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籽鹅羽束性状分析及SOX5候选基因生物学功能预测
1
作者 张宇辰 周瑞进 +6 位作者 袁建彬 李文杰 臧树成 王立鹏 朗立敏 陈妍 杨焕民 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2019年第9期970-976,共7页
目的分析籽鹅头顶部的表型性状-羽束性状(crest trait),并预测SOX5候选基因的相关生物学功能,从而进一步揭示禽类表型性状与调控基因的作用机制。方法选取无羽束公鹅6只,有、无羽束母鹅各15只,建立两个资源群体,有羽束群(crest populati... 目的分析籽鹅头顶部的表型性状-羽束性状(crest trait),并预测SOX5候选基因的相关生物学功能,从而进一步揭示禽类表型性状与调控基因的作用机制。方法选取无羽束公鹅6只,有、无羽束母鹅各15只,建立两个资源群体,有羽束群(crest population,C):3只无羽束公鹅,15只有羽束母鹅;无羽束群(non-crest population,NC):3只无羽束公鹅,15只无羽束母鹅。两个试验群体同舍分组饲养,收集试验蛋孵化,通过后代表型分离比,分析羽束性状遗传规律。采集1、14、21日龄肝脏、头顶部皮肤组织,采用qRT-PCR方法测定各组织中SOX5基因相对表达量,并通过生物信息方法进行关联性分析。结果观察籽鹅表型分离比,证明无羽束性状符合隐性遗传规律,有羽束性状受常染色体显性基因调控。在1日龄雏鹅肝脏组织中,C群SOX5基因的相对表达量显著高于NC群(P <0. 01),其他时期差异虽无统计学意义(P> 0. 05),但C群仍高于NC群。随日龄增长,公鹅体重呈上升趋势,且与SOX5基因在皮肤中相对表达量变化趋势相同。经SMART、David软件预测,SOX5基因具有保守结构域,能形成具有生物学功能蛋白。结论籽鹅羽束性状类似于鸡冠表型遗传方式,受常染色体基因调控,SOX5基因为羽束性状的调控基因,且广泛参与禽类相关组织的发育过程。 展开更多
关键词 籽鹅 羽束性状 表型修饰 SOX5基因 组织发育
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籽鹅羽束性状在肝脏中相关候选基因关联性分析
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作者 张宇辰 李文杰 +5 位作者 袁建彬 臧树成 王立鹏 朗立敏 陈妍 杨焕民 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期203-209,共7页
本研究旨在分析籽鹅头顶部羽束性状(crest trait)相关调控基因,从而进一步揭示禽类表型性状与调控基因的作用机制,为后续分子遗传育种、禽类基因编辑等提供理论基础。本试验选取同家系同世代1日龄籽鹅作为试验样本,构建2个资源群体,每群... 本研究旨在分析籽鹅头顶部羽束性状(crest trait)相关调控基因,从而进一步揭示禽类表型性状与调控基因的作用机制,为后续分子遗传育种、禽类基因编辑等提供理论基础。本试验选取同家系同世代1日龄籽鹅作为试验样本,构建2个资源群体,每群体60只雏鹅,饲养周期为21 d。有羽束鹅群(crest population,C):该群体均为有羽束公雏;无羽束鹅群(non-crest,NC):该群体均为无羽束公雏,2个群体同舍分栏饲养。随后,为测定肝脏组织中eomes、hoxc8、sox5、mnr2、wnt5a、bmp2、gh候选基因相对表达量,在1,7,14,21日龄进行采样,应用qRT-PCR技术进行检测。结合生物信息学分析方法,分析调控羽束性状的关联基因。在qRT-PCR分析结果中,sox5基因在1日龄雏鹅肝脏组织中相对表达量,C组高于NC组,并且差异极显著(P<0.01)。其他时期虽无显著差异,但羽束鹅群仍高于无羽束鹅群相对表达量高。wnt5a基因在1日龄雏鹅肝脏中相对表达量,C组高于NC组,差异极显著(P<0.01),在其他时期无显著差异。通过生物信息学分析,结合Multiexperiment Viewer软件对候选基因进行聚类分析,sox5、wnt5a、bmp2基因可能均在同一调控通路中。结果提示,sox5基因可能为羽束性状调控基因,与wnt5a基因在同一信号通路中,并对羽束性状发育起到调控作用,sox5、bmp2基因可能在肝脏发育、代谢过程中起到调控作用。 展开更多
关键词 籽鹅 羽束性状 信号通路 调控基因 sox5基因
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四倍体杂交冰草F_(2)群体农艺性状聚类、相关及通径分析 被引量：2
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作者 杨东升 于肖夏 +1 位作者 卢倩倩 于卓 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期836-844,共9页
为深入开展四倍体冰草数量性状产量基因定位分析、优良新种质选育研究,以四倍体杂交冰草F_(2)群体的120个分离单株及其亲本蒙古冰草(Agropyron mongolicum)、航道冰草(Agropyron cristatum‘Fariway’)为材料,对其株高、叶长、叶宽、穗... 为深入开展四倍体冰草数量性状产量基因定位分析、优良新种质选育研究,以四倍体杂交冰草F_(2)群体的120个分离单株及其亲本蒙古冰草(Agropyron mongolicum)、航道冰草(Agropyron cristatum‘Fariway’)为材料,对其株高、叶长、叶宽、穗长、穗宽、茎粗、茎叶比和单株鲜重8个产量相关的农艺性状进行了测定分析。结果表明,该群体各性状均为受多基因控制的数量性状,呈正态分布,且存在超亲分离现象。聚类分析显示,在欧氏距离为17.5处,将F_(2)群体分为3个类群,其中第1、3类分别表现出优质和高产的特性。相关及通径分析表明,对单株产量影响最大的性状是株高(r=0.265,P<0.01),直接通径系数为0.174,其后依次为穗长(r=0.214,P<0.05)、茎叶比(r=0.197,P>0.05)和茎粗(r=0.109,P>0.05)。本试验结果可为高产优质的四倍体杂交冰草新品种培育奠定基础。 展开更多
关键词 四倍体杂交冰草 F_(2)群体 数量性状 超亲 聚类分析 相关分析 通径分析
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194份扁穗冰草种质资源表型多样性分析、综合评价及核心种质构建
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作者 吴昌忠 闫伟红 +5 位作者 赵彦 李志勇 武自念 潘文喧 霍春然 闫文昊 《草地学报》 2026年第3期865-880,共16页
本研究针对194份不同来源扁穗冰草(Agropyron cristatum)种质资源,利用变异系数、遗传多样性指数、聚类分析、主成分分析、相关性分析和灰色关联法等方法,基于28个表型性状进行多样性评估,并筛选出优异种质资源。进而结合QGA软件分析遗... 本研究针对194份不同来源扁穗冰草(Agropyron cristatum)种质资源,利用变异系数、遗传多样性指数、聚类分析、主成分分析、相关性分析和灰色关联法等方法,基于28个表型性状进行多样性评估,并筛选出优异种质资源。进而结合QGA软件分析遗传距离、取样比例和聚类方法,探讨核心种质构建最佳策略,并检验其可靠性和代表性。结果表明:194份扁穗冰草种质资源28个表型性状统计分析显示:变异系数为17.02%~87.85%,遗传多样性指数介于0.500~2.103。质量性状的变异系数为24.43%~52.75%,遗传多样性指数平均为0.869;数量性状的变异系数为17.02%~87.85%,遗传多样性指数均大于1.524,平均为1.962;这表明扁穗冰草具有较高遗传多样性。灰色关联法分析获得的穗长、穗宽、小穗数、穗轴第一节间长、小穗颜色、旗叶宽、叶鞘长度、植株颜色等可以作为扁穗冰草种质资源综合评价主要指标。筛选出优异种质资源编号B61,B1,B37,B83,B164,B193,B48,B85,均包含在核心种质中,为核心种质的构建提供了依据。主成分与QGA软件综合统计分析确定“欧式距离+多次聚类优先取样法+最短距离法+25%取样比例”是扁穗冰草核心种质构建的最佳策略,其MD值为0%、CR值达100%、VD值为25%、VR值为113.474%。最终获得的48份核心种质其累计贡献率(75.54%)显著高于原始群体,完整保留了原始种质的遗传多样性,为扁穗冰草种质资源的高效利用与遗传改良提供了理想材料。 展开更多
关键词 扁穗冰草 表型性状 遗传多样性 核心种质 综合评价
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