烟草线粒体基因atp6的SNP及其与CMS的相关性 被引量：17

1

作者 赵婷 朱滕义 +2 位作者 刘齐元 张美良 蒋海燕 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1655-1661,共7页

为更好地在烟草育种中利用雄性不育,对烟草胞质雄性不育(CMS)的分子机理进行了研究。atp6基因是影响植物CMS的一个重要候选基因。本研究以7个烟草CMS系及其相应的保持系为材料,利用PCR特异引物扩增其线粒体基因atp6,通过直接测序和比对... 为更好地在烟草育种中利用雄性不育,对烟草胞质雄性不育(CMS)的分子机理进行了研究。atp6基因是影响植物CMS的一个重要候选基因。本研究以7个烟草CMS系及其相应的保持系为材料,利用PCR特异引物扩增其线粒体基因atp6,通过直接测序和比对,发现atp6中A-59C、T-92C、T-185G、T-253C、T-418C和T-768C共6个核苷酸位点存在碱基变异,其中第59位、92位、185位和418位碱基的变化导致了相应位点编码氨基酸残基的改变,另两个位点(第253位和768位)为同义突变。对atp6基因中第59位A→C的突变进行了大量个体(共222个烟草植株个体)的PCR-RFLP检测及分析,结果表明,所有保持系单株的线粒体atp6基因片段都可以被Bst1107I酶切,酶切后出现两种条带;而96%以上的雄性不育系单株的线粒体atp6基因片段部分能被Bst1107I酶切,部分由于第59位A→C突变不能被Bst1107I酶切,酶切后出现3种条带。说明atp6基因第59位的SNP位点与烟草CMS特性存在显著的相关性。 展开更多

关键词 烟草 CMS atp6基因 单核苷酸多态性

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苎麻atp6和atp9基因的克隆表达及与细胞质雄性不育的相关性 被引量：12

2

作者 段继强 杜光辉 +2 位作者 李建永 梁雪妮 刘飞虎 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1487-1498,共12页

根据GenBank报道的双子叶植物线粒体atp6和atp9基因编码区保守序列设计简并引物,通过PCR技术从苎麻细胞质雄性不育系、保持系和恢复系(简称"三系")mtDNA中扩增目的基因片段,发现所得序列开放阅读框虽不完整,但与GenBank报道... 根据GenBank报道的双子叶植物线粒体atp6和atp9基因编码区保守序列设计简并引物,通过PCR技术从苎麻细胞质雄性不育系、保持系和恢复系(简称"三系")mtDNA中扩增目的基因片段,发现所得序列开放阅读框虽不完整,但与GenBank报道的其他植物线粒体atp6和atp9基因同源性分别高于94%和85%。采用DNA Walking步移法分别从3′端和5′端扩增两个基因片段的未知侧翼序列,分离出完整的苎麻线粒体atp6和atp9基因,包含了完整的开放阅读框。其中"三系"的atp6基因在mtDNA水平、转录和翻译调控水平、蛋白质水平上均无差异。不育系atp9基因在编码区3′端与保持系和恢复系相比存在若干个碱基的差异和缺失;RT-PCR分析还表明,不育系atp9基因在现蕾期和盛花期的表达量很高。推测不育系atp9基因的结构变异和/或异常表达与苎麻细胞质雄性不育(CMS)的关系密切。 展开更多

关键词 苎麻 细胞质雄性不育 atp6基因 atp9基因 DNA WALKING RT-PCR

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辣椒核质互作雄性不育系线粒体不育基因CoxⅡ和atp6的克隆与序列分析 被引量：8

3

作者 邓明华 邹学校 +4 位作者 霍金龙 文锦芬 朱海山 张竹青 赵凯 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1935-1940,共6页

以辣椒核质互作雄性不育系9704A、保持系9704B和恢复系9701(简称"三系")为材料,根据GenBank报道的茄科作物线粒体CoxⅡ和atp6基因编码序列分别设计引物,PCR扩增辣椒"三系"线粒体DNA目的基因片段,研究辣椒"三系... 以辣椒核质互作雄性不育系9704A、保持系9704B和恢复系9701(简称"三系")为材料,根据GenBank报道的茄科作物线粒体CoxⅡ和atp6基因编码序列分别设计引物,PCR扩增辣椒"三系"线粒体DNA目的基因片段,研究辣椒"三系"线粒体DNACoxⅡ和atp6基因的差异及与雄性不育的关系。结果表明:从辣椒核质互作雄性不育系中扩增到两个基因的部分序列atp6-706和CoxⅡ-708,GenBank登录号分别为FJ986191和FJ986190,生物信息学分析发现分离的atp6-706和CoxⅡ-708片段与GenBank报道的茄科作物线粒体CoxⅡ和atp6基因的相似性高达95%以上;在保持系和恢复系中均未能扩增到任何序列,说明辣椒雄性不育系的CoxⅡ和atp6基因与保持系和恢复系在线粒体DNA水平上存在差异,这种结构上的变化暗示可能与辣椒雄性不育相关。 展开更多

关键词 辣椒 核质互作雄性不育 coxⅡ基因 atp6基因 线粒体DNA

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大豆细胞质雄性不育系与保持系atp6基因的RNA编辑比较研究 被引量：10

4

作者 韩利涛 杨守萍 +1 位作者 喻德跃 盖钧镒 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期361-365,共5页

对大豆细胞质雄性不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的atp6基因的RNA编辑进行比较研究。结果在不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B的atp6-3基因保守区中均发现2个编辑位点,但互不相同,并且导致了氨基酸的不同变化;mtDNA序列分析显示,atp6-3基... 对大豆细胞质雄性不育系NJCMS1A与其保持系NJCMS1B的atp6基因的RNA编辑进行比较研究。结果在不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B的atp6-3基因保守区中均发现2个编辑位点,但互不相同,并且导致了氨基酸的不同变化;mtDNA序列分析显示,atp6-3基因转录本保守区在不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B间存在1个碱基的差异;另外还发现atp6-1、atp6-2和atp6-3的表达在不育系NJCMS1A与保持系NJCMS1B间存在明显差异。 展开更多

关键词 大豆 细胞质雄性不育 atp6基因 RNA编辑

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雄性不育烟草atp6基因育性相关生物信息学分析 被引量：6

5

作者 周玮 刘齐元 +3 位作者 朱腾义 范东东 朱肖文 程元强 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期54-59,67,共7页

线粒体基因atp6与多种植物细胞质雄性不育(CMS)关系密切。为探索atp6基因致烟草CMS的潜能,以2对烟草不育系和相应保持系为材料克隆atp6基因,测序结果显示不育系与保持系atp6基因间有6个碱基差异。进一步的生物信息学分析结果表明,6个碱... 线粒体基因atp6与多种植物细胞质雄性不育(CMS)关系密切。为探索atp6基因致烟草CMS的潜能,以2对烟草不育系和相应保持系为材料克隆atp6基因,测序结果显示不育系与保持系atp6基因间有6个碱基差异。进一步的生物信息学分析结果表明,6个碱基差异导致4个预测氨基酸残基差异及差异残基所处区域的亲/疏水性改变,不育系atp6基因预测蛋白在二级结构和结构域上均呈现出周期结构(主要为α-螺旋)增加而非周期结构(主要为无规卷曲)减少的趋势,不育系atp6基因的碱基差异能在一定程度上引起编码亚基空间结构类型发生改变。推测atp6编码亚基尤其是亚基结构域空间结构类型的改变可能干扰线粒体F0F1-ATP合成酶的功能,从而成为影响烟草育性的因素之一。 展开更多

关键词 烟草 细胞质雄性不育 atp6基因 育性 生物信息学

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中国3个不同地域藏族群体线粒体ATP6、ATP8和Cyt b基因的比较：探查自然选择在基因组的印记 被引量：9

6

作者 顾明亮 汪业军 +2 位作者 史磊 张永彪 褚嘉祐 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期147-152,共6页

线粒体基因组(Mitochondrial DNA,mtDNA)具有区别于核基因组的诸多特性(例如缺乏重组等),在人类进化历史的研究领域具有巨大的应用价值。文章通过对3个不同地域藏族群体线粒体基因组的ATP6、ATP8和Cytb基因约2kb区域的测序研究发现:随... 线粒体基因组(Mitochondrial DNA,mtDNA)具有区别于核基因组的诸多特性(例如缺乏重组等),在人类进化历史的研究领域具有巨大的应用价值。文章通过对3个不同地域藏族群体线粒体基因组的ATP6、ATP8和Cytb基因约2kb区域的测序研究发现:随着海拔的增加,3个基因的全序列、ATP6和ATP8基因逐渐偏离中性模式,但未呈现显著性差异;随着海拔的降低,Cytb基因受到纯化选择的作用逐渐增大;ATP6基因可能存在适应性选择,并且随着海拔的增高呈现出适应性选择增强的趋势;选择的主要因素应该是该群体所处的特殊的地理环境,即不同的地理环境具有直接的选择作用。 展开更多

关键词 藏族群体 线粒体基因 atp6 ATP8 CYT b 自然选择

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水稻线粒体基因atp6启动子突变导致的一种细胞质雄性不育型 被引量：3

7

作者 任鄄胜 李仕贵 +5 位作者 肖培村 陈勇 张仁 谢丛简 孙泽武 赵慧霞 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期544-549,共6页

内江杂交水稻科技开发中心从恢复系"万恢88/内恢92-4"杂交组合F2代不育株选育的细胞质不育系,被暂时定名为"万恢88型水稻细胞质雄性不育系"。利用PAGE电泳、琼脂糖凝胶电泳和克隆测序等技术对其不育系和保持系线粒... 内江杂交水稻科技开发中心从恢复系"万恢88/内恢92-4"杂交组合F2代不育株选育的细胞质不育系,被暂时定名为"万恢88型水稻细胞质雄性不育系"。利用PAGE电泳、琼脂糖凝胶电泳和克隆测序等技术对其不育系和保持系线粒体基因组进行研究,分析其雄性不育的分子基础和分子机理。通过PAGE电泳发现,其不育系线粒体基因组PCR带型与野败型(WA)、印水型(ⅡA)、D型(D i)、冈型(GA)存在差异。对其不育系内香2A和保持系内香2B的差异片段回收测序,获得两条667 bp长度的m tDNA片段2A和2B,通过序列比对和电子杂交分析,获得片段为atp6基因的部分序列及其上游序列。2A和2B相比有3个碱基不同,分别是第57位G→T,第100位T→C,第161位C→T。功能分析第100位T-C点突变使atp6基因启动子核心序列遭到破坏。通过对atp6基因上游序列的RT-PCR分析,发现不育系内香2A的atp6基因不能正常表达。故而推测万恢88型水稻细胞质雄性不育是由于不育系线粒体atp6基因核心启动子区域发生点突变,导致atp6基因不能正常转录,致使线粒体供能不足,最后导致花粉败育。 展开更多

关键词 水稻 细胞质雄性不育 atp6基因 启动子 点突变

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鸡蛔虫凉山州分离株线粒体ATP6基因的序列测定和种系发育分析 被引量：9

8

作者 郝桂英 何学谦 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1341-1345,共5页

利用PCR技术，对分离自四川省凉山州17个鸡蛔虫分离株的线粒体ATP合成酶FO亚单位6基因（ATP6）的全序列进行扩增和分析。测序结果显示，所获得的鸡蛔虫ATP6全序列长度均为597bp，有25个变异位点，共检测到11个单倍型，种内变异为0．0～2... 利用PCR技术，对分离自四川省凉山州17个鸡蛔虫分离株的线粒体ATP合成酶FO亚单位6基因（ATP6）的全序列进行扩增和分析。测序结果显示，所获得的鸡蛔虫ATP6全序列长度均为597bp，有25个变异位点，共检测到11个单倍型，种内变异为0．0～2．4％。种系发育树显示，所有鸡蛔虫分离株聚在同一分支，能与其他蛔虫相鉴别。结果表明，鸡蛔虫的ATP6基因序列种内变异小，种间差异大，故可作为分子标记用于鸡蛔虫的种间鉴定；鸡蛔虫凉山州分离株存在一定的遗传变异和遗传多样性。本研究结果为鸡蛔虫的分子分类、分子流行病学调查和种群遗传的进一步研究奠定了基础。 展开更多

关键词 鸡蛔虫 线粒体atp6基因 种系发育 遗传多样性

原文传递

紫稻(Oryza sativa L.)线粒体ATP合成酶atp6基因转录本RNA编辑 被引量：6

9

作者 魏磊 费震江 丁毅 《武汉植物学研究》 CSCD 北大核心 2010年第3期251-256,共6页

紫稻(Oryza sativa L.)细胞质雄性不育系紫稻A是本实验室构建的新型细胞质雄性不育系。本研究使用PCR、RT-PCR、DNA测序等技术,得到了紫稻细胞质雄性不育水稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体atp6基因转录本cDNA序列。通过与基因... 紫稻(Oryza sativa L.)细胞质雄性不育系紫稻A是本实验室构建的新型细胞质雄性不育系。本研究使用PCR、RT-PCR、DNA测序等技术,得到了紫稻细胞质雄性不育水稻不育系(樱香A)及其保持系(樱香B)线粒体atp6基因转录本cDNA序列。通过与基因组序列比对发现:樱香Aatp6cDNA序列中,没有发生RNA编辑;而樱香Batp6 cDNA序列中有16个编辑位点,在樱香B cDNA序列16个编辑位点位于15个密码子中,所编码的氨基酸均发生改变:在1003位点由C替换为T,导致原来编码谷氨酰胺密码子(CAA)成为终止密码子(TAA),保证atp6 mRNA编码一个正常的ATP6多肽;而由于没有发生RNA编辑,樱香A mRNA就不能翻译成正常的多肽。研究表明,RNA编辑在合成正常的ATP6多肽的过程中具有至关重要的作用,同时也说明RNA编辑可能与细胞质雄性不育相关。 展开更多

关键词 atp6基因 RNA编辑 细胞质雄性不育 线粒体 紫稻

原文传递

洋葱atp6基因的克隆与系统进化分析 被引量：6

10

作者 王振宝 霍雨猛 +5 位作者 缪军 高莉敏 刘冰江 杨妍妍 吴雄 程斐 《山东农业科学》 2014年第1期10-14,共5页

细胞质雄性不育(CMS)在作物遗传育种研究中占有重要地位,多种植物的细胞质雄性不育均与线粒体基因结构变异及新嵌合基因的产生有关。为探索线粒体atp6基因与洋葱CMS的关系,以13份不育系和11份保持系为材料克隆洋葱atp6基因编码序列,测... 细胞质雄性不育(CMS)在作物遗传育种研究中占有重要地位,多种植物的细胞质雄性不育均与线粒体基因结构变异及新嵌合基因的产生有关。为探索线粒体atp6基因与洋葱CMS的关系,以13份不育系和11份保持系为材料克隆洋葱atp6基因编码序列,测序结果表明不同材料atp6基因间存在一个C/A多态性位点,该多态性位点在不育系和保持系间随机出现,而不是不育系与保持系的特征差异。蛋白质分析表明这一多态性位点的变异并未改变atp6蛋白跨膜结构。进一步的蛋白比对分析揭示了atp6蛋白在物种间有一定的保守性,特别是第IV跨膜结构域的Arg在所有物种中是高度保守的,也是H+转运所必需的。基于atp6蛋白序列的系统进化树显示细菌和病毒位于树的基部,其次是真菌、低等藻类以及原生生物,然后高等藻类、苔藓和蕨类,高等绿色开花植物处于树的顶端,单子叶植物处于树的最顶端。 展开更多

关键词 洋葱 雄性不育 atp6基因 系统进化

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MT-ATP6基因突变致Leigh综合征一家系研究 被引量：3

11

作者 刘军 刘芳 《疑难病杂志》 CAS 2020年第7期682-685,共4页

Leigh综合征是与基因突变密切相关的一类线粒体疾病。文章通过回顾一家系中2例Leigh综合征患者的临床资料及基因检测结果,寻找可能的致病基因。对先证者及其母亲进行线粒体全基因组测序,并对其胞兄进行线粒体突变基因验证。结果发现,先... Leigh综合征是与基因突变密切相关的一类线粒体疾病。文章通过回顾一家系中2例Leigh综合征患者的临床资料及基因检测结果,寻找可能的致病基因。对先证者及其母亲进行线粒体全基因组测序,并对其胞兄进行线粒体突变基因验证。结果发现,先证者及其胞兄血液样本中均检测到编码线粒体ATP6蛋白的基因突变m.8993T>G(p.L156R),先证者突变负荷为97.3%,其胞兄为93.7%,两者临床表型均符合Leigh综合征。先证者母亲血液样本中检测到相同的致病性突变,突变负荷为62.1%,表型正常。提示该突变来自母亲,符合线粒体母系遗传疾病的遗传方式。因此对临床表现疑似Leigh综合征的患者应尽早进行基因检测以明确诊断。 展开更多

关键词 atp6蛋白基因 LEIGH综合征 基因突变 家系分析

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瓣化型胡萝卜雄性不育基因atp6的CAPS标记建立 被引量：5

12

作者 于春霞 梁毅 李龙年 《中国农学通报》 CSCD 2007年第12期68-72,共5页

根据atp6的基因序列设计特异扩增引物,以瓣化型胡萝卜核质互作雄性不育系H05A及其保持系H05B为试材,扩增获得了1条约500bp的特异扩增片段。用限制性内切酶BglII对该片段进行酶切,不育系产生1条保持系中没有的特异片段,其分子量约为60bp... 根据atp6的基因序列设计特异扩增引物,以瓣化型胡萝卜核质互作雄性不育系H05A及其保持系H05B为试材,扩增获得了1条约500bp的特异扩增片段。用限制性内切酶BglII对该片段进行酶切,不育系产生1条保持系中没有的特异片段,其分子量约为60bp。建立了atp6基因的CAPS标记,该分子标记可用于胡萝卜雄性不育分子标记辅助育种。 展开更多

关键词 胡萝卜 细胞质雄性不育 atp6基因 CAPS标记

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甜菜线粒体atp6基因转录本的RNA编辑位点研究 被引量：6

13

作者 施真 程大友 +3 位作者 罗成飞 刘巧红 史淑芝 崔杰 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期428-432,共5页

RNA编辑现象普遍存在于高等植物的线粒体中,是线粒体中产生功能蛋白所不可或缺的加工步骤。以甜菜细胞质雄性不育系DY5-CMS及其保持系DY5-O为材料,通过PCR、RT-PCR以及PCR产物直接测序等方法,对甜菜线粒体atp6基因转录本的RNA编辑位点... RNA编辑现象普遍存在于高等植物的线粒体中,是线粒体中产生功能蛋白所不可或缺的加工步骤。以甜菜细胞质雄性不育系DY5-CMS及其保持系DY5-O为材料,通过PCR、RT-PCR以及PCR产物直接测序等方法,对甜菜线粒体atp6基因转录本的RNA编辑位点进行了研究,以期探寻其与细胞质雄性不育之间的关系。结果表明,atp6基因转录本的保守区域共有8个编辑位点,均发生在密码子的第一、二位点上,这些位点的编辑将导致氨基酸种类的变化,如第二个编辑位点上发生的由丝氨酸(疏水参数0.8)到亮氨酸(疏水参数3.8)的转变。通过分析可看出atp6基因RNA编辑有着改变蛋白质疏水性的作用,同时它能增加物种间的保守性。 展开更多

关键词 甜菜 线粒体 RNA编辑 atp6基因 细胞质雄性不育

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湖南省日本血吸虫线粒体atp6基因部分序列的多态性分析 被引量：3

14

作者 夏英定 汪世平 +6 位作者 李娟 吴昌义 田智 尹铁球 周云飞 张树菊 冯其梅 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期1-6,63,共7页

目的研究湖南省日本血吸虫不同地域自然隔离群线粒体ATP合成酶F0亚单位6基因(atp6)部分序列的遗传多态性,为湖南不同地域自然隔离群日本血吸虫的遗传特性研究提供实验依据。方法采用试剂盒抽提基因组总DNA,以特异性引物对线粒体atp6基... 目的研究湖南省日本血吸虫不同地域自然隔离群线粒体ATP合成酶F0亚单位6基因(atp6)部分序列的遗传多态性,为湖南不同地域自然隔离群日本血吸虫的遗传特性研究提供实验依据。方法采用试剂盒抽提基因组总DNA,以特异性引物对线粒体atp6基因进行PCR扩增,通过单链构象多态性技术(SSCP)筛选出差异带型并进行测序,用DNAStar 5.0及Mega 4.0软件进行比对分析。结果湖南省5个流行区的日本血吸虫PCR扩增后获得了483 bpatp6部分序列,检测出17个变异位点,变异率为3.52%,雌雄虫之间的差异为0.0%～1.3%,不同地理来源虫株间的差异率为0.0%～1.5%。聚类分析结果表明:湖南不同地域自然隔离群日本血吸虫的种系发育不能按照其来源归为相应的系统发育进化树。结论湖南不同地域自然隔离群日本血吸虫的atp6基因存在明显的个体差异,是否由于生存环境的选择压力造成了同一地理来源日本血吸虫个体之间atp6基因的遗传差异,其原因尚有待于进一步研究。 展开更多

关键词 日本血吸虫 线粒体atp6基因 PCR-SSCP 序列分析

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基于线粒体ATP6基因全序列分析中国绵羊痒螨(兔亚种)的遗传多样性 被引量：4

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作者 尹潇潇 李燕方 +4 位作者 古江 廖艳 谢跃 杨光友 古小彬 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第8期1231-1238,共8页

为进一步了解我国绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传变异情况和分类情况,采用PCR技术扩增绵羊痒螨(兔亚种)虫株的线粒体ATP6基因全序列,并分析所得序列,旨在探讨中国华北、华东、华中、西北、西南地区绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传多样性和种群... 为进一步了解我国绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传变异情况和分类情况,采用PCR技术扩增绵羊痒螨(兔亚种)虫株的线粒体ATP6基因全序列,并分析所得序列,旨在探讨中国华北、华东、华中、西北、西南地区绵羊痒螨(兔亚种)种群的遗传多样性和种群结构。本研究成功获得88条序列,长度均为672 bp,包含41个单倍型,表现出较高的遗传多样性(π=0.014 94)和单倍型多样性(Hd=0.925 81),且以种群内部的遗传变异为主(97.92%)。进一步分析发现,5个种群间遗传分化程度较弱(F st=0.020 81),基因交流频繁(Nm=11.763 5),中性检验值(Tajima s D=0.937 98,Fu s Fs=0.522 06)为不显著的正值,结合错配分布曲线呈现多峰,表明我国绵羊痒螨(兔亚种)种群在进化过程中比较稳定,无种群扩张事件。从单倍型网络图和NJ树可知,中国绵羊痒螨(兔亚种)没有形成基于兔品种、温度带或地理分布的遗传结构。中国绵羊痒螨(兔亚种)种群遗传多样性高,但种群间无明显分化,未形成基于兔品种、温度带或地理分布的遗传结构。 展开更多

关键词 绵羊痒螨(兔亚种) 线粒体ATP 6基因 遗传多样性

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基于水稻线粒体atp6基因的稻属CMS基因起源及DNA条形码的研究 被引量：2

16

作者 李平 刘雅婷 +2 位作者 赵自仙 娄红波 张雪梅 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2019年第4期555-563,共9页

【目的】探讨亚洲栽培稻CMS基因起源及水稻线粒体atp6特异性引物作为稻属DNA条形码标记的应用。【方法】用水稻atp6特异性引物通过PCR检测产于中国的4种水稻,共720个个体,并对111个个体测序。【结果】普通野生稻和亚洲栽培稻中均检测到a... 【目的】探讨亚洲栽培稻CMS基因起源及水稻线粒体atp6特异性引物作为稻属DNA条形码标记的应用。【方法】用水稻atp6特异性引物通过PCR检测产于中国的4种水稻,共720个个体,并对111个个体测序。【结果】普通野生稻和亚洲栽培稻中均检测到atp6保守序列。药用野生稻中没检测到扩增产物。疣粒野生稻中检测到的5个单倍型间共计17个变异位点。澜沧、普洱、勐海居群共同拥有H1,单倍型H2、H3、H4和H5分别为新平、墨江、保亭和崖城居群特有。云南组和海南组,组内平均遗传距离为0,组间为0.02;组间遗传分化系数Fst为92.08%;变异位点数(S)、单倍型数(h)、核苷酸多样性(Pi)均显示:云南组(4、3、0.00201)遗传多样性大于海南组(1、2、0.00131);云南组单倍型多样性Hd为0.6,海南组为1。5个单倍型与水稻atp6保守序列的相似度最高为45.19%。最大似然法ML进化树显示:澜沧、普洱及勐海一带可能是疣粒野生稻的起源地,海南疣粒野生稻可能源自大陆。【结论】水稻atp6特异性引物可作为疣粒野生稻种内条形码标记,该标记也可区分普通野生稻、药用野生稻和疣粒野生稻。从线粒体DNA角度证实亚洲栽培稻CMS基因源自普通野生稻。 展开更多

关键词 atp6基因 水稻 序列分析 起源 DNA条形码

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河南汉族人群精神分裂症患者线粒体ATP6基因9115、9185位点突变分析 被引量：4

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作者 何书平 仝冬晓 +4 位作者 司沛茹 王丽雯 程美锦 景嘉楠 程晓丽 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2018年第3期313-316,共4页

目的:分析线粒体ATP6基因的9115位点和9185位点突变与精神分裂症的关系。方法:采用病例-对照研究方法、PCR-限制性内切酶片段长度多态性及基因测序技术,分别对244例精神分裂症患者和260例正常对照的外周血线粒体ATP6基因9115及9185位点... 目的:分析线粒体ATP6基因的9115位点和9185位点突变与精神分裂症的关系。方法:采用病例-对照研究方法、PCR-限制性内切酶片段长度多态性及基因测序技术,分别对244例精神分裂症患者和260例正常对照的外周血线粒体ATP6基因9115及9185位点进行检测、分析。结果:病例组9115位点突变率高于对照组(P=0.025),9115G能增加精神分裂症的患病风险(OR=4.790,95%CI=1.046~21.972);病例组及对照组中均未发现9185位点突变。结论:线粒体ATP6基因9115A/G突变可能是精神分裂症的危险因素。 展开更多

关键词 线粒体 atp6基因 突变 精神分裂症 河南省

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MT-ATP6基因9176T>C变异致晚发型Leigh综合征一家系报道并文献复习 被引量：1

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作者 周亚光 瞿千千 +3 位作者 刘海燕 陈萍 崔文豪 吕海东 《中风与神经疾病杂志》 CAS 2023年第1期48-51,共4页

目的探讨晚发型Leigh综合征(leigh syndrome,LS)的临床、头部MRI和MT-ATP6基因变异特点。方法详细收集一家系中2例晚发型Leigh综合征患者的临床资料、脑影像以及基因检测结果,并结合文献进行讨论。结果先证者,男,9岁,以“双侧眼睑下垂... 目的探讨晚发型Leigh综合征(leigh syndrome,LS)的临床、头部MRI和MT-ATP6基因变异特点。方法详细收集一家系中2例晚发型Leigh综合征患者的临床资料、脑影像以及基因检测结果,并结合文献进行讨论。结果先证者,男,9岁,以“双侧眼睑下垂、步态不稳半年,精神行为异常4个月”为主诉,于2020年4月10日就诊于河南省焦作市人民医院。患儿出生正常,自幼体质和智力均较同龄人差。半年前出现双侧眼睑下垂,视物有重影,并逐渐出现步态不稳,跑步困难,头部MRI检查提示双侧基底节区和脑干异常信号。4个月前无诱因出现间断性恶心呕吐,精神行为异常。2个月前感冒发热后突发昏迷抽搐,在当地医院抢救治疗,生命体征平稳后转入河南省焦作市人民医院。查体:身材矮小,体型消瘦,呈睁眼昏迷状。双侧眼睑下垂遮盖瞳孔大于1/2,双眼球居中固定,吞咽障碍,鼻饲管饮食。四肢肌张力高,腱反射活跃,肢体呈屈曲状,双侧病理征阳性。家族史:患儿父母非近亲结婚,父亲身体健康,母亲身材矮小,有精神行为异常病史。先证者的哥哥,14岁,发育均较同龄人差。7岁出现眼睑下垂,步态不稳,无昏迷抽搐病史。先证者和其哥哥行骨骼肌病理活检未见破碎红边纤维,线粒体基因组检测均发现有MT-ATP6基因9176T>C变异。结论晚发型Leigh综合征临床表型具有较大的异质性,可伴有精神行为异常和认知障碍。头部MRI以双侧基底节和中脑导水管周围异常信号为其影像特点,基因检测是诊断Leigh综合征的重要依据。 展开更多

关键词 LEIGH综合征 MT-atp6基因 临床特点 头部MRI

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基于线粒体ATP6基因序列的作物系统发育研究 被引量：1

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作者 胡晓天 向妍 +3 位作者 张柯 刘齐元 范彦君 周玮 《湖南农业科学》 2015年第10期1-4,共4页

ATP6编码ATP合酶a亚基,对酶正常功能的实现作用重要。为探讨线粒体ATP6基因在作物系统发育分析上的应用,采用NJ法的Kimura 2-parameter模型、E距离模型,以及最大似然法对30种作物进行分子系统树构建,并结合植物形态学分类结果进行比较... ATP6编码ATP合酶a亚基,对酶正常功能的实现作用重要。为探讨线粒体ATP6基因在作物系统发育分析上的应用,采用NJ法的Kimura 2-parameter模型、E距离模型,以及最大似然法对30种作物进行分子系统树构建,并结合植物形态学分类结果进行比较分析。结果表明,基于NJ法和最大似然法的ATP6系统发育树聚类结果一致,契合现有植物形态学分类,在分析作物物种分化起源上有巨大潜力。 展开更多

关键词 ATP合酶 atp6基因 作物 系统发育

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红麻线粒体基因atp6过表达载体的构建与转化

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作者 韦美玲 廖小芳 +6 位作者 李枝玲 周步进 郑杰 孔祥军 刘一丁 李宏伟 周瑞阳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第12期2740-2746,共7页

【目的】构建红麻线粒体基因atp6过表达载体遗传转化体系,为红麻线粒体基因的遗传转化及功能研究打下基础。【方法】以红麻UG93A花药cDNA为模板,通过同源克隆技术克隆atp6基因编码区(CDS)的全长序列;利用In-Fusion基因融合技术构建植物... 【目的】构建红麻线粒体基因atp6过表达载体遗传转化体系,为红麻线粒体基因的遗传转化及功能研究打下基础。【方法】以红麻UG93A花药cDNA为模板,通过同源克隆技术克隆atp6基因编码区(CDS)的全长序列;利用In-Fusion基因融合技术构建植物过表达载体,通过农杆菌介导法转化野生型烟草,并对转基因阳性烟草植株进行抗性筛选和PCR验证。【结果】红麻UG93A的atp6基因CDS全长为1182 bp,成功构建红麻atp6基因全长过表达载体pBI121-atp6-EGFP,并获得4株转基因烟草植株(B1、B2、B3和B4),使用过表达载体上3对不同位点的引物组合对转基因植株进行PCR验证,发现有2株转基因烟草植株在3对不同引物中稳定表达,即获得2株含pBI121-atp6-EGFP的T0代转基因阳性植株(B1和B2)。【结论】构建的红麻线粒体基因atp6过表达载体遗传转化体系,可用于指导后续atp6基因调控红麻细胞质雄性不育(CMS)分子机理研究。 展开更多

关键词 红麻 细胞质雄性不育(CMS) atp6基因 过表达载体 转化

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