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湖南省怀化地区白纹伊蚊核糖体18S rRNA和线粒体cox 1基因的序列测定及分析 被引量:16
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作者 李中波 侯强红 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第8期2736-2745,共10页
为探究湖南省怀化地区白纹伊蚊的基因变异、遗传多样性及其遗传进化关系,本试验以收集于怀化地区的30只白纹伊蚊为研究对象,利用PCR技术扩增其核糖体18S rRNA及细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因序列,并对其基因变异、遗传多样性及遗传... 为探究湖南省怀化地区白纹伊蚊的基因变异、遗传多样性及其遗传进化关系,本试验以收集于怀化地区的30只白纹伊蚊为研究对象,利用PCR技术扩增其核糖体18S rRNA及细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(cox1)基因序列,并对其基因变异、遗传多样性及遗传进化关系进行分析。结果显示,所获全部样品的18S rRNA和cox 1基因序列长度均为489和1004 bp;基于18S rRNA基因序列,怀化地区白纹伊蚊的种内差异为0~2.9%,种间差异为28.74%~61.46%;基于cox 1基因序列,怀化地区白纹伊蚊的种内差异为0~0.2%,种间差异为6.08%~12.65%。基于18S rRNA、cox 1基因序列所构建的进化树发现,来自于怀化市的白纹伊蚊全部位于同一分支上。结果表明,怀化地区白纹伊蚊之间存在一定程度的基因变异和遗传多样性,但它们之间的亲缘关系较近,且其18S rRNA、cox 1基因序列的种内差异小、种间差异大,可作为白纹伊蚊鉴定的理想遗传标记。 展开更多
关键词 白纹伊蚊 18S rRNA cox 1基因 遗传多样性 生物进化
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湖南娄底市犬弓首蛔虫流行状况及线粒体cox 1和nad 4序列变异分析 被引量:4
2
作者 王先坤 李静 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2022年第4期40-44,共5页
为了解湖南省娄底市犬弓首蛔虫流行状况及虫株遗传变异情况,本试验于2021年3—9月对该地区368份犬粪便和104份环境(土壤和水源)样品的犬弓首蛔虫污染情况进行调查;对9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列进行扩增、测序与分析。... 为了解湖南省娄底市犬弓首蛔虫流行状况及虫株遗传变异情况,本试验于2021年3—9月对该地区368份犬粪便和104份环境(土壤和水源)样品的犬弓首蛔虫污染情况进行调查;对9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列进行扩增、测序与分析。结果显示:被调查的犬粪便和环境样品的犬弓首蛔虫虫卵检出率分别为13.59%(50/368)和18.27%(19/104);其中宠物犬(11.74%)较流浪犬(17.36%)来源粪便样品检出率低,公园来源土壤样品(9.09%)较小区来源样品(3.92%)检出率高;9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列长度分别为424 bp和1197 bp,核苷酸序列同源性为99.4%~100.0%和98.7%~100.0%,与其他具有代表性蛔虫分离株对应序列同源性均低于90%;9个犬弓首蛔虫分离株线粒体cox 1和nad 4序列核苷酸多样性分别为0.007±0.002和0.006±0.003。结果表明湖南娄底市犬弓首蛔虫分离株遗传变异较低,但虫卵流行状况严重,且存在于公共环境中,对人类健康造成潜在威胁。 展开更多
关键词 犬弓首蛔虫 流行情况 线粒体cox 1和nad 4 遗传变异
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基于SSU rDNA和线粒体cox 1序列分析甲藻中不同生态类群的演化规律
3
作者 唐晨 董丽 +6 位作者 饶涛 贾睿 于克锋 吴维宁 王金辉 徐韧 何培民 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期577-585,共9页
应用SSU rDNA和线粒体cox 1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系。通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox 1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的相关序列,以Plasmodium falciparum为外群,构建ML树和NJ树,... 应用SSU rDNA和线粒体cox 1序列研究甲藻(Dinoflagellate)中不同生态类群的演化关系。通过PCR扩增和测序获取4株甲藻SSU rDNA及其线粒体cox 1部分片段,结合GenBank中24株甲藻的相关序列,以Plasmodium falciparum为外群,构建ML树和NJ树,并采用自展支持度评估进化树分支结构,通过计算后验概率评估进化树整体结构,应用1sKH、SH、ELW和2sKH等方法评估两株ML树间的拓扑结构。结果显示,在由上述两序列构建的进化树上,底栖原甲藻均未与浮游原甲藻聚类,且前沟藻具有独特演化地位。表明联合选择SSU rDNA和线粒体cox 1序列构建的进化树在一定程度上能够反映出甲藻的演化规律。这为从基因层面深入探索甲藻中不同生态类群的演化关系初步奠定了基础。 展开更多
关键词 浮游型甲藻 底栖型甲藻 利玛原甲藻 强壮前沟藻 SSU rDNA cox1
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Evidence for using a dual COX 1/2 and 5-LOX inhibitor in neurodegenerative diseases
4
作者 Natasha Irrera Alessandra Bitto 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2017年第7期1077-1078,共2页
A complex network of factors contributes to neuroinflammation,such as infections,brain injuries and accumulation of toxic metabolites(Gendelman,2002).Eicosanoids and several cytokines are the main mediators of infla... A complex network of factors contributes to neuroinflammation,such as infections,brain injuries and accumulation of toxic metabolites(Gendelman,2002).Eicosanoids and several cytokines are the main mediators of inflammatory process;in fact,when an inflammatory condition persists,it can be responsible for the progression of degenerative diseases, 展开更多
关键词 cox LOX in Evidence for using a dual cox 1/2 and 5-LOX inhibitor in neurodegenerative diseases for
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陕西省榆林地区鸡异刺线虫的流行情况调查及其核糖体ITS区、线粒体cox1基因的序列分析 被引量:2
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作者 郑星星 李中波 尹会方 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第3期84-92,101,共10页
为了解陕西省榆林地区鸡异刺线虫的流行情况及其核糖体ITS区、线粒体cox1基因序列进化特征,试验于2022年4—10月份采集榆林市榆阳区、横山区、佳县、米脂县、靖边县、定边县和神木县7个区(县)养鸡场的新鲜鸡粪样本536份(笼养鸡和放养鸡... 为了解陕西省榆林地区鸡异刺线虫的流行情况及其核糖体ITS区、线粒体cox1基因序列进化特征,试验于2022年4—10月份采集榆林市榆阳区、横山区、佳县、米脂县、靖边县、定边县和神木县7个区(县)养鸡场的新鲜鸡粪样本536份(笼养鸡和放养鸡粪便各268份),采用饱和盐水漂浮法富集虫卵,并通过形态学检测鸡异刺线虫虫卵,统计不同区(县)笼养鸡和放养鸡粪便鸡异刺线虫阳性样本数量和阳性率;每个区(县)随机挑选出5只粪检呈鸡异刺线虫阳性的放养鸡(编号为YLHG1~YLHG35),取盲肠内容物提取基因组DNA后对鸡异刺线虫核糖体ITS区、线粒体cox1基因进行PCR扩增与测序,分析核糖体ITS区、线粒体cox1基因序列的碱基组成与遗传差异性,并分别基于鸡异刺线虫核糖体ITS区、线粒体cox1基因构建系统发育树以分析榆林地区鸡异刺线虫的系统发育关系。结果表明:检测到的鸡异刺线虫虫卵外观整体呈淡灰褐色、长椭圆形、轮廓清晰,卵壳光滑且分为明显的内外两层,内含单个尚未分裂的胚细胞;536份新鲜鸡粪样本中共有300份样本检出鸡异刺线虫虫卵,总阳性率为55.97%。其中55份来自笼养鸡,阳性率为20.52%;245份来自放养鸡,阳性率为91.42%。榆林市7个区(县)鸡异刺线虫总阳性率由高到低依次为靖边县(64.10%)、定边县(63.41%)、神木县(57.89%)、佳县(55.81%)、米脂县(51.14%)、横山区(50.0%)、榆阳区(46.77%),笼养鸡阳性率由高到低依次为定边县(31.71%)、靖边县(30.77%)、神木县(23.68%)、佳县(18.60%)、米脂县(15.91%)、榆阳区(9.68%)、横山区(9.38%),放养鸡阳性率由高到低依次为靖边县(97.44%)、定边县(95.12%)、佳县(93.02%)、神木县(92.10%)、横山区(90.62%)、米脂县(86.36%)、榆阳区(83.87%)。PCR扩增出鸡异刺线虫的核糖体ITS区、线粒体cox1基因大小分别为969 bp和1325 bp。鸡异刺线虫核糖体ITS区基因序列碱基A、T、G、C含量百分比分别为24.6%~25.3%、30.5%~31.5%、24.6%~25.8%和18.6%~19.1%,其中A+T的含量为55.1%~56.8%,G+C的含量为43.2%~44.9%,呈现明显的AT偏好性;鸡异刺线虫线粒体cox1基因序列碱基A、T、G、C含量分别为23.4%~23.5%、42.9%~43.3%、21.2%~21.4%和11.9%~12.4%,其中A+T的含量为66.3%~66.8%,G+C的含量为33.1%~33.8%,呈现明显的AT偏好性。鸡异刺线虫核糖体ITS区基因序列种内差异为0~3.8%,种间差异为20.4%~31.0%;线粒体cox1基因序列种内差异为0~0.9%,种间差异为8.6%~14.6%。基于鸡异刺线虫核糖体ITS区基因构建的系统发育树分为3个分支(分支Ⅰ~Ⅲ)。分支Ⅰ由达荷美异刺线虫(JX845277)、泡状异刺线虫(LC389877)和等矛异刺线虫(KM212953)共同聚类而成;分支Ⅱ由贝拉异刺线虫(LC592733)与印度异刺线虫(LC592806)共同聚类而成;分支Ⅲ由本研究获得的35株鸡异刺线虫(YLHG1~YLHG35)与鸡异刺线虫虫株MPM(LC777441)、HJL10F(LC592784)、HHL19F(LC592776)共同聚类而成,其中鸡异刺线虫虫株YLHG1、MPM(LC777441)、YLHG32~YLHG35聚类成第1个小分支,虫株YLHG30与YLHG31聚类成第2个小分支,其余鸡异刺线虫虫株聚类成第3个小分支。基于鸡异刺线虫线粒体cox1基因构建的系统发育树分为2个分支(分支Ⅰ、Ⅱ)。分支Ⅰ由贝拉异刺线虫(KU529972)、印度异刺线虫(LC592869)与异形异刺线虫(MK024389)共同聚类而成,分支Ⅱ由本研究获得的35株鸡异刺线虫(YLHG1~YLHG35)与鸡异刺线虫虫株YA1(KP308308)、XC1(KP308317)、MY1(KP308325)共同聚类而成。说明陕西省榆林地区鸡群感染鸡异刺线虫情况较为普遍,且7个区(县)鸡群感染的虫株之间存在一定程度的遗传差异性。 展开更多
关键词 鸡异刺线虫 核糖体ITS区基因 线粒体cox1基因 序列特征 基因变异 遗传多样性 系统发育关系
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基于D-loop区和cox1基因序列的江西9个地区草鱼养殖群体遗传多样性分析 被引量:1
6
作者 侯佳浩 刘文玉 +7 位作者 吴春林 张明辉 李琳洁 王子予 黄培荧 范洪祥 简少卿 赵大显 《南昌大学学报(理科版)》 2025年第2期198-207,共10页
为评估江西省草鱼(Ctenopharyngodon idellus)养殖群体的种质资源现状,本研究采用线粒体D-loop区(309 bp)与细胞色素C氧化酶I(cox1)基因(527 bp)部分序列,对江西省9个草鱼繁育场(新干XG、吉安JA、峡江XJ、大余DY、宁都ND、瑞昌RC、上栗S... 为评估江西省草鱼(Ctenopharyngodon idellus)养殖群体的种质资源现状,本研究采用线粒体D-loop区(309 bp)与细胞色素C氧化酶I(cox1)基因(527 bp)部分序列,对江西省9个草鱼繁育场(新干XG、吉安JA、峡江XJ、大余DY、宁都ND、瑞昌RC、上栗SL、万载WZ、南昌NC)草鱼养殖群体进行遗传多样性分析。结果显示:D-loop区检测到225个多态性位点,分离出27个单倍型;cox1基因检测到73个多态性位点,分离出9个单倍型。两个标记的遗传多样性参数均处于较低水平:D-loop区单倍型多样性(Hd)0.067~0.515,核苷酸多样性(π)0.00012~0.03138,cox1基因Hd=0~0.331,π=0~0.00797。群体结构分析表明,群体间发生了不同程度的分化。遗传分化系数:D-loop区0~0.04783、cox1基因0~0.18190。分子方差分析(AMOVA)表明遗传变异主要源于群体内(D-loop区98.82%,cox1基因97.87%)。单倍型网络图与邻接法系统发育树均未呈现地理聚类特征,表明江西9个地区草鱼养殖群体遗传多样性较低,群体间分化匮乏。本研究中9个地区草鱼养殖群体遗传多样性背景,可以为江西草鱼种质资源保护与利用提供参考依据。 展开更多
关键词 草鱼 D-LOOP区 cox1基因 遗传多样性
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基于COX1和ITS-2基因的市售猫犬的肝吸虫感染调查分析
7
作者 黄玉碧 蒋智华 +4 位作者 唐雯茜 韦尧宝 吕国丽 胡莉萍 方钟燎 《医学动物防制》 2025年第8期778-783,共6页
目的探索广西壮族自治区市售猫犬感染的肝吸虫虫种及其遗传进化特征,进一步了解广西壮族自治区肝吸虫分子流行情况,为肝吸虫病的防控提供科学依据。方法2022年12月至2024年1月从广西壮族自治区不同方位收集猫、犬的肝脏,收集肝吸虫成虫... 目的探索广西壮族自治区市售猫犬感染的肝吸虫虫种及其遗传进化特征,进一步了解广西壮族自治区肝吸虫分子流行情况,为肝吸虫病的防控提供科学依据。方法2022年12月至2024年1月从广西壮族自治区不同方位收集猫、犬的肝脏,收集肝吸虫成虫样本,提取成虫DNA,PCR扩增COX1基因和ITS-2基因并测序。采用BioEdit测序结果进行分析,与GenBanK数据库基因比对,采用最大似然法构建基于COX1和ITS-2基因序列的系统进化树。结果不同县市共收集44份狗肝样本,55份猫肝样本,狗肝未发现肝吸虫感染,猫肝肝吸虫成虫感染率为23.6%。COX1和ITS-2基因的PCR扩增产物长度分别约为328bp和366bp。基于COX1和ITS-2基因序列构建系统进化树,结果显示,这些序列均与华支睾吸虫聚为一支,基于COX1基因序列构建的进化树显示,其与越南、广西壮族自治区、广东省分离株的亲缘关系较近,基于ITS-2基因序列构建的进化树与越南分离株和广西壮族自治区南宁市分离株亲缘关系较近。结论广西壮族自治区猫间所流行的肝吸虫虫种为华支睾吸虫,在人群华支睾吸虫感染率低的地区也有华支睾吸虫感染,其基因序列主要与越南分离株亲缘关系较近。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 保虫宿主 PCR cox1基因 ITS-2基因 调查 分析
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基于mt Cytb、COX1与D⁃Loop基因的骨唇黄河鱼遗传多样性与系统发育分析
8
作者 刘珏巧 王廷宽 +5 位作者 张明盩 刘哲 权金强 张佳慧 邓倩 卢军浩 《甘肃农业大学学报》 北大核心 2025年第5期24-37,共14页
【目的】掌握骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)其野生种质资源现状,了解其系统发育关系和进化状况。【方法】对野外采样的106尾骨唇黄河鱼进行mt DNA Cytb,COX1和D-Loop基因多样性对比。【结果】结果表明9个裂腹鱼亚科群体系统发育进化树... 【目的】掌握骨唇黄河鱼(Chuanchia labiosa)其野生种质资源现状,了解其系统发育关系和进化状况。【方法】对野外采样的106尾骨唇黄河鱼进行mt DNA Cytb,COX1和D-Loop基因多样性对比。【结果】结果表明9个裂腹鱼亚科群体系统发育进化树分为3大支,Network与系统发育树结果基本一致。骨唇黄河鱼Tajima’sD和Fu’sFs检验及错配分布分析均表明其经历过种群扩张,不同种群分离的时间可能与青藏高原地质运动有关。【结论】骨唇黄河鱼的遗传多样性相对较低,呈高单倍型多样度和低核苷酸多样度的特点。 展开更多
关键词 遗传多样性 骨唇黄河鱼 CYTB基因 cox1基因 D-Loop基因
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LncRNA SNHG15通过miR-30b-3p调控COX6B1轴促进肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的分子机制 被引量:2
9
作者 龚秀莹 侯顺福 +5 位作者 赵苗苗 王晓娜 张致涵 刘清华 尹崇高 李洪利 《南方医科大学学报》 北大核心 2025年第7期1498-1505,共8页
目的探索LncRNA SNHG15是否可以与COX6B1竞争性结合miR-30b-3p调控肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。方法利用LncRNAs微阵列芯片数据集GSE196584和LncBase预测与miR-30b-3p互用的LncRNA。通过在线数据库查询其与患者预后的关系及其表达量,... 目的探索LncRNA SNHG15是否可以与COX6B1竞争性结合miR-30b-3p调控肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。方法利用LncRNAs微阵列芯片数据集GSE196584和LncBase预测与miR-30b-3p互用的LncRNA。通过在线数据库查询其与患者预后的关系及其表达量,筛选出长链非编码RNA(LncRNA)核仁RNA宿主基因15(SNHG15)作为接下来的研究对象。FISH检测LncRNA SNHG15的亚细胞定位。使用qRT-PCR检测LncRNA SNHG15在人正常肺上皮细胞和肺腺癌细胞系中的表达水平;将A549细胞分为4组并共转染:sh-NC+miR-NC组(空载质粒+miR-30b-3p对照质粒共转染)、sh-SNHG15+miR-NC组(SNHG15敲低质粒+miR-30b-3p对照质粒共转染)、sh-NC+miR-30b-3p-inhibitor组(空载质粒+miR-30b-3p抑制质粒共转染)、sh-SNHG15+miR-30b-3p-inhibitor组(SNHG15敲低质粒+miR-30b-3p抑制质粒共转染),通过EdU、伤口愈合及Transwell实验检测细胞增殖、迁移与侵袭能力。使用生物信息学数据库预测LncRNA SNHG15与COX6B1的调控关系,Western Blot实验验证敲低LncRNA SNHG15后,COX6B1的表达水平。进一步开展SNHG15与COX6B1的挽救实验,将A549细胞分为4组共转染:sh-NC+CON组(SNHG15对照质粒+COX6B1空载质粒共转染)、sh-SNHG15+oe-CON组(SNHG15敲低质粒+COX6B1空载质粒共转染)、sh-NC+oe-COX6B1组(SNHG15对照质粒+COX6B1过表达质粒共转染)、sh-SNHG15+oe-COX6B1组(SNHG15敲低质粒+COX6B1过表达质粒共转染),进行EdU实验、伤口愈合实验、Transwell实验检测各组A549细胞增殖、迁移、侵袭能力的变化。结果LncRNA SNHG15与miR-30b-3p存在靶向关系。LncRNA SNHG15高表达与肺腺癌患者不良预后有关且在肺腺癌组织中高表达。LncRNA SNHG15主要定位在细胞质。LncRNA SNHG15在A549、NCI-H1299细胞中的表达高于在BEAS-2B中的表达(P<0.05)。下调miR-30b-3p可以逆转敲低LncRNA SNHG15导致的A549细胞增殖、迁移和侵袭能力的减弱(P<0.05)。LncRNA SNHG15和COX6B1存在调控关系且呈正相关(r=0.128,P=0.003)。Western blotting实验证实敲低LncRNA SNHG15可以使COX6B1的表达水平下降(P<0.05)。过表达COX6B1可以挽救下调LncRNA SNHG15导致的A549细胞迁移,侵袭和增殖能力的下降(P<0.05)。结论LncRNA SNHG15可能通过ceRNA机制与COX6B1竞争性结合miR-30b-3p,从而进一步影响肺腺癌的增殖、迁移、侵袭。 展开更多
关键词 肺腺癌 LncRNA SNHG15 miR-30b-3p cox6B1 迁移 侵袭
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北京警用犬眼结膜吸吮线虫的分离鉴定与cox1基因序列分析
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作者 易婷婷 马文宇 +7 位作者 赵子涵 范梦雨 张攀 戈欣媛 陈晓晓 杜孟泽 李秋明 尹德琦 《北京农学院学报》 2025年第3期34-38,共5页
【目的】旨在找寻犬结膜吸吮线虫病的诊断和干预方法。【方法】采集4只感染犬的眼线虫样本进行形态学观察,对其线粒体cox1基因进行PCR扩增和测序,并构建系统发育树。【结果】通过形态学观察可初步判定符合结膜吸吮线虫形态学特征;cox1... 【目的】旨在找寻犬结膜吸吮线虫病的诊断和干预方法。【方法】采集4只感染犬的眼线虫样本进行形态学观察,对其线粒体cox1基因进行PCR扩增和测序,并构建系统发育树。【结果】通过形态学观察可初步判定符合结膜吸吮线虫形态学特征;cox1基因序列扩增长度均为663 bp,各虫株之间序列相似度为96.5%~99.1%,未发现明显遗传变异;4只犬分离到的虫体与结膜吸吮线虫位于同一大分支,且与河南、陕西等地区的虫株亲缘关系较近,而与湖北、安徽等地区的虫株亲缘关系则相对较远,存在地区遗传差异。【结论】研究成功鉴定出感染4例犬的眼线虫为结膜吸吮线虫,这一发现为北京警用犬的眼线虫病的防控提供了数据支撑。 展开更多
关键词 结膜吸吮线虫 分离鉴定 cox1基因
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血清COX-2、Apelin、IGF-1与妊娠期甲状腺功能减退症患者母婴结局关系研究 被引量:1
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作者 汤路路 李明 徐燕 《陕西医学杂志》 2025年第8期1113-1117,1123,共6页
目的:探讨妊娠期甲状腺功能减退症患者血清环氧合酶-2(COX-2)、Apelin、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)水平变化及其与母婴结局的关系。方法:选取妊娠期甲状腺功能减退症患者320例为观察组。另选取同期产检健康孕妇320例为对照组。比较两组... 目的:探讨妊娠期甲状腺功能减退症患者血清环氧合酶-2(COX-2)、Apelin、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)水平变化及其与母婴结局的关系。方法:选取妊娠期甲状腺功能减退症患者320例为观察组。另选取同期产检健康孕妇320例为对照组。比较两组血清COX-2、Apelin、IGF-1水平,采用Pearson法分析血清COX-2、Apelin、IGF-1水平与患者甲状腺功能指标的相关性。记录并比较两组孕妇不良母婴结局发生情况,且根据母婴结局将观察组分为母婴结局不良组(111例)和母婴结局良好组(209例)。比较不同母婴结局患者临床资料,采用二元Logistic回归分析妊娠期甲状腺功能减退症患者发生母婴不良结局的影响因素。结果:观察组血清COX-2、Apelin水平高于对照组,IGF-1水平低于对照组(均P<0.05)。血清COX-2、Apelin与TSH水平呈正相关,与游离三碘甲状腺原氨酸(FT_(3))、游离甲状腺素(FT_(4))水平呈负相关(均P<0.05)。血清IGF-1与促甲状腺激素(TSH)水平呈负相关,与FT_(3)、FT_(4)水平呈正相关(均P<0.05)。观察组宫内发育迟缓、低出生体重儿及胎儿窘迫发生率高于对照组,且母婴不良结局总发生率高于对照组(均P<0.05)。母婴结局不良组患者有不良妊娠史、焦虑抑郁、甲状腺过氧化物酶抗体(TPOAb)阳性比例及血清COX-2、Apelin、TSH水平高于母婴良好组,血清IGF-1、FT_(4)水平低于母婴结局良好组(均P<0.05)。不良妊娠史、焦虑抑郁、TPOAb阳性及血清COX-2、Apelin、IGF-1、FT_(4)、TSH为妊娠期甲状腺功能减退症患者发生母婴不良结局的独立影响因素(均P<0.05)。结论:妊娠期甲状腺功能减退症患者血清COX-2、Apelin水平升高,IGF-1水平降低,三者与母婴结局有关,是患者发生母婴不良结局的影响因素。 展开更多
关键词 妊娠期甲状腺功能减退症 环氧合酶-2 APELIN 胰岛素样生长因子-1 母婴结局
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基于线粒体基因cox1的中国近海褐斑鲬遗传多样性研究 被引量:4
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作者 黄志基 章群 +2 位作者 杨喜书 罗纯 张玉宁 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2021年第3期257-266,共10页
为了解中国近海褐斑鲬(Platycephalus sp.1)遗传多样性和种群遗传结构,提出合理的种质资源保护建议,分析了中国近海褐斑鲬7个群体155个个体的细胞色素C氧化酶cox 15′端652 bp序列,结果共检测到28个变异位点,定义28个单倍型。中国近海... 为了解中国近海褐斑鲬(Platycephalus sp.1)遗传多样性和种群遗传结构,提出合理的种质资源保护建议,分析了中国近海褐斑鲬7个群体155个个体的细胞色素C氧化酶cox 15′端652 bp序列,结果共检测到28个变异位点,定义28个单倍型。中国近海褐斑鲬总体属于低单倍型多样性(0.428)、低核苷酸多样性(0.00102)类型。其中,单倍型多样性防城港群体最高(0.864),连云港群体次之(0.489),福州群体最低(0.298);核苷酸多样性防城港群体最高(0.00302),大连群体次之(0.00124),南通群体最低(0.00061)。群体间遗传分化系数F st为-0.02127~0.18929,其中,广西防城港群体与其余群体间F st为0.08861~0.18929(P<0.05),表明琼州海峡两侧群体存在一定程度的遗传分化;AMOVA分析也显示琼州海峡两侧群体间分子差异占据了全部差异来源的24.19%。推测其成因,一方面是琼州海峡削弱了两侧群体间通过海流流动带来的基因交流;另一方面,琼州海峡以东群体在海洋环流系统和鱼类生殖洄游作用下更加趋向同质化。防城港群体中性检验结果均为负值(D=-1.024,P=0.152;F s=-2.60,P=0.015),表明种群可能发生过种群扩张;琼州海峡东侧群体中性检验为极显著负值(D=-2.468,P=0.000;F s=-34.02,P=0.000),Bayesian skyline plot出现拐点,说明发生了扩张事件,扩张时间约为2.5万年前。推测褐斑鲬祖先群体在末次间冰期扩张,在末次冰期则回归避难所,在末次冰期后期伴随着海平面上升扩张到中国近海海域。基于中国近海褐斑鲬的遗传结构,建议将琼州海峡两侧群体分别作为独立管理单元,因地制宜,合理管理、保护和开发。其中,防城港群体遗传多样性最高,建议优先保护以便利用;大连群体是琼州海峡东侧群组中核苷酸多样性最高的群体,也应重点保护;南通群体核苷酸多样性最低,应采取措施避免其遗传多样性进一步下降。 展开更多
关键词 褐斑鲬 中国近海 遗传多样性 cox 1基因 种群遗传结构
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基于线粒体cox1和Cyt b基因对四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性研究 被引量:23
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作者 郝桂英 杨应东 +1 位作者 周英姿 杨光友 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期631-638,共8页
为研究四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性和系统发生关系,用线粒体cox1基因和Cyt b基因全序列分析了20株四川山羊源多头蚴(11株寄生于脑,9株寄生于肌间)的遗传变异,并构建了系统发育树。结果显示:20株多头蚴cox1和Cyt b基因全序列长... 为研究四川地区多头带绦虫的种群遗传多样性和系统发生关系,用线粒体cox1基因和Cyt b基因全序列分析了20株四川山羊源多头蚴(11株寄生于脑,9株寄生于肌间)的遗传变异,并构建了系统发育树。结果显示:20株多头蚴cox1和Cyt b基因全序列长度分别为1 623和1 068bp,分别有59个和9个变异位点,其碱基变异率分别为0.1%~2.5%和0.1%~0.7%;分别检测到17个和6个单倍型,总的单倍型多样性分别为0.968±0.033和0.737±0.068,核苷酸多样性分别为0.005 98±0.001 33和0.003 06±0.000 79,平均遗传距离分别为0.006和0.003。构建的系统进化树均显示来源于脑部和肌间的20株四川山羊源多头蚴与多头带绦虫同在一个支系,均为多头带绦虫,且多头带绦虫四川分离株与伊朗、土耳其分离株亲缘关系较近,而与中国甘肃、中国广州、意大利分离株亲缘关系较远。研究结果表明线粒体cox1和Cyt b基因均可作为检测多头带绦虫种群遗传多样性的有效分子标记,且Cyt b基因的多样性水平低于cox1基因。 展开更多
关键词 多头带绦虫 cox1基因 CYT B基因 遗传多样性 四川
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基于核糖体DNA ITS区和COX1基因鉴别华支睾吸虫囊蚴 被引量:14
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作者 杨庆利 申继清 +4 位作者 蒋智华 杨益超 李红梅 陈颖丹 周晓农 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期217-220,共4页
目的基于核糖体DNA ITS区和COX1基因,PCR鉴别鱼体内华支睾吸虫囊蚴。方法于2013年5月底采集广西横县某水库的麦穗鱼,用消化法从鱼肉组织中分离单个华支睾吸虫囊蚴及其他吸虫囊蚴;PCR检测华支睾吸虫核糖体DNA ITS区和COX1基因,并分析检... 目的基于核糖体DNA ITS区和COX1基因,PCR鉴别鱼体内华支睾吸虫囊蚴。方法于2013年5月底采集广西横县某水库的麦穗鱼,用消化法从鱼肉组织中分离单个华支睾吸虫囊蚴及其他吸虫囊蚴;PCR检测华支睾吸虫核糖体DNA ITS区和COX1基因,并分析检测的灵敏性和特异性。结果分离到不同发育阶段的华支睾吸虫囊蚴并经PCR检测证实。用针对核糖体DNA ITS区和COX1基因的PCR均能检测到单个华支睾吸虫囊蚴DNA,其特异性扩增条带大小分别为437/549、156/249和195/166 bp。用核糖体DNA ITS1和ITS2区的通用引物和特异性引物扩增华支睾吸虫囊蚴DNA的阳性数之比分别为0.905和0.952。针对COX1基因的特异性扩增均检测到目标DNA,并且扩增条带较亮。用该方法对其他吸虫囊蚴检测的对比试验显示特异性引物均未出现任何非特异性扩增反应;用ITS区通用引物检测其他吸虫囊蚴则显示出严重的非特异性扩增反应。结论通过形态观察结合PCR法识别出了不同发育阶段的华支睾吸虫囊蚴。用华支睾吸虫核糖体DNA ITS区的特异性引物进行PCR检测的灵敏性和特异性均优于相应通用引物。针对COX1基因的特异性PCR检测的灵敏性和特异性与核糖体DNA ITS区的检测结果相当。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 囊蚴 ITS区 cox1基因 PCR
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湖南省鸡蛔虫线粒体cox1和nad1基因的序列测定及种系发育分析 被引量:16
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作者 伍慧兰 谭美英 +4 位作者 刘国华 李芬 徐平原 罗冬生 刘毅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1592-1597,共6页
本研究旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位l基因(nad1)部分序列(pnad1)的遗传变异情况,并用pcox1和pnad1序列构建鸡蛔虫与其它科蛔虫的种群遗... 本研究旨在阐明湖南省鸡蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位l基因(nad1)部分序列(pnad1)的遗传变异情况,并用pcox1和pnad1序列构建鸡蛔虫与其它科蛔虫的种群遗传关系。作者应用聚合酶链反应(PCR)扩增鸡蛔虫虫株的pcox1和pnad1,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,然后用Phylip3.67程序MP法和Mega4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树。所获得的pcox1和pnad1序列长度均为394和408bp,种系发育树表明,20个分离株鸡蛔虫位于同一分枝。由于鸡蛔虫pcox1和pnad1序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记。本研究系首次报道鸡蛔虫的pcox1和pnad1序列,从而为鸡蛔虫的分类鉴定以及进一步的分子流行病学调查和群体遗传研究奠定了基础。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 线粒体DNA cox1基因 nad1基因 种系发育关系
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湖南省猬迭宫绦虫的线粒体cox1和nad1基因的序列测定及种系发育分析 被引量:16
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作者 刘自逵 刘国华 +4 位作者 戴荣四 刘伟 李芬 胡涛 刘毅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期463-468,共6页
本研究旨在阐明猬迭宫绦虫湖南分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位l基因(nad1)部分序列(pnad1)的遗传变异情况,并用pcox1和pnad1序列重构猬迭宫绦虫与其它绦虫的种... 本研究旨在阐明猬迭宫绦虫湖南分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)脱氢酶亚单位l基因(nad1)部分序列(pnad1)的遗传变异情况,并用pcox1和pnad1序列重构猬迭宫绦虫与其它绦虫的种群遗传关系。利用聚合酶链反应(PCR)扩增猬迭宫绦虫的pcox1和pnad1,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,再用Phylip3.67程序MP法和Mage4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树,同时利用DNAStar5.0中的Megalign程序进行同源性分析。结果显示所获得各样品株的pcox1和pnad1序列长度一致,分别为396和566bp,湖南分离株与已知猬迭宫绦虫位于同一分枝。由于猬迭宫绦虫pcox1和pnad1序列种内相对保守,种间差异较大,故均可作为种间遗传变异研究的标记,从而为猬迭宫绦虫的种群体遗传学研究和其相关疾病的诊断奠定基础。 展开更多
关键词 猬迭宫绦虫 线粒体DNA cox1基因 nad1基因 种系发育关系
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我国片形吸虫(Fasciola)线粒体细胞色素c氧化酶亚基基因(cox1)部分序列的多态性 被引量:16
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作者 董世娟 黄维义 +4 位作者 林瑞庆 钱德兴 吴绍强 宋慧群 朱兴全 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期378-381,共4页
用33P对引物进行标记,对来自国内不同地区不同宿主的片形吸虫(Fasciola)的线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基基因(pcox1)部分序列进行PCR扩增及DNA单链构象多态性(SSCP)分析,结果76个虫体均成功地扩增出约450bp的基因片段;SSCP分析显示,... 用33P对引物进行标记,对来自国内不同地区不同宿主的片形吸虫(Fasciola)的线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基基因(pcox1)部分序列进行PCR扩增及DNA单链构象多态性(SSCP)分析,结果76个虫体均成功地扩增出约450bp的基因片段;SSCP分析显示,不同地区或同一地区的不同样品在pcox1的SSCP带型上存在多态性;代表性样品的测序结果表明,其碱基序列存在差异。试验结果显示,我国片形吸虫pcox1序列种内变异不明显,种间变异显著,表明cox1序列可以作为片形吸虫分类鉴定中一个可靠的遗传标记。 展开更多
关键词 片形吸虫 cox1 PCR-SSCP 多态性
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弓首蛔虫线粒体cox1基因的多态性研究 被引量:14
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作者 李明伟 林瑞庆 +4 位作者 邹丰才 宋慧群 曹湛 何芳 朱兴全 《中国兽医科技》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期386-390,共5页
应用PCR SSCP技术和DNA 序列分析对犬弓首蛔虫(Toxocara canis)线粒体DNA(mtDNA)中的细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)进行了分析研究,并与弓首属的猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫、牛弓首蛔虫及弓蛔属的狮弓蛔虫进行了... 应用PCR SSCP技术和DNA 序列分析对犬弓首蛔虫(Toxocara canis)线粒体DNA(mtDNA)中的细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)进行了分析研究,并与弓首属的猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫、牛弓首蛔虫及弓蛔属的狮弓蛔虫进行了种间比较。结果显示,犬弓首蛔虫种群内的pcox1 序列差异为2.72%,与马来西亚弓首蛔虫种群间的序列差异为11.38%,与猫弓首蛔虫种群间的序列差异为11. 20%,与牛弓首蛔虫种群间的序列差异为10.40%,与狮弓蛔虫种群间的序列差异为11.48%;马来西亚弓首蛔虫种群内的pcox1 序列差异为0.57%,与猫弓首蛔虫的序列差异为8.23%,与牛弓首蛔虫的序列差异为8.70%,与狮弓蛔虫的序列差异为10.60%。研究证实,犬弓首蛔虫不同地方虫株的pcox1 有一定差异,与同属其他种类及狮弓蛔虫的差异较大;马来西亚弓首蛔虫确为一独立种。 展开更多
关键词 弓首蛔虫 线粒体DNA cox1基因 PCR—SSCP
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基于线粒体cox1片段序列的胶州湾浮游动物DNA条形码分析 被引量:17
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作者 王敏晓 程方平 +1 位作者 李超伦 孙松 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期702-710,共9页
采用cox1基因特异扩增测序的方法,分析了胶州湾45种常见海洋动物的DNA条形码序列82条,联合GenBank中28条cox1序列的分析结果表明:种内个体间遗传差异均值为0.013(0—0.11);属内不同种间遗传差异均值为0.265(0.137—0.369),是种内遗传差... 采用cox1基因特异扩增测序的方法,分析了胶州湾45种常见海洋动物的DNA条形码序列82条,联合GenBank中28条cox1序列的分析结果表明:种内个体间遗传差异均值为0.013(0—0.11);属内不同种间遗传差异均值为0.265(0.137—0.369),是种内遗传差异的20多倍,条形码间隙明显。在分子系统树中,所有种类的不同个体都聚成一个单系枝;cox1序列遗传差异在科、属水平发生重叠,无法准确解析上述分类阶元的系统发育关系;但在更高分类阶元,cox1序列具有一定程度的解析能力。利用DNA条形码,本研究订正了中国近海多个桡足类的命名。以上结果表明,线粒体cox1基因可以作为DNA条形码实现浮游动物的准确鉴定。 展开更多
关键词 胶州湾 浮游动物 cox1基因 DNA条形码
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湖南长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体cox1基因的克隆及序列分析 被引量:17
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作者 刘国华 戴荣四 +4 位作者 赵光辉 林瑞庆 刘伟 刘毅 朱兴全 《热带医学杂志》 CAS 2009年第2期117-120,共4页
目的研究湖南省长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列重构泡状带绦虫与其他带科绦虫的种群遗传关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增泡状带绦虫虫株的pcox1,... 目的研究湖南省长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列重构泡状带绦虫与其他带科绦虫的种群遗传关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增泡状带绦虫虫株的pcox1,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,然后用Phylip3.67程序MP法和Mage4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树;同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析,并与GenBankTM中已知泡状带绦虫相应基因序列进行比较分析。结果所获得的pcox1序列长度一致,均为343bp,与GenBankTM公布的带科绦虫序列进行比较分析表明,湖南长沙分离株1和湘西分离株5与已知泡状带绦虫相应基因的相似性分别为99.4%和99.7%,与其它带科绦虫的相似性均小于90.0%;湖南长沙1和湘西分离株5与已知泡状带绦虫相应基因遗传距离分别为0.006和0.003,与其他带科绦虫的遗传距离均大于0.100。种系发育树表明,2个分离株与已知泡状带绦虫位于同一分枝,Bootstrap值在97%以上。结论由于泡状带绦虫pcox1序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,研究结果为进一步研究泡状带绦虫的群体遗传结构奠定了基础。 展开更多
关键词 泡状带绦虫 线粒体DNA cox1基因 种系发育关系
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