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携带非典型cpb2基因牛源A型产气荚膜梭菌重组α毒素的免疫保护性研究 被引量:4
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作者 德艳艳 姜志刚 +2 位作者 牛思博 孙刚 于力 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期563-567,共5页
为验证重组α毒素对携带非典型cpb2基因的A型产气荚膜梭菌的免疫保护性,本研究应用PCR技术,从某牛场牛源A型产气荚膜梭菌G1分离株中扩增出1 194 bp的α毒素编码基因(cpa)和795 bp的β2毒素编码基因(cpb2)。经BLAST分析显示,G1分离株携带... 为验证重组α毒素对携带非典型cpb2基因的A型产气荚膜梭菌的免疫保护性,本研究应用PCR技术,从某牛场牛源A型产气荚膜梭菌G1分离株中扩增出1 194 bp的α毒素编码基因(cpa)和795 bp的β2毒素编码基因(cpb2)。经BLAST分析显示,G1分离株携带的cpb2基因与14个菌株的非典型cpb2基因的氨基酸序列同源性为95.1%~98.9%,与典型cpb2基因(L77695)的氨基酸序列同源性为61.7%。这表明,G1的cpb2基因为非典型cpb2基因。同时分别将cpa和cpb2基因扩增产物克隆于原核表达载体中,构建重组表达质粒pET-a和pET-b2,重组菌经IPTG诱导表达重组蛋白,将其纯化后单独及联合免疫小鼠进行免疫保护试验。结果显示,单独免疫重组α毒素蛋白组以及联合免疫重组β2毒素蛋白组的小鼠,均可以抵抗至少6倍最小致死量(MLD)的G1外毒素(包含α毒素和非典型β2毒素)的攻击,也可以完全抵抗至少6 MLD的G2外毒素(不包含β2毒素)的攻击。表明,重组α毒素蛋白对含有及不含有非典型β2毒素的A型产气荚膜梭菌均具有良好的免疫保护作用。 展开更多
关键词 非典型cpb2基因 A型产气荚膜梭菌 重组α毒素 重组非典型β2毒素
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猪CPB2基因可变剪接体的克隆及生物信息学研究 被引量:3
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作者 夏博策 张凯艺 +4 位作者 苗佳坤 杨宇 彭焕祺 王彦芳 杨述林 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期3377-3390,共14页
本研究旨在克隆猪CPB2基因的不同可变剪接体,预测对应蛋白的功能特性以及研究不同转录本表达特性。以健康状态和体重相同的3头12月龄巴马小型猪为试验动物,通过RT-PCR技术及基因平末端克隆技术扩增猪CPB2基因的CDS区及部分非编码区,利... 本研究旨在克隆猪CPB2基因的不同可变剪接体,预测对应蛋白的功能特性以及研究不同转录本表达特性。以健康状态和体重相同的3头12月龄巴马小型猪为试验动物,通过RT-PCR技术及基因平末端克隆技术扩增猪CPB2基因的CDS区及部分非编码区,利用生物信息学工具预测CPB2编码蛋白的基本生物学特征,利用RT-PCR技术检测CPB2基因在肝、心、肾、皮下脂肪、肠系膜脂肪、股二头肌和背最长肌中的表达特征。以实验室制备的代谢性疾病易感猪为试验动物,利用qRT-PCR技术检测CPB2基因在富营养饮食效应下肝中的表达特征。结果表明,本研究成功克隆出猪CPB2基因的3种可变剪接体(CPB2-1、CPB2-2和CPB2-3),其中CPB2-1与NCBI序列XM_001929146.4相同,CPB2-2和CPB2-3为新发现转录本。与CPB2-1相比,CPB2-2和CPB2-3发生了5'端可变剪接(alternative5'splicesite,A5SS)事件;CPB2-1编码423个氨基酸的酸性不稳定性蛋白,CPB2-2和CPB2-3编码同种281个氨基酸的碱性不稳定性蛋白;与CPB2-1相比,CPB2-2和CPB2-3缺少信号肽和激活肽,但具有相同羧肽酶活性结构域;CPB2基因3种转录本仅在肝和肾中表达,其他组织无表达;在富营养饮食诱导的代谢性疾病易感猪的肝中,CPB2-1(P<0.01)和CPB2-2(P<0.01)显著降低,CPB2-3未显著降低(P=0.14)。综上,本研究成功在肝中克隆了猪CPB2的3种可变剪接体,推测CPB2-1是行使纤溶与凝血等生理功能的正常转录本;新发现转录本CPB2-2和CPB2-3被留在肝和肾中可能具有羧肽酶活性和重要生理学功能;CPB2基因可能与代谢相关的慢性肝病存在一定联系。 展开更多
关键词 cpb2 可变剪接 功能预测 表达特征 慢性肝病
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凝血酶激活纤溶抑制物基因CPB2单核苷酸多态性与不明原因复发性流产的关联探讨 被引量:4
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作者 胡春青 刘玉美 +1 位作者 唐晓勇 雷永革 《首都食品与医药》 2021年第2期17-19,共3页
目的观察分析不明原因复发性流产(URSA)与凝血酶激活纤溶抑制物(TAFI)基因CPB2单核苷酸多态性的关联.方法本研究纳入2019年7月~2020年6月我院和深圳市光明区人民医院妇产科收治的100例URSA患者,将其设为观察组;并收入同期无自然流产史... 目的观察分析不明原因复发性流产(URSA)与凝血酶激活纤溶抑制物(TAFI)基因CPB2单核苷酸多态性的关联.方法本研究纳入2019年7月~2020年6月我院和深圳市光明区人民医院妇产科收治的100例URSA患者,将其设为观察组;并收入同期无自然流产史的生育期、有正常妊娠与生育史、常规体检妇女200例,设为对照组,其中非孕、在孕各100例;采集两组妇女外周血标本,提取DNA,检测两组CPB2单核苷酸多态性,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测.比较两组等位基因频率与基因型,分析血栓指标与连锁不平衡性、基因点位相关性.结果观察组Rs9316179等位基因C、Rs7337140等位基因G、Rs3742264等位基因A、Rs2296642等位基因C频率分布均低于对照组(P<0.05);经Bonferroni多重检验校正分析显示,两组妇女Rs9316179、Rs7337140基因型、等位基因频率分布对比P<0.05;研究显示,观察组妇女Rs3742264~rs9316179点位组合中GGTT频率显然高于对照组妇女(P<0.05),且经FDR、Bonfermni多重检验校正结果显示P<0.05;URSA患者等位基因4G、基因型频率4G/4G显然高于对照组(P<0.05);与5G/5G基因型比较,URSA的发生与4G纯合子妇女、携带4G等位基因妇女相关,OR为4.822、2.810.而同时兼有PAI-1基因4G/4G基因型患者,发生URSA风险更高(P<0.01)(CI:2.294~7.366).结论URSA妇女中普遍存在CPB2基因遗传易感,PAgT(ADP)水平在rs3742264基因型间存在差异,rs3742264等位基因A可维持血小板、血浆TAFI正常功能,是URSA保护等位基因,对妇女妊娠具有积极作用;PAI-1基因4G/5G多态性与URSA发生存在密切相关性. 展开更多
关键词 凝血酶激活纤溶抑制物 复发性流产 cpb2 妊娠
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Genomic insights into cpb2-positive Clostridium perfringens and the potential biological function of cpb2 gene
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作者 Ke Wu Yuan Yuan +9 位作者 Mingjin Fang Yiwen Liu Danjiao Yang Likun Zhang Xin Tian Leina Dou Dongyang Ye Edward MFox Juan Wang Zengqi Yang 《One Health Advances》 2024年第1期76-82,共7页
Clostridium perfringens,capable of causing intestinal infections in both animals and humans,represents a significant public health concern.This study aimed to assess the occurrence of the beta2 toxin-coding gene cpb2 ... Clostridium perfringens,capable of causing intestinal infections in both animals and humans,represents a significant public health concern.This study aimed to assess the occurrence of the beta2 toxin-coding gene cpb2 in C.perfrin-gens from various host species and to explore the genetic contexts of this gene.The results showed an enrichment of cpb2 in pig-derived C.perfringens.A comparative analysis of the detection rates of cpb2 and pCP13-like plasmids revealed that the cpb2 gene itself,rather than the pCP13-like plasmids,caused the enrichment.Sequence comparison of cpb2-positive pCP13-like plasmids showed that cpb2 was located on the cpb2-hp-transcriptional regulator(PadR family)segment.Despite the diverse plasmid structures of pCP13-like plasmids,the cpb2-hp-transcriptional regulator(PadR family)segment was consistently observed in all cpb2-positive C.perfringens strains,suggesting the potential transmission of the cpb2 gene on this specific genetic segment.Additionally,phylogenetic analysis of the C.per-fringens strains harboring pCP13-like plasmids,as well as 31 pCP13-like plasmids,indicated that cpb2 did not affect the evolutionary relationship of either pCP13-like plasmids or C.perfringens.Genetic markers,particularly those located on mobile genetic elements(MGEs),that can help bacteria survive in external environments are more readily enriched in the population.The high prevalence of cpb2 in pig-derived strains indicated that it might confer a selec-tive advantage,enhancing the survival and persistence of C.perfringens in the pig intestine.In conclusion,our study elucidated the genetic context,host tropism and potential biological functions of cpb2,which can provide references for further research. 展开更多
关键词 Clostridium perfringens cpb2 GENOME Host adaption
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编码TAFI的CPB2基因Thr325Ile多态性与脑梗死的相关性研究 被引量:1
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作者 陈煜森 肖波 +3 位作者 赵斌 许志恩 山県英久 三木哲郎 《卒中与神经疾病》 2004年第1期13-16,共4页
目的 探讨TAFI基因单核苷酸的多态性与脑梗死的关系。方法 收集了 189例尸体检查的样本 ,其中包括 95例脑梗死和 94例对照。CPB2基因Thr32 5Ile的基因型是用PCR RFLP(Restrictionfrag mentlengthploymorphism)法来分析。 结果 Thr32 ... 目的 探讨TAFI基因单核苷酸的多态性与脑梗死的关系。方法 收集了 189例尸体检查的样本 ,其中包括 95例脑梗死和 94例对照。CPB2基因Thr32 5Ile的基因型是用PCR RFLP(Restrictionfrag mentlengthploymorphism)法来分析。 结果 Thr32 5Ile的基因型频率分布是Thr32 5Thr 139例 (74 % ) ,Thr32 5Ile 4 5例 (2 3% ) ,Ile32 5Ile 5例 (3% )。在脑梗死组和对照组之间这些基因型频率分布的差别没有显著性意义 (P >0 .0 5 )。结论 CPB2基因的多态性 (Thr32 5Ile)与脑梗死没有明显关系。 展开更多
关键词 TAFI cpb2基因 基因多态性 脑梗死 相关性 病理机制 PCR-RFLP
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凝血酶激活的纤溶抑制物编码区基因位点C1040T和G505A单核苷酸多态性与脑梗死的相关性研究 被引量:1
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作者 石磊 王丽丽 +3 位作者 李召东 王苗国 石鑫 徐成伟 《浙江中西医结合杂志》 2011年第3期149-152,共4页
目的:研究凝血酶激活的纤溶抑制物(TAFI)编码区CPB2基因位点C1040T和G505A的单核苷酸多态性与脑梗死之间的联系。方法:应用聚合酶链反应和限制性内切酶片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP)检测98例脑梗死患者和100名正常对照者的TAFI基因... 目的:研究凝血酶激活的纤溶抑制物(TAFI)编码区CPB2基因位点C1040T和G505A的单核苷酸多态性与脑梗死之间的联系。方法:应用聚合酶链反应和限制性内切酶片段长度多态性分析技术(PCR-RFLP)检测98例脑梗死患者和100名正常对照者的TAFI基因编码区C1040T(Thr325Ile)、G505A(Thr147Ala)多态性分布特点。结果:CPB2基因C1040T(Thr325Ile)及G505A(Thr147Ala)2个位点的3种基因型在脑梗死组和对照组的频率分布分别为C1040C(Thr325Thr)33(33.7%)、29(29.0%);C1040T(Thr325Ile)47(48.0%)、51(51.0%);T1040T(Ile325Ile)18(18.3%)、20(20.0%);A505A(Thr147Thr)15(15.3%)、43(43.0%);G505A(Thr147Ala)44(45.0%)、19(19.0%);G505G(Ala147 Ala)39(39.7%)、38(38.0%)。经χ2检验,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,并且脑梗死组与对照组之间各种基因型频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论:TAFI编码区CPB2基因(Thr325Ile、Thr147Ala)的多态性与脑梗死的发生无明显相关性。 展开更多
关键词 脑梗死 凝血酶激活的纤溶抑制物 PCR-RFLP cpb2基因 单核苷酸多态性
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冠状动脉粥样硬化性心脏病患者凝血酶激活的纤溶抑制物及其编码区基因多态性的研究 被引量:3
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作者 徐成伟 王丽丽 +3 位作者 吴晓本 赵敬杰 杜贻萌 姜翠英 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期438-442,共5页
目的探讨凝血酶激活的纤溶抑制物(thrombin actiratable fibrinolysis inhibitor,TAFI)及其编码基因CPB2单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)之间的联系。方法应用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性分析技术(poly... 目的探讨凝血酶激活的纤溶抑制物(thrombin actiratable fibrinolysis inhibitor,TAFI)及其编码基因CPB2单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)之间的联系。方法应用聚合酶链反应.限制性片段长度多态性分析技术(polymerase chain reaction-restriction fragmentlengthpo lymorphisin,PCR-RFLP)检测210例冠心病患者和190名正常对照者的似仃基因编码区Thr325Ile、Thrl47Ala多态性分布特点,同时应用发色底物法和ELISA法分别测定TAFI的活性及抗原,并进一步分析基因多态性与TAH的活性及抗原之间的关系。结果冠心病组(心肌梗死组及心绞痛组)血浆中TAFI的活性及抗原水平均较对照组显著增高,差异有统计学意义。CPB2基因C1040T(Thr325Ile)及GSOSA(Thrl47Ala)2个位点的3种基因型在冠心病组和对照组的频率分布分别为C1040C(Thr325Thr)67(31.9%)、64(33.6%);C1040T(Thr325Ile)109(51.9%)、92(48.4%);T1040T(lle325Ile)34(16.2%)、34(17.8%);G505G(Alal47Ala)75(35.7%)、72(37.8%);G505A(Thrl47Ala)112(53.3%)、96(50.5%);A505A(Thrl47Thr)23(10.9%)、22(11.7%),经x^2检验,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,并且两组之间各种基因型频率分布差异无统计学意义(P〉0.05)。在冠心病组和对照组Thr325Ile不同的基因型对TAFI活性没有影响;对TAH抗原含量的影响则以Thr325Thr纯合基因型者血浆TAH抗原浓度最高,较其他两型差异有统计学意义(P〈0.05),Thr325Ile与TIle325Ile型之间则差异无统计学意义(P〉0.05)。而Thrl47Ala基因多态性与血浆中TAFI活性及抗原水平之间的差异均无统计学意义(P〉0.05)。结论TAFI具有抑制纤溶的作用,可能是冠心病发病的危险因子。TAFI编码区基因Thr325Ile的多态性对血浆中TAFI抗原水平有明显影响,但Thr325Ile、Thrl47Ala的多态性与冠心病的发生没有明显的相关性。 展开更多
关键词 凝血酶激活的纤溶抑制物 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性 cpb2基因多态性 冠状动脉粥样硬化性心脏病
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