期刊文献+
共找到59篇文章
< 1 2 3 >
每页显示 20 50 100
枳属种质遗传多样性及其与近缘属植物亲缘关系的SSR和cpSSR分析 被引量:35
1
作者 龚桂芝 洪棋斌 +2 位作者 彭祝春 江东 向素琼 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期1742-1750,共9页
应用核基因组SSR和叶绿体基因组SSR,分析了枳属28份枳及枳杂种种质的遗传多样性及其与近缘属植物的亲缘关系。核基因组SSR分析表明普通枳的遗传差异明显,22个SSR位点的平均多态性信息含量(PIC)为0.51,平均期望杂合度为0.52,表明中国枳... 应用核基因组SSR和叶绿体基因组SSR,分析了枳属28份枳及枳杂种种质的遗传多样性及其与近缘属植物的亲缘关系。核基因组SSR分析表明普通枳的遗传差异明显,22个SSR位点的平均多态性信息含量(PIC)为0.51,平均期望杂合度为0.52,表明中国枳种质资源具有较丰富的遗传多样性。在遗传距离约0.16时,22份普通枳可以分成4个类型。叶绿体基因组SSR分析则发现普通枳间基本无差异,表明以母系遗传为特征的枳叶绿体基因组相对保守。富民枳与普通枳无论是在核基因组还是在叶绿体基因组上均存在较大差异,支持富民枳种的地位。SSR和cpSSR结合使用可比较准确地鉴定枳杂种。 展开更多
关键词 SSR cpssr 遗传多样性 亲缘关系
原文传递
果梅nSSR、cpSSR引物在李属果树上的通用性分析 被引量:6
2
作者 韩键 王化坤 +3 位作者 练春兰 周杰 高志红 章镇 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期830-835,共6页
用来自果梅的17对nSSR引物和13对cpSSR引物,对李属果树桃、李、梅、杏、樱桃5个树种的24个基因型进行了扩增,以分析其在李属不同果树上的通用性。结果显示,有13对nSSR引物和13对cpSSR引物得到多态性扩增,分别占所用引物的76.5%和100%,平... 用来自果梅的17对nSSR引物和13对cpSSR引物,对李属果树桃、李、梅、杏、樱桃5个树种的24个基因型进行了扩增,以分析其在李属不同果树上的通用性。结果显示,有13对nSSR引物和13对cpSSR引物得到多态性扩增,分别占所用引物的76.5%和100%,平均PIC值分别为0.591和0.654。其中,9对nSSR引物和11对cpSSR引物具有高多态性信息含量,可用于李属果树基因组学和遗传育种方面的研究,显示出果梅SSR引物在李属类果树中具有很好的通用性。 展开更多
关键词 果梅 nSSR cpssr 核果类 通用性
在线阅读 下载PDF
栗属植物cpSSR标记技术的建立与体系优化 被引量:7
3
作者 甄贞 曹庆芹 +3 位作者 杨凯 沈元月 冯永庆 秦岭 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期557-560,共4页
叶绿体微卫星标记是一种新的分子标记技术。用1对来源于拟南芥的cpSSR引物研究栗属资源,对栗属植物cpSSR反应体系的主要影响因子进行了优化筛选。结果表明,20μL反应体系各组分的最适浓度分别为:2.5mmol/LMg2+,0.5U Taq DNA聚合酶,0.25m... 叶绿体微卫星标记是一种新的分子标记技术。用1对来源于拟南芥的cpSSR引物研究栗属资源,对栗属植物cpSSR反应体系的主要影响因子进行了优化筛选。结果表明,20μL反应体系各组分的最适浓度分别为:2.5mmol/LMg2+,0.5U Taq DNA聚合酶,0.25mmol/L dNTP,10mg/L的DNA模板,正向引物和反向引物都为0.1μmol/L,NTCP40最适退火温度为56℃。该体系已成功应用于栗属资源的遗传多样性研究中。 展开更多
关键词 栗属植物 cpssr 体系优化
在线阅读 下载PDF
应用cpSSR和EST-SSR标记进行柑橘特异种质资源遗传背景研究 被引量:28
4
作者 王福生 江东 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期465-474,共10页
将叶绿体SSR和EST-SSR标记用于揭示柑橘及其近缘属的系统发育关系,并阐明保存在重庆国家果树种质柑橘圃内一些特异种质资源的遗传背景。其中50份材料和44份材料分别用cpSSR和EST-SSR分析。22对cpSSR引物产生146个多态性条带,平均检测到6... 将叶绿体SSR和EST-SSR标记用于揭示柑橘及其近缘属的系统发育关系,并阐明保存在重庆国家果树种质柑橘圃内一些特异种质资源的遗传背景。其中50份材料和44份材料分别用cpSSR和EST-SSR分析。22对cpSSR引物产生146个多态性条带,平均检测到6.64个多态性条带,平均Shannon's多样性指数为0.32;18对EST-SSR引物产生240个多态性条带,平均检测到13.3个多态性条带,平均多态信息含量(PIC)为0.73,平均期望杂合度为0.78。根据cpSSR和EST-SSR分析,结合形态学证据,阐明一些特异柑橘种质资源的遗传背景,同时证明莽山野橘、元橘、宜昌橙有较近的亲缘关系。 展开更多
关键词 柑橘 cpssr EST-SSR 遗传背景
原文传递
榧树居群遗传多样性的cpSSR分析 被引量:12
5
作者 易官美 邱迎君 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期583-588,753,共7页
【目的】探讨全球气候变化和人类活动干扰对榧树遗传多样性的影响。【方法】采用叶绿体基因组SSR分子标记的方法,对榧树自然分布区10个居群的遗传多样性和遗传结构进行了研究。【结果】5个cpSSR多态性位点共检测到17个等位基因,可组成2... 【目的】探讨全球气候变化和人类活动干扰对榧树遗传多样性的影响。【方法】采用叶绿体基因组SSR分子标记的方法,对榧树自然分布区10个居群的遗传多样性和遗传结构进行了研究。【结果】5个cpSSR多态性位点共检测到17个等位基因,可组成28个单倍型。单倍型H3和H13是所有居群共有的单倍型。榧树叶绿体基因组的遗传多样性HE为0.157(0.098~0.211),明显低于其他针叶树种叶绿体基因组的遗传多样性(0.370)。榧树的遗传多样性主要分布于居群内(97.95%),居群间的遗传分化GST为0.020 3,低于其他37种针叶树种的遗传分化(0.165)。【结论】榧树居群经历了历史瓶颈效应。武夷山、黄山、会稽山和天目山等山区可能是榧树在第4纪气候振荡期的孑遗地。瓶颈效应和遗传漂变是形成榧树单倍型分布式样的重要原因。 展开更多
关键词 榧树 遗传多样性 遗传结构 cpssr 孑遗地
在线阅读 下载PDF
利用cpSSR分子标记法对丹参遗传特征的分析 被引量:5
6
作者 王海 何冬梅 +3 位作者 王睿婷 宋杰 郭晓恒 严铸云 《安徽农业科学》 CAS 2012年第19期9985-9989,共5页
[目的]利用cpSSR(叶绿体微卫星)分子标记法对丹参的遗传特征进行分析。[方法]选择12对cpSSR扩增良好、重复性好、条带清晰的SSR引物,对全国8省25县31个采样点的丹参进行cpSSR检测分析。[结果]丹参在细胞质遗传(cpSSR)上,总体均体现为中... [目的]利用cpSSR(叶绿体微卫星)分子标记法对丹参的遗传特征进行分析。[方法]选择12对cpSSR扩增良好、重复性好、条带清晰的SSR引物,对全国8省25县31个采样点的丹参进行cpSSR检测分析。[结果]丹参在细胞质遗传(cpSSR)上,总体均体现为中等水平;在地区上存在不同程度差异。基于Shannon多样性指数和Nei’s基因多样性指数的细胞质遗传多样性各省间大小依次为:山西、河南、山东、河北、四川、江苏、陕西、安徽。8省区间丹参的遗传变异以种群间的遗传变异为主导;省区内种群间的基因流有限,而省区间的基因交流较明显。[结论]综合分析认为道地产区和传统主产区的丹参主要为就地引种栽培,在栽培过程中引入了部分外来种源;在道地产区四川、山东、河南之间很早就存在种质互换,新产区多从道地产区引种。但在遗传分化方面未显示地理相关性,进一步说明全国丹参种质之间存在广泛的基因交流,是由于人类活动中对丹参的异地引种所造成。 展开更多
关键词 丹参 cpssr 分子标记 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
苎麻cpSSR标记筛选及在亲缘关系研究中的应用 被引量:3
7
作者 陈平 喻春明 +3 位作者 王延周 陈继康 卢凌霄 熊和平 《湖北农业科学》 北大核心 2014年第21期5084-5086,共3页
利用cp SSR引物(叶绿体微卫星)分子标记对苎麻[(Boehmeria nivea(L.)Gaudich.]属植物进行亲缘关系分析。从22对cp SSR引物中,筛选出5对在苎麻中扩增良好、条带清晰、重复性好的引物,多态性比例为22.73%。5对引物在8份供试材料中共扩增... 利用cp SSR引物(叶绿体微卫星)分子标记对苎麻[(Boehmeria nivea(L.)Gaudich.]属植物进行亲缘关系分析。从22对cp SSR引物中,筛选出5对在苎麻中扩增良好、条带清晰、重复性好的引物,多态性比例为22.73%。5对引物在8份供试材料中共扩增出16条多态条带,平均每对引物的多态性条带为3.2条。聚类分析将这些材料分为3类,分类结果与采用叶绿体基因序列分类结果一致。 展开更多
关键词 苎麻[(Boehmeria nivea (L.) Gaudich.] 亲缘关系 cpssr
在线阅读 下载PDF
川滇地区麻疯树遗传多样性及亲缘关系的cpSSR研究 被引量:1
8
作者 蒲光兰 周兰英 +1 位作者 向倩 马永志 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期23-31,共9页
目的:研究川滇地区麻疯树遗传多样性,探讨居群间亲缘关系,为合理利用麻疯树种质资源及良种选育奠定理论基础。方法:作者运用12对叶绿体微卫星(cpSSR)标记引物对10个麻疯树野生居群进行分析,将扩增出的条带作为原始矩阵,用POPGENE versio... 目的:研究川滇地区麻疯树遗传多样性,探讨居群间亲缘关系,为合理利用麻疯树种质资源及良种选育奠定理论基础。方法:作者运用12对叶绿体微卫星(cpSSR)标记引物对10个麻疯树野生居群进行分析,将扩增出的条带作为原始矩阵,用POPGENE version 1.32软件分析遗传多样性参数,并采用NTSYSpc version 2.10软件进行UPGMA聚类分析,构建系统树状图。结果:共检测到多态性位点22个,多态性位点百分率(P)平均为76.28%。其中,云南双柏(YNSB)居群多态性位点百分率最高,达95.45%;而云南泸水(YNLS)居群多态性位点百分率最低,仅45.45%。Nei's基因多样性指数He 0.402 0,Shannon信息多样性指数I 0.576 7,有效等位基因数Ae 1.713 6,总基因多样性(HT)0.443 3,基因分化系数Gst 0.080 2,基因流(Nm)3.058 5;居群内基因多样性HS 0.405 1,居群间基因多样性(Dst)0.035 7,表明麻疯树居群内的基因多样性在总居群基因多样性中所占比例较大,麻疯树居群间几乎没有分化;ANOVA分析结果表明,91.02%的变异来源于居群内,8.98%变异来源于居群间,即10个供试麻疯树居群遗传变异主要发生在居群内,居群内的遗传变异大于居群间的遗传变异,这与Nei's基因分化系数分析结果一致;麻疯树各居群遗传多样性由低到高依次为:云南泸水(YNLS)居群<云南西双版纳(XSBN)居群<四川花棚子(SCHPZ)居群<四川会东(SCHD)居群<四川金河(SCJH)居群<云南普洱(YNPR)居群<四川雷波(SCLB)居群<云南双柏(YNSB)居群<云南法依(YNFY)居群<四川会理(SCHL)居群;10个麻疯树居群的遗传一致度为0.812 7~0.979 8;遗传距离为0.020 4~0.207 3,表明这10个居群间的相似程度较高,遗传距离较小,亲缘关系较近;UPGMA聚类分析显示:10个麻疯树居群可分为两大类,即SCJH居群和SCHPZ居群聚为一类;SCHL居群、SCHD居群、SCLB居群、YNSB居群、YNFY居群、YNPR居群、XSBN居群和YNLS居群聚为另一类。结论:川滇地区麻疯树具有丰富的遗传多样性,但各居群间亲缘关系较近。 展开更多
关键词 麻疯树 cpssr 遗传多样性 亲缘关系 四川 云南
原文传递
黄瓜cpSSR-PCR反应体系优化及应用 被引量:1
9
作者 胡建斌 梁芳芳 +3 位作者 李建吾 袁鸣 董小结 侯卫真 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第4期822-826,共5页
叶绿体微卫星(chloroplast microsatellite,cpSSR)是近几年发展起来的新型高效分子标记,在植物系统发育和基因漂移研究中有广泛应用。在前期开发黄瓜cpSSR引物的研究基础上,本文研究了Taq酶量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA质量和浓... 叶绿体微卫星(chloroplast microsatellite,cpSSR)是近几年发展起来的新型高效分子标记,在植物系统发育和基因漂移研究中有广泛应用。在前期开发黄瓜cpSSR引物的研究基础上,本文研究了Taq酶量、MgCl2浓度、dNTPs浓度、模板DNA质量和浓度、循环次数等参数对cpSSR-PCR扩增效果的影响,获得优化的反应体系,即15μL体积包括:1×Taq酶缓冲液,0.5UTaq聚合酶,0.2μmol/L引物,0.2mmol/LdNTPs,1.5mmol/LMgCl2,约10ng模板DNA,循环25次。采用该优化体系,以已开发的黄瓜cpSSR引物,对12份黄瓜材料进行了重复性PCR扩增。结果发现国外种质中存在3种单倍型,而在国内种质中只检测到2种单倍型,说明在本研究所用的材料中,国外种质叶绿体遗传差异明显大于国内栽培种。此结果说明优化的cpSSR反应体系具有稳定性和可靠性。 展开更多
关键词 黄瓜 cpssr 体系优化 单倍型
在线阅读 下载PDF
叶绿体基因组微卫星标记(cpSSR)研究进展 被引量:7
10
作者 李博 刘合霞 《安徽农业科学》 CAS 2012年第13期7638-7639,7649,共3页
随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开... 随着测序技术的发展,叶绿体基因组微卫星标记(cpSSRs)的开发和应用越来越普遍。该研究介绍了叶绿体基因组分子标记的特点、用途、开发方法以及已开发的cpSSRs所具有的特点。随着cpSSRs开发成本的降低及研究技术的成熟,新的cpSSRs不断开发,将会有越来越多的叶绿体基因组SSR分子标记应用于群体遗传学、生物地理学和杂交育种的研究。其在野生植物进化过程研究中所具备的潜力在不久的将来将被充分认识和利用。 展开更多
关键词 叶绿体基因组 微卫星标记 叶绿体基因组微卫星标记cpssrs
在线阅读 下载PDF
濒危藏药桃儿七cpSSR-PCR引物开发与反应体系优化 被引量:5
11
作者 张盾 任梦云 +1 位作者 张银东 关潇 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期2886-2894,共9页
利用桃儿七叶绿体全基因组开发cpSSR引物,使用正交设计试验,对桃儿七cpSSR-PCR反应体系中的5种主要因素(模板DNA,Mg^(2+),Taq DNA酶,dNTPs及ISSR引物)进行筛选优化来研究桃儿七遗传多样性。选取甘肃碌曲县则岔石林桃儿七居群样本及13个... 利用桃儿七叶绿体全基因组开发cpSSR引物,使用正交设计试验,对桃儿七cpSSR-PCR反应体系中的5种主要因素(模板DNA,Mg^(2+),Taq DNA酶,dNTPs及ISSR引物)进行筛选优化来研究桃儿七遗传多样性。选取甘肃碌曲县则岔石林桃儿七居群样本及13个不同桃儿七居群验证该反应体系。正交试验表明:各因素显著性为Mg^(2+)>引物>Taw酶>DNA浓度>dNTPs,桃儿七cuss-PCR反应的最佳体系为(25μL):DNA20 ng/μL,Mg^(2+)1.5 mmol/L,dNTPs 2.0 mmol/L,Taq DNA酶0.5 U,引物1.0μmol/L,2.5μL 10×Buffer。该体系具有很高的稳定性和重复性,并为野生桃儿七遗传多样性及保护策略研究提供了技术支持。 展开更多
关键词 桃儿七 cpssr-PCR 引物开发 正交试验
原文传递
麻疯树cpSSR标记技术的建立与体系优化研究 被引量:1
12
作者 向倩 周兰英 +6 位作者 万静 张旭 雷宝盛 金银春 冯毅 赵晓英 于绪任 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第32期15746-15748,共3页
[目的]建立麻疯树cpSSR-PCR反应的最佳反应体系。[方法]对影响麻疯树cpSSR-PCR反应体系的5个因素(TaqDNA聚合酶、DNA模板、Mg2+、dNTP、引物)进行优化试验,筛选各反应因素的最佳水平。[结果]20μl反应体系各组分的最合适浓度分别为10... [目的]建立麻疯树cpSSR-PCR反应的最佳反应体系。[方法]对影响麻疯树cpSSR-PCR反应体系的5个因素(TaqDNA聚合酶、DNA模板、Mg2+、dNTP、引物)进行优化试验,筛选各反应因素的最佳水平。[结果]20μl反应体系各组分的最合适浓度分别为10×Buffer、2.00mmol/LMg2+、2U/μlTaqDNA聚合酶、0.2mmol/LdNTP、0.2μmol/L引物、35ng/μlDNA模板。[结论]最佳的退火温度为52℃;该反应体系的稳定性和可重复性均较好。 展开更多
关键词 麻疯树 cpssr—PCR 体系优化
在线阅读 下载PDF
基于cpSSR标记的红松天然群体自由授粉子代的父本分析 被引量:1
13
作者 赵丹 隋心 +1 位作者 孙晓艳 冯富娟 《经济林研究》 2011年第4期23-27,共5页
为了研究天然红松林的花粉传播规律,利用筛选出的9对多态性高的cpSSR引物,对红松天然群体内28个单株的280个自由授粉子代进行了父本分析。9对引物共检测到21个等位基因,每个位点的等位基因数在2~4之间,平均2.3个。试验群体平均观测杂... 为了研究天然红松林的花粉传播规律,利用筛选出的9对多态性高的cpSSR引物,对红松天然群体内28个单株的280个自由授粉子代进行了父本分析。9对引物共检测到21个等位基因,每个位点的等位基因数在2~4之间,平均2.3个。试验群体平均观测杂合度、平均期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.405 1,0.510 4和0.411 8。采用最大似然法对子代进行父本分析,在95%的可信度水平下可确定59个子代的父本,占子代群体的21%,其累积排除概率为90.16%。在自由授粉状态下,红松自交率为0。绝大多数亲本的雄性繁殖适合度在1%~2%之间,平均为1.34%。各项指标均表明红松天然群体内亲本群体与子代群体的遗传多样性水平十分接近,得出了自由授粉的天然种群具有较好的遗传多样水平的保持性和传续性。 展开更多
关键词 红松 天然群体 cpssr标记 父本分析
在线阅读 下载PDF
Investigation on Genetic Characteristics of Salvia miltiorrhiza Bge. by Using cpSSR Technology
14
作者 王海 何冬梅 +3 位作者 王睿婷 宋杰 郭晓恒 严铸云 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第6期1157-1163,共7页
[Objective] This study aimed to analyze the genetic characteristics of Salvia miltiorrhiza by using cpSSR (chloroplast microsatellites) molecular marker method. [Method] Twelve pairs of SSR primers with ideal cpSSR ... [Objective] This study aimed to analyze the genetic characteristics of Salvia miltiorrhiza by using cpSSR (chloroplast microsatellites) molecular marker method. [Method] Twelve pairs of SSR primers with ideal cpSSR amplification result, good repeatability and clear amplification bands were selected for cpSSR detection and analysis of S. miltiorrhiza samples from 31 sampling locations in 25 counties of 8 provinces in China. [Result] S. miltiorrhiza shows an overall medium level in the cytoplasmic inheritance (cpSSR) and varying degrees of differences in the regions. Based on Shannon’s Information index (I) and Nei’s genetic diversity index, the cytoplasmic genetic diversity in different provinces shows a decreasing order of Shanxi, Henan, Shandong, Hebei, Sichuan, Jiangsu, Shaanxi, Anhui. Genetic variations of S. miltiorrhiza in eight provinces were found mainly among populations. Gene flow among populations with in a province is less than that among different provinces. [Conclusion] Comprehensive analysis shows that S. miltiorrhiza cultivated in genuine producing areas and traditional main producing areas are mainly introduced from the local before introduction of some foreign germplasm resources during cultivation. The exchange of S. miltiorrhiza germplasm resources exists very early among genuine producing areas such as Sichuan, Shandong and Henan, while S. miltiorrhiza germplasm resources in new producing areas are mainly introduced from genuine producing areas. However, no geographical correlation was observed in the genetic differentiation, which further reveals that there is a wide range of genetic exchange among S. miltiorrhiza germplasm resources in China, resulting from the artificial introduction from allopatry. 展开更多
关键词 Salvia miltiorrhiza Bunge cpssr Molecular marker Genetic diversity
在线阅读 下载PDF
基于cpSSR标记的甘薯品种亲缘关系及遗传多样性分析 被引量:6
15
作者 王崇 王连军 +4 位作者 苏文瑾 雷剑 柴沙沙 杨新笋 张文英 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期1687-1696,共10页
在甘薯遗传多样性研究中,目前主要采用细胞核基因组的遗传信息。而放任授粉(集团杂交)是甘薯育种的重要手段,但基于叶绿体微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)标记技术的甘薯的遗传多样性分析和指纹图谱构建的研究报道较... 在甘薯遗传多样性研究中,目前主要采用细胞核基因组的遗传信息。而放任授粉(集团杂交)是甘薯育种的重要手段,但基于叶绿体微卫星(chloroplast simple sequence repeat,cpSSR)标记技术的甘薯的遗传多样性分析和指纹图谱构建的研究报道较少。本研究基于cpSSR标记技术,对16份甘薯品种进行分子鉴别,并建立相对应的指纹图谱。利用在19对cpSSR引物中筛选出的11对特异性引物进行cpSSR扩增,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,结果显示,共扩增出43个条带,其中多态性条带33条,平均每对引物扩增出3个多态性条带,多态性百分率为76.74%。16份甘薯品种的遗传距离变异范围为0.0912-0.5067,平均遗传距离是0.2301。聚类分析表明,cpSSR标记能大致反映出不同品种之间的亲缘关系。该指纹图谱的建立,可为中国甘薯品种数据库的完善、近缘甘薯品种的鉴定、育种亲本的选择和品种保护提供参考依据。 展开更多
关键词 甘薯 cpssr标记 品种鉴定 指纹图谱
原文传递
基于cpSSR标记的山药种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量:5
16
作者 张静珍 王连军 +3 位作者 雷剑 柴沙沙 杨新笋 张文英 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第7期1222-1233,共12页
采用叶绿体SSR(cpSSR)分子标记对从国内外引进的64份山药种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,旨在为山药品种亲本选择,山药种质创新及品种改良提供依据。结果显示:从21对cpSSR引物中筛选出10对扩增稳定、多态性高的引物,在64... 采用叶绿体SSR(cpSSR)分子标记对从国内外引进的64份山药种质资源进行遗传多样性分析,构建DNA指纹图谱,旨在为山药品种亲本选择,山药种质创新及品种改良提供依据。结果显示:从21对cpSSR引物中筛选出10对扩增稳定、多态性高的引物,在64份山药种质材料中扩增出69个条带,多态性条带59个,多态性比率高达85.51%,平均观测等位基因数(Na)为2,平均有效等位基因数(Ne)为1.5693(1.2311~1.9160),平均Shannon信息指数为0.5606(0.3290~0.6711),平均Nei's基因多样性指数(He)为0.3781(0.1848~0.4781),表明64份山药种质资源具有丰富的遗传多样性。聚类分析结果表明,遗传相似系数变幅为0.55~0.93,在相似系数为0.63时,可将64份山药种质资源分为4类,结果表明,基于cpSSR分子标记的山药种质资源的分类在种间具有较好的区分能力,但是cpSSR分类表现出较大的地理分布的相关性,而与形态特征关系不密切。选用较少的引物区分较多的品种为原则,采用2对引物成功构建供试种质的DNA指纹图谱,为山药种质资源鉴定和品种选育亲本的选择提供理论依据。 展开更多
关键词 山药 种质资源 cpssr标记 DNA指纹图谱 遗传多样性
在线阅读 下载PDF
104个甘薯品种的cpSSR指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量:5
17
作者 王崇 王连军 +5 位作者 杨新笋 雷剑 柴沙沙 张文英 焦春海 田小海 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第6期1549-1556,共8页
基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,... 基于甘薯叶绿体基因组,利用cpSSR分子标记,对104份甘薯栽培品种和地方品种进行遗传多样性分析并构建指纹图谱,为甘薯资源的保护鉴定和遗传改良提供参考。使用了11对cpSSR引物,在104个甘薯材料中总共扩增得到58条条带,多态性条带为47条,单条引物平均扩增的条带数为5.27,平均多态性百分率为81.03%。根据引物在甘薯材料中的扩增结果,构建104个甘薯品种的指纹图谱。对104个甘薯品种的扩增结果进行聚类分析,每个品种间的遗传距离为0.0386~5.2723,平均遗传距离为0.2201,在遗传系数为0.74时将104个甘薯品种分为5组。 展开更多
关键词 甘薯 cpssr分子标记 遗传多样性 指纹图谱
在线阅读 下载PDF
濒危植物对节白蜡遗传多样性的cpSSR分析 被引量:9
18
作者 郑鹏丽 程建如 周明芹 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2020年第7期1399-1403,共5页
【目的】为探讨对节白蜡自然资源的濒危机制,为其野生资源的保护提供依据。【方法】利用cpSSR分子标记,对我国特有的珍稀濒危保护植物对节白蜡10个自然居群196个个体进行遗传多样性研究,并构建其UPGMA聚类图。【结果】6对cpSSR引物扩增... 【目的】为探讨对节白蜡自然资源的濒危机制,为其野生资源的保护提供依据。【方法】利用cpSSR分子标记,对我国特有的珍稀濒危保护植物对节白蜡10个自然居群196个个体进行遗传多样性研究,并构建其UPGMA聚类图。【结果】6对cpSSR引物扩增出了30条多态性带,居群的遗传多样性(多态性位点百分率:PPL=25.75%,Nei’s基因多样性指数:h=0.0974,香农信息指数:I=0.1440,等位基因数:Na=1.2575,有效等位基因数:Ne=1.1712)低于其在物种水平上的多样性(PPL=75.00%,h=0.1720,I=0.22732,Na=1.7500,Ne=1.2756)。居群间遗传分化系数(Gst)为0.4187,基因流(Nm)为0.6942,遗传距离范围0.0329~0.1569,根据遗传一致度(0.8548~0.9676),10个自然居群聚成4个大类。【结论】对节白蜡总遗传多样性处于中等水平,遗传变异主要发生在居群内(58.11%),因此,保护对节白蜡天然种群应重点保护遗传多样性丰富的居群。 展开更多
关键词 对节白蜡 cpssr 天然居群 遗传多样性 UPGMA
在线阅读 下载PDF
猕猴桃属植物的cpSSR遗传多样性及其同域分布物种的杂交渐渗与同塑 被引量:33
19
作者 张田 李作洲 +2 位作者 刘亚令 姜正旺 黄宏文 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期1-22,共22页
同域分布的近缘物种常常发生杂交而导致种间基因渐渗,从而对相关物种的自然居群遗传结构产生重要影响,近缘种间的杂交渐渗已成为进化生物学和保护生物学关注的热点。本研究采用8对cpSSR引物对我国西部高原台地向中东部丘陵平原过渡地带... 同域分布的近缘物种常常发生杂交而导致种间基因渐渗,从而对相关物种的自然居群遗传结构产生重要影响,近缘种间的杂交渐渗已成为进化生物学和保护生物学关注的热点。本研究采用8对cpSSR引物对我国西部高原台地向中东部丘陵平原过渡地带同域重叠分布的猕猴桃属(Actinidia)7个物种的自然居群遗传多样性、居群遗传结构和同域分布种间遗传分化进行了检测。结果表明:(1)在6个多态性位点检测到18个等位基因形成的42个单倍型,尽管各单倍型间显示了复杂的网状进化关系,但还是具有明显的物种特异性;(2)各物种有丰富的cpSSR遗传多样性,但种间存在较大差异,绵毛猕猴桃(Actinidia fulvicoma var.lanata)的遗传多样性水平最高(P=62.50%,hT=0.173,HT=0.897),美味猕猴桃(A.deliciosa)的最低(P=37.5%,hT=0.041,HT=0.516);(3)尽管不同物种的居群分化程度存在较大差异,但种内居群间存在明显分化(GST为0.319-0.780,FST为0.401-0.695),居群间的基因流不足(Nm为0.219-0.747<1);其中以美味猕猴桃的居群遗传分化度最高(GST=0.780,FST=0.695);(4)遗传分化系数GST(unordered alleles)与NST(ordered alleles)无显著差异,揭示本研究的大多数猕猴桃属物种不存在系统地理结构,与用Mantel检验得出的居群遗传距离和地理距离不存在显著性相关的结果一致;(5)除了中华/美味猕猴桃复合体(A.chinensis/A.deliciosa complex)的湖北五峰(HW)和广西资源(GZ)两个同域复合居群外,同域分布的物种间遗传分化强烈(FST为0.476-0.990),与UPGMA聚类时多数居群按各自物种聚类的结果一致。进一步分析表明,中华/美味猕猴桃复合体近缘种间存在明显的共祖多态性和杂交渐渗现象,近缘种植株分布的交错程度以及是否存在亚居群结构对杂交渐渗存在着重要影响。亲缘关系较远的物种间杂交渐渗事件稀少,但存在个别同塑事件。本研究结果有助于进一步了解猕猴桃属植物自然居群cpDNA的遗传特性和渐渗杂交进化模式,为我国猕猴桃野生种质资源保育及可持续开发利用提供基础数据和科学依据。 展开更多
关键词 猕猴桃 叶绿体SSR 基因渐渗 遗传多样性 遗传结构 共祖多态性 同塑效应
在线阅读 下载PDF
黄花瑞香狼毒cpSSR序列特征分析 被引量:2
20
作者 梁程博 刘道鑫 +2 位作者 陈前 谢久祥 闫京艳 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第13期4434-4440,共7页
黄花瑞香狼毒具备作为观赏植物和药用植物的开发价值。为获得黄花瑞香狼毒叶绿体微卫星序列特征,本研究对获得的黄花瑞香狼毒叶绿体基因组进行测序,通过软件MISA v1.0检测到315个SSR位点,平均每550 bp出现一个SSR位点。cpSSR主要分布于... 黄花瑞香狼毒具备作为观赏植物和药用植物的开发价值。为获得黄花瑞香狼毒叶绿体微卫星序列特征,本研究对获得的黄花瑞香狼毒叶绿体基因组进行测序,通过软件MISA v1.0检测到315个SSR位点,平均每550 bp出现一个SSR位点。cpSSR主要分布于大单拷贝区,主要由A、T碱基组成。核心重复区主要为单碱基重复序列,占重复序列总数的74.92%。有14个cpSSR的长度≥20 bp,其具有较高的多态性潜能,在对黄花瑞香狼毒的研究中可能有较高的利用价值。对黄花瑞香狼毒cpSSR进行分析,可为黄花瑞香狼毒种质资源鉴定和分子标记辅助育种提供标记信息。 展开更多
关键词 黄花瑞香狼毒 叶绿体基因组 cpssr
原文传递
上一页 1 2 3 下一页 到第
使用帮助 返回顶部