。为了能够建立及时、有效检出Ⅱ型鲤疱疹病毒的技术,本研究在克隆了Cy HV-2解旋酶基因和三联体蛋白基因的基础上,建立了检测CyHV-2的普通PCR、双重PCR、巢式PCR、环介导等温扩增、实时荧光定量PCR等方法,并对这5种PCR技术检测Cy HV-2的灵敏性进行了系统研究。结果表明,针对CyHV-2病毒的解旋酶基因和三联体蛋白基因,普通PCR能够检测出的极限值是2.4×10~4 copies/μL,双重PCR是1.4×10~4 copies/μL,巢式PCR是2.4×10^(-2)copies/μL,荧光定量PCR是2.4×10^(-2)copies/μL,环介导等温扩增是3.5×10~2 copies/μL。通过采用以上方法对从不同地区采集的54尾异育银鲫提取的DNA为模板进行临床检验,测定不同检测方法的阳性检出率。结果表明,实时荧光定量PCR和巢式PCR的检出率很高,分别为89%和90.7%;普通PCR的检出率最低,为68.5%。综合检测灵敏度和阳性检出率,环介导等温扩增(LAMP)是一种适用于生产实践的能有效检测CyHV-2的良好技术。 展开更多
关键词 Ⅱ型鲤疱疹病毒 双重PCR 巢式PCR 环介导等温扩增 荧光定量PCR
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羊乳中牛乳成分的环介导等温扩增高分辨熔解检测 被引量:4
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作者 张文娟 澹台玮 +2 位作者 李敏康 蔡露阳 徐秦峰 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2020年第21期223-227,共5页
为了提高检测效率,节省时间、试剂和样本,建立了基于高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)的双重环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术用于羊乳中牛乳成分的检测。通过引物设计优化,牛引物目标... 为了提高检测效率,节省时间、试剂和样本,建立了基于高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)的双重环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术用于羊乳中牛乳成分的检测。通过引物设计优化,牛引物目标产物的T m值在80℃,羊引物目标产物的T m值在83℃,由于在传统熔解曲线中峰型有交叉重叠,同时检测存在干扰,因此使用HRM技术,实现了2种不同动物源性成分的有效区分。该方法特异性好,不需要针对牛、羊源性成分单独进行检测,当体系中存在其中一种或两种都存在时都可将其快速检出,且对其他物种没有交叉反应及假阳性现象的发生,成功应用于市售羊乳及其制品的检测。 展开更多
关键词 羊乳 牛乳 环介导等温扩增(lamp)技术 高分辨率熔解曲线(HRM) 双重检测
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