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棉花bZIP转录因子基因GhbZIP15的克隆与表达分析 被引量:10
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作者 李月 许朋斐 +4 位作者 陈全家 代培红 刘超 曲延英 刘晓东 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2015年第6期515-523,共9页
b ZIP转录因子在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。本研究依据生物信息学分析,采用RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)方法从棉花中克隆了一个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP15(Gen Bank登录号为KP938299)。... b ZIP转录因子在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。本研究依据生物信息学分析,采用RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)方法从棉花中克隆了一个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP15(Gen Bank登录号为KP938299)。该基因c DNA全长1980 bp,其开放阅读框为966 bp,编码321个氨基酸的蛋白,预测分子量为37.1 k D,等电点为7.44。SMART蛋白结构预测发现,该蛋白含有b ZIP家族典型的BRLZ碱性结构域和亮氨酸拉链,属于B-zip1家族。系统进化树分析表明Ghb ZIP15属于b ZIP转录因子AREB亚家族,和拟南芥A亚家族的Atb ZIP12,At ABF1和At ABF2亲缘关系最近。洋葱表皮细胞中瞬时表达分析表明,Ghb ZIP15主要定位于细胞核中。RT-PCR分析表明Ghb ZIP15对干旱、高盐、低温等处理都有一定程度的响应,推测该基因对棉花非生物胁迫的调控起重要作用。 展开更多
关键词 棉花 b ZIP转录因子 非生物胁迫 GHB ZIP15 克隆表达
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红掌两个bZIPs基因片段的克隆与低温响应特性分析 被引量:1
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作者 彭英 杜凤凤 +2 位作者 田丹青 潘晓韵 刘晓静 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期622-626,共5页
本研究以红掌‘Alabama’幼苗为材料,克隆了2个b ZIP转录因子基因Aab ZIP1和Aab ZIP2。Aab ZIP1片段长度462 bp,Aab ZIP2片段长度为369 bp,两基因核苷酸序列的相似度为46.97%,推定的氨基酸序列相似性为31.17%。Blastx发现两个基因均具... 本研究以红掌‘Alabama’幼苗为材料,克隆了2个b ZIP转录因子基因Aab ZIP1和Aab ZIP2。Aab ZIP1片段长度462 bp,Aab ZIP2片段长度为369 bp,两基因核苷酸序列的相似度为46.97%,推定的氨基酸序列相似性为31.17%。Blastx发现两个基因均具有亮氨酸拉链的保守结构域,具备b ZIP转录因子家族的基本特征。RT-PCR分析检测表明,低温处理后,Aab ZIP1基因为组成型表达,不响应低温胁迫;Aab ZIP2基因表达受低温诱导,其表达强度随着低温处理时间的延长而增强,Aab ZIP2可能在红掌的低温胁迫响应过程中起重要作用。 展开更多
关键词 红掌 BZIP 亮氨酸拉链 低温 克隆
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人参bZIP基因家族生物信息学分析 被引量:7
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作者 王思嘉 孙嘉莹 +4 位作者 刘美琦 任伟超 于欣欣 刘秀波 马伟 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期2786-2794,共9页
目的通过人参bZIP基因家族生物信息学分析,为人参功能基因开发利用提供理论依据。方法运用PlantTFDB数据库预测人参基因组中b ZIP基因;通过ExPASy网站得到人参bZIP基因家族信息和特征;使用MEME网站对PgbZIP基因家族保守基因序列进行分析... 目的通过人参bZIP基因家族生物信息学分析,为人参功能基因开发利用提供理论依据。方法运用PlantTFDB数据库预测人参基因组中b ZIP基因;通过ExPASy网站得到人参bZIP基因家族信息和特征;使用MEME网站对PgbZIP基因家族保守基因序列进行分析;运用MEGA软件建立PgbZIP基因家族系统进化关系;利用TBtools软件进行PgbZIP表达分析。结果人参基因组中含有157个bZIP基因家族成员,其中152个定位在细胞核,其余5个分别定位在叶绿体和内质网,相对分子质量在14009.93~83440.38,等电点在4.53~10.05,氨基酸数目在120~760 aa,除PgbZIP157以外,均为亲水蛋白。PgbZIP131在干旱胁迫下的表达量为83.47;PgbZIP99在根和盐胁迫条件下表达量均最高,分别为119.82和117.86;PgbZIP117在叶中表达量为48.54;花中PgbZIP106表达量最高为79.55;成熟果实中表达量最高是PgbZIP118,为119.32;PgbZIP101在未成熟果实中的表达量最高,且为65.32。结论推测PgbZIP99与同源基因AtbZIP11功能相似,可以调控根的分生组织活性;PgbZIP131在干旱胁迫条件下表达量最高,推测PgbZIP131对干旱胁迫有重要调控作用;A亚族成员ABF2/AREB1(AtbZIP36)、ABF3(Atb ZIP37)、ABF4/AREB2(AtbZIP38)参与干旱胁迫和盐胁迫调控,推测与A亚族成员具有同源关系的PgbZIP74、PgbZIP132、PgbZIP122、PgbZIP112在干旱胁迫和盐胁迫条件下具有相似调控作用。 展开更多
关键词 人参 BZIP 生物信息学 基因家族 盐胁迫 干旱胁迫
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棉花bZIP转录因子FD基因的发掘和GhFD基因的组织表达分析 被引量:3
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作者 张彦楠 于秀立 +2 位作者 吕新华 刘慧 黄先忠 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期2250-2260,共11页
在叶片中合成由FLOWERING LOCUS T(FT)编码的成花素蛋白通过韧皮部运输到顶端分生组织(SAM),与b ZIP转录因子FD相互作用形成复合物,激活花分生组织身份基因的表达,从而调节植物开花和其他的一些生物学过程。本研究以棉花全基因组数据库... 在叶片中合成由FLOWERING LOCUS T(FT)编码的成花素蛋白通过韧皮部运输到顶端分生组织(SAM),与b ZIP转录因子FD相互作用形成复合物,激活花分生组织身份基因的表达,从而调节植物开花和其他的一些生物学过程。本研究以棉花全基因组数据库为基础,发掘并得到18个棉花FD基因的序列并确定它们在各基因组染色体上的位置。生物信息学分析显示,棉花FD蛋白质分子量在15.69~28.24 k D之间,理论等电点在9.24~10.38之间,是一种非分泌性蛋白;亚细胞定位预测显示,棉花FD蛋白分布于细胞核上,是典型的核蛋白;氨基酸序列分析表明,棉花FD是一种亲水性蛋白,还存在着糖基化位点和磷酸化位点以及4个保守基序;进化分析表明,棉花FD1和FD2与葡萄Vv FD基因亲缘关系最近。组织表达分析表明,陆地棉10个Gh FD基因在不同组织中具有表达特征多样性,Gh FD5-D在纤维中的表达量最高,其余Gh FD基因均在SAM中的表达量最高,不同的表达特征表明它们可能具有不同的功能。这些结果为进一步解析棉花FD基因的功能和作用机理积累了有价值的资料。 展开更多
关键词 棉花 FD基因 b ZIP转录因子 基因表达
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胃癌组织lncRNA MAFG-AS1、miR-143-3p表达变化及其临床意义 被引量:2
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作者 赵艳争 佘坤 +3 位作者 郭青 季艳霞 王忠瑜 孙彩云 《山东医药》 CAS 2022年第1期5-9,共5页
目的观察胃癌组织长链非编码RNA(lncRNA)碱性亮氨酸拉链家族转录因子V-Maf鸟类肌筋膜纤维肉瘤癌基因同源物G-反义核糖核酸1(MAFG-AS1)、微小RNA-143-3p(miR-143-3p)表达变化,并探讨二者表达与患者临床病理特征和预后的关系。方法选择胃... 目的观察胃癌组织长链非编码RNA(lncRNA)碱性亮氨酸拉链家族转录因子V-Maf鸟类肌筋膜纤维肉瘤癌基因同源物G-反义核糖核酸1(MAFG-AS1)、微小RNA-143-3p(miR-143-3p)表达变化,并探讨二者表达与患者临床病理特征和预后的关系。方法选择胃癌患者105例,取手术切除的胃癌组织及其配对的癌旁正常组织,采用RT-qPCR技术检测lncRNA MAFG-AS1、miR-143-3p表达。收集胃癌患者临床病理资料和术后随访资料,分析胃癌组织lncRNA MAFG-AS1、miR-143-3p表达与患者临床病理特征和预后的关系。结果胃癌组织lncRNA MAFG-AS1相对表达量高于癌旁正常组织,miR-143-3p相对表达量低于癌旁正常组织(P均<0.05)。胃癌组织lncRNA MAFG-AS1、miR-143-3p表达与肿瘤组织分化程度、浸润深度、pTNM分期、淋巴结转移有关(P均<0.05),而与性别、年龄、肿瘤直径无关(P均>0.05)。胃癌组织lncRNA MAFG-AS1表达与miR-143-3p表达呈负相关关系(r=-0.699,P<0.05)。以lncRNA MAFG-AS1、miR-143-3p相对表达量的均数为临界值,将患者分为lncRNA MAFG-AS1高表达者55例与lncRNA MAFG-AS1低表达者50例、miR-143-3p高表达者48例与miR-143-3p低表达者57例。lncRNA MAFG-AS1高表达者3年总生存率低于lncRNA MAFG-AS1低表达者,miR-143-3p高表达者3年总生存率高于miR-143-3p低表达者(χ^(2)分别为4.783、5.383,P均<0.05)。结论胃癌组织lncRNA MAFG-AS1表达上调、miR-143-3p表达下调,二者表达变化与胃癌恶性生物学行为和患者预后不良有关。 展开更多
关键词 胃癌 长链非编码RNA 碱性亮氨酸拉链家族转录因子V-Maf鸟类肌筋膜纤维肉瘤癌基因同源物G-反义核糖核酸1 微小RNA-143-3p 临床病理特征 预后
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Maf家族蛋白的组成及功能 被引量:3
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作者 运晨霞 吴光 王坤 《医学分子生物学杂志》 CAS CSCD 2008年第1期82-86,共5页
Maf家族蛋白是一群结构相似、具有典型的碱性结构域和b-Zip基序的转录因子,可以与细胞核内含有b-Zip基序的其他家族的转录因子结合形成同源或异源二聚体,再与DNA上的特异性序列Maf识别元件(Maf recognition elements,MARE)结合,调节相... Maf家族蛋白是一群结构相似、具有典型的碱性结构域和b-Zip基序的转录因子,可以与细胞核内含有b-Zip基序的其他家族的转录因子结合形成同源或异源二聚体,再与DNA上的特异性序列Maf识别元件(Maf recognition elements,MARE)结合,调节相应基因转录。在胚胎母系红细胞的增值、转移和分化,眼晶状体的发育,Th2细胞的极化,胰岛素的产生,及细胞凋亡中都起到了关键的作用。 展开更多
关键词 Maf家族蛋白 b-zip基序 Maf识别元件 转录因子
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核蛋白CREB的转录调控机制 被引量:6
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作者 畅晓燕 《国外医学(分子生物学分册)》 CSCD 2002年第3期136-139,共4页
CREB(c AMP反应元件结合蛋白 )是一重要的核转录因子 ,为 b ZIP家族成员之一。它的蛋白单体从 N端到 C端主要包括激酶诱导域 (KID)、碱性区 (basic region)和亮氨酸拉链模体 (leucine zipper m otif)。 CREB受多种信号转导通路的调控 ,... CREB(c AMP反应元件结合蛋白 )是一重要的核转录因子 ,为 b ZIP家族成员之一。它的蛋白单体从 N端到 C端主要包括激酶诱导域 (KID)、碱性区 (basic region)和亮氨酸拉链模体 (leucine zipper m otif)。 CREB受多种信号转导通路的调控 ,除了经典的 c AMP调控通路外 ,还有如 Ras- Raf- MAPK通路、Ca2 + - Ca MK通路、应激相关的 P38通路等。活化的 CREB需同辅激活因子 CBP相结合 ,才能激活转录发生。 CREB为管家基因的产物 ,功能广泛而复杂 ,可诱导癌细胞凋亡 。 展开更多
关键词 核蛋白CREB 转录 调控机制 b-zip蛋白家族
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The b‑ZIP transcription factor,FgBzip16,is essential for fungal development,ascospore discharge,and pathogenicity by modulating fatty acid metabolism in Fusarium graminearum
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作者 Bing Li Yuhe Shen +7 位作者 Yupan Zhu Lingling Yang Ruonan Ma Hao Sun Jingang Liang Kangkang Chen Zhen Jiao Wenchao Yang 《Phytopathology Research》 2023年第1期336-349,共14页
Fusarium graminearum is an economically devastating pathogen that causes cereal worldwide.The plant disease cycle involves sexual reproduction,with the perithecium playing a crucial role in overwintering and the disch... Fusarium graminearum is an economically devastating pathogen that causes cereal worldwide.The plant disease cycle involves sexual reproduction,with the perithecium playing a crucial role in overwintering and the discharge of ascospores.Although fatty acid biosynthesis and metabolism are linked to perithecium formation and ascospore discharge,the regulation of these processes remains largely unknown.In this study,we identified and characterized FgBZIP16,as a basic leucine zipper(b-ZIP)transcription factor,in F.graminearum.Targeted gene deletion revealed that FgBzip16 is important for vegetative growth,asexual/sexual development,and plant infection.Cytological observations revealed that FgBzip16 was localized in the nucleus during the hyphal and conidial stages.FgBzip16 is essential for ascospore discharge,with transcriptomics and molecular biology showing it binds to the promoter of its target genes FGSG_05321 and FGSG_03244,which regulate ascospore discharge by encoding fatty acid synthase subunit alpha-reductase and enoyl hydratase,respectively.Altogether,these results constitute the first report of the specific functions associated with b-ZIP transcription factor FgBzip16,linking its regulatory roles to fungal development,fatty acid accumulation,and metabolism,host penetration,and pathogenicity of F.graminearum. 展开更多
关键词 b-zip transcription factor FgBzip16 Development Ascospore discharge Fatty acid metabolism PATHOGENICITY
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