目的基于网络拓扑学、Bulk转录组学和空间转录组学探究绿茶多酚抗胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)的分子机制。方法利用网络拓扑学分析绿茶多酚抗PAAD的潜在作用靶点,基于BEST平台和GSCA数据库评估靶基因的富集通路和肿瘤免疫...目的基于网络拓扑学、Bulk转录组学和空间转录组学探究绿茶多酚抗胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)的分子机制。方法利用网络拓扑学分析绿茶多酚抗PAAD的潜在作用靶点,基于BEST平台和GSCA数据库评估靶基因的富集通路和肿瘤免疫微环境,通过SpatialTME数据库探究靶基因的空间作用机制。结果绿茶多酚能够通过多条通路和多靶点干预PAAD的发生发展。靶基因表达水平与受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine kinase,RTK)信号通路呈显著正相关关系。此外,靶基因表达与中性粒细胞(neutrophil)、辅助性T细胞2型(T helper 2 cell,Th2)和初始CD4阳性T淋巴细胞(naive CD4-positive T lymphocyte,CD4_naive)浸润丰度呈显著负相关关系(P<0.05),而与黏膜相关恒定T细胞(mucosal-associated invariant T cells,MAIT)、CD4阳性T淋巴细胞(CD4-positive T lymphocyte,CD4_T)和1型调节性T细胞(type 1 regulatory T cell,Tr1)等丰度呈显著正相关关系(P<0.05)。靶基因在免疫治疗抗程序性细胞死亡蛋白1(programmed cell death protein 1,PD-1)和抗PD-1/程序性死亡配体1(PD-1/programmed death-ligand 1,PD-1/PD-L1)队列中能够显著区分有反应者和无反应者。结论本研究揭示了绿茶多酚干预PAAD的组织定位机制,提示靶基因有望作为PAAD的肿瘤标志物,对其临床诊断和治疗具有重要意义。展开更多
文摘目的基于网络拓扑学、Bulk转录组学和空间转录组学探究绿茶多酚抗胰腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)的分子机制。方法利用网络拓扑学分析绿茶多酚抗PAAD的潜在作用靶点,基于BEST平台和GSCA数据库评估靶基因的富集通路和肿瘤免疫微环境,通过SpatialTME数据库探究靶基因的空间作用机制。结果绿茶多酚能够通过多条通路和多靶点干预PAAD的发生发展。靶基因表达水平与受体酪氨酸激酶(receptor tyrosine kinase,RTK)信号通路呈显著正相关关系。此外,靶基因表达与中性粒细胞(neutrophil)、辅助性T细胞2型(T helper 2 cell,Th2)和初始CD4阳性T淋巴细胞(naive CD4-positive T lymphocyte,CD4_naive)浸润丰度呈显著负相关关系(P<0.05),而与黏膜相关恒定T细胞(mucosal-associated invariant T cells,MAIT)、CD4阳性T淋巴细胞(CD4-positive T lymphocyte,CD4_T)和1型调节性T细胞(type 1 regulatory T cell,Tr1)等丰度呈显著正相关关系(P<0.05)。靶基因在免疫治疗抗程序性细胞死亡蛋白1(programmed cell death protein 1,PD-1)和抗PD-1/程序性死亡配体1(PD-1/programmed death-ligand 1,PD-1/PD-L1)队列中能够显著区分有反应者和无反应者。结论本研究揭示了绿茶多酚干预PAAD的组织定位机制,提示靶基因有望作为PAAD的肿瘤标志物,对其临床诊断和治疗具有重要意义。
