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番茄茉莉酸缺失突变体灰霉菌侵染响应miRNA及其表达分析
被引量:
9
1
作者
李琳琳
金华
+2 位作者
刘斯超
邹吉祥
李天来
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期1323-1334,共12页
为揭示miRNA对番茄灰霉菌胁迫的响应机制,以番茄茉莉酸(JA)缺失突变体def1、spr2及其野生型(CM)为试验材料,构建了3个材料接种灰霉菌前后(0 h、48 h)2个时期的miRNA文库,并采用Illumina平台测序,对测序数据进行生物信息分析,结合实时荧...
为揭示miRNA对番茄灰霉菌胁迫的响应机制,以番茄茉莉酸(JA)缺失突变体def1、spr2及其野生型(CM)为试验材料,构建了3个材料接种灰霉菌前后(0 h、48 h)2个时期的miRNA文库,并采用Illumina平台测序,对测序数据进行生物信息分析,结合实时荧光定量检测目的miRNA及其预测的靶基因表达情况。结果表明灰霉菌侵染番茄后,JA缺失突变体def1和spr2的病情指数显著高于CM,H2O2含量低于CM。高通量测序鉴定了130个已知miRNA和811个新miRNA。进一步筛选出8个保守miRNA(Sly-miR156e-3p、Sly-miR166c-5p、Sly-miR171f、Sly-miR172b、Sly-miR319a、Sly-miR390b-5p、Sly-miR399b、Sly-miR482d-5p),其在6个样本中表达模式各异。预测差异miRNA靶基因122个,结合qRT-PCR技术分析了8个miRNA和8个靶基因的表达情况,与高通量测序结果基本一致。推测Sly-miR156e-3p、Sly-miR390b-5p、Sly-miR399b、Sly-miR482d-5p通过依赖JA信号途径参与番茄对灰霉病的抗性。
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关键词
番茄
MIRNA
突变体
茉莉酸
def1
spr2
灰霉菌
原文传递
题名
番茄茉莉酸缺失突变体灰霉菌侵染响应miRNA及其表达分析
被引量:
9
1
作者
李琳琳
金华
刘斯超
邹吉祥
李天来
机构
大连民族大学环境与资源学院
沈阳农业大学园艺学院
承德市蔬菜技术推广站
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第7期1323-1334,共12页
基金
辽宁省自然科学基金项目(20170540189)
大连市高层次人才项目(2018RQ80)
+3 种基金
河北省重点研发计划项目(19226914D)
河北省现代农业产业技术体系项目(HBCT2018030402)
辽宁省自然科学基金联合基金项目
中央高校基本科研业务费项目。
文摘
为揭示miRNA对番茄灰霉菌胁迫的响应机制,以番茄茉莉酸(JA)缺失突变体def1、spr2及其野生型(CM)为试验材料,构建了3个材料接种灰霉菌前后(0 h、48 h)2个时期的miRNA文库,并采用Illumina平台测序,对测序数据进行生物信息分析,结合实时荧光定量检测目的miRNA及其预测的靶基因表达情况。结果表明灰霉菌侵染番茄后,JA缺失突变体def1和spr2的病情指数显著高于CM,H2O2含量低于CM。高通量测序鉴定了130个已知miRNA和811个新miRNA。进一步筛选出8个保守miRNA(Sly-miR156e-3p、Sly-miR166c-5p、Sly-miR171f、Sly-miR172b、Sly-miR319a、Sly-miR390b-5p、Sly-miR399b、Sly-miR482d-5p),其在6个样本中表达模式各异。预测差异miRNA靶基因122个,结合qRT-PCR技术分析了8个miRNA和8个靶基因的表达情况,与高通量测序结果基本一致。推测Sly-miR156e-3p、Sly-miR390b-5p、Sly-miR399b、Sly-miR482d-5p通过依赖JA信号途径参与番茄对灰霉病的抗性。
关键词
番茄
MIRNA
突变体
茉莉酸
def1
spr2
灰霉菌
Keywords
tomato
microRNA
JA
mutant
def1
spr2
Botrytis cinerea
分类号
S641.2 [农业科学—蔬菜学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
番茄茉莉酸缺失突变体灰霉菌侵染响应miRNA及其表达分析
李琳琳
金华
刘斯超
邹吉祥
李天来
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
9
原文传递
已选择
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参考文献
引证文献
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