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Differentiation of genetic diversity and byssal phenotype among wild populations of Mytilus coruscus located at different latitudes
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作者 LIN Yuetong WANG Yuqing +2 位作者 NI Jiyue LI Yifeng LU Xia 《水产学报》 北大核心 2025年第8期109-120,共12页
The mussel is one of the main cultivated species in the world.A significant challenge faced by suspension-cultured mussels is the high incidence of mussel fall-off from cultivation ropes,adversely impacting harvest yi... The mussel is one of the main cultivated species in the world.A significant challenge faced by suspension-cultured mussels is the high incidence of mussel fall-off from cultivation ropes,adversely impacting harvest yields,which have been documented at commercial mussel farms in the United Kingdom,the United States of America,Canada,Spain,New Zealand and China.Byssus is an important attachment structure for marine mussels,and weakness in byssal thread attachment is a major factor leading to mussel detachment from ropes.To investigate the relationship between genetic variability and byssal thread phenotypic characteristics in the hard-shelled mussel(Mytilus coruscus),we collected three wild populations of M.coruscus from different latitudes in the East China Sea,including the Shengsi(SS),Jiaojiang(JJ),and Fuding(FD)populations.The genetic diversity and structure of these populations were investigated using 10 microsatellite loci.The mean observed heterozygosity(Ho)in the SS population was 0.44,higher than the mean Ho values of the JJ(0.40)and FD(0.39)populations.The mean inbreeding coefficients(F_(is))in the SS population was 0.20,lower than the mean F_(is)values of the JJ(0.33)and FD populations(0.40).These results revealed that the SS population exhibited higher genetic diversity compared to the other two populations.The different numbers of private alleles(P_(a))in the three populations,ranging from 10 to 17,suggest that these populations have experienced selective pressures from various environments.Moreover,genetic differentiation was observed in the genetic distance between the SS population and the other two populations.We also examined the phenotypic characteristics of their byssal threads.There were significant differences in byssus attachment strength among the three populations,with the SS population located at the highest latitude secreting more byssal threads and exhibiting greater byssal breaking force and plaque adhesion strength,while the Fuding(FD)population located at the lowest latitude had the weakest byssal attachment.The observed differentiation in private alleles and byssus phenotypes might suggest that the three wild populations have experienced different environmental selective pressures.This study provides insight for future genetic enhancement programs aimed at improving byssus attachment in M.coruscus. 展开更多
关键词 Mytilus coruscus MICROSATELLITE genetic diversity genetic structure byssal phenotype
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利用质谱技术结合EST库搜索鉴定厚壳贻贝新型足丝蛋白(英文) 被引量:1
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作者 孙敬敬 李楠楠 +1 位作者 王信超 廖智 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期75-84,共10页
贻贝利用足丝粘附于水下各种基质表面.作为一种具有优异粘附性能的生物材料,贻贝足丝蛋白在新型水下粘附剂及表面保护涂层的研制与开发中具有重要的仿生学意义.目前,已报道的贻贝足丝蛋白分子达11种,但是仍然有更多的足丝蛋白分子不为人... 贻贝利用足丝粘附于水下各种基质表面.作为一种具有优异粘附性能的生物材料,贻贝足丝蛋白在新型水下粘附剂及表面保护涂层的研制与开发中具有重要的仿生学意义.目前,已报道的贻贝足丝蛋白分子达11种,但是仍然有更多的足丝蛋白分子不为人知.为进一步探讨贻贝足丝蛋白的分子多样性,并从中筛选具有特殊生物学功能的足丝蛋白分子,本文采用鸟枪法-液相色谱-质谱/质谱技术(shotgun-LC-MS/MS)对厚壳贻贝足丝蛋白进行了蛋白质组学分析.将厚壳贻贝足丝分为足丝纤维和足丝盘两部分,每一部分均采用醋酸-尿素溶液,以及醋酸-盐酸胍溶液进行蛋白质抽提;抽提后的足丝蛋白经胰蛋白酶酶解,利用线性离子阱四级杆质谱(LTQ)进行鸟枪法质谱分析.二级质谱图(MS/MS)用以搜索公共数据库中的贻贝表达序列标签(expressed sequence tag,EST)数据库.采用上述方法,获得14种贻贝新型足丝蛋白的高可信度结果及其所匹配的部分或全长cDNA序列;经结构域分析,发现上述新型贻贝足丝蛋白分子的序列中多数包含各种类型的结构域,包括胶原蛋白结构域、C1Q结构域、C1Q结合结构域、微管蛋白辅助折叠结构域、蛋白酶拮抗结构域、VWA结构域、几丁质酶结构域等.在此基础上,对上述新型足丝蛋白在贻贝足丝形成以及粘附方面的功能进行了推测.上述结果对进一步了解贻贝足丝的分子组成以及粘附机理奠定了基础. 展开更多
关键词 厚壳贻贝 足丝蛋白 鸟枪法-液相色谱-质谱 质谱 表达序列标签
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论晚二叠世的“克氏蛤” 被引量:6
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作者 方宗杰 《古生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第6期653-661,793,共9页
系统评述了目前世界上已发现的晚二叠世克氏蛤类标本,并描述采自贵州、云南、藏东的有关化石1属3种,其中1新属1新种.右壳足丝凹口特征在克氏蛤类研究中具有重要意义.晚二叠世的Claraioides gen.nov.以足丝凹口内端明显向腹方或后腹方扩... 系统评述了目前世界上已发现的晚二叠世克氏蛤类标本,并描述采自贵州、云南、藏东的有关化石1属3种,其中1新属1新种.右壳足丝凹口特征在克氏蛤类研究中具有重要意义.晚二叠世的Claraioides gen.nov.以足丝凹口内端明显向腹方或后腹方扩展膨大成足丝凹湾而不同于早三叠世的Claraia.后者似由前者演化而来,它们在二叠-三叠系界线附近发生替代,可能与古生代末的绝灭事件相关. 展开更多
关键词 晚二叠世 足丝凹湾 克氏蛤类 化石
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论Aucellina与Buchia的区别 被引量:4
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作者 沙金庚 《地质论评》 CAS CSCD 北大核心 1992年第2期131-139,T001,共10页
Aucellina和Buchia是两个典型的外表形态趋同,但又分别是中Barremian—早Cenomanian和Oxfordian—Hauterivian期的双壳类分层化石。本文从足丝耳、足丝凹口和弹体窝形态,铰合区的韧带分布范围,假丝梳的存在与否,双壳不等程度,后耳和壳... Aucellina和Buchia是两个典型的外表形态趋同,但又分别是中Barremian—早Cenomanian和Oxfordian—Hauterivian期的双壳类分层化石。本文从足丝耳、足丝凹口和弹体窝形态,铰合区的韧带分布范围,假丝梳的存在与否,双壳不等程度,后耳和壳表放射脊和同心脊发育状况,及地质历程诸方面讨论了这两属的形态区别和时代差异。 展开更多
关键词 Aucollina Buchia 足丝耳 假丝梳
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翡翠贻贝足丝器的组织结构观察 被引量:2
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作者 石琼 陈舜华 《热带海洋》 CSCD 1996年第2期13-16,T002,共5页
用光镜和电镜技术初步探讨了翡翠贻贝Pernaviridis足丝器(Byssalappratus)的三大组成部分之间的空间结构关系,着重观察足丝柄部发生器(BSG)的片层结构,揭示小片具有典型的胶原原纤维电镜特征。此外... 用光镜和电镜技术初步探讨了翡翠贻贝Pernaviridis足丝器(Byssalappratus)的三大组成部分之间的空间结构关系,着重观察足丝柄部发生器(BSG)的片层结构,揭示小片具有典型的胶原原纤维电镜特征。此外,通过足丝丝部的表面结构观察,发现可用众多的突起来解释足丝表面对放射性碘的强机械吸附作用;利用足丝丝部横切片,计算出其长径约105μm,短径约40μm。 展开更多
关键词 翡翠贻贝 足丝 足丝器 组织结构
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隆凸克氏蛤(Claraia tumida)(双壳纲)足丝凹口的再研究
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作者 方宗杰 《古生物学报》 CSCD 北大核心 2019年第1期72-78,共7页
简述Claraia tumida(Patte)的研究历史,依据共模标本再度描述研究其右壳的足丝凹口特征。《中国的瓣鳃类化石》一书中曾描述的本种的半轮状"足丝凹口",实际上是完全依照裂缝或破口的痕迹修剪而成,与真正的足丝凹口并无关系。... 简述Claraia tumida(Patte)的研究历史,依据共模标本再度描述研究其右壳的足丝凹口特征。《中国的瓣鳃类化石》一书中曾描述的本种的半轮状"足丝凹口",实际上是完全依照裂缝或破口的痕迹修剪而成,与真正的足丝凹口并无关系。这一虚假的"足丝凹口"近年来曾被广泛引用,企图借以证明本种和克氏蛤属也发育了Claraioides型足丝凹口。凡是由这个虚假的"足丝凹口"派生而来的观点和推论都不能成立。 展开更多
关键词 CLARAIA 足丝凹口 双壳类 二叠纪晚期-早三叠世
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基于Illumina测序的厚壳贻贝足组织转录组研究 被引量:2
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作者 潘齐冬 齐齐 +4 位作者 鲍林飞 秦传利 何建瑜 范美华 廖智 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期872-882,共11页
贻贝足丝是贻贝足组织分泌的足丝蛋白形成的非细胞组织,具有在水环境下的极强粘附性能,是当前生物粘附剂及抗腐蚀材料的研发热点.为进一步了解贻贝足丝蛋白的分子多样性特征,采用新一代Illumina高通量测序平台对厚壳贻贝(Mytilus corusc... 贻贝足丝是贻贝足组织分泌的足丝蛋白形成的非细胞组织,具有在水环境下的极强粘附性能,是当前生物粘附剂及抗腐蚀材料的研发热点.为进一步了解贻贝足丝蛋白的分子多样性特征,采用新一代Illumina高通量测序平台对厚壳贻贝(Mytilus coruscus)足组织进行转录组测序,首次构建了厚壳贻贝足组织的转录组数据库.共计获得7 199 799 840 nt的碱基数据.经过序列拼接和组装,获得88 825条unigene.对上述unigene开展了序列注释,共计37 007条unigene获得注释.在此基础上,经序列检索和比对,从中筛选出与目前已知的11种足丝蛋白同源的56条unigene序列并进行分析.结果表明,厚壳贻贝足丝蛋白具有明显的氨基酸偏好性,部分足丝蛋白具有重复序列,且厚壳贻贝足丝蛋白与其他种类的贻贝足丝蛋白具有较高的序列相似性.上述结果为后续贻贝足丝蛋白的批量鉴定以及在此基础上的贻贝足丝形成、固化以及粘附机制相关研究奠定了基础. 展开更多
关键词 厚壳贻贝 足丝 足丝蛋白 转录组
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3D打印仿贻贝足丝结构的黏附性能
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作者 徐万崟 谢宇 钱劲 《应用数学和力学》 CSCD 北大核心 2024年第3期261-272,共12页
贻贝足丝是一种自然界存在的高性能生物黏附器,能够在不同环境下提供贻贝⁃固体表面之间的黏附作用.近年来,许多研究者开始关注贻贝足丝的组成和宏微观结构对其黏附性能的定量影响,为仿生黏附器件的设计寻找思路.该文结合3D打印技术、脱... 贻贝足丝是一种自然界存在的高性能生物黏附器,能够在不同环境下提供贻贝⁃固体表面之间的黏附作用.近年来,许多研究者开始关注贻贝足丝的组成和宏微观结构对其黏附性能的定量影响,为仿生黏附器件的设计寻找思路.该文结合3D打印技术、脱黏实验和有限元方法,系统研究了形状和几何参数对仿贻贝足丝结构脱黏模式和黏附性能的影响机制.该文结果揭示了贻贝足丝的脱黏机理,发现贻贝足丝存在最优的足丝方向角,使其黏附性能最佳,探究了同一角度下足丝线⁃斑块连接位置和斑块底部形状对其黏附性能的影响.最后,模拟了束状仿贻贝足丝结构在竖直拉力作用下的完整脱黏过程,所获得的锯齿状脱黏曲线表明束状结构具有相对稳定的抗脱黏能力.这些研究结果有助于理解自然界贻贝足丝的脱黏行为,可为仿生黏附器件的优化设计提供基础和参考. 展开更多
关键词 贻贝足丝 仿生结构 结构因素 黏附性能 3D打印
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企鹅珍珠贝足丝蛋白3基因的克隆及其表达分析
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作者 杨蕾 陈一 +1 位作者 张佳谊 战欣 《水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期613-621,共9页
为探明企鹅珍珠贝足丝黏附的分子机理,基于企鹅珍珠贝转录组序列,应用RACE-PCR技术获得足丝蛋白3(BP3)基因的cDNA全长序列,通过实时荧光定量PCR技术分析BP3基因在有足丝企鹅珍珠贝各组织及有/无足丝个体足中的表达情况。结果显示,企鹅... 为探明企鹅珍珠贝足丝黏附的分子机理,基于企鹅珍珠贝转录组序列,应用RACE-PCR技术获得足丝蛋白3(BP3)基因的cDNA全长序列,通过实时荧光定量PCR技术分析BP3基因在有足丝企鹅珍珠贝各组织及有/无足丝个体足中的表达情况。结果显示,企鹅珍珠贝BP3基因cDNA全长为601 bp,开放阅读框长453 bp,共编码150个氨基酸,该基因5′端非编码区为71 bp, 3′端非编码区为77 bp。蛋白质分子质量为16.81 ku,等电点为7.33,是一种亲水性稳定膜外蛋白,主要定位于细胞外基质。氨基酸序列比对表明,企鹅珍珠贝足丝蛋白3与厚壳贻贝同源性最高,为30.34%。实时荧光定量PCR结果显示,各组织中均有BP3基因mRNA表达,表达量在外套膜组织中最高,与足、闭壳肌、珍珠状袋存在显著差异(P<0.05),而与鳃、唇瓣差异不显著(P>0.05),且在有足丝企鹅珍珠贝个体足中的表达量显著高于无足丝个体足(P<0.05)。本试验结果可为进一步探究企鹅珍珠贝足丝黏附的分子机理提供基础。 展开更多
关键词 企鹅珍珠贝 足丝蛋白3基因 基因克隆 基因表达模式
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