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草鱼cadm2b基因的克隆及在成体组织中的表达分析
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作者 梁健嘉 张琼宇 +2 位作者 李恒 郑建波 罗琛 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期9-17,共9页
为研究CADMs(Cell adhesion molecules)在草鱼构建抵御病害感染的第一道防线中发挥的作用,用RTPCR和RACE方法结合测序分析,在草鱼脑组织中检测到了该基因家族成员cadm2b基因的4条不同的c DNA全长序列。序列比对结果表明这4条全长c DNA在... 为研究CADMs(Cell adhesion molecules)在草鱼构建抵御病害感染的第一道防线中发挥的作用,用RTPCR和RACE方法结合测序分析,在草鱼脑组织中检测到了该基因家族成员cadm2b基因的4条不同的c DNA全长序列。序列比对结果表明这4条全长c DNA在5′端的序列完全相同,在3′端的3个局部区域有不同片段的缺失。因此,可以确定这4条不同的m RNA是cadm2b的不同剪接体。这4条不同的剪接体被分别命名为cadm2b、cadm2b X2、cadm2b X3和cadm2b X6。cadm2b的c DNA序列全长1669 bp,开放阅读框(ORF)1203 bp,编码400个氨基酸。cadm2b X2的c DNA序列全长2783 bp,开放阅读框长1323 bp,编码440个氨基酸;cadm2b X3的c DNA序列全长2755 bp,开放阅读框1296 bp,编码431个氨基酸;cadm2b X6基因的c DNA序列全长2649 bp,开放阅读框1161 bp,编码386个氨基酸。根据碱基序列所进行的氨基酸序列和蛋白结构预测显示这4个CADM2b蛋白亚型都具有CADM家族保守的4个功能区,但其C端的蛋白结合位点存在差异。CADM2b具有近膜4.1蛋白结合位点和Ⅱ型PDZ蛋白结合位点,CADM2b X2、X3缺失了PDZ蛋白结合位点,而CADM2b X6则同时缺失4.1蛋白和PDZ蛋白的结合位点。实时定量RT-PCR检测结果显示cadm2b剪接突变体是该基因m RNA的主要形式。半定量RT-PCR和套式PCR实验检测结果表明cadm2b基因在草鱼成体脑中高水平表达,在肝、肾、心脏和肌肉组织中有微量表达。这种表达模式提示草鱼中CADM2b主要是由非免疫细胞,而不是由免疫肥大细胞合成分泌的细胞黏附因子,可能通过介导免疫肥大细胞与病原靶细胞的黏附而起非特异性抵御病害感染的作用。 展开更多
关键词 草鱼 cadm2b 基因克隆 组织表达
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