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Single-cell RNA sequencing的正则化方法（英文） 被引量：1
1
作者 Han Henry 刘文斌 《广州大学学报（自然科学版）》 CAS 2019年第2期44-55,共12页
正则化是scRNA-seq数据分析的核心并影响决定下游分析的质量.相比bulkRNA-seq,由于scRNA-seq的zero inflation,其正则化是一个尚未解决的问题.本研究给出了一个bias analysis framework对现有的scRNA-seq正则化方法进行评估比较.这个bia... 正则化是scRNA-seq数据分析的核心并影响决定下游分析的质量.相比bulkRNA-seq,由于scRNA-seq的zero inflation,其正则化是一个尚未解决的问题.本研究给出了一个bias analysis framework对现有的scRNA-seq正则化方法进行评估比较.这个bias analysis framework对scRNA-seq正则化提供了理论基础.同时作者比较了广为使用的bulkRNA-seq正则化方法,以及专为scRNA-seq设计的正则化方法在scRNA-seq基准数据聚类中的作用. 展开更多
关键词 bulkrna-seq scRNA-seq 正则化 biasanalysis DROPOUT zeroinflation
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