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Epidermal growth factor receptor mutation analysis in cytological specimens and responsiveness to gefitinib in advanced non-small cell lung cancer patients 被引量:5
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作者 Lin Li Zijin Zhang +7 位作者 Zhixin Bie Zheng Wang Ping Zhang Xin Nie Yuanming Li Hui Wang Bin Ai Gang Cheng 《Chinese Journal of Cancer Research》 SCIE CAS CSCD 2015年第3期294-300,共7页
Background: Epidermal growth factor receptor(EGFR) mutation is the key predictor of EGFR tyrosine kinase inhibitors(TKIs) efficacy in non-small cell lung cancer(NSCLC). We conducted this study to verify the fea... Background: Epidermal growth factor receptor(EGFR) mutation is the key predictor of EGFR tyrosine kinase inhibitors(TKIs) efficacy in non-small cell lung cancer(NSCLC). We conducted this study to verify the feasibility of EGFR mutation analysis in cytological specimens and investigate the responsiveness to gefitinib treatment in patients carrying EGFR mutations.Methods: A total of 210 cytological specimens were collected for EGFR mutation detection by both direct sequencing and amplification refractory mutation system(ARMS). We analyzed EGFR mutation status by both methods and evaluated the responsiveness to gefitinib treatment in patients harboring EGFR mutations by overall response rate(ORR), disease control rate(DCR) and progression free survival(PFS).Results: Of all patients, EGFR mutation rate was 28.6%(60/210) by direct sequencing and 45.2%(95/210) by ARMS(P〈0.001) respectively. Among the EGFR wild type patients tested by direct sequencing, 26.7% of them were positive by ARMS. For the 72 EGFR mutation positive patients treated with gefitinib, the ORR, DCR and median PFS were 69.4%, 90.2% and 9.3 months respectively. The patients whose EGFR mutation status was negative by direct sequencing but positive by ARMS had lower ORR(48.0% vs. 80.9%, P=0.004) and shorter median PFS(7.4 vs. 10.5 months, P=0.009) as compared with that of EGFR mutation positive patients by both detection methods. Conclusions: Our study verified the feasibility of EGFR analysis in cytological specimens in advanced NSCLC. ARMS is more sensitive than direct sequencing in EGFR mutation detection. EGFR Mutation status tested on cytological samples is applicable for predicting the response to gefitinib. Abundance of EGFR mutations might have an influence on TKIs efficacy. 展开更多
关键词 Non-small cell lung cancer (NSCLC) epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation cytological specimen amplification refractory mutation system (ARMS) GEFITINIB
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Relationship between EGFR and KRAS mutations and prognosis in Chinese patients with non-small cell lung cancer:a mutation analysis with real-time polymerase chain reaction using scorpion amplification refractory mutation system
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作者 高洁 《China Medical Abstracts(Internal Medicine)》 2012年第4期220-220,共1页
Objective To investigate the gene mutation of EGFR and KRAS in Chinese patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) ,and to analyze the relationship between the gene mutations and the clinicopathological features ... Objective To investigate the gene mutation of EGFR and KRAS in Chinese patients with non-small cell lung cancer (NSCLC) ,and to analyze the relationship between the gene mutations and the clinicopathological features and EGFR-TKI efficiency. Methods EGFR mutation was detected in 120 patients and KRAS mutation in 104 展开更多
关键词 mutation refractory PROGNOSIS SMOKING ADENOCARCINOMA worse amplification moderately DIFFERENTIATED gender
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突变扩增系统实时荧光定量扩增法用于检测非综合征型耳聋GJB2 235delC基因突变
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作者 戴翔 李隽 +1 位作者 蔡文倩 熊乾 《中国计划生育学杂志》 2025年第6期1369-1374,共6页
目的:探讨突变扩增系统实时荧光定量扩增法(ARMS-qPCR)用于检测GJB2基因235delC突变引起的非综合征型耳聋。方法:以GJB2 235delC基因序列为靶基因,基于该位点的序列设计特异性引物,并运用ARMS-qPCR技术对GJB2 235delC基因位点进行检测,... 目的:探讨突变扩增系统实时荧光定量扩增法(ARMS-qPCR)用于检测GJB2基因235delC突变引起的非综合征型耳聋。方法:以GJB2 235delC基因序列为靶基因,基于该位点的序列设计特异性引物,并运用ARMS-qPCR技术对GJB2 235delC基因位点进行检测,从而区分野生型、突变纯合型和突变杂合型。同时以GJB2 235delC型样本53例及耳聋基因室间质评标准质控物45例作对比验证。结果:ARMS-qPCR的方法能有效区分GJB2 235delC野生型、突变纯合型和突变杂合型,且具有良好的特异性。结论:本实验建立的ARMS-qPCR方法检测GJB2 235delC基因突变引起的非综合征型耳聋,简便快速,成本低,灵敏度高,特异性强。 展开更多
关键词 耳聋 突变扩增系统实时荧光定量扩增法(ARMS-qPCR) 连接蛋白 GJB2 235delC 遗传
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基于扩增受阻突变系统鉴别木香与土木香
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作者 赵雄峰 陈小艳 +2 位作者 覃桂 刘红 汪波 《医药导报》 北大核心 2025年第11期1814-1820,共7页
目的基于扩增受阻突变系统(ARMS)建立一种中药材木香与其常见混伪品土木香的分子鉴定方法。方法通过比对木香与土木香植物核糖体基因转录间隔区Ⅱ(ITS2)序列,筛选单核苷酸多态性(SNP)位点设计物种特异性引物,建立ARMS鉴别法,对不同来源... 目的基于扩增受阻突变系统(ARMS)建立一种中药材木香与其常见混伪品土木香的分子鉴定方法。方法通过比对木香与土木香植物核糖体基因转录间隔区Ⅱ(ITS2)序列,筛选单核苷酸多态性(SNP)位点设计物种特异性引物,建立ARMS鉴别法,对不同来源木香、土木香样品进行特异性扩增,根据特异性条带大小进行鉴别。结果在退火温度56℃、循环次数25、内外引物浓度比1:4、胶浓度1.5%并使用2×TSINGKE Master Mix(blue)扩增时,木香与土木香可分别扩增出170 bp和271 bp特异性条带,木香对土木香掺伪检出限5%。对市场收集的23份样品进行检测,ARMS鉴别结果与测序后DNA条形码鉴定结果、经典分类结果一致。结论该实验建立的ARMS法能特异性鉴别木香与其常见混伪品土木香,具有特异性强、灵敏度高、操作简便等特点,为解决木香药材掺伪问题提供了基础研究,可为木香药材质量控制提供技术支持。 展开更多
关键词 木香 土木香 扩增受阻突变系统 分子鉴定 掺伪鉴别
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重组酶聚合酶扩增探针辅助荧光与胶体金试纸条双模式快速鉴定GⅡ型诺如病毒单碱基突变
5
作者 郝亚茹 张竹慧 +4 位作者 NOOR Fatima 孙思颖 吴阮 孙永 陈伟 《食品安全质量检测学报》 2025年第23期47-56,共10页
目的建立基于重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)探针辅助荧光与胶体金试纸条双模式快速检测GⅡ型诺如病毒单碱基突变(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法。方法本研究应用扩增阻滞突变系统(amplifica... 目的建立基于重组酶聚合酶扩增(recombinase polymerase amplification,RPA)探针辅助荧光与胶体金试纸条双模式快速检测GⅡ型诺如病毒单碱基突变(single nucleotide polymorphism,SNP)的方法。方法本研究应用扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)技术与RPA技术结合胶体金试纸条检测GⅡ型诺如病毒的单个碱基突变。选定编码GⅡ型诺如病毒RdRp和VP1蛋白的一段基因区域,主动设计单个碱基的突变,以此作为靶基因,设计并合成高特异性引物,扩增产物上样后通过试纸条控制线(C线)、检测线(T线)显色强度判读结果。优化胶体金与抗体偶联体系后进行了特异性、灵敏度、重复性和稳定性实验,并检测了食品加标样本。同时用荧光法作为辅助手段来验证试纸条结果的可靠性。结果本方法可在43℃下反应25 min识别单个碱基的突变,检出限为102 copies/μL,可检测低至1%的突变,与荧光法检测结果一致。结论本研究建立的基于ARMS-RPA结合胶体金试纸条的GⅡ型诺如病毒突变检测方法,不仅能够实现单碱基突变的可视化检测,而且操作简便、检测速度快、灵敏度高,还可在现场即时检测,具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 GⅡ型诺如病毒 单碱基突变 胶体金试纸条 荧光法 扩增阻滞突变系统 重组酶聚合酶扩增 可视化检测
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基于ARMS法检测BRAF V600E突变在甲状腺乳头状癌中的临床价值 被引量:10
6
作者 丁金旺 罗定存 +8 位作者 荀延萍 王炜 徐骁诚 周荣璟 姜燕平 徐益平 张卧 潘钢 叶柳青 《中国耳鼻咽喉头颈外科》 CAS CSCD 2017年第2期71-75,共5页
目的探讨扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)法检测BRAF V600E突变的可行性,并评估BRAF V600E突变对鉴别甲状腺结节性质的临床价值。方法采用ARMS法检测并比较179例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid car... 目的探讨扩增阻滞突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)法检测BRAF V600E突变的可行性,并评估BRAF V600E突变对鉴别甲状腺结节性质的临床价值。方法采用ARMS法检测并比较179例甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)和115例甲状腺良性病变组织的BRAF V600E突变状态,计算BRAF V600E突变对鉴别甲状腺结节性质的各项诊断指标,分析BR A F V600E突变与PTC临床病理特征的相关性。结果ARMS法检测甲状腺病灶组织中的BRAF V600E突变方法可行,结果可信。BRAF V600E在PTC中的突变率为82.68%,而在良性组织中的突变率仅为1.74%,两者差异有统计学意义(χ2=183.568,P<0.01)。利用BRAF V600E突变判定甲状腺结节性质的诊断敏感度为82.68%,特异度为98.26%,准确度为88.76%,约登指数为0.8094。BRAF V600E突变与PTC患者的性别、年龄、肿瘤大小、病灶数目、双侧病灶、腺外侵犯以及淋巴结转移等因素无关。结论 ARMS法检测BRAF V600E突变具有较高的诊断敏感度和特异度,其对鉴别甲状腺结节的性质具有重要的临床早期诊断价值。 展开更多
关键词 甲状腺肿瘤 诊断 突变 扩增阻滞突变系统 BRAF基因
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肾上腺脑白质营养不良分子诊断中假基因干扰的排除 被引量:7
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作者 黄梁浒 郑德柱 +2 位作者 曾健 辛娜 兰风华 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第6期572-575,共4页
在基因组DNA水平 ,应用基因突变分析的方法对肾上腺脑白质营养不良进行分子诊断十分重要 .由于人体内存在多个肾上腺脑白质营养不良假基因的拷贝 ,应用PCR RFLP和PCR产物直接测序等常规方法难以检测一部分的基因突变 .为了排除基因组DN... 在基因组DNA水平 ,应用基因突变分析的方法对肾上腺脑白质营养不良进行分子诊断十分重要 .由于人体内存在多个肾上腺脑白质营养不良假基因的拷贝 ,应用PCR RFLP和PCR产物直接测序等常规方法难以检测一部分的基因突变 .为了排除基因组DNA中假基因的干扰 ,利用扩增阻滞突变系统 ,成功地分析了一个肾上腺脑白质营养不良 (R6 17G突变 )家系成员的基因型 .结果表明 ,扩增阻滞突变系统是排除假基因干扰的有效方法之一 . 展开更多
关键词 肾上腺脑白质营养不良 分子诊断 ABCD1基因 假基因 扩增阻滞突变系统
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非小细胞肺癌患者KRAS基因突变情况分析 被引量:18
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作者 罗炜 王慧 +2 位作者 徐韫健 林云恩 欧雅文 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第13期2025-2028,共4页
目的探讨非小细胞肺癌患者KRAS基因突变情况与临床特征间的相关性。方法收集经病理确诊的454例非小细胞肺癌患者的肿瘤组织,采用突变扩增阻滞系统(ARMS)技术检测组织标本中KRAS基因外显子2第12、13位密码子突变状态,分析基因突变与临床... 目的探讨非小细胞肺癌患者KRAS基因突变情况与临床特征间的相关性。方法收集经病理确诊的454例非小细胞肺癌患者的肿瘤组织,采用突变扩增阻滞系统(ARMS)技术检测组织标本中KRAS基因外显子2第12、13位密码子突变状态,分析基因突变与临床特征间的相关性。结果 454例非小细胞肺癌患者中有17例(3.7%)存在KRAS突变,第12位密码子共检出5种突变类型,分别是G12A(1.1%,5/454)、G12C(1.1%,5/454)、G12D(0.4%,2/454)、G12V(0.4%,2/454)、G12S(0.2%,1/454);第13位密码子检出1种突变类型,为G13D(0.4%,2/454)。KRAS基因突变率男性(6.2%,17/273)高于女性(0,0/181),两者差异有统计学意义(P<0.05)。结论非小细胞肺癌KRAS基因突变与患者性别有关,与年龄、病理组织类型、标本类型无关。ARMS技术操作简便,可以快速进行KRAS基因突变检测,有利于指导患者的个体化分子靶向治疗。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 KRAS基因 突变扩增阻滞系统
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ARMS技术联合Taqman探针检测100例非小细胞肺癌EGFR基因突变 被引量:8
9
作者 赵静 赵金银 +5 位作者 赵肖 陈唯军 钟巍 张力 李龙芸 王孟昭 《中国肺癌杂志》 CAS 北大核心 2013年第1期25-32,共8页
背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变是决定表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)疗效最重要的预测因子,对EGFR基因突变进行检测,对指导患者个体化治疗... 背景与目的表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变是决定表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR tyrosine kinase inhibitor,EGFR-TKI)疗效最重要的预测因子,对EGFR基因突变进行检测,对指导患者个体化治疗具有重要意义。EGFR基因突变检测方法有很多,每种方法各有优缺点,本研究拟采用扩增阻滞突变系统(ampli cation refractory mutation system,ARMS)技术与Taqman探针相结合的方法,建立一种能快速、敏感及特异检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的方法。方法首先,应用Primer Premier5.0软件在EGFR基因E746_A750和L858R处设计ARMS引物及Taqman水解探针。然后,以包含E746_A750缺失和L858R点突变的质粒为研究对象,进一步分析所建立方法的灵敏度、敏感性以及特异性。最后,用所建立的ARMS-Taqman法检测100例非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)临床标本。结果在无背景DNA干扰的情况下,ARMS-Taqman法检测灵敏度可达10copies。对于检测敏感性,在500copies/L野生型基因背景下,其敏感性达1%;在5,000copies/l野生型基因背景下,其敏感性高达0.1%-0.5%。对于检测特异性,以正常人白细胞DNA为研究对象,21L858R突变存在一定程度的非特异性扩增,但其最小Ct高达14.89,而19Del未见非特异性扩增。对100份临床标本进行检测,19Del21例,21L858R18例,总突变率为39.0%。结论我们所构建的ARMS-Taqman法是一种快速、简便以及具有较高灵敏度和特异性的EGFR基因突变检测方法,值得在临床上进一步推广和验证。 展开更多
关键词 扩增阻滞突变系统 TAQMAN探针 表皮生长因子受体 突变检测 肺肿瘤
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水稻垩白基因Chalk5功能标记的开发与应用 被引量:8
10
作者 朱金燕 王晴晴 +6 位作者 王军 范方军 李文奇 王芳权 王绪鹏 仲维功 杨杰 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第1期1-8,共8页
水稻垩白是衡量水稻外观品质优劣的重要指标之一,降低稻米的垩白是培育优质水稻品种的前提。Chalk5是一个能显著降低稻米垩白从而提高稻米外观品质的主效基因。为提高垩白基因Chalk5在育种中的选择效率,在前人克隆的基础上,根据其启动... 水稻垩白是衡量水稻外观品质优劣的重要指标之一,降低稻米的垩白是培育优质水稻品种的前提。Chalk5是一个能显著降低稻米垩白从而提高稻米外观品质的主效基因。为提高垩白基因Chalk5在育种中的选择效率,在前人克隆的基础上,根据其启动子区域存在的2个功能突变位点,分别设计等位基因特异PCR(ARMS-PCR)引物,最终筛选出2对Chalk5基因的功能标记Chalk12、NChalk12和Chalk22、NChalk22,通过PCR产物测序的方法对这2对标记的检查结果进行了验证,说明Chalk12、NChalk12和Chalk22、NChalk22可以准确鉴定出Chalk5的不同基因型。利用该标记对不同来源的43份籼稻资源、江苏2007-2013年审定的65份粳稻品种和太湖流域179份粳稻地方资源进行了Chalk5基因型检测,筛选到携带chalk5低垩白率等位基因的籼稻资源20份,太湖流域粳稻地方资源仅8份,其余259份粳型资源中均不携带chalk5低垩白率等位基因,这也说明chalk5主要分布在籼型水稻资源中,在粳型资源中分布很少。 展开更多
关键词 水稻 垩白 Chalk5 等位基因特异PCR 功能标记Q78
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直接测序法与ARMS法检测甲状腺乳头状微小癌组织中BRAF基因突变的比较 被引量:5
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作者 段秀梅 腾永亮 +4 位作者 佟玲玲 田庄 孙默 王海莹 金美善 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第11期1514-1516,1522,共4页
目的:探讨直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统(Scorpions amplification refractory mutation system,scorpions ARMS法)检测甲状腺乳头状微小癌组织中(Papillary thyroid microcarcinoma,PTMC)的鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1(BR... 目的:探讨直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统(Scorpions amplification refractory mutation system,scorpions ARMS法)检测甲状腺乳头状微小癌组织中(Papillary thyroid microcarcinoma,PTMC)的鼠类肉瘤滤过性毒菌致癌同源体B1(BRAF)基因突变的特异性和敏感性。方法:采用直接测序法和ARMS法同时检测56例甲状腺乳头状微小癌患者组织中BRAF基因突变情况。结果:56例患者甲状腺癌组织中,直接测序法与ARMS法所检出BRAF基因突变阳性率分别为32.1%和82.9%,敏感度分别为39.1%和100%,前者均显著低于后者(P<0.01)。结论:检测甲状腺乳头状微小癌组织BRAF基因突变时ARMS方法较直接测序法具有更好的敏感性,癌组织小的标本BRAF基因突变检测更适合用ARMS法。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状微小癌 BRAF基因突变 测序法 蝎形探针扩增阻滞突变系统
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血浆EGFR基因突变检测在晚期非小细胞肺癌患者EGFR-TKI疗效评估中的价值 被引量:9
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作者 冯卫能 张华 +3 位作者 陈泽程 唐溢聪 梁剑苗 邓燕明 《山东医药》 CAS 北大核心 2017年第13期17-19,共3页
目的探讨血浆表皮生长因子受体(EGFR)突变状态检测在晚期非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKI)疗效评估中的价值。方法应用扩增阻滞突变系统(ARMS)法检测70例晚期非小细胞肺癌患者肿瘤组织及血浆的EGFR突变状态。... 目的探讨血浆表皮生长因子受体(EGFR)突变状态检测在晚期非小细胞肺癌患者表皮生长因子受体酪氨酸酶抑制剂(EGFR-TKI)疗效评估中的价值。方法应用扩增阻滞突变系统(ARMS)法检测70例晚期非小细胞肺癌患者肿瘤组织及血浆的EGFR突变状态。以肿瘤组织中的EGFR突变状态检测为对照,计算血浆中EGFR突变状态检测的敏感性、特异性、一致性,并比较两种检测对患者EGFR-TKI疗效及预后评估的差异。结果以配对的肿瘤组织EGFR突变检测结果为对照,ARMS法检测血浆EGFR突变的敏感性、一致性及特异性分别为58.1%、72.9%、96.3%。在38例经过EGFR-TKI治疗的患者中,肿瘤组织EGFR突变型患者的有效率及中位无进展生存期均优于EGFR野生型患者(有效率:69%比11.1%,P=0.005;无进展生存期:10个月比3个月,P=0.003)。血浆EGFR突变型患者与肿瘤组织EGFR突变型患者的有效率及中位无进展生存期均相似(有效率:P=0.908;中位无进展生存期:P=0.593)。在血浆标本中,EGFR突变型患者的中位无进展生存期长于EGFR野生型患者(10个月比7个月,P=0.032)。EGFR突变型患者的有效率高于EGFR野生型患者,但差异无统计学意义(70.6%比42.9%,P=0.111)。结论血浆EGFR突变可预测晚期非小细胞肺癌患者EGFR-TKI疗效,但因较高的假阴性率,血浆EGFR野生型患者需应用肿瘤组织进一步检测。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 扩增阻滞突变系统 表皮生长因子受体 循环肿瘤DNA
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非小细胞肺癌患者细胞学标本EGFR基因突变检测及其临床病理意义 被引量:5
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作者 吴娟 杜芸 +5 位作者 王珩 吴家宁 赵银环 王蕊 张艳 纪晓坤 《癌变·畸变·突变》 CAS CSCD 2016年第1期27-31,共5页
目的:探讨细胞学标本在非小细胞肺癌(NSCLC)的诊断及个体化治疗中的临床应用价值。方法:收集352例新鲜细胞学标本制片后,行常规HE染色;同时选择TTF-1、NapsinA、CK7、CEA、CD56、Syn、P63、CK5/6、WT-1、E-cadherin等抗体对来源不明的... 目的:探讨细胞学标本在非小细胞肺癌(NSCLC)的诊断及个体化治疗中的临床应用价值。方法:收集352例新鲜细胞学标本制片后,行常规HE染色;同时选择TTF-1、NapsinA、CK7、CEA、CD56、Syn、P63、CK5/6、WT-1、E-cadherin等抗体对来源不明的肿瘤细胞进行免疫细胞化学标记,并对明确诊断为NSCLC的病例,采用突变扩增阻滞系统(ARMS)检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变情况。结果:352例患者中,345例有癌细胞。经临床及免疫细胞化学证实345例恶性细胞中,NSCLC有335例,且NSCLC细胞学标本中有302例DNA提取成功,占90.15%(302/335)。EGFR基因检测结果显示,EGFR共突变123例,总突变率为40.73%(123/302)。其中,第18、19、20、21外显子的突变率分别为0.99%(3/302)、19.21%(58/302)、0.66%(2/302)和19.87%(60/302);EGFR 18、19、21外显子突变占EGFR突变总数的98.37%(121/123)显著高于EGFR 20外显子突变(P<0.05)。302例患者中,女性患者EGFR突变率为54.35%(75/138),明显高于男性患者29.27%(48/164)(P<0.05);非吸烟患者EGFR的突变率为51.49%(104/202),显著高于吸烟者19%(19/100)(P<0.05)。276例腺癌中EGFR突变率44.20%(122/276);非腺癌EGFR突变率4.34%(1/23);腺癌EGFR突变率明显高于其他类型(P<0.05)。结论:利用新鲜细胞学标本,结合免疫细胞化学标记和ARMS分子病理技术有助于晚期非小细胞肺癌的诊断,并为表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKIs)个体化治疗提供可靠依据。 展开更多
关键词 细胞学标本 免疫细胞化学 非小细胞肺癌 突变扩增阻滞系统 EGFR基因突变检测
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载脂蛋白E基因多态性与原发性高尿酸血症相关性研究 被引量:11
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作者 姚华 孙玉萍 +5 位作者 玛丽亚.沙吾那斯 李清 王秋云 胡静 古丽巴哈.阿不都热合曼 妥玲 《新疆医科大学学报》 CAS 2007年第6期543-547,共5页
目的:探讨维吾尔族与汉族载脂蛋白E基因多态性与原发性高尿酸血症的相关性。方法:收集2006年1~12月在新疆医科大学附属中医医院和乌鲁木齐市宝科达医院健康体检的670人血标本,检测血尿酸、血液生化指标以及ApoE基因型。结果:新疆维吾... 目的:探讨维吾尔族与汉族载脂蛋白E基因多态性与原发性高尿酸血症的相关性。方法:收集2006年1~12月在新疆医科大学附属中医医院和乌鲁木齐市宝科达医院健康体检的670人血标本,检测血尿酸、血液生化指标以及ApoE基因型。结果:新疆维吾尔族和汉族ApoE基因型分布差异有统计学意义(P<0.05),汉族高尿酸组和正常组ApoE基因型分布总体差异有统计学意义(P<0.05),而维吾尔族总体差异无统计学意义(P>0.05)。汉族和维吾尔族ApoE基因型中E3/3占主导,汉族E2/2>E4/4,而维吾尔族正好相反。与正常组相比,高尿酸组ApoEε2等位基因频率降低,而ε4频率升高,ε4等位基因可能是原发性高尿酸血症的危险因素。两个民族高尿酸组不同等位基因血尿酸(SUA)和除高密度脂蛋白-胆固醇(HDL-C)外的各生化指标均高于正常组,而且两个民族高尿酸组和正常组尿酸和血脂代谢指标水平在ApoE等位基因ε2、ε3、ε4型中也有一定的差别。结论:ApoEε4等位基因可能是汉族和维吾尔族原发性高尿酸血症的遗传易感基因,但仍然表现出民族的差异。 展开更多
关键词 APOE基因 原发性高尿酸血症 基因多态性 等位基因特异性多重PCR技术 等位基因频率
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非综合征型耳聋患者mtDNA A1555G异质性突变比例与临床表型的关系 被引量:6
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作者 程祖建 杨滨 +1 位作者 江凌 欧启水 《中华耳科学杂志》 CSCD 2008年第4期381-384,共4页
目的定量检测非综合征型耳聋患者线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)1555突变型/野生型的拷贝数,探讨突变型/野生型比例与临床表型之间的关系。方法建立实时定量PCR技术和扩增阻滞突变系统(Real-time quantitative PCR和Amplification ... 目的定量检测非综合征型耳聋患者线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)1555突变型/野生型的拷贝数,探讨突变型/野生型比例与临床表型之间的关系。方法建立实时定量PCR技术和扩增阻滞突变系统(Real-time quantitative PCR和Amplification refractory mutation system,RT-ARMS-qPCR系统)对含突变型和野生型mtDNA 1555位点的拷贝数进行定量检测并计算比例。共检测散发组12例、家系组7例异质性突变患者,结合耳聋患者的临床资料,分析突变型与野生型的比例与耳聋严重程度的关系。结果散发组mtDNA A1555G异质性突变的患者中,突变型mtDNA所占的比例与耳聋轻重程度相关(r=0.771,P=0.003);家系组患者中,突变型mtD-NA所占的比例亦与耳聋轻重程度相关(r=0.850,P=0.015)。结论突变型mtDNA占所有mtDNA的比例与耳聋的严重程度密切相关,是非综合征型耳聋临床表型多样性的分子基础。 展开更多
关键词 非综合征型耳聋 线粒体DNA 突变 实时定量PCR技术和扩增阻滞突变(RT-ARMS-qPCR)系统 拷贝数 临床表型
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表皮生长因子受体基因突变检测方法改进及初步临床验证 被引量:2
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作者 张百华 阳鹏 +5 位作者 王文祥 吴康 吴智宁 李旭 周勇 梁剑平 《现代生物医学进展》 CAS 2016年第23期4438-4442,4471,共6页
目的:改进现有的检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的荧光PCR法并开发出新的试剂盒,将其与直接测序法和ARMS法进行对比,验证该试剂盒用于临床诊断的敏感性、特异性和准确性。方法:收集2013年6月至2015年8月手术确诊的141例非小细胞肺... 目的:改进现有的检测表皮生长因子受体(EGFR)基因突变的荧光PCR法并开发出新的试剂盒,将其与直接测序法和ARMS法进行对比,验证该试剂盒用于临床诊断的敏感性、特异性和准确性。方法:收集2013年6月至2015年8月手术确诊的141例非小细胞肺癌(NSCLC)的石蜡包埋组织标本。采用盲法分别使用直接测序法、ARMS法和新试剂盒检测EGFR突变,比较新试剂盒与其他两种检测方法的差异,结果不一致时采用三种方法分别重复检验一次。结果:三种方法检测成功率均为100%,新试剂盒与直接测序法测得结果完全一致的比率达75.9%(107/141),在直接测序法测得的96例突变阳性中,92例在新试剂盒检测中得到验证(95.8%)。而直接测序法显示突变阴性的45例中,新试剂盒检测发现了23例突变阳性,两种检测方法的结果存在统计学差异(x2=40.745,P<0.05)。与直接测序法进行比较,新试剂盒检测EGFR突变的敏感性、特异性分别为95.8%、48.9%,阳性预测值、阴性预测值分别为80.0%、84.6%,检测准确度为80.9%。以ARMS检测法为金标准,新试剂盒测得结果完全一致的比率达84.4%(119/141),两者的一致性比较好(K=0.749,P<0.05),敏感性、特异性分别为94.1%、86.4%。结论:改进后EGFR基因突变检测的试剂盒在技术上较好地控制了检测结果的假阳性和假阴性,该检测方法较直接测序法具有更好的敏感性和准确性,与现有的ARMS法一致性较高。 展开更多
关键词 表皮生长因子受体 非小细胞肺癌 基因突变 直接测序法 扩增阻滞突变系统
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采用微滴式数字PCR技术检测血浆EGFR基因突变状态在晚期非小细胞肺癌患者EGFR-TKI疗效评估中的价值 被引量:6
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作者 庄武 洪雅萍 +6 位作者 何约明 黄韵坚 林金兰 黄章洲 黄诚 吴标 徐振武 《当代医学》 2019年第12期15-18,共4页
目的探讨采用微滴式数字PCR技术检测晚期非小细胞肺癌患者血浆EGFR突变状态的可行性,及检测结果与接受埃克替尼疗效的相关性。方法分别采用AMRS法检测肿瘤组织样本,dPCR检测配对的血浆样本筛查晚期非小细胞肺癌患者(ⅢB/Ⅳ期)258例的EGF... 目的探讨采用微滴式数字PCR技术检测晚期非小细胞肺癌患者血浆EGFR突变状态的可行性,及检测结果与接受埃克替尼疗效的相关性。方法分别采用AMRS法检测肿瘤组织样本,dPCR检测配对的血浆样本筛查晚期非小细胞肺癌患者(ⅢB/Ⅳ期)258例的EGFR表达状态,以肿瘤组织中的EGFR突变状态检测为对照,计算ddPCR法检测血浆EGFR突变状态的灵敏度、特异度、一致率。对于组织检测阳性和(或)血浆检测阳性的晚期NSCLC患者均给予埃克替尼靶向治疗。结果以配对的肿瘤组织EGFR突变检测结果为对照,ddPCR法检测血浆EGFR突变的灵敏度、特异度及一致率分别为66.7%,98.5%,83.8%。123例患者组织检测阳性和(或)血浆检测阳性,接受埃克替尼治疗,其中组织AMRS法检测阳性且血浆ddPCR检测阳性为A组(80例);组织AMRS检测阳性而血浆ddPCR检测阴性为B组(41例);组织AMRS检测阴性而血浆ddPCR检测阳性为C组(2例)。3组患者的DCR、ORR、PFS比较差异均无统计学意义(P=0.118,0.158,0.076)。结论 ddPCR法检测晚期NSCLC血浆中EGFR基因突变方法灵敏,取材方便;应用检测结果指导临床EGFR-TKIs治疗疗效与组织学检测结果比较差异无统计学意义,提示该方法预测疗效有良好的临床应用前景。 展开更多
关键词 非小细胞肺 微滴式数字PCR 扩增阻滞系统 表皮生长因子
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甲状腺乳头状癌中BRAF基因突变与相关蛋白表达的相关性 被引量:6
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作者 巩雷 陈萍 +1 位作者 刘宪军 刘学鑫 《诊断病理学杂志》 2017年第4期270-273,共4页
目的研究甲状腺乳头状癌(PTC)中BRAF基因突变和D2-40、CK19、cyclinD 1蛋白表达的临床意义。方法应用扩增阻碍突变系统(ARMS法)检测63例PTC和34例甲状腺乳头状增生组织中BRAF基因突变情况;应用免疫组化SP法检测上述组织中D2-40,CK19,cyc... 目的研究甲状腺乳头状癌(PTC)中BRAF基因突变和D2-40、CK19、cyclinD 1蛋白表达的临床意义。方法应用扩增阻碍突变系统(ARMS法)检测63例PTC和34例甲状腺乳头状增生组织中BRAF基因突变情况;应用免疫组化SP法检测上述组织中D2-40,CK19,cyclinD 1蛋白表达水平,分析其相关性。结果BRAF基因突变率和D2-40、CK19和cyclinD 1蛋白阳性率在甲状腺乳头状癌组中显著高于乳头状增生组(P<0.05);在甲状腺乳头状癌组中,BRAF基因突变率和D2-40、cyclinD 1蛋白阳性率在淋巴结转移组高于无淋巴结转移组(P<0.05);CK19蛋白阳性率在甲状腺乳头状癌中有、无淋巴结转移组之间差异不显著(P>0.05)。结论BRAF基因突变和D2-40、CK19,cyclinD 1蛋白表达的联合检测有助于甲状腺乳头状癌与甲状腺乳头状增生的诊断与鉴别诊断,同时可作为预测甲状腺乳头状癌预后的重要指标。 展开更多
关键词 扩增阻碍突变系统 免疫组化 甲状腺乳头状癌 BRAF基因 D2-40 CK19 cyclinD1
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扩增阻滞突变系统快速检测H型高血压患者MTHFR C677T基因型的应用研究 被引量:5
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作者 王佳 王淑玲 +1 位作者 周文胜 洪秀琴 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第35期4303-4306,共4页
目的通过扩增阻滞突变系统-聚合酶链反应(ARMS-PCR)检测H型高血压患者5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因型,以期建立一种低成本、简单快速的MTHFR C677T基因分型方法。方法基于湖南省H型高血压危险因素研究的大型流行病调查的... 目的通过扩增阻滞突变系统-聚合酶链反应(ARMS-PCR)检测H型高血压患者5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因型,以期建立一种低成本、简单快速的MTHFR C677T基因分型方法。方法基于湖南省H型高血压危险因素研究的大型流行病调查的人群基础,采用单纯随机方法,选取94例H型高血压患者作为研究对象。设计阻滞度递减的系列错配引物,采用ARMS-PCR对94例患者外周血样本的MTHFR C677T基因型进行鉴定,并抽取不同基因型进行测序验证。结果 ARMS-PCR产物电泳后条带清晰,易于判读MTHFR C677T基因型。94例H型高血压患者共检出CC基因型42例、CT基因型24例和TT基因型28例。ARMS-PCR与DNA测序结果一致。结论 ARMS-PCR经阻滞度递减的系列错配引物能有效对MTHFR C677T基因型进行鉴定,此法具有成本低、操作简单、用时短的优点。适用于各类基因的多态性分析。 展开更多
关键词 扩增阻滞突变系统 5 10-亚甲基四氢叶酸还原酶 基因分型 H型高血压
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CYP1A2*1F基因多态性的检测方法建立及其对阿戈美拉汀药代动力学的影响 被引量:2
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作者 辛勤 梁国威 +5 位作者 刘曼 王晓琳 张丹 杨漫 杜爱华 刘会臣 《药物生物技术》 CAS 2014年第6期506-510,共5页
建立实时荧光定量PCR方法检测CYP1A2*1F基因多态性,并探讨CYP1A2*1F基因多态性对阿戈美拉汀药代动力学的影响。该方法采用扩增阻滞突变系统(ARMS)结合TaqMan探针技术(ARMS-TaqMan法)同时检测野生和突变两个反应体系,根据野生引物循环阈... 建立实时荧光定量PCR方法检测CYP1A2*1F基因多态性,并探讨CYP1A2*1F基因多态性对阿戈美拉汀药代动力学的影响。该方法采用扩增阻滞突变系统(ARMS)结合TaqMan探针技术(ARMS-TaqMan法)同时检测野生和突变两个反应体系,根据野生引物循环阈值(Ct_w)与突变引物循环阈值(Ct_m)的差值绝对值(△Ct)来判断CYP1A2*1F的基因型。同时进行口服阿戈美拉汀片25mg的药代动力学试验,采用液相色谱-串联质谱法测定血浆中阿戈美拉汀浓度,采用WinNonlin 6.3软件处理血浆中药物浓度-时间数据,非房室模型方法计算药代动力学参数T_(max)、C_(max)、AUC_(0→1)、AUC_(0→∞)和T_(1/2)。结果表明,在55名健康受试者中,CYP1A2*1F野生型共12例(21.8%),其△Ct值为9.89±0.56;杂合型22例(40.0%),其△Ct值为0.41±0.14;纯合突变型21例(38.2%),其△Ct值为6.85±0.32。统计分析显示,CYP1A2*1F3种基因型组间各药代动力学参数比较皆无显著性差异(P>0.05),但所建立的用于CYP1A2*1F基因多态性检测的ARMS-TaqMan法具有准确、操作简单、高通量等优势,便于进一步筛查基因多态性对阿戈美拉汀药代动力学的影响,适合临床应用。本方法检测原理可用于各种单碱基突变率的检测,具有广泛的应用前景。 展开更多
关键词 细胞色素P450 1A2*1F 基因多态性 阿戈美拉汀 药代动力学 扩增阻滞突变系统 TaqMan探
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