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Establishment and application of a fibrosis/scar biospecimen repository and systematic research platform
1
作者 Zhiyuan Zhou Ya Gao +6 位作者 Chiakang Ho Dongsheng Wen Yangdan Liu Tingyu Tsai Yuxin Lin Qingfeng Li Yifan Zhang 《Chinese Journal of Plastic and Reconstructive Surgery》 2024年第4期199-205,共7页
Fibrosis is a pathological outcome of a dysregulated repair response to injury,which can occur in any organ and have devastating effects on hundreds of millions of patients worldwide.However,challenges remain in delin... Fibrosis is a pathological outcome of a dysregulated repair response to injury,which can occur in any organ and have devastating effects on hundreds of millions of patients worldwide.However,challenges remain in delineating the complex and dynamic network regulating fibrosis,as well as translating this information into effective anti-fibrotic treatments.A comprehensive understanding of existing methodologies and the development of new research tools are essential for ensuring the transferability of findings from bench to bedside.In this review,we present a framework consisting of a large biospecimen repository that integrates diverse patient cohorts with corresponding clinical data,and a systematic research platform incorporating multiple layers of experimental strategies,primarily focused on skin fibrosis.We summarize current advancements and the applications of various tools for preclinical fibrosis research and examine the limitations of traditional methods used to simulate and investigate biomechanical signals in the fibrotic environment.Importantly,we highlight the strengths of research techniques and translational approaches of varying physiological relevance developed by us over the past decade.Collectively,we emphasize a trend toward more faithfully replicating the functional,structural,and biological complexity of fibrosis while providing high spatio-temporal control over soluble cues and intricate interactions.Our comprehensive overview of methodology paves the way for minimizing batch-to-batch variation and improving the reproducibility of experimental systems. 展开更多
关键词 FIBROSIS biospecimen repository Clinical cohort Research platform
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人类生物样本资源共享利用模式探索——以浙江省肿瘤医院为例
2
作者 郑智国 朱骥 《中国肿瘤》 北大核心 2025年第11期884-890,共7页
近年来,医院生物样本库得到迅速发展,也建立了一些国家级和区域级生物样本库联盟。但是,人类生物样本资源共享利用机制尚未有效建立,是制约医院生物样本资源充分利用的重要因素之一。全文聚焦人类生物样本资源共享利用主题,分析共享模... 近年来,医院生物样本库得到迅速发展,也建立了一些国家级和区域级生物样本库联盟。但是,人类生物样本资源共享利用机制尚未有效建立,是制约医院生物样本资源充分利用的重要因素之一。全文聚焦人类生物样本资源共享利用主题,分析共享模式、共享问题,提出提高人类生物样本资源共享所要考虑的因素;并总结浙江省肿瘤医院实践,为医院生物样本资源共享提供案例,对医院生物样本资源共享利用进行总结和展望。 展开更多
关键词 生物样本库 人类生物样本资源 共享机制 医院实践
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《赫尔辛基宣言》中强化生物样本伦理治理及启示
3
作者 周吉银 徐玉梅 《医学与哲学》 北大核心 2025年第14期28-32,共5页
2024版《赫尔辛基宣言》强调使用生物样本要获得研究参与者自由和充分知情的同意,伦理委员会要监管生物样本库的建立和持续使用,我国生物样本研究伦理治理面临诸多挑战。适应我国生物样本库快速发展亟须规范治理的现状,使用生物样本研... 2024版《赫尔辛基宣言》强调使用生物样本要获得研究参与者自由和充分知情的同意,伦理委员会要监管生物样本库的建立和持续使用,我国生物样本研究伦理治理面临诸多挑战。适应我国生物样本库快速发展亟须规范治理的现状,使用生物样本研究的伦理审查要点包括:研究剩余生物样本明确目的的二次使用应当获得自由和充分知情的同意;通过严格的治理体系保障泛知情同意有效实施;规范有效使用免知情同意;加强对生物样本库使用的监管;探索委托第三方生物样本库存储,以更加全面地保护研究参与者的权益,促进生物样本库的规范化运行和有效利用。 展开更多
关键词 《赫尔辛基宣言》 生物样本 伦理治理
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免除伦理审查制度适法性与可操作性探讨 被引量:5
4
作者 赵励彦 张玉梅 刘瑞爽 《医学与哲学》 北大核心 2024年第2期24-27,共4页
结合我国现行法律和基本伦理原则,深入分析了免除伦理审查的前置条件和适用情形在适法性与可操作性上可能存在的问题,并在此基础上提出了可行性的建议:第一,明确监管范围,免除伦理审查是一种特殊的审查方式,而非不进行伦理审查;第二,全... 结合我国现行法律和基本伦理原则,深入分析了免除伦理审查的前置条件和适用情形在适法性与可操作性上可能存在的问题,并在此基础上提出了可行性的建议:第一,明确监管范围,免除伦理审查是一种特殊的审查方式,而非不进行伦理审查;第二,全面评估风险,对研究的风险判断不仅要考虑因研究给个人带来的生理风险,还应考虑其心理、经济、社会以及法律等方面的风险,尤其是对最小风险应明确界定;第三,界定前置条件中的具体概念,以及在此基础上适用情形的判断,制定具体、合理、合法的实施细则,为免除伦理审查的实施提供参考。 展开更多
关键词 免除伦理审查 知情同意 生物样本 个人信息 敏感个人信息 最小风险
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肌少症标准化生物样本和数据库建设中国专家共识 被引量:1
5
作者 中国医药生物技术协会组织生物样本库分会 上海交通大学医学院附属仁济医院 +3 位作者 翁玉蓉 胡耀敏 康晓楠 张小燕 《中国医药生物技术》 2024年第5期480-488,共9页
随着人口老龄化的不断加剧,肌少症患病率持续增高,肌少症标准化生物样本和数据库的建设对于进一步加深疾病研究及转化应用至关重要。由于目前国内外在此领域尚未建立统一共识,中国医药生物技术协会组织生物样本库分会、上海交通大学医... 随着人口老龄化的不断加剧,肌少症患病率持续增高,肌少症标准化生物样本和数据库的建设对于进一步加深疾病研究及转化应用至关重要。由于目前国内外在此领域尚未建立统一共识,中国医药生物技术协会组织生物样本库分会、上海交通大学医学院附属仁济医院老年医学科和生物样本资源中心联合全国老年医学领域、生物样本领域、衰老基础与临床研究领域的专家制订了本共识,旨在推动肌少症高质量生物样本和数据库的建设,以促进肌少症研究、精准诊治和临床转化。 展开更多
关键词 肌少症 生物样本 数据库 专家共识
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大型综合性医院生物样本信息资源大数据科研平台的建设与应用 被引量:8
6
作者 刘辉 蔡宏伟 +3 位作者 高娟娟 张琳珮 那天 王亚文 《医学信息学杂志》 CAS 2024年第1期77-82,共6页
目的/意义通过整合临床与生物样本信息,构建生物样本信息资源大数据科研平台,为科研人员提供一站式数据检索、集成、分析服务,建立数据治理体系,提升医院临床科研基础设施建设水平。方法/过程采用通用数据模型和数据治理技术,通过抽取... 目的/意义通过整合临床与生物样本信息,构建生物样本信息资源大数据科研平台,为科研人员提供一站式数据检索、集成、分析服务,建立数据治理体系,提升医院临床科研基础设施建设水平。方法/过程采用通用数据模型和数据治理技术,通过抽取、转换、加载等步骤整合来自不同厂商的数据源,提供统一数据访问入口。结果/结论该生物样本信息资源大数据科研平台具备多维数据筛查和快速集成分析的优势,可为临床科研提供支撑。 展开更多
关键词 生物样本 医疗大数据 数据治理 通用数据模型
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新医科背景下研究生生物样本管理教育的思考 被引量:2
7
作者 赖菁贞 陈泉 +2 位作者 余峰玲 尹富强 梁浩 《基础医学教育》 2024年第8期706-711,共6页
新医科建设需要生物大数据支持精准医学、转化医学等医学新专业的发展。生物样本作为生物大数据的来源,是医学科学研究的基础,是我国重要的战略资源;规范化生物样本管理是基于生物样本的高质量医学科学研究活动的重要保障。因此,面向医... 新医科建设需要生物大数据支持精准医学、转化医学等医学新专业的发展。生物样本作为生物大数据的来源,是医学科学研究的基础,是我国重要的战略资源;规范化生物样本管理是基于生物样本的高质量医学科学研究活动的重要保障。因此,面向医学研究生开展生物样本管理教育有利于提高医学科研质量和保护我国人类遗传资源。文章围绕医学研究生生物样本管理教育展开讨论,介绍生物样本库的概念,阐明生物样本库在科学研究和医学教育中的作用,分析生物样本管理在教学和科学研究中的重要性,探讨开展生物样本管理相关教育的方式方法,为医学研究生的生物样本管理教育提供建议方案,旨在提升未来高层次复合型医学人才开展科学研究工作的知识储备和技术能力。 展开更多
关键词 人类遗传资源 生物样本 生物样本库 医学研究生 新医科
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生物样本库及样本应用现状 被引量:20
8
作者 林敏 姜岩 +2 位作者 张亚南 闫寒冰 何晖 《现代肿瘤医学》 CAS 2016年第9期1490-1493,共4页
目前精准医疗成为热点,生物样本库则在恶性肿瘤、血液病、免疫系统疾病、代谢性疾病、心脑血管疾病等重大疾病的精准医疗过程中扮演着重要角色。样本在"试验台-临床"这个过程中扮演着不可或缺的地位。实体样本库、临床信息库... 目前精准医疗成为热点,生物样本库则在恶性肿瘤、血液病、免疫系统疾病、代谢性疾病、心脑血管疾病等重大疾病的精准医疗过程中扮演着重要角色。样本在"试验台-临床"这个过程中扮演着不可或缺的地位。实体样本库、临床信息库结合的建库思路已经深入人心,但是样本的使用问题则是目前国内遇到的难题。完善立法措施,建立行业规范,保证样本质量,建立可相互兼容的样本库平台是工作的重点。小型生物样本库的建设要立足规范化,立足于自身特色,以样本质量控制及应用为导向进行日常工作。 展开更多
关键词 生物样本库 生物样本 质量 应用
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医院如何建设富有生命力的生物样本资源库 被引量:6
9
作者 张可浩 郜恒骏 《中国肿瘤》 CAS 2015年第4期268-272,共5页
近十年来,国内医院生物样本资源库的建设有了长足的发展和进步。同时,各种困扰医院领导和广大生物样本资源库建设者的问题日益显现出来,并成为制约医院生物样本资源库进一步可持续健康发展的关键问题。全文总结作者十年来从事医院生物... 近十年来,国内医院生物样本资源库的建设有了长足的发展和进步。同时,各种困扰医院领导和广大生物样本资源库建设者的问题日益显现出来,并成为制约医院生物样本资源库进一步可持续健康发展的关键问题。全文总结作者十年来从事医院生物样本库建设以及第三方生物样本资源库中心建设的经验,针对目前医院生物样本资源库建设全过程可能存在的突出问题,从医院生物样本资源库的顶层设计与构建、生物样本资源质量管理体系建设、以及如何建立和完善生物样本资源库可持续健康发展的自身造血机制等宏观角度进行了较为系统地阐述。在一定程度上为医院领导和生物样本资源库建设者理清了思路和方向,破解了当前困扰医院生物样本资源库可持续健康发展的瓶颈问题,给医院生物样本资源库建设工作提供了有益的指导。 展开更多
关键词 医院 生物样本 资源 BIOBANK
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临床生物样本库血液样本的可控性采集和质量管理 被引量:14
10
作者 吴曼丽 王柱清 +1 位作者 罗凯 康晓楠 《转化医学杂志》 2016年第6期327-332,共6页
目的建立医疗过程中血液样本可控性采集模式,保证样本的采集、处理过程可回溯,为肿瘤、自身免疫性疾病、心脑血管疾病及代谢性疾病的研究提供高质量的血液样本。方法通过建立网络化样本采集管理流程,将样本采集电子申请、项目管理以及... 目的建立医疗过程中血液样本可控性采集模式,保证样本的采集、处理过程可回溯,为肿瘤、自身免疫性疾病、心脑血管疾病及代谢性疾病的研究提供高质量的血液样本。方法通过建立网络化样本采集管理流程,将样本采集电子申请、项目管理以及样本处理中涉及血液样本的各项前处理因素整合到电子工作程序中,保证标准流程的执行情况处于可控状态,形成规范化的血液采集、前处理、保存和管理办法。结果仁济医院血液样本库有临床疾病20余种,含有完整的临床及随访资料。血液样本与相应的组织样本、临床信息相匹配;系统记录每份样本采集时间、到库时间、入库时间等;可通过组合查询筛选相应质量要求的样本。共采集血液样本40 000余份,抽样检查90%的样本分子生物学指标稳定。结论仁济医院可控性血液采集、处理模式和管理模式为综合性医院血液生物样本库建设提供管理经验,为血液样本的规范化、高质量采集、前处理、保存提供详细操作经验参考,为肿瘤、自身免疫性疾病、心脑血管疾病及代谢性疾病的研究提供高质量的血液样本及信息资源。 展开更多
关键词 样本 生物样本库 血液样本库
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临床与生物样本信息整合平台建设 被引量:9
11
作者 于广军 崔文彬 +3 位作者 郑培永 杨佳泓 赵蓉 高解春 《中国卫生资源》 2014年第2期89-92,共4页
对上海市"临床与生物样本信息整合平台"建设的背景、意义、目标、内容、实现路径、关键技术、问题挑战、应用前景和效益等方面进行了全面阐述。
关键词 转化医学 生物样本库 临床信息 生物样本信息 整合平台
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生物样本中微囊藻毒素检测方法的研究进展 被引量:6
12
作者 谭瑶 舒为群 邱志群 《环境卫生学杂志》 北大核心 2014年第1期93-98,共6页
水体的富营养化导致水体频频发生水华,不但使水中微囊藻毒素含量升高,并能进入鱼、虾、贝类等水生动物体内,经食物链在人体内富集,危害人类健康。本文从检测原理、操作的难易程度、优缺点方面综述生物样本中微囊藻毒素的检测方法,并提... 水体的富营养化导致水体频频发生水华,不但使水中微囊藻毒素含量升高,并能进入鱼、虾、贝类等水生动物体内,经食物链在人体内富集,危害人类健康。本文从检测原理、操作的难易程度、优缺点方面综述生物样本中微囊藻毒素的检测方法,并提出展望。 展开更多
关键词 微囊藻毒素 生物样本
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院所融合发展模式下浙江省肿瘤医院科研管理的实践与探索 被引量:2
13
作者 杨凝 张盛洁 +2 位作者 娄懿 郑智国 李清林 《中国肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期742-746,共5页
在推进公立医院高质量发展背景下,浙江省肿瘤医院的科研管理工作逐步形成了院所深度融合发展模式下,以科研项目驱动、科研平台引领、国际合作助力、生物样本支撑的全方位、一体化的管理模式,为浙江省肿瘤医院向研究型肿瘤中心的转型升... 在推进公立医院高质量发展背景下,浙江省肿瘤医院的科研管理工作逐步形成了院所深度融合发展模式下,以科研项目驱动、科研平台引领、国际合作助力、生物样本支撑的全方位、一体化的管理模式,为浙江省肿瘤医院向研究型肿瘤中心的转型升级提供科研创新助力。 展开更多
关键词 科研管理 科研项目 科研平台 国际合作 生物样本 肿瘤医院 浙江
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绍兴地区肿瘤生物样本库的建设和管理 被引量:3
14
作者 李玉红 丁倩男 +1 位作者 王勋英 郭航远 《浙江医学》 CAS 2018年第16期1850-1854,共5页
目的建设标准化、规范化绍兴地区高发肿瘤生物样本库,为医学研究提供样本资源。方法 2015年12月建成绍兴地区高发肿瘤生物样本库,在进行质量控制和规范化管理的同时收集切除后的组织样本,包括癌组织、癌旁组织、远端正常组织及肿瘤患者... 目的建设标准化、规范化绍兴地区高发肿瘤生物样本库,为医学研究提供样本资源。方法 2015年12月建成绍兴地区高发肿瘤生物样本库,在进行质量控制和规范化管理的同时收集切除后的组织样本,包括癌组织、癌旁组织、远端正常组织及肿瘤患者外周血细胞和血清/血浆标本,置于-80℃低温冰箱或者液氮罐中冷冻保存;同时建立一套肿瘤标本库信息管理系统,存储患者病历信息和样本信息。结果共收集各类组织标本1 875管、血液标本2 008管、粪便标本122管以及骨髓标本14管;生物标本对应的临床信息完整度达100%。组织样本热缺血时间均数为(12±3)min,随机抽取10份组织标本,提取10份组织样本RNA,A260/A280值均数为1.92±0.02。结论绍兴地区肿瘤生物标本库已初步建成,形成一套肿瘤生物标本质量管理控制体系,为相关肿瘤研究提供标本资源。 展开更多
关键词 肿瘤生物标本库 信息系统 绍兴地区 规范化管理
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浙江省肿瘤医院生物样本库建立与发展 被引量:1
15
作者 葛明华 郑智国 +2 位作者 孙文勇 凌志强 徐海苗 《中国肿瘤》 CAS 2015年第4期273-275,共3页
肿瘤样本作为肿瘤基础研究与临床研究的宝贵资源,是肿瘤转化研究的基石。浙江省肿瘤医院生物样本库于2007年建立,现已拥有300多平方米独立场地,包括样本处理,储存,质控和技术平台等功能区,样本库信息系统采用实验室信息管理系统(LIMS)... 肿瘤样本作为肿瘤基础研究与临床研究的宝贵资源,是肿瘤转化研究的基石。浙江省肿瘤医院生物样本库于2007年建立,现已拥有300多平方米独立场地,包括样本处理,储存,质控和技术平台等功能区,样本库信息系统采用实验室信息管理系统(LIMS)进行管理。同时努力推动浙江省共享平台发展,牵头成立了中国医药生物技术协会组织生物样本库分会浙江协作组。 展开更多
关键词 生物样本库 共享平台 肿瘤医院
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以应用实践为指导的转化医学创新教学探索 被引量:4
16
作者 吉栩 张春燕 +1 位作者 赵晓静 刘春蕾 《中国继续医学教育》 2020年第17期9-12,共4页
在近年转化医学发展的推动之下,医学教育逐步在专科教学中融入转化医学的教学理念。中国人民解放军总医院、解放军医学院依托于自身生物样本库和转化医学实验平台的硬件设施以及临床科研需求,创新性开设了《生物样本与转化医学》课程,... 在近年转化医学发展的推动之下,医学教育逐步在专科教学中融入转化医学的教学理念。中国人民解放军总医院、解放军医学院依托于自身生物样本库和转化医学实验平台的硬件设施以及临床科研需求,创新性开设了《生物样本与转化医学》课程,为研究生提供体系化的转化医学研究教学。回顾2016年—2019年课程的授课内容和方式的演变和创新尝试,前沿技术主题内容和实践课程在总课时中比重逐步增加。依托于前沿技术以应用实践为指导的课程建设方案与科研的需求相吻合,获得了良好的反馈。在后续的教学实践中,将继续以应用实践为指导方针,借助网络等教学手段补充和完善现有案例式教学方式。 展开更多
关键词 转化医学 医学教育 生物样本 前沿技术 应用实践 案例式教学
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论生物样本的人格权局部共有及区分所有权 被引量:2
17
作者 刘瑞爽 《医学与哲学(A)》 北大核心 2017年第2期20-25,共6页
生物样本包括载体、环境暴露信息、遗传信息三个要素,其中遗传信息决定了对生物样本的研究与传统研究所引起的伦理法律问题的不同,主要包括同意的方式、再次同意、保密、样本和数据的所有权问题、利益的公正分配问题、商业化和利益冲突... 生物样本包括载体、环境暴露信息、遗传信息三个要素,其中遗传信息决定了对生物样本的研究与传统研究所引起的伦理法律问题的不同,主要包括同意的方式、再次同意、保密、样本和数据的所有权问题、利益的公正分配问题、商业化和利益冲突等。类似于建筑物的区分所有权现象,生物样本遗传信息具有多个权利主体的人格权益的局部共有以及财产权利区分所有的特性。"多个权利主体"包括但不限于样本提供者、血亲、族群乃至国家。样本提供者享有生物样本的原初所有权,但不享有研究机构的专利权。 展开更多
关键词 生物样本 生物样本库 遗传信息 所有权 隐私 知情同意 再次同意 广泛同意
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涉及病历记录及生物标本研究的伦理审查问题 被引量:2
18
作者 汪秀琴 《中国医学伦理学》 2014年第5期614-616,共3页
介绍了针对涉及病历记录及生物标本研究的伦理审查的不同方式,并对相关定义进行了说明,对是否属于涉及人的研究进行了分析。在此基础上提出,为了合理地保护受试者的权益,同时又不给研究者和伦理委员会自身增加不必要的负担,根据国际上... 介绍了针对涉及病历记录及生物标本研究的伦理审查的不同方式,并对相关定义进行了说明,对是否属于涉及人的研究进行了分析。在此基础上提出,为了合理地保护受试者的权益,同时又不给研究者和伦理委员会自身增加不必要的负担,根据国际上的相关做法,可以基于研究的风险大小,对涉及病历记录或生物标本的研究,采取免除伦理审查与快速审查不同的伦理审查与管理方式。 展开更多
关键词 生物标本研究 病历记录研究 伦理审查 伦理委员会 审查方式
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生物样本所有权及相关法律争议的处理与启示——以美国司法实践为例
19
作者 黄清华 《医学与哲学(A)》 北大核心 2017年第2期15-19,共5页
在生物样本库管理过程中,由于生物样本包含个人独特的生物信息,可能具有巨大的经济价值,生物样本的所有权可能成为捐赠者的关切,可派生出相关的知情同意、专利收益和不当得利问题。对此,美国案例法提示我们,生物样本捐赠者的同意捐赠,... 在生物样本库管理过程中,由于生物样本包含个人独特的生物信息,可能具有巨大的经济价值,生物样本的所有权可能成为捐赠者的关切,可派生出相关的知情同意、专利收益和不当得利问题。对此,美国案例法提示我们,生物样本捐赠者的同意捐赠,应当是被充分告知和知情的,强调明示的知情同意;生物样本库产权单位,应当建立相关专利的权属归其所有的知识产权政策;在与研究者和捐赠者的关系中,要求生物样本库产权单位明确实现利益分享的条件。这些规则,对于包括国家基因库在内的我国生物样本库的伦理和法制建设,具有启示意义和借鉴价值。 展开更多
关键词 生物样本 所有权 知情同意 专利收益 不当得利
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临床生物样本库信息系统建设与发展 被引量:21
20
作者 郭丹 杨文航 徐英春 《协和医学杂志》 2018年第1期81-86,共6页
随着转化医学的快速发展,临床生物样本库的作用日益凸显,其建设和应用日益受到关注和重视。信息管理系统是样本库的核心部分,其建设应立足于支撑样本库的运营、管理和服务全过程,通过建立样本信息数据采集流程、数据集成与交换系统及安... 随着转化医学的快速发展,临床生物样本库的作用日益凸显,其建设和应用日益受到关注和重视。信息管理系统是样本库的核心部分,其建设应立足于支撑样本库的运营、管理和服务全过程,通过建立样本信息数据采集流程、数据集成与交换系统及安全系统,形成一体化整合数据库和公共门户网站,实现生物样本、临床资料和分子数据等各种资源的高效管理和全面共享。 展开更多
关键词 临床生物样本库 信息系统 生物样本管理 公共网络平台
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