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cDNA RDA在类似普通2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达筛查中的应用
被引量:
3
1
作者
杨架林
李果
+6 位作者
张芳林
刘优萍
张迪
周文中
许光武
杨义生
罗敏
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期667-671,共5页
应用代表性差异分析 (cDNARDA)技术 ,对类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达进行筛查 ,初步探讨类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害发病的分子机制 .首先以类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织作为实验组 (Tester) ,正常大鼠肾脏作为...
应用代表性差异分析 (cDNARDA)技术 ,对类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达进行筛查 ,初步探讨类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害发病的分子机制 .首先以类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织作为实验组 (Tester) ,正常大鼠肾脏作为对照组或驱动组 (Driver)通过cDNARDA进行基因差异表达筛查 ;最终的差异产物亚克隆到Puc 18载体 ,测序及并进行生物信息学分析 ;半定量RT PCR对筛查到新的基因进行初步的鉴定 .结果发现 9个新ESTs ,2个新基因 .这 2个新基因分别与人及小鼠的丝氨酸蛋白酶抑制因子F ,及真核细胞转录启动因子 3亚单位 5 (EIF 3epsilon)基因有高度的相似性 (>90 % )并在类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织表达上调 .推测 2个新基因分别是大鼠的丝氨酸蛋白酶抑制因子F及真核细胞转录启动因子 3亚单位 5 .两个新基因在类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织表达上调 ,可能与类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害相关 .同时 。
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关键词
cdnarda
糖尿病
大鼠
肾脏组织
基因差异表达
表达序列标签
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职称材料
一个新鼻咽癌抑瘤候选基因的克隆及其功能初步分析
被引量:
32
2
作者
余鹰谢
奕曹利
+3 位作者
张必成
周鸣
李桂源
public.cs.hn.cn
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2000年第3期319-324,共6页
从cDNA代表差异分析法 (cDNArepresentationaldifferenceanalysis ,cDNARDA)分离的新cDNA片段入手 ,进一步采用RT PCR验证 ,其中发现AF152 60 5片段在 74 %鼻咽癌 (nasopharyngealcarcinoma ,NPC)活检组织中表达下调和缺失 ,DNA印迹显...
从cDNA代表差异分析法 (cDNArepresentationaldifferenceanalysis ,cDNARDA)分离的新cDNA片段入手 ,进一步采用RT PCR验证 ,其中发现AF152 60 5片段在 74 %鼻咽癌 (nasopharyngealcarcinoma ,NPC)活检组织中表达下调和缺失 ,DNA印迹显示其代表一转录本为 2 1kb的基因 ,结合生物信息学 ,运用文库筛选克隆该基因 ,命名为NAG4基因 ,GenBank登录号AF1792 85,定位于 6q2 2 1~ 2 2 33 ,至少含有两个外显子 ,并在第一外显子的上游有TATA盒样序列 ,编码一个 50 8个氨基酸组成的、分子质量为 57 4ku的蛋白质 ;功能预测NAG4基因产物与小鼠溴区蛋白BP75有 84 %同源 ,是含有多个磷酸化位点和溴区结构域的核内转录因子 ;突变分析表明NAG4基因在HeLa细胞株中发生整码突变 .以上结果说明NAG4基因是鼻咽癌抑瘤基因的良好候选者 。
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关键词
抑瘤基因
鼻咽癌
基因克隆
cdnarda
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职称材料
题名
cDNA RDA在类似普通2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达筛查中的应用
被引量:
3
1
作者
杨架林
李果
张芳林
刘优萍
张迪
周文中
许光武
杨义生
罗敏
机构
上海第二医科大学附属瑞金医院
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第5期667-671,共5页
基金
瑞士罗氏公司资助~~
文摘
应用代表性差异分析 (cDNARDA)技术 ,对类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达进行筛查 ,初步探讨类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害发病的分子机制 .首先以类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织作为实验组 (Tester) ,正常大鼠肾脏作为对照组或驱动组 (Driver)通过cDNARDA进行基因差异表达筛查 ;最终的差异产物亚克隆到Puc 18载体 ,测序及并进行生物信息学分析 ;半定量RT PCR对筛查到新的基因进行初步的鉴定 .结果发现 9个新ESTs ,2个新基因 .这 2个新基因分别与人及小鼠的丝氨酸蛋白酶抑制因子F ,及真核细胞转录启动因子 3亚单位 5 (EIF 3epsilon)基因有高度的相似性 (>90 % )并在类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织表达上调 .推测 2个新基因分别是大鼠的丝氨酸蛋白酶抑制因子F及真核细胞转录启动因子 3亚单位 5 .两个新基因在类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏组织表达上调 ,可能与类似普通 2型糖尿病大鼠肾脏损害相关 .同时 。
关键词
cdnarda
糖尿病
大鼠
肾脏组织
基因差异表达
表达序列标签
Keywords
cDNA representational difference analysis, diabetes, rat, ESTs, gene expression,expressed sequence tag
分类号
R587.1 [医药卫生—内分泌]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
一个新鼻咽癌抑瘤候选基因的克隆及其功能初步分析
被引量:
32
2
作者
余鹰谢
奕曹利
张必成
周鸣
李桂源
public.cs.hn.cn
机构
湖南医科大学肿瘤研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2000年第3期319-324,共6页
基金
国家 8 6 3 !(1 0 2 1 0 0 1 0 5 )
973重点项目<"疾病基因组学"理论和技术体系的建立>
国家自然科学基金资助! (3 970 0 1
文摘
从cDNA代表差异分析法 (cDNArepresentationaldifferenceanalysis ,cDNARDA)分离的新cDNA片段入手 ,进一步采用RT PCR验证 ,其中发现AF152 60 5片段在 74 %鼻咽癌 (nasopharyngealcarcinoma ,NPC)活检组织中表达下调和缺失 ,DNA印迹显示其代表一转录本为 2 1kb的基因 ,结合生物信息学 ,运用文库筛选克隆该基因 ,命名为NAG4基因 ,GenBank登录号AF1792 85,定位于 6q2 2 1~ 2 2 33 ,至少含有两个外显子 ,并在第一外显子的上游有TATA盒样序列 ,编码一个 50 8个氨基酸组成的、分子质量为 57 4ku的蛋白质 ;功能预测NAG4基因产物与小鼠溴区蛋白BP75有 84 %同源 ,是含有多个磷酸化位点和溴区结构域的核内转录因子 ;突变分析表明NAG4基因在HeLa细胞株中发生整码突变 .以上结果说明NAG4基因是鼻咽癌抑瘤基因的良好候选者 。
关键词
抑瘤基因
鼻咽癌
基因克隆
cdnarda
Keywords
nasopharyngeal neoplasms, gene expressing , tumor suppressor gene, cloning, bromodomain
分类号
R739.630.2 [医药卫生—肿瘤]
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
cDNA RDA在类似普通2型糖尿病大鼠肾脏组织基因差异表达筛查中的应用
杨架林
李果
张芳林
刘优萍
张迪
周文中
许光武
杨义生
罗敏
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2003
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
一个新鼻咽癌抑瘤候选基因的克隆及其功能初步分析
余鹰谢
奕曹利
张必成
周鸣
李桂源
public.cs.hn.cn
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2000
32
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职称材料
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0
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