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dPCR方法动态监测T790M突变在EGFR阳性非小细胞肺癌耐药治疗中的指导作用
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作者 姚铠涛 曾小芸 +3 位作者 连逸恺 林建雄 王双玲 魏丹娜 《分子诊断与治疗杂志》 2026年第1期131-134,共4页
目的本研究旨在探讨使用数字PCR(dPCR)方法动态监测血浆EGFR T790M突变的可行性,并评估基于血浆T790M突变检测的早期干预是否可作为EGFR突变非小细胞肺癌患者EGFR-TKI转换治疗的最佳时机。方法初筛2021年7月至2023年12月在汕头大学医学... 目的本研究旨在探讨使用数字PCR(dPCR)方法动态监测血浆EGFR T790M突变的可行性,并评估基于血浆T790M突变检测的早期干预是否可作为EGFR突变非小细胞肺癌患者EGFR-TKI转换治疗的最佳时机。方法初筛2021年7月至2023年12月在汕头大学医学院第二附属医院75例接受埃克替尼治疗的EGFR阳性Ⅳ期NSCLC患者,T790M突变率为53.3%,最终纳入40例患者。试验组(n=18)在血浆检测到T790M突变后更换第三代EGFR-TKI治疗,对照组(n=22)在影像学进展及T790M突变后更换EGFR-TKI治疗。比较两组的临床疗效、无进展生存期(PFS)及不良反应。结果试验组的客观缓解率(ORR)为72.2%,对照组为68.2%,两组差异无统计学意义(P>0.05)。试验组的疾病控制率(DCR)为94.4%,对照组为81.9%,差异无统计学意义(P>0.05)。试验组的中位PFS显著长于对照组,差异有统计学意义(14.8个月vs 10.3个月,P=0.024)。两组的不良反应均为1~2级,皮疹、腹泻及肝功能异常的发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论使用dPCR动态监测血浆EGFR T790M突变,可较影像学更早识别一代EGFR-TKI耐药,从而及时转换三代EGFR-TKI治疗,延缓疾病进展,是一种经济且临床可行的策略。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 EGFR T790M 数字pcr 三代酪氨酸激酶抑制剂
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Detection Sensitivity of Chip Digital PCR for Staphylococcus aureus
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作者 Yunxia WANG Xiaxia HOU +1 位作者 Xiaoli WU Wang LIU 《Asian Agricultural Research》 2026年第1期46-50,60,共6页
[Objectives]This study aimed to evaluate the detection sensitivity of Staphylococcus aureus in dairy products utilizing the chip digital PCR(cdPCR)technique.[Methods]Specific primers and probes were designed and synth... [Objectives]This study aimed to evaluate the detection sensitivity of Staphylococcus aureus in dairy products utilizing the chip digital PCR(cdPCR)technique.[Methods]Specific primers and probes were designed and synthesized based on the conserved sequence of the heat-resistant nuclease gene nuc of S.aureus.cdPCR was employed to detect S.aureus,and the sensitivity of this technique was systematically assessed in samples exhibiting low levels of contamination.[Results]cdPCR demonstrated precise quantification when the initial concentration of the sample enrichment solution was equal to or greater than 50 CFU/mL.The detection dynamic range extended across at least five orders of magnitude,with a minimum DNA detection limit of 0.2304 pg/μL.In artificially contaminated cheese samples,the method s lower limit of quantification for detecting S.aureus was 8×10^(2) CFU/g.Regression analysis demonstrated that the gene copy number concentration measured by cdPCR exhibited a strong linear correlation with bacterial contamination concentration across a broad range.[Conclusions]The cdPCR method developed in this study demonstrates high sensitivity and robust quantitative capabilities,offering a reliable technical approach for the precise detection of low-level S.aureus contamination in dairy products. 展开更多
关键词 Staphylococcus aureus Chip digital pcr (cdpcr) Sensitivity
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大视场dPCR检测系统中的荧光LED照明设计 被引量:1
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作者 金旭东 张磬瀚 +3 位作者 严言 郑继红 韦晓孝 万新军 《光学技术》 北大核心 2025年第4期424-431,共8页
数字聚合酶链式反应(dPCR)是一种能实现绝对定量检测的分子生物学技术。传统的dPCR荧光检测系统在检测通量、检测速度、系统体积以及成本之间难以达到合理平衡。特别是传统照明系统设计在照射面积、均匀性、体积和开关响应速度方面存在... 数字聚合酶链式反应(dPCR)是一种能实现绝对定量检测的分子生物学技术。传统的dPCR荧光检测系统在检测通量、检测速度、系统体积以及成本之间难以达到合理平衡。特别是传统照明系统设计在照射面积、均匀性、体积和开关响应速度方面存在限制,影响设备的整体性能及应用。为此,本文设计了一种基于匀光设计LED激发优化的便携式dPCR大视场荧光检测系统,旨在不牺牲检测速度与通量的前提下,缩小系统体积并降低成本。系统通过高集成度的环形LED光源排布,实现了18mm×18mm全视场范围内三种荧光通道(FAM、HEX、ROX)的均匀照明,实际照明均匀度超过90%,并支持三通道快速开关切换。相比于传统的照明模块,LED匀光激发照明在小型化、低成本以及高集成度方面具有优势,适应于多种荧光检测应用场景,促进dPCR技术未来的发展。 展开更多
关键词 应用光学 数字pcr 微流控芯片 光学设计 荧光显微镜
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日本血吸虫病小鼠粪便虫卵DNA检测荧光RAA法和ddPCR探针法比较
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作者 汤宪时 赵松 +2 位作者 杨静 许永良 仝德胜 《热带医学杂志》 2025年第1期1-5,11,共6页
目的比较荧光重组酶介导的等温扩增反应(RAA)法和微滴式数字PCR(ddPCR)探针法检测小鼠粪便中日本血吸虫虫卵DNA的灵敏度。方法CD1小鼠15只,随机分为感染组(n=10)和阴性对照组(n=5)。阴性对照组以去氯水处理;感染组小鼠经腹壁接触感染日... 目的比较荧光重组酶介导的等温扩增反应(RAA)法和微滴式数字PCR(ddPCR)探针法检测小鼠粪便中日本血吸虫虫卵DNA的灵敏度。方法CD1小鼠15只,随机分为感染组(n=10)和阴性对照组(n=5)。阴性对照组以去氯水处理;感染组小鼠经腹壁接触感染日本血吸虫尾蚴20条,于感染后第23、27、30、35天取小鼠粪便,第45天安乐死解剖,获得肝内虫卵,进行虫卵计数。分别以含固定数量虫卵的粪便基因组DNA连续稀释梯度、含不同虫卵数量小鼠粪便基因组DNA、小鼠不同感染时间点粪便基因组DNA为模板比较荧光RAA和ddPCR探针法灵敏度。结果含固定虫卵数量(>50000)粪便样本(661 ng/μL)浓度稀释107倍后,荧光RAA仍可检出阳性反应,而ddPCR探针法检测稀释105倍样本的数值(15.10 copies/μL)与对照组(11.40 copies/μL)近似。荧光RAA法未能于虫卵含量少于50000个的粪便基因组DNA检出明显阳性扩增,而约含5000、1000、500、200、100个虫卵的粪便DNA样本的ddPCR探针法检测值[(60.97±3.46)、(103.33±10.69)、(55.10±2.02)、(20.00±2.45)、(36.37±0.45)copies/μL]与对照组(0.38±0.16)copies/μL比较差异均有统计学意义(P均<0.01)。两种方法均未能于感染后23 d小鼠粪便DNA样本中检出阳性反应,荧光RAA法可在感染后第30天粪便DNA检出明显阳性反应,感染后第27天粪便样本出现阳性反应趋势,而ddPCR探针法只于感染后第35天(205.00 copies/μL)粪便中检出阳性反应。结论荧光RAA比ddPCR探针法在检测日本血吸虫感染小鼠粪便虫卵DNA方面更敏感,但ddPCR探针法检测结果稳定,可重复性更好,两者结合使用,可以实现敏感有效地检测粪便虫卵DNA。 展开更多
关键词 日本血吸虫 粪便 虫卵 重组酶介导的等温扩增反应 微滴式数字pcr
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猪圆环病毒2型微滴数字PCR检测方法的建立及临床应用
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作者 刘武函 唐小明 +8 位作者 彭志 张坤 谢怡灵 范仲鑫 王卫国 尚玲 张梦凡 杨青 胡巧云 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2026年第1期120-125,共6页
为建立一种特异性强、敏感性高、重复性好的猪圆环病毒2型(PCV-2)微滴数字PCR检测方法,试验基于PCV-2 ORF1保守区域设计引物和探针,通过优化引物浓度、探针浓度和退火温度及特异性、敏感性和重复性试验建立微滴数字PCR方法,并采用该方法... 为建立一种特异性强、敏感性高、重复性好的猪圆环病毒2型(PCV-2)微滴数字PCR检测方法,试验基于PCV-2 ORF1保守区域设计引物和探针,通过优化引物浓度、探针浓度和退火温度及特异性、敏感性和重复性试验建立微滴数字PCR方法,并采用该方法对90份临床样本进行检测。结果表明:建立的PCV-2微滴数字PCR检测方法的最佳引物和探针浓度分别为18μmol/L和9μmol/L,退火温度为61℃;能特异性检出PCV-2,与多种常见猪病原[猪圆环病毒3型(PCV-3)、伪狂犬病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、非洲猪瘟病毒(ASFV)、猪瘟病毒(CSFV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)]无交叉反应;最低检测限为3.48 copies/μL;重复性试验中扩增后的拷贝数组内与组间变异系数范围分别在0.91%~6.13%和1.44%~8.53%之间,均小于10%。90份临床样本中,建立的微滴数字PCR方法检出PCV-2阳性样本43份,检出率为47.78%,经统计微滴数字PCR方法检出的阳性样本包含了实时荧光定量PCR方法检出的所有阳性样本,与实时荧光定量PCR方法的符合率为88.89%。说明本研究建立的PCV-2微滴数字PCR检测方法特异性强、敏感性高、重复性好,适用于临床样本(特别是低病毒载量样本)的检测。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 微滴数字pcr 病毒检测 检测方法 特异性试验 敏感性试验 重复性试验
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阿胶含量定量检测中Digital PCR的应用研究
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作者 李娜 王一村 +3 位作者 苟艳萍 郭岳 侯广月 周莉莉 《中国标准化》 2025年第13期206-210,共5页
本文探讨了在阿胶含量定量检测中引入数字聚合酶链反应(Digital PCR)技术的必要性、可行性及技术路径。通过对阿胶样本的全面评估,结合Digital PCR的高灵敏度和绝对定量优势,提出了一套系统的检测流程,包括样本总体的确定、技术指标和... 本文探讨了在阿胶含量定量检测中引入数字聚合酶链反应(Digital PCR)技术的必要性、可行性及技术路径。通过对阿胶样本的全面评估,结合Digital PCR的高灵敏度和绝对定量优势,提出了一套系统的检测流程,包括样本总体的确定、技术指标和质量特性的设定、样本抽取及检测结果的评估等。研究表明,Digital PCR技术能够有效提升阿胶含量定量检测的准确性,并为行业提供可靠的质量数据。 展开更多
关键词 阿胶含量 定量检测 digital pcr
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牛肠道病毒数字微滴PCR检测方法的建立与应用
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作者 孟令品 尹柳祎 +6 位作者 宋扬 安彦 桑浩杰 郭帅 赵东辉 翟景波 温树波 《微生物学通报》 北大核心 2026年第2期1083-1095,共13页
背景牛肠道病毒(bovine enterovirus,BEV)是影响牛养殖业效益的重要病原之一,其流行性随着畜牧业的发展进一步加剧。现有的检测方法如qPCR虽然应用广泛,但其在低病毒载量的样本中常有假阴性或结果不稳定的局限性。数字微滴PCR(droplet d... 背景牛肠道病毒(bovine enterovirus,BEV)是影响牛养殖业效益的重要病原之一,其流行性随着畜牧业的发展进一步加剧。现有的检测方法如qPCR虽然应用广泛,但其在低病毒载量的样本中常有假阴性或结果不稳定的局限性。数字微滴PCR(droplet digital PCR,ddPCR)凭借高灵敏度与绝对定量优势,为低载量病毒检测提供了更可靠的方法。目的建立一种特异性强、灵敏度高、重复性良好的BEV数字微滴PCR(RT-ddPCR)检测方法。方法基于BEV基因组保守区域设计特异性引物和探针,以BEV cDNA为模板进行PCR扩增,将产物克隆至pMD18-T载体构建质粒标准品;优化RT-ddPCR退火温度并评估其特异性、灵敏度和重复性。结果该检测方法最佳退火温度为60℃;灵敏度高,最低检测限达1.6 copies/μL;重复性好(变异系数CV=8.6%);特异性强。该方法在检测牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛库布病毒(bovine kobuvirus,BKoV)、牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCoV)及牛副流感病毒5型(bovine parainfluenza virus type 5,BPIV5)时均未出现阳性结果,表明无非特异性扩增;与RT-qPCR平行检测14份牛粪便样品结果显示,RT-ddPCR具有更优的检测性能。结论成功建立的BEV RT-ddPCR方法特异性强、灵敏度高、重复性好,适用于临床样品的核酸检测,为牛肠道病毒感染的早期诊断与准确定量提供了可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 牛肠道病毒 数字微滴pcr 病毒检测
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The Application Value of Droplet Digital PCRTechnology in the Diagnosis of BacterialInfections in Febrile Patients
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作者 Yan Zeng 《Journal of Clinical and Nursing Research》 2025年第12期72-76,共5页
Droplet digital PCR(ddPCR),as the third-generation PCR technology,demonstrates significant advantages in the etiological diagnosis of infectious diseases due to its absolute quantification,ultra-high sensitivity,and m... Droplet digital PCR(ddPCR),as the third-generation PCR technology,demonstrates significant advantages in the etiological diagnosis of infectious diseases due to its absolute quantification,ultra-high sensitivity,and multiplex detection capabilities.This article reports a case of a patient with fever of unknown origin,where ddPCR rapidly confirmed a drug-resistant bacterial infection and dynamically monitored treatment efficacy.Combining literature evidence,this paper systematically elaborates on the technical principles,clinical performance,and practical value of ddPCR in febrile patients. 展开更多
关键词 Droplet digital pcr Bacterial infection Nucleic acid detection Drug resistance gene
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基于微滴式数字PCR技术多重精准检测鉴定三种常见检疫性粉蚧
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作者 李鑫 李辉 +4 位作者 李立梅 杨力凤 孟凡泽 褚栋 付海滨 《昆虫学报》 北大核心 2026年第2期255-265,共11页
【目的】应用微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)技术,建立大洋臀纹粉蚧Planococcus minor、南洋臀纹粉蚧Pl.lilacinus和木瓜秀粉蚧Paracoccus marginatus 3种高频截获检疫性粉蚧多重精准检测方法。【方法】以口岸截获和国内采... 【目的】应用微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)技术,建立大洋臀纹粉蚧Planococcus minor、南洋臀纹粉蚧Pl.lilacinus和木瓜秀粉蚧Paracoccus marginatus 3种高频截获检疫性粉蚧多重精准检测方法。【方法】以口岸截获和国内采集的常见粉蚧大洋臀纹粉蚧、南洋臀纹粉蚧、木瓜秀粉蚧、新菠萝灰粉蚧Dysmicoccus neobrevipes、杰克贝尔氏粉蚧Pseudococcus jackbeardsleyi、木槿曼粉蚧Maconellicoccus hirsutus、康氏粉蚧Ps.comstocki和桔臀纹粉蚧Pl.citri为参试材料,选择COⅠ基因序列为靶标,使用GenBank数据库、 MEGA11和Beacon Designer 8等进行同源性比对和特异性引物与探针设计;在构建的大洋臀纹粉蚧、南洋臀纹粉蚧和木瓜秀粉蚧3种粉蚧单重ddPCR检测体系的基础上,通过筛选最佳引物和探针浓度优化反应体系,建立可同时快速、绝对定量检测大洋臀纹粉蚧、南洋臀纹粉蚧和木瓜秀粉蚧基因组拷贝数的多重ddPCR检测方法,并与TaqMan qPCR方法进行比较,测定该方法的灵敏度、定量限及准确性。【结果】构建的多重ddPCR检测体系内各组引物和探针对目标粉蚧基因组均能扩增,未出现交叉反应,DNA最低检测浓度与TaqMan qPCR中的一致。这一多重ddPCR体系对大洋臀纹粉蚧基因组的绝对定量检测低限为0.44拷贝/μL,对南洋臀纹粉蚧基因组的绝对定量检测低限为0.43拷贝/μL,对木瓜秀粉蚧基因组的绝对定量检测低限为0.44拷贝/μL。在定量检测范围内这一多重ddPCR体系定量检测的线性决定系数R^(2)均大于0.99,且重复性和线性相关性较好。【结论】本研究建立的多重ddPCR检测方法可实现对3种高频截获检疫性粉蚧大洋臀纹粉蚧、南洋臀纹粉蚧和木瓜秀粉蚧快速、精准鉴定,为口岸外来有害生物防控和保护我国生态安全提供技术服务和支持。 展开更多
关键词 大洋臀纹粉蚧 南洋臀纹粉蚧 木瓜秀粉蚧 分子鉴定 分子标记 微滴式数字pcr
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Droplet Digital PCR for Diagnosing Brucellosis Spondylitis:Method Development and Evaluation
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作者 Xiuqin Chang Guangtian Liu +3 位作者 Bo Li Meng Hao Xuefeng Jiang Zhiguo Liu 《Biomedical and Environmental Sciences》 2025年第7期877-880,共4页
Brucellosis is a global public health issue that severely affects human health,Brucella melitensis is currently the predominant species in China.Brucella spondylitis is the primary cause of the debilitating and disabl... Brucellosis is a global public health issue that severely affects human health,Brucella melitensis is currently the predominant species in China.Brucella spondylitis is the primary cause of the debilitating and disabling complications[1].The lumbar vertebra was the most commonly affected site,followed by the thoracic,cervical,thoracolumbar,and lumbosacral segments,and back pain,fever,sweating,and fatigue were the most common symptoms[2].However,the diagnosis of Brucella spondylitis is challenging owing to its wide spectrum of clinical presentations,cross-reactions with other bacteria,and low strain isolation rate.Therefore,a timely and accurate diagnosis of spinal brucellosis is crucial for implementing an effective therapeutic plan and improving treatment outcomes.Droplet digital polymerase chain reaction(ddPCR)is widely used for low-abundance nucleic acid detection and is useful for diagnosing infectious diseases[3].Therefore,this study aimed to evaluate the ddPCR approach for the diagnosis of brucellosis with spondylitis to improve its clinical diagnostic capacity. 展开更多
关键词 Droplet digital pcr Clinical Presentation Method Development lumbar vertebra Public Health Issue Diagnostic Evaluation Brucella Melitensis brucella spondylitis
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转基因大豆DBN8205转化体特异性定量PCR方法的研发和验证
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作者 吴琼 谢香庭 +2 位作者 王磊 牟勇 李进伟 《中国农业科学》 北大核心 2026年第1期29-40,共12页
【目的】转基因大豆DBN8205转化体已获批转基因生物安全证书(生产应用),转育品种即将产业化应用,建立DBN8205转化体特异性定性定量检测方法,为转基因生物安全监管和定量标识制度的实施提供依据。【方法】根据DBN8205转化体的分子特征序... 【目的】转基因大豆DBN8205转化体已获批转基因生物安全证书(生产应用),转育品种即将产业化应用,建立DBN8205转化体特异性定性定量检测方法,为转基因生物安全监管和定量标识制度的实施提供依据。【方法】根据DBN8205转化体的分子特征序列,设计转化体特异性引物和探针。通过比较多个引物探针组合的扩增曲线及Ct值,筛选出最佳引物探针组合。分别在实时荧光定量PCR和微滴数字PCR平台上考察DBN8205转化体特异性PCR方法的特异性、检测限、定量限、动力学范围和定量准确性等技术参数。制定标准方法联合验证方案,邀请多家实验室对实时荧光定量PCR方法进行联合验证,对联合验证数据进行统计分析,考察方法的重复性和重现性。【结果】筛选出最佳引物探针组合DBN8205-QF/QR/QP,扩增产物长120 bp,仅特异性识别DBN8205转化体成分,具有良好的扩增特异性。在实时荧光定量PCR平台上,检测限为10 copies,定量限为40 copies,标准曲线的各项技术参数符合标准要求,在40—8.2×10^(4)copies动力学范围内,模板拷贝数和Ct值间具有良好的线性关系,能够对含量低至0.1%的样品进行准确定量。8家实验室联合验证结果表明,DBN8205转化体特异性实时荧光定量PCR方法具有良好的重复性和重现性。在微滴数字PCR平台上,检测限和定量限与实时荧光定量PCR方法相同,分别为10和40 copies,动力学范围为40—8.0×10^(4)copies,能够对低至0.1%的样品进行准确定量,定量结果比qPCR具有更高的精密度。t检验表明,实时荧光定量PCR和二重微滴数字PCR的定量结果具有良好的一致性。【结论】建立的DBN8205转化体特异性定量PCR方法能够对DBN8205转化体进行身份鉴定,可在实时荧光定量PCR和微滴数字PCR平台上对产品中的DBN8205转化体成分进行精准定量分析。 展开更多
关键词 转基因大豆 DBN8205转化体 实时荧光定量pcr 二重微滴数字pcr 定量
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禽痘病毒微滴数字PCR检测方法的建立及应用
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作者 张熠帆 韩笑 +5 位作者 张叶娜 孔朋莉 宋厚辉 张晓峰 王晓杜 帅江冰 《畜牧兽医学报》 北大核心 2026年第1期337-348,共12页
旨在建立一种禽痘病毒(fowlpox virus,FWPV)微滴式数字聚合酶链式反应(digital droplet PCR,ddPCR)检测方法。本研究通过对反应体系优化,包括引物和探针浓度的优化、退火温度的优化等步骤,进行重复性、敏感性、特异性试验,建立了较为完... 旨在建立一种禽痘病毒(fowlpox virus,FWPV)微滴式数字聚合酶链式反应(digital droplet PCR,ddPCR)检测方法。本研究通过对反应体系优化,包括引物和探针浓度的优化、退火温度的优化等步骤,进行重复性、敏感性、特异性试验,建立了较为完整的ddPCR反应体系。本方法确定FWPV ddPCR反应体系最佳引物浓度为900 nmol·L^(-1),最佳探针浓度为200 nmol·L^(-1),且在55℃反应条件下,ddPCR检测结果最优;本方法与其他常见禽类病毒无交叉反应,特异性强;本方法重复性好,批间与批内变异系数均小于10%。本ddPCR方法最低检测限为2.37拷贝·反应-1。采用建立的ddPCR检测方法和行业标准(SN/T 1226—2015)检测方法对80份模拟样本进行检测,其中8份作为阴性,其余72份样品作为模拟感染样品,符合率为100%,比行业标准套式PCR方法符合率高出75%。在25份人工攻毒样本中,ddPCR对阳性样本的检出率达100%,行业标准套式PCR方法对阳性样本的检出率为33.3%。本方法的建立为检测禽及其肉制品中禽痘病毒提供了痕量精准检测方法,为降低禽痘对禽类养殖产业风险带来保障。 展开更多
关键词 禽痘病毒 微滴数字pcr 定量检测
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数字PCR技术在植物病原物检测中的应用
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作者 黄一鸣 王慧珍 +7 位作者 向国旗 张朝政 潘龙其 宋发菊 李双华 施昌华 田进山 乐超银 《中国农业科技导报(中英文)》 北大核心 2026年第2期128-136,共9页
真菌、细菌、病毒和线虫等病原物感染造成的作物损失严重威胁全球农业生产,亟需高效精准的病原物检测技术以实现对病害的早期监测与防控。数字PCR作为第3代核酸定量技术,凭借其高灵敏度、绝对定量及强抗干扰能力,为植物病原物检测提供... 真菌、细菌、病毒和线虫等病原物感染造成的作物损失严重威胁全球农业生产,亟需高效精准的病原物检测技术以实现对病害的早期监测与防控。数字PCR作为第3代核酸定量技术,凭借其高灵敏度、绝对定量及强抗干扰能力,为植物病原物检测提供了新的解决方案。介绍了数字PCR技术原理,并系统综述了该技术在植物病原真菌、细菌、病毒和线虫检测中的应用及其显著提升无症状样本、低载量及复杂基质中病原物检出率等技术优势,进一步展望了其在植物病害监测中的应用前景,为促进植物病原物分子检测技术的优化与创新,构建病害早期预警、种苗检疫及精准施药的智能化病害防控体系提供理论和技术参考。 展开更多
关键词 植物病原物 数字pcr 检测技术 病害监测
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数字PCR在肉类及肉制品食源性致病菌检测中的应用进展
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作者 唐琪 刘静 +1 位作者 曹若蕾 张岩 《河北省科学院学报》 2026年第1期57-63,81,共8页
肉类及肉制品是沙门氏菌属、弯曲杆菌属、大肠杆菌及金黄色葡萄球菌等食源性致病菌的主要载体,其加工环节操作不当易引发全球公共卫生危机。传统检测技术包括培养法、免疫分析法、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法面临... 肉类及肉制品是沙门氏菌属、弯曲杆菌属、大肠杆菌及金黄色葡萄球菌等食源性致病菌的主要载体,其加工环节操作不当易引发全球公共卫生危机。传统检测技术包括培养法、免疫分析法、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法面临时效性差、抗干扰弱、活/死菌无法区分等瓶颈。数字PCR(digital PCR,dPCR)通过微反应单元分区与泊松分布统计,实现肉类基质中病原体的免校准绝对定量,显著突破痕量检测极限。本文系统综述了dPCR在肉类及肉制品主要食源性致病菌检测中的应用,以期为食源性致病菌的风险防控与未来研究提供参考。 展开更多
关键词 数字pcr 肉类 肉制品 检测 食源性致病菌
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数字PCR技术在动物疾病检测中的应用进展
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作者 刘志玲 黄超 +5 位作者 梁佳琪 鱼海琼 焦彦翔 段燕喻 梅明珠 吴晓薇 《现代畜牧兽医》 2026年第2期83-88,共6页
病原微生物对动物养殖业造成了巨大损失,开发高效、灵敏的病原检测技术具有重要意义。数字PCR(digital PCR,dPCR)是第三代PCR检测方法,具有高准确性、高特异性、高灵敏度的特点,且不依赖标准品实现对病原微生物的绝对定量,已大量应用于... 病原微生物对动物养殖业造成了巨大损失,开发高效、灵敏的病原检测技术具有重要意义。数字PCR(digital PCR,dPCR)是第三代PCR检测方法,具有高准确性、高特异性、高灵敏度的特点,且不依赖标准品实现对病原微生物的绝对定量,已大量应用于兽医诊断领域。目前,dPCR技术用于检测病毒、细菌、寄生虫、支原体、衣原体等病原体的相关研究已得到了较多报道。文章综述了dPCR技术的基本原理及其在动物病原检测中的应用,以期为dPCR技术在畜牧兽医领域中的推广提供参考。 展开更多
关键词 数字pcr 动物病原体 核酸检测 绝对定量
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非洲猪瘟病毒微滴数字PCR(ddPCR)方法的建立及应用 被引量:46
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作者 邬旭龙 肖璐 +7 位作者 宋勇 林华 陈世界 杨苗 安微 姚学萍 杨泽晓 王印 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2839-2846,共8页
【目的】非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)能导致猪群高死亡率,从而造成严重的经济损失。因此,建立严密、高效的防控系统,包括灵敏、准确的诊断方法以及高效的预报预警机制等,以避免ASF传入我国。本文旨在建立一种新型而... 【目的】非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)能导致猪群高死亡率,从而造成严重的经济损失。因此,建立严密、高效的防控系统,包括灵敏、准确的诊断方法以及高效的预报预警机制等,以避免ASF传入我国。本文旨在建立一种新型而高灵敏度的ASFV微滴数字PCR(Droplet digital PCR,dd PCR)检测方法。【方法】针对ASFV K205R基因设计一对特异性引物和Taq Man探针,通过反应条件优化,建立了ASFV实时荧光定量PCR(q PCR)和dd PCR检测方法;并对两种方法的线性关系、灵敏性、特异性和重复性进行了评估,利用建立的ASFV检测方法对163份国内和进境的组织样本及血清样本进行检测,血清样本经商品化ASFV ELISA试剂盒复检,评估不同方法检测结果的符合率。【结果】建立的ASFV q PCR和dd PCR检测方法线性关系较好(R2≥0.998),dd PCR的最低检测限度可达到0.36拷贝,在20μL反应体系中约为10拷贝/反应,检测灵敏度是q PCR的10倍。ASFV dd PCR检测方法具有很高的特异性和重复性,不与其他猪常见病毒发生交叉反应。【结论】该方法灵敏度高、特异性强,可作为一种有效的分子生物学方法来诊断ASFV,为防止该病传入我国以及ASFV的实时监测提供新的技术储备,同时促进dd PCR技术在我国的发展和应用。 展开更多
关键词 微滴数字pcr 实时荧光定量pcr 非洲猪瘟病毒 诊断调查
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PMA结合ddPCR检测食品中金黄色葡萄球菌的研究 被引量:16
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作者 赵丽青 王静 +4 位作者 秦燕 贾俊涛 姜英辉 唐静 张健 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期105-109,共5页
研究了将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴式数字PCR(ddPCR)技术相结合,用于金黄色葡萄球菌活菌的检测。结果表明,强烈光照15 min,可以使PMA与死菌DNA共价交联,同时钝化游离的PMA;可以有效抑制金黄色葡萄球菌死菌DNAPCR扩增的PMA终浓度为2.0μg/... 研究了将叠氮溴化丙锭(PMA)与微滴式数字PCR(ddPCR)技术相结合,用于金黄色葡萄球菌活菌的检测。结果表明,强烈光照15 min,可以使PMA与死菌DNA共价交联,同时钝化游离的PMA;可以有效抑制金黄色葡萄球菌死菌DNAPCR扩增的PMA终浓度为2.0μg/m L;不抑制活菌DNA扩增的PMA最高浓度是5.0μg/m L。在不同死、活菌比例下,PMA-ddPCR可以定量检测活菌,避免了死菌DNA的干扰,本方法的检出限为10 copy/20μL。利用PMA-ddPCR检测人工污染鸡肉样品,最低可检出102cfu/m L的金黄色葡萄球菌。表明PMA-ddPCR方法的灵敏度高。 展开更多
关键词 叠氮溴化丙锭 微滴式数字pcr 金黄色葡萄球菌
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抗草甘膦转基因玉米外源基因ddPCR拷贝数分析 被引量:3
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作者 余桂容 张维 +3 位作者 杜文平 宋军 陈谦 徐利远 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第8期1707-1712,共6页
【目的】本研究是从前期获得的100余份转基因抗除草剂草甘膦玉米品系中,挑选T抗-1等14个转基因玉米品系进行拷贝数检测。【方法】采用一种新型的拷贝数分析方法——微滴数字PCR技术(droplet digital PCR,简称dd PCR),设计特异引物对外... 【目的】本研究是从前期获得的100余份转基因抗除草剂草甘膦玉米品系中,挑选T抗-1等14个转基因玉米品系进行拷贝数检测。【方法】采用一种新型的拷贝数分析方法——微滴数字PCR技术(droplet digital PCR,简称dd PCR),设计特异引物对外源抗草甘膦基因2m G2-epsps进行绝对定量分析。【结果】供试的14份转基因材料中10份是单拷贝品系。同时,通过引物探针特异性试验、叶片基因组DNA的PCR抑制和浓度检测、转基因玉米的外源基因2m G2-epsps的实时PCR检测和基因组DNA的酶切等系列研究,建立稳定的转基因玉米拷贝数分析的dd PCR检测体系。【结论】微滴数字PCR技术为这批转基因玉米的下一步转基因生物安全评价提供了重要参数,同时建立了转基因玉米(genetically modified maize)外源基因拷贝数dd PCR分析方法。 展开更多
关键词 转基因玉米 草甘膦抗性 外源基因 拷贝数 微滴数字pcr(ddpcr)
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数字PCR技术在动物疫病检测中的应用 被引量:2
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作者 孟晓琴 赵淑娟 张晓霞 《中兽医医药杂志》 2025年第2期54-59,共6页
近年来,随着纳米技术和微流体技术的进步,数字PCR(dPCR)技术逐渐突破瓶颈,展现出快速发展的趋势。dPCR通过将反应体系分割为数万个微小独立反应单元,实现核酸模板的绝对定量分析,具有无需标准曲线、对抑制剂耐受性高、灵敏度高、特异性... 近年来,随着纳米技术和微流体技术的进步,数字PCR(dPCR)技术逐渐突破瓶颈,展现出快速发展的趋势。dPCR通过将反应体系分割为数万个微小独立反应单元,实现核酸模板的绝对定量分析,具有无需标准曲线、对抑制剂耐受性高、灵敏度高、特异性强、重复性好等显著优势。目前,dPCR在猪、牛、羊、禽等动物疫病检测中展现出应用潜力,能够检测早期感染或混合感染,支持流行病学研究,监测治疗效果,并实现病原体核酸浓度的绝对定量分析。然而,与qPCR相比,dPCR在寄生虫病检测中的灵敏度和准确性有待进一步提高。另外,高成本也在一定程度上限制了dPCR技术的大规模推广应用。随着技术的进一步发展和检测成本的降低,dPCR有望在临床诊断、流行病学研究和无症状携带病原动物的识别等领域发挥更重要的作用。 展开更多
关键词 数字pcr技术 动物疫病诊断 定量检测
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数字PCR技术对HEK293细胞系基因组DNA的定量 被引量:1
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作者 毕华 问芬芬 +5 位作者 陶磊 魏玲慧 杨靖清 卢宁 秦玺 梁成罡 《中国生物制品学杂志》 2025年第2期190-196,203,共8页
目的通过微流体芯片式数字PCR技术对HEK293细胞基因组DNA进行定量研究,为更加准确地定量基因以及基因组DNA相关检测提供新思路。方法首先通过柱提法获得HEK293细胞DNA,经琼脂糖凝胶电泳进行鉴定及纯度分析,再采用传统分光光度法、Qubit... 目的通过微流体芯片式数字PCR技术对HEK293细胞基因组DNA进行定量研究,为更加准确地定量基因以及基因组DNA相关检测提供新思路。方法首先通过柱提法获得HEK293细胞DNA,经琼脂糖凝胶电泳进行鉴定及纯度分析,再采用传统分光光度法、Qubit法和微流体芯片式数字PCR技术分别对HEK293细胞基因组DNA进行定量并进行统计分析。结果分光光度法测定HEK293细胞基因组DNA浓度为100.08 ng/μL,Qubit法测定值为93.98 ng/μL,数字PCR法检测拷贝数为29722.81 copies/μL,按照1个人类单拷贝基因组约3.3 pg粗略回算,分光光度和Qubit法换算的拷贝数分别约为30327和28479 copies/μL,数字PCR法测定值与分光光度法测定值的偏差仅为2%,而与Qubit法测定值的偏差仅为4%。结论本研究通过数字PCR、分光光度和Qubit法对HEK293细胞基因组进行DNA测定并比较,为DNA的定量提供了一种新的测定方法及思路,同时也为其他核酸类物质的定量提供了参考。 展开更多
关键词 HEK293细胞 数字pcr 宿主DNA DNA定量
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