植物细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)与线粒体ATP合成酶亚基基因功能异常有密切关系。为了揭示烟草atp2基因在其生长发育过程中的功能,本研究利用在线软件分析了烟草ATP2蛋白的组成结构和理化性质,绘制了atp2基因和ATP...植物细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)与线粒体ATP合成酶亚基基因功能异常有密切关系。为了揭示烟草atp2基因在其生长发育过程中的功能,本研究利用在线软件分析了烟草ATP2蛋白的组成结构和理化性质,绘制了atp2基因和ATP2蛋白的分子进化树,通过在烟草中瞬时表达atp2-gfp基因明确其蛋白的亚细胞定位。结果表明,ATP2蛋白全长包含560个氨基酸,等电点6.05,相对分子质量59.7 kD,氨基酸组成中甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、亮氨酸(Leu)含量最高;其二级结构中,螺旋、折叠片、环状结构分别占比为37.95%、14.03%、48.02%;三级结构预测表明第1~51位氨基酸是线粒体信号肽序列;不同高等植物atp2基因序列一致性达到85.7%,其ATP2蛋白序列C端高度保守,但是N端信号肽序列差异显著。分子进化分析表明,atp2基因同义(dS)替换速率显著高于非同义(dN)替换速率,且不同植物中的非同义替换速率差异显著。亚细胞定位结果表明,烟草ATP2蛋白定位于线粒体内,叶绿体内未发现其定位信号。本研究结果为后续深入探讨烟草雄性生殖发育过程中atp2的基因功能提供了理论依据。展开更多
目的探究钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)基因rs35678,rs2289274位点多态性与良性阵发性位置性眩晕(BPPV)的相关性。方法选取2022年1月~2024年1月西安工会医院收治的BPPV患者186例作为BPPV组,另选取同期体检的100例健康者作为对照组。通过聚...目的探究钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)基因rs35678,rs2289274位点多态性与良性阵发性位置性眩晕(BPPV)的相关性。方法选取2022年1月~2024年1月西安工会医院收治的BPPV患者186例作为BPPV组,另选取同期体检的100例健康者作为对照组。通过聚合酶链式反应(PCR)检测ATP2B2基因rs35678,rs2289274位点的多态性;比较两组等位基因及基因型频率;非条件Logistic回归法分析rs35678,rs2289274位点三种遗传模型(共显性、显性和隐性)下与BPPV易感性的相关性。结果ATP2B2基因rs35678,rs2289274位点的基因型在对照组、BPPV组的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ^(2)=0.003~0.050,均P>0.05),具有群体代表性。与对照组相比,BPPV组rs35678位点等位基因T频率(56.45%vs 41.00%)和基因型TT频率(31.87%vs 16.81%)升高,rs2289274位点等位基因A频率(54.30%vs 42.00%)和基因型AA频率(29.48%vs 17.64%)升高,差异具有统计学意义(χ^(2)=3.936~12.290,均P<0.05)。rs35678位点在共显性模型(CC vs TT)下,TT基因型携带者患病风险高于CC基因型携带者(OR=1.851,95%CI:1.059~2.936);显性模型(CT+TT vs CC)和隐性模型(CT+CC vs TT)下,rs35678位点多态性与BPPV的关联性(OR=1.716,95%CI:1.074~2.936;OR=0.759,95%CI:0.517~0.837),差异具有统计学意义(均P<0.05)。rs2289274位点在共显性模型(GG vs AA)下,AA基因型携带者患病风险高于GG基因型携带者(OR=1.627,95%CI:1.191~2.973);显性模型(AG+AA vs GG)下,rs2289274位点多态性与BPPV的关联性(OR=1.941,95%CI:1.191~3.673),差异具有统计学意义(均P<0.05)。结论ATP2B2基因rs35678位点TT基因型及rs2289274位点AA基因型会增加BPPV患病风险。展开更多
文摘植物细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)与线粒体ATP合成酶亚基基因功能异常有密切关系。为了揭示烟草atp2基因在其生长发育过程中的功能,本研究利用在线软件分析了烟草ATP2蛋白的组成结构和理化性质,绘制了atp2基因和ATP2蛋白的分子进化树,通过在烟草中瞬时表达atp2-gfp基因明确其蛋白的亚细胞定位。结果表明,ATP2蛋白全长包含560个氨基酸,等电点6.05,相对分子质量59.7 kD,氨基酸组成中甘氨酸(Gly)、丙氨酸(Ala)、亮氨酸(Leu)含量最高;其二级结构中,螺旋、折叠片、环状结构分别占比为37.95%、14.03%、48.02%;三级结构预测表明第1~51位氨基酸是线粒体信号肽序列;不同高等植物atp2基因序列一致性达到85.7%,其ATP2蛋白序列C端高度保守,但是N端信号肽序列差异显著。分子进化分析表明,atp2基因同义(dS)替换速率显著高于非同义(dN)替换速率,且不同植物中的非同义替换速率差异显著。亚细胞定位结果表明,烟草ATP2蛋白定位于线粒体内,叶绿体内未发现其定位信号。本研究结果为后续深入探讨烟草雄性生殖发育过程中atp2的基因功能提供了理论依据。
文摘目的探究钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)基因rs35678,rs2289274位点多态性与良性阵发性位置性眩晕(BPPV)的相关性。方法选取2022年1月~2024年1月西安工会医院收治的BPPV患者186例作为BPPV组,另选取同期体检的100例健康者作为对照组。通过聚合酶链式反应(PCR)检测ATP2B2基因rs35678,rs2289274位点的多态性;比较两组等位基因及基因型频率;非条件Logistic回归法分析rs35678,rs2289274位点三种遗传模型(共显性、显性和隐性)下与BPPV易感性的相关性。结果ATP2B2基因rs35678,rs2289274位点的基因型在对照组、BPPV组的分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ^(2)=0.003~0.050,均P>0.05),具有群体代表性。与对照组相比,BPPV组rs35678位点等位基因T频率(56.45%vs 41.00%)和基因型TT频率(31.87%vs 16.81%)升高,rs2289274位点等位基因A频率(54.30%vs 42.00%)和基因型AA频率(29.48%vs 17.64%)升高,差异具有统计学意义(χ^(2)=3.936~12.290,均P<0.05)。rs35678位点在共显性模型(CC vs TT)下,TT基因型携带者患病风险高于CC基因型携带者(OR=1.851,95%CI:1.059~2.936);显性模型(CT+TT vs CC)和隐性模型(CT+CC vs TT)下,rs35678位点多态性与BPPV的关联性(OR=1.716,95%CI:1.074~2.936;OR=0.759,95%CI:0.517~0.837),差异具有统计学意义(均P<0.05)。rs2289274位点在共显性模型(GG vs AA)下,AA基因型携带者患病风险高于GG基因型携带者(OR=1.627,95%CI:1.191~2.973);显性模型(AG+AA vs GG)下,rs2289274位点多态性与BPPV的关联性(OR=1.941,95%CI:1.191~3.673),差异具有统计学意义(均P<0.05)。结论ATP2B2基因rs35678位点TT基因型及rs2289274位点AA基因型会增加BPPV患病风险。
