甘蓝型油菜种皮色泽相关基因的cDNA-SRAP差异显示 被引量：24

1

作者 马爱芬 李加纳 +3 位作者 谌利 钱伟 付福友 刘列钊 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期526-529,共4页

为探寻甘蓝型油菜黄黑籽之间的种皮色泽表达差异的分子基础,探索cDNA-SRAP差异显示的可行性,选用培育7年的重组自交系群体(RILs),根据群体分离分析法(bulkedsegregantanalysis,BSA)构建了种子的RNA混合池,利用cDNA-SRAP法进行了差异显... 为探寻甘蓝型油菜黄黑籽之间的种皮色泽表达差异的分子基础,探索cDNA-SRAP差异显示的可行性,选用培育7年的重组自交系群体(RILs),根据群体分离分析法(bulkedsegregantanalysis,BSA)构建了种子的RNA混合池,利用cDNA-SRAP法进行了差异显示研究。996对SRAP引物组合扩增出2100条带,2次扩增重复率为65.2%,其中在黄黑籽材料之间重复稳定出现的差异片段有12条,长度在100～300bp之间。选择其中7条差异片段,进行回收、克隆和测序,发现2个片段分别与拟南芥的NAD+ADP核糖转移酶及小肽转移蛋白3具有很高的同源性。结果表明,利用SRAP方法可以对甘蓝型油菜cDNA混合池进行差异显示研究,2条差异片段可能与甘蓝型油菜的种皮色泽基因表达相关。 展开更多

关键词 甘蓝型油菜 cdna-srap 群体分离分析法 差异显示

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利用cDNA-SRAP分析赤霉素诱导甘蔗节间伸长的差异表达 被引量：11

2

作者 吴建明 李杨瑞 +2 位作者 王爱勤 杨柳 杨丽涛 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第19期3937-3944,共8页

【目的】探寻赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因表达差异的分子基础,为分离节间伸长相关基因奠定基础。【方法】以新台糖22号为材料,在伸长初期以浓度为200mg·L-1的赤霉素进行叶面喷施,以喷施清水为对照,分别提取总RNA进行等量混合,获得... 【目的】探寻赤霉素诱导甘蔗节间伸长基因表达差异的分子基础,为分离节间伸长相关基因奠定基础。【方法】以新台糖22号为材料,在伸长初期以浓度为200mg·L-1的赤霉素进行叶面喷施,以喷施清水为对照,分别提取总RNA进行等量混合,获得2种不同处理的样品池,采用cDNA-SRAP技术进行基因差异表达分析。【结果】700对引物组合共扩增到约15000条、大小在50—750bp的cDNA片段。在GA3处理组和对照组中,甘蔗幼茎中的转录水平具有很大的差异,获得134条差异条带。从反向Northern杂交结果阳性的S-TDFs中选取24个片段进行克隆和序列分析,按照功能可以将24个差异表达基因片段S-TDFs(cDNA-SRAP transcriptderive dfragments)分为6类,分别为能量与代谢相关基因(4条,占总数的16.67%)、未知功能蛋白基因(6条,占总数的25%)、未知基因(10条,占总数的41.66%)、细胞壁生物合成与修饰相关基因(1条,占总数的4.17%)、信号传导相关基因(2条,占总数的8.33%)和转录因子相关基因(1条,占总数的4.17%)。【结论】cDNA-SRAP完全适用于差异表达分析,从中获得一些与甘蔗节间伸长相关的差异基因片段,这些基因可用于甘蔗节间伸长的分子机理研究。 展开更多

关键词 赤霉素 甘蔗 cdna-srap 差异表达

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梨果实愈伤组织褐腐病菌侵染过程cDNA-SRAP差异分析 被引量：6

3

作者 孙朝霞 侯思宇 +2 位作者 赵娟 杨凤龙 王玉国 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期166-172,共7页

梨果实褐腐病危害果实,可造成果实运输和储藏过程中严重的经济损失。本研究构建了褐腐病菌侵染梨果实愈伤组织离体系统,对梨褐腐病菌侵染其果实愈伤组织不同时期进行细胞学观察分析,基于cDNA-SRAP技术,分析该过程中差异基因表达,以期分... 梨果实褐腐病危害果实,可造成果实运输和储藏过程中严重的经济损失。本研究构建了褐腐病菌侵染梨果实愈伤组织离体系统,对梨褐腐病菌侵染其果实愈伤组织不同时期进行细胞学观察分析,基于cDNA-SRAP技术,分析该过程中差异基因表达,以期分离克隆与梨果实抗病反应过程相关的防卫基因。结果表明:与未侵染的梨果实愈伤组织相比,侵染12～60h过程中梨果实褐腐病菌从表面逐渐深入到内部细胞;30个SRAP引物组合共扩增出457条带,其中差异回收条带数为16条,差异比率为3.5%。最终获得5条差异基因表达条带。核酸序列同源性分析表明,其中1条差异基因片段未搜索到任何同源蛋白,2条差异基因片段经序列比对,序列相似度一致,与苹果属的肉桂醇乙酰脱氢酶(CAD)同源性为96%;其他2条差异基因片段分别与DNA结合蛋白(DBP)和寡肽转运蛋白(OPT)基因序列同源,其同源性为85%和78%,因此暂将这3个基因命名为PbCAD、PbDBP和PbOPT。荧光定量PCR结果表明,PbCAD基因在褐腐病菌侵染梨果实愈伤组织12和24h时相对表达量最高,为对照的2.94和2.66倍;PbOPT基因在褐腐病菌侵染梨果实愈伤组织12～36h时相对表达量明显升高,为对照的2.17～2.46倍,而其他时期表达量均与对照接近;PbDBP基因表达量在整个侵染时期均与对照接近。因此我们推测PbCAD和PbOPT基因可能为梨褐腐病菌侵染梨果实愈伤组织响应的相关防卫基因。 展开更多

关键词 梨 愈伤组织 褐腐病菌 cdna-srap

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cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物基因差异表达上的应用及其分析比较 被引量：6

4

作者 吴建明 李杨瑞 +4 位作者 杨柳 王爱勤 杨丽涛 熊发前广西作物遗传改良生物技术重点开发实验室 甘崇昆 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期52-55,共4页

对cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物上的应用研究进行了介绍,指出cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术已逐渐成为基因表达研究的重要工具,是构建转录图谱、定位目标性状位点、研究差异基因表达等研究的主要手段,具有广泛广阔的应用前景。但是cDNA-A... 对cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物上的应用研究进行了介绍,指出cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术已逐渐成为基因表达研究的重要工具,是构建转录图谱、定位目标性状位点、研究差异基因表达等研究的主要手段,具有广泛广阔的应用前景。但是cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术均具有一定的缺限,主要表现在获得的差异片段还不够全面丰富。cD-NA-AFLP可以扩增到扩增较多的带,但试验程序比较繁琐、昂贵而且耗时较长、操作较困难;而cDNA-SRAP相对比较简便、便宜而耗时较短,较易操作。因而将cDNA-AFLP与cDNA-SRAP技术结合起来,可望得到更全面丰富的差异片段,从而在植物基因差异表达、新基因发现、抗逆性分子机理研究等方面发挥更大的作用。 展开更多

关键词 CDNA-AFLP cdna-srap 分子标记 差异表达

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利用cDNA-SRAP分离结球甘蓝抗黑腐病相关基因的研究 被引量：7

5

作者 张云霞 宋立晓 +2 位作者 曾爱松 高兵 严继勇 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期29-32,共4页

为了挖掘抗病基因,探寻甘蓝抗黑腐病机制,选取抗性材料C7,在幼苗4-5片真叶期,喷施菌液浓度为1.0×108cfu/mL的细菌悬浮液,喷施蒸馏水作对照,提取接种后1,3,5 d的总RNA进行等量混合,获得2种不同处理的样品池。采用SRAP分子标记技术... 为了挖掘抗病基因,探寻甘蓝抗黑腐病机制,选取抗性材料C7,在幼苗4-5片真叶期,喷施菌液浓度为1.0×108cfu/mL的细菌悬浮液,喷施蒸馏水作对照,提取接种后1,3,5 d的总RNA进行等量混合,获得2种不同处理的样品池。采用SRAP分子标记技术进行基因差异表达分析,结果显示：60对SRAP引物组合共扩增出大小在100-750 bp的685条带,平均每对引物扩增11条带,共检测到24个多克隆位点。回收测序后,将得到的9条差异表达片段TDFs（Transcript derived fragments）进行克隆和序列分析,其中3条差异基因片段未搜索到任何同源蛋白,其余6个基因均按功能分类,可分为涉及能量代谢、植物细胞壁蛋白相关基因、液泡加工酶基因和未知功能基因。表明cDNASRAP方法简单、重复性好、试验成本低,完全适用于差异表达分析,从中获得一些与甘蓝抗黑腐病相关的差异基因片段,可用于甘蓝抗黑腐病的分子机理研究。 展开更多

关键词 甘蓝 黑腐病 cdna-srap

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用cDNA-SRAP技术分离蜡梅花发育不同时期差异表达基因片段 被引量：6

6

作者 赵凯歌 王文颖 陈龙清 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期693-698,共6页

应用cDNA-SRAP标记方法,筛选出19对引物,对8-12月所采集的24个蜡梅花芽(花朵)样品所制备的cDNA模板进行扩增,研究蜡梅花发育各时期的基因表达情况,并对部分差异片段进行了表达分析和功能预测。结果表明,cDNA-SRAP分子标记技术操作简便,... 应用cDNA-SRAP标记方法,筛选出19对引物,对8-12月所采集的24个蜡梅花芽(花朵)样品所制备的cDNA模板进行扩增,研究蜡梅花发育各时期的基因表达情况,并对部分差异片段进行了表达分析和功能预测。结果表明,cDNA-SRAP分子标记技术操作简便,能产生较丰富的条带,是进行差异显示分析研究的有效途径;与玉米淀粉去分支酶基因、欧洲山杨纤维素合成酶基因、玉米抗锈病基因和小麦多酚氧化酶基因相似性高的差异表达片段,可能对蜡梅花发育和抗性表现起着重要的作用。 展开更多

关键词 蜡梅 cdna-srap 差异显示 基因表达 发育阶段

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山楂果实不同组织RNA提取方法比较及cDNA-SRAP分析体系的建立 被引量：4

7

作者 乔燕春 吕德国 +1 位作者 郭栋梁 杨运英 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期915-919,共5页

以软籽山楂为材料,采用改良Trizol法和改良热硼酸法提取果肉、种核和种子部位的总RNA。经核酸蛋白测定仪测定和凝胶电泳显示:改良Trizol法可以从山楂果肉、种核部位提取到高质量的RNA,所得RNA的A260/A230均大于2.0,A260/A230分别为1.92... 以软籽山楂为材料,采用改良Trizol法和改良热硼酸法提取果肉、种核和种子部位的总RNA。经核酸蛋白测定仪测定和凝胶电泳显示:改良Trizol法可以从山楂果肉、种核部位提取到高质量的RNA,所得RNA的A260/A230均大于2.0,A260/A230分别为1.92和1.84,但其产量较低,分别为60.3μg·g-1和46.2μg·g-1。改良Trizol法不能从种子中提取得到完整的RNA。改良热硼酸法可以从山楂果肉、种核和种子部位提取到高质量的RNA,所得RNA的A260/A230均大于2.0,A260/A230分别为1.88、1.93和1.93,其RNA产量也较改良Trizol法高,分别为600.2、507.4和490.8μg·g-1。将改良热硼酸法分离的RNA用于cDNA-SRAP分析,获得的条带清晰,表明其质量完全可以满足进一步分子生物学研究的要求。 展开更多

关键词 山楂果实 不同组织 RNA cdna-srap

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玉米cDNA-SRAP反应体系的优化 被引量：7

8

作者 苏亮 白建荣 王秀红 《山西农业科学》 2010年第8期6-9,60,共5页

利用cDNA-SRAP技术对玉米耐低磷相关基因进行mRNA水平的基因差异表达分析,并对cD-NA-SRAP扩增条件进行了优化,获得了最佳的cDNA-SRAP反应体系：总体积20μL,cDNA模板140 ng,dNTP 0.25 mmol/L,Mg^2＋浓度为1.8 mmol/L,正、反向引物浓度... 利用cDNA-SRAP技术对玉米耐低磷相关基因进行mRNA水平的基因差异表达分析,并对cD-NA-SRAP扩增条件进行了优化,获得了最佳的cDNA-SRAP反应体系：总体积20μL,cDNA模板140 ng,dNTP 0.25 mmol/L,Mg^2＋浓度为1.8 mmol/L,正、反向引物浓度分别为0.5μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U。 展开更多

关键词 玉米 差异表达 cdna-srap 优化

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基于cDNA-SRAP技术筛选的ATP合成酶CF_1-α亚单位基因(CTL-spn)与红花刺性状紧密连锁（英文） 被引量：1

9

作者 郭丹丹 郭庆华 +1 位作者 高越 郭美丽 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1052-1059,共8页

红花的花是传统的活血化瘀中药,但因其花序周围苞叶有刺非常不利于人工采摘。本研究采用cDNA-SRAP技术分析了与红花苞叶刺性状紧密连锁的基因。在分别建立红花F2代c DNA无刺池和有刺池的基础上,利用60对引物筛选与苞叶刺连锁的基因片段... 红花的花是传统的活血化瘀中药,但因其花序周围苞叶有刺非常不利于人工采摘。本研究采用cDNA-SRAP技术分析了与红花苞叶刺性状紧密连锁的基因。在分别建立红花F2代c DNA无刺池和有刺池的基础上,利用60对引物筛选与苞叶刺连锁的基因片段,获得6条与红花刺性状连锁的基因片段,其中基因GPY-1和GPY-2重组率低,与苞叶刺紧密连锁并成功测序。采用RACE技术,克隆了GPY-2 c DNA全长,命名为CTL-spn,生物信息学分析显示:CTL-spn全长1 679 bp,具有1 524 bp的开放阅读框,编码508个氨基酸。同源比对发现:CTL-spn表达蛋白与其他物种的ATP合成酶CF1-α亚基具有很高的同源性(97%)。半定量RT-PCR分析结果显示:GPY-1和GPY-2仅在有刺F2代单株中表达。因此,红花ATP合成酶CF1-α亚基基因(CTL-spn)可能直接参与了红花刺性状的形成从而提高了有刺红花的抗逆性,这一发现为红花无刺品种的选育提供了重要思路。 展开更多

关键词 红花 有刺/无刺 cdna-srap ATP合成酶

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黄鳝粘液雌雄差异的cDNA-SRAP分析 被引量：1

10

作者 胡彬 曹哲明 +1 位作者 丁炜东 邴旭文 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期74-78,共5页

采用cDNA-SRAP技术对黄鳝雌雄粘液进行基因差异表达分析,筛选黄鳝体表粘液中与性别相关的分子标记。从64对引物组合中筛选出12对引物组合,共获得123个稳定清晰的扩增位点,并筛选出4条雌雄有差异的条带。这4条特异性条带经过回收、克隆... 采用cDNA-SRAP技术对黄鳝雌雄粘液进行基因差异表达分析,筛选黄鳝体表粘液中与性别相关的分子标记。从64对引物组合中筛选出12对引物组合,共获得123个稳定清晰的扩增位点,并筛选出4条雌雄有差异的条带。这4条特异性条带经过回收、克隆、测序后,将测序结果进行Blast分析,结果发现在GenBank中只有片段1与白鳍豚硫酸盐/硫代硫酸盐CYSA样进口ATP结合盒蛋白有较高的同源性。根据片段1的序列设计1对引物进行半定量RT-PCR反应,结果发现,片段1在雌雄黄鳝体表粘液均可获得扩增条带,但其在雄性粘液中的表达量显著高于雌性。这可能是由于雌雄黄鳝粘液中所存在的表皮细胞和粘液腺细胞有差异所致。 展开更多

关键词 黄鳝 粘液 cdna-srap技术 性别特异 分子标记

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cDNA-SRAP技术在植物基因表达差异分析中的应用 被引量：2

11

作者 刘洋 高宝嘉 +1 位作者 张斌 陈明叶 《河北林果研究》 2016年第2期146-150,共5页

相关序列扩增多态性(SRAP)是基于PCR的新型分子标记系统。文章综述了现今植物基因表达差异分析中的常用方法,并简单介绍了cDNA-SRAP技术的原理、方法、步骤、优点,及其研究现状和前景。该方法具有简单便捷、结果稳定、重复性好、试验成... 相关序列扩增多态性(SRAP)是基于PCR的新型分子标记系统。文章综述了现今植物基因表达差异分析中的常用方法,并简单介绍了cDNA-SRAP技术的原理、方法、步骤、优点,及其研究现状和前景。该方法具有简单便捷、结果稳定、重复性好、试验成本低的优点,将会成为基因表达研究的有力工具。随着分子标记技术的发展和新技术的出现,不同分子标记和技术的相互结合使用将会在发现新基因、比较植物不同生长发育时期的基因表达、构建植物转录图谱和植物抗逆分子机制研究等方面发挥重要作用。 展开更多

关键词 相关序列扩增多态性 分子标记 cdna-srap 植物 基因表达差异

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茶树cDNA-SRAP体系正交优化研究 被引量：3

12

作者 王晓 沈程文 +3 位作者 周跃斌 齐冬晴 蔡翔 段一凡 《茶叶通讯》 2015年第1期22-26,共5页

采用正交设计L9(34)对茶树良种湘妃翠cDNA-SRAP体系中的四因素在三个水平上进行优化试验,在25μL反应体系中,最优组合为Mg2+浓度3.0mmol/L、Taq DNA聚合酶0.1U/μL、引物浓度0.8umol/L、dNTPs浓度0.2mmol/L。以筛选出的引物组合Me6/Em6... 采用正交设计L9(34)对茶树良种湘妃翠cDNA-SRAP体系中的四因素在三个水平上进行优化试验,在25μL反应体系中,最优组合为Mg2+浓度3.0mmol/L、Taq DNA聚合酶0.1U/μL、引物浓度0.8umol/L、dNTPs浓度0.2mmol/L。以筛选出的引物组合Me6/Em6、Me7/Em6和Me7/Em7在湘妃翠、安吉白茶、龙井长叶、安茗早和湘波绿五个茶树品种材料上进行验证,表明该组合具有较好的稳定性。 展开更多

关键词 茶树 cdna-srap 正交设计 优化

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柱花草cDNA-SRAP反应体系的建立 被引量：2

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作者 韩蓉蓉 史亮涛 +5 位作者 刘国道 何光熊 文亦芾 曾黎琼 金杰 姜飞 《草业与畜牧》 2015年第2期8-11,共4页

以热研5号柱花草为材料提取RNA,进行反转录合成c DNA第一链,对影响SRAP反应体系的主要因素进行了优化,建立了柱花草的c DNA-SRAP反应体系。结果表明,20μL反应体系中,最佳cDNA模板用量为200ng、Mg2+浓度为2.5mmol/L、引物浓度为0.4μmo... 以热研5号柱花草为材料提取RNA,进行反转录合成c DNA第一链,对影响SRAP反应体系的主要因素进行了优化,建立了柱花草的c DNA-SRAP反应体系。结果表明,20μL反应体系中,最佳cDNA模板用量为200ng、Mg2+浓度为2.5mmol/L、引物浓度为0.4μmol/L、d NTP浓度为0.25mmol/L、Taq酶用量为1U。为利用c DNA-SRAP标记技术对柱花草进行分子生物学研究及分子育种奠定基础。 展开更多

关键词 柱花草 cdna-srap 反应体系

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两种独行菜种子cDNA-SRAP反应体系的建立及优化

14

作者 李佳 张娜 +1 位作者 赖晓辉 李群 《北方园艺》 CAS 北大核心 2016年第24期99-103,共5页

以2种独行菜种子为试材,采用cDNA-SRAP技术,研究了dNTPs、Mg^(2+)、上下游引物、cDNA模板、Taq DNA聚合酶浓度等5个因素对独行菜cDNA-SRAP反应体系扩增结果的影响,以期得到适合2种独行菜种子的cDNA-SRAP反应体系,并且对cDNA-SRAP扩增条... 以2种独行菜种子为试材,采用cDNA-SRAP技术,研究了dNTPs、Mg^(2+)、上下游引物、cDNA模板、Taq DNA聚合酶浓度等5个因素对独行菜cDNA-SRAP反应体系扩增结果的影响,以期得到适合2种独行菜种子的cDNA-SRAP反应体系,并且对cDNA-SRAP扩增条件进行了优化。结果表明:优化的最佳cDNA-SRAP反应体系(20μL)为10×PCR buffer,cDNA模板用量100ng,Mg^(2+)浓度1.75mmol·L^(-1),dNTPs浓度0.275mmol·L^(-1),引物浓度1.0μmol·L^(-1),Taq DNA聚合酶用量0.5U;利用优化的cDNA-SRAP反应体系能够扩增获得清晰、数目多的条带,可用于后续深入研究2种独行菜不同处理下差异表达基因。 展开更多

关键词 独行菜 cdna-srap 单因素试验 正交实验设计

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白花泡桐茎和叶差异表达的cDNA-SRAP分析

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作者 茹广欣 周霜晴 +2 位作者 朱秀红 刘小囡 王鋆瑞 《河南农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第4期481-486,共6页

以白花泡桐茎和叶为材料,利用cDNA-SRAP分子标记技术,对其进行基因表达的差异分析。从64对引物中筛选出25对扩增效果较好的引物对进行扩增,检测得到36个差异片段,2次PCR扩增重复率为66.8%。经挑选回收、克隆和测序,最终测得23条差异片... 以白花泡桐茎和叶为材料,利用cDNA-SRAP分子标记技术,对其进行基因表达的差异分析。从64对引物中筛选出25对扩增效果较好的引物对进行扩增,检测得到36个差异片段,2次PCR扩增重复率为66.8%。经挑选回收、克隆和测序,最终测得23条差异片段序列,长度主要在400~1 700bp之间。经BLASTX进行比对和功能分析,16条与已知功能基因有较高同源性,包含能量与代谢(34.78%)、蛋白质合成(8.70%)、细胞壁相关(4.35%)、信号传导与胁迫响应(8.70%)及复合影响(13.04%)等多个方面;7条与未知功能基因序列有较高同源性。 展开更多

关键词 cdna-srap 白花泡桐 差异片段 功能分析

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利用cDNA-SRAP技术分析天麻与蜜环菌共生时差异表达基因片段 被引量：2

16

作者 黄万兵 桂阳 +4 位作者 卢颖颖 杨通静 朱国胜 侯颖辉 莫远琪 《中药材》 CAS 北大核心 2019年第6期1267-1272,共6页

目的:探索天麻与蜜环菌共生时的分子调控机制。方法:以红天麻与蜜环菌共培养时不同形态的白麻作为研究材料,利用cDNA-SRAP技术分析红天麻在与蜜环菌共生前后的差异表达基因。结果:被侵染的白麻在转录水平获得53条特异的差异条带,未被侵... 目的:探索天麻与蜜环菌共生时的分子调控机制。方法:以红天麻与蜜环菌共培养时不同形态的白麻作为研究材料,利用cDNA-SRAP技术分析红天麻在与蜜环菌共生前后的差异表达基因。结果:被侵染的白麻在转录水平获得53条特异的差异条带,未被侵染白麻为64条。从被侵染白麻的差异表达基因片段S-TDFs中选取稳定的31个片段进行TA克隆和序列比对分析,按照功能预测可分为7类,即能量与代谢、转录调控、细胞膜通透性、自交不亲和性、染色质重塑、抗性相关及未知功能基因。部分S-TDFs荧光定量(qPCR)结果也与cDNA-SRAP表达谱结果一致。结论:cDNA-SRAP技术适宜分析天麻与蜜环菌共培养时差异表达基因,可作为研究二者共生分子调控机制的前期有效手段;能量和代谢方面的S-TDFs在分子水平上验证了天麻的生活史离不开蜜环菌。 展开更多

关键词 天麻 cdna-srap 差异表达 共生

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烟草杂交组合Florda301×GDH94的杂种优势表现和cDNA-SRAP分析 被引量：2

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作者 邹序生 张启发 +2 位作者 谢瑞 卢光明 聂琼 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期3989-3995,共7页

为了解烟草杂交组合Florda301×GDH94的杂种优势表现及其形成原因,我们分析了该组合的6个农艺性状的杂种优势表现,并利用主成分分析法对各农艺性状的贡献进行了分析;利用6对SRAP引物,对Florda301×GDH94及其亲本进行c DNA-SRAP... 为了解烟草杂交组合Florda301×GDH94的杂种优势表现及其形成原因,我们分析了该组合的6个农艺性状的杂种优势表现,并利用主成分分析法对各农艺性状的贡献进行了分析;利用6对SRAP引物,对Florda301×GDH94及其亲本进行c DNA-SRAP差异表达分析,并对差异表达片段进行克隆测序分析。结果表明:超高亲优势表现为株高>叶数>叶厚>叶长>叶宽>叶面积;中亲优势表现为株高>叶数>叶面积>叶长>叶宽>叶厚。叶面积和叶长、叶宽,叶长与叶宽呈极显著相关。主成分分析将6个农艺性状简化为3个主成分,即叶产量因子、长势因子、叶数因子,提供的信息占全部信息量的95.99%。6对SRAP引物在Florda301×GDH94及其亲本中共扩增出66条带,其中差异条带32条,占48.48%;差异表达类型分为UNF1、ABF1、UNP1、UNP2、DMP、DMP2六种,分别占:19.20%、8.04%、4.60%、5.75%、2.30%、6.90%。从杂种特异表达片段中分离的两条片段分别与GDP-甘露糖4,6-脱水酶和蔗糖6-果糖基转移酶同源。本研究结果为烟草农艺性状杂种优势研究提供基础理论参考。 展开更多

关键词 cdna-srap 农艺性状 杂种优势

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光质对离体诱导棕色棉纤维基因表达影响的cDNA-SRAP分析 被引量：6

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作者 陈沙沙 樊洪泓 +4 位作者 关蕾 林毅 蔡永萍 钱森和 孙旭 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2014年第1期34-40,共7页

以离体培养棕色棉纤维(暗培养10 d)为材料,分别用红、黄、蓝、白光进行处理,在24 h光照条件下培养10d后,利用cDNA-SRAP技术对其基因表达进行分析。对其中16个差异片段测序后进行同源性比对和功能分析表明:2个序列功能与植物抗逆性有关(C... 以离体培养棕色棉纤维(暗培养10 d)为材料,分别用红、黄、蓝、白光进行处理,在24 h光照条件下培养10d后,利用cDNA-SRAP技术对其基因表达进行分析。对其中16个差异片段测序后进行同源性比对和功能分析表明:2个序列功能与植物抗逆性有关(CNGC5类似蛋白基因、(+)-δ-杜松烯合成酶);3个序列与生物代谢相关(β-1,3-葡聚糖酶13基因、质膜胆碱转运蛋白基因、tau类谷胱甘肽转移酶基因)。其中,谷胱甘肽转移酶基因与原花青素合成前体物质的转运有关,光质可能通过影响谷胱甘肽转移酶基因进而对原花青素的合成产生影响。 展开更多

关键词 离体培养 cDNA—SRAP 谷胱甘肽转移酶 植物抗逆性

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应用cDNA-SRAP研究大黄不同功效组分型特异表达基因 被引量：5

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作者 刘娟 魏胜利 +3 位作者 刘春生 程小丽 张晓芹 郭争争 《中国实验方剂学杂志》 CAS 北大核心 2013年第11期140-143,共4页

目的:探讨生态环境和遗传背景相同条件下3种不同化学变异类型大黄在基因表达水平上的差异,揭示大黄种内变异的分子机制。方法:采用cDNA-SRAP生物信息学方法,对不同化学变异类型大黄地下组织特异表达的基因进行分析和功能预测。结果:共获... 目的:探讨生态环境和遗传背景相同条件下3种不同化学变异类型大黄在基因表达水平上的差异,揭示大黄种内变异的分子机制。方法:采用cDNA-SRAP生物信息学方法,对不同化学变异类型大黄地下组织特异表达的基因进行分析和功能预测。结果:共获得5条差异表达基因片段和4条表达量有明显差异的公共条带,其中4条功能已知,分别与植物生长发育及光信号转导、植物抗病性及水分运输相关,5条功能未知。结论:克隆了不同化学变异类型大黄特异表达的基因,为筛选优良变异类型、品种选育、功能基因组的研究提供参考。 展开更多

关键词 大黄 变异类型 cDNA—SRAP 差异表达基因

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应用cDNA-SRAP标记比较苹果梨与延光梨果皮性状的表达差异

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作者 崔百会 金炳奎 +2 位作者 杨洋 曹后男 宗成文 《延边大学农学学报》 2016年第3期192-198,共7页

以苹果梨和延光梨果皮为试材,对盛花后7周的苹果梨和延光梨果皮cDNA进行SRAP-PCR检测,找出2个梨品种(系)在转录水平的差异,共扩增出444条可被应用的条带。2个品种间的相似性极高,仅检测到2个差异片段,多态性为0.45%。其中,ME7-EM5引物... 以苹果梨和延光梨果皮为试材,对盛花后7周的苹果梨和延光梨果皮cDNA进行SRAP-PCR检测,找出2个梨品种(系)在转录水平的差异,共扩增出444条可被应用的条带。2个品种间的相似性极高,仅检测到2个差异片段,多态性为0.45%。其中,ME7-EM5引物组合扩增出的差异条带是因为核苷酸序列包含内含子序列,为模板中存在的少量DNA扩增;ME4-EM3引物组合扩增出的差异条带经回收测序,于Blast上比对得知其为植物凝集素基因,经半定量RT-PCR验证多态性消失,判断差异条带可能是由于苹果梨与延光梨引物结合位点存在差异而致。 展开更多

关键词 苹果梨 延光梨 芽变 cdna-srap

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