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Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa细胞色素c成熟蛋白亚基ccmFN基因的序列分析 被引量：3
1
作者 凡星 张颖 周永红 《四川农业大学学报》 CSCD 2006年第3期252-255,共4页
研究报道了禾本科小麦族物种Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa的细胞色素c成熟蛋白亚基ccmFN基因部分序列。序列分析显示,Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa的ccmFN序列相似性为99%。它们与... 研究报道了禾本科小麦族物种Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa的细胞色素c成熟蛋白亚基ccmFN基因部分序列。序列分析显示,Psathyrostachys huashanica和Pseudoroegneria strigosa的ccmFN序列相似性为99%。它们与小麦的ccmFN具有98%的相似性,与水稻和玉米分别有97%和93%的相似性。还讨论了该基因具有的系统学意义。 展开更多
关键词 Psathyrostachys huashanica PSEUDOROEGNERIA strigosa 细胞色素C成熟蛋白亚基F ccmfn
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10种藏药材ccmFN基因片段密码子偏好性分析 被引量：1
2
作者 郝豆豆 张勇群 +1 位作者 雷鸣 拉多 《中成药》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1551-1557,共7页
目的分析苞叶雪莲、砂生槐、西藏大戟、拉萨小檗、桃儿七、樱草杜鹃、大花黄牡丹、总状绿绒蒿、拉萨蒲公英、藏橐吾10种藏药材的ccmFN基因片段密码子偏好性。方法运用Codon软件对ccmFN基因部分片段密码子组成、密码子使用性各参数和同... 目的分析苞叶雪莲、砂生槐、西藏大戟、拉萨小檗、桃儿七、樱草杜鹃、大花黄牡丹、总状绿绒蒿、拉萨蒲公英、藏橐吾10种藏药材的ccmFN基因片段密码子偏好性。方法运用Codon软件对ccmFN基因部分片段密码子组成、密码子使用性各参数和同义密码子相对使用度进行计算和统计分析,从而分析密码子的使用情况;利用ENC绘图、PR2绘图推测影响密码子偏性的因素。结果 ccmFN基因部分片段共同的偏好密码子为GCU、GAU、GAG、GGA、AUU、UUA、CUA、AAU、CCC、CAG、CGU、CGG,且偏好使用以U/A结尾的密码子。ENC绘图表明,10种单子叶植物受自然选择作用的影响比10种双子叶植物和10种藏药材大;PR2绘图表明,密码子第3位的碱基A和T使用不对称,从而影响密码子的偏好使用。结论 ccmFN基因部分片段密码子使用偏好性在苞叶雪莲等10种藏药材、10种双子叶植物、10种单子叶植物中差异不大,表明此区域在植物中具有保守性,突变作用是导致密码子偏好的主要因素。 展开更多
关键词 藏药材 ccmfn基因 密码子偏好性
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多裂叶水芹线粒体特征及雄性不育候选基因的鉴定
3
作者 谭国飞 李梦瑶 +4 位作者 罗庆 钟秀来 朱顺华 王堃 熊爱生 《南京农业大学学报》 北大核心 2025年第5期1013-1022,共10页
[目的]本文旨在分析多裂叶水芹线粒体特征,鉴定其雄性不育候选基因,为水芹雄性不育杂交育种和理论研究提供参考。[方法]以多裂叶水芹不育株系(命名为:OtBY002)及对应的可育株系(命名为:OtKY002)为材料,采用Illumina公司提供的二代测序和... [目的]本文旨在分析多裂叶水芹线粒体特征,鉴定其雄性不育候选基因,为水芹雄性不育杂交育种和理论研究提供参考。[方法]以多裂叶水芹不育株系(命名为:OtBY002)及对应的可育株系(命名为:OtKY002)为材料,采用Illumina公司提供的二代测序和Nanopore提供的三代测序平台,分别对其线粒体基因组进行测序和组装;再对基因组进行注释,筛选、获得候选基因,并对不育基因蛋白进行三维结构分析和进化分析。[结果]OtBY002和OtKY002均含有1个大环和1个小环线粒体基因组,均含有75个基因;其中,OtBY002和OtKY002大环线粒体基因组长度分别为336668 bp(登录号:PP693295.1)和336731 bp(PP693297.1),二者小环线粒体基因组大小一致且长度均为48051 bp(登录号分别为PP693296.1和PP693298.1)。进一步分析表明,ccmFN基因序列长度在OtBY002和OtKY002中具有显著差别,分别为1050和1740 bp,其中,OtBY002中该基因在921 bp位置上发生突变导致其不育,进化上OtBY002和OtKY002的ccmFN具有一定的进化距离,不在同一分支上。[结论]ccmFN基因序列发生突变是导致OtBY002产生不育的潜在原因。 展开更多
关键词 多裂叶水芹 雄性不育 线粒体基因组 ccmfn
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