本研究旨在探究豫西脂尾羊线粒体Cytb基因的遗传多样性及其与其他绵羊品种的系统发育关系。研究选取了30只豫西脂尾羊作为研究对象,通过PCR扩增和产物测序技术对其线粒体Cytb基因(Cytochrome B Gene)进行分析。结果显示,所检测的样本中...本研究旨在探究豫西脂尾羊线粒体Cytb基因的遗传多样性及其与其他绵羊品种的系统发育关系。研究选取了30只豫西脂尾羊作为研究对象,通过PCR扩增和产物测序技术对其线粒体Cytb基因(Cytochrome B Gene)进行分析。结果显示,所检测的样本中共发现4种单倍型,涉及4个简约信息位点,单倍型多样度(Hd)为0.637,核苷酸多样度(Pi)为0.002。随后,将豫西脂尾羊Cytb基因全序列与GenBank数据库中其他23个绵羊品种的Cytb基因进行了序列对比,并利用基于邻接法(NJ法)和最大似然法(ML法)构建了NJ树和ML树,研究了豫西脂尾羊种群间的系统发生关系。结果显示,豫西脂尾羊在系统进化树中分别聚为2个支系,推测豫西脂尾羊存在2个母系起源。展开更多
【目的】掌握骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)其野生种质资源现状,了解其系统发育关系和进化状况。【方法】对野外采样的106尾骨唇黄河鱼进行mt DNA Cytb,COX1和D-Loop基因多样性对比。【结果】结果表明9个裂腹鱼亚科群体系统发育进化树...【目的】掌握骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)其野生种质资源现状,了解其系统发育关系和进化状况。【方法】对野外采样的106尾骨唇黄河鱼进行mt DNA Cytb,COX1和D-Loop基因多样性对比。【结果】结果表明9个裂腹鱼亚科群体系统发育进化树分为3大支,Network与系统发育树结果基本一致。骨唇黄河鱼Tajima’sD和Fu’sFs检验及错配分布分析均表明其经历过种群扩张,不同种群分离的时间可能与青藏高原地质运动有关。【结论】骨唇黄河鱼的遗传多样性相对较低,呈高单倍型多样度和低核苷酸多样度的特点。展开更多
研究以海南陵水、马来西亚、西沙、南沙4个海域共101尾波纹唇鱼作为研究对象,通过线粒体DNA的COⅠ和Cytb基因序列分析方法对波纹唇鱼进行了遗传多样性研究。经PCR扩增、克隆与序列测定,分别获得1560 bp COⅠ基因和1141 bp Cytb基因序列...研究以海南陵水、马来西亚、西沙、南沙4个海域共101尾波纹唇鱼作为研究对象,通过线粒体DNA的COⅠ和Cytb基因序列分析方法对波纹唇鱼进行了遗传多样性研究。经PCR扩增、克隆与序列测定,分别获得1560 bp COⅠ基因和1141 bp Cytb基因序列。两者多态性遗传参数统计显示,101尾个体分别存在23(COⅠ)和30(Cytb)个变异位点,分别检测出20(COⅠ)和27(Cytb)个单倍型,总群体单倍型多样性(Hd)分别为0.629(COⅠ)和0.755(Cytb),平均核苷酸差异数(K)分别为1.195(COⅠ)和1.424(Cytb),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.00077(COⅠ)和0.00126(Cytb)。分子方差分析(AMOVA)结果分别为26.26%(COⅠ)和4.22%(Cytb)的变异来自群体间,73.74%(COⅠ)和95.78%(Cytb)的变异来自群体内。同时,两个基因的单倍型网络图呈星状放射结构,不同地理来源的单倍型无明显分支,呈交错分布,没有体现地理差异性。研究初步认为,波纹唇鱼的遗传多样性处于较低水平,遗传分化存在但不显著,该结果可为今后波纹唇鱼的种质资源保护工作提供必要的科学依据。展开更多
文摘本研究旨在探究豫西脂尾羊线粒体Cytb基因的遗传多样性及其与其他绵羊品种的系统发育关系。研究选取了30只豫西脂尾羊作为研究对象,通过PCR扩增和产物测序技术对其线粒体Cytb基因(Cytochrome B Gene)进行分析。结果显示,所检测的样本中共发现4种单倍型,涉及4个简约信息位点,单倍型多样度(Hd)为0.637,核苷酸多样度(Pi)为0.002。随后,将豫西脂尾羊Cytb基因全序列与GenBank数据库中其他23个绵羊品种的Cytb基因进行了序列对比,并利用基于邻接法(NJ法)和最大似然法(ML法)构建了NJ树和ML树,研究了豫西脂尾羊种群间的系统发生关系。结果显示,豫西脂尾羊在系统进化树中分别聚为2个支系,推测豫西脂尾羊存在2个母系起源。
文摘【目的】掌握骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)其野生种质资源现状,了解其系统发育关系和进化状况。【方法】对野外采样的106尾骨唇黄河鱼进行mt DNA Cytb,COX1和D-Loop基因多样性对比。【结果】结果表明9个裂腹鱼亚科群体系统发育进化树分为3大支,Network与系统发育树结果基本一致。骨唇黄河鱼Tajima’sD和Fu’sFs检验及错配分布分析均表明其经历过种群扩张,不同种群分离的时间可能与青藏高原地质运动有关。【结论】骨唇黄河鱼的遗传多样性相对较低,呈高单倍型多样度和低核苷酸多样度的特点。
文摘研究以海南陵水、马来西亚、西沙、南沙4个海域共101尾波纹唇鱼作为研究对象,通过线粒体DNA的COⅠ和Cytb基因序列分析方法对波纹唇鱼进行了遗传多样性研究。经PCR扩增、克隆与序列测定,分别获得1560 bp COⅠ基因和1141 bp Cytb基因序列。两者多态性遗传参数统计显示,101尾个体分别存在23(COⅠ)和30(Cytb)个变异位点,分别检测出20(COⅠ)和27(Cytb)个单倍型,总群体单倍型多样性(Hd)分别为0.629(COⅠ)和0.755(Cytb),平均核苷酸差异数(K)分别为1.195(COⅠ)和1.424(Cytb),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.00077(COⅠ)和0.00126(Cytb)。分子方差分析(AMOVA)结果分别为26.26%(COⅠ)和4.22%(Cytb)的变异来自群体间,73.74%(COⅠ)和95.78%(Cytb)的变异来自群体内。同时,两个基因的单倍型网络图呈星状放射结构,不同地理来源的单倍型无明显分支,呈交错分布,没有体现地理差异性。研究初步认为,波纹唇鱼的遗传多样性处于较低水平,遗传分化存在但不显著,该结果可为今后波纹唇鱼的种质资源保护工作提供必要的科学依据。
