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鄱阳湖南矶山湿地不同植被类型对土壤碳组分、羧化酶及cbbl基因的影响 被引量:13
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作者 曹煦彬 林娣 +2 位作者 蔡璐 江玉梅 朱笃 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1269-1279,共11页
选取鄱阳湖南矶山湿地南荻群落(ND)、芦苇苔草混合群落(HH)、苔草群落(TC)、茭白群落(JB)及裸滩地(LT)土壤为研究对象,分析土壤中不同碳组分、固碳酶(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RubisCO)酶活及其大亚基编码基因(cbbl)及环境因子对... 选取鄱阳湖南矶山湿地南荻群落(ND)、芦苇苔草混合群落(HH)、苔草群落(TC)、茭白群落(JB)及裸滩地(LT)土壤为研究对象,分析土壤中不同碳组分、固碳酶(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(RubisCO)酶活及其大亚基编码基因(cbbl)及环境因子对它们的影响。结果表明:土壤中全碳(TC)、有机碳(SOC)、微生物生物量碳(MBC)和可溶性有机碳(DOC)依次为6 380~33 830、1 209~2 259、124.6~1 282、2.848~18.00 mg kg^(-1),其平均值变化表现为ND>HH>TC>JB;土壤中RubisCO酶活性在38.08~125.1 nmol CO_2 kg^(-1) min^(-1)之间,ND土壤RubisCO酶活性最高(125.1 nmol CO_2 kg^(-1) min^(-1)),TC最低(38.08 nmol CO_2 kg^(-1) min^(-1));HH与JB的RubisCO酶活性分别为38.85、66.05 nmol CO_2 kg^(-1) min^(-1)。土壤cbbl基因总拷贝数在36.07×10~4~195.6×10~4 copies g^(-1)之间,ND最高,JB最低。相关性分析表明,MBC和DOC与cbbl基因均呈极显著正相关(p<0.01),而TC、SOC分别与RubisCO酶活性呈显著正相关关系(p<0.05)。本研究结果说明,固碳酶及cbbl基因与各碳组分具有密切的关系,这对于进一步揭示鄱阳湖湿地土壤碳素循环及其微生物机制具有重要的参考意义。 展开更多
关键词 鄱阳湖 碳库 碳组分 固碳酶RubisCO cbbl基因
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林地转型耕地对东北丘陵区白浆土cbbL细菌群落丰度和结构的影响 被引量:5
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作者 王蕊 吴宪 +3 位作者 李刚 修伟明 王丽丽 张贵龙 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第12期5561-5569,共9页
土壤固碳细菌的CO2同化作用能够将CO2转化成有机质,是土壤碳循环的重要过程,然而对土地利用方式转变下土壤固碳细菌群落丰度和结构变化的了解却非常有限.在此,采用q PCR和高通量测序技术研究了东北丘陵区林地转型耕地后白浆土cbb L细菌... 土壤固碳细菌的CO2同化作用能够将CO2转化成有机质,是土壤碳循环的重要过程,然而对土地利用方式转变下土壤固碳细菌群落丰度和结构变化的了解却非常有限.在此,采用q PCR和高通量测序技术研究了东北丘陵区林地转型耕地后白浆土cbb L细菌群落丰度和结构变化,并探讨了土壤理化因子在群落丰度和结构变化中的作用.结果表明,耕地土壤细菌的cbb L基因丰度为2. 57×108copies·g-1,显著低于林地土壤的7. 30×108copies·g-1,但林地与耕地间cbb L/16S r RNA基因拷贝数比无显著差异.与林地相比,耕地土壤cbb L细菌群落的Shannon和Chao1指数显著降低,而Simpson指数显著升高.系统发育树分析和主坐标分析(principal co-ordinates analysis,PCo A)均表明林地转型耕地改变了土壤cbb L细菌群落组成. Pearson相关分析表明,cbb L基因丰度和Shannon指数均与p H极显著正相关,而与AP和NO3-显著负相关,证明了施肥导致的土壤p H和速效养分改变是造成土壤cbb L细菌群落丰度和多样性变化的主要原因.典范对应分析(canonical correspondence analysis,CCA)显示,p H、NO3-、AP和NH4+与土壤cbb L细菌群落结构变化显著相关.综上所述,了解土壤cbb L细菌群落对土地利用方式转变的响应及其微生物学机制将为加强我国东北丘陵区白浆土的可持续利用及生态环境重建提供新的见解. 展开更多
关键词 丘陵区 白浆土 林地 耕地 CBB L细菌群落
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稻田土壤固碳功能微生物群落结构和数量特征 被引量:39
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作者 刘琼 魏晓梦 +5 位作者 吴小红 袁红朝 王久荣 李裕元 葛体达 吴金水 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第2期760-768,共9页
研究不同类型稻田土壤自养微生物数量和多样性差异及其影响因子,对全面认识稻田生态系统的固碳潜力及其机制具有重要意义.鉴于此,本文选取4种典型稻田土壤,通过室内培养实验对具备卡尔文循环途径碳同化微生物进行了研究.利用荧光定量PCR... 研究不同类型稻田土壤自养微生物数量和多样性差异及其影响因子,对全面认识稻田生态系统的固碳潜力及其机制具有重要意义.鉴于此,本文选取4种典型稻田土壤,通过室内培养实验对具备卡尔文循环途径碳同化微生物进行了研究.利用荧光定量PCR(qPCR)、克隆文库以及末端限制性长度多态性分析(T-RFLP)技术,研究了卡尔文循环关键酶(1,5二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶Rubis CO)的2种编码基因(cbbL和cbbM)的丰度和多样性.结果表明,与培养前相比,培养45 d后碳同化自养微生物数量有所增加,cbbL基因丰度比cbbM基因高3个数量级.不同稻田土壤中碳同化功能微生物优势种群存在差异,且这些微生物大多不能归类到已知的细菌类群中,部分可归类的与变形菌和放线菌有较高相似度.RDA分析结果显示土壤有机碳(SOC)、阳离子交换量(CEC)、pH、黏粒、粉粒和砂粒含量对碳同化功能微生物群落结构有显著影响.本文的研究结果对于理解微生物在碳循环过程中的作用具有一定的科学意义,也可以为稻田土壤肥力科学化管理和构建低碳农业提供科学依据. 展开更多
关键词 稻田土壤 自养固碳微生物 cbbl cbbM 群落结构
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农田土壤自养微生物碳同化潜力及其功能基因数量、关键酶活性分析 被引量:25
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作者 陈晓娟 吴小红 +6 位作者 简燕 袁红朝 周萍 葛体达 童成立 邹冬生 吴金水 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第3期1144-1150,共7页
研究农田土壤自养微生物碳同化潜力,对全面认识农田生态系统碳吸收和碳储存有着重要意义.选取6种典型农田土壤,通过14C连续标记示踪技术结合密闭系统模拟培养,量化了土壤自养微生物碳同化潜力及其向土壤活性碳库组分转化,同时结合... 研究农田土壤自养微生物碳同化潜力,对全面认识农田生态系统碳吸收和碳储存有着重要意义.选取6种典型农田土壤,通过14C连续标记示踪技术结合密闭系统模拟培养,量化了土壤自养微生物碳同化潜力及其向土壤活性碳库组分转化,同时结合分子生物学技术及酶学分析方法,探讨了不同土壤自养微生物细菌固碳功能基因(cbbL)丰度及关键酶(RubisCO)活性.结果表明,土壤自养微生物具有可观的CO,同化潜力,在本实验条件下,全球每年表层(0-20cm)土壤通过自养微生物的同化作用可固定的碳为0.57-7.3Pg.供试土壤的14C土壤有机碳(14C-SOC)含量范围为10.63-153.81mg·kg^-1,而14C可溶性有机碳(14C-DOC)、14C微生物生物量碳(14C-MBC)含量范围分别为0.96-8.10mg·kg^-1.70-49.16mg·kg^-1.土壤可溶解性有机碳(DOC)、微生物量碳(MBC)和SOC的更新率分别为5.07%-ld.3%、2.51%-13.12%和0.09%-0.64%.土壤细菌cbbL丰度范围为2.d0×10^7-1.9×10。copies·g^1,且RubisCO酶活性(CO,/soil)范围为34.06-71.86nmol-(g·min)^-1.相关分析表明,土壤14C-SOC与14C-MBC及RubisCO酶活性均呈极显著正相关关系(P〈0.01).说明土壤对大气CO:的同化作用主要是由自养微生物参与的同化过程,且较高的RubisCO酶活性意味着较高的自养微生物CO:同化潜力. 展开更多
关键词 土壤自养微生物 碳同化潜力 cbbl基因 RubisCO活性 农田土壤 14C连续标记
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长期施肥对稻田土壤固碳功能菌群落结构和数量的影响 被引量:27
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作者 袁红朝 秦红灵 +4 位作者 刘守龙 童成立 葛体达 魏文学 吴金水 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期183-189,共7页
微生物固碳在减缓全球气候变化、实现人类可持续发展方面具有重要的意义,通过揭示长期不同施肥制度对土壤固碳细菌的影响规律,可以为我国稻田土壤科学施肥,稻田固碳和温室气体减排的共轭双赢作用提供重要的理论依据。以湖南宁乡国家级... 微生物固碳在减缓全球气候变化、实现人类可持续发展方面具有重要的意义,通过揭示长期不同施肥制度对土壤固碳细菌的影响规律,可以为我国稻田土壤科学施肥,稻田固碳和温室气体减排的共轭双赢作用提供重要的理论依据。以湖南宁乡国家级稻田肥力变化长期定位试验为平台,采用PCR-克隆测序和实时荧光定量(Real-time)PCR技术,研究不施肥(CK),氮磷钾肥(NPK)和氮磷钾加秸秆还田(NPK plus crop residue return;NPKS)3种长期施肥制度对稻田土壤固碳细菌群落结构及数量的影响。通过分析固碳细菌cbbL基因文库发现,长期施肥导致土壤固碳细菌种群结构产生了明显差异,NPK和NPKS处理中兼性自养固碳菌群落优势增加而严格自养固碳菌生长受到抑制。LUBSHUFF软件统计分析显示cbbL基因文库在CK、NPK及NPKS处理间均存在显著性差异。3种施肥处理的稻田土壤细菌cbbL基因拷贝数为3.35×108—5.61×108/g土,施肥后,土壤细菌cbbL基因数量增加,其中NPKS处理cbbL数量最多,是CK处理的1.5倍左右。稀疏曲线则显示长期施化肥导致细菌cbbL基因多样性高于NPKS,而NPKS高于CK。上述结果表明了长期施肥对土壤固碳细菌群落结构,多样性及数量均有显著的影响。结果可为深入探讨稻田土壤微生物固碳潜力及其影响机理提供有力的依据。 展开更多
关键词 稻田土壤 施肥 多样性 cbbl基因 实时定量PCR
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土壤质地对自养固碳微生物及其同化碳的影响 被引量:17
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作者 王群艳 吴小红 +4 位作者 祝贞科 袁红朝 隋方功 葛体达 吴金水 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第10期3987-3995,共9页
自养微生物可同化大气中的CO2并将其转化为土壤有机碳,对提高农田土壤的碳吸收和碳储存有重要意义,然而土壤质地对自养固碳微生物功能种群及其同化碳的影响机制还不清楚.本研究选取亚热带地区同一母质发育而成的两种质地水稻土壤(壤质... 自养微生物可同化大气中的CO2并将其转化为土壤有机碳,对提高农田土壤的碳吸收和碳储存有重要意义,然而土壤质地对自养固碳微生物功能种群及其同化碳的影响机制还不清楚.本研究选取亚热带地区同一母质发育而成的两种质地水稻土壤(壤质黏土和砂质黏壤土),通过^(14)C-CO2连续标记技术结合室内模拟培养实验,探讨土壤质地对自养微生物同化碳(^(14)C-SOC)、自养微生物截留碳(^(14)C-MBC)和自养微生物可溶性碳(^(14)C-DOC)的影响.以固碳功能基因(cbb L基因)作为指示基因,结合PCR和克隆测序技术,分析不同质地土壤自养固碳微生物群落结构和多样性的差异.结果表明,壤质黏土^(14)C-SOC、^(14)C-MBC和^(14)C-DOC平均含量分别为133.81、40.16和8.10 mg·kg-1,均显著高于砂质黏壤土^(14)C-SOC(104.95 mg·kg-1)、^(14)C-MBC(33.26 mg·kg-1)和^(14)C-DOC(4.18 mg·kg-1)平均含量(P<0.05),说明土壤质地显著影响了土壤自养微生物碳同化量以及自养微生物同化碳在土壤中的转化.稀疏曲线、细菌cbb L基因文库覆盖度以及多样性指数分析结果显示壤质黏土固碳细菌群落多样性高于砂质黏壤土.系统发育分析表明,壤质黏土细菌cbb L基因序列与Rhodoblastus acidophilus、Blastochloris viridis、Thauera humireducens、Mehylibium sp.、Variovorax sp.等具有一定的同源性,而砂质黏壤土cbb L基因序列主要与根瘤菌和放线菌同源.可见,土壤质地对自养固碳微生物群落结构和多样性产生了深刻的影响,壤质黏土中较高的黏粒含量、土壤养分含量和阳离子交换量可能有利于维持更高的自养固碳微生物多样性和活性,从而导致不同质地土壤自养微生物碳同化量及其转化存在显著差异. 展开更多
关键词 土壤质地 固碳自养微生物 CO2同化 cbbl基因 多样性 群落结构
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亚热带4种典型森林植被土壤固碳细菌群落结构及数量特征 被引量:18
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作者 刘茗 曹林桦 +5 位作者 刘彩霞 梁辰飞 秦华 陈俊辉 邵帅 徐秋芳 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期1028-1039,共12页
为研究亚热带不同森林植被类型土壤固碳微生物特征及其影响因子,选取毛竹林(Moso banboo groves)、阔叶林(Broad-leaved forest)、杉木林(Chinese fir forest)和马尾松林(Masson pine forest)等4种森林植被为研究对象,以cbbL为固碳细菌... 为研究亚热带不同森林植被类型土壤固碳微生物特征及其影响因子,选取毛竹林(Moso banboo groves)、阔叶林(Broad-leaved forest)、杉木林(Chinese fir forest)和马尾松林(Masson pine forest)等4种森林植被为研究对象,以cbbL为固碳细菌指示基因,利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR)和MiSeq高通量测序为研究手段。结果表明,4种林分土壤的细菌16S rRNA基因和固碳细菌cbbL基因丰度范围分别是5.40×10^(10)~2.81×10^(11) copies·g^(-1)干土和4.55×10^(8)~3.53×10^(9) copies·g^(-1)干土,其中毛竹林显著高于其他三种林分(P<0.05);基因丰度显著关联的环境因子是阔叶林土壤的有效磷、不同土层的pH(P<0.05)。杉木林土壤固碳细菌多样性显著低于其他3种林分(P<0.05),其亚表层土壤高于表层(P<0.05);双因子分析表明,林型、土层之间土壤固碳细菌多样性均存在显著或极显著差异。所有土壤具有相似的优势属但相对丰度不同,其中毛竹林和杉木林土壤的甲基化石油杆菌属(Methylibium)和诺卡菌属(Nocardia)占比明显高于阔叶林和马尾松林。冗余分析结果显示,不同林分土壤pH、土壤有机碳、有效磷、全氮差异是影响土壤固碳细菌群落特征形成的主要因素。综上,4种植被对土壤固碳微生物数量及群落结构多样性影响明显,从土壤理化性质、固碳细菌基因丰度、多样性以及结构特征等多维度结果证明,毛竹林对土壤肥力以及固碳细菌影响效果最好,固碳微生物对毛竹林土壤有机质积累贡献大于阔叶林,定量结论有待进一步研究。 展开更多
关键词 固碳细菌 cbbl基因 亚热带森林 实时荧光定量PCR 高通量测序
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南海表层海水参与卡尔文循环的固碳基因多样性研究 被引量:9
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作者 季凤云 明红霞 +8 位作者 李洪波 昝帅君 王建宁 苏洁 郭立梅 常永凯 石岩 关春江 樊景凤 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期4037-4043,共7页
为揭示南海北部表层海水中参与卡尔文循环的固碳基因多样性及其与环境因子的关系,本研究以卡尔文循环中的关键酶核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubis CO)的Ⅰ、Ⅱ型基因(cbbL、cbbM)作为分子标记,采用Illumina Miseq高通量测序技术对... 为揭示南海北部表层海水中参与卡尔文循环的固碳基因多样性及其与环境因子的关系,本研究以卡尔文循环中的关键酶核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubis CO)的Ⅰ、Ⅱ型基因(cbbL、cbbM)作为分子标记,采用Illumina Miseq高通量测序技术对海水中的固碳基因多样性进行分析,并结合多元统计分析的方法,探讨了固碳基因多样性与环境因子的关系.结果显示,在南海北部表层海水中,含cbbL基因固碳基因主要归属于变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),其中,优势亚群分别是γ-变形菌亚门(45.3%)、蓝细菌(30.9%)和β-变形杆菌亚门(23.8%);而含cbbM基因的固碳菌群未检测到;近岸的A9站位与其他站位物种组成有一定的差异,异着色菌属(Allochromatium)、硫杆菌属(Thiobacillus)和硫单胞菌属(Thiohalomonas)为其特有菌属.相关性和冗余分析(RDA)结果显示,含cbbL基因的固碳基因丰度与水温、盐度呈显著负相关(p<0.01),与硝酸盐、亚硝酸盐、硅酸盐呈显著正相关(p<0.01). 展开更多
关键词 珠江口 卡尔文循环 cbbl基因 cbbM基因 固碳基因多样性
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岩溶与非岩溶区稻田土壤CO_2固定细菌的丰度比较 被引量:2
9
作者 王腾 靳振江 +4 位作者 郭家怡 张双双 程亚平 张琴 李金城 《中国岩溶》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期74-80,共7页
以桂林毛村岩溶试验场稻田土壤为研究对象,以cbbLR1、cbbLG1和cbbM为CO_2固定细菌的指示基因,采用荧光定量PCR技术,对比三者在岩溶区、混合区与非岩溶区中的丰度。结果表明,cbbLG1基因在岩溶区的丰度显著高于混合区和非岩溶区,最大值为1... 以桂林毛村岩溶试验场稻田土壤为研究对象,以cbbLR1、cbbLG1和cbbM为CO_2固定细菌的指示基因,采用荧光定量PCR技术,对比三者在岩溶区、混合区与非岩溶区中的丰度。结果表明,cbbLG1基因在岩溶区的丰度显著高于混合区和非岩溶区,最大值为1.42×10~9拷贝·g^(-1);cbbLR1和cbbM基因在混合区的丰度显著高于岩溶区和非岩溶区,最大值为2.06×10~9拷贝·g^(-1)和3.35×10~7。相关性分析表明,cbbLG1的丰度与土壤中有机碳质量分数、全氮质量分数及阳离子交换量显著相关;三个cbbL基因对pH的敏感度不同:pH与cbbL G1基因呈显著正相,而与cbbM基因呈显著负相关。 展开更多
关键词 岩溶区 水稻土 土壤性质 cbbl基因
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土壤固碳微生物的绝对定量检测实验设计
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作者 付小花 陈皓 +2 位作者 张华 周磊 唐贤春 《实验室研究与探索》 CAS 北大核心 2024年第4期18-22,共5页
为了定量检测土壤中的固碳微生物,设计以功能基因cbbL为靶标的固碳微生物微滴数字聚合酶链式反应(ddPCR)检测方法。选择合适的引物探针,从退火温度、探针浓度以及引物浓度进行反应条件的优化,分析ddPCR检测方法的线性范围、敏感性、重... 为了定量检测土壤中的固碳微生物,设计以功能基因cbbL为靶标的固碳微生物微滴数字聚合酶链式反应(ddPCR)检测方法。选择合适的引物探针,从退火温度、探针浓度以及引物浓度进行反应条件的优化,分析ddPCR检测方法的线性范围、敏感性、重复性和特异性。结果显示,当退火温度为55.8℃、探针与引物浓度分别为350、750 nmol/L时,建立的cbbL-ddPCR扩增反应效率最高,阴阳性微滴分布界限最明显,平均拷贝数较高;检测的线性范围为2.3×10^(0)~2.3×10^(5)copies/μL-DNA,曲线方程y=0.1077x-95.562,相关系数R^(2)为0.9997,检出限为0.5 copy/μL-DNA,21个重复的变异系数仅为3.92%,与其他4种非固碳微生物DNA未发生交叉反应。所建立的cbbL-ddPCR方法可用于土壤微生物固碳潜能测定。 展开更多
关键词 微滴数字聚合酶链式反应 固碳微生物 cbbl基因 反应条件优化
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林冠受损对小坑林场土壤固碳微生物群落结构的影响 被引量:9
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作者 禹飞 梁俊峰 +2 位作者 史静龙 王胜坤 陆俊锟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期2297-2306,共10页
【目的】以典型南亚热带常绿阔叶林小坑林场土壤为研究对象,模拟2008年冰雪灾害对森林造成的损伤设置实验,分析不同林冠开度和凋落物输入量对土壤固碳微生物群落结构的影响。【方法】试验设置对照(CN)、损伤处理+移除处理枝叶(TR)、损... 【目的】以典型南亚热带常绿阔叶林小坑林场土壤为研究对象,模拟2008年冰雪灾害对森林造成的损伤设置实验,分析不同林冠开度和凋落物输入量对土壤固碳微生物群落结构的影响。【方法】试验设置对照(CN)、损伤处理+移除处理枝叶(TR)、损伤处理+保留处理枝叶(TD)、未处理+添加处理枝叶(UD)4个处理,受损处理一年后,采用MiSeq高通量测序技术对土壤固碳微生物的功能基因cbbL进行测序分析。【结果】通过生物信息学及统计学分析表明,森林林冠损伤后林冠开度和凋落物输入量增加,导致土壤固碳微生物种群数量降低,多样性增加,群落结构也受到影响,亚硝化螺菌属(Nitrosospira)明显增加,成为优势种群,而原来的优势菌群慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)明显减少。主成分分析(PCA)表明,与对照相比,其他3个样地的土壤固碳微生物结构均发生明显改变。【结论】模拟林冠损伤处理一年后,凋落物的大量骤然输入和林冠开度增大提高了土壤固碳微生物群落多样性,但降低了其种群数量,影响了土壤固碳微生物群落结构,这为进一步的研究提供了依据。 展开更多
关键词 cbbl基因 凋落物输入量 固碳微生物 林冠开度 群落结构
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水分含量对紫色土自养微生物丰度与活性的影响 被引量:6
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作者 魏万玲 程永毅 +1 位作者 周志峰 王明霞 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期541-548,共8页
通过室内培养试验,研究土壤水分对紫色土自养微生物丰度与活性的影响。土壤含水量(质量百分比)设置为4个处理,分别为10%(W10)、15%(W15)、25%(W25)及淹水(WL),于室温下培养28天。分别于培养的第3、7、14、28天取样,测定土壤有机碳含量、... 通过室内培养试验,研究土壤水分对紫色土自养微生物丰度与活性的影响。土壤含水量(质量百分比)设置为4个处理,分别为10%(W10)、15%(W15)、25%(W25)及淹水(WL),于室温下培养28天。分别于培养的第3、7、14、28天取样,测定土壤有机碳含量、cbb L基因(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶大亚基基因)丰度、RubisCO(1,5-二磷酸核酮糖羧化酶)酶活性,并分析它们之间的相关性。结果表明:土壤cbbL基因丰度于培养的前14天呈现随含水量增加而升高的趋势,且淹水处理(WL)在整个培养期间其cbbL丰度均处于最高水平。各处理土壤的RubisCO酶活性在培养初期(第3天)无显著差异,培养后期(第28天)低含水量(W10和W15)处理中RubisCO酶活性显著低于高含水量的W25及WL处理(P<0.05)。单因素重复检测方差分析结果表明,含水量显著影响土壤有机碳含量(F=11.91,P=0.03)、cbbL丰度(F=42.33,P<0.01)和RubisCO酶活性(F=51.55,P<0.01)。相关性分析表明,土壤cbbL丰度与RubisCO酶活性呈显著正相关(R2=0.23,P<0.01),而它们均与土壤有机碳含量呈显著负相关。综上,土壤水分含量是影响紫色土自养微生物丰度和活性的关键因子,它们均随含水量升高而增加,此结果可为揭示土壤碳转化对土壤湿度变化的响应机制提供重要的基础信息。 展开更多
关键词 含水量 紫色土 cbbl基因 RubisCO酶活性 有机碳
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固碳微生物菌株的分离鉴定及其固碳能力测定 被引量:18
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作者 郭珺 樊芳芳 +2 位作者 王立革 武爱莲 郑军 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期90-97,共8页
利用微生物回收和固定CO2气体的生物固碳方法,成为解决"温室效应"这一重大环境问题的焦点,本研究目的是分离筛选固碳微生物菌株。利用无碳源无机培养基从活性污泥、沼液和设施土壤中分离筛选出以CO2为碳源的菌株24株,选取其... 利用微生物回收和固定CO2气体的生物固碳方法,成为解决"温室效应"这一重大环境问题的焦点,本研究目的是分离筛选固碳微生物菌株。利用无碳源无机培养基从活性污泥、沼液和设施土壤中分离筛选出以CO2为碳源的菌株24株,选取其中生长较快的8株菌进行cbbL基因、形态观察、生理生化反应测定和16S rDNA测序分析,将测序结果在BlAST数据库中比对,进行固碳菌株的分子鉴定,并对其菌体含量和RubisCO酶活性进行比较。选取RubisCO酶活性最高的菌株C2-8R,进行土壤施用试验,通过土壤RubisCO酶活性的测定,确定分离筛选的固碳菌的固碳能力。研究表明,可通过无碳源培养基进行固碳微生物菌株的筛选,筛选的固碳菌分别隶属于假单胞菌属和嗜甲基菌属,并可通过RubisCO酶活性来反映微生物的固碳能力。 展开更多
关键词 固碳微生物菌株 cbbl基因 16S RDNA RubisCO酶活性
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黄土高原雨养区苜蓿种植年限对土壤固碳细菌丰度和活性有机碳组分的影响 被引量:7
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作者 蔡雪梅 潘占东 +4 位作者 罗珠珠 李玲玲 牛伊宁 蔡立群 刘家鹤 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1024-1034,共11页
为了揭示紫花苜蓿(Medicago sativa)种植对土壤固碳细菌丰度和活性有机碳组分的影响,本研究采用实时荧光定量PCR技术,分析不同种植年限(2、9、16和18年)紫花苜蓿地和农田[玉米(Zea mays)]土壤固碳细菌丰度变化特征,探讨土壤固碳细菌丰... 为了揭示紫花苜蓿(Medicago sativa)种植对土壤固碳细菌丰度和活性有机碳组分的影响,本研究采用实时荧光定量PCR技术,分析不同种植年限(2、9、16和18年)紫花苜蓿地和农田[玉米(Zea mays)]土壤固碳细菌丰度变化特征,探讨土壤固碳细菌丰度与活性有机碳组分及Rubis CO酶活性之间的关系,并耦合土壤理化因子解析影响cbb L基因丰度和土壤活性有机碳组分的重要因素。结果表明,与农田相比,种植18和16年苜蓿显著提高了土壤总有机碳和3种活性有机碳组分(P<0.05),其中总有机碳、易氧化有机碳、可溶性有机碳和微生物量碳分别增加了18.15%和14.60%、130.00%和76.43%、22.87%和11.17%、127.03%和133.49%,种植9年苜蓿提高了3种土壤活性有机碳组分,而种植2年苜蓿仅显著提高了微生物量碳含量(P<0.05)。土壤干土cbb L基因拷贝数介于(1.12×10^(8))~(1.96×10^(8))copies·g^(-1),表现为苜蓿地土壤均显著高于农田(P<0.05),且随苜蓿种植年限的延长而增加。相关分析结果表明,cbb L基因丰度与土壤C、N和p H呈显著正相关关系(P<0.05),与土壤水分、P素和Rubis CO酶活性呈显著负相关关系(P<0.05);进一步逐步回归分析发现,土壤全氮和p H是影响cbb L基因丰度的关键因子。冗余分析结果显示,土壤水分和全氮是影响土壤总有机碳和活性有机碳组分的主要因素。综上,了解土壤cbb L细菌丰度和活性有机碳组分对苜蓿种植年限的响应对后期进一步揭示黄土高原雨养区土壤固碳的微生物机制提供了参考。 展开更多
关键词 黄土高原 紫花苜蓿 种植年限 农田 活性碳组分 RubisCO酶 cbbl基因
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汞污染对土壤有机碳稳定性和固碳功能微生物群落的影响 被引量:1
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作者 张语馨 孙约兵 +2 位作者 张仁甫 王超 贾宏涛 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第12期7358-7367,共10页
为阐明Hg污染对土壤有机碳稳定性及自养微生物碳同化的影响机制,采用室内培养试验与分子生物学技术,研究了Hg污染29 d前后土壤CO_(2)排放速率、有机碳组分和cbbL、cbbM功能微生物的变化特征.结果表明,不同水平Hg污染对土壤CO_(2)排放速... 为阐明Hg污染对土壤有机碳稳定性及自养微生物碳同化的影响机制,采用室内培养试验与分子生物学技术,研究了Hg污染29 d前后土壤CO_(2)排放速率、有机碳组分和cbbL、cbbM功能微生物的变化特征.结果表明,不同水平Hg污染对土壤CO_(2)排放速率的影响存在差异,高水平Hg(S2、S3和S5)抑制了土壤CO_(2)累计排放量,而低水平Hg(S1、S4和S6)促进了土壤碳排放.Hg污染影响了土壤有机碳组分比例,不同处理间SOC和MBC含量变化规律基本一致,均存在显著差异(P <0.05),EOC和DOC随Hg含量的增加而降低.与第1 d相比,培养结束各处理qCO_(2)均显著降低(P <0.05).不同水平Hg污染对cbbL和cbbM功能微生物群落的影响存在明显差异,变形菌门、放线菌门和酸杆菌门是两种功能微生物共有的优势菌门.土壤CO_(2)累计排放量和SOC是影响cbbL群落变化的主要因素,土壤有效Hg是影响cbbM群落变化的主要因素.综上所述,研究结果可为Hg污染区域生态系统的碳循环及积累提供理论依据. 展开更多
关键词 汞污染 CO_(2)排放特征 有机碳组分 cbbl cbbM
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3种碳添加对退化农田土壤固碳细菌群落结构多样性的影响 被引量:20
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作者 苏鑫 郭迎岚 +2 位作者 卢嫚 冯程程 岳中辉 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期234-241,共8页
为研究秸秆、生物炭和纳米碳添加对退化农田土壤固碳细菌群落结构多样性的影响,利用高通量测序技术,对3种碳源添加后黑龙江省嫩江县退化农田土壤的固碳细菌群落结构及多样性进行研究.结果表明:①在97%相似度水平下,秸秆、生物炭添加后... 为研究秸秆、生物炭和纳米碳添加对退化农田土壤固碳细菌群落结构多样性的影响,利用高通量测序技术,对3种碳源添加后黑龙江省嫩江县退化农田土壤的固碳细菌群落结构及多样性进行研究.结果表明:①在97%相似度水平下,秸秆、生物炭添加后土壤固碳细菌的Chao1指数、Observed species和Shannon指数高于纳米碳添加后的土壤.②群落组成方面,在门水平上,变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,在生物炭添加后的相对丰度最高,为94.35%;在纲水平上,γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)为优势菌纲,在纳米碳添加后的相对丰度最高,为67.45%;在目水平上,着色菌目(Chromatiales)为优势菌目,在纳米碳添加后的相对丰度最高,为50.83%;在科水平上,节外硫红螺菌科(Ectothiorhodospiraceae)为优势菌科,在纳米碳添加后的相对丰度最高,为34.34%;在属水平上,硫碱弧菌(Thioalkalivibrio)、Sulfurifustis、Thiobacillus为优势菌属,分别在生物炭、纳米碳和秸秆添加后的相对丰度最高,相对丰度分别为17.02%、16.40%、13.03%.③层次聚类和主成分分析结果显示,生物炭和纳米碳添加后土壤固碳细菌群落结构差异显著,进一步进行组间差异显著性分析表明,显著差异标记主要富集在生物炭添加的土壤中,主要为硫碱弧菌和硫腺菌(Thiocystis)最为显著.④冗余分析结果表明,土壤固碳细菌群落结构受土壤pH、有机碳、全氮、全磷、碱解氮及有效磷的综合影响,其中,土壤pH和全氮含量是影响土壤固碳细菌群落结构的主要理化性质.上述结果表明,秸秆添加对土壤固碳细菌群落结构及多样性影响较小,生物炭添加可显著提高土壤固碳细菌群落多样性,纳米碳添加对土壤固碳细菌的影响具有一定特异性;土壤固碳细菌群落结构受土壤pH和全氮含量显著影响. 展开更多
关键词 退化农田 碳添加 固碳细菌 cbbl基因 高通量测序
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科尔沁沙地植被重建对土壤固氮和固碳菌群的影响 被引量:9
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作者 王子擎 张颖 +2 位作者 王扬 崔娅楠 曹成有 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期31-40,共10页
为掌握风沙土固氮和固碳微生物多样性以及人工植被类型对菌群结构的影响,在科尔沁沙地典型植被重建区选择相同年限的小叶锦鸡儿、差巴嘎蒿、小黄柳、山竹岩黄蓍、小叶杨和樟子松人工固沙林以及毗邻的天然榆树疏林为对象,以nifH和cbbL基... 为掌握风沙土固氮和固碳微生物多样性以及人工植被类型对菌群结构的影响,在科尔沁沙地典型植被重建区选择相同年限的小叶锦鸡儿、差巴嘎蒿、小黄柳、山竹岩黄蓍、小叶杨和樟子松人工固沙林以及毗邻的天然榆树疏林为对象,以nifH和cbbL基因为标记,采用高通量测序技术分别研究了不同固沙植被类型土壤固氮和固碳菌群结构和多样性。结果表明:植被类型对土壤理化性质、生物活性、固氮及固碳菌的多样性和菌群结构均有显著影响;小黄柳和小叶杨固沙林土壤固氮菌多样性显著高于其他植被;而樟子松和小叶杨固沙林土壤固碳菌多样性最高;斯克尔曼氏菌属、慢生根瘤菌属、固氮螺菌属和广泛固氮氢自养单胞菌属等是风沙土固氮菌群的优势菌属,平均相对优势度分别为22.3%、21.5%、20.8%和17.8%;假诺卡氏菌属、中慢生根瘤菌属、贪铜菌属、慢生根瘤菌属等是固碳菌群的优势菌属,平均相对优势度分别为22.4%、18.5%、10.5%和6.0%。小叶锦鸡儿植被区土壤固氮菌、小黄柳和小叶杨植被区固碳菌的群落结构已基本恢复到天然榆树疏林水平。影响固氮菌群结构的主要土壤因子为有机质、NH_(4)^(+)-N和全磷,而影响固碳菌群的为pH、土壤含水率和速效磷。研究结果可为沙地植被重建生态效益的评估提供科学依据。 展开更多
关键词 固沙植被 NIFH cbbl 植被类型 植被重建
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毛木耳代料栽培适宜碳氮比及菌棒中固碳、固氮细菌群落结构 被引量:6
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作者 叶雷 谭伟 +3 位作者 张伟伟 戴怀斌 张波 李小林 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期97-103,共7页
为解析毛木耳代料栽培基质碳氮比(C/N)组成对其生育的影响以及在最适C/N的菌棒(菌丝和基料混合物)中参与卡尔文循环的固碳基因和固氮基因多样性,以毛木耳"上海1号"为供试菌株,设计5个不同C/N基质,在同一条件下进行出耳试验,... 为解析毛木耳代料栽培基质碳氮比(C/N)组成对其生育的影响以及在最适C/N的菌棒(菌丝和基料混合物)中参与卡尔文循环的固碳基因和固氮基因多样性,以毛木耳"上海1号"为供试菌株,设计5个不同C/N基质,在同一条件下进行出耳试验,测定相关农艺性状指标并采用高通量测序技术分析最佳C/N处理组菌棒中固碳和固氮基因多样性.结果显示:(1)在C/N约60∶1时生长最佳:菌丝长速最快,为4.43 mm/d;发菌期料袋污染率最低,为4.27%;菌丝长势好;第一潮鲜耳单簇表面积达3624.09 cm^(2)/簇,干耳边缘厚达0.71 mm;单袋干耳单产达164.79 g/袋,转化率达14.98%.生长情况其次C/N 45∶1和75∶1.(2)菌丝满袋期C/N 60∶1时菌棒含cbbL固碳基因主要分布在Proteobacteria和Actinobacteria,相对丰度分别为90.8%和0.2%,且以β-Proteobacteria为主,主要归属于Cupriavidus(41.7%)、Rubrivivax(33.6%)、Methylococcus(6.5%);而含cbbM基因的固碳细菌未检测出.(3)norB固氮基因主要分布在Firmicutes(3.2%)和Proteobacteria(0.4%),主要优势菌属为Geobacillus(2.1%)、Macrococcus(0.9%)、Pseudomonas(0.2%)、Staphylococcus(0.1%)和Bacillus(0.1%)等.本研究筛选获得了毛木耳代料栽培较佳基质C/N为60∶1,并解析了菌丝满袋期参与固碳和固氮基因细菌群落,为实现毛木耳精准化栽培和研究参与基质碳、氮素物质转化功能微生物菌群奠定了基础. 展开更多
关键词 碳氮比 毛木耳 代料栽培 农艺性状 cbbl基因 norB基因
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不同施肥措施对华北潮土区玉米田土壤固碳细菌群落结构多样性的影响 被引量:7
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作者 刘红梅 海香 +6 位作者 安克锐 张海芳 王慧 张艳军 王丽丽 张贵龙 杨殿林 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2022年第4期715-722,共8页
研究不同施肥措施下华北潮土区玉米田土壤固碳细菌群落特征及其影响因子,为华北地区可持续施肥管理提供理论依据和数据支持。以农业农村部环境保护科研监测所建立的武清长期定位试验站为平台,利用高通量测序技术,研究6种不同施肥处理[... 研究不同施肥措施下华北潮土区玉米田土壤固碳细菌群落特征及其影响因子,为华北地区可持续施肥管理提供理论依据和数据支持。以农业农村部环境保护科研监测所建立的武清长期定位试验站为平台,利用高通量测序技术,研究6种不同施肥处理[不施肥对照(A0)、单施有机肥(A1)、氮肥减量配施有机肥(A2)、常量化肥配施有机肥(A3)、氮肥增量配施有机肥(A4)和单施化肥(A5)]对华北潮土区土壤固碳细菌结构及多样性的影响。结果表明,(1)与对照A0相比,A1和A3处理提高了Shannon多样性指数,A4和A5处降低了Shannon多样性指数。(2)群落组成方面,在门水平上,变形菌门(Proteobacteria)(92.83%—4.98%)为优势菌门;与对照A0相比,A4和A5处理显著降低了变形菌门相对丰度,A1、A2和A3无显著差异。在纲水平上,优势菌纲为γ-变形菌纲Gammaproteobacteria(53.75%—65.80%);与对照A0相比,A2、A3、A4和A5处理显著降低了γ-变形菌纲相对丰度,A1处理与对照A0无显著差异。(3)主成分分析表明,5个施肥处理OTUs与对照处理差别显著,且A3、A4和A5处理与对照A0、A1和A2处于不同排序区。(4)冗余分析结果表明,土壤pH、全氮、全磷、硝态氮、铵态氮、微生物量碳和微生物量氮与土壤cbbL细菌群落结构变化显著相关。以上结果表明,长期氮肥增量配施有机肥和单施化肥可能降低土壤固碳细菌群落多样性;不同施肥措施通过改变土壤化学性质,影响了土壤固碳细菌群落结构。 展开更多
关键词 施肥措施 潮土 固碳细菌 cbbl基因 群落结构 高通量测序
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南京市大气降尘固碳微生物群落多样性研究 被引量:2
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作者 曲浩丽 肖永良 +1 位作者 李立峰 曹慧 《环境科技》 2016年第3期1-5,共5页
采用液体微生物采样器采集南京市3个功能区(南京农业大学校园、玄武湖公园游乐场和植物园)大气降尘微生物样品。通过PCR-RFLP方法分析南京市春季大气降尘中固定CO2微生物多样性。结果表明:南京市3个功能区固定CO2的主要生物类群为脱氮... 采用液体微生物采样器采集南京市3个功能区(南京农业大学校园、玄武湖公园游乐场和植物园)大气降尘微生物样品。通过PCR-RFLP方法分析南京市春季大气降尘中固定CO2微生物多样性。结果表明:南京市3个功能区固定CO2的主要生物类群为脱氮硫杆菌(Thiobacillus denitrificans)和胶球藻属(Coccomyxa)的藻类。不同功能区的固定CO2微生物类群有一定差异,除了环境因素,人类活动对南京农业大学校园大气降尘中固碳生物类群有较大影响。 展开更多
关键词 南京市 二氧化碳 多样性 CBB L基因 PCR-RFLP
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