该文综述了中药复杂成分靶点鉴定的新方法及其应用研究进展,系统梳理了靶点鉴定的经典方法与前沿技术体系,涵盖蛋白质组学分析、荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技术、网络药理学预测模型、高通量生物...该文综述了中药复杂成分靶点鉴定的新方法及其应用研究进展,系统梳理了靶点鉴定的经典方法与前沿技术体系,涵盖蛋白质组学分析、荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技术、网络药理学预测模型、高通量生物芯片筛选、基于分子亲和垂钓的靶标捕获策略、基因定点突变验证以及靶蛋白共结晶结构解析等多元策略,强调了靶点鉴定在阐明中药作用机制、新药研发过程中的重要作用,为推动中药现代化发展奠定基础。展开更多
为了探讨复合物中分子间相互作用对单体分子动力学的影响,对CF3Cl-CO复合物中单体振动谱带基线平移进行了预测。首先,采用二阶多体微扰理论(M?ller-Plesset perturbation theory of second order, MP2)结合扩展相关一致性极化价三重ζ基...为了探讨复合物中分子间相互作用对单体分子动力学的影响,对CF3Cl-CO复合物中单体振动谱带基线平移进行了预测。首先,采用二阶多体微扰理论(M?ller-Plesset perturbation theory of second order, MP2)结合扩展相关一致性极化价三重ζ基组(augmented correlation-consistent polarized valence triple-zeta, Aug-cc-pVTZ)对该复合物的5种结构(S1′、S2、S3、S4、A)进行几何优化、频率计算;然后,引入键函数(3s3p2d1f),在包含单激发、双激发和微扰三激发的耦合簇(coupled cluster with single, double, and perturbative triple excitations, CCSD(T))方法结合Aug-cc-pVTZ的水平上计算稳定结构的分子间相互作用能,并对最稳定结构的单体谱带基线平移进行预测。结果表明,S1′为该复合物的最稳定结构,其分子间相互作用能为-3.81 kJ/mol,其能量分解中交换能占比最高为38%。此外,研究中发现了复合物的2个新的稳定结构S4、A,其分子间相互作用能分别为-2.68、-2.72 kJ/mol。单体谱带基线平移预测表明,在S1′结构中,相比于自由单体振动,复合物中CF3Cl单体的C-Cl键伸缩振动发生了红移,而CO的伸缩振动则表现为蓝移,这表明分子间卤键对分子内动力学存在显著影响。该研究结果为进一步实验测量CF3Cl-CO复合物光谱提供了理论参考。展开更多
The transition metal complexes with phosphido bridge have been widely used insynthesis of organometallic compounds. The NMR 31P chemical shift is useful in structureelucidation. The value of 31P shift ofter used as a ...The transition metal complexes with phosphido bridge have been widely used insynthesis of organometallic compounds. The NMR 31P chemical shift is useful in structureelucidation. The value of 31P shift ofter used as a structural probe for the presence orabsence of metal-metal bond. In this paper,the 31P shift of the series of compound[(CO)4M(μ-PMe2)]2, M=V, Cr, Mn have been calculated. The correlation of 31P shiftwith metal-metal bond has been studied.In this paper "Magnetic nuclei molecular orbit group approximation for calculationof NMR chemical shift" has been proposed.展开更多
文摘该文综述了中药复杂成分靶点鉴定的新方法及其应用研究进展,系统梳理了靶点鉴定的经典方法与前沿技术体系,涵盖蛋白质组学分析、荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)技术、网络药理学预测模型、高通量生物芯片筛选、基于分子亲和垂钓的靶标捕获策略、基因定点突变验证以及靶蛋白共结晶结构解析等多元策略,强调了靶点鉴定在阐明中药作用机制、新药研发过程中的重要作用,为推动中药现代化发展奠定基础。
文摘为了探讨复合物中分子间相互作用对单体分子动力学的影响,对CF3Cl-CO复合物中单体振动谱带基线平移进行了预测。首先,采用二阶多体微扰理论(M?ller-Plesset perturbation theory of second order, MP2)结合扩展相关一致性极化价三重ζ基组(augmented correlation-consistent polarized valence triple-zeta, Aug-cc-pVTZ)对该复合物的5种结构(S1′、S2、S3、S4、A)进行几何优化、频率计算;然后,引入键函数(3s3p2d1f),在包含单激发、双激发和微扰三激发的耦合簇(coupled cluster with single, double, and perturbative triple excitations, CCSD(T))方法结合Aug-cc-pVTZ的水平上计算稳定结构的分子间相互作用能,并对最稳定结构的单体谱带基线平移进行预测。结果表明,S1′为该复合物的最稳定结构,其分子间相互作用能为-3.81 kJ/mol,其能量分解中交换能占比最高为38%。此外,研究中发现了复合物的2个新的稳定结构S4、A,其分子间相互作用能分别为-2.68、-2.72 kJ/mol。单体谱带基线平移预测表明,在S1′结构中,相比于自由单体振动,复合物中CF3Cl单体的C-Cl键伸缩振动发生了红移,而CO的伸缩振动则表现为蓝移,这表明分子间卤键对分子内动力学存在显著影响。该研究结果为进一步实验测量CF3Cl-CO复合物光谱提供了理论参考。
文摘The transition metal complexes with phosphido bridge have been widely used insynthesis of organometallic compounds. The NMR 31P chemical shift is useful in structureelucidation. The value of 31P shift ofter used as a structural probe for the presence orabsence of metal-metal bond. In this paper,the 31P shift of the series of compound[(CO)4M(μ-PMe2)]2, M=V, Cr, Mn have been calculated. The correlation of 31P shiftwith metal-metal bond has been studied.In this paper "Magnetic nuclei molecular orbit group approximation for calculationof NMR chemical shift" has been proposed.