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Rg1通过调控miR-34a-5p/DDX17轴改善非酒精性脂肪性肝病分子机制的研究
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作者 姜华 陈徐佳 +7 位作者 高建鹏 易春艳 张志波 杨明慧 丁蕊 钱丽柏 胡阳 王辉 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年第7期1023-1031,共9页
目的研究人参皂苷Rg1对TGF-β1诱导的肝星状细胞(hepatic stellate cells,HSCs-T6)活力、增殖能力、炎性因子含量和纤维化水平的改善作用及其分子机制。方法使用TGF-β1诱导HSCs-T6细胞构建肝纤维化细胞模型后,用不同浓度Rg1处理细胞,通... 目的研究人参皂苷Rg1对TGF-β1诱导的肝星状细胞(hepatic stellate cells,HSCs-T6)活力、增殖能力、炎性因子含量和纤维化水平的改善作用及其分子机制。方法使用TGF-β1诱导HSCs-T6细胞构建肝纤维化细胞模型后,用不同浓度Rg1处理细胞,通过CCK-8检测筛选出最佳作用浓度和时间。采用质粒转染用来干预HSCs-T6细胞中DDX17、miR-34a-5p的表达水平,分别用CCK-8和EdU试剂盒检测HSCs-T6细胞活力和增殖能力,ELISA检测炎性因子(TNF-α、IL-6、IL-10)的含量,qRT-PCR实验检测纤维化相关蛋白(α-SMA、COL1、TIMP-1)基因的mRNA表达水平,Western blotting检测纤维化相关蛋白(α-SMA、COL1、TIMP-1)的表达水平。通过双荧光素酶报告基因实验和RIP实验验证miR-34a-5p和DDX17的靶向结合关系。结果Rg1(2.5μg/mL)处理HSCs-T6细胞24 h显著降低TNF-α和IL-6的水平,增加了抗炎的IL-10的水平,显著降低α-SMA、COL1、TIMP-1基因的mRNA和蛋白的表达(P<0.05)。与TGF-β组相比,过表达DDX17能够改善TGF-β1诱导的HSCs-T6细胞活力、增殖能力、炎症因子和α-SMA、COL1、TIMP-1基因mRNA和蛋白的表达(P<0.05),而沉默DDX17则产生相反作用(P<0.05)。双荧光素酶报告基因实验结果显示miR-34a-5p mimic降低DDX17-WT的荧光素酶活性(P<0.05)。与TGF-β1组相比,过表达miR-34a-5p促进HSCs-T6细胞活力、增殖能力、促炎因子、纤维化相关基因mRNA和蛋白的表达;干扰miR-34a-5p则产生相反作用。在回复实验中,与TGF-β1/Rg1相比,过表达miR-34a-5p可显著降低HSCs-T6细胞活力和增殖能力、促炎因子、α-SMA、COL1、TIMP-1基因mRNA和蛋白的表达,而同时过表达miR-34a-5p和DDX17则逆转了miR-34a-5p的上述作用。结论人参皂苷Rg1通过调节miR-34a-5p/DDX17轴改善非酒精性脂肪性肝病的肝纤维化。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 人参皂苷RG1 miR-34a-5p ddx17 肝纤维化
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猫DDX20基因克隆及生物信息学分析
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作者 董宁宁 张琦 +8 位作者 谈晓梅 孙亚娟 李传峰 朱杰 汤傲兴 张达 刘光清 李永畅 孟春春 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第5期206-214,共9页
本研究对猫DDX20的CDS区进行克隆、比对不同物种DDX20核苷酸序列和氨基酸序列,构建系统发育树,利用ExPASy ProtParam、DeepTMHMM等软件或在线工具对DDX20蛋白理化性质、二级结构等进行预测分析,并在mRNA水平上判断猫杯状病毒(FCV)对猫DD... 本研究对猫DDX20的CDS区进行克隆、比对不同物种DDX20核苷酸序列和氨基酸序列,构建系统发育树,利用ExPASy ProtParam、DeepTMHMM等软件或在线工具对DDX20蛋白理化性质、二级结构等进行预测分析,并在mRNA水平上判断猫杯状病毒(FCV)对猫DDX20的影响。结果表明:成功克隆出猫DDX20基因CDS区,并上传GenBank,获得登录号:OR237969;生物信息学分析结果显示,猫DDX20蛋白为亲水性蛋白,无跨膜螺旋区和信号肽,有92个潜在的磷酸化修饰位点,3个潜在的N-糖基化位点和7个潜在的O-糖基化位点;亚细胞定位分析显示猫DDX20蛋白主要分布在细胞核(65.2%);进化分析表明,猫DDX20与老虎和豹子同源性较高;FCV感染会导致猫DDX20的mRNA水平升高,或对病毒的复制产生影响。本研究成功克隆猫DDX20基因CDS区,为后续猫DDX20蛋白功能研究奠定基础。 展开更多
关键词 ddx20蛋白 克隆 生物信息学分析
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RNA解旋酶DDX46敲除对新城疫病毒复制和抗病毒免疫的影响
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作者 刘彦峰 欧晓晴 +8 位作者 贺赛男 唐兰兰 赵飞扬 廖瑛 仇旭升 谭磊 宋翠萍 丁铲 孙英杰 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第4期1-8,共8页
本研究利用CRISPR-Cas9技术构建DEAD/H-box解旋酶超家族中DDX46敲除细胞,并评估DDX46敲除对新城疫病毒(NDV)复制和抗病毒免疫的影响。首先针对DDX46共设计3条sgRNA,构建重组LentiCRISPRv2-DDX46质粒,包装慢病毒并感染HeLa细胞,使用嘌呤... 本研究利用CRISPR-Cas9技术构建DEAD/H-box解旋酶超家族中DDX46敲除细胞,并评估DDX46敲除对新城疫病毒(NDV)复制和抗病毒免疫的影响。首先针对DDX46共设计3条sgRNA,构建重组LentiCRISPRv2-DDX46质粒,包装慢病毒并感染HeLa细胞,使用嘌呤霉素进行筛选,最后进行亚克隆筛选。通过测序以及Western blot验证,结果表明共得到2株杂合子DDX46敲除细胞系。NDV分别感染野生型和DDX46敲除细胞,结果显示NDV复制在DDX46敲除细胞中受到显著抑制,而干扰素β和下游干扰素刺激因子的表达量则显著增加,表明NDV感染细胞后,DDX46显著抑制宿主天然免疫,并促进病毒复制。上述研究为DDX46调控抗病毒先天性免疫的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9 ddx46 新城疫病毒 先天性免疫
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从江香猪DDX6基因克隆、组织表达分析及真核表达蛋白鉴定
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作者 赵静 邓乔木 +4 位作者 胡璇 王怡然 杨洪兴 温贵兰 李波 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第1期369-375,387,共8页
本研究克隆了从江香猪DDX6(DEAD-Box Polypeptide 6,DDX6)基因CDS区序列,对其进行生物信息学分析和组织表达分析,并构建真核表达载体,鉴定其表达与细胞定位,为研究DDX6在抗病毒免疫应答中的作用奠定基础。结果表明:成功克隆了从江香猪D... 本研究克隆了从江香猪DDX6(DEAD-Box Polypeptide 6,DDX6)基因CDS区序列,对其进行生物信息学分析和组织表达分析,并构建真核表达载体,鉴定其表达与细胞定位,为研究DDX6在抗病毒免疫应答中的作用奠定基础。结果表明:成功克隆了从江香猪DDX6基因CDS区,从江香猪DDX6基因CDS区序列全长1452 bp,编码483个氨基酸。DDX6蛋白为可溶性蛋白,不存在跨膜结构,拥有多个糖基化修饰位点。DDX6在从江香猪的心脏、肝脏和脾脏等组织中均有表达。DDX6在淋巴结的表达量显著高于其余组织,在骨骼肌的表达量则相对最低。DDX6在猪肺泡巨噬细胞传代细胞系(PAM-CD163)中主要定位于细胞质,重组蛋白Myc-DDX6具有良好的反应原性。以上试验结果为进一步探究DDX6基因的生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 从江香猪 ddx6基因 克隆 生物信息学 真核表达载体
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剪接因子DDX3Y下调IL-6/JAK/STAT3信号通路促进男性胃癌细胞增殖和类器官生长的机制研究
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作者 周雅静 李东宝 +6 位作者 王鹏博 段开鹏 董超 李炜康 孙小童 徐呈祥 周进 《中国临床新医学》 2025年第6期642-651,共10页
目的分析剪接因子DDX3Y下调IL-6/JAK/STAT3信号通路促进男性胃癌细胞增殖和类器官生长的机制。方法通过生物信息学方法分析DDX3Y在胃癌组织和癌旁组织中的表达水平以及DDX3Y表达情况与患者预后的关系。收集苏州大学附属第一医院收治的... 目的分析剪接因子DDX3Y下调IL-6/JAK/STAT3信号通路促进男性胃癌细胞增殖和类器官生长的机制。方法通过生物信息学方法分析DDX3Y在胃癌组织和癌旁组织中的表达水平以及DDX3Y表达情况与患者预后的关系。收集苏州大学附属第一医院收治的男性胃癌患者的胃癌组织和癌旁组织(距离胃癌组织>5 cm)进行免疫组化染色。对人胃永生化黏膜上皮细胞GES-1以及男性来源胃癌细胞SNU-1、NUGC-3、KATOIII、MKN74、HGC-27、NCI-N87进行培养。采用Western blot法检测DDX3Y在不同细胞系中的表达水平。通过慢病毒转染SNU-1细胞和HGC-27细胞,分别构建DDX3Y高表达/低表达的细胞(OE-DDX3Y/shDDX3Y),进行EdU细胞增殖实验。利用男性胃癌患者的胃癌组织构建类器官,并通过慢病毒转染进一步构建DDX3Y高表达/低表达的类器官,分析抑制IL-6/JAK/STAT3信号通路对类器官直径及活力的影响。使用RBPmap在线网站预测DDX3Y与IL-6前体mRNA结合的可能性。结果癌旁组织中DDX3Y mRNA表达水平显著高于胃癌组织(P<0.05)。DDX3Y mRNA高表达患者的生存预后显著优于低表达患者(log-rank检验:χ^(2)=7.856,P=0.005)。与GES-1细胞相比,DDX3Y蛋白在HGC-27细胞中显著高表达(P<0.05);相较于HGC-27细胞,SNU-1细胞中DDX3Y蛋白表达量较低(P<0.05)。在SNU-1细胞中,OE-DDX3Y组的DDX3Y蛋白表达量显著高于高表达对照组(P<0.05),OE-DDX3Y组EdU染色阳性细胞比例显著低于高表达对照组(P<0.05)。在HGC-27细胞中,shDDX3Y-1组的DDX3Y蛋白表达量显著低于低表达对照组(P<0.05),shDDX3Y组EdU染色阳性细胞比例显著高于低表达对照组(P<0.05)。相较于高表达对照组,OE-DDX3Y组类器官直径显著减小(P<0.05),活力显著降低(P<0.05),抑制IL-6/JAK/STAT3信号通路后类器官直径进一步减小(P<0.05),活力进一步降低(P<0.05)。相较于低表达对照组,shDDX3Y组类器官直径显著增大(P<0.05),活力显著增加(P<0.05),抑制IL-6/JAK/STAT3信号通路后类器官直径显著减小(P<0.05),活力显著降低(P<0.05)。RBPmap在线网站预测结果提示DDX3Y很可能与IL-6的前体mRNA发生结合(Z-score>3,结合信号显著)。结论剪接因子DDX3Y下调促进男性胃癌细胞增殖和类器官生长,其调控IL-6的可变剪接并可进一步通过影响IL-6/JAK/STAT3信号通路发挥促进肿瘤进展的作用。 展开更多
关键词 ddx3Y 肿瘤细胞增殖 可变剪接 IL-6/JAK/STAT3信号通路 胃癌性别差异
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PAK5与p53竞争结合DDX5促进乳腺癌细胞的增殖
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作者 蔡伊航 王乐严 +1 位作者 赵鑫 李洋 《现代肿瘤医学》 2025年第5期749-755,共7页
目的:探讨p21活化激酶-5(p21-activated kinase 5,PAK5)通过磷酸化修饰对DDX5与p53结合的影响和可能机制。方法:为了探究PAK5对DDX5与p53结合的影响,在过表达PAK5的乳腺癌细胞中,采用Co-IP验证DDX5与p53结合能力的变化,并在细胞外利用GS... 目的:探讨p21活化激酶-5(p21-activated kinase 5,PAK5)通过磷酸化修饰对DDX5与p53结合的影响和可能机制。方法:为了探究PAK5对DDX5与p53结合的影响,在过表达PAK5的乳腺癌细胞中,采用Co-IP验证DDX5与p53结合能力的变化,并在细胞外利用GST pulldown实验验证PAK5对DDX5与p53直接结合能力的影响。构建DDX5截短质粒,GST pulldown实验验证PAK5和p53与DDX5的结合结构域。构建DDX5磷酸化位点突变质粒,纯化不同磷酸化状态的DDX5蛋白,GST pulldown实验验证DDX5和p53的结合状态。Real-Time PCR实验证实PAK5抑制成熟的miR-143和miR-145的表达。最后,通过CCK-8实验检测过表达不同磷酸化状态的DDX5对乳腺癌细胞增殖的影响。结果:过表达PAK5减弱了DDX5与p53的结合,促进乳腺癌细胞的增殖。结论:PAK5可能通过磷酸化DDX5,与p53竞争性结合DDX5,抑制成熟的miR-143和miR-145的表达,从而促进乳腺肿瘤的生长。 展开更多
关键词 磷酸化 竞争性结合 p21活化蛋白5(PAK5) DEAD box RNA解旋酶5(ddx5)
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DDX3X肝特异性敲除在对乙酰氨基酚诱导小鼠急性肝损伤中的作用机制研究
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作者 莫胤康 范子豪 +1 位作者 徐玲 任锋 《胃肠病学和肝病学杂志》 2025年第4期554-559,共6页
目的探讨DDX3X在对乙酰氨基酚(acetaminophen,APAP)诱导小鼠急性肝损伤(APAP-induced acute liver injury,AILI)中的作用及机制。方法动物实验使用C57BL/6J小鼠(包括野生型、DDX3X^(fl/fl)和DDX3X^(Δhep)小鼠),APAP(300 mg/kg)诱导急... 目的探讨DDX3X在对乙酰氨基酚(acetaminophen,APAP)诱导小鼠急性肝损伤(APAP-induced acute liver injury,AILI)中的作用及机制。方法动物实验使用C57BL/6J小鼠(包括野生型、DDX3X^(fl/fl)和DDX3X^(Δhep)小鼠),APAP(300 mg/kg)诱导急性肝损伤。检测肝功、病理评价小鼠肝脏损伤;qRT-PCR方法检测基因表达水平;利用Western blotting方法确定蛋白表达含量;ELISA方法鉴定小鼠血清中蛋白表达水平。结果DDX3X的基因和蛋白表达在APAP处理时间梯度中先上升后降低;APAP处理24 h后,DDX3X^(fl/fl)小鼠出现了严重的肝损伤,而DDX3X^(Δhep)小鼠的肝损伤显著减轻,主要表现在小鼠肝功水平显著降低(P<0.05),病理坏死区域和炎症细胞浸润面积减少。两组小鼠中肝组织CYP2E1和GSH的蛋白表达在两组间差异无统计学意义(P>0.05)。同时,与DDX3X^(fl/fl)小鼠相比,DDX3X^(Δhep)小鼠在APAP处理后炎症指标TNF-α、IL-1β和IL-6在肝组织中基因表达和血清中含量均显著降低(P<0.05)。结论DDX3X肝特异性敲除可能通过降低炎症反应来明显改善小鼠AILI,这为DDX3X在调控肝损伤的功能方面提供了理论支撑。 展开更多
关键词 对乙酰氨基酚 药物性肝损伤 ddx3X 炎症反应
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核酸感受器DDX60在疾病中的作用研究进展
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作者 席毓灵 隋丽娜 +1 位作者 何良梅 刘志平 《赣南医科大学学报》 2025年第2期117-123,共7页
核酸感受器在先天性免疫、炎症和肿瘤中具有重要的调控作用。DEAD-box RNA解旋酶(DEAD-box helicase)是哺乳动物基因中最大的RNA解旋酶家族,除具有解旋酶功能外,部分解旋酶分子也具有核酸感受器功能,可以对内源性或外源性异常核酸物质... 核酸感受器在先天性免疫、炎症和肿瘤中具有重要的调控作用。DEAD-box RNA解旋酶(DEAD-box helicase)是哺乳动物基因中最大的RNA解旋酶家族,除具有解旋酶功能外,部分解旋酶分子也具有核酸感受器功能,可以对内源性或外源性异常核酸物质做出反应。对核酸感受器的认识也从维持正常生理功能到病原防御再上升到参与疾病的发生发展。维甲酸诱导基因Ⅰ样受体(Retinoic acid inducible gene-Ⅰreceptors,RLRs)主要包括维甲酸诱导基因I(Retinoic acid inducible gene-Ⅰ,RIG-Ⅰ)和黑色素瘤分化相关基因5(Melanoma differentiationassociated gene 5,MDA5),是解旋酶家族中被鉴定为参与RNA配体识别的核酸感受器,它们在病原防御、炎症、肿瘤中的作用被广泛研究。DExD/H-box解旋酶60(DExD/H-box helicase 60,DDX60)是另一个被鉴定为功能区域类似RIG-Ⅰ样受体的解旋酶分子,近年来其在肿瘤、炎症、病原防御中的作用及机制也逐渐被揭示,本文就DDX60的相关研究进展进行总结分析。 展开更多
关键词 ddx60 先天性免疫 病毒防御 炎症 肿瘤
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RNA解旋酶DDX5在癌症中的研究进展
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作者 宋静 苏磊 +1 位作者 范泽彦 张浩平 《世界肿瘤研究》 2025年第3期124-131,共8页
恶性肿瘤是威胁人类健康的重大疾病之一,由于肿瘤的异质性和发病机理的复杂性,临床治疗面临巨大挑战。因此,寻找精准的治疗靶点和新型分子标志物已成为肿瘤学研究热点。DDX5 (DEAD-box RNA helicase 5)是DEAD-box蛋白家族的重要成员,在... 恶性肿瘤是威胁人类健康的重大疾病之一,由于肿瘤的异质性和发病机理的复杂性,临床治疗面临巨大挑战。因此,寻找精准的治疗靶点和新型分子标志物已成为肿瘤学研究热点。DDX5 (DEAD-box RNA helicase 5)是DEAD-box蛋白家族的重要成员,在进化上高度保守,主要通过ATP依赖的RNA解旋活性参与多种基因表达调控。研究表明,DDX5在多种癌症中异常表达。因此,深入探究DDX5在癌症发生发展中的调控机制,成为当前癌症研究领域的热点。本论文综述了DDX5蛋白的结构特征及其在转录调节、细胞周期调控和DNA损伤修复等基础生物学过程中的关键作用,重点探讨DDX5通过调控细胞周期、转录因子活性及上皮–间质细胞转化等机制影响多种癌症的发生发展,为进一步研究DDX5作为潜在治疗靶点和预后标志物提供指导。 展开更多
关键词 ddx5 结构与功能 癌症
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角质形成细胞的DDX5介导IL7R可变剪接调控痤疮炎症的相关研究
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作者 王媛 江天 +1 位作者 沈杰 孙振亮 《齐齐哈尔医学院学报》 2025年第10期907-915,共9页
目的 探讨痤疮中DDX5是否介导IL7R可变剪接及其潜在致病机制。方法 通过分析GEO数据中痤疮患者正常皮肤与病灶处的DDX5表达水平,探讨其在痤疮中的作用。通过使用灭活的痤疮丙酸杆菌(C.acnes)菌液刺激人永生化角质形成细胞(HaCaT)和小鼠... 目的 探讨痤疮中DDX5是否介导IL7R可变剪接及其潜在致病机制。方法 通过分析GEO数据中痤疮患者正常皮肤与病灶处的DDX5表达水平,探讨其在痤疮中的作用。通过使用灭活的痤疮丙酸杆菌(C.acnes)菌液刺激人永生化角质形成细胞(HaCaT)和小鼠原代角质形成细胞(mKC),模拟痤疮炎症环境。在人宫颈癌细胞系(HeLa)及构建的DDX5^(-/-)HeLa细胞中转染IL7R minigene,然后通过DNA-PAGE检测IL7R的可变剪接情况研究DDX5对IL7R可变剪接的影响。结果 通过GEO数据库分析后发现,痤疮患者病灶处皮肤较正常皮肤中DDX5的表达显著性降低,这表明在痤疮炎症中也存在角质形成细胞DDX5表达的减少。在体内痤疮模型研究中比较K14^(cre) DDX5^(fl/fl)小鼠和DDX5^(fl/fl)小鼠,K14^(cre) DDX5^(fl/fl)小鼠炎症症状更严重,耳朵厚度明显高于对照组。HE染色和免疫荧光染色结果显示,与正常皮肤相比,C.acnes刺激的小鼠耳朵注射部位的表皮层DDX5的表达明显降低。在体外痤疮模型研究中,C.acnes的刺激抑制了HaCaT和mKC细胞中的DDX5表达。IL7R的表达与DDX5呈现相关性。DNA-PAGE实验显示,DDX5的降低会增加IL7R的可变剪接,增加可溶性IL7R的表达。结论 这些研究结果表明,DDX5在痤疮炎症中发挥重要作用,尤其是在调控IL7R mRNA前体的剪接过程中。进一步研究可能会揭示DDX5作为潜在的治疗痤疮的靶点和治疗监测指标。 展开更多
关键词 痤疮丙酸杆菌 角质形成细胞 ddx5 IL-7R 可变剪接
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African swine fever virus MGF360-9L degrades DDX20 through the Rab1A-dependent autophagy pathway to antagonize its antiviral effect
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作者 Lu He Xuxu Fan +7 位作者 Zhaoyu Zhu Danshi Pei Yizhuo Wang Xizhong Li Qingfeng Ren Haixue Zheng Weiwei Li Zixiang Zhu 《Virologica Sinica》 2025年第5期822-834,共13页
African swine fever(ASF)is an acute,hemorrhagic,and highly contagious disease in pigs caused by the African swine fever virus(ASFV).Our previous studies have demonstrated that deletion of the MGF360-9L gene weakens AS... African swine fever(ASF)is an acute,hemorrhagic,and highly contagious disease in pigs caused by the African swine fever virus(ASFV).Our previous studies have demonstrated that deletion of the MGF360-9L gene weakens ASFV virulence in pigs,yet the underlying mechanism remains unclear.To investigate the mechanism of MGF360-9L regulating ASFV pathogenicity,the relationship between MGF360-9L and host proteins was identified by mass spectrometry.We found that host protein DEAD-box helicase 20(DDX20)interacted with and colocalized with MGF360-9L.Overexpression of DDX20 inhibited ASFV replication,whereas knockdown of DDX20 had the opposite effects.Moreover,DDX20 inhibited ASFV replication by promoting the activation of type I interferon signaling.Surprisingly,DDX20 was gradually degraded following ASFV infection.Mechanistically,MGF360-9L promoted the autophagic degradation of DDX20 by recruiting autophagy-related protein Ras-related protein Rab-1A(Rab1A).Silencing Rab1A suppressed ASFV replication,while overexpression of Rab1A exhibited the opposite effects.Furthermore,Rab1A,MGF360-9L and DDX20 could form a complex to facilitate the degradation of DDX20.Knockdown of Rab1A impaired MGF360-9L-mediated degradation of DDX20 during ASFV infection.In summary,our study demonstrates that MGF360-9L targets DDX20 for autophagy degradation to antagonize its antiviral function and facilitate ASFV replication.This finding broadens our understanding of the regulatory network between ASFV and its host,and provides new insights into the pathogenesis and immune evasion mechanisms of ASFV. 展开更多
关键词 African swine fever virus(ASFV) MGF360-9L ddx20 Rab1A Protein degradation AUTOPHAGY
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Competitive Sequestration of miR-1183 by lncRNA DDX11-AS1 Drives Gliomagenesis through E2F7 Activation
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作者 Jianwei Wang Xinzhi Yang +2 位作者 Lvbiao Lin Jianbo Yu Jie Mao 《Oncology Research》 2025年第10期3023-3040,共18页
Objectives:Glioma,as the most lethal primary brain malignancy with poor prognosis,requires further elucidation on the functional role of long noncoding RNA(lncRNA)DDX11 antisense RNA 1(DDX11-AS1)in its pathogenesis,de... Objectives:Glioma,as the most lethal primary brain malignancy with poor prognosis,requires further elucidation on the functional role of long noncoding RNA(lncRNA)DDX11 antisense RNA 1(DDX11-AS1)in its pathogenesis,despite its established oncogenic functions in other cancers.Therefore,this study sought to characterize the oncogenic role and molecular mechanism of DDX11-AS1 in glioma.Methods:DDX11-AS1 expression levels were analyzed in clinical surgical glioma specimens and publicly available datasets.The functional roles of DDX11-AS1 on glioma cell proliferation and migration were investigated using in vitro knockdown and overexpression assays.In vivo tumor growth was assessed using orthotopic glioma-bearing mouse models.To elucidate the regulatory axis involving DDX11-AS1,miR-1183,and E2F transcription factor 7(E2F7),we performed competitive endogenous RNA(ceRNA)analysis and conducted functional rescue experiments via miR-1183 inhibition.Results:DDX11-AS1 expression was markedly upregulated in clinical glioma specimens.Functionally,DDX11-AS1 knockdown significantly suppressed glioma cell proliferation and migration in vitro,while its overexpression exacerbated these malignant phenotypes.Orthotopic glioma-bearingmouse models confirmed that DDX11-AS1 drives in vivo glioma tumor growth.Mechanistically,DDX11-AS1 functions as a ceRNA by competitively interacting with miR-1183.Critically,inhibition of miR-1183 rescued the suppressive effects of DDX11-AS1 knockdown on glioma tumorigenic phenotypes and restored E2F7 expression levels.Conclusions:This study demonstrates that lncRNA DDX11-AS1 promotes glioma progression by regulating the miR-1183/E2F7 axis,indicating a potential therapeutic target for glioma. 展开更多
关键词 GLIOMA ddx11 antisense RNA 1 miR-1183 E2F transcription factor 7 competitive endogenous RNA
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DDX39在胃低级别上皮内瘤变组织的表达及临床意义
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作者 邓秋萍 黎莉 +4 位作者 庄薇 刘正勇 魏涛 黄大强 杨卫文 《现代消化及介入诊疗》 2025年第3期272-275,281,共5页
目的 探讨DDX39在胃癌、胃低级别上皮内瘤变、慢性非萎缩性胃炎等不同组织中的表达情况及其临床意义。方法 纳入2019年1月至2022年1月就诊于贵阳市第二人民医院消化内科门诊及病房经胃镜检查及活检、组织病理检查证实的慢性非萎缩性胃炎... 目的 探讨DDX39在胃癌、胃低级别上皮内瘤变、慢性非萎缩性胃炎等不同组织中的表达情况及其临床意义。方法 纳入2019年1月至2022年1月就诊于贵阳市第二人民医院消化内科门诊及病房经胃镜检查及活检、组织病理检查证实的慢性非萎缩性胃炎(200例)、胃低级别上皮内瘤变(200例)、胃癌(150例)病例,收集相关临床资料及胃黏膜组织,采用免疫组化法检测组织中DDX39表达情况。对胃低级别上皮内瘤变患者胃镜下大体改变、组织病理学变化及活检组织中DDX39表达情况进行随访。结果 DDX39在胃癌、胃低级别上皮内瘤变中表达较慢性非萎缩性胃炎组显著增加,且DDX39在胃癌组织中表达高于胃低级别上皮内瘤变组织。随访200例胃低级别上皮内瘤患者胃镜下表现、组织中DDX39表达情况,平均随访时长为24月,发现7例发生病理升级,其中6例转化为胃高级别上皮内瘤变,1例转化为胃癌,发生病理升级的病例胃黏膜组织中DDX39的表达量高于未发生病理升级者。结论 DDX39在胃低级别上皮内瘤变组织中高表达。DDX39的表达量与其病理升级相关,DDX39可作为胃低级别上皮内瘤变预测其病理升级的指标,同时有望作为评估是否需要行内镜下治疗的一个重要标志物。 展开更多
关键词 胃低级别上皮内瘤变 ddx39 胃癌
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DDX1基因下调对宫颈鳞癌SiHa细胞增殖、凋亡、侵袭和迁移能力的影响
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作者 陈建欢 王蕾 +2 位作者 马蓉 陈复刚 马彩玲 《现代生物医学进展》 CAS 2024年第19期3628-3632,共5页
目的:探讨下调DEAD-box解旋酶1(DDX1)基因对宫颈鳞癌Si Ha细胞增殖、凋亡、转移及侵袭能力的影响。方法:si RNA转染构建DDX1低表达Si Ha细胞系、和阴性对照组,用RT-qPCR和Westem Blot检测DDX1的m RNA和蛋白表达水平。应用CCK8法、流式... 目的:探讨下调DEAD-box解旋酶1(DDX1)基因对宫颈鳞癌Si Ha细胞增殖、凋亡、转移及侵袭能力的影响。方法:si RNA转染构建DDX1低表达Si Ha细胞系、和阴性对照组,用RT-qPCR和Westem Blot检测DDX1的m RNA和蛋白表达水平。应用CCK8法、流式细胞技术、Transwell实验分别检测DDX1低表达对Si Ha细胞增殖、凋亡、转移和侵袭能力的影响。结果:(1)m RNA水平检测显示:下调DDX1,Si-DDX1组中DDX1表达均低于Si-NC组,差异有统计学意义(P<0.05)。蛋白水平检测显示,Si-DDX1组中DDX1表达低于Si-NC组,差异有统计学意义(P<0.05)。(2)下调DDX1后,Si-DDX1组细胞的增殖活性较Si-NC组升高,Si-DDX1组的凋亡率较Si-NC组降低,差异有统计学意义(P<0.05)。(3)下调DDX1后,Si-DDX1组细胞转移率和侵袭率均较Si-NC组增高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:DDX1的表达受到抑制后,宫颈鳞癌Si Ha细胞的增殖能力增强、凋亡能力减弱,转移和侵袭能力增强。 展开更多
关键词 ddx1基因 宫颈鳞癌 增殖 凋亡 侵袭 转移
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DDX58基因多态性与乙型肝炎病毒感染慢性化关联的研究
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作者 刘宇畅 姚轶男 +5 位作者 沈艳 季燕 黄鹏 李敏 姚海萍 丁玲云 《热带医学杂志》 CAS 2024年第7期1040-1043,1052,共5页
目的探究维甲酸诱导基因I(DDX58)中的单核苷酸多态性位点(SNPs)是否与乙型肝炎病毒(HBV)感染慢性化有关。方法2009年9月-2010年3月间,选取张家港市20个村的48417人进行健康检查并定期随访,于2020年11月共纳入842例基线乙肝表面抗原(HBs... 目的探究维甲酸诱导基因I(DDX58)中的单核苷酸多态性位点(SNPs)是否与乙型肝炎病毒(HBV)感染慢性化有关。方法2009年9月-2010年3月间,选取张家港市20个村的48417人进行健康检查并定期随访,于2020年11月共纳入842例基线乙肝表面抗原(HBsAg)阳性患者为研究对象,其中无症状感染者674例,慢性乙型肝炎(CHB)患者168例。对2个单核苷酸多态性位点(DDX58 rs9695310、rs10738889)进行基因分型,采用t检验、χ^(2)检验、多因素logistic回归等多种统计学方法,探讨其与HBV感染慢性化的关系。结果rs9695310基因多态性与HBV感染慢性化相关(P=0.004)。与无症状感染者相比,rs9695310的突变C等位基因与患者慢性化显著相关(显性模型:OR=1.74,95%CI:1.18~2.54)。同时,rs9695310、性别、年龄、血小板、白球比例及总胆固醇是HBV感染慢性化的独立预测因子(P均<0.05)。ROC曲线显示,以上6个独立因素都能够较好地将HBV感染慢性化感染者同无症状感染者进行区分(AUC=0.738)。结论位于DDX58上的rs9695310的突变C等位基因与中国汉族人群HBV感染慢性化具有相关性,可作为HBV感染转归的预测指标。 展开更多
关键词 ddx58 rs9695310 基因多态性 乙型肝炎
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DDX6通过调控CKMT1A mRNA稳定性促进鼻咽癌细胞增殖和迁移的机制研究 被引量:1
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作者 熊茄妍 雷伟 +5 位作者 游波 张振新 谢海静 单颖 夏天 周勇 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期451-459,共9页
背景与目的:DDX是一类腺苷三磷酸(adenosine triphosphate,ATP)依赖的RNA解旋酶,与mRNA调控、肿瘤增殖及侵袭等密切相关。本研究旨在探讨DDX家族成员DDX6对CKMT1A mRNA稳定性的影响以及DDX6-CKMT1A轴对人鼻咽癌细胞CNE2增殖和迁移能力... 背景与目的:DDX是一类腺苷三磷酸(adenosine triphosphate,ATP)依赖的RNA解旋酶,与mRNA调控、肿瘤增殖及侵袭等密切相关。本研究旨在探讨DDX家族成员DDX6对CKMT1A mRNA稳定性的影响以及DDX6-CKMT1A轴对人鼻咽癌细胞CNE2增殖和迁移能力的影响及其分子机制。方法:检索癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中DDX6和CKMT1A在人头颈部鳞状细胞癌中的表达情况并进行相关性分析,利用蛋白质印迹法(Western blot)检测南通大学附属医院保存的人体鼻咽癌组织和正常鼻咽部组织中CKMT1A和DDX6的表达,本研究通过了南通大学附属医院伦理委员会的审查(编号:2022-L114)。利用transwell实验检测细胞迁移能力,采用EdU试剂盒检测细胞增殖能力,采用细胞集落形成实验检测克隆形成能力。转染慢病毒、质粒,构建南通大学附属医院保存的人源鼻咽癌细胞CNE2的shDDX6、sh-CKMT1A、sh-CKMT1A+sh-DDX6和oe-CKMT1A细胞模型,明确DDX6和CKMT1A表达水平对鼻咽癌细胞恶性生物学表型的影响。构建BALC/c裸小鼠皮下移植瘤模型,检测DDX6和CKMT1A在小鼠体内对鼻咽癌细胞成瘤性的影响。采用RNA稳定性实验检测敲除DDX6对CKMT1A mRNA的影响,进一步明确DDX6的分子机制。结果:人鼻咽癌组织中DDX6高表达,CKMT1A低表达,DDX6与CKMT1A表达呈负相关。DDX6通过破环CKMT1A mRNA稳定性,抑制CKMT1A蛋白质翻译。在CNE2细胞中,CKMT1A低表达可增强细胞迁移和增殖能力,高表达则抑制细胞迁移和增殖能力,而DDX6的敲除可逆转CKMT1A下调导致的恶性行为进展。在裸鼠皮下移植瘤模型中,低表达CKMT1A促进肿瘤细胞生长,低表达DDX6抑制肿瘤细胞生长,而同时敲除DDX6与CKMT1A能恢复单独敲低DDX6导致的抑制效果。结论:鼻咽癌细胞中DDX6通过破坏CKMT1A mRNA稳定性,负调控CKMT1A蛋白质翻译,增强鼻咽癌细胞增殖和迁移能力,从而促进鼻咽癌恶性进展。 展开更多
关键词 鼻咽癌 CKMT1A ddx6 细胞增殖 细胞迁移
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DDX3X基因变异致X连锁智力障碍3例临床分析及康复随访 被引量:1
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作者 夏秦 顾琴 +5 位作者 陈婷 张何威 霍洪亮 曹徐君 王巍巍 吉永春 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期948-954,共7页
目的总结DDX3X基因变异导致X连锁智力障碍(XLID)患儿的临床特征及基因变异特点。方法回顾性分析2018年1月至2021年4月在康复科就诊的3例因DDX3X基因变异致XLID患儿的基因检测结果及临床表型,长期随访其康复训练效果。结果例1为8个月23... 目的总结DDX3X基因变异导致X连锁智力障碍(XLID)患儿的临床特征及基因变异特点。方法回顾性分析2018年1月至2021年4月在康复科就诊的3例因DDX3X基因变异致XLID患儿的基因检测结果及临床表型,长期随访其康复训练效果。结果例1为8个月23天男孩,例2为6个月女孩,例3为1岁6个月女孩。3例患儿首次就诊均表现为全面发育迟缓,特殊面容及肌张力障碍。全外显子测序发现例1为DDX3X基因c.1025+3A>C(p?)剪切突变,其母亲该位点为杂合子状态,父亲为野生型,根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)指南,该变异为临床意义未明性变异。经RT-PCR及Sanger验证后,该变异可引起内含子10部分保留及外显子10部分跳跃,提示该变异可能是导致基因功能异常的候选位点,该位点未经报道。例2为c.1535-1536 delAT(p.H 512 Rfs*5)缺失突变,其父母该位点均为野生型,根据ACMG指南,该变异为新发致病性变异。例3为在DDX3X基因7号内含子区域发现一处c.679+2T>G剪切突变,其父母该位点均为野生型,该变异为新发致病性变异。结论本研究发现3个新的国内首次报道的DDX3X基因变异位点,其中1例剪切突变经验证为候选位点;丰富了DDX3X基因变异谱,为患儿的临床诊断和遗传咨询提供了依据。 展开更多
关键词 ddx3X基因 X连锁智力障碍 遗传学分析
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基于微阵列分析DDX5影响头颈部鳞状细胞癌的初步探究 被引量:1
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作者 刘郭琦 刘春霞 +6 位作者 王静静 左金华 王芳 宋娇娇 于栋林 马向瑞 王文龙 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期810-816,共7页
目的:探讨DDX5解旋酶(DDX5)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达及作用。方法:组织微阵列芯片分析DDX5相关mRNA表达谱数据,并用R软件筛选差异mRNAs(DEGs)。使用GEPIA 2、TCGA数据库预测DDX5的表达水平。通过RT-qPCR、免疫组化、Western b... 目的:探讨DDX5解旋酶(DDX5)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达及作用。方法:组织微阵列芯片分析DDX5相关mRNA表达谱数据,并用R软件筛选差异mRNAs(DEGs)。使用GEPIA 2、TCGA数据库预测DDX5的表达水平。通过RT-qPCR、免疫组化、Western blot检测DDX5表达水平。基于高通量测序数据筛选差异circRNAs(DECs)、差异miRNAs(DEMIs)构建DDX5竞争内源性RNA网络(ceRNA)。Cytoscape软件可视化ceRNA网络图,进一步筛选出调控轴。结果:组织芯片筛选发现HNSCC中DDX5表达上调。免疫组化验证DDX5阳性染色更集中于鳞癌细胞核;qPCR结果提示DDX5 mRNA在组织和细胞中的表达有临床意义(P<0.05);Western blot结果示DDX5蛋白在组织中高表达。在ceRNA网络中确定了相关HNSCC轴circRNA-039626-miR-222-5p-DDX5。结论:DDX5在HNSCC中高表达,并且circRNA-039626-miR-222-5p-DDX5轴可能是HNSCC发生发展的潜在调控轴。 展开更多
关键词 ddx5解旋酶 头颈部鳞状细胞癌 ceRNA 微阵列分析
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miR-541-5p在食管癌组织中表达及调控DDX52表达对食管癌细胞增殖、迁移的影响 被引量:1
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作者 杨海龙 王丁丁 +3 位作者 陈雨桐 陈晓伟 李冰 王欣丽 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2024年第4期966-972,共7页
目的探讨miR-541-5p在食管癌(EC)组织中表达及调控DDX52表达对EC细胞增殖、迁移的影响。方法qRT-聚合酶链反应(PCR)分析检测EC组织和细胞中miR-541-5p表达。使用miR-541-5p模拟物或抑制物转染EC细胞(EC9706细胞或ECA-109细胞)以上调或下... 目的探讨miR-541-5p在食管癌(EC)组织中表达及调控DDX52表达对EC细胞增殖、迁移的影响。方法qRT-聚合酶链反应(PCR)分析检测EC组织和细胞中miR-541-5p表达。使用miR-541-5p模拟物或抑制物转染EC细胞(EC9706细胞或ECA-109细胞)以上调或下调miR-541-5p表达,CCK-8、集落形成实验和伤口愈合实验检测miR-541-5p对EC细胞增殖、迁移的影响。生物信息学和双荧光素酶实验分析miR-541-5p与DDX52之间的关系。Western印迹分析miR-541-5p对DDX52表达的影响。CCK-8、集落形成实验和伤口愈合实验检测DDX52能否逆转miR-541-5p对EC细胞增殖、迁移的作用。构建异种移植裸鼠模型,检测miR-541-5p过表达对裸鼠肿瘤组织生长、转移的影响。结果miR-541-5p在EC组织和细胞中较正常组织和细胞表达显著降低(P<0.05)。在体外,上调miR-541-5p表达可明显抑制EC细胞增殖和迁移,下调miR-541-5p表达可明显促进EC细胞增殖和迁移(P<0.05)。miR-541-5p负靶向调控DDX52表达(P<0.05)。DDX52可在一定程度上逆转miR-541-5p过表达对EC细胞增殖、迁移的抑制作用,差异有统计学意义(P<0.05)。在体内,miR-541-5p过表达显著抑制了裸鼠肿瘤生长和转移(P<0.05)。结论miR-541-5p在EC组织中低表达,其通过调节DDX52抑制EC细胞增殖和迁移,为EC的治疗提供了新的生物标志物。 展开更多
关键词 miR-541-5p ddx52 食管癌 增殖 迁移
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基于CRISPR/Cas9联合Cre-LoxP方法的Ddx3x肝脏条件性敲除小鼠模型的构建与鉴定 被引量:1
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作者 潘桢桢 徐玲 +5 位作者 张向颖 高耀 田原 范子豪 曹亚玲 任锋 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2024年第10期1275-1280,共6页
目的采用CRISPR/Cas9联合Cre-LoxP方法构建DEAD-box RNA解旋酶3X连锁(DEAD-box RNA helicase 3X-linked,Ddx3x)肝脏条件性敲除小鼠。方法设计特异的sgRNA序列,在Ddx3x基因外显子4~10两端插入LoxP序列,构建Ddx3x-flox小鼠。采用PCR方法... 目的采用CRISPR/Cas9联合Cre-LoxP方法构建DEAD-box RNA解旋酶3X连锁(DEAD-box RNA helicase 3X-linked,Ddx3x)肝脏条件性敲除小鼠。方法设计特异的sgRNA序列,在Ddx3x基因外显子4~10两端插入LoxP序列,构建Ddx3x-flox小鼠。采用PCR方法对F0代和F1代小鼠进行基因鉴定。将Ddx3x-flox F1代小鼠与特异性表达Alb-Cre的工具鼠交配,获得肝脏条件性敲除Ddx3x基因小鼠(Ddx3x^(Δhep))。采用PCR方法和Western blotting方法分别检测Ddx3x^(Δhep)基因小鼠目的基因与蛋白的表达。选取8周龄雄性野生型C57/6J小鼠、Ddx3x^(Δhep)小鼠、Ddx3x^(fl/fl)小鼠,测定血清ALT、AST水平评价肝脏肝损伤情况。结果对F1代小鼠基因PCR鉴定的结果表明,基因型符合Ddx3x^(fl/fl);F1代小鼠与Alb-Cre小鼠杂交,子代与Ddx3x^(fl/fl)小鼠杂交,即获得Ddx3x^(Δhep)小鼠;PCR与Western blotting结果显示,目的小鼠肝组织中Ddx3x基因和蛋白表达显著降低。此外,Ddx3x^(Δhep)小鼠无胚胎致死现象,出生后生理状况良好。正常饲养条件下,Ddx3x^(Δhep)小鼠与Ddx3x^(fl/fl)小鼠及野生型小鼠相比,血清ALT、AST指标及体质量差异均无统计学意义(P>0.05)。结论基于CRISPR/Cas9联合Cre-LoxP方法成功构建了Ddx3x^(Δhep)小鼠动物模型,为后续研究Ddx3x在肝脏中的生物学功能及作用机制奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas9技术 Cre-LoxP系统 ddx3x 肝脏条件性敲除小鼠
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