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猪circME1的鉴定及其在脂肪沉积中的生物学功能预测
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作者 王畅 王冰洁 +11 位作者 张开源 常乐彬 韩雪蕾 李新建 李秀领 余彤 乔瑞敏 原黎伟 张永前 杨峰 柏峻 王腾飞 《黑龙江畜牧兽医》 北大核心 2025年第10期7-14,共8页
为了研究猪背最长肌中circME1的分子特征,并预测其在脂肪沉积调控网络中的功能机制,基于前期研究中确山黑猪和大白猪背最长肌的RNA测序数据,试验选定测序数据中差异表达的circME1作为研究对象,采用PCR扩增、Sanger测序和RNase R消化等... 为了研究猪背最长肌中circME1的分子特征,并预测其在脂肪沉积调控网络中的功能机制,基于前期研究中确山黑猪和大白猪背最长肌的RNA测序数据,试验选定测序数据中差异表达的circME1作为研究对象,采用PCR扩增、Sanger测序和RNase R消化等方法对circME1的环状结构进行鉴定,采用核质分离和实时荧光定量PCR分析其生物学特性,利用miRanda和TargetScan预测miRNA结合位点,基于GO功能和KEGG通路富集分析结果构建circME1-miRNA-mRNA调控网络。结果表明:猪circME1是由ME1基因上第5个与第7个外显子构成的环状结构,具有较强的RNase R酶抗性,主要分布在细胞质中。circME1包含6个开放阅读框(ORF)、2个内部核糖体进入位点(IRES)和1个m6A甲基化修饰位点,circME1通过海绵吸附miR-455-3p、miR-6782-3p和miR-769-5p调控MAPK和PI3KAKT信号轴。GO功能和KEGG通路富集分析结果显示,circME1的靶基因主要富集在膜结合的细胞器等相关条目及MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调控通路等。circME1在背部脂肪中的相对表达量明显高于背最长肌组织,其中确山黑猪背最长肌和背部脂肪中circME1相对表达量显著或极显著高于大白猪(P<0.05或P<0.001)。说明circME1通过内源竞争RNA机制协同调控脂肪生成生物调控功能,为猪脂肪沉积的转录后调控机制提供了新视角,对优质猪肉分子育种具有重要应用价值。 展开更多
关键词 猪 circme1 亚细胞定位 脂肪沉积 ceRNA网络
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